|
|
больше ...
Термины запроса в документе
Реферат
[RU] 1. Соединение формулы 1  в которой R 1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R 1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из: 1) галогена; 2) алкокси; 3) амино; 4) -N(Н)С(О)-алкила; 5) -N(H)SO 2 -арила; 6) -N(H)SO 2 -гетероарила; 7) -N(H)CON(H)-арила; 8) -N(H)CON(H)-гетероарила; в которой дополнительно алкил относится к замещенным или незамещенным насыщенным углеводородным группам, имеющим от 1 до 6 атомов углерода; алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород; карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим; гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим; арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим; гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим; при этом замещенная группа может быть замещена заместителем, выбранным из алкила, галогеналкила, галогена, гидроксила, карбонила, формила, ацила, тиокарбонила, алкоксила, фосфорила, фосфата, фосфоната, фосфината, амино, амидо, амидина, имина, циано, нитро, азидо, сульфгидрила, алкилтио, сульфата, сульфоната, сульфамоила, сульфонамидо, сульфонила, гетероциклила, аралкила, арила или гетероарила. 2. Соединение по п.1, где R 1 выбран из группы, состоящей из    3. Соединение по п.1, где R 1 выбран из   4. Соединение, выбранное из группы, состоящей из                   5. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 1, 2, 18, 24, 25, 31, 32, 60 и 61. 6. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 26, 29, 34, 37, 40, 49 и 51. 7. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 14, 16, 17, 20, 21, 23, 30, 33, 36, 39, 41, 44, 45, 46, 47, 50, 55, 57, 58, 59, 62, 63, 64, 66, 67, 68, 69, 72 и 73. 8. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 11, 13, 19, 27, 28, 35, 43, 48, 54, 56 и 74. 9. Фармацевтическая композиция для модулирования киназы, содержащая соединение по любому из пп.1-8 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. 10. Способ модулирования функции протеинкиназы, включающий введение соединения по любому из пп.1-8 или фармацевтической композиции по п.9 пациенту. 11. Способ по п.10, в котором функция протеинкиназы представляет собой функцию киназы, выбранной из PDGFR, FGFR, VEGFR. 12. Способ по п.11, в котором киназа представляет собой cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 или Tie2. 13. Способ по любому из пп.10-12, в котором пациент страдает раком, артритом, миелопролиферативными заболеваниями, гипертрофией сердца, фиброзом легких, фиброзом печени, атеросклерозом, рестенозом, гломерулонефритом, псориазом, волчанкой, рассеянным склерозом, макулярной дегенерацией, астмой или реактивным синовитом. 14. Применение соединения по любому из пп.1-8 в качестве ингибитора протеинкиназы. 15. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из PDGFR, FGFR и VEGFR. 16. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 и Tie2. 17. Применение по любому из пп.13-16, в котором ингибитор протеинкиназы используют в лечении рака, артрита, миелопролиферативных заболеваний, гипертрофии сердца, фиброза легких, фиброза печени, атеросклероза,рестеноза, гломерулонефрита, псориаза, волчанки, рассеянного склероза, макулярной дегенерации, астмы или реактивного синовита. 18. Способ модулирования функции протеинкиназы ex vivo, включающий приведение в контакт клетки с соединением по любому из пп.1-8 в количестве, достаточном для модулирования функции протеинкиназы, модулируя таким образом активность и сигнализацию протеинкиназы. 19. Способ получения соединения формулы i-e, включающий стадии: а) алкилирование R 1 NH 2 бромацетонитрилом для получения промежуточного соединения i-a  b) конденсация i-a с  в присутствии кислоты для получения промежуточного соединения i-c  с) обработка промежуточного соединения i-c основанием для получения промежуточного соединения i-d  d) обработка промежуточного соединения i-d формамидинацетатом в спирте для получения соединения формулы i-e  при этом R 1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R 1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из: 1) галогена; 2) алкокси; 3) амино; 4) -N(Н)С(О)-алкила; 5) -N(H)SO 2 -арила; 6) -N(H)SO 2 -гетероарила; 7) -N(H)CON(H)-арила; 8) -N(H)CON(H)-гетероарила; X выбран из CH 2 , О; где дополнительно алкил относится к замещенным или незамещенным углеводородным группам; алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород; карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим; гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим; арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим; гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим.
Полный текст патента
(57) Реферат / Формула:
1. Соединение формулы 1 в которой R 1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R 1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из: 1) галогена; 2) алкокси; 3) амино; 4) -N(Н)С(О)-алкила; 5) -N(H)SO 2 -арила; 6) -N(H)SO 2 -гетероарила; 7) -N(H)CON(H)-арила; 8) -N(H)CON(H)-гетероарила; в которой дополнительно алкил относится к замещенным или незамещенным насыщенным углеводородным группам, имеющим от 1 до 6 атомов углерода; алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород; карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим; гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим; арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим; гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим; при этом замещенная группа может быть замещена заместителем, выбранным из алкила, галогеналкила, галогена, гидроксила, карбонила, формила, ацила, тиокарбонила, алкоксила, фосфорила, фосфата, фосфоната, фосфината, амино, амидо, амидина, имина, циано, нитро, азидо, сульфгидрила, алкилтио, сульфата, сульфоната, сульфамоила, сульфонамидо, сульфонила, гетероциклила, аралкила, арила или гетероарила. 2. Соединение по п.1, где R 1 выбран из группы, состоящей из 3. Соединение по п.1, где R 1 выбран из 4. Соединение, выбранное из группы, состоящей из 5. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 1, 2, 18, 24, 25, 31, 32, 60 и 61. 6. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 26, 29, 34, 37, 40, 49 и 51. 7. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 14, 16, 17, 20, 21, 23, 30, 33, 36, 39, 41, 44, 45, 46, 47, 50, 55, 57, 58, 59, 62, 63, 64, 66, 67, 68, 69, 72 и 73. 8. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 11, 13, 19, 27, 28, 35, 43, 48, 54, 56 и 74. 9. Фармацевтическая композиция для модулирования киназы, содержащая соединение по любому из пп.1-8 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель. 10. Способ модулирования функции протеинкиназы, включающий введение соединения по любому из пп.1-8 или фармацевтической композиции по п.9 пациенту. 11. Способ по п.10, в котором функция протеинкиназы представляет собой функцию киназы, выбранной из PDGFR, FGFR, VEGFR. 12. Способ по п.11, в котором киназа представляет собой cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 или Tie2. 13. Способ по любому из пп.10-12, в котором пациент страдает раком, артритом, миелопролиферативными заболеваниями, гипертрофией сердца, фиброзом легких, фиброзом печени, атеросклерозом, рестенозом, гломерулонефритом, псориазом, волчанкой, рассеянным склерозом, макулярной дегенерацией, астмой или реактивным синовитом. 14. Применение соединения по любому из пп.1-8 в качестве ингибитора протеинкиназы. 15. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из PDGFR, FGFR и VEGFR. 16. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 и Tie2. 17. Применение по любому из пп.13-16, в котором ингибитор протеинкиназы используют в лечении рака, артрита, миелопролиферативных заболеваний, гипертрофии сердца, фиброза легких, фиброза печени, атеросклероза,рестеноза, гломерулонефрита, псориаза, волчанки, рассеянного склероза, макулярной дегенерации, астмы или реактивного синовита. 18. Способ модулирования функции протеинкиназы ex vivo, включающий приведение в контакт клетки с соединением по любому из пп.1-8 в количестве, достаточном для модулирования функции протеинкиназы, модулируя таким образом активность и сигнализацию протеинкиназы. 19. Способ получения соединения формулы i-e, включающий стадии: а) алкилирование R 1 NH 2 бромацетонитрилом для получения промежуточного соединения i-a b) конденсация i-a с в присутствии кислоты для получения промежуточного соединения i-c с) обработка промежуточного соединения i-c основанием для получения промежуточного соединения i-d d) обработка промежуточного соединения i-d формамидинацетатом в спирте для получения соединения формулы i-e при этом R 1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R 1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из: 1) галогена; 2) алкокси; 3) амино; 4) -N(Н)С(О)-алкила; 5) -N(H)SO 2 -арила; 6) -N(H)SO 2 -гетероарила; 7) -N(H)CON(H)-арила; 8) -N(H)CON(H)-гетероарила; X выбран из CH 2 , О; где дополнительно алкил относится к замещенным или незамещенным углеводородным группам; алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород; карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим; гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим; арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим; гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим.
Евразийское 025542 (13) B1
патентное
ведомство
(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ЕВРАЗИЙСКОМУ ПАТЕНТУ
(45) Дата публикации и выдачи патента 2017.01.30
(21) Номер заявки
201370211
(22) Дата подачи заявки 2012.04.03
(51) Int. Cl.
