EA201791569A1 20180131 Номер и дата охранного документа [PDF] EAPO2018\PDF/201791569 Полный текст описания [**] EA201791569 20160115 Регистрационный номер и дата заявки US62/104,785 20150118 Регистрационные номера и даты приоритетных заявок US2016/013716 Номер международной заявки (PCT) WO2016/115530 20160721 Номер публикации международной заявки (PCT) EAA1 Код вида документа [PDF] eaa21801 Номер бюллетеня [**] СПОСОБ И СИСТЕМА ОПРЕДЕЛЕНИЯ СТАТУСА ЗЛОКАЧЕСТВЕННОЙ ОПУХОЛИ Название документа [8] G06F 19/18, [8] G06F 19/24, [8] C12Q 1/68 Индексы МПК [US] Чжан Кан, [CN] Хоу Жуй, [CN] Чжэн Лянхун Сведения об авторах [US] ЗЕ РЕДЖЕНТС ОФ ЗЕ ЮНИВЕРСИТИ ОФ КАЛИФОРНИЯ, [KY] ЮСХЕЛС БАЙОТЕК, ЛИМИТЕД Сведения о заявителях
 

Патентная документация ЕАПВ

 
Запрос:  ea201791569a*\id

больше ...

Термины запроса в документе

Реферат

[RU]

Настоящее изобретение относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения типа злокачественной опухоли у индивидуума. Настоящее изобретение также относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью и композициям для создания базы данных по профилям метилирования CpG.


Полный текст патента

(57) Реферат / Формула:

Настоящее изобретение относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения типа злокачественной опухоли у индивидуума. Настоящее изобретение также относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью и композициям для создания базы данных по профилям метилирования CpG.


(19)
Евразийское
патентное
ведомство
(21) 201791569 (13) A1
(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ЕВРАЗИЙСКОЙ ЗАЯВКЕ
(43) Дата публикации заявки 2018.01.31
(22) Дата подачи заявки 2016.01.15
(51) Int. Cl.
G06F19/18 (2011.01) G06F19/24 (2011.01) C12Q1/68 (2006.01)
(54) СПОСОБ И СИСТЕМА ОПРЕДЕЛЕНИЯ СТАТУСА ЗЛОКАЧЕСТВЕННОЙ ОПУХОЛИ
(31) (32) (33)
(86) (87) (71)
(72)
(74)
62/104,785; 14/986,520 2015.01.18; 2015.12.31
PCT/US2016/013716
WO 2016/115530 2016.07.21
Заявитель:
ЗЕ РЕДЖЕНТС ОФ ЗЕ ЮНИВЕРСИТИ ОФ КАЛИФОРНИЯ (US); ЮСХЕЛС БАЙОТЕК, ЛИМИТЕД (KY)
Изобретатель:
Чжан Кан (US), Хоу Жуй, Чжэн Лянхун (CN)
Представитель: Строкова О.В. (RU)
(57) Настоящее изобретение относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения типа злокачественной опухоли у индивидуума. Настоящее изобретение также относится к способам, системам, платформам, машиночитаемому носителю с постоянной записью и композициям для создания базы данных по профилям метилирования CpG.
1-H I
СПОСОБ И СИСТЕМА ОПРЕДЕЛЕНИЯ СТАТУСА ЗЛОКАЧЕСТВЕННОЙ
ОПУХОЛИ
ОПИСАНИЕ Ссылка на родственную заявку
Согласно настоящей заявке испрашивается преимущество в соответствии с предварительной заявкой на выдачу патента США № 62/104785, поданной 18 января 2015 года, настоящая заявка является продолжающей заявкой для заявки на выдачу патента США № 14/986520, поданной 31 декабря 2015 года, при этом все эти заявки включены в настоящий документ посредством отсылки.
Перечень последовательностей
Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который был представлен в формате ASCII посредством приложения EFS-Web и, таким образом, включен в настоящий документ посредством отсылки в полном его объеме. Указанная копия в формате ASCII, созданная 12 января 2016 года, названа 49697-701.601_SL.txt и имеет размер 846 килобайт.
Область техники, к которой относится настоящее изобретение
Злокачественная опухоль является основной причиной смертности во всем мире, при этом ожидают, что ежегодные случаи увеличатся с 14 миллионов в 2012 году до 22 миллионов за следующие два десятилетия (ВОЗ). Диагностические процедуры в некоторых случаях начинают только после того, как у пациента уже присутствуют симптомы, что приводит к дорогостоящим, инвазивным и времязатратным процедурам. Помимо всего прочего, точной диагностике иногда препятствуют недоступные области. Кроме того, с поздним диагнозом ассоциированы высокие показатели заболеваемости злокачественной опухолью и смертности от нее.
Краткое раскрытие настоящего изобретения
В соответствии с некоторыми вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения типа злокачественной опухоли у индивидуума. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее
изобретение также относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для ранней детекции злокачественной опухоли. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с еще дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для распознания различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения прогноза злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, прогнозирования ответа на лечение и отслеживания ответа на лечение. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для создания базы данных по профилям метилирования CpG и зондам, применяемым для создания данных по метилированию CpG.
Настоящее изобретение относится, в соответствии с некоторыми вариантами осуществления, к вычислительной платформе для использования данных по злокачественному метилированию CpG для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, включающей:
(а) первое вычислительное устройство, содержащее процессор, модуль памяти, операционную систему и компьютерную программу, включающую исполняемые процессором инструкции для создания приложения для сбора данных с целью получения данных по метилированию CpG из набора биологических образцов, причем приложение для сбора данных содержит: (1) модуль секвенирования, способный работать с устройством для секвенирования с целью создания данных по метилированию CpG из набора биологических образцов, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец;
причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; а также первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и (2) модуль приема данных, способный осуществлять прием:
(i) первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
(ii) второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и
(ш)третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и
(b) второе вычислительное устройство, содержащее процессор, модуль памяти, операционную систему и компьютерную программу, включающую инструкции, исполняемые процессором, для создания приложения для анализа данных с целью создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем приложение для анализа данных содержит модуль для анализа данных, способный:
(1) создавать набор данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
(2) анализировать набор данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(i) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(ii) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, создание набора данных по попарным различиям метилирования предусматривает: (а) вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных; (Ь) вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и (с) вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, создание набора данных по попарным различиям метилирования дополнительно основано на вычисленном различии первой пары наборов данных, вычисленном различии второй пары наборов данных и вычисленном различии третьей пары наборов данных.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает способ полуконтролируемого обучения или способ неконтролируемого обучения. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из
одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, данные по метилированию CpG получают из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, модуль для анализа данных дополнительно способен анализировать экстрагированную геномную ДНК способом секвенирования следующего поколения для получения данных по метилированию CpG. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ секвенирования следующего поколения представляет собой способ секвенирования с применением цифровой ПНР.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 15-18. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 15. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 16. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 17. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880, cgl5797834, cg27125093,cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145, cgl1252953, cgl8456621,cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721, cg27023597,
cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927,cg08480068, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538,cg22460896, cg07116712, cgl0186131, cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756, cg03569637, cg02522196,cgl1655490,cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751, cg25954028, cgl4642045,cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472, cgl4999168, cg09399878, cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526,cg00862408, cgl6260696,cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087, cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392,cg26769700, cg03218479,cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852,cg25652701,cg00282244, cgl8887230,cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669,cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907,cgl3597051, cgl8113826,cg04859102, cg01620360,cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192,cg05614346,cg06439655, cgl1334870,cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280,cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918,cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220,cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 iicg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927,cg26769700, cg25574765,cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415,cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213,cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833,cgl4556909,cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353,cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080,cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530,cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205,cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3 или 4 биомаркера, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой метастатический тип злокачественной опухоли или рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные
опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), злокачественную фиброзную гистиоцитомную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому,
неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, овариальную злокачественную опухоль, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз,
злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контрольный набор данных включает набор профилей метилирования, причем каждый указанный профиль метилирования создан на основе биологического образца, полученного из известного типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают бесклеточный биологический образец. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец циркулирующей опухолевой ДНК. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец биопсии. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец ткани.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к вычислительной системе, содержащей процессор, модуль памяти, операционную систему, способную исполнять машиночитаемые инструкции, и компьютерную программу, включающую исполняемые процессором инструкции для создания приложения для анализа с целью создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем приложение для анализа содержит:
(а) модуль приема данных, способный осуществлять прием:
(1) первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
(2) второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и
(3) третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой
(1)
набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и (Ь) модуль для анализа данных, способный:
(1) создавать набор данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
(2) анализировать набор данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(i) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(ii) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к реализуемому на компьютере способу создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, предусматривающему:
a. создание данных по метилированию CpG из набора биологических образцов способом секвенирования, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и причем первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
b. получение с помощью первого процессора первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор
данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
c. получение с помощью первого вычислительного устройства второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью первого вычислительного устройства третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными;
e. создание с помощью второго процессора набора данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
f. анализ набора данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(1) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(2) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, стадия е) дополнительно предусматривает (а) вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных; (Ь) вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и (с) вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, стадия е) дополнительно предусматривает создание набора данных по попарным различиям метилирования с помощью второго процессора из вычисленного различия первой пары наборов данных, вычисленного различия второй пары наборов данных и вычисленного различия третьей пары наборов данных.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает способ полуконтролируемого обучения или способ неконтролируемого обучения. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, данные по метилированию CpG получают из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 15-18. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 15. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит
приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 16. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 17. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113,
eg12042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cgO1681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 cgl3924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cg24166457, cgl3911392, cg04858553, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cgO1657186, cg03758697, cg24480810, cgl6402452, cg09399878, cg00220455, cg20136100, cg00242035, cg04888360, cg05931497, cgl4633252, cg02609337,
cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023,cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351,cg23429794,cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226,cg06482498,cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287,cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731,cg21461981,cg25765104, cg26394055,cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343,cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157,cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964,cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795,cgl5341833,cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005,cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852,cg23824762, cg23021796,cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668,
cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3 или 4 биомаркера, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM),
волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), злокачественную фиброзную гистиоцитомную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, овариальную злокачественную опухоль, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы, первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы,
саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную
опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контрольный набор данных включает набор профилей метилирования, причем каждый указанный профиль метилирования создан на основе биологического образца, полученного из известного типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают бесклеточный биологический образец. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец циркулирующей опухолевой ДНК. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец биопсии. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец ткани.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к реализуемому на компьютере способу диагностики злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, предусматривающему:
a. получение с помощью первого процессора четвертой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от четвертого злокачественного биологического образца и четвертого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от четвертого злокачественного биологического образца, образуют седьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют восьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, и четвертый злокачественный биологический образец и четвертый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
b. получение с помощью первого процессора пятой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого нормального биологического образца и шестого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого нормального биологического образца, образуют девятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от
шестого нормального биологического образца, образуют десятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой нормальные биологические образцы являются различными;
c. получение с помощью первого процессора шестой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого злокачественного биологического образца и шестого злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого злокачественного биологического образца, образуют одиннадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого злокачественного биологического образца, образуют двенадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой злокачественные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью второго процессора второго набора данных по попарным различиям метилирования из четвертой, пятой и шестой пары наборов данных; и
e. анализ второго набора данных по попарным различиям метилирования с помощью описанной выше базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем корреляция между вторым набором данных по попарным различиям метилирования и профилем метилирования CpG в рамках базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли определяет тип злокачественной опухоли у индивидуума.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, первый процессор находится на первом вычислительном устройстве, а второй процессор находится на втором вычислительном устройстве. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ дополнительно предусматривает реализацию режима лечения на основе диагностированного типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изображение относится к реализуемому на компьютере способу дифференцирования первичной опухоли от метастатической злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, предусматривающему:
а. получение с помощью первого процессора четвертой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от четвертого
