(57) Реферат / Формула:
Настоящее изобретение относится к применению VCAM-1, ICAM-1 и/или PIGF в качестве биомаркеров для прогнозирования результата лечения афлиберцептом или зив-афлиберцептом пациента, предположительно страдающего от рака.
Евразийское (21) 201891693 (13) A1
патентное
ведомство
(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ЕВРАЗИЙСКОЙ ЗАЯВКЕ
(43) Дата публикации заявки 2018.12.28
(22) Дата подачи заявки 2017.01.24
(51) Int. Cl. G01N33/574 (2006.01)
(54) СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РЕЗУЛЬТАТА ЛЕЧЕНИЯ АФЛИБЕРЦЕПТОМ
ПАЦИЕНТА, ПРЕДПОЛОЖИТЕЛЬНО СТРАДАЮЩЕГО ОТ РАКА, ПОСРЕДСТВОМ ИЗМЕРЕНИЯ УРОВНЯ БИОМАРКЕРА В ПЛАЗМЕ КРОВИ
(31) 16305065.1 (57) Настоящее изобретение относится к примене-
(32) 2016.01.25 нию VCAM-1, ICAM-1 и/или PIGF в качестве био-
(33) EP маркеров для прогнозирования результата лечения
(86) PCT/EP2017/051363 афлиберцептом или зив-афлиберцептом пациента,
(87) WO 2017/129537 2017.08.03 предположительно страдающего от рака.
(71) Заявитель: САНОФИ (FR)
(72) Изобретатель: Широн-Блондель Мариелль, Дрейманн Дженнифер, Паккар
Каролин (FR)
(74) Представитель:
Медведев В.Н. (RU)
ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
2420-551135ЕА/032 СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РЕЗУЛЬТАТА ЛЕЧЕНИЯ АФЛИБЕРЦЕПТОМ ПАЦИЕНТА, ПРЕДПОЛОЖИТЕЛЬНО СТРАДАЮЩЕГО ОТ РАКА, ПОСРЕДСТВОМ ИЗМЕРЕНИЯ УРОВНЯ БИОМАРКЕРА В ПЛАЗМЕ КРОВИ
Настоящее изобретение относится к применению VCAM-1, ICAM-1 и P1GF в качестве биомаркеров для прогнозирования результата лечения афлиберцептом или зив-афлиберцептом пациента, предположительно страдающего от рака.
Афлиберцепт или зив-афлиберцепт, также называемый VEGFR1R2-Fc.DELTA.CI FltlD2.FlklD3.Fc.DELTA.С1 или AVE0005, представляет собой гомодимерный белок, в котором каждый димер содержит два идентичных мономера, каждый из которых является слитым белком, содержащим сигнальную последовательность VEGFR1, слитую с Ig-доменом D2 рецептора VEGFR1, который собственно слит с Ig-доменом D3 рецептора VEGFR2, в свою очередь слитого с Fc-доменом IgGl.
Белковая цепь является гликозилированной N-ацетил-глюкозамином, фукозой, галактозой, маннозой и сиаловыми кислотами, участвующими в образовании углеводных структур. N-связанные олигосахариды состоят главным образом из би-антеннарных структур с одной или двумя концевыми сиаловыми кислотами или без них. Мономер характеризуется аминокислотной последовательностью под SEQ ID №1.
Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) уже одобрило афлиберцепт под торговой маркой EYLEA(r) для лечения пациентов с неоваскулярной (влажной) возрастной макулодистрофией (AMD). В частности, EYLEA(r) является торговой маркой афлиберцепта, полученного, обработанного и составленного для интравитреальной инъекции.
В ходе регистрации афлиберцепта (ZALTRAP(r)) для применения в лечении рака и с учетом утвержденного применения афлиберцепта для лечения AMD, FDA потребовало присвоить другое название (зив-афлиберцепт) соединению, используемому в лечении рака. Таким образом, зив-афлиберцепт является наименованием лекарственного
препарата по Справочнику национальных непатентованных названий США (USAN), официально присвоенным FDA для обозначения фармацевтической композиции, содержащей афлиберцепт в виде полученной, обработанной и составленной формы для инъекции путем внутривенной инфузии. Зив-афлиберцепт был утвержден FDA для продажи под торговой маркой ZALTRAP(r) для лечения метастатического колоректального рака (mCRC).
Европейское агентство по оценке и контролю лекарственных средств (ЕМА) также утвердило ZALTRAP(r), однако не предложило разделить названия для данного соединения. Таким образом, в Европейском союзе название "афлиберцепт" используют независимо от показания.
ZALTRAP(r) и EYLEA(r) получали посредством несколько отличающихся способов. Они оба содержат афлиберцепт или зив-афлиберцепт, но соотношение агрегатов афлиберцепта или зив-афлиберцепта в ZALTRAP(r) и EYLEA(r) несколько отличается.
Утверждение ZALTRAP(r) основывалось на данных, полученных из испытания VELOUR - многоцентрового рандомизированного плацебо-контролируемого испытания III фазы, в котором сравнивали эффективность афлиберцепта в отношении плацебо в комбинации со схемой FOLFIRI для пациентов с mCRC, которых ранее лечили по схеме, предусматривающей оксалиплатин.
Несмотря на эффективность и безопасность лечения рака афлиберцептом, целью остается улучшение идентификации пациентов, которые должны получать большую пользу от лечения.
Действительно, способность идентифицировать пациентов с метастатическим колоректальным раком (mCRC), которые получат пользу от афлиберцепта, дополнительно улучшит клиническую эффективность данного лекарственного средства.
На сегодняшний день не было идентифицировано достоверных прогностических биомаркеров в сыворотке или плазме крови, которые коррелируют с результатами лечения афлиберцептом.
Профилирование образцов опухоли и плазмы крови, полученных от пациентов, участвующих в клинических испытаниях, и последующий анализ их геномных/протеомных и клинических данных,
могли бы обеспечить открытие и потенциальную валидацию прогностических биомаркеров.
Было обнаружено, что высокие уровни VCAM-1, ICAM-1 и/или P1GF в начальный момент времени коррелируют с более короткими показателями времени выживаемости.
Васкулярная молекула клеточной адгезии-1 (VCAM-1), также известная как CD106, характеризуется последовательностью под SEQ ID №1 (эталонная последовательность NCBI: NP_001069.1). Термин "VCAM-1" охватывает ее гомологи и изоформы и их варианты, а также фрагменты последовательностей при условии, что вариантные белки (в том числе изоформы), гомологичные белки и/или фрагменты распознаются одним или несколькими специфическими к VCAM-1 антителами.
Молекула межклеточной адгезии-1 (ICAM-1), также известная как CD54, характеризуется последовательностью под SEQ ID №2
(эталонная последовательность NCBI: NP_000192.2). Термин "ICAM-1" охватывает ее гомологи и изоформы и их варианты, а также фрагменты последовательностей при условии, что вариантные белки
(в том числе изоформы), гомологичные белки и/или фрагменты распознаются одним или несколькими специфическими к ICAM-1 антителами.
"Плацентарный фактор роста" или "P1GF" включает 2 изоформы P1GF1 и P1GF2, которые характеризуются соответственно последовательностями под SEQ ID №3 (эталонная последовательность NCBI: NP_002623.2) и под SEQ ID №4 (эталонная последовательность NCBI: NP_001193941.1) . Термин "P1GF" охватывает P1GF1 и P1GF2, их гомологи и изоформы и их варианты, а также фрагменты последовательностей при условии, что вариантные белки (в том числе изоформы), гомологичные белки и/или фрагменты распознаются одним или несколькими специфическими к P1GF антителами.
Корреляцию между ICAM-1 и исходом у пациентов тестировали в клинических испытаниях, где пациентов лечили бевацизумабом.