C07D 487/04 (2006.01) A61K31/519 (2006.01) A61K 49/00 (2006.01)
A61K 51/04 (2006.01)
C07D 491/147 (2006.01) C12Q1/00 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01)
(54) ИНГИБИТОРЫ ПРОТЕИНКИНАЗЫ
(31) 61/471,322
(32) 2011.04.04
(33) US
(43) 2014.06.30
(86) PCT/CA2012/000285
(87) WO 2012/135937 2012.10.11
(71) (73) Заявитель и патентовладелец:
ФАРМАСАЙНС ИНК. (CA)
(72) Изобретатель:
Лоран Алейн, Роуз Янник, Моррис Стивен, Жакит Джеймс (CA)
(74) Представитель:
Дементьев В.Н. (RU)
(56) CA-2698018 CA-2730319
J. Med. Chem., 1999, 42 (26), p. 5464-5474, H. D. Hollis Showalter at al. "Tyrosine Kinase Inhibitors. 16. 6,5,6-Tricyclic Benzothieno[3,2-d]pyrimidines and Pyrimido[5,4-b]- and -[4,5-b]indoles as Potent Inhibitors of the Epidermal Growth Factor Receptor Tyrosine Kinase"
(57) Настоящее изобретение относится к новым ингибиторам киназы, представляющим собой соединение формулы 1. Было обнаружено, что соединения формулы 1 являются эффективными ингибиторами протеинкиназ, включая членов семейств PDGFR и VEGFR
Формула 1
где заместитель R1 раскрыт в формуле изобретения.
Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к новым ингибиторам киназы. В частности, настоящее изобретение относится к ингибиторам рецепторных тирозинкиназ, таких как члены семейства рецепторов тром-боцитарного фактора роста (PDGFR), в том числе cFMS (CSF-1R) и FMS-подобная тирозинкиназа-3 (FLT3), которые обычно регулируют клеточную функцию посредством активации внешними лигандами.
Сведения о предшествующем уровне техники
Протеинкиназы представляют собой большую группу внутриклеточных и трансмембранных сигнальных белков в эукариотических клетках (например, см. Manning, G., D. В. Whyte, et al. (2002). "The protein kinase complement of the human genome." Science 298(5600): 1912-1934). Эти ферменты отвечают за перенос терминального (гамма) фосфата от АТР на специфические аминокислотные остатки белков-мишеней. Фосфорилирование специфических аминокислотных остатков белков-мишеней может модулировать их активность, что приводит к значительным изменениям клеточной сигнализации и метаболизма. Киназы содержатся в клеточной мембране, цитозоле и органеллах, таких как ядро, и отвечают за опосредование множества клеточных функций, включая метаболизм, клеточный рост и деление, клеточную сигнализацию, модуляцию иммунных ответов и апоптоз. Рецепторы клеточной поверхности с про-теинтирозинкиназной активностью известны как рецепторные тирозинкиназы. Это большое семейство белков включает рецепторы факторов роста с разнообразной биологической активностью (например, см. Lemmon, М. A. and J. Schlessinger (2010). "Cell signaling by receptor tyrosine kinases." Cell 141(7): 1117-1134).
Аберрантная активация или избыточная экспрессия различных протеинкиназ вовлечена в механизм развития множества заболеваний и нарушений, характеризующихся доброкачественной и злокачественной пролиферацией, избыточным ангиогенезом, а также заболеваний, возникающих в результате неадекватной активации иммунной системы. Таким образом, следует ожидать, что ингибиторы выбранных ки-наз или семейств киназ будут полезны в лечении заболеваний и нарушений, таких как: рак, артрит, мие-лопролиферативные заболевания, гипертрофия сердца, фиброз легких, фиброз печени, атеросклероз, рес-теноз, гломерулонефрит, псориаз, волчанка, рассеянный склероз, макулярная дегенерация, астма, реактивный синовит и т.п. (например, см.: Chitu, V. and E. R. Stanley (2006). "Colony-stimulating factor-1 in immunity and inflammation." Curr Opin Immunol 18(1): 39-48; Mitchell-Jordan, S. A., T. Holopainen, et al. (2008). "Loss of Bmx nonreceptor tyrosine kinase prevents pressure overload-induced cardiac hypertrophy." Circ Res 103(12): 1359-1362; Uemura, Y., H. Ohno, et al. (2008). "The selective M-CSF receptor tyrosine kinase inhibitor Ki20227 suppresses experimental autoimmune encephalomyelitis." J Neuroimmunol 195(1-2): 73-80; Cohen, P. (2009). "Targeting protein kinases for the development of anti- inflammatory drugs." Curr Opin Cell Biol 21(2): 317-324; Menke, J., W. A. Rabacal, et al. (2009). "Circulating CSF- 1 promotes monocyte and macrophage phenotypes that enhance lupus nephritis." J Am Soc Nephrol 20(12): 2581-2592; Grimminger, F., R. T. Schermuly, et al. (2010). "Targeting non-malignant disorders with tyrosine kinase inhibitors." Nat Rev Drug Discov 9(12): 956-970; Hilgendorf, I., S. Eisele, et al. (2011). "The oral spleen tyrosine kinase inhibitor fostamatinib attenuates inflammation and atherogenesis in low-density lipoprotein receptor-deficient mice." Ar-terioscler Thromb Vasc Biol 31(9): 1991-1999; Sharma, P. S., R. Sharma, et al. (2011). "VEGF/VEGFR pathway inhibitors as anti-angiogenic agents: present and future." Curr Cancer Drug Targets 11(5): 624-653; Fabbro, D., S. W. Cowan-Jacob, et al. (2012). "Targeting cancer with small-molecular-weight kinase inhibitors." Methods Mol Biol 795: 1-34).
Примеры киназ, на которые можно прицельно воздействовать для модулирования заболевания, включают рецепторные тирозинкиназы, такие как члены семейств рецепторов тромбоцитарного фактора роста (PDGFR) и рецепторов сосудистого эндотелиального фактора роста (VEGFR).
Семейство PDGFR рецепторных тирозинкиназ включает cFMS (CSF- IR) и FMS-подобную тиро-зинкиназу-3 (FLT3), которые обычно регулируют клеточную функцию посредством активации внешними лигандами.
cFMS представляет собой трансмембранную рецепторную киназу, которая связывается с колоние-стимулирующим фактором-1 (CSF-1) и интерлейкином (IL)-34 (IL-34) (например, см. Chihara, Т., S. Suzu, et al. (2010). "IL-34 and M-CSF share the receptor Fms but are not identical in biological activity and signal activation." Cell Death Differ 17(12): 1917-1927), и которая играет важную роль в биологии макрофагов, моноцитов и остеокластов. Путь cFMS-CSF-1 активируется в различных заболеваниях человека, которые связаны с хронической активацией макрофагов. Активация cFMS играет центральную роль в развитии артрита через свою роль в дифференцировке моноцитов (например, см. Paniagua, R. Т., A. Chang, et al. (2010). "c-Fms-mediated differentiation and priming of monocyte lineage cells play a central role in autoimmune arthritis." Arthritis Res Ther 12(1): R32), и ингибирование cFMS показало эффективность в доклинических моделях артрита (например, см.: Conway, J. G., H. Pink, et al. (2008). "Effects of the cFMS kinase inhibitor 5-(3-methoxy-4-((4-methoxybenzyl)oxy)benzyl)pyrimidine-2,4-diamine (GW2580) in normal and arthritic rats." J Pharmacol Exp Ther 326(1): 41-50); Ohno, H., Y. Uemura, et al. (2008). "The orally-active and selective c-Fms tyrosine kinase inhibitor Ki20227 inhibits disease progression in a collagen-induced arthritis mouse model." Eur J Immunol 38(1): 283-291; Huang, H., D. A. Hutta, et al. (2009). "Pyrido[2,3-d]pyrimidin-5-ones: a novel class of antiinflammatory macrophage colony-stimulating factor-1 receptor inhibitors." J Med
Chem 52(4): 1081-1099; and Illig, C. R., C. L. Manthey, et al. (2011). "Optimization of a potent class of aryla-mide colony-stimulating factor-1 receptor inhibitors leading to anti-inflammatory clinical candidate 4-cyano-N-[2-( 1 -cyclohexen-1-yl)-4-[1-[(dimethylamino)acetyl] -4-piperidiny I]phenyl] -1H-imidazole-2-carboxamide (JNJ-28312141)." В J Med Chem 54(22): 7860-7883) предполагается, что ингибиторы киназы cFMS могут быть полезны в лечении артрита у человека. Также ингибирование cFMS показало эффективность в доклинической модели рассеянного склероза (Uemura, Y., H. Ohno, et al. (2008). "The selective M-CSF receptor ty-rosine kinase inhibitor Ki20227 suppresses experimental autoimmune encephalomyelitis." J Neuroimmunol
195(1-2): 73-80).
Следует ожидать, что ингибиторы cFMS будут терапевтически полезны в лечении теносиновиаль-ной гигантоклеточной опухоли, пигментного виллонодулярного синовита и других реактивных синови-тов, которые часто характеризуются высокими уровнями экспрессии CSF-1 (например, см. J. S., M. A. Miller, et al. (2007). "Translocation and expression of CSF1 in pigmented villonodular synovitis, tenosynovial giant cell tumor, rheumatoid arthritis and other reactive synovitides." Am J Surg Pathol 31(6): 970-976). Доклинические исследования с использованием антител, нацеленных на CSF-1, прогнозируют, что ингибиторы cFMS могут быть полезны в лечении этих заболеваний человека (Cheng, H., P. W. Clarkson, et al. (2010). "Therapeutic Antibodies Targeting CSF1 Impede Macrophage Recruitment in a Xenograft Model of Tenosynovial Giant Cell Tumor." Sarcoma 2010: 174528).
cFMS играет важную роль в дифференцировке и функции остеокластов и, следовательно, ингиби-рование cFMS может быть полезно в модулировании функции остеокластов в артрите, а также в формировании и прогрессировании костных метастазов (например, см. Manthey, С. L. D. L. Johnson, et al. (2009). "JNJ-28312141, a novel orally active colony-stimulating factor-1 receptor/FMS-related receptor tyrosine kinase-3 receptor tyrosine kinase inhibitor with potential utility in solid tumors, bone metastases, and acute mye-loid leukemia." Mol Cancer Ther 8(11): 3151-3161). Секреция факторов роста и иммуносупрессивных ци-токинов опухоль-ассоциированными макрофагами указывает на то, что прицельное воздействие на их функцию посредством ингибирования cFMS может являться эффективной противораковой терапией (например, см. Bingle, L, N. J. Brown, et al. (2002). "The role of tumour-associated macrophages in tumour progression: implications for new anticancer therapies." J Pathol 196(3): 254-265). Таким образом, ингибирова-ние или нокдаун cFMS показало эффективность в моделях опухолей через ингибирование опухоль-ассоциированных макрофагов (например, см. Aharinejad, S., P. Paulus, et al. (2004). "Colony-stimulating factor-1 blockade by antisense oligonucleotides and small interfering RNAs suppresses growth of human mammary tumor xenografts in mice." Cancer Res 64(15): 5378-5384; and Manthey, Johnson et al. 2009), что указывает на то, что ингибиторы cFMS могут быть полезны в лечении рака у человека.