злокачественного биологического образца и четвертого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от четвертого злокачественного биологического образца, образуют седьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют восьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, и четвертый злокачественный биологический образец и четвертый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
b. получение с помощью первого процессора пятой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого нормального биологического образца и шестого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого нормального биологического образца, образуют девятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого нормального биологического образца, образуют десятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой нормальные биологические образцы являются различными;
c. получение с помощью первого процессора шестой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого злокачественного биологического образца и шестого злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого злокачественного биологического образца, образуют одиннадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого злокачественного биологического образца, образуют двенадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой злокачественные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью второго процессора второго набора данных по попарным различиям метилирования из четвертой, пятой и шестой пары наборов данных; и
e. анализ второго набора данных по попарным различиям метилирования с помощью описанной выше базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем корреляция между вторым набором
данных по попарным различиям метилирования и профилем метилирования CpG в рамках базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли дифференцирует первичную опухоль от метастатической злокачественной опухоли у индивидуума. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к реализуемому на компьютере способу отслеживания прогрессирования злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, предусматривающему:
a. получение с помощью первого процессора четвертой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от четвертого злокачественного биологического образца и четвертого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от четвертого злокачественного биологического образца, образуют седьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют восьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, и четвертый злокачественный биологический образец и четвертый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
b. получение с помощью первого процессора пятой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого нормального биологического образца и шестого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого нормального биологического образца, образуют девятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого нормального биологического образца, образуют десятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой нормальные биологические образцы являются различными;
c. получение с помощью первого процессора шестой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого злокачественного биологического образца и шестого злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого злокачественного биологического образца, образуют одиннадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого злокачественного биологического образца,
образуют двенадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой злокачественные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью второго процессора второго набора данных по попарным различиям метилирования из четвертой, пятой и шестой пары наборов данных; и
e. анализ второго набора данных по попарным различиям метилирования с помощью описанной выше базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем корреляция между вторым набором данных по попарным различиям метилирования и профилем метилирования CpG в рамках базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли определяет, есть ли прогрессирование злокачественной опухоли у индивидуума.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, индивидуумом было получено лечение перед получением первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к реализуемому на компьютере способу определения прогрессирования злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, предусматривающему:
a. получение с помощью первого процессора четвертой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от четвертого злокачественного биологического образца и четвертого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от четвертого злокачественного биологического образца, образуют седьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют восьмой набор данных в рамках четвертой пары наборов данных, и четвертый злокачественный биологический образец и четвертый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
b. получение с помощью первого процессора пятой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого нормального биологического образца и шестого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого нормального
биологического образца, образуют девятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого нормального биологического образца, образуют десятый набор данных в рамках пятой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой нормальные биологические образцы являются различными;
c. получение с помощью первого процессора шестой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от пятого злокачественного биологического образца и шестого злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от пятого злокачественного биологического образца, образуют одиннадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от шестого злокачественного биологического образца, образуют двенадцатый набор данных в рамках шестой пары наборов данных, и четвертый, пятый и шестой злокачественные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью второго процессора второго набора данных по попарным различиям метилирования из четвертой, пятой и шестой пары наборов данных; и
e. анализ второго набора данных по попарным различиям метилирования с помощью описанной выше базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем корреляция между вторым набором данных по попарным различиям метилирования и профилем метилирования CpG в рамках базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли определяет прогноз злокачественной опухоли у индивидуума.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, прогноз злокачественной опухоли коррелирует со стадией злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, прогноз злокачественной опухоли не коррелирует со стадией злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, прогноз злокачественной опухоли указывает на потенциальную возможность ответа на лечение у индивидуума.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к панели зондов, содержащей множество зондов, каждый зонд является зондом с формулой I:
Формула I
где:
А является первым связывающим цель участком; В является вторым связывающим цель участком; и L является линкерным участком;
где А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 30 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775; В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 12 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775; L присоединен к А; а В присоединен либо к А, либо к L. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, L присоединен к А, а В присоединен к L. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, множество зондов представляет собой по меньшей мере 10, 20, 30, 50, 100 или более зондов. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, множество проб применяют в реакции секвенирования следующего поколения в растворе для создания данных по метилированию CpG. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, реакция секвенирования следующего поколения в растворе представляет собой способ секвенирования с применением капельной цифровой ПЦР. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, каждый зонд коррелирует с сайтом CpG. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, L составляет в длину от 10 до 60, от 15 до 55, от 20 до 50, от 25 до 45 и от 30 до 40 нуклеотидов. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, L дополнительно содержит адапторный участок. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, адапторный участок содержит последовательность, применяемую для идентификации каждого зонда.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к машиночитаемому носителю с постоянной записью с сохраненными на нем инструкциями, которые при выполнении процессором осуществляют стадии, предусматривающие:
создание данных по метилированию CpG из набора биологических образцов способом секвенирования, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и причем первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
получение с помощью первого процессора первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
получение с помощью первого вычислительного устройства второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
получение с помощью первого вычислительного устройства третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG,
полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными;
e. создание с помощью второго процессора набора данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
f. анализ набора данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(1) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(2) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, стадия е) дополнительно предусматривает (а) вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных; (Ь) вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и (с) вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, стадия е) дополнительно предусматривает создание набора данных по попарным различиям метилирования с помощью второго процессора из вычисленного различия первой пары наборов данных, вычисленного различия второй пары наборов данных и вычисленного различия третьей пары наборов данных.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает способ полуконтролируемого обучения или способ неконтролируемого обучения. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из
одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, данные по метилированию CpG получают из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 15-18. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 15. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 16. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 17. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 или 100 биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблицы 18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880, cgl5797834, cg27125093,cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145, cgl1252953, cgl8456621,cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721, cg27023597, cg02782634,cgl8942579,cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538,cg22460896, cg07116712, cgl0186131,
cg06380123
cgl8610205
cgl2353452
cgl0590292
cg00037681
cg05596756
cg03569637,
cg02522196, cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751, cg25954028, cgl4642045, cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472, cgl4999168, cg09399878, cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137,cg24301930, cgl3395086,cg20136100, cg09153080,cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978,cg25225070,cg20411756, cg24247537,cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392,cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128,cgl9421584, cgl7984956,cg05177060, cg24107852,cg25652701,cg00282244, cgl8887230,cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023,cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130,cgl2098228,cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513,cg01456691, cgl7207512,cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870,cg08912922, cg23021796,cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918,cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055,cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из cg25922751,
cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343,cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157,cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964,cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795,cgl5341833,cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005,cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852,cg23824762, cg23021796,cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3 или 4 биомаркера, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому,
хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), злокачественную фиброзную гистиоцитомную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, овариальную злокачественную опухоль, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль,
злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы, первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи,
злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контрольный набор данных включает набор профилей метилирования, причем каждый указанный профиль метилирования создан на основе биологического образца, полученного из известного типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают бесклеточный биологический образец. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец циркулирующей опухолевой ДНК. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец биопсии. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец ткани.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способу определения наличия злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, предусматривающему: (а) обработку экстрагированной геномной ДНК дезаминирующим средством для получения обработанной геномной ДНК, содержащей дезаминированные нуклеотиды, причем экстрагированная геномная ДНК получена из биологического образца от индивидуума; (Ь) создание профиля метилирования, содержащего один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы
20, из обработанной геномной ДНК; и (с) сравнение профиля метилирования с контролем, причем корреляция между профилем метилирования и контролем определяет наличие злокачественной опухоли у индивидуума.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования дополнительно содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из таблиц 15-18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования дополнительно содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502,
cgl2504877 cg03087897 cgl7518965 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cg03758697 cg24480810 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl0351284 cg24107852 cg21913888 cg24706505 cg20695297 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg05398700 cg02053964 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg23554164 cg25652701 cg26683005 cgl3911392 cg04858553 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cgl4058476 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 cgl3924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cg24166457 cgl8901104 cg09419005 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl8158859 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128 cgl8887230 cg27141915 cg25982880 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl9300307 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl7122157 cgl5797834 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl8842353 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg09844573, cg27125093, cg07058988, cg27219182, cg26112797, cg07860918, cg22190721, cg08480068, cg22460896, cg00037681, cg21249754, cgl4088196, cgl0732611, cgl6402452, cg09399878, cg00220455, cg20136100, cg00242035, cg04888360, cg05931497, cgl4633252, cg02609337, cg05177060, cgl2629796,
cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480,cgl6748008, cgl6644023,cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343,cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907,cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513,cg01456691,cgl7207512,cg20510285, cgOl149192,cg05614346,cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918,cg05352688, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713,cg23589035, cg01903374,cg23612220, cg26315985,cgl8856478,cg23229016, cg21004490,cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сравнение дополнительно включает создание набора данных по попарным различиям метилирования, который содержит (i) первое различие между профилем метилирования обработанной геномной ДНК и профилем метилирования первого нормального образца; (ii) второе различие между профилем метилирования второго нормального образца и профилем метилирования третьего нормального образца и (iii) третье различие между профилем метилирования первого образца первичной злокачественной опухоли и профилем метилирования второго образца первичной злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сравнение дополнительно включает анализ набора данных по попарным различиям метилирования с контролем способом машинного обучения для создания профиля метилирования. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сравнение дополнительно включает определение типа злокачественной опухоли у индивидуума. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, создание дополнительно включает гибридизацию каждого из одного или нескольких биомаркеров с зондом и осуществление реакции секвенирования ДНК для количественного
определения метилирования каждого из одного или нескольких биомаркеров. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, реакция секвенирования ДНК представляет собой цифровую ПНР-реакцию.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контроль включает профили метилирования нормальных образцов. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контроль включает профили метилирования образцов злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли представляет собой метастатический тип злокачественной опухоли или рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта,
гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), злокачественную фиброзную гистиоцитомную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, овариальную злокачественную опухоль, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, ренальную
злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки,
холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологические образцы включают образец циркулирующей опухолевой ДНК или образец ткани. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологический образец представляет собой образец биопсии. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологический образец представляет собой бесклеточный биологический образец.
Способ выбора терапии для индивидуума со злокачественной опухолью, предусматривающий: (а) идентификацию типа злокачественной опухоли индивидуума в соответствии с описываемым в настоящем документе способом; и, (Ь) исходя из результатов стадии (а), выбор терапии, подходящей для такого типа злокачественной опухоли.