Корреляцию между ICAM-1 и исходом у пациентов наблюдали в испытании, в котором пациентов с раком легких лечили бевацизумабом, цисплатином и этопозидом (Horn et al., J Clin
Oncol 2009, 27:6006-6011). Авторы обнаружили, что "у пациентов с высокими уровнями ICAM была незначительная тенденция к улучшению OS по сравнению с пациентами с низкими уровнями", при этом в другом исследовании (Dowlati et al, 2008, Clin Cancer Res 14 (5), 1407) "у пациентов с низким уровнем ICAM в начальный момент времени был более ярко выраженный ответ, чем у пациентов с высоким уровнем ICAM".
Но у пациентов с колоректальным раком, которых лечили бевацизумабом, капецитабином и оксалиплатином, корреляция между ICAM-1 и исходом у пациентов не была обнаружена (Liu et al. Cancer Medicine 2013; 2(2): 234-242).
Эти статьи показывают уровень непредсказуемости между различными исследованиями биомаркеров с одними и теми же биологическими препаратами, т. е. бевацизумабом.
Кроме того, бевацизумаб является антителом к VEGF-A. Афлиберцепт представляет собой химерный белок, а не антитело. Он состоит из частей внеклеточных доменов рецепторов 1 и 2 VEGF человека, слитых с частью Fc IgGl человека. Афлиберцепт связывается не только с VEGF-A, но также с VEGF-B и плацентарным фактором роста (P1GF).
Таким образом, бевацизумаб и афлиберцепт характеризуются
структурой и функциями, весьма отличными друг от друга, и
специалист в данной области не будет непосредственно
экстраполировать результаты, полученные в отношении
бевацизумаба, на афлиберцепт.
Корреляция между VCAM-1 и исходом у пациентов была обнаружена в двух клинических испытаниях, упомянутых выше (Liu et al; Cancer Medicine 2013; 2 (2): 234-242 и Horn et al, J Clin Oncol 2009; 27:6006-6011) . Однако эти два исследования были без режима лечения, предусматривающего плацебо, дающего возможность понять, является ли эффект прогностическим или предсказывающим.
Настоящее изобретение относится к применению VCAM-1, ICAM-1 и/или P1GF в качестве биомаркеров для прогнозирования результата лечения афлиберцептом или зив-афлиберцептом пациента, предположительно страдающего от рака.
Согласно одному аспекту настоящее изобретение
предусматривает способ определения того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом указанного рака, предусматривающий стадию проведения по меньшей мере одного анализа биологического образца пациента для измерения в начальный момент времени уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, где, если уровень биомаркера в биологическом образце является низким по отношению к эталонному уровню экспрессии биомаркера, то пациента идентифицируют как кандидата для терапии в отношении рака.
Согласно другому аспекту настоящее изобретение предусматривает способ определения того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом указанного рака, предусматривающий стадию проведения по меньшей мере одного анализа биологического образца пациента для измерения в начальный момент времени уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, где, если уровень биомаркера в биологическом образце является высоким по отношению к эталонному или пороговому уровню экспрессии биомаркера, то пациента идентифицируют как не являющегося кандидатом для терапии в отношении рака. Пороговый или эталонный уровень экспрессии биомаркера позволяет определить чувствительные и нечувствительные популяции.
Согласно варианту осуществления эталонный уровень экспрессии VCAM-1 находится в диапазоне от около 406 нг/мл до около 57 7 нг/мл. Еще согласно одному эталонный уровень экспрессии VCAM-1 составляет около 553 нг/мл.
Согласно другому варианту осуществления эталонный уровень экспрессии ICAM-1 находится в диапазоне от около 92 нг/мл до около 145 нг/мл. Еще согласно одному эталонный уровень экспрессии ICAM-1 составляет около 144 нг/мл.
Согласно другому варианту осуществления эталонный уровень экспрессии P1GF находится в диапазоне от около 12 нг/мл до около 19 нг/мл. Еще согласно одному эталонный уровень экспрессии P1GF составляет около 17 нг/мл.
Настоящее изобретение также относится к способу лечения пациента с раком с помощью афлиберцепта или зив-афлиберцепта, предусматривающему введение терапевтически эффективного количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта пациенту, где уровень биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, в биологическом образце пациента является низким по отношению к эталонному уровню экспрессии биомаркера.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к способу улучшения выживаемости без прогрессирования заболевания (PFS) и/или общей выживаемости (OS) пациента с раком, предусматривающему введение терапевтически эффективного количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта пациенту, где уровень биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, в биологическом образце пациента является низким по отношению к эталонному уровню экспрессии биомаркера.
Согласно варианту осуществления одного из способов, описанных выше, биологический образец выбран из группы, состоящей из крови, сыворотки и плазмы крови.
Согласно варианту осуществления одного из способов, описанных выше, рак представляет собой рак толстого кишечника, колоректальный рак или рак прямой кишки.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из колоректальный рак представляет собой метастатический колоректальный рак.
Согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения субъекта лечат афлиберцептом и дополнительно подвергают химиотерапевтическому лечению оксалиплатином, 5-фторурацилом (5-FU) и фолиниевой кислотой (т. е. лечению FOLFOX), фолиниевой кислотой, 5-фторурацилом и иринотеканом (т. е. лечению FOLFIRI) или 5-фторурацилом и фолиниевой кислотой (т. е. лечению FUFOL или LV5FU2).
Химиотерапевтическое лечение может объединять по меньшей мере 2, 3, 4, 5, б, 7, 8, 9, 10 или не более 10, 9, 8, 7, б, 5, 4, 3, 2 средств, таких как, например, комбинация оксалиплатина, 5-фторурацила (5-FU) и фолиниевой кислоты (т. е. лечение FOLFOX или модифицированное лечение FOLFOXб, как описано в примере
ниже), комбинация фолиниевой кислоты, 5-фторурацила и иринотекана (т. е. лечение FOLFIRI) или комбинация 5-фторурацила и фолиниевой кислоты (т. е. лечение FUFOL или LV5FU2).
В связи с этим заявка W0 2012146610 относится к способу лечения mCRC с использованием афлиберцепта или зив-афлиберцепта в комбинации с FOLFIRI. Содержание данной заявки включено посредством ссылки.
Согласно варианту осуществления одного из способов, описанных выше, терапевтически эффективные количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта, оксалиплатина, 5-фторурацила (5-FU) и фолиниевой кислоты вводят указанному пациенту.
Согласно варианту осуществления одного из способов, описанных выше, терапевтически эффективные количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта, фолиниевой кислоты, 5-фторурацила (5-FU) и иринотекана вводят указанному пациенту.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, пациенту вводят фолиниевую кислоту в дозе, находящейся в диапазоне от приблизительно 200 мг/м2 до приблизительно 600 мг/м2, 5-фторурацил (5-FU) в дозе, находящейся в диапазоне от приблизительно 2 000 мг/м2 до приблизительно 4 000 мг/м2, иринотекан в дозе, находящейся в диапазоне от приблизительно 100 мг/м2 до приблизительно 300 мг/м2, и афлиберцепт в дозе, находящейся в диапазоне от приблизительно 1 мг/кг до приблизительно 10 мг/кг.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, пациенту вводят фолиниевую кислоту в дозе, составляющей приблизительно 400 мг/м2, 5-фторурацил (5-FU) в дозе, составляющей приблизительно 28 00 мг/м2, иринотекан в дозе, составляющей приблизительно 180 мг/м2, и афлиберцепт в дозе, составляющей приблизительно 4 мг/кг.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, фолиниевую кислоту вводят внутривенно в дозе, составляющей приблизительно 400 мг/м2, 5-фторурацил (5-FU) вводят внутривенно в дозе, составляющей приблизительно 2800 мг/м2, иринотекан вводят внутривенно в дозе, составляющей приблизительно 180 мг/м2, и афлиберцепт вводят внутривенно в
дозе, составляющей приблизительно 4 мг/кг, и при этом комбинацию вводят каждые две недели.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, фолиниевую кислоту, 5-фторурацил (5-FU), иринотекан и афлиберцепт вводят внутривенно каждые две недели в течение периода, находящегося в диапазоне от 9 до 18 недель.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, фолиниевую кислоту вводят внутривенно непосредственно после введения афлиберцепта. Ее также можно вводить внутривенно непосредственно после введения афлиберцепта в течение периода, составляющего приблизительно 2 часа.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, иринотекан вводят внутривенно непосредственно после введения афлиберцепта. Его также можно вводить внутривенно непосредственно после введения афлиберцепта в течение периода, составляющего приблизительно 90 минут.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, 5-фторурацил (5-FU) вводят непосредственно после введения афлиберцепта.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, первое количество 5-фторурацила (5-FU) вводят внутривенно непосредственно после введения афлиберцепта, а второе количество 5-FU вводят внутривенно после первого количества посредством непрерывной инфузии.