FLT3 мутирует приблизительно у 30% взрослых пациентов с острым миелоидным лейкозом (AML) и оказывает существенное влияние на прогноз (например, см. Gilliland, D. G. and J. D. Griffin (2002). "The roles of FLT3 in hematopoiesis and leukemia." Blood 100(5): 1532-1542). Соответственно, следует ожидать, что ингибирование FLT3 будет полезно в лечении злокачественных новообразований, таких как AML (например, см.: Knapper, S. (2011). "The clinical development of FLT3 inhibitors in acute myeloid leukemia." Expert Opin Investiq Drugs 20(10): 1377- 1395; Pemmaraju, N., H. Kantarjian, et al. (2011). "FLT3 inhibitors in the treatment of acute myeloid leukemia: the start of an era?" Cancer 117(15): 3293-3304). Кроме того, FLT3-лиганд вовлечен в индукцию и развитие артрита, что указывает на то, что ингибиторы FLT3 могут быть полезны в лечении артрита (например, см. Dehlin, М., М. Bokarewa, et al. (2008). "Intra-articular fms-like tyrosine kinase 3 ligand expression is a driving force in induction and progression of arthritis." PLoS One 3(11):
e3633).
Предполагается, что ингибирование членов семейства васкулярного эндотелиального фактора роста (VEGF) и TIE2 будет иметь антиангиогенные эффекты, которые могут быть полезны в лечении многих заболеваний или нарушений, в том числе рака и артрита (например, см.: Timar, J. and В. Dome (2008). "Antiangiogenic drugs and tyrosine kinases." Anticancer Agents Med Chem 8(5): 462-469; Huang, H., A. Bhat, et al. (2010). "Targeting the ANGPT-TIE2 pathway in malignancy." Nat Rev Cancer 10(8): 575-585; and Huang, H., J. Y. Lai, et al. (2011). "Specifically targeting angiopoietin-2 inhibits angiogenesis, Tie2-expressing monocyte infiltration, and tumor growth." Clin Cancer Res 17(5): 1001-1011).
Рецептор фактора роста фибробластов 1 (FGFR1) представляет собой еще один пример киназы, на которую можно прицельно воздействовать для получения терапевтического эффекта. FGFR1 амплифи-цирован в выбранных подгруппах рака (например, см.: Courjal, F., M. Cuny, et al. (1997). "Mapping of DNA amplifications at 15 chromosomal localizations in 1875 breast tumors: definition of phenotypic groups." Cancer Res 57(19): 4360-4367; and Tsujimoto, H., H. Sugihara, et al. (1997). "Amplification of growth factor receptor genes and DNA ploidy pattern in the progression of gastric cancer." Virchows Arch 431(6): 383- 389), и ингибирование FGFR1 показало эффективность в доклинических моделях рака (например, см. Gozgit, J. M., M. J. Wong, et al. (2012). "Ponatinib (AP24534), multi-targeted pan-FGFR inhibitor with activity in multiple FGFR-amplified or mutated cancer models." Mol Cancer Ther. 11(3): 690-9).
Ингибирование киназ с использованием низкомолекулярных ингибиторов успешно привело к созданию нескольких утвержденных терапевтических агентов, применяющихся для лечения заболеваний человека. В настоящем документе авторы раскрыли новое семейство ингибиторов киназ. Кроме того,
авторы продемонстрировали, что модификации в замещении соединения могут влиять на селективность киназ и, следовательно, биологическую функцию этого агента.
Сущность изобретения
Настоящее изобретение относится к новым ингибиторам киназы. В частности, настоящее изобретение относится к ингибиторам рецепторных тирозинкиназ, таких как члены семейства рецепторов фактора роста тромбоцитов (PDGFR), в том числе cFMS, Flt3, KDR и FGFR1.
В настоящем изобретении предложено соединение формулы 1
или
Формула 1
R1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из:
1) галогена;
2) алкокси;
3) амино;
4) -^Н)С(О)О-алкила;
5) -N^O^^m;
6) -N(Н)SO2-гетероарила;
7) -^ЩОЩЩ-арила;
8) и -N(H)CON(H)-гетероарила; в которой дополнительно
алкил относится к замещенным или незамещенным насыщенными углеводородным группам, имеющим от 1 до 6 атомов углерода;
алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород;
карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим;
гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим;
арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим;
гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим;
при этом замещенная группа может быть замещена заместителем выбранным из алкила, галогенал-кила, галогена, гидроксила, карбонила, формила, ацила, тиокарбонила, алкоксила, фосфорила, фосфата, фосфоната, фосфината, амино, амидо, амидина, имина, циано, нитро, азидо, сульфгидрила, алкилтио, сульфата, сульфоната, сульфамоила, сульфонамидо, сульфонила, гетероциклила, аралкила, арила или гетероарила.
В некоторых вариантах осуществления соединения формулы 1 могут быть дополнительно определены как указано выше, где R1 может быть определен как
В другом аспекте настоящего изобретения предложена фармацевтическая композиция для модулирования киназы, содержащая эффективное количество соединения формулы 1 и фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество.
В другом аспекте настоящего изобретения предложено применение соединения формулы 1 в качестве ингибитора протеинкиназы, в частности в качестве ингибитора cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 и Tie2.
В другом аспекте настоящего изобретения предложено применение соединения формулы 1 в качестве ингибитора протеинкиназы, в котором ингибитор протеинкиназы используют в лечении рака, артрита, миелопролиферативных заболеваний, гипертрофии сердца, фиброза легких, фиброза печени, атеросклероза, рестеноза, гломерулонефрита, псориаза, волчанки, рассеянного склероза, макулярной дегенерации, астмы или реактивного синовита.
Другой аспект настоящего изобретения обеспечивает способ модулирования функции киназы, при этом способ включает приведение в контакт клетки с соединением по настоящему изобретению в количестве, достаточном для модулирования ферментативной активности заданной киназы или киназ, таких как cFMS, FLT3, KDR, FGFR1 и Tie2, и других, модулируя тем самым функцию киназ.
Другой аспект настоящего изобретения обеспечивает способ модулирования функции целевой ки-назы ex vivo, при этом способ включает а) приведение в контакт клетки с соединением по настоящему изобретению в количестве, достаточном для модулирования функции целевой киназы, тем самым b) модулируя активность и сигнализацию целевой киназы.
Подробное описание предпочтительных вариантов осуществления изобретения
Настоящее изобретение относится к новым ингибиторам киназы. Авторы изобретения обнаружили, что эти соединения являются эффективными ингибиторами протеинкиназ, включая членов суперсемейства тирозиновых рецепторов.
Соединения по настоящему изобретению могут быть формулированы в фармацевтическую композицию, которая содержит эффективное количество соединения формулы 1 с фармацевтически приемлемым разбавителем или носителем. Например, фармацевтические композиции могут быть представлены в стандартной фармацевтической форме, пригодной для перорального введения (например, таблеток, капсул, гранул, порошков и сиропов), парентерального введения (например, инъекций (внутривенных, внутримышечных или подкожных)), препаратов для капельного вливания, ингаляции, глазных примочек, местного введения (например, мазей) или суппозиториев. Независимо от выбранного пути введения, соединения могут быть приготовлены в виде фармацевтически приемлемых лекарственных форм обычными способами, известными специалистам в данной области.
Используемое в настоящем описании выражение "фармацевтически приемлемый" относится к таким лигандам, материалам, композициям и/или лекарственным формам, которые, в рамках обоснованного медицинского заключения, подходят для применения в контакте с тканями человека и животного без избыточной токсичности, раздражения, аллергической реакции или других проблем или осложнений соразмерно с приемлемым соотношением польза/риск.