Способ дифференцирования первичной опухоли от метастатической злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, который предусматривает (а) обработку экстрагированной геномной ДНК дезаминирующим средством для получения обработанной геномной ДНК, содержащей дезаминированные нуклеотиды, причем экстрагированная геномная ДНК получена из биологического образца от индивидуума; (Ь) создание профиля метилирования, содержащего один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 20, из обработанной геномной ДНК; и (с) сравнение профиля метилирования с контролем, причем корреляция между профилем метилирования и контролем позволяет дифференцировать первичную опухоль от метастатической злокачественной опухоли у индивидуума.
Способ отслеживания прогрессирования злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, который предусматривает (а) обработку экстрагированной геномной ДНК дезаминирующим средством для получения обработанной геномной ДНК, содержащей дезаминированные нуклеотиды, причем экстрагированная геномная ДНК получена из биологического образца от индивидуума; (Ь) создание профиля метилирования, содержащего один или несколько биомаркеров,
выбранных из таблицы 20, из обработанной геномной ДНК; и (с) сравнение профиля метилирования со вторым профилем метилирования, причем второй профиль метилирования создан из обработанной геномной ДНК, полученной из второго биологического образца, полученного от индивидуума до получения первого биологического образца, и причем различие между первым профилем метилирования и вторым профиль метилирования указывает на то, спрогрессировала ли у индивидуума злокачественная опухоль.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение также относится к набору, который содержит описанную выше панель зондов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение дополнительно относится к сервису, который включает описанный выше способ.
Включение посредством ссылок
Все упомянутые в настоящем описании публикации, патенты и патентные заявки включены в настоящее описание посредством ссылки до такой же степени, как если бы каждая отдельная публикация, патент или патентная заявка были специально и индивидуально указаны как включенные посредством ссылки.
Краткое описание чертежей
Изложены новые признаки настоящего изобретения и особенно подробно для прилагаемой формулы изобретения. Более полное понимание признаков и преимуществ настоящего изобретения будет получено с учетом приведенного далее подробного описания, в котором раскрыты иллюстративные варианты осуществления, в которых использованы идеи настоящего изобретения, и прилагаемых чертежей, краткое описание которых приведено далее.
На фиг. 1А и фиг. 1В проиллюстрирована общая схема раскрываемых в настоящем документе способа, платформы и системы.
На фиг. 2 проиллюстрирована диаграмма раскрываемой в настоящем документе компьютерной системы.
На фиг. 3 проиллюстрирован выход бесклеточной ДНК из мочи. Бесклеточная ДНК в моче варьировала от 1 до 30 нг на 1 мл мочи, что составляет приблизительно 1/5 от концентрации, наблюдаемой в плазме. Диапазон варьирует среди образцов от различных индивидуумов, а также зависит от других факторов, например, пола, определенных стадий заболевания.
На фиг. 4 проиллюстрировано влияние стабилизирующего буфера для мочи (USB) на выход бесклеточной ДНК из мочи. Образцы мочи хранили при комнатной температуре в течение 14 дней после смешивания с USB-буфером или другим коммерческим электродным буфером. Спустя 14 дней высвобождение геномной ДНК из образцов без буфера давало намного более высокий выход ДНК. Но USB или электродный буфер предотвращали высвобождение клеточной ДНК.
На фиг. 5 проиллюстрирован выход ДНК с применением различных рабочих концентраций USB. Из выхода ДНК в различных соотношениях стабилизирующего буфера для мочи в моче в сравнении с коммерческим электродным буфером или без буфера видно, что USB-буфер работает в диапазоне от 1:10 до 1:50 разведения в моче.
На фиг. 6 проиллюстрировано кратное изменение детектирующего сигнала для эмбриональной ДНК в плазме по сравнению с мочой. Начиная с 4 мл исходного образца плазмы и мочи, сигнал мужской эмбриональной ДНК был детектирован в бесклеточной ДНК с помощью количественной ПНР в режиме реального времени со специфичным для мужского пола геном SRY. Сигнал приблизительно в 2-8 раз сильнее в плазме, чем в моче с тем же объемом.
На фиг. 7 проиллюстрирован выход бесклеточной ДНК в моче и бронхоальвеолярном секрете от одного пациента со злокачественной опухолью легкого в различные моменты времени. Средняя бесклеточная ДНК в бронхоальвеолярном секрете составляет приблизительно 130 нг/мл, а в моче составляет приблизительно 20 нг/мл.
На фиг. 8 проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования у различных типов злокачественной опухоли.
На фиг. 9А - фиг. 9С проиллюстрированы профили метилирования, которые используют для дифференцирования различных типов злокачественных опухолей в одном типе тканей с помощью неконтролируемой иерархической кластеризации и теплокарт, ассоциированных с эталонными профилями метилирования у различных типов злокачественных опухолей. Теплокарта, которая проиллюстрирована на фиг. 9А, получена от 511 образцов LGG, 138 GBM и 150 образцов нормальной ткани головного мозга на основании 1409 маркеров. Теплокарта, которая проиллюстрирована на фиг. 9В, получена от 311 образцов LUAD, 359 LUSC и 74 образцов нормальной ткани легкого на основании 926 маркеров. Теплокарта, которая проиллюстрирована на фиг. 9С, получена
от 321 образца КЖС, 226 КЖР и 205 образцов нормальной ткани почки на основании 716 маркеров.
На фиг. 10А - фиг. 10В приведены графики, на которых проиллюстрированы маркеры метилирования, которые используют для прогнозирования общей выживаемости пациентов с различными типами злокачественных опухолей, в том числе: LGG, KIRP, КЖС, LUSC и LUAD, а также стратифицированных в соответствии с опухолевым статусом и опухолевой стадией.
На фиг. ПА - фиг. 11D проиллюстрировано, что классификация в отношении выживаемости на основании метилирования коррелирует со статусом инициирующей мутации. На фиг. ПА проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования и инициирующей мутацией генов у LGG. На фиг. 11В показана кривая 5-летней выживаемости у пациентов с LGG в зависимости от комбинации значения РСА и мутации ШН. На фиг. ПС проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования и часто мутирующими генами у LGG. На фиг. 11D проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования и часто мутирующими генами у KIRC.
На фиг. 12 проиллюстрирована теплокарта сравнения дифференциальной экспрессии гиперметилированных генов либо в злокачественной опухоли молочной железы, либо в злокачественной опухоли печени в сравнении с соответствующей нормальной тканью.
На фиг. 13А - фиг. 13С проиллюстрированы данные РНК-секвенирования от TCGA в качестве группы обнаружения для вычисления дифференциальной экспрессии гиперметилированных генов либо в злокачественной опухоли молочной железы, либо в злокачественной опухоли печени по сравнению с соответствующей нормальной тканью.
На фиг. 14 показаны графики, на которых проиллюстрировано, что паттерны метилирования коррелируют с профилями экспрессии генов и характеристиками злокачественной опухоли. Экспрессию мРНК дифференциально метилированных генов в злокачественной опухоли молочной железы и злокачественной опухоли печени определяли с помощью qPCR. Экспрессия мРНК в образцах опухолей была нормализована к экспрессии в близлежащей нормальной ткани, полученной от того же пациента. Результаты представлены как средний процент изменения экспрессии нескольких образцов (п = 3-7), причем для каждого образца было сделано 3 технических
повторности. Все образцы объединяли в пул для статистического анализа с использованием рангового критерия Уилкоксона для определения, изменяется ли генная экспрессия обратно с метилированием, как это было спрогнозировано; р-значение для объединенных в пул образцов было определено как равное 1,21х10"21.
На фиг. 15А - фиг. 15J проиллюстрировано влияние сконструированного гена на ингибирование роста линии клеток злокачественной опухоли молочной железы. Сконструированный ген бы трансдуцирован в линии клеток злокачественной опухоли молочной железы. На фиг. 15А и фиг. 15F проиллюстрированы соответствующие сайты метилирования CpG. На фиг. 15В и фиг. 15G показаны иссеченные и измеренные опухоли после имплантации клеток, которые были трансдуцированы сконструированным геном, или контрольных клеток. На фиг. 15D и фиг. 151 показан количественный рост этих опухолей с течением времени. На фиг. 15С, фиг. 15Е, фиг. 15Н и фиг. 15J показано образование колоний in vitro клетками, которые были трансдуцированы сконструированным геном, в сравнении с контрольными клетками.
На фиг. 16 проиллюстрированы сигнатуры метилирования ДНК, ассоциированные со злокачественной опухолью толстой кишки. Неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с профилем метилирования 435 образцов от TCGA (злокачественная опухоль толстой кишки: 390; нормальная толстая кишка: 45) с панелью из 311 маркеров CpG. Каждый столбец представляет отдельного пациента, а каждый ряд представляет отдельный маркер CpG.
На фиг. 17 проиллюстрированы сигнатуры метилирования ДНК, ассоциированные со злокачественной опухолью толстой кишки, легкого и печени. Неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с профилем метилирования 1108 образцов от TCGA (злокачественная опухоль толстой кишки: 390; нормальная толстая кишка: 45; злокачественная опухоль печени: 238; нормальная печень: 50; злокачественная опухоль легкого: 311; нормальное легкое: 74) на основе 2793 маркеров CpG. Каждый столбец представляет отдельного пациента, а каждый ряд представляет отдельный маркер CpG.
На фиг. 18 проиллюстрированы сигнатуры метилирования ДНК, ассоциированные с первичной и метастатической злокачественной опухолью толстой кишки, злокачественной опухолью печени и злокачественной опухолью легкого в китайской группе. Неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с профилем метилирования 567 образцов первичной опухоли на основе 104 маркеров.
На фиг. 19А - фиг. 19Е проиллюстрированы маркеры метилирования, которые применяют для прогнозирования общей выживаемости пациентов с аденокарциномой толстой кишки (COAD) на кривой Каплана-Мейера. На фиг. 19А показан коэффициент 5-летней выживаемости, стратифицированный в соответствии с профилями метилирования. Группа со значением РСА> 0 (п=127) имеет повышенную вероятность выживания (81,2%), чем у группы (42%) со значением РСА <0 (п=145) (Р=0,007). На фиг. 19В показаны коэффициенты 5-летней выживаемости у пациентов с I-II стадией, стратифицированных в соответствии с результатами профилирования метилирования, группа со значением РСА> 0 (п=73) имеет повышенную вероятность выживания (100%), чем у группы (51,3%) со значением РСА <0 (п=77) (Р=0,007). На фиг. 19С показаны коэффициенты 5-летней выживаемости у пациентов с III-IV стадией, стратифицированных в соответствии с результатами профилирования метилирования, группа со значением РСА> 0 (п=49) имеет повышенную вероятность выживания (81,1%), чем у группы (42%) со значением РСА <0 (п=66) (Р=0,01). На фиг. 19D показаны коэффициенты 5-летней выживаемости у пациентов со II стадией, стратифицированных в соответствии с результатами профилирования метилирования, группа со значением РСА> 0 (п=51) имеет повышенную вероятность выживания (100%), чем у группы (53,4%) со значением РСА <0 (п=58) (Р=0,029). На фиг. 19Е показаны коэффициенты 5-летней выживаемости у пациентов с III стадией, стратифицированных в соответствии с результатами профилирования метилирования, группа со значением РСА> 0 (п=34) имеет повышенную вероятность выживания (94,1%), чем у группы (57,2%) со значением РСА <0 (п=46) (Р=0,021).