Согласно дополнительному варианту осуществления одного из способов, описанных выше, приблизительно 4 00 мг/м2 5-фторурацила (5-FU) вводят внутривенно за период, составляющий от 2 до 4 минут после введения афлиберцепта, и при этом 2400 мг/м2 5-FU вводят внутривенно в течение более около 4 6 часов после введения 4 00 мг/м2 посредством непрерывной инфузии.
Согласно варианту осуществления указанного пациента предварительно лечили с помощью терапии на основе оксалиплатина или бевацизумаба.
Согласно другому варианту осуществления химиотерапия, лучевая терапия или хирургическое вмешательство у указанного
пациента были неудачными.
Настоящее изобретение также относится к применению афлиберцепта или зив-афлиберцепта для лечения пациента, предположительно страдающего от рака, где пациента идентифицировали как имеющего более низкий уровень биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, в биологическом образце по сравнению с эталонным уровнем экспрессии биомаркера.
Настоящее изобретение дополнительно относится к набору для прогнозирования того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом, при этом набор содержит:
a) средства для измерения уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF; и
b) необязательно инструкцию, предоставляющую указания по применению указанного набора в прогнозировании того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом.
Другой аспект настоящего изобретения дополнительно относится к изделию, содержащему
a) упаковочный материал;
b) средства для измерения уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF; и
c) инструкцию, предоставляющую указания по применению
указанного набора в прогнозировании того, является ли пациент,
предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии
афлиберцептом или зив-афлиберцептом.
Вышеуказанные способы и применение по настоящему изобретению могут представлять собой, например, in vitro или ex vivo способы и применение.
Средства для измерения уровня экспрессии белка VCAM-1, ICAM-1 и P1GF хорошо известны из уровня техники и включают иммунологический анализ, такой как анализ ELISA. Например, средства для измерения уровня VCAM-1 включают антитела, специфически связывающиеся с VCAM-1.
Уровень белка VCAM-1 можно определить, например, с
использованием способов иммунологического выявления, таких как анализ ELISA. Способы включают антитело, которое связывается с белком VCAM-1, например моноклональное или поликлональное антитело, вариант или фрагменты антитела, такие как одноцепочечное антитело, диатело, минитело, одноцепочечный Fv-фрагмент (sc(Fv)), sc(Fv)2 антитело, Fab-фрагмент, или F(ab')2-фрагмент, или однодоменное антитело. Такие антитела хорошо известны из уровня техники и являются коммерчески доступными. В частности, их также можно получать путем иммунизации животных
(например, кроликов, крыс или мышей) белком VCAM-1. Антитела можно использовать для определения экспрессии белка в ряде иммунологических анализов, включающих системы конкурентного и неконкурентного анализа, использующие такие методики, как вестерн-блоттинг, иммуногистохимический анализ/иммунофлуоресценция (т. е. выявление белка в фиксированных клетках или тканях), радиоиммунологический анализ, такой как RIA (изотопный иммунологический анализ), ELISA
(ферментный иммуносорбентный анализ), иммунологические анализы
по типу "сэндвич", анализы с использованием реакции
иммунопреципитации, анализы с использованием реакции
иммунодиффузии, анализы с использованием реакции агглютинации,
анализы с использованием реакции связывания комплемента,
иммунорадиометрические анализы, иммунофлуоресцентные анализы,
например FIA (иммунологический флуоресцентный анализ),
хемилюминесцентные иммунологические анализы, ECLIA
(электрохемилюминесцентный иммунологический анализ) и
иммунологические анализы с использованием белка А. Данные анализы являются стандартными и хорошо известны специалисту в данной области (Ausubel et al (1994) Current Protocols in Molecular Biology, Vol. 1, John Wiley & Sons, Inc., New York).
Экспрессию белка VCAM-1 можно определять с помощью протеомного способа, такого как масс-спектрометрические анализы
(LC-MS или LC-MS/MS). Качественные и количественные масс-спектрометрические методики известны и используются в уровне техники. Для этого целевые пептиды, специфические к маркерным белкам, выбирают и количественно определяют на основе
калибровочных кривых, построенных по данным анализа синтетических пептидов, меченых стабильными изотопами. Продукты ферментативного расщепления, в которые добавляли определенное количество меченых изотопами целевых пептидов, анализируют посредством жидкостной хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией. Соотношение меченых и немеченых целевых пептидов измеряли для оценки концентраций целевых пептидов и, следовательно, концентрации маркерного белка.
Средства для измерения уровня экспрессии VCAM-1 могут также включать такие реагенты, как, например, реакционные и/или отмывочные буферы. Средства могут находиться, например, во флаконах или титрационных микропланшетах, или могут быть закрепленными на твердой подложке, такой как микрочип, что может быть в случае для праймеров и зондов.
Аналогичные средства доступны специалисту в данной области для выявления ICAM-1 и P1GF.
Согласно варианту осуществления белки VCAM-1, ICAM-1 и P1GF можно измерять с помощью мультиплексного анализа на основе микросфер, методики Luminex(tm).
Афлиберцепт или зив-афлиберцепт предложен в составе, который не причиняет вреда пациенту, подлежащему лечению.
Согласно варианту осуществления афлиберцепт или зив-афлиберцепт предложен в составе с сахарозой и полисорбатом 2 0 (стабилизаторами), хлоридом натрия, цитратным буфером и натрий-фосфатным буфером, с доведенным до определенного значения рН.
Согласно другому варианту осуществления афлиберцепт или зив-афлиберцепт поставляют в двух формах выпуска лекарственного средства:
форме выпуска со 100 мг афлиберцепта или зив-афлиберцепта/4,0 мл (номинальная концентрация);
второй форме выпуска с 2 00 мг афлиберцепта или зив-афлиберцепта/ 8,0 мл (номинальная концентрация).
Обе формы выпуска изготавливают из одного основного стерильного раствора с концентрацией афлиберцепта или зив-афлиберцепта, составляющей 25 мг/мл.
Перед инфузией пациенту концентрированный раствор разбавляют 0,9% раствором хлорида натрия или 5% декстрозой.
Противораковые средства, которые используют в упомянутом выше способе или применении, предлагают в фармацевтически приемлемом носителе, наполнителе или разбавителе, который не причиняет вреда пациенту, подлежащему лечению.
Фармацевтически приемлемые носители и наполнитель, которые
можно использовать в композициях по настоящему изобретению
включают без ограничения ионообменные вещества, оксид алюминия,
стеарат алюминия, лецитин, самоэмульгирующиеся системы для
доставки лекарственных средств (SEDDS), как, например, d-a-
токоферол полиэтиленгликоль 1000 сукцинат, поверхностно-активные
вещества, используемые в фармацевтических лекарственных формах,
такие как разновидности Tween, или другие подобные полимерные
матрицы для доставки, сывороточные белки, такие как сывороточный
альбумин человека, буферные вещества, такие как фосфаты, глицин,
сорбиновая кислота, сорбат калия, неполные глицеридные смеси
насыщенных растительных жирных кислот, воду, соли или
электролиты, такие как протаминсульфат, натрия фосфат
двузамещенный, вторичный кислый фосфат калия, хлорид натрия,
соли цинка, коллоидный диоксид кремния, трисиликат магния,
поливинилпирролидон, вещества на основе целлюлозы,
полиэтиленгликоль, натрий-карбоксиметилцеллюлозу, полиакрилаты, воски, блок-сополимеры полиэтилена и полиоксипропилена, полиэтиленгликоль и ланолин.