Используемое в настоящем описании выражение "фармацевтически приемлемый носитель" означает фармацевтически приемлемый материал, композицию или носитель, такой как жидкий или твердый наполнитель, разбавитель, вспомогательное вещество, растворитель или инкапсулирующий материал. Каждый носитель должен быть "приемлемым" в смысле совместимости с другими ингредиентами препарата и не вредным для пациента. Некоторые примеры материалов, которые могут служить в качестве фармацевтически приемлемых носителей, включают: (1) сахара, такие как лактоза, глюкоза и сахароза; (2) крахмалы, такие как кукурузный крахмал, картофельный крахмал и замещенный или незамещенный Р-циклодекстрин; (3) целлюлозу и ее производные, такие как натрийкарбоксиметилцеллюлоза, этилцел-люлоза и ацетат целлюлозы; (4) порошкообразный трагакант; (5) солод; (6) желатин; (7) тальк; (8) вспомогательные вещества, такие как масло какао и воски для суппозиториев; (9) масла, такие как арахисовое масло, хлопковое масло, сафлоровое масло, кунжутное масло, оливковое масло, кукурузное масло и соевое масло; (10) гликоли, такие как пропиленгликоль; (11) полиолы, такие как глицерин, сорбит, маннит и полиэтиленгликоль; (12) сложные эфиры, такие как этилолеат и этиллаурат; (13) агар; (14) буферные агенты, такие как гидроксид магния и гидроксид алюминия; (15) альгиновую кислоту; (16) апирогенную воду; (17) изотонический физиологический раствор; (18) раствор Рингера; (19) этиловый спирт; (20) фосфатные буферные растворы; и (21) другие нетоксичные совместимые вещества, используемые в фармацевтических препаратах.
Термин "фармацевтически приемлемая соль" относится к относительно нетоксичным аддитивным солям соединения(й) с неорганическими и органическими кислотами. Указанные соли можно получить in situ в процессе конечного выделения и очистки соединения(й), или осуществления отдельного взаимодействия очищенного соединения(й) в форме свободного основания с приемлемой органической или неорганической кислотой и выделения полученной таким образом соли. Типичные соли включают гидробромид, гидрохлорид, сульфат, бисульфат, фосфат, нитрат, ацетат, валерат, олеат, пальмитат, стеарат, лаурат, бензоат, лактат, фосфат, тозилат, цитрат, малеат, фумарат, сукцинат, тартрат, нафтилат, мезилат, глюкогептонат, лактобионат, лаурилсульфонат и аминокислотные соли, и т.п. (См., например, Berge et al. (1977) "Pharmaceutical Salts", J. Pharm. Sci. 66: 1-19)
В других случаях соединения по настоящему изобретению могут содержать одну или несколько кислотных функциональных групп и, таким образом, могут образовывать фармацевтически приемлемые соли с фармацевтически приемлемыми основаниями. Термин "фармацевтически приемлемые соли" в
указанных случаях относится к относительно нетоксичным аддитивным солям соединения(й) с неорганическими или органическими основаниями. Указанные соли можно аналогичным образом получить in situ в процессе конечного выделения и очистки соединения(й), или осуществления отдельного взаимодействия очищенного соединения(й) в форме свободной кислоты с приемлемым основанием, таким как гидроксид, карбонат или бикарбонат фармацевтически приемлемого катиона металла, с аммиаком или фармацевтически приемлемым первичным, вторичным или третичным органическим амином. Типичные соли щелочных или щелочноземельных металлов включают соли лития, натрия, калия, кальция, магния, алюминия и т.п. Типичные органические амины, пригодные для получения основно-аддитивных солей, включают этиламин, диэтиламин, этилендиамин, этаноламин, диэтаноламин, пиперазин и т.п. (см., например, Berge et al., supra).
Используемый в настоящем описании термин "аффинная метка" означает лиганд или группу, которые связываются с соединением по настоящему изобретению или с протеинкиназным доменом, давая возможность извлекать конъюгат из раствора.
Термин "алкил" относится к замещенным или незамещенным насыщенным углеводородным группам, включая алкильные группы с неразветвленной цепью и алкильные группы с разветвленной цепью, включая галогеналкильные группы, такие как трифторметил и 2,2,2-трифторэтил, и т.д. Типичные ал-кильные группы включают метил, этил, н-пропил, изопропил, н-бутил, трет-бутил, изобутил, втор-бутил, (циклогексил)метил, циклопропилметил, н-пентил, н-гексил, н-гептил, н-октил и т.п. Термины "алкенил" и "алкинил" относятся к замещенным или незамещенным ненасыщенным алифатическим группам, аналогичным в отношении длины и возможного замещения описанным выше алкилам, но которые имеют по меньшей мере одну двойную или тройную связь, соответственно. Типичные алкенильные группы включают винил, пропен-2-ил, кротил, изопентен-2-ил, 1,3-бутадиен-2-ил, 2,4-пентадиенил и 1,4-пентадиен-3-ил. Типичные алкинильные группы включают этинил, 1- и 3-пропинил и 3-бутинил. В некоторых предпочтительных вариантах осуществления алкильные заместители представляют собой группы низшего алкила, например содержащие от 1 до 6 атомов углерода. Аналогичным образом, алкенил и алкинил предпочтительно относятся к группами низшего алкенила и алкинила, например содержащим от 2 до 6 атомов угелерода. Используемый здесь "алкилен" относится к алкильной группе с двумя открытыми валентностями (более чем одна валентность), такой как -(CH2)1-10-, и ее замещенным вариантам.
Термин "алкокси" относится к алкильной группе с присоединенным к ней кислородным радикалом. Типичные алкоксигруппы включают метокси, этокси, пропокси, трет-бутокси и т.п. "Простой эфир" означает два углеводорода, ковалентно связанных кислородом. Поэтому заместитель алкила, который делает алкил простым эфиром, является или подобен алкокси.
Термин "алкоксиалкил" относится к алкильной группе, замещенной алкоксигруппой, образуя таким образом простой эфир.
Термины "амид" и "амидо" известны в данной области как аминозамещенный карбонил и включают фрагмент, который может быть представлен общей формулой
в которой R9, R10 имеют указанные выше значения. Предпочтительные примеры амида не будут включать имиды, которые могут быть неустойчивыми.
Термины "амин" и "амино" известны в данной области и относятся к незамещенным и замещенным
аминам и их солям, например фрагменту, который может быть представлен общей формулой
R9 R9
' '+
-N -N-R10
10 в10' ИЛИ
где R9, R10 и R10, каждый, независимо представляет собой водород, алкил, алкенил, -(CH2)m-R8, или R9 и R10 вместе с атомом N, к которому они присоединены, образуют гетероцикл, имеющий от 4 до 8 атомов в кольцевой структуре; R8 представляет собой арил, циклоалкил, циклоалкенил, гетероциклил или полициклил; и m равен 0 или целому числу от 1 до 8. В предпочтительных вариантах осуществления только один из R9 или R10 может быть карбонилом, например R9, R10 вместе с атомом азота не образуют имид. В еще более предпочтительных вариантах осуществления R9 и R10 (и необязательно R10), каждый, независимо представляет собой водород, алкил, алкенил или -(CH2)m-R8. В некоторых вариантах осуществления аминогруппа имеет основной характер, означающий, что протонированная форма имеет pKa> 7.00.
Используемый в настоящем описании термин "аралкил" относится к алкильной группе, замещенной арильной группой.
Используемый в настоящем описании термин "арил" включает 5-, 6- и 7-членные одноциклические замещенные или незамещенные ароматические группы, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод. Термин "арил" также включает полициклические кольцевые системы, имеющие два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных
колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим, например другие циклические кольца могут представлять циклоалкилы, циклоалкенилы, циклоалкинилы, арилы, гетероарилы и/или гетероциклилы. Арильные группы включают бензол, нафталин, фенентрен, фенол, анилин, антрацен и фенантрен.
Используемые в настоящем описании термины "карбоцикл" и "карбоциклил" относятся к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода. Термины "карбоцикл" и "карбоциклил" также включают полициклические кольцевые системы, имеющие два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим, например другие циклические кольца могут представлять циклоалкилы, циклоалкенилы, циклоалкинилы, арилы, гетероа-рилы и/или гетероциклилы. Типичные карбоциклические группы включают циклопентил, циклогексил, 1-циклогексенил и 3-циклогексен-1-ил, циклогептил.
Термин "карбонил" известен в данной области и включает такие фрагменты, которые могут быть представлены общей формулой
в которой X представляет собой связь или представляет кислород или серу, и R11 представляет водород, алкил, алкенил, -(CH2)m-R8 или фармацевтически приемлемую соль. Когда X представляет собой кислород и R11 не является водородом, формула представляет "сложный эфир". Когда X представляет собой кислород и R11 представляет собой водород, формула представляет "карбоновую кислоту".
Термин "гетероарил" включает замещенные или незамещенные ароматические от 5- до 7-членные кольцевые структуры, более предпочтительно от 5- до 6-членные кольца, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов. Термин "гетероарил" также включает полициклические кольцевые системы, имеющие два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гете-роароматическим, например другие циклические кольца представляют циклоалкилы, циклоалкенилы, циклоалкинилы, арилы, гетероарилы и/или гетероциклилы. Гетероарильные группы включают, например, пиррол, фуран, тиофен, имидазол, изоксазол, оксазол, тиазол, триазол, пиразол, пиридин, пиразин, пиридазин и пиримидин, и т.п.
Используемый в настоящем описании термин "гетероатом" означает атом любого элемента кроме углерода или водорода. Предпочтительными гетероатомами являются азот, кислород и сера.
Термины "гетероциклил" или "гетероциклическая группа" относятся к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, более предпочтительно от 3- до 7-членным кольцам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов. Термины "гетероциклил" или "гетероциклическая группа" также включают полициклические кольцевые системы, имеющие два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим, например другие циклические кольца представляют циклоалкилы, циклоалкенилы, циклоалкинилы, ари-лы, гетероарилы и/или гетероциклилы. Гетероциклические группы включают, например, тетерагидрофу-ран, тетрагидропиран, пиперидин, пиперазин, пирролидин, морфолин, лактоны и лактамы.