На фиг. 20А - фиг. 20F проиллюстрировано, что классификация в отношении выживаемости на основании метилирования коррелировала со статусом инициирующей мутации. На фиг. 20А проиллюстрирована кривая 5-летней выживаемости у пациентов с COAD в зависимости от значения РСА. На фиг. 20В показана кривая 5-летней выживаемости у пациентов с COAD в зависимости от мутации гена. На фиг. 20С проиллюстрирована кривая 5-летней выживаемости пациентов с COAD в зависимости от комбинации значения РСА и мутации гена. На фиг. 20D показана неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования и часто мутирующими генами у COAD. На фиг. 20Е проиллюстрированы Р-значения генов, которые значимо ассоциированы с общей выживаемостью. На фиг. 20F проиллюстрирована ассоциация между статусом мутации и выживаемостью пациентов (Р-значения оценивали с помощью логарифмического рангового критерия).
На фиг. 21 проиллюстрированы характеристики группы пациентов.
На фиг. 22 проиллюстрирована экспрессия мРНК дифференциально метилированных генов в злокачественной опухоли толстой кишки, определенная с помощью qPCR. Экспрессия мРНК в образцах опухолей была нормализована к экспрессии в близлежащей нормальной ткани, полученной от того же пациента. Результаты представлены как средний процент изменения экспрессии нескольких образцов (п = 3-7), причем для каждого образца было сделано 3 технических повторности. Все образцы объединяли в пул для статистического анализа с использованием рангового критерия Уилкоксона для определения, изменяется ли генная экспрессия обратно с метилированием, как это было спрогнозировано; р-значение для объединенных в пул образцов было определено как равное 1,21х10"21.
На фиг. 23 А - фиг. 23Е проиллюстрировано влияние PCDH17 на ингибирование роста линии клеток злокачественной опухоли толстой кишки. PCDH17 был трансдуцирован в клетки НСТ116. На фиг. 23А проиллюстрированы профили метилирования CpG. На фиг. 23В показаны иссеченные и измеренные опухоли после имплантации клеток, которые были трансдуцированы сконструированным геном, или контрольных клеток. На фиг. 23С показан количественный рост этих опухолей с течением времени. На фиг. 23D и фиг. 23Е показано образование колоний in vitro клетками, которые были трансдуцированы сконструированным геном, в сравнении с контрольными клетками.
На фиг. 24 проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с профилем метилирования у AML в сравнении с нормальной кровью.
На фиг. 25 проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования в образцах AML в сравнении с образцами нормальной крови в репликационной группе.
На фиг. 26 проиллюстрирована неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования (в соответствии с показанной цветовой шкалой) в образцах ALL в сравнении с образцами нормальной крови.
На фиг. 27 проиллюстрировано, что с помощью профиля метилирования можно дифференцировать подтип лейкоза. Иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с типами злокачественных опухолей ALL, AML.
На фиг. 28А - фиг. 28В проиллюстрированы профили маркеров метилирования. На фиг. 28А показаны маркеры метилирования, с помощью которых можно прогнозировать пятилетнюю общую выживаемость пациентов с AML, а на фиг. 28В показаны маркеры метилирования, с помощью которых можно прогнозировать пятилетнюю общую выживаемость пациентов с ALL.
На фиг. 29 проиллюстрированы степени метилирования иллюстративных сайтов CpG (cg06747543, cgl5536663, cg22129276 и cg07418387) в образце как ткани злокачественной опухоли толстой кишки, так и ткани нормальной толстой кишки (Farsite).
На фиг. 30 проиллюстрированы степени метилирования пяти иллюстративных сайтов CpG в образце ткани метастатической злокачественной опухоли толстой кишки, эталонном образце первичной злокачественной опухоли толстой кишки и эталонном образце геномной ДНК нормальных лимфоцитов.
На фиг. 31А - фиг. 31С показаны сигнатуры метилирования от образцов бесклеточной ДНК (cfDNA), полученных из злокачественной опухоли толстой кишки. На фиг. 31А показаны метилированные участки геномной cfDNA, а на фиг. 31В проиллюстрированы неметилированные участки геномной cfDNA. На фиг. 31С проиллюстрированы степени метилирования сайтов CpG eg 10673 833 от трех пациентов (2043089, 2042981 и 2004651), эталонного образца нормальной cfDNA, эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки и эталонного образца нормальной крови. У пациентов 2043089 и 2042981 - первичная злокачественная опухоль толстой кишки, а у пациента 2004651 - метастатическая злокачественная опухоль толстой кишки.
На фиг. 32А - фиг. 32С показаны профили метилирования для первичных злокачественных опухолей печени, молочной железы и легкого. На фиг. 32А показана степень метилирования сайта CpG cg00401797 в образце cfDNA злокачественной опухоли печени, образце нормальной cfDNA, эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли печени (геномной ДНК) и в эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). На фиг. 32В показана степень метилирования сайта CpG cg07519236 в образце cfDNA злокачественной опухоли молочной железы, образце нормальной cfDNA, эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли молочной железы (геномной ДНК) и эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). На фиг. 32С показана степень метилирования сайта CpG cg02877575 в образце cfDNA злокачественной опухоли легкого, образце нормальной cfDNA,
эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли легкого (геномной ДНК) и эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК).
На фиг. ЗЗА - фиг. 33В показаны два различных зонда, которые позволяют дифференцировать первичную злокачественную опухоль толстой кишки от нормального образца. На фиг. ЗЗА показан зонд Cob-2, который нацелен на сайт CpG cgl0673833, и профили метилирования из образцов cfDNA от трех пациентов со злокачественной опухолью толстой кишки, образца нормальной cfDNA, эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки (геномной DNA) и эталонного образца нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). У двух из трех пациентов (2043089 и 2042981) - первичная злокачественная опухоль толстой кишки. У оставшегося пациента (2004651) - метастатическая злокачественная опухоль толстой кишки. На фиг. 33В показан зонд Brb-2, который нацелен на сайт CpG cg07974511, и профили метилирования из образцов cfDNA от двух пациентов с первичной злокачественной опухолью толстой кишки (2043089 и 2042981), образца нормальной cfDNA, эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки (геномной DNA) и эталонного образца нормальных лимфоцитов (геномной ДНК).
На фиг. 34А - фиг. 34D показаны результаты анализа cfDNA от пациентов со злокачественной опухолью молочной железы. Были использованы четыре зонда: Brb-3 (фиг. 34А), Brb-4 (фиг. 34В), Brb-8 (фиг. 34С) и Brb-13 (фиг. 34D). Степень метилирования cfDNA первичной злокачественной опухоли молочной железы сравнивали с образцом нормальной cfDNA, эталонным образцом ткани первичной злокачественной опухоли молочной железы (геномной ДНК) и эталонным образцом нормальных лимфоцитов (геномной ДНК).
На фиг. 35А - фиг. 35В показана детекция метастатической злокачественной опухоли толстой кишки в образцах тканей от 49 пациентов от двух зондов, соЬ З и brb_13.
На фиг. 36 проиллюстрирован описанный в настоящем документе способ анализа с использованием фильтрации РСА и ICA.
На фиг. 37 показаны клинико-патологические характеристики обучающей группы.
На фиг. 38 показаны клинико-патологические характеристики группы проверки
На фиг. 39 показаны клинико-патологические характеристики группы проверки
На фиг. 40 показаны клинико-патологические характеристики подтипов злокачественных опухолей головного мозга, почки и легкого.
На фиг. 41 показаны сигнатуры метилирования ДНК, ассоциированные с первичной злокачественной опухолью молочной железы, метастазами злокачественной опухоли молочной железы в печень, нормальной молочной железой, злокачественной опухолью печени и нормальными тканями печени в китайской группе. Неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарта, ассоциированные с профилем метилирования 126 образцов опухолей и 75 нормальных образцов на основе 128 маркеров. Цветовая полоска показывает относительное метилирование.
На фиг. 42А - фиг. 42В проиллюстрировано, что классификация в отношении выживаемости на основании метилирования коррелирует со статусом инициирующей мутации. На фиг. 42А проиллюстрирована кривая 5-летней выживаемости пациентов с ЬШС в зависимости от комбинации значения РСА и мутантного статуса гена. На фиг. 42В проиллюстрирована кривая 5-летней выживаемости у пациентов с KIRC в зависимости от комбинации значения РСА и мутантного статуса гена.
На фиг. 43 А - фиг. 43В проиллюстрирована зависимость различных выбранных дифференциально метилированных маркеров CpG от генной экспрессии в BRCA (фиг. 43А) и ЬШС (фиг. 43В). Каждая точка на графике рассеяния представляет уровень метилирования обозначенного маркера CpG, нанесенного на график относительно экспрессии соответствующего гена. В первом ряду набора изображений представлены гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, которые коррелируют с пониженной генной экспрессией; во втором ряду набора изображений представлены гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, которые, по-видимому, не оказывали влияния на генную экспрессию; а в третьем ряду набора изображений представлены гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, в которых каждая ассоциированная точка на графике разброса представляет уровень метилирования обозначенного маркера CpG, нанесенного на график относительно экспрессии соответствующего гена. В первом ряду набора изображений показаны гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, которые коррелируют с пониженной генной экспрессией; во втором ряду набора изображений показаны гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, которые, по-видимому, не оказывали влияния на генную экспрессию; а в третьем ряду набора изображений показаны гиперметилированные при злокачественной опухоли сайты CpG, в котором они ассоциированы.
На фиг. 44А - фиг. 44В показаны клинико-патологические характеристики групп TCGA и китайских пациентов.
На фиг. 45 показана связь дифференциально метилированных маркеров с генной экспрессией. Каждая точка на графике рассеяния демонстрировала уровень метилирования обозначенного маркера eg, нанесенного на график относительно экспрессии соответствующего гена. В наборе изображений в первой строке показано, что гиперметилирование коррелировало со сниженной генной экспрессией; в наборе изображений во второй строке показано, что уровни метилирования не коррелировали с уровнями генной экспрессии; в наборе изображений в третьей строке показано, что уровни метилирования не имели никакой взаимосвязи с уровнями генной экспрессии
На фиг. 46 проиллюстрированы изменения в профиле метилирования для двух иллюстративных сайтов CpG (сайт 1 CpG и сайт 2 CpG) с помощью двух различных зондов злокачественных опухолей толстой кишки (cob-2 и cob-9).
На фиг. 47 проиллюстрированы изменения в профиле метилирования для зондов злокачественной опухоли толстой кишки cob-2 и cob-9 в образцах от четырех пациентов (пациентов 2045021, 2044629, 2044645 и 2045021) после хирургического вмешательства.
На фиг. 48 проиллюстрированы изменения профиля метилирования для зондов злокачественной опухоли толстой кишки cob-2 и cob-9 в образцах с различной стадией злокачественной опухоли.