Специалистам в данной области будет понятно, что композиции соответственно составляют так, чтобы они были совместимы с предполагаемым путем введения. Примеры подходящих путей введения включают парентеральный путь, включая, например, внутримышечные, подкожные, внутривенные, внутрибрюшинные или местные внутриопухолевые инъекции. Пероральный путь также можно использовать, при условии, что композиция находится в подходящей для перорального введения форме, способной защитить активное вещество от ферментов желудка и кишечника.
Термин "эффективное количество" относится к количеству лекарственного средства в отдельности или в сочетании с другими
лекарственным средством или схемой лечения, эффективными для
лечения заболевания или нарушения у млекопитающего. В случае
рака терапевтически эффективное количество лекарственного
средства может уменьшать количество раковых клеток; уменьшать
размер опухоли; ингибировать (т. е. замедлять до некоторой
степени и предпочтительно останавливать) инфильтрацию раковых
клеток в периферические органы; ингибировать (т. е. замедлять до
некоторой степени и предпочтительно останавливать) метастазы
опухолей; ингибировать до некоторой степени рост опухоли и/или
уменьшать до некоторой степени один или несколько симптомов,
связанных с нарушением. В соответствии со степенью, с которой
лекарственное средство может предотвращать рост и/или убивать
существующие раковые клетки, оно может быть цитостатическим
и/или цитотоксическим. Например, для терапии рака эффективность
in vivo может быть измерена путем оценки продолжительности
выживаемости, продолжительности выживаемости без
прогрессирования заболевания (PFS), значений частоты ответа (RR), продолжительности ответа и/или качества жизни.
Термины "терапия", "терапевтический", "лечение" и "осуществление лечения" используют в данном документе для характеристики терапевтического способа или способа, который направлен на (1) замедление или остановку прогрессирования, обострения или ухудшения симптомов течения заболевания или болезненного состояния, по отношению к которым используют данный термин; (2) облегчение или осуществление уменьшения интенсивности симптомов течения заболевания или болезненного состояния, по отношению к которым данный термин используют; и/или (3) регрессию или устранение течения заболевания или болезненного состояния, по отношению к которым данный термин используют.
Термин "общая выживаемость (OS)" относится к длительности времени в ходе лечения и после него, в течение которого пациент продолжает жить. Как может оценить специалист в данной области, общая выживаемость пациента улучшается или увеличивается, если пациент относится к подгруппе пациентов, у которой статистически значимое более длительное среднее время выживаемости по
сравнению с другой подгруппой пациентов.
Термин "выживаемость без прогрессирования заболевания (PFS)" относится к длительности времени в ходе лечения и после него, в течение которого, согласно оценке лечащего врача или исследователя, заболевание пациента не ухудшается, т. е. не прогрессирует. Как будет понятно специалисту в данной области, выживаемость без прогрессирования заболевания у пациента улучшается или увеличивается, если пациент принадлежит к подгруппе пациентов с более длительным периодом времени, в течение которого заболевание не прогрессирует, по сравнению со средним значением или средним временем выживаемости без прогрессирования заболевания у контрольной группы пациентов со схожим состоянием.
"Субъектом" или "пациентом" может быть человек или отличное от человека млекопитающее, такое как обезьяны, собаки, кошки, морские свинки, хомяки, кролики, коровы, лошади, козы и овцы.
Термин "эталонный уровень" в данном документе относится к заранее определенному значению. Как будет понятно специалисту в данной области, эталонный уровень предопределен и установлен в соответствии с требованиями в отношении, например, специфичности и/или чувствительности. Эти требования могут различаться, например от одного регулирующего органа к другому. Может быть, например, что чувствительность или специфичность анализа, соответственно, должны быть установлены в определенных пределах, например 80%, 90% или 95%. Такие требования также могут быть определены с точки зрения положительных или отрицательных прогностических значений. Тем не менее, на основе идеи, изложенной в настоящем изобретении, всегда можно будет достичь эталонного уровня, соответствующего этим требованиям. Согласно одному варианту осуществления эталонный уровень определяют у здоровых индивидуумов. Эталонное значение согласно одному варианту осуществления было предопределено для нозологической единицы, к которой принадлежит пациент. Согласно некоторым вариантам осуществления эталонный уровень, например, может быть установлен на любой процент от 25% до 75% от общего распределения значений в исследуемой нозологической единице.
Согласно другим вариантам осуществления эталонный уровень, например, может быть установлен на медиану, тертили или квартили, как определено из общего распределения значений в исследуемой нозологической единице. Согласно одному варианту осуществления эталонный уровень установлен на медианное значение, как определено из общего распределения значений в исследуемой нозологической единице.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
На фигуре 1 представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки PFS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по VCAM-1.
На фигуре 2 представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки OS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по VCAM-1.
На фигуре 3 представлены кривые Каплана-Мейера для конечных точек PFS для чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по ICAM-1.
На фигуре 4 представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки OS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по ICAM-1.
На фигуре 5 представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки PFS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по VCAM-1 и ICAM-1.
На фигуре б представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки OS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по VCAM-1 и ICAM-1.
На фигуре 7 представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки PFS в отношении чувствительных и нечувствительных популяций, определенных по P1GF.
ПРИМЕР. Прогностический эффект VCAM-1, ICAM-1 и/или P1GF в отношении PFS в исследовании AFLAME
ИССЛЕДОВАНИЕ EFC11338 (AFLAME)
EFC11338 разрабатывали как многонациональное
рандомизированное двойное слепое исследование афлиберцепта в сравнении с плацебо с комбинацией иринотекан/5-FU (FOLFIRI) у пациентов с метастатическим колоректальным раком (MCRC) после
отсутствия результата с режимом на основе оксалиплатина. Цели
Идентифицировать потенциальные прогностические биомаркеры для ответа на лечение в конечных точках эффективности (выживаемость без прогрессирования заболевания (PFS), общая выживаемость (OS) и общая частота ответа (ORR)).
Идентифицировать потенциальные прогностические биомаркеры для конечных точек эффективности (PFS, OS и ORR).
Идентифицировать потенциальную корреляцию между
биомаркерами и другими исходными особенностями.
Идентифицировать потенциальную корреляцию длительных измерений в плазме крови с клиническими конечными точками.
Идентифицировать потенциальные группы гомогенных
индивидуумов на основе их молекулярных профилей неконтролируемым образом и оценить корреляцию с клиническими исходами (PFS, OS и ORR) .
Оценить профиль безопасности популяции, идентифицированной при помощи предсказывающих/прогностических биомаркеров. Доза и график введения
Пациентам вводили либо афлиберцепт, либо плацебо, в зависимости от группы лечения, в которую их распределяли. Сразу после этого пациенты получали иринотекан, 5-FU и лейковорин (схема FOLFIRI). Данное лечение повторяли каждые 2 недели.
Афлиберцепт/плацебо.
Группа лечения А, афлиберцепт: 4 мг/кг вводили IV в течение 1 часа в 1 день, каждые 2 недели, или
группа лечения В, плацебо: 4 мг/кг вводили IV в течение 1 часа в 1 день, каждые 2 недели. Схема FOLFIRI
Сразу после введения афлиберцепта/плацебо все пациенты получали:
- иринотекан 180 мг/м2 с помощью IV инфузии в 500 мл D5W в течение 90 минут и dl-лейковорин* 400 мг/м2 с помощью IV инфузии в течение 2 часов, в одно и то же время, в пакетах с применением Y-инфузионной системы, с последующим введением:
- 5-FU 400 мг/м2 в виде болюсного IV введения в течение 2-4 минут, затем:
- 5-FU 2400 мг/м2 в виде непрерывной IV инфузии в 500 мл D5W (рекомендуется)
в течение более 4 6 часов. Продолжительность лечения
Лечение пациента осуществляли до наступления
прогрессирования заболевания, до наступления неприемлемой токсичности или до отказа пациента.