Используемый в настоящем описании термин "углеводород" относится к группе, которая присоединена посредством атома углерода, которая не имеет =O или =S заместителя и обычно имеет по меньшей мере одну углерод-водородную связь и исходную углеродную цепь, но необязательно может включать гетероатомы. Таким образом, такие группы как метил, этоксиэтил, 2-пиридил и трифторметил считаются гидрокарбильными для целей настоящего описания, но заместители, такие как ацетил (который имеет =O заместитель на связывающем атоме углерода) и этокси (который связан через атом кислорода, но не углерода), не считаются. Гидрокарбильные группы включают, но без ограничения, арил, гетероа-рил, карбоцикл, гетероцикл, алкил, алкенил, алкинил и их комбинации.
Термин "полициклил" или "полициклический" относится к двум или более кольцам (например, циклоалкилы, циклоалкенилы, циклоалкинилы, арилы, гетероарилы и/или гетероциклилы), в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, например кольца представляют собой "конденсированные кольца". Все кольца полицикла могут быть замещенными или незамещенными.
Используемый в настоящем описании термин "зонд" означает соединение по изобретению, которое мечено либо детектируемой меткой, либо аффинной меткой, и которое способно к связыванию, либо ковалентному, либо нековалентному, с протеинкиназным доменом. Если, например, зонд связан некова-лентно, он может быть замещен тестируемым соединением. Если, например, зонд связан ковалентно, он может применяться для получения поперечносшитых аддуктов, которые могут быть количественно определены и ингибированы тестируемым соединением.
Термин "замещенный" относится к фрагментам, имеющим заместители, заменяющие водород у одного или нескольких углеродов в основной углеводородной цепи. Следует отметить, что термины "за
мещение" или "замещенный" подразумевают условие, заключающееся в том, что такое замещение соответствует допустимой валентности замещенного атома и заместителя, и что указанное замещение позволяет получить устойчивое соединение, например такое, которое не подвергается спонтанному превращению в результате перегруппировки, циклизации, элиминирования и т.д. Используемый в настоящем описании термин "замещенный" предполагает включение всех возможных заместителей органических соединений. В широком понимании возможные заместители включают ациклические или циклические, разветвленные и неразветвленные, карбоциклические и гетероциклические, ароматические и неароматические заместители органических соединений. Приемлемыми заместителями может быть один или несколько одинаковых или разных заместителей, пригодных для соответствующих органических соединений. В соответствии с целями настоящего изобретения гетероатомы, такие как азот, могут иметь водородные заместители и/или любые приемлемые заместители описанных в настоящем документе органических соединений, которые соответствуют валентностям гетероатомов. Заместители могут включать, например, галоген, гидроксил, карбонил (такой как карбоксил, алкоксикарбонил, формил или ацил), тио-карбонил (такой как сложный тиоэфир, тиоацетат или тиоформиат), алкоксил, фосфорил, фосфат, фос-фонат, фосфинат, амино, амидо, амидин, имин, циано, нитро, азидо, сульфгидрил, алкилтио, сульфат, сульфонат, сульфамоил, сульфонамидо, сульфонил, гетероциклил, аралкил или ароматическую или гете-роароматическую группу. Специалисту в данной области будет понятно, что замещаемые на углеводородной цепи группы могут сами по себе быть замещенными, если целесообразно.
Соединения по изобретению также включают все изотопы атомов, присутствующих в промежуточных и/или конечных соединениях. Изотопы включают такие атомы, которые имеют один и тот же атомный номер, но различаются массовыми числами. Например, изотопы водорода включают дейтерий и тритий.
В табл. 1 приведены некоторые иллюстративные варианты осуществления соединения формулы 1.
Таблица 1
Соединение
Структура
MS (m/z)
NH2 ^у==}
[M+Hj*=400.2
NH2 у=^
[M+H]*=266.2
H2N
|M*Hf=406.1
HN-O
[M+H|'=358.2
[M+H]*=29S.1
NH2 ^==У
[M+H]*=344.1
NH2
[M+H]*-281.1
NH2 ^==^
N5b
HN-^
NH2 ^y=^
1M+H[*=337.2
NH2 ^y=^
" <ХЬ
|M+Hf=370.2
HN-Ao O--
{M+Hf=415.2
NH2
[M+H]'=342.2
NH2 Ч==/
[M+Hj'=415.2
NHj
[M+H]"=403.2
NH2 f-J^jf
[M+H]'=265.1
NH2 \fsJ
[M+H]*=415.1
HN-4Q CF3
[M+H|*=453.1
[М+НГ=280.2
[M+H]*=403.1
HN-4,q CI
NH2
[M+H]*-419.3
NH2
1М+нГ=45з.1
NH2
N*b
[M+H]*=419.5
NH2 4=^
[M+H]*=453.1
[M+H]*=400.2
f\-NH2 NH2 у/
[M+H]*=266.1
[M+H]*=267.1
NH2
[M+Hf=451.1
HN-CV
[М+НГ=429.1
IM*H]*=279.2
NH NH
NH2
IM+H]*=413.2
NH2 \=У
[M+H]*=403.2
NH2 f-J^^
(MtH]*=293.2
NH2 ^3
IM+HJ*=391.3
HN о CF3
[M+H]*=4B3.1
HN-4.Q F
[M+Hf=433.3
hn40 ochf2
[M+Hf=451.1
HN о СРз
[M+H]'=483,1
F HN"\l
(M+H)'*410.2
NH,
NH2 ^y=^
N V-o
[M+H]*=473.0
NH2
[M+H]*=451,2
HN О
NH2
[M+H]'=487.3
OMe
HN о CF;3
NH2 ^y=^
(M+H]*=483 2
Общие методы синтеза. Общий метод синтеза А.
Соединения общей формулы i-e могут быть получены четырехстадийным способом, который приведен на Схеме i. Алкилирование R:NH2 бромацетонитрилом обеспечивает промежуточное соединение i-a. Конденсация i-a с i-b в присутствии кислоты, такой как п-толуолсульфоновая кислота, обеспечивает промежуточное соединение i-c. Обработка промежуточного соединения i-c основанием, таким как tBuOK в t-BuOH, обеспечивает промежуточное соединение i-d. Обработка промежуточного соединения i-d фор-мамидинацетатом в этаноле обеспечивает соединения общей формулы i-e.
Схема i бро мацетонитрил
Иллюстративный пример.
Следующие методы синтеза представленны в качестве примера химии, используемой для получения соединений формулы 1 и не рассматриваются как ограничивающие. Синтез соединения 1
Схема 1
Соединение 1
Стадия 1. Промежуточное соединение 1-а.
В раствор бензол-1,4-диамина (10.0 г, 92 ммоль) в дихлорметане (1000 мл), охлажденный до 0°С, добавляли бензилхлорформиат (13.20 мл, 92.0 ммоль) и DIPEA (16.15 мл, 92.0 ммоль). Реакционную смесь медленно нагревали до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи. Реакционную смесь концентрировали до половины объема. Добавляли воду и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли диэтиловый эфир (30 мл); происходило образование осадка, который удаляли путем фильтрации. Фильтрат концентрировали в вакууме с получением промежуточного соеди-
нения 1-а в виде бежевого твердого вещества. Стадия 2. Промежуточное соединение 1-b.
В раствор промежуточного соединения 1-а (14.3 г, 59.0 ммоль) и 2-бромацетонитрила (7.79 г, 64.9 ммоль) в THF (150 мл) добавляли DIPEA при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение ночи и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и этилацетата; органический слой отделяли, промывали насыщенным водным раствором хлорида аммония и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли диэтиловый эфир, происходило образование осадка и промежуточное соединение 1-b собирали фильтрацией в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 3. Промежуточное соединение 1-c.
В раствор промежуточного соединение 1-b (2.00 г, 7.11 ммоль) в толуоле (50 мл) добавляли 2-оксоциклопентанкарбонитрил (815 мг, 7.47 ммоль) и 4-метилбензолсульфоновой кислоты гидрат (0.135 г, 0.711 ммоль). Реакционную смесь нагревали с обратным холодильником в течение 3 ч с использованием насадки Дина-Старка и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли гек-сан, происходило образование осадка, промежуточное соединение 1-c собирали путем фильтрации в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 4. Промежуточное соединение 1-d.
В раствор промежуточного соединения 1-c (2.10 г, 5.64 ммоль) в трет-бутаноле (25 мл) добавляли трет-бутоксид натрия (542 мг, 5.64 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 2 ч и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и этилацетат, органический слой отделяли, водную фазу экстрагировали этилацетатом, объединенные органические экстракты промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли диэтиловый эфир, происходило образование осадка, промежуточное соединение 1-d собирали путем фильтрации в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 5. Соединение 1.
В раствор промежуточного соединения 1-d (2.39 г, 6.42 ммоль) в этаноле (50 мл) добавляли ацетат формамидина (5.34 г, 51.3 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 1.5 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над безводным MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения 1 в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=400.2
Синтез соединения 2.
Соединение 1 Соединение 2
Метанольный раствор соединения 1 (114 мг, 0.24 ммоль) обрабатывали 10% Pd/C (53 мг, 0.02 ммоль) и продували H2. Раствор перемешивали в атмосфере H2 (1 атм.) в течение 18 ч перед фильтрацией через целит. Фильтрат концентрировали в вакууме и очищали хроматографией на силикагеле, с получением соединения 2 в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=266.2.