На фиг. 49А - фиг. 49J проиллюстрированы изменения профилей метилирования десяти иллюстративных сайтов CpG для 19 образцов различных типов злокачественной опухоли и нормальной крови. В число типов злокачественной опухоли входят злокачественная опухоль мочевого пузыря, злокачественная опухоль молочной железы, злокачественная опухоль шейки матки, холангиокарцинома (CHOL), злокачественная опухоль толстой кишки, злокачественная опухоль пищевода, злокачественная опухоль головы и шеи, злокачественная опухоль почки, злокачественная опухоль печени, злокачественная опухоль легкого, злокачественная опухоль поджелудочной железы, феохромоцитома и параганглиома (PCPG), злокачественная опухоль предстательной железы, злокачественная опухоль прямой кишки, саркома, злокачественная опухоль кожи, злокачественная опухоль желудка и злокачественная опухоль щитовидной железы.
На фиг. 50А- фиг. 50N проиллюстрированы изменения профилей метилирования приблизительно 280 сайтов CpG (биомаркеров) для образца злокачественной опухоли
молочной железы, злокачественной опухоли толстой кишки, злокачественной опухоли печени, злокачественной опухоли легкого и нормальной крови.
Подробное раскрытие настоящего изобретения
Злокачественная опухоль характеризуется аномальным ростом клетки, вызванным одной или несколькими мутациями или модификациями гена, что приводит к нарушению равновесия пролиферации клеток и гибели клеток. Метилирование ДНК вызывает сайленсинг экспрессии генов-супрессоров опухолей и представляет собой одно из первых неопластических изменений. У паттернов метилирования, обнаруженных в неопластической ткани и плазме, видна однородной, а в некоторых случаях их используют в качестве чувствительного диагностического маркера. Например, в одном исследовании было показано, что анализ cMethDNA приблизительно на 91% чувствителен и приблизительно на 96% специфичен при его применении для диагностики метастатической злокачественной опухоли молочной железы. В другом исследовании циркулирующая опухолевая ДНК (ctDNA) была приблизительно на 87,2% чувствительной и приблизительно на 99,2% специфичной при ее применении для идентификации мутации гена KRAS в большой группе пациентов с метастатической злокачественной опухолью толстой кишки (Bettegowda et al., Detection of Circulating Tumor DNA in Early- and Late-Stage Human Malignancies. Sci. Transl. Med, 6(224):ra24. 2014). В том же исследовании было дополнительно продемонстрировано, что ctDNA является детектируемой у > 75% пациентов с поздней стадией злокачественных опухолей поджелудочной железы, яичника, толстой и прямой кишок, мочевого пузыря, гастроэзофагеальной злокачественной опухолью, молочной железы, меланомы, гепатоклеточной злокачественной опухолью и злокачественной опухолью головы и шеи (Bettegowda et al).
Из результатов дополнительных исследований было видно, что паттерн метилирования CpG коррелирует с неопластическим прогрессированием. Например, в одном исследовании паттернов метилирования злокачественной опухоли молочной железы было установлено, что гиперметилирование Р16 коррелирует со злокачественной опухолью молочной железы ранней стадии, тогда как гиперметилирование промотора ТГМРЗ коррелирует со злокачественной опухолью молочной железы поздней стадии. Кроме того, было показано, что гиперметилирование промотора ВМР6, CST6 и ТГМРЗ ассоциировано с метастазами в лимфатические узлы при злокачественной опухоли молочной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профилирование метилирования ДНК обеспечивает более высокую клиническую чувствительность и динамический диапазон по сравнению с анализом соматических мутаций для детекции злокачественной опухоли. В других случаях было показано, что измененная сигнатура метилирования ДНК коррелирует с прогнозом ответа на лечение для некоторых видов злокачественной опухоли. Например, из результатов одного исследования было видно, что в группе пациентов с поздней стадией злокачественной опухоли прямой кишки для создания прогноза пациентов применяли десять дифференциально метилированных участков. Аналогичным образом, в другом исследовании на пациентах со злокачественной опухолью молочной железы применяли измерение метилирования ДНК RASSF1А в сыворотке для прогнозирования неблагоприятного исхода у пациентов, проходящих вспомогательную терапию. Кроме того, в другом исследовании гиперметилирование гена SRBC было ассоциировано с плохим исходом у пациентов со злокачественной опухолью толстой и прямой кишок, которых лечили оксалиплатином. В другом исследовании было продемонстрировано, что метилирование гена ESR1 коррелирует с клиническим ответом у пациентов со злокачественной опухолью молочной железы, получающих тамоксифен. Кроме того, было показано, что гиперметилирование промотора гена ARHI является предиктором долговременной выживаемости у пациентов со злокачественной опухолью молочной железы, которых не лечили тамоксифеном.
В некоторых случаях анализы с целью профилирования метилирования ДНК адаптируют к конкретным типам злокачественной опухоли. В некоторых случаях анализ с целью профилирования метилирования ДНК не позволяет отличить различные типы злокачественных опухолей в условиях анализа для различных форм злокачественной опухоли. В дополнительных случаях в условиях низкой концентрации образца (например, в условии концентрации ng) анализы с целью профилирования метилирования ДНК не обладают воспроизводимостью и имеют сниженную чувствительность по сравнению с условиями более высокой концентрации образца.
Настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения типа злокачественной опухоли у индивидуума. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение также относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для ранней детекции злокачественной опухоли. В соответствии с
дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с еще дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для распознания различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для определения прогноза злокачественной опухоли у нуждающегося в том индивидуума, прогнозирования ответа на лечение и отслеживания ответа на лечение. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе, машиночитаемому носителю с постоянной записью, сервисам и наборам для создания базы данных по профилям метилирования CpG и зондам, применяемым для создания данных по метилированию CpG.
Определение статуса злокачественной опухоли у пациента
Метилирование ДНК представляет собой присоединение метальной группы в С5-положении у нуклеотидного основания цитозин и ^-положении у аденина. Метилирование аденина происходит преимущественно у прокариот, тогда как метилирование цитозина происходит как у прокариот, так и у эукариот. В некоторых случаях метилирование цитозина происходит в мотиве динуклеотидов CpG. В других случаях метилирование цитозина происходит, например, в мотивах CHG и СНН, где Н представляет собой аденин, цитозин или тимин. В некоторых случаях один или несколько мотивов динуклеотида CpG или сайтов CpG образуют CpG-островок - короткую последовательность ДНК с богатым содержанием динуклеотида CpG. В некоторых случаях CpG-островок присутствует в 5'-участке приблизительно половины всех генов у человека. CpG-островки обычно, но не всегда, имеют длину от приблизительно 0,2 до приблизительно 1 т. о. Метилирование цитозина дополнительно включает 5-метилцитозин (5-mCyt) и 5-гидроксиметилцитозин.
CpG (цитозин-фосфат-гуанин) или мотив CG относится к участкам молекулы ДНК, где цитозиновый нуклеотид встречается непосредственно за гуаниновым нуклеотидом в линейной цепи. В некоторых случаях цитозин в динуклеотиде CpG
метилирован с образованием 5-метилцитозина. В некоторых случаях цитозин в динуклеотиде CpG метилирован с образованием 5-гидроксиметилцитозина.
База данных по профилям метилирования CpG
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, множество данных по метилированию CpG создают и интегрируют в базу данных по профилям метилирования CpG. В некоторых случаях базу данных по профилям метилирования CpG используют в качестве эталонной базы данных совместно со способом, системой, машиночитаемым носителем с постоянной записью или набором, которые описаны в настоящем документе. В некоторых случаях база данных по профилям метилирования CpG содержит библиотеку профилей метилирования CpG, в которой каждый профиль метилирования CpG коррелирует с типом злокачественной опухоли (например, злокачественной опухолью молочной железы, злокачественной опухолью толстой и прямой кишок, злокачественной опухолью головного мозга и т. п.). В некоторых случаях каждый указанный профиль метилирования CpG дополнительно коррелирует с подтипом злокачественной опухоли (например, трижды отрицательной злокачественной опухолью молочной железы, аденокарциномой толстой и прямой кишок, астроцитомами и т. п.).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, база данных по профилям метилирования CpG создают как проиллюстрировано на фиг. 1 А. В некоторых случаях геномную ДНК (например, ядерную ДНК или циркулирующую ДНК) выделяют из биологического образца, а затем обрабатывают дезаминирующим средством для получения экстрагированной геномной ДНК (101). В некоторых случаях экстрагированную геномную ДНК (например, экстрагированную ядерную ДНК или экстрагированную циркулирующую ДНК) необязательно обрабатывают одним или несколькими рестрикционными ферментами для получения набора фрагментов ДНК перед проведением анализа секвенирования с целью получения данных по метилированию CpG (102). Данные по метилированию CpG затем вводят в программу машинного обучения/классификации (103) для создания базы данных по профилям метилирования CpG (105).
В некоторых случаях создают набор биологических образцов, а затем вводят их в программу машинного обучения/классификации (103). В некоторых случаях набор биологических образцов содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30 или более биологических образцов. В некоторых случаях набор биологических образцов содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7,
8, 9, 10, 20, 30 или более нормальных биологических образцов. В некоторых случаях набор биологических образцов содержит 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30 или более злокачественных биологических образцов. В некоторых случаях набор биологических образцов содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными. В некоторых случаях создают три пары наборов данных, при этом эти три пары наборов данных содержат первую пару наборов данных по метилированию CpG, полученных от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, а первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов; вторую пару наборов данных по метилированию CpG, полученных от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и третью пару наборов данных по метилированию CpG, полученных от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными. В некоторых случаях вычисляют различие в каждой указанной паре наборов данных, а затем эти различия
вводят в программу машинного обучения/классификации (103). В некоторых случаях создают набор данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных, а затем анализируют в присутствии контрольного набора данных или обучающего набора данных (104) способом машинного обучения/классификации (103) с целью создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли (105). В некоторых случаях способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя (например, значения t-критерия, значения Р-критерия) и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений. В некоторых случаях база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли (105) содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет некий тип злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для детекции наличия злокачественной опухоли применяют первую панель биомаркеров. В некоторых случаях для определения типа злокачественной опухоли применяют по меньшей мере дополнительную панель биомаркеров, например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6 или более панелей биомаркеров. В некоторых случаях для необязательного определения стадии злокачественной опухоли применяют по меньшей мере дополнительную панель биомаркеров, например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6 или более панелей биомаркеров, для того, чтобы различить первичный подтип злокачественной опухоли от метастатический подтип злокачественной опухоли, для отслеживания прогрессирования злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли или для отслеживания режима лечения.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для диагностики типа злокачественной опухоли в качестве эталонной базы данных применяют базу данных по профилям метилирования CpG. В некоторых случаях применение базы данных по профилям метилирования CpG в качестве эталонной базы данных для диагностики злокачественной опухоли имеет общую схему, проиллюстрированную на фиг. 1В. В некоторых случаях геномную ДНК (например, ядерную ДНК или циркулирующую ДНК) выделяют из биологического образца, а затем обрабатывают дезаминирующим средством для получения экстрагированной геномной ДНК (111). В некоторых случаях экстрагированную геномную ДНК (например, экстрагированную ядерную ДНК или экстрагированную циркулирующую ДНК) необязательно обрабатывают одним или
несколькими рестрикционными ферментами для получения набора фрагментов ДНК перед проведением анализа секвенирования с целью получения данных по метилированию CpG. Данные по метилированию CpG дополнительно анализируют и компилируют в представляющий интерес профиль метилирования CpG (112). Представляющий интерес профиль метилирования CpG необязательно вводят в программу машинного обучения/классификации (114), а затем сравнивают с профилями метилирования CpG в рамках базы данных по профилям метилирования CpG (115). Совпадение между профилем метилирования CpG в базе данных по профилям метилирования CpG и представляющим интерес профилем метилирования CpG указывает на тип злокачественной опухоли.