Продолжительность наблюдения
Наблюдение пациентов осуществляли в ходе исследуемого лечения и во время периода последующего наблюдения до смерти или даты завершения исследования в отношении OS, в зависимости от того, что наступало раньше. Дата завершения исследования в отношении OS - один год после последнего зарегистрированного пациента.
Количество субъектов
Популяция, сформированная в зависимости от назначенного лечения (ITT): 332 (109 в группе плацебо+223 в группе афлиберцепта).
Популяция, оцениваемая по частоте ответа: 295 (96 в группе плацебо+199 в группе афлиберцепта).
Оцениваемая по биомаркерам Luminex - группа 1 биомаркеров: 295 (99 в группе плацебо+196 в группе афлиберцепта).
Оцениваемая по биомаркерам Luminex - группа 2 биомаркеров: 108 (37 в группе плацебо+71 в группе афлиберцепта).
Оцениваемая по биомаркерам ELISA: 32 9 (107 в группе плацебо+222 в группе афлиберцепта).
Из-за рабочей ошибки некоторые пациенты, рандомизированные в группу лечения афлиберцептом, получали плацебо в ходе одного или нескольких циклов лечения, или наоборот. В общей сложности 198 пациентов получали по меньшей мере один неправильно собранный набор для лечения.
Критерии оценки
Биомаркеры
Изучали различные типы данных о биомаркерах в текущем
предложении по трансляционным исследованиям в изучении AFLAME:
107 ангиогенных факторов плазмы крови и воспалительных цитокинов, измеренных в начальный момент времени, во время и после лечения (окончание инфузии в цикле 1, 4 8 ч после афлиберцепта/плацебо в цикле 2 или 3, через 30 дней после последнего введения афлиберцепта/плацебо) с использованием методики Luminex(r);
уровни свободных VEGF-A и P1GF, измеренные в образцах плазмы крови в начальный момент времени с использованием методики ELISA (ферментного иммуносорбентного анализа). ПОДГОТОВКА ОБРАЗЦОВ И АНАЛИЗ
Биомаркеры в плазме крови измеряли либо с помощвю методики Luminex(tm) (мулвтиплексный анализ с исполвзованием микросфер) г либо с помощвю ELISA.
Биомаркеры плазмы, измеренные с помощью методики Luminex(tm)
Ангиогенные факторы в плазме крови и воспалительные цитокины измеряли в начальный момент времени перед циклом 1.
Тридцать белков, измеренных во всех образцах, были определены как биомаркеры группы 1, и 7 7 белков, измеренных только для некоторых образцов, были определены как биомаркеры группы 2. Биомаркеры группы 1 представляли собой ангиогенные/воспалительные молекулы и были выбраны на основе механизма действия афлиберцепта (ингибирование 3 ангиогенных факторов и их рецепторов), ключевые кандидатные биомаркеры идентифицировали, исходя из независимых исследований афлиберцепта или литературных источников/экспертов.
Биомаркеры плазмы крови, измеренные с помощью ELISA
Помимо биомаркеров плазмы крови, измеренных с использованием методики Luminex(tm), с помощью методики ELISA измеряли концентрации свободного VEGF-A и свободного P1GF в образцах плазмы крови в начальный момент времени.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Однофакторный анализ
Биомаркеры исследовали в отношении прогностических и предсказывающих эффектов на PFS.
VCAM-1 и ICAM-1 идентифицировали как потенциально прогностические с р-значением, скорректированным поправкой Бенжамини-Хохберга (ВН) , < 0,2 (295 субъектов) .
Затем чувствительные и нечувствительные популяции определяли с использованием VCAM-1 и ICAM-1 (р-значение с ВН < 0,2) .
P1GF идентифицировали как потенциально прогностические с помощью ELISA (нескорректированное р-значение=0, 075) .
Идентификация чувствительных и нечувствительных популяций с помощью VCAM-1
Для определения чувствительных (197 индивидуумов) и нечувствительных (98 индивидуумов) популяций соответственно, соответствующих индивидуумам с низкими значениями уровня VCAM-1 и высокими значениями уровня VCAM-1, определили пороговое значение 6,32, соответствующее 553 нг/мл.
На фигуре 1 и фигуре 2 представлены кривые Каплана-Мейера для конечных точек PFS и OS для чувствительных и нечувствительных популяций, что иллюстрирует лучший эффект лечения для группы с низким уровнем VCAM-1 по сравнению с группой с высоким уровнем VCAM-1. В отношении OS, в дополнение к лучшему эффекту лечения по сравнению с плацебо, чувствительная популяция показала в целом лучший прогноз (повышенная OS для группы с низким уровнем VCAM-1 в группах лечения плацебо и афлиберцептом).
В таблице 1 показана частота ответа для чувствительных и нечувствительных популяций по группе лечения. В чувствительной популяции наблюдали повышенную частоту ответа (26%) на лечение афлиберцептом/folfiri по сравнению с нечувствительной популяцией (10%) .
Таблица 1 - Частота ответа для
нечувствительных/чувствительных популяций, определенных с помощью VCAM-1 для PFS - предварительно обработанные данные -VCAM-1 и оцениваемая популяция RR
Плацебо/ Афлиберцепт/
Популяция
Folfiri Folfiri
Чувствительная по VCAM-1 <= 6,32 (N=189) 3/68 (4%) 31/121 (26%)
Нечувствительная по VCAM-1 > 6,32 (N=94) 1/26 (4%) 7/68 (10%)
Общее количество 4/94 (4%) 38/189 (20%)
Идентификация чувствительных и нечувствительных популяций с помощью I САМ-1
Для определения чувствительных (2 05 индивидуумов) и нечувствительных (90 индивидуумов) популяций соответственно, соответствующих индивидуумам с низкими значениями уровня ICAM-1 и высокими значениями уровня ICAM-1, определили пороговое значение 5,04, соответствующее 144 нг/мл.
На фигуре 3 и фигуре 4 представлены кривые Каплана-Мейера для конечных точек PFS и OS для чувствительных и нечувствительных популяций, что иллюстрирует лучший эффект лечения для группы с низким уровнем ICAM-1 по сравнению с группой с высоким уровнем ICAM-1. В отношении OS, в дополнение к лучшему эффекту лечения по сравнению с плацебо, чувствительная популяция показала в целом лучший прогноз (повышенная OS для группы с низким уровнем ICAM-1 в группах лечения плацебо и афлиберцептом).
В таблице 2 показана частота ответа для чувствительных и нечувствительных популяций по группе лечения. В чувствительной популяции наблюдали повышенную частоту ответа (25%) на лечение афлиберцептом/folfiri по сравнению с нечувствительной популяцией (9%) .
Таблица 2 - Частота
ответа для
нечувствительных/чувствительных популяций,
определенных с
помощью ICAM-1 для PFS - предварительно обработанные данные -
ICAM-1 и оцениваемая популяция RR
Плацебо/
Афлиберцепт/
Популяция
Folfiri
Folfiri
Чувствительная по ICAM-1 <= 5,04 (N=197) 3/63 (5%)
33/134 (25%)
Нечувствительная по ICAM-1 > 5,04 (N=86) 1/31 (3%)
5/55 (9%)
Общее количество 4/94 (4%)
38/189 (20%)
Многофакторный анализ
Многофакторный прогностический
показатель
0,089 х ICAM - 1 + 0,17 х VCAM - 1 дихотомизировали
с использованием
квантиля от 10% до 90% в качестве порогового.
Чувствительная популяция показала значительную разницу в значениях PFS и OS в пользу афлиберцепта по сравнению с плацебо (HR=0,47 для PFS, и HR=0,66 для OS), которые были повышенными по сравнению с нечувствительной популяцией (HR=0,98 для PFS, и HR=1,04 для OS).