Синтез соединения 3.
Соединение 2 Соединение 3
В раствор соединения 2 (50 мг, 0.16 ммоль) в пиридине (1 мл), охлажденный до 0°С, добавляли DMAP (2.0 мг, 0.017 ммоль) и фенилсульфонилхлорид (64.3 мг, 0.364 ммоль) в дихлорметане. Реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 3 ч и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и этилацетат, органический слой отделяли, промы
вали насыщенным водным раствором NaHCO3 и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Очистка хроматографией на силикагеле обеспечила соединение 3 в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=406.1. Синтез соединения 4.
Схема 4
Соединение 2 Соединение 4
В раствор соединения 2 (83 мг, 0.275 ммоль) в пиридине (1 мл), охлажденный до 0°С, добавляли раствор фенилизоцианата (36 мг, 0.30) в дихлорметане. Реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 18 ч. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и эти-лацетат, органический слой отделяли, промывали насыщенным водным раствором NaHCO3 и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 4-HCl в виде белого твердого вещества. MS (m/z) М+Н=358.2.
Синтез соединения 17.
Соединение 2 Соединение 17
В раствор соединения 2 (150 мг, 0.56 ммоль) в уксусной кислоте (5 мл) добаляли (трифторме-тил)фенилизоцианат (83 мкл, 0.59 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин. Добавляли этилацетат; происходило образование осадка, который собирали фильтрацией, сушили под вакуумом с получением соединения 17 в виде белого твердого вещества. MS (m/z)
М+Н=453.1
Синтез соединение 27.
Соединение 2 Соединение 27
В раствор соединения 2 (150 мг, 0.56 ммоль) в THF (1 мл) и DCM (3 мл) добавляли 4-(дифторметокси)фенилизоцианат (87 мкл, 0.62 ммоль) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанола в 1% HCl обеспечила получение соединения 27-HCl в виде белого твердого вещества. MS (m/z) M+H=451.1.
Синтез соединения 30.
Соединение 2 Соединение 30
В раствор соединения 2 (100 мг, 0.37 ммоль) в THF (1 мл) и DCM (3 мл) добавляли бензилизоцианат (51 мкл, 0.41 ммоль) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 18 ч. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанол в 1% HCl, обеспечила получение соединения 30-HCl в виде белого твердого вещества. MS (m+z) M+H=399.2.
Синтез соединения 31.
Схема 8
8с соединение 31
Стадия 1. Промежуточное соединение 8-а.
Раствор бутил-2-гидроксиацетата (47.2 г, 357 ммоль) в THF (50 мл) добавляли по каплям в суспензию гидрида натрия (14.28 г, 357 ммоль) в THF (250 мл). Смесь обрабатывали при нагревании с обратным холодильником раствором кротонитрила (23.96 г, 357 ммоль) в THF (50 мл) и смесь выдерживали при кипении в течение 2 ч, затем охлаждали до комнатной температуры. Растворитель выпаривали; в остаток добавляли 2N NaOH (200 мл) и диэтиловый эфир (200 мл). Органический слой отделяли; водную фазу дважды экстрагировали диэтиловым эфиром и затем подкисляли до рН 1 концентрированной HCl (75 мл). Водную фазу затем экстрагировали 3 раза дихлорметаном; объединенные органические экстракты сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали в вакууме для получения промежуточного соединения 8-а в виде коричневого масла.
Стадия 2. Промежуточное соединение 8-b.
В раствор промежуточного соединения 1-b (3.38 г, 12.0 ммоль) в толуоле (60 мл) добавляли промежуточное соединение 8-а (2.0 г, 18.0 ммоль) и 4-метилбензолсульфоновой кислоты гидрат (228 мг, 1.20 ммоль). Реакционную смесь нагревали с обратным холодильником в течение 3 ч с использованием насадки Дина-Старка и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Очистка хроматографией на сили-кагеле обеспечила получение промежуточного соединения 8-b в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 3. Промежуточное соединение 8-с.
В раствор промежуточного соединения 8-b (2.0 г, 5.34 ммоль) в трет-бутаноле (25 мл) добавляли трет-бутоксид калия (659 мг, 5.88 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 30 мин и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли 10% водный раствор HCl и этилацетат, органический слой отделяли, водную фазу экстрагировали этилацетатом, объединенные органические экстракты промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения 8-с в виде коричневого твердого вещества.
Стадия 4. Соединение 31.
В раствор промежуточного соединения 8-с (1.9 г, 5.07 ммоль) в этаноле (50 мл) добавляли форма-мидинацетат (4.23 г, 40.6 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 1.5 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над безводным MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением соединения 31 в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=402.2.
Синтез соединения 32.
Соединение 31 Соединение 32
Метанольный раствор соединения 31 (200 мг, 0.49 ммоль) обрабатывали 10% Pd/C (106 мг, 0.05 ммоль) и продували H2. Раствор перемешивали в атмосфере H2 (1 атм) в течение 45 мин перед фильтрацией через целит. Фильтрат концентрировали в вакууме и очищали хроматографией на силикагеле с получением соединения 32 в виде грязно-белого твердого вещества. MS (m/z) M+H=268.2.
Синтез соединения 33.
Схема 10
соединение 32 соединение 33
В раствор соединения 32 (123 мг, 0.46 ммоль) в дихлорметане (3 мл) добавляли 4-фторфенилизоцианат (63 мг, 0.46 ммоль), уксусную кислоту (0.5 мл) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-40% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 33-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) М+Н=405.2.
Синтез соединения 41.
Соединение 2 Соединение 41
В раствор соединения 2 (156 мг, 0.58 ммоль) в DCM (5 мл) добавляли циклогексилизоцианат (79 мкл, 0.62 ммоль), уксусную кислоту (0.5 мл) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 18 ч. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обра-щенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанола в 1% HCl, обеспечила получе-
Соединение 2 Соединение 42
В раствор соединения 2 (112 мг, 0.42 ммоль) в DCM (3 мл) добавляли 1-фтор-4-(2-изоцианатоэтил)бензол (77 мг, 0.46 ммоль), уксусную кислоту (0.6 мл) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 18 ч. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 42-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) М+Н=431.2.
Синтез соединения 47.
Соединение 32 Соединение 47
В раствор соединения 32 (200 мг, 0.74 ммоль) в DCM (3 мл) добавляли 1-фтор-2-изоцианато-4-метилбензол (113 мг, 0.74 ммоль), уксусную кислоту (0.5 мл) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 30 ч. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-40% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 47-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) М+Н=419.2.
Синтез соединения 48.
Схема 14
Соединение 32 Соединение 48
В раствор соединения 32 (154 мг, 0.57 ммоль) в уксусной кислоте (5 мл) добавляли 1-изоцианато-3-(трифторметил)бензол (108 мг, 0.57 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-40% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 48-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=455.1. Синтез соединения 60.
Схема 15
15-g соединение 60
Стадия 1. Промежуточное соединение 15-а.
В раствор 3-фтор-4-нитроанилина (5.0 г, 32.0 ммоль) в дихлорметане (100 мл) добавляли ВОС2О (6.99 г, 32.0 ммоль) и после перемешивания в течение 15 мин добавляли DMAP (391 мг, 3.20 ммоль). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 2 дней и затем концентрировали в вакууме. Добавляли 10% лимонную кислоту и этилацетат; органический слой отделяли, промывали насыщенным водным раствором NaHCO3 и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Очистка хроматографией на силикагеле обеспечила получение промежуточного соединения 15-а в виде желтого твердого вещества.
Стадия 2. Промежуточное соединение 15-b.
Метанольный раствор промежуточного соединения 15-а (1.7 г, 6.63 ммоль) обрабатывали 10% Pd/C (1.41 г, 0.66 ммоль) и продували H2. Раствор перемешивали в атмосфере H2 (1 атм) в течение ночи перед фильтрацией через целит. Фильтрат концентрировали в вакууме с получением промежуточного соединения 15-b в виде белого твердого вещества.
Стадия 3. Промежуточное соединение 15-с.
В раствор промежуточного соединения 15-b (1.5 г, 6.63 ммоль) в дихлорметане (66.0 мл), охлажденный до 0°С, последовательно добавляли бензилхлорформиат (943 мкл, 6.63 ммоль) и DIPEA (1.15 мл, 6.63 ммоль), и реакционную смесь медленно нагревали до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи. Реакционную смесь концентрировали в вакууме. Добавляли воду и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения 15-с в виде бежевого масла.
Стадия 4. Промежуточное соединение 15-d.
4N HCl в диоксане (10 мл, 40.0 ммоль) добавляли в промежуточное соединение 15-с (2.17 г, 6.02 ммоль) при 0°С и суспензию перемешивали при 0°С в течение 1 ч. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении и остаток растирали с диэтиловым эфиром. Происходило образование осадка, который собирали фильтрацией, сушили под вакуумом с получением промежуточного соединения 15-d в виде белого твердого вещества. MS (m/z) M+H=261.1.
Стадия 5. Промежуточное соединение 15-е.