В некоторых случаях в качестве эталонной базы данных дополнительно применяют базу данных по профилям метилирования CpG для определения первичного подтипа злокачественной опухоли и метастатического подтипа злокачественной опухоли или для отслеживания прогрессирования злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, базу данных по профилям метилирования CpG создают на основании данных по метилированию CpG образца биопсии. В некоторых случаях базу данных по профилям метилирования CpG создают на основании данных по метилированию CpG образца ткани. В некоторых случаях базу данных по профилям метилирования CpG создают на основании данных по метилированию CpG от бесклеточного биологического образца. В некоторых случаях базу данных по профилям метилирования CpG создают на основании данных по метилированию CpG от образца циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA). Биомаркеры
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, описываемые в настоящем документе биомаркеры (или маркеры) дифференциально метилированы в злокачественной опухоли в сравнении с нормальной тканью. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биомаркер указывает на или представляет собой сигнатуру метилирования, такую как например, сайт метилирования CpG, статус метилирования, индекс метилирования или профиль метилирования. В некоторых случаях в панели биомаркеров представлена коллекция сигнатур метилирования для создания, к примеру, профиля метилирования, метилирования одного или нескольких генов и т. п. В некоторых случаях биомаркеры используют отдельно или совместно в качестве диагностического инструмента, или в комбинации, или преобразованными в виде панели биомаркеров. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления,
биомаркеры оценивают в одном или нескольких генах, в некоторых случаях дополнительно сравнивают с профилем метилирования одного или нескольких генов, таким как эталонные профили метилирования, что в результате дает характеристику статуса злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам, системам, платформе и машиночитаемому носителю с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли на основе профиля метилирования или сигнатуры метилирования одного или нескольких биомаркеров. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, один или несколько биомаркеров используют для детекции злокачественной опухоли на ранних стадиях. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, один или несколько биомаркеров применяют для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с еще одними вариантами осуществления, один или несколько биомаркеров применяют для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, один или несколько биомаркеров применяют для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящее изобретение также относится к способам, системам, платформе и машиночитаемому носителю с постоянной записью для создания базы данных по профилям метилирования CpG. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для создания базы данных по профилям метилирования CpG используют один или несколько биомаркеров.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, описываемый в настоящем документе биомаркер включает такие биомаркеры, которые представлены в таблице 15. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, описываемый в настоящем документе биомаркер включает биомаркер, раскрытый в таблицах 15, 16, 17 и/или 18. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18 для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18 для детекции злокачественной опухоли на ранних стадиях. В соответствии с
дополнительными вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18 для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18 для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18 для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и
параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, описываемый в настоящем документе биомаркер включает: cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113,
eg12042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl0351284 cg24107852 cgl6454130 cgl1105292 cg08858130 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg23554164 cg25652701 cg26433975 cg05287480 cgl2098228 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cgO1681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 cgl3924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl0673833 cgl6748008 cg26811313 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128 cgl8887230 cg06787669 cgl6644023 cg25432518 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg06488150 cgl6622899 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg05098343 cg09450197 cgl2359001 cg24166457, cgl3911392, cg04858553, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cgO1657186, cg03758697, cg24480810, cgl6402452, cg09399878, cg00220455, cg20136100, cg00242035, cg04888360, cg05931497, cgl4633252, cg02609337, cg05177060, cgl2629796, cg07573366, cg20336172, cgO1209642,
cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513,cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870,cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042,cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455,cg07186032,cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008,cg27405400,cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 или cg26017930. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583,
cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113 cg27377213, cg26680502,cgl2504877, cg21913888,cg26683005, cg24166457 cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505,cgl7126555, cgl3911392 cg25982880, cgl5797834, cg27125093, cgl7518965,cg20695297, cg04858553 cg25490145, cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925 cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721, cg27023597 cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297 cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807 cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862 cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427, cg03653601 cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg22460896, cg07116712, cgl0186131 cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681,cg05596756, cg03569637 cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186 cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697 cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353,cgl0732611, cg24480810 cg25922751, cg25954028, cgl4642045, cg24165921,cgl8215449, cgl6402452 cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472,cgl4999168, cg09399878 cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455 cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100 cg09902130,cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035
cgl2042264, cg27141915, cgl8901104, cg09419005, cg27410601, cg02782634, cg22589778, cg00558804, cg23093496, cgO1990910, cg06380123, cg02522196, cg23764129, cg05398700, cg02053964, cg21376733, cg02874908, cg20826709, cg09153080, cg04314978,
cg25225070
cg20411756
cg24247537
cg04330884
cg23130731
cg04888360
cg00907272,
cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087, cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584,cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903,cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975,cgl0673833,cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051,cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922,cg23021796, cg24835948,cgl0393744, cg07428959,cgl7694130,cg03956042, cgl9266387,cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688,cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490,cg24742520, cg23013029,cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930 для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113,cgl2042264, cg27377213,cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880,cgl5797834, cg27125093, cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145,cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721,cg27023597,cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg22460896,
cg07116712, cgl0186131, cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756, cg03569637, cg02522196, cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998,cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476,cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751,cg25954028, cgl4642045, cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472, cgl4999168,cg09399878,cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415,cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975,cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228,cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015,cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400,cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287,cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985,cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930 для детекции злокачественной опухоли на ранних стадиях, неинвазивной детекции злокачественной опухоли, отличия различных стадий злокачественной опухоли, определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или
машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093,cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833,cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930,cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476,cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448,cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474,cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965,cgl6748008,cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20) для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg25922751,cg25432518,cg23612220, cg23130731,cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307,cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346,cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930,cg22513455,cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834,cgl5698795,cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505,cg24107852, cg23824762,cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668,cgl4642045,cgl3924996, cgl2353452,cg09335715, cg08858130, cg08480068,
cg08052292, cg07428959,cg06153925, cg04147906,cg03431741, cg00282244иcg00025044 (таблица 20) для детекции злокачественной опухоли на ранних стадиях, неинвазивной детекции злокачественной опухоли, отличия различных стадий злокачественной опухоли, определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, описываемый в настоящем документе биомаркер включает cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе
с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555 для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описываемых в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение одного или нескольких биомаркеров: cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555 для детекции злокачественной опухоли на ранних стадиях, неинвазивной детекции злокачественной опухоли, отличия различных стадий злокачественной опухоли, определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит один или несколько описанных в настоящем документе биомаркеров. В некоторых случаях панель содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15 или таблицы 16. В некоторых случаях панель содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 17 или таблицы 18. В некоторых случаях в таблицах 15-18 представлены панели маркеров образцов злокачественной опухоли или нормальных образцов. В некоторых случаях в таблицах 15 и 16 представлены панели маркеров образцов злокачественной опухоли или нормальных образцов. В некоторых случаях в таблицах 17 и 18 представлены панели маркеров образцов злокачественной опухоли или нормальных образцов.
В некоторых случаях панель содержит один или несколько биомаркеров: cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050,
cg21122474 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cg06064964 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl1779113 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cgO1657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl2042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cgl2504877, cg03087897, cg27125093, cgl8456621, cgl2900649, cgl0530767, cg23878564, cg03549146, cg26769927, cg20357538, cgl0590292, cg26363363, cgl6061668, cgl9300307, cgl4642045, cgl4556909, cgl1791526, cg07420137, cg27284288, cg24247537, cg04441857, cgl6191087,
cg03431741, cg07417146, cg09001226 cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl408301b: cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346: cg23021796, cg24835948 eel 0393744 ce07428959
cg20847580: cgl3597051 cg01456691 cg08912922
cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130,cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292,cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899,cgl2359001,cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343,
5, cgl5046123: cg06439655:
га?П847^8П гоГП4^1741 rof)741714fS гоПОПГЛ 996 гаП648?408 гоГПЯОт^П cg00899907,
cgl1334870,
cgl0393744,cg07428959, cgl7694130, cg03956042,
cg27366280,
cg03190513,
cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455,cg07186032, cg08052292 cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008,cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601,cg05656900, cg08132573,cg24686918
cg21004490 cg26017930
cg00907272, cgl1436362, cg24480810,
cg27125093, cg26112797 cgl0673833, cg09866569 cg24301930, cg22513455
В некоторых случаях панель содержит один или несколько биомаркеров: cg25922751,cg25432518,cg23612220, cg23130731,cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272 p.o771 95093 (tm)96119797 Cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, r.al 1436369
_0 _0 . , cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569
cgl5797834,cgl5698795, cgl5341833
cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502,
cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213,
cgl0590292, cg06787669, "6___, "6__, .6____,
cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505,cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621,cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068,
cg08052292, cg07428959,cg06153925, cg04147906,cg03431741, cg00282244иcg00025044 (таблица 20).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит один или несколько биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит два или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит три или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит четыре или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркеры cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель состоит из одного или нескольких биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель состоит из двух или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель состоит из трех или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель состоит из четырех или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель состоит из биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркер cg25574765. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркер cg25490145. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркер cgl 8384097. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркер cgl7126555. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит биомаркер cg25922751. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит один или несколько биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555 и необязательно один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15, таблицы 16, таблицы 17, таблицы 18 и/или биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457,