Медианная разница значений PFS между афлиберцептом и плацебо составляла 2,59 месяца в чувствительной популяции, демонстрируя большую, но умеренную разницу по сравнению с нечувствительной популяцией (0,5 месяца).
Медианная разница значений OS между афлиберцептом и плацебо составляла 3,75 месяца в чувствительной популяции, демонстрируя большую разницу по сравнению с нечувствительной популяцией (0,3 9 месяца). Для нечувствительной популяции было отмечено уменьшение медианного значения OS для группы плацебо и группы лечения (8,90 месяца и 8,51 месяца) по сравнению с другими популяциями, иллюстрирующими потенциальный предсказывающий эффект многофакторного показателя в дополнение к прогностическому эффекту.
В заключение, чувствительная популяция показала снижение HR по сравнению с нечувствительной популяцией в отношении PFS и OS с умеренным усилением относительно медианы.
На фигуре 5 и фигуре б представлены кривые Каплана-Мейера для конечных точек PFS и OS для чувствительных и нечувствительных популяций, что иллюстрирует лучший эффект лечения для группы с низким показателем по сравнению с группой с высоким показателем. В отношении OS, в дополнение к лучшему эффекту лечения по сравнению с плацебо, чувствительная популяция показала в целом лучший прогноз (повышенная OS для группы с низким показателем в группах лечения плацебо и афлиберцептом).
Идентификация чувствительных и нечувствительных популяций с помощью P1GF
Для определения чувствительных (230 индивидуумов) и нечувствительных (99 индивидуумов) популяций соответственно, соответствующих индивидуумам с низкими значениями уровня P1GF и высокими значениями уровня P1GF, определили пороговое значение 2,82, соответствующее 17 пг/мл.
Фигура 7, на которой представлены кривые Каплана-Мейера для конечной точки PFS для чувствительных и нечувствительных популяций, определенных с помощью P1GF, иллюстрирует определение отсекающего значения P1GF для чувствительных и нечувствительных популяций.
ВЫВОДЫ
VCAM-1 и ICAM-1 идентифицировали как потенциально прогностические биомаркеры для PFS в одномерной структуре (нескорректированное р-значение, равное 0,00017 для VCAM-1 и 0,0043 для ICAM-1).
Третий биомаркер, который оказался потенциально прогностическим, был P1GF, измеренный с помощью ELISA (нескорректированное значение р=0,075).
Линейную комбинацию VCAM-1 и ICAM-1 идентифицировали как потенциально прогностическую для PFS.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> SANOFI
<120> СПОСОБ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ РЕЗУЛЬТАТА ЛЕЧЕНИЯ АФЛИБЕРЦЕПТОМ ПАЦИЕНТА, ПРЕДПОЛОЖИТЕЛЬНО СТРАДАЮЩЕГО ОТ РАКА, ПОСРЕДСТВОМ ИЗМЕРЕНИЯ УРОВНЯ БИОМАРКЕРА В ПЛАЗМЕ КРОВИ
<130> FR2015-020
<160> 4
<170> PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 739
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Pro Gly Lys Met Val Val Ile Leu Gly Ala Ser Asn Ile Leu Trp
1 5 10 15
Ile Met Phe Ala Ala Ser Gln Ala Phe Lys Ile Glu Thr Thr Pro Glu
20 25 30
Ser Arg Tyr Leu Ala Gln Ile Gly Asp Ser Val Ser Leu Thr Cys Ser
35 40 45
Thr Thr Gly Cys Glu Ser Pro Phe Phe Ser Trp Arg Thr Gln Ile Asp
50 55 60
Ser Pro Leu Asn Gly Lys Val Thr Asn Glu Gly Thr Thr Ser Thr Leu
65 70 75 80
Thr Met Asn Pro Val Ser Phe Gly Asn Glu His Ser Tyr Leu Cys Thr
85 90 95
Ala Thr Cys Glu Ser Arg Lys Leu Glu Lys Gly Ile Gln Val Glu Ile
100 105 110
Tyr Ser Phe Pro Lys Asp Pro Glu Ile His Leu Ser Gly Pro Leu Glu
115 120 125
Ala Gly Lys Pro Ile Thr Val Lys Cys Ser Val Ala Asp Val Tyr Pro
130 135 140
Phe Asp Arg Leu Glu Ile Asp Leu Leu Lys Gly Asp His Leu Met Lys
145 150 155 160
Ser Gln Glu Phe Leu Glu Asp Ala Asp Arg Lys Ser Leu Glu Thr Lys
165 170 175
Ser Leu Glu Val Thr Phe Thr Pro Val Ile Glu Asp Ile Gly Lys Val
180 185 190
Leu Val Cys Arg Ala Lys Leu His Ile Asp Glu Met Asp Ser Val Pro
195 200 205
Thr Val Arg Gln Ala Val Lys Glu Leu Gln Val Tyr Ile Ser Pro Lys
210 215 220
Asn Thr Val Ile Ser Val Asn Pro Ser Thr Lys Leu Gln Glu Gly Gly
225 230 235 240
Ser Val Thr Met Thr Cys Ser Ser Glu Gly Leu Pro Ala Pro Glu Ile
245 250 255
Phe Trp Ser Lys Lys Leu Asp Asn Gly Asn Leu Gln His Leu Ser Gly
260 265 270
Asn Ala Thr Leu Thr Leu Ile Ala Met Arg Met Glu Asp Ser Gly Ile
275 280 285
Tyr Val Cys Glu Gly Val Asn Leu Ile Gly Lys Asn Arg Lys Glu Val
290 295 300
Glu Leu Ile Val Gln Glu Lys Pro Phe Thr Val Glu Ile Ser Pro Gly
305 310 315 320
Pro Arg Ile Ala Ala Gln Ile Gly Asp Ser Val Met Leu Thr Cys Ser
325 330 335
Val Met Gly Cys Glu Ser Pro Ser Phe Ser Trp Arg Thr Gln Ile Asp
340 345 350
Ser Pro Leu Ser Gly Lys Val Arg Ser Glu Gly Thr Asn Ser Thr Leu
355 360 365
Thr Leu Ser Pro Val Ser Phe Glu Asn Glu His Ser Tyr Leu Cys Thr
370 375 380
Val Thr Cys Gly His Lys Lys Leu Glu Lys Gly Ile Gln Val Glu Leu
385 390 395 400
Tyr Ser Phe Pro Arg Asp Pro Glu Ile Glu Met Ser Gly Gly Leu Val
405 410 415
Asn Gly Ser Ser Val Thr Val Ser Cys Lys Val Pro Ser Val Tyr Pro
420 425 430
Leu Asp Arg Leu Glu Ile Glu Leu Leu Lys Gly Glu Thr Ile Leu Glu
435 440 445
Asn Ile Glu Phe Leu Glu Asp Thr Asp Met Lys Ser Leu Glu Asn Lys
450 455 460
Ser Leu Glu Met Thr Phe Ile Pro Thr Ile Glu Asp Thr Gly Lys Ala
465 470 475 480
Leu Val Cys Gln Ala Lys Leu His Ile Asp Asp Met Glu Phe Glu Pro
485 490 495
Lys Gln Arg Gln Ser Thr Gln Thr Leu Tyr Val Asn Val Ala Pro Arg
500 505 510
Asp Thr Thr Val Leu Val Ser Pro Ser Ser Ile Leu Glu Glu Gly Ser
515 520 525
Ser Val Asn Met Thr Cys Leu Ser Gln Gly Phe Pro Ala Pro Lys Ile
530 535 540
Leu Trp Ser Arg Gln Leu Pro Asn Gly Glu Leu Gln Pro Leu Ser Glu