В раствор промежуточного соединения 15-d (1.8 г, 6.07 ммоль) и бромацетонитрила (800 мг, 6.67 ммоль) в THF (12.0 мл) добавляли DIPEA (2.22 мл, 12.74 ммоль) при комнатной температуре, и ре
акционную смесь затем перемешивали при 80°С в течение ночи и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и этилацетат; органический слой отделяли, промывали насыщенным водным раствором хлорида аммония и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли диэтиловый эфир; происходило образование осадка, который собирали путем фильтрации с получением промежуточного соединения 15-е в виде бежевого твердого вещества. Стадия 6. Промежуточное соединение 15-f.
В раствор промежуточного соединения 15-е (1.8 г, 6.01 ммоль) в толуоле (30.0 мл) добавляли 2-оксоциклопентанкарбонитрил (984 мг, 9.02 ммоль) и 4-метилбензолсульфоновой кислоты гидрат (114 мг, 0.60 ммоль). Реакционную смесь нагревали с обратным холодильником в течение 3 ч с использованием насадки Дина-Старка и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Очистка хроматографией на силикагеле обеспечила получение промежуточного соединения 15-f в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) М+Н=391.5.
Стадия 7. Промежуточное соединение 15-g.
В раствор промежуточного соединения 15-f (1.3 г, 3.33 ммоль) в трет-бутаноле (33.0 мл) добавляли трет-бутоксид калия (411 мг, 3.66 ммоль), и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 30 мин и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли 10% водный раствор HCl и этилацетат, органический слой отделяли, водную фазу экстрагировали этилацетатом, объединенные органические экстракты промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения 15-g в виде коричневого твердого вещества. MS (m/z) M+H=391.7.
Стадия 8. Соединение 60.
В раствор промежуточного соединения 15-h (1.3 г, 3.33 ммоль) в этаноле (33 мл) добавляли форма-мидинацетат (2.77 г, 26.6 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 1.5 ч. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над безводным MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-50% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 60-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=418.1.
Синтез соединения 61.
Схема 16
Соединение 60 Соединение 61
Метанольный раствор соединения 60 (1.2 г, 2.87 ммоль) обрабатывали 10% Pd/C (612 мг, 0.28 ммоль) и продували H2. Раствор перемешивали в атмосфере H2 (1 атм) в течение 45 мин перед фильтрацией через целит. Фильтрат концентрировали в вакууме с получением соединения 61 в виде грязно-белого твердого вещества.
Синтез соединения 62.
Соединение 61 Соединение 62
В раствор соединения 61 (200 мг, 0.70 ммоль) в АсОН (5 мл) добавляли 1-фтор-2-изоцианато-4-(трифторметил)бензол (145 мг, 0.76 ммоль) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращен-но-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-50% метанола в 1% HCl, обеспечила получение
соединения 62-HCl в виде бежевого твердого вещества. MS (m/z) M+H=489.1. Синтез соединения 63.
Схема 18
соединение 61 соединение 63
В раствор соединения 61 (200 мг, 0.70 ммоль) в АсОН (5 мл) добавляли 3-трифторметилфенилизоцианат (132 мг, 0.70 ммоль) и реакционную смесь затем перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин. Добавляли этилацетат; происходило образование осадка, который собирали путем фильтрации. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-50% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 63-HCl в виде белого твердого вещества.
MS (m/z)M+H=471.1.
Синтез соединение 64.
Соединение 2 Соединение 64
В раствор соединения 2 (119 мг, 0.45 ммоль) в уксусной кислоте (3 мл) добавляли 1-изоцианато-4-(метилсульфонил)бензол (115 мг, 0.58 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. Очистка обращен-но-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-70% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 64-HCl в виде белого твердого вещества. MS (m/z) M+H=463.2.
Синтез соединения 74.
Стадия 1. Промежуточное соединение 20-а.
В раствор бензол-1,4-диамина (16.2 г, 150 ммоль) и триэтиламина (20.77 мл, 150 ммоль) в DMF добавляли по каплям в течение 15 мин раствор ди-трет-бутил-дикарбоната (34.8 мл, 150 ммоль) в DMF. и реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Добавляли воду и этил-ацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над безводным MgSO4, фильтровали и концентрировали в вакууме. В остаток добавляли гексан; происходило образование осадка, который собирали путем фильтрации с получением промежуточного соединения 20-а в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 2. Промежуточное соединение 20-b.
В раствор промежуточного соединения 20-а (10.0 г, 48.0 ммоль) и бромацетонитрила (6.34 г, 52.8 ммоль) в THF (150 мл) добавляли DIPEA (17.61 мл, 101 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь затем перемешивали при 80°С в течение ночи и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор хлорида аммония и этилацетат, органический слой отделяли, промывали насыщенным водным раствором хлорида аммония и солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. В остаток добавляли диэтиловый эфир; происходило образование осадка, который собирали путем фильтрации с получением промежуточного соединения 20-b в виде бежевого твердого вещества.
Стадия 3. Промежуточное соединение 20-с.
В раствор промежуточного соединения 20-b (1.2 г, 4.85 ммоль) в толуоле (30.0 мл) добавляли 2-оксоциклопентанкарбонитрил (794 мг, 7.28 ммоль) и 4-метилбензолсульфоновой кислоты гидрат (92 мг, 0.48 ммоль). Реакционную смесь нагревали с обратным холодильником в течение 3 ч с использованием насадки Дина-Старка и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения 20-с в виде коричневого твердого вещества.
Стадия 4. Промежуточное соединение 20-d.
В раствор промежуточного соединения 20-с (1.3 г, 4.73 ммоль) в THF (25 мл) добавляли 5-трет-бутил-3-изоцианатоизоксазол (865 мг, 5.20 ммоль), и реакционную смесь перемешивали при нагревании с обратным холодильником в течение 1 ч и затем охлаждали до комнатной температуры. Летучие соединения удаляли при пониженном давлении. В остаток добавляли гексаны; происходило образование осадка, который собирали путем фильтрации с получением промежуточного соединения 20-d в виде коричневого твердого вещества.
Стадия 5. Промежуточное соединение 20-е.
В раствор промежуточного соединения 20-d (1.9 г, 4.70 ммоль) в трет-бутаноле (23.0 мл) добавляли трет-бутоксид калия (580 мг, 5.17 ммоль), и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 30 мин и затем охлаждали до комнатной температуры. Добавляли 10% водный раствор HCl и этилацетат, органический слой отделяли, водную фазу экстрагировали этилацетатом, объединенные органические экстракты промывали солевым раствором, сушили над MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении с получением промежуточного соединения 20-е в виде коричневого твердого вещества.
Стадия 6. Соединение 74.
В раствор промежуточного соединение 20-е (1.9 г, 4.70 ммоль) в этаноле (23 мл) добавляли форма-мидинацетат (3.91 г, 37.6 ммоль) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 30 мин. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении. Добавляли насыщенный водный раствор NaHCO3 и этилацетат, органический слой отделяли, промывали солевым раствором, сушили над безводным MgSO4, фильтровали и концентрировали при пониженном давлении. Очистка обращенно-фазовой хроматографией, элюируя с градиентом 10-50% метанола в 1% HCl, обеспечила получение соединения 74-HCl. MS (m/z) M+H=432.2 Связывание киназы Аффинности связывания выбранных киназ определяли с использованием протоколов Kinase Profiler(tm) Service Assay Protocols (Millipore, V53.0).
Соединение 14 ингибирует cFMS(h), Aurora-B(h), Flt3(h), KDR(h), PDGFR-b(h), FGFR1, Tie2 и FLT4 при концентрации 100 нМ.
Соединение 44 ингибирует cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 и EphA2 при 100 нМ. В качестве индекса селективности 216 других киназ ингибировали на 20% или меньше при 300 нМ. Биохимический анализ cFMS (CSF1R)
Биохимические анализы киназы на основе поляризации флуоресценции выполняли в формате 384-луночного планшета с использованием меченного гистидином рецептора рекомбинантного человеческого колониестимулирующего фактора 1 (FMS), полученного от компании Invitrogen(tm) (содержит каталитический домен (538-910 аминокислот), экспрессируется в клетках насекомых и активируется in vitro посредством аутофосфорилирования), и модифицированного протокола KinEASE(tm) FP Fluorescein Green Assay от компании Millipore(tm).
Киназные реакции выполняли в формате 384-луночного планшета при комнатной температуре в течение 60 мин в присутствии 100 мкМ субстрата, 10 мкМ АТР и изменяющихся концентраций тестируемого образца. Реакцию останавливали с помощью реагентов для детекции EDTA/KinEASE(tm) и поляризацию измеряли на приборе Tecan 500. Значения IC50 определяли на основе полученной кривой зависимости "доза-эффект" с помощью программного обеспечения GraphPad Prism(r) с применением нелинейной аппроксимации кривой.
Таблица 2
Соединение
cFMS ICS0
IC50 a: меньше, чем 100 нМ; b: между 100 и 1000 нМ; с: больше, чем 1000 нМ. Клеточные анализы.
Анализ выживаемости M-CSF-зависимых клеток линии M-NFS-60 миелоидного лейкоза мышей.