545 550 555 560
Asn Ala Thr Leu Thr Leu Ile Ser Thr Lys Met Glu Asp Ser Gly Val
565 570 575
Tyr Leu Cys Glu Gly Ile Asn Gln Ala Gly Arg Ser Arg Lys Glu Val
580 585 590
Glu Leu Ile Ile Gln Val Thr Pro Lys Asp Ile Lys Leu Thr Ala Phe
595 600 605
Pro Ser Glu Ser Val Lys Glu Gly Asp Thr Val Ile Ile Ser Cys Thr
610 615 620
Cys Gly Asn Val Pro Glu Thr Trp Ile Ile Leu Lys Lys Lys Ala Glu
625 630 635 640
Thr Gly Asp Thr Val Leu Lys Ser Ile Asp Gly Ala Tyr Thr Ile Arg
645 650 655
Lys Ala Gln Leu Lys Asp Ala Gly Val Tyr Glu Cys Glu Ser Lys Asn
660 665 670
Lys Val Gly Ser Gln Leu Arg Ser Leu Thr Leu Asp Val Gln Gly Arg
675 680 685
Glu Asn Asn Lys Asp Tyr Phe Ser Pro Glu Leu Leu Val Leu Tyr Phe
690 695 700
Ala Ser Ser Leu Ile Ile Pro Ala Ile Gly Met Ile Ile Tyr Phe Ala
705 710 715 720
Arg Lys Ala Asn Met Lys Gly Ser Tyr Ser Leu Val Glu Ala Gln Lys
725 730 735
Ser Lys Val
<210> 2
<211> 532
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 2
Met Ala Pro Ser Ser Pro Arg Pro Ala Leu Pro Ala Leu Leu Val Leu
1 5 10 15
Leu Gly Ala Leu Phe Pro Gly Pro Gly Asn Ala Gln Thr Ser Val Ser
20 25 30
Pro Ser Lys Val Ile Leu Pro Arg Gly Gly Ser Val Leu Val Thr Cys
35 40 45
Ser Thr Ser Cys Asp Gln Pro Lys Leu Leu Gly Ile Glu Thr Pro Leu
50 55 60
Pro Lys Lys Glu Leu Leu Leu Pro Gly Asn Asn Arg Lys Val Tyr Glu
65 70 75 80
Leu Ser Asn Val Gln Glu Asp Ser Gln Pro Met Cys Tyr Ser Asn Cys
85 90 95
Pro Asp Gly Gln Ser Thr Ala Lys Thr Phe Leu Thr Val Tyr Trp Thr
100 105 110
Pro Glu Arg Val Glu Leu Ala Pro Leu Pro Ser Trp Gln Pro Val Gly
115 120 125
Lys Asn Leu Thr Leu Arg Cys Gln Val Glu Gly Gly Ala Pro Arg Ala
130 135 140
Asn Leu Thr Val Val Leu Leu Arg Gly Glu Lys Glu Leu Lys Arg Glu
145 150 155 160
Pro Ala Val Gly Glu Pro Ala Glu Val Thr Thr Thr Val Leu Val Arg
165 170 175
Arg Asp His His Gly Ala Asn Phe Ser Cys Arg Thr Glu Leu Asp Leu
180 185 190
Arg Pro Gln Gly Leu Glu Leu Phe Glu Asn Thr Ser Ala Pro Tyr Gln
195 200 205
Leu Gln Thr Phe Val Leu Pro Ala Thr Pro Pro Gln Leu Val Ser Pro
210 215 220
Arg Val Leu Glu Val Asp Thr Gln Gly Thr Val Val Cys Ser Leu Asp
225 230 235 240
Gly Leu Phe Pro Val Ser Glu Ala Gln Val His Leu Ala Leu Gly Asp
245 250 255
Gln Arg Leu Asn Pro Thr Val Thr Tyr Gly Asn Asp Ser Phe Ser Ala
260 265 270
Lys Ala Ser Val Ser Val Thr Ala Glu Asp Glu Gly Thr Gln Arg Leu
275 280 285
Thr Cys Ala Val Ile Leu Gly Asn Gln Ser Gln Glu Thr Leu Gln Thr
290 295 300
Val Thr Ile Tyr Ser Phe Pro Ala Pro Asn Val Ile Leu Thr Lys Pro
305 310 315 320
Glu Val Ser Glu Gly Thr Glu Val Thr Val Lys Cys Glu Ala His Pro
325 330 335
Arg Ala Lys Val Thr Leu Asn Gly Val Pro Ala Gln Pro Leu Gly Pro
340 345 350
Arg Ala Gln Leu Leu Leu Lys Ala Thr Pro Glu Asp Asn Gly Arg Ser
355 360 365
Phe Ser Cys Ser Ala Thr Leu Glu Val Ala Gly Gln Leu Ile His Lys
370 375 380
Asn Gln Thr Arg Glu Leu Arg Val Leu Tyr Gly Pro Arg Leu Asp Glu
385 390 395 400
Arg Asp Cys Pro Gly Asn Trp Thr Trp Pro Glu Asn Ser Gln Gln Thr
405 410 415
Pro Met Cys Gln Ala Trp Gly Asn Pro Leu Pro Glu Leu Lys Cys Leu
420 425 430
Lys Asp Gly Thr Phe Pro Leu Pro Ile Gly Glu Ser Val Thr Val Thr
435 440 445
Arg Asp Leu Glu Gly Thr Tyr Leu Cys Arg Ala Arg Ser Thr Gln Gly
450 455 460
Glu Val Thr Arg Lys Val Thr Val Asn Val Leu Ser Pro Arg Tyr Glu
465 470 475 480
Ile Val Ile Ile Thr Val Val Ala Ala Ala Val Ile Met Gly Thr Ala
485 490 495
Gly Leu Ser Thr Tyr Leu Tyr Asn Arg Gln Arg Lys Ile Lys Lys Tyr
500 505 510
Arg Leu Gln Gln Ala Gln Lys Gly Thr Pro Met Lys Pro Asn Thr Gln
515 520 525
Ala Thr Pro Pro 530
<210> 3
<211> 170
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 3
Met Pro Val Met Arg Leu Phe Pro Cys Phe Leu Gln Leu Leu Ala Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Pro Ala Val Pro Pro Gln Gln Trp Ala Leu Ser Ala Gly
20 25 30
Asn Gly Ser Ser Glu Val Glu Val Val Pro Phe Gln Glu Val Trp Gly
35 40 45
Arg Ser Tyr Cys Arg Ala Leu Glu Arg Leu Val Asp Val Val Ser Glu
50 55 60
Tyr Pro Ser Glu Val Glu His Met Phe Ser Pro Ser Cys Val Ser Leu
65 70 75 80
Leu Arg Cys Thr Gly Cys Cys Gly Asp Glu Asn Leu His Cys Val Pro
85 90 95
Val Glu Thr Ala Asn Val Thr Met Gln Leu Leu Lys Ile Arg Ser Gly
100
105
110
Asp Arg Pro Ser Tyr Val Glu Leu Thr Phe Ser Gln His Val Arg Cys
115 120 125
Glu Cys Arg Pro Leu Arg Glu Lys Met Lys Pro Glu Arg Arg Arg Pro
130 135 140
Lys Gly Arg Gly Lys Arg Arg Arg Glu Lys Gln Arg Pro Thr Asp Cys
145 150 155 160
His Leu Cys Gly Asp Ala Val Pro Arg Arg 165 170
<210> 4
<211> 149
<212> БЕЛОК
<213> Homo sapiens
<400> 4
Met Pro Val Met Arg Leu Phe Pro Cys Phe Leu Gln Leu Leu Ala Gly
1 5 10 15
Leu Ala Leu Pro Ala Val Pro Pro Gln Gln Trp Ala Leu Ser Ala Gly
20 25 30
Asn Gly Ser Ser Glu Val Glu Val Val Pro Phe Gln Glu Val Trp Gly
35 40 45
Arg Ser Tyr Cys Arg Ala Leu Glu Arg Leu Val Asp Val Val Ser Glu
50 55 60
Tyr Pro Ser Glu Val Glu His Met Phe Ser Pro Ser Cys Val Ser Leu
65 70 75 80
Leu Arg Cys Thr Gly Cys Cys Gly Asp Glu Asn Leu His Cys Val Pro
85 90 95
Val Glu Thr Ala Asn Val Thr Met Gln Leu Leu Lys Ile Arg Ser Gly
100 105 110
Asp Arg Pro Ser Tyr Val Glu Leu Thr Phe Ser Gln His Val Arg Cys
115 120 125
Glu Cys Arg Pro Leu Arg Glu Lys Met Lys Pro Glu Arg Cys Gly Asp
130 135 140
Ala Val Pro Arg Arg 145
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
1. Применение биомаркера, выбранного из группы, состоящей
из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, для прогнозирования результата лечения
афлиберцептом или зив-афлиберцептом пациента, предположительно
страдающего от рака.