M-CSF-зависимые клетки линии M-NFS-60 миелоидного лейкоза мышей получали от компании АТСС (CRL-1838). Клетки культивировали по стандартной методике при 37°С, 5% CO2 в полной среде (RPMI, дополненной 10% FBS, 1% пеницилина/стрептомицина, 50 мкМ бета-меркаптоэтанола), содержащей 30 нг/мл рекомбинантного мышиного M-CSF (Peprotech 315-02). Для анализов выживаемости клетки переносили в обедненную среду (полная среда, лишенная M-CSF) на 24 ч перед инициированием каждого эксперимента. Обедненные M-CSF клетки собирали и ресуспендировали в полной среде, содержащей 20 нг/мл M-CSF. Клетки высевали в количестве 25000 клеток/лунку в 96-луночные планшеты и инкубировали в течение 1 ч при 37°С, 5% CO2. Клетки обрабатывали 1 мкМ или 10 мкМ соединения в трех повторностях и выживаемость клеток измеряли через 72 ч при помощи Cell Titer-Glo Luminescent Assay (Promega). Люминесценцию считывали с использованием микропланшетного ридера Infinite F200, Tecan. Значения ЕС50 (50% выживаемости в присутствии соединения по сравнению с контролями, обработанными носителем) рассчитывали на основе кривых зависимости "доза-эффект" с помощью программного обеспечения GraphPad Prism Software с применением нелинейной аппроксимации кривой.
Анализ выживаемости клеток человеческого бифенотипического В-миеломоноцитарного лейкоза линии MV4-11.
Клетки бифенотипического В-миеломоноцитарного лейкоза линии MV4-11 (АТСС CRL-9591) культивировали в суспензии при 37°С, 5% CO2 в полной среде (RPMI дополненной 10% FBS, 1% пенициллина/стрептомицина). За один день до обработки клетки высевали в 96-луночные планшеты в количестве 8000 клеток/лунка в полной среде. На следующий день лунки в трех повторностях обрабатывали соединением при начальной концентрации 100, 1000 или 10000 нМ в соответствии с активностью соединения. Клеточную выживаемость измеряли через 72 ч при помощи Cell Titer-Glo Luminescent Assay (Promega). Люминесценцию считывали с использованием микропланшетного ридера Infinite F200, Tecan. Значения ЕС50 (50% выживаемости в присутствии соединения по сравнению с обработанными носителем контролями) рассчитывали на основе кривых зависимости "доза-эффект" с помощью программного обеспечения CambridgeSoft BioAssay software (Perkin Elmer) с применением нелинейной аппроксимации кривой.
Результаты клеточных анализов
Соединение
ECso M-NFS-60 (нМ)
ECso MV4-11 (нМ)
Таблица 3
ЕС50 а: меньше, чем 100 нМ; b: между 100 и 1000 нМ; с: больше, чем 1000 нМ.
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
1. Соединение формулы 1
Формула 1
в которой R1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из:
1) галогена;
2) алкокси;
3) амино;
4) -^Н)С(О)-алкила;
5) -N(H)SO2-арила;
6) -N(H)SO2-гетероарила;
7) ^(Н)ОЖ(Н)-арила;
8) -^Н)ОЖ(Н)-гетероарила;
в которой дополнительно алкил относится к замещенным или незамещенным насыщенным углево
дородным группам, имеющим от 1 до 6 атомов углерода;
алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород;
карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим;
гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим;
арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим;
гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических колец, в которых два или более атомов углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим;
при этом замещенная группа может быть замещена заместителем, выбранным из алкила, галогенал-кила, галогена, гидроксила, карбонила, формила, ацила, тиокарбонила, алкоксила, фосфорила, фосфата, фосфоната, фосфината, амино, амидо, амидина, имина, циано, нитро, азидо, сульфгидрила, алкилтио, сульфата, сульфоната, сульфамоила, сульфонамидо, сульфонила, гетероциклила, аралкила, арила или
гетероарила.
3. Соединение по п.1, где R1 выбран из
О Р С 0 О
}-NH /=\ /=ч ^NH
NH2 N*SrNV
NH2 \SP^
NH2
NH2 ^y===^
HN-^ HN~4^
NH2
<5
NH2 \==J
HN-O HN4q O'
NH2
NH2
HN"\Г^"°Ч
NH2 \==^/
tfb
NH2 W
HN-0
NH2 KsJ
НмН0 CF3 NH2 y=-)
NH2 y=*
HN-O
T4o F
NH2 ysJ
HN-\J HN-^Q CI
NH2 ^==^
HN4q
NH2
NH2 у*7
NH2
NH2 V=/
члЪ
yTVNH2 NH2 V=s/
NH2 ^y=^
N4b
5 F
NH2
NH2 W
NH2
N^VNv
HN-\)
NH2
NH2
NH NH
NH2
NH NH
NH2
NH2
HN4q F
NH2 V5^
HN-Q НМ"Л0 OCHF2
NH2 ^==^
NH2
HN-^0 CF3
NH2
Sr4i
NH2 ^===^
P HN-AQ CF3 NH2^y==^
P HN"^-0 CF3
HN-\J 4
NH2 Vs'
HN4c
NH2 \^
N5b
HN-Q
нм-Л0 CN
NH2
NH2 ^===^
NH2
HN-AQ CF3
NH2
OMe
NH2
NH2
NH2
NH2 \sss/
Я 7
NH2 ^===^
5. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 1, 2, 18, 24, 25, 31, 32, 60 и 61.
6. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 3, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 15, 26, 29, 34, 37, 40, 49 и 51.
7. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 14, 16, 17, 20, 21, 23, 30, 33, 36, 39, 41, 44, 45, 46, 47, 50, 55, 57, 58, 59, 62, 63, 64, 66, 67, 68, 69, 72 и 73.
8. Соединение по п.4, при этом соединение выбрано из группы, состоящей из соединений 11, 13, 19, 27, 28, 35, 43, 48, 54, 56 и 74.
9. Фармацевтическая композиция для модулирования киназы, содержащая соединение по любому из пп.1-8 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
10. Способ модулирования функции протеинкиназы, включающий введение соединения по любому из пп.1-8 или фармацевтической композиции по п.9 пациенту.
11. Способ по п.10, в котором функция протеинкиназы представляет собой функцию киназы, выбранной из PDGFR, FGFR, VEGFR.
12. Способ по п.11, в котором киназа представляет собой cFMS, Flt3, KDR, FGFR1 или Tie2.
13. Способ по любому из пп.10-12, в котором пациент страдает раком, артритом, миелопролифера-тивными заболеваниями, гипертрофией сердца, фиброзом легких, фиброзом печени, атеросклерозом, рестенозом, гломерулонефритом, псориазом, волчанкой, рассеянным склерозом, макулярной дегенерацией, астмой или реактивным синовитом.
14. Применение соединения по любому из пп.1-8 в качестве ингибитора протеинкиназы.
15. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из PDGFR, FGFR
и VEGFR.
16. Применение по п.14, в котором протеинкиназа выбрана из группы, состоящей из cFMS, Flt3,
KDR, FGFR1 и Tie2.
17. Применение по любому из пп.13-16, в котором ингибитор протеинкиназы используют в лечении рака, артрита, миелопролиферативных заболеваний, гипертрофии сердца, фиброза легких, фиброза печени, атеросклероза, рестеноза, гломерулонефрита, псориаза, волчанки, рассеянного склероза, макулярной
17.
дегенерации, астмы или реактивного синовита.
18. Способ модулирования функции протеинкиназы ex vivo, включающий приведение в контакт клетки с соединением по любому из пп.1-8 в количестве, достаточном для модулирования функции про-теинкиназы, модулируя таким образом активность и сигнализацию протеинкиназы.
19. Способ получения соединения формулы i-e, включающий стадии:
а) алкилирование R:NH2 бромацетонитрилом для получения промежуточного соединения i-a
b) конденсация i-a с
при этом R1 выбран из алкила, гетероалкила, карбоциклила или гетероциклила; R1 также выбран из арила или гетероарила, при этом арил и гетероарил могут быть дополнительно замещены группами, выбранными из:
1) галогена;
2) алкокси;
3) амино;
4) -]\Г(Н)С(О)-алкила;
5) -^И^СЬ-арила;
6) -1Ч(Н^02-гетероарила;
7) -]\Г(Н)С0]Ч(Н)-арила;
8) -]\Г(Н)С0]Ч(Н)-гетероарила; X выбран из СН2, О;
где дополнительно
алкил относится к замещенным или незамещенным углеводородным группам;
алкокси относится к алкильной группе, имеющей присоединенный к ней кислород;
карбоциклил относится к неароматическому замещенному или незамещенному кольцу, в котором все атомы являются атомами углерода, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является карбоциклическим;
гетероциклил относится к замещенным или незамещенным неароматическим от 3- до 10-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом меньшей мере одно из колец является гетероциклическим;
арил относится к 5-, 6- и 7-членным одноциклическим замещенным или незамещенным ароматическим группам, в которых каждый атом кольца представляет собой углерод, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является ароматическим;
гетероарил относится к замещенным или незамещенным ароматическим от 5- до 7-членным кольцевым структурам, кольцевые структуры которых содержат от одного до четырех гетероатомов, и полициклическим кольцевым системам, имеющим два или более циклических кольца, в которых два или более атома углерода являются общими для двух смежных колец, при этом по меньшей мере одно из колец является гетероароматическим.
Евразийская патентная организация, ЕАПВ Россия, 109012, Москва, Малый Черкасский пер., 2
025542
- 1 -
(19)
025542
- 1 -
(19)
025542
- 1 -
(19)
025542
- 4 -
025542
- 3 -
025542
- 3 -
025542
- 9 -
025542
- 26 -
025542
- 39 -
025542
- 40 -
025542
- 41 -
025542
- 43 -
025542
- 45 -
025542
- 46 -
025542
- 62 -
025542
- 63 -
025542
- 63 -
|