2. Способ определения того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом указанного рака, предусматривающий стадию проведения по меньшей мере одного анализа биологического образца пациента для измерения в начальный момент времени уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, где, если уровень биомаркера в биологическом образце является низким по отношению к эталонному уровню экспрессии биомаркера, то пациента идентифицируют как кандидата для терапии в отношении рака.
3. Способ определения того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом указанного рака, предусматривающий стадию проведения по меньшей мере одного анализа биологического образца пациента для измерения в начальный момент времени уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, где, если уровень биомаркера в биологическом образце является высоким по отношению к эталонному уровню экспрессии биомаркера, то пациента идентифицируют как не являющегося кандидатом для терапии в отношении рака.
4. Способ лечения пациента с раком с помощью афлиберцепта или зив-афлиберцепта, предусматривающий введение терапевтически эффективного количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта пациенту, где уровень биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, в биологическом образце пациента ниже, чем эталонный уровень экспрессии биомаркера.
5. Способ лечения пациента с раком с помощью афлиберцепта или зив-афлиберцепта, предусматривающий введение пациенту терапевтически эффективного количества афлиберцепта или зив-афлиберцепта, где уровни VCAM-1 и ICAM-1 в биологическом образце
4.
пациента ниже, чем соответствующие эталонные уровни экспрессии VCAM-1 и ICAM-1.
6. Способ определения того, является ли пациент,
предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии
афлиберцептом или зив-афлиберцептом указанного рака,
предусматривающий стадию проведения по меньшей мере одного
анализа биологического образца пациента для измерения
соответствующих уровней VCAM-1 и ICAM-1 в начальный момент
времени, где, если уровни VCAM-1 и ICAM-1 в биологическом
образце являются низкими по отношению к соответствующим уровням
экспрессии VCAM-1 и ICAM-1, то пациента идентифицируют как
кандидата для терапии в отношении рака.
7. Способ по любому из пп. 2-6, где уровень, измеренный по отношению к эталонному уровню экспрессии VCAM-1, находится в диапазоне от около 406 до около 577 нг/мл.
8. Способ по любому из пп. 2-6, где уровень, измеренный по отношению к эталонному уровню экспрессии VCAM-1, составляет около 553 нг/мл.
9. Способ по любому из пп. 2-6, где уровень, измеренный по отношению к эталонному уровню экспрессии ICAM-1, находится в диапазоне от около 92 до около 145 нг/мл.
10. Способ по любому из пп. 2-6, где пороговый уровень ICAM-1 для определения чувствительных и нечувствительных популяций составляет около 144 нг/мл.
11. Способ по любому из пп. 2-6, где уровень, измеренный по отношению к эталонному уровню экспрессии P1GF, находится в диапазоне от около 12 до около 19 пг/мл.
12. Способ по любому из пп. 2-6, где уровень, измеренный по отношению к эталонному уровню экспрессии P1GF, составляет около 17 пг/мл.
13. Способ по любому из пп. 4-14, где биологический образец выбран из группы, состоящей из крови, сыворотки и плазмы крови.
14. Способ по любому из пп. 4-15, где рак представляет собой рак толстого кишечника, колоректальный рак или рак прямой кишки.
15. Способ по п. 16, где колоректальный рак представляет
собой метастатический колоректальный рак.
16. Способ по любому из пп. 4-17, где определяемый уровень VCAM-1, ICAM-1 и/или P1GF представляет собой циркулирующий в крови уровень.
17. Способ по любому из пп. 4-18, где указанный способ предусматривает введение указанному пациенту терапевтически эффективных количеств афлиберцепта или зив-афлиберцепта, фолиниевой кислоты, 5-фторурацила (5-FU) и иринотекана.
18. Афлиберцепт или зив-афлиберцепт для применения в лечении пациента, предположительно страдающего от рака, где пациент был идентифицирован как имеющий более низкий уровень биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF, в биологическом образце по сравнению с эталонным уровнем экспрессии биомаркера.
19. Набор для прогнозирования того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом, при этом набор содержит
a) средства для измерения уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF; и
b) необязательно инструкцию, предоставляющую указания по применению указанного набора в прогнозировании того, является ли пациент, предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии афлиберцептом или зив-афлиберцептом.
20. Изделие, содержащее
a) упаковочный материал;
b) средства для измерения уровня биомаркера, выбранного из группы, состоящей из VCAM-1, ICAM-1 и P1GF; и
c) инструкцию, предоставляющую указания по применению
указанного набора в прогнозировании того, является ли пациент,
предположительно страдающий от рака, кандидатом для терапии
афлиберцептом или зив-афлиберцептом.
По доверенности
1 1 1 1 1 1 г
О 3 6 9 12 15 18 21
Количество с риском Время (месяцы)
Низкий, плацебо 71 56 23 7 1 § О О
Низкий, с лечением 126 102 76 35 14 10 3 1
Высокий, плацебо 28 20 14 5 1 1 § 0
Высокий, с лечением 70 45 26 10 3 1 § 0
се О.
QJ ЗВ
сё Я ее Ч С св
се 'Л
Количество с риском
Низкий, плацебо 71 Низкий, с лечением 128 Высокий,плацебо 28 Высокий, с лечением 70
Время (месяцы)
121
113
се S3
ч с
03 03
'-г я
Количество с риском
Низкий, плацебо 67 55
Низкий, с лечением 138 108
Высокий, плацебо 32 21
Высокий, с лечением 58 39
25 81
9^ *1l <2
Время (месяцы)
7 0
38 15
6 2
0 9 1
-2 0 О
о о о 1
ее " I
ее В ее Ч В ее
й> КГ
оо о"
|> ф
2.4
Количество с риском
Время (месяцы)
Низкий, плацебо 67
Низкий, с лечением 138
134
125
110
Высокий, плацебо 32
Высокий, с лечением 58
Общая модель (HR=0,59, р=0,00016) - скорректированная в отношении предсказывающих факторов
I I ! i I I I Г
О 3 6 9 12 15 18 21
Количество с риском Время (месяцы)
Низкий, плацебо 75 59 26 8 1 0 0 0
Низкий, с лечением 135 107 79 38 15 11 3 1
Высокий, плацебо 24 17 11 4 1 1 0 §
Высокий, с лечением 61 40 23 7 2 О 0 §
Общая модель (HR=0,77, р=0,074) - скорректированная в отношении предсказывающих факторов
ее Я ее
ее Я Я
12 15
Количество с риском
Время (месяцы)
Низкий, плацебо 75
37 23
Низкий, с лечением 135
12"
121
107
92 64
Высокий, плацебо 24
7 6
Высокий, с лечением 61
19 15
(19)
(19)
(19)
ФИГ. 1
Общая модель (HR=0,59, р=0,00021)
ФИГ. 1
Общая модель (HR=0,59, р=0,00021)
ФИГ. 2
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 2
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 2
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 2
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 3
Общая модель (HR=0,59, р=0,00021)
ФИГ. 3
Общая модель (HR=0,59, р=0,00021)
ФИГ. 4
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 4
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 4
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 4
Общая модель (HR=0,79, р=0,11)
ФИГ. 7
Общая модель (HR=0,62, р=0,00037)
ФИГ. 7
Общая модель (HR=0,62, р=0,00037)