cg27141915: cgl8901104: cg09419005: cg27410601: cg02782634: cg22589778: cg00558804: cg23093496: cgO 1990910: cg06380123: cg02522196: cg23764129: cg05398700: cg02053964: cg21376733: cg02874908: cg20826709: cg09153080: cg04314978: cg00907272: cgl3408086: cgl9252956: cgl0351284: cg24107852 cgl6454130: cgl1105292 cg08858130: cgl4564351: cg09001226: cgO 16203 60. cgO1149192 cgl0393744: cg22513455: cgl3821008: cgl7122157 cg25982880: cg25490145: cg03297901: cgl8942579: cg07137244: cg05304979: cg07641284: cg00933696: cgl8610205: cgll655490: cg04514998: cgl4058476: cg25922751: cgl6509569: cgl0542975: cgl1436362 cg09902130: cg25225070: cg05979232: cgl3555415: cg00015530: cg23554164: cg25652701: cg26433975: cg05287480: cgl2098228: cg23429794: cg06482498: cgl4083015: cg05614346: cg07428959: cg07186032 cg27405400: cg09844573: cgl5797834: cgll252953: cg06853339: cg01409343: cg04147906: cg27598656: cgO1681367 cg09866569: cgl2353452 cgl9693177 cg07332880: cgl8158859: cg25954028: cg08075204: cgl5698795: cgl3924996: cg07380416: cg20411756: cg00025044: cg22552736: cg08632810: cgl9021985: cg00282244: cgl0673833: cgl6748008: cg26811313: cg26401541: cg03891050: cgl5046123: cg06439655: cgl7694130: cg08052292: cg09366118: cg03087897 cg27125093: cgl8456621: cgl2900649: cgl0530767 cg23878564: cg03549146: cg26769927: cg20357538: cgl0590292 cg26363363: cgl6061668: cgl9300307 cgl4642045: cgl4556909: cgll791526: cg07420137 cg27284288: cg24247537: cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128: cgl8887230: cg06787669: cgl6644023: cg25432518: cg20046343: cg00899907: cg03190513: cgll334870: cg03956042: cg27366280: cgl5341833: cg24706505: cgl7518965: cg07058988: cg27219182 cg26112797 cg07860918: cg22190721: cg08480068: cg22460896: cg00037681: cg21249754: cg25574765: cgl8842353: cg24165921: cg07119472 cg00862408: cg24301930: cgl3912307 cg04330884: cg09684112 cgl3925432 cg26769700: cgl9421584: cg08486903: cgl2192582 cg06488150: cgl6622899: cg20847580: cgl3597051: cg01456691: cg08912922: cgl9266387 cg06825448: cg02233149: cgl7126555: cg20695297: cgl7864646: cgl5759721: cg00253248: cg00206490: cg01660934: cg02914427: cg07116712 cg05596756: cg23147227: cgl4088196: cgl0732611: cgl8215449: cgl4999168: cgl6260696: cgl3395086: cgl0511890: cg23130731: cg27388962: cgl3464240: cg03218479: cgl7984956: cg09335715: cg05098343: cg09450197 cgl2359001: cg03431741: cgl8113826: cgl7207512 cg23021796: cgl3512830: cg25451702 cgl4247287: cgl3911392, cg04858553, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cgO1657186, cg03758697, cg24480810, cgl6402452, cg09399878, cg00220455, cg20136100, cg00242035, cg04888360, cg05931497, cgl4633252, cg02609337, cg05177060, cgl2629796, cg07573366, cg20336172, cgO1209642, cg07417146, cg04859102, cg20510285, cg24835948, cgl9982684, cg08098128, cg23824762,
cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981,cg25765104, cg26394055,cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 iicg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит один или несколько биомаркеров из таблицы 20 и необязательно один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15, таблицы 16, таблицы 17, таблицы 18 и/или биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964,cgl1779113, cgl2042264, cg27377213,
cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 eg19693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 eg14642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 eg12737392 cg21031128 cgl8887230 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cg02609337 cg05177060 cgl2629796 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl0351284 cg24107852 cgl6454130 cgl7122157, cg25982880, cg25490145, cg03297901, cgl8942579, cg07137244, cg05304979, cg07641284, cg00933696, cgl8610205, cgl1655490, cg04514998, cgl4058476, cg25922751, cgl6509569, cgl0542975, cgl1436362, cg09902130, cg25225070, cg05979232, cgl3555415, cg00015530, cg23554164, cg25652701, cg26433975,
cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001,cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741,cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826,cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123,cg03190513,cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035,cg01903374, cg23612220,cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров. В некоторых случаях панель содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, причем биомаркеры выбраны из таблиц 15, 16, 17 и/или 18. В некоторых случаях панель содержит приблизительно 5 или более биомаркеров, включая 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров или маркеров, выбранных из любой из таблиц 15, 16, 17 и/или 18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550,
600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, причем биомаркеры выбраны из таблиц 15-16. В некоторых случаях панель содержит приблизительно 5 или более биомаркеров, включая 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров или маркеров, выбранных из любой из таблиц 15-16.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, панель содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, причем биомаркеры выбраны из таблиц 17-18. В некоторых случаях панель содержит приблизительно 5 или более биомаркеров, включая 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров или маркеров, выбранных из любой из таблиц 17-18.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанном в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии. В соответствии с
дополнительными вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17, и/или 18, для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с еще дополнительными вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 17 и/или таблицы 18, для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе,
системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 17 и/или таблицы 18, для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 17 и/или таблицы 18, для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В соответствии с еще дополнительными вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 17 и/или таблице 18, для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 17 и/или таблицы 18, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5,
6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250 или более биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479,
cgl6911583 eg12042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl0351284 cg24107852 cgl6454130 cgl1105292 cg08858130 cgl4564351 cg09001226 cgl5139596 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg23554164 cg25652701 cg26433975 cg05287480 cgl2098228 cg23429794 cg06482498 cgl6927606 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cgO1681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 cgl3924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl0673833 cgl6748008 cg26811313 cg26401541 cg03891050 cgl2967050 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128 cgl8887230 cg06787669 cgl6644023 cg25432518 cg20046343 cg00899907 cg21122474 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg06488150 cgl6622899 cg20847580 cgl3597051 cg06064964 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg05098343 cg09450197 cgl2359001 cg03431741 cgl8113826 cgl1779113, cg24166457, cgl3911392, cg04858553, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cgO1657186, cg03758697, cg24480810, cgl6402452, cg09399878, cg00220455, cg20136100, cg00242035, cg04888360, cg05931497, cgl4633252, cg02609337, cg05177060, cgl2629796, cg07573366, cg20336172, cgO1209642, cg07417146, cg04859102,
cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280,cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731,cg21461981,cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930, для определения типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250 или более биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479,
cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964 cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005 cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555 cgl8901104, cg25982880, cgl5797834, cg27125093,cgl7518965, cg20695297 cg09419005, cg25490145, cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646 cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721 cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248 cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490 cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934 cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427 cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538,cg22460896, cg07116712 cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756 cg02522196,cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227 cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196 cg05398700, cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307,cgl8842353, cgl0732611 cg02053964, cg25922751, cg25954028, cgl4642045,cg24165921, cgl8215449 cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909,cg07119472, cgl4999168 cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526,cg00862408, cgl6260696
cgl1779113, cg24166457, cgl3911392, cg04858553, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cgO1657186, cg03758697, cg24480810, cgl6402452, cg09399878, cg00220455,
cg20826709
cgl1436362
cgl3924996
cg07420137
cg24301930
cgl3395086
cg20136100,
cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392,cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852,cg25652701,cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907,cgl3597051, cgl8113826,cg04859102, cg01620360,cgl4083015,cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918,cg05352688, cgl8384097,cgl6266227, cgl9675731,cg21461981,cg25765104, cg26394055,cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220,cg26315985,cgl8856478, cg23229016,cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930, для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии, для неинвазивной детекции злокачественной опухоли, для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В некоторых случаях в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более биомаркеров cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343,cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157,cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833,
cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149,cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755,cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756,cg03891050,cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715,cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4 или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555, для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в описанных в настоящем документе способе, системе, платформе или машиночитаемом носителе с постоянной записью предусмотрено применение панели, которая содержит 1, 2, 3, 4 или более биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555, для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии, для неинвазивной детекции злокачественной опухоли, для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, база данных по профилям метилирования CpG содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, база данных по профилям метилирования CpG содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425,
450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из таблиц 17-18. В некоторых случаях база данных по профилям метилирования CpG содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 105, ПО, 115, 120, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264,
cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg23554164 cg25652701 cg26433975 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl0673833 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128 cgl8887230 cg06787669 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg05098343 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cg02609337 cg05177060 cgl2629796 cg07573366 cg27141915, cgl8901104, cg09419005, cg27410601, cg02782634, cg22589778, cg00558804, cg23093496, cgO1990910, cg06380123, cg02522196, cg23764129, cg05398700, cg02053964, cg21376733, cg02874908, cg20826709, cg09153080, cg04314978, cg00907272, cgl3408086, cgl9252956, cgl0351284, cg24107852, cgl6454130, cgl1105292,
cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051,cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691,cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959,cgl7694130,cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688,cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490,cg24742520, cg23013029,cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930. В некоторых случаях база данных по профилям метилирования CpG содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343,cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157,cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964,cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795,cgl5341833,cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005,cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852,cg23824762, cg23021796,cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20). В некоторых случаях база данных по профилям метилирования CpG содержит 1, 2, 3, 4 или более биомаркеров, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751иcgl7126555.
Профиль метилирования
Описываемый в настоящем документе профиль метилирования относится к набору данных, представляющему состояния или уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров (или локусов) в молекуле ДНК. В некоторых случаях описываемый в настоящем документе профиль метилирования относится к набору данных, представляющему состояния или уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17 и/или 18. В некоторых случаях описываемый в настоящем документе профиль метилирования относится к набору данных, представляющему состояния или уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964,cgl1779113, cgl2042264, cg27377213,
cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 eg19693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 eg14642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl7122157, cg25982880, cg25490145, cg03297901, cgl8942579, cg07137244, cg05304979, cg07641284, cg00933696, cgl8610205, cgl1655490, cg04514998, cgl4058476, cg25922751, cgl6509569, cgl0542975, cgl1436362, cg09902130, cg25225070, cg05979232, cgl3555415, cg00015530,
cg08632810
cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164,
cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715,cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343,cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197,cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313,cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541,cg20046343,cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702,cg08098128, cgl3821008,cg27405400, cg09366118,cgl5341833,cg02233149, cgl4247287,cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055,cg20685713, cg23589035,cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930. В некоторых случаях описываемый в настоящем документе профиль метилирования относится к набору данных, представляющему состояния или уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927,cg26769700, cg25574765,cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415,cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213,cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833,cgl4556909,cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762,cg23021796, cg21122474,cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925,cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20). В
некоторых случаях описываемый в настоящем документе профиль метилирования относится к набору данных, представляющему состояния или уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555. В некоторых случаях данные по метилированию ДНК содержат без ограничения индекс метилирования сайта CpG, плотность метилирования сайтов CpG в участке, распределение сайтов CpG в смежном участке, паттерн или уровень метилирования для одного или нескольких отдельных сайтов CpG в участке, который содержит более одного сайта CpG, отсутствие метилирования CpG и/или метилирование отличного от CpG сайта. В некоторых случаях профиль метилирования содержит набор индексов метилирования сайта CpG, набор показателей плотности метилирования сайтов CpG в участке, набор показателей распределения сайтов CpG в смежном участке, набора показателей паттерна или уровня метилирования одного или нескольких отдельных сайтов CpG в участке, который содержит более одного сайта CpG, набор показателей отсутствия метилирования CpG и/или метилирования отличного от CpG сайта или их комбинацию. В некоторых случаях профиль метилирования в настоящем документе также называют отпечатком метилирования или сигнатурой метилирования.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции наличия злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для
неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения прогноза злокачественной опухоли, для прогнозирования ответа на лечение и/или для отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, получают из образца ткани. В некоторых случаях сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, получают из образца бесклеточной ДНК (cfDNA). В некоторых случаях сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, получают из образца циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 15, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 16, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли. В некоторых случаях профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 17, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции наличия злокачественной опухоли в биологическом образце. В некоторых случаях за ним следует по меньшей мере второй профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18, который применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли и необязательно для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264,
cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086
cg24166457, cg27141915, cgl3911392, cgl8901104, cg04858553, cg09419005, cg06153925, cg27410601, cg27023597, cg02782634, cg01722297, cg22589778, cg07644807, cg00558804, cg02358862, cg23093496, cg03653601, cg01990910, cgl0186131,cg06380123, cg03569637, cg02522196, cg01657186, cg23764129, cg03758697, cg05398700, cg24480810, cg02053964, eg16402452, cg21376733, cg09399878,cg02874908, cg00220455, cg20826709, cg20136100, cg09153080,
cg09902130
cg07380416
cg27284288
cgl3912307
cgl0511890
cg00242035
cg04314978,
cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087, cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700,cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584,cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903,cg09335715, cgl2629796,cgl6454130, cg26433975,cgl0673833,cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691,cgl7207512, cg20510285,cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688,cgl8384097, cgl6266227,cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713,cg23589035, cg01903374,cg23612220, cg26315985,cgl8856478,cg23229016, cg21004490,cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции наличия злокачественной опухоли в биологическом образце. В некоторых случаях за ним следует по меньшей мере второй профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113,cgl2042264, cg27377213,cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880,cgl5797834, cg27125093, cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145,cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721,cg27023597,cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721,
cgO1660934
cg02358862
cg23093496
cg07641284
cg01681367
cg26769927
cg08480068,
cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg22460896, cg07116712, cgl0186131, cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756, cg03569637, cg02522196, cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751,cg25954028, cgl4642045,cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569,cg08075204, cgl4556909,cg07119472, cgl4999168,cg09399878, cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696,cg00220455,cg20826709, cgl1436362,cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070,cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232,cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415,cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794,cg26401541, cg20046343,cg20847580, cg03431741,cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959,cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032,cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400,cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097,cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035,cg01903374,cg23612220, cg26315985,cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930, который применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли и необязательно для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза
злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение. В некоторых случаях первый профиль метилирования и/или второй профиль метилирования содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093,cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833,cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930,cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476,cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448,cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280,cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474,cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965,cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 20, применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции наличия злокачественной опухоли в биологическом образце. В некоторых случаях за ним следует по меньшей мере второй профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 20, который применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли и необязательно для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из таблицы 20, применяют с помощью способа,
системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для детекции наличия злокачественной опухоли в биологическом образце. В некоторых случаях за ним следует по меньшей мере второй профиль метилирования, который содержит сведения о состояниях или уровнях метилирования панели биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213,
cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 eg19693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl0673833 cgl6748008 cg26811313 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 eg14642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 eg12737392 cg21031128 cgl8887230 cg06787669 eg16644023 cg25432518 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg06488150 cgl6622899 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg05098343 cg09450197 cgl2359001 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cg02609337 cg05177060 cgl2629796 cg07573366 cg20336172 cgO1209642 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cgl0351284 cg24107852 cgl6454130 cgl1105292 cg08858130 cgl4564351 cgl7122157, cg25982880, cg25490145, cg03297901, cgl8942579, cg07137244, cg05304979, cg07641284, cg00933696, cgl8610205, cgl1655490, cg04514998, cgl4058476, cg25922751, cgl6509569, cgl0542975, cgl1436362, cg09902130, cg25225070, cg05979232, cgl3555415, cg00015530, cg23554164, cg25652701, cg26433975, cg05287480, cgl2098228, cg23429794,
cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796,cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830,cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118,cgl5341833,cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, eg 10055231 и cg26017930, который применяют с помощью способа, системы, платформы или машиночитаемого носителя с постоянной записью для определения типа злокачественной опухоли и необязательно для отличия различных стадий злокачественной опухоли, для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В некоторых случаях профиль метилирования, который охватывает более 30%, 40%), 50%), 60%), 70%), 80%), 90%), 95% или более генома, рассматривают в качестве метилома. В некоторых случаях метилом получают на основании панели биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17 и/или 18. В некоторых случаях способ, система, платформа или машиночитаемый носитель с постоянной записью предусматривает применение описанного в настоящем документе метилома для определения типа злокачественной опухоли. В некоторых случаях способ, система или машиночитаемый носитель с постоянной записью предусматривает применение описанного в настоящем документе метилома для детекции злокачественной опухоли на ранней стадии. В некоторых случаях способ, система, платформа или машиночитаемый носитель с постоянной записью предусматривает применение описанного в настоящем документе метилома для неинвазивной детекции злокачественной опухоли. В некоторых случаях способ, система или машиночитаемый носитель с постоянной записью предусматривает применение описанного в настоящем документе метилома для отличия различных стадий злокачественной опухоли. В еще одних дополнительных случаях способ, система, платформа или машиночитаемый носитель с постоянной записью предусматривает применение описанного в настоящем документе метилома для определения прогноза злокачественной опухоли, прогнозирования ответа на лечение и/или отслеживания ответа на лечение.
В некоторых случаях статус метилирования или уровень метилирования указывает на наличие, отсутствие и/или количественный показатель метилирования в конкретном нуклеотиде, или нуклеотидах, в части ДНК. В некоторых случаях статус метилирования конкретной последовательности ДНК (например, описанного в настоящем документе биомаркера или участка ДНК) указывает на состояние метилирования каждого основания в последовательности, или может указывать на состояние метилирования подгруппы пар оснований (например, цитозинов или состояния метилирования одной или нескольких конкретных последовательностей распознавания рестрикционным ферментом) в последовательности, или может давать информацию касательно плотности метилирования участка в последовательности без предоставления точной информации о том, где в последовательности происходит метилирование. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, статус/уровни метилирования применяют для дифференцировки между различными подтипами или опухолями в целом. В некоторых случаях конкретные паттерны метилирования ДНК позволяют отличать опухоли с низким и высоким метастатическим потенциалом, что позволяет адаптировать режим лечения.
В некоторых случаях статус метилирования в одном или нескольких сайтах метилирования CpG в последовательность ДНК включают неметилированный, полностью метилированный и/или полуметилированный сайт. В некоторых случаях коллекцию профилей метилирования применяют для создания панели метилирования, например, для представления профилей метилирования для группы индивидуумов или для типа или характеристики опухоли. В некоторых случаях гиперметилирование представляет собой среднее состояние метилирования, соответствующее повышенному наличию 5-mCyt в одном или множестве динуклеотидов CpG в последовательности ДНК тестового образца ДНК относительно количества 5-mCyt, обнаруживаемого в соответствующих динуклеотидах CpG в контрольном образце нормальной ДНК. В некоторых случаях гипометилирование представляет собой среднее состояние метилирования, соответствующее сниженному наличию 5-mCyt в одном или множестве динуклеотидов CpG в последовательности ДНК тестового образца ДНК относительно количества 5-mCyt, обнаруживаемого в соответствующих динуклеотидах CpG в контрольном образце нормальной ДНК.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, индекс метилирования для каждого геномного сайта (например, сайта CpG) относится к части считываний последовательности, свидетельствующих о метилировании в сайте, относительно
общего количества считываний, охватывающих этот сайт. В некоторых случаях плотность метилирования в участке представляет собой количество свидетельствующих о метилировании считываний в сайтах в участке, деленное на общее число считываний, охватывающих сайты в этом участке. В некоторых случаях плотность метилирования CpG в участке представляет собой количество считываний, свидетельствующих о метилировании CpG, деленное на общее количество считываний, охватывающих сайты CpG в участке (например, конкретном сайте CpG, сайтах CpG в CpG-островке или большем участке). Например, плотность метилирования для каждого интервала в 100 тыс. оснований в геноме человека определяют из общего количества неконвертированных цитозинов (что соответствует метилированному цитозину) в сайтах CpG как долю всех сайтов CpG, охватываемых считываниями последовательностей, картированных на участке в 100 тыс. оснований. В некоторых случаях этот анализ также выполняют для других размеров интервалов, например, 50 тыс. оснований или 1 миллион оснований и т. д. В некоторых случаях участок представляет собой весь геном или хромосому или часть хромосомы (например, хромосомное плечо). В некоторых случаях индекс метилирования сайта CpG совпадает с плотностью метилирования для участка, если участок включает только этот сайт CpG. В некоторых случаях доля метилированных цитозинов относится к количеству сайтов цитозина "С", для которых было показано, что они являются метилированными (например, неконвертированными после дезаминирующей обработки, такой как бисульфитная конверсия), относительно общего количества проанализированных остатков цитозина, т. е. в том числе цитозинов вне контекста CpG, в участке. В некоторых случаях индекс метилирования, плотность метилирования и доля метилированных цитозинов являются примерами уровней метилирования.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, определение профиля метилирования предусматривает определение статуса метилирования более чем по меньшей мере приблизительно 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 75, or 100, 150, 200, 250, 300, 400, 500, 750, 1000, 2000, 2500, 3000, 4000, 5000, 7500, 10000, 20000, 25000, 30000, 40000, 50000, 75000, 100000, 200000, 300000, 400000, 500000, 600000 и 700000 CpG из образца ДНК. В соответствии с одним аспектом настоящего варианта осуществления, профиль метилирования получают на основании статуса метилирования от приблизительно 1 до приблизительно 500000 сайтов CpG.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профиль метилирования получают из образца биопсии. В некоторых случаях профиль
метилирования получают из образца ткани. В некоторых случаях профиль метилирования получают из бесклеточного биологического образца. В некоторых случаях профиль метилирования получают из образца циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA). Контроль
Различные описанные в настоящем документе методики предусматривают стадию, которая включает сравнение значения, уровня, признака, характеристики, свойства и т. д. с подходящим контролем, взаимозаменяемо называемым в настоящем документе соответствующим контролем, контрольным образцом или контролем. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контроль представляет собой значение, уровень, признак, характеристику, свойство и т. д., определенные в клетке, ткани, органе или образце, полученном от пациента. В некоторых случаях клетка, ткань, орган или образец являются нормальной клеткой, тканью, органом или образцом. В некоторых случаях клетка, ткань, орган или образец являются злокачественной клеткой, тканью, органом или образцом. Например, биомаркеры по настоящему изобретению анализируют в отношении уровня их метилирования в образце от непораженного индивидуума, или нормального контрольного индивидуума, или непораженного члена семьи субъекта. В соответствии с другим вариантом осуществления, контроль представляет собой значение, уровень, признак, характеристику, свойство и т. д., определенные до начала проведении терапии (например, лечения злокачественной опухоли) на пациенте или посреди терапевтического режима. В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, контроль представляет собой предопределенное значение, уровень, признак, характеристик, свойство и т. д.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, контроль представляет собой профиль метилирования одного или нескольких биомаркеров по настоящему изобретению, который коррелирует с одним типом злокачественной опухоли, с которым сравнивают образец пациента. В некоторых случаях контроль представляет собой профиль метилирования одного или нескольких биомаркеров из таблиц 15, 16, 17, 18 и/или 20. В некоторых случаях контроль представляет собой профиль метилирования одного или нескольких биомаркеров cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502,cgl2504877, cg21913888,cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505,cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880, cgl5797834, cg27125093, cgl7518965,cg20695297, cg04858553, cg09419005,
cg25490145: cg03297901: cgl8942579 cg07137244: cg05304979: cg07641284: cg00933696: cgl8610205: cgll655490: cg04514998: cgl4058476: cg25922751: cgl6509569 cgl0542975: cgl1436362 cg09902130: cg25225070: cg05979232: cgl3555415: cg00015530: cg23554164 cg25652701: cg26433975: cg05287480: cgl2098228: cg23429794: cg06482498: cgl4083015: cg05614346: cg07428959: cg07186032 cg27405400: cg05656900: cg21461981: cgll252953: cg06853339 cg01409343: cg04147906: cg27598656: cg01681367 cg09866569: cgl2353452 cgl9693177 cg07332880: cgl8158859 cg25954028: cg08075204: cgl5698795: cgl3924996: cg07380416: cg20411756: cg00025044: cg22552736: cg08632810: cgl9021985: cg00282244: cgl0673833: cgl6748008: cg26811313: cg26401541: cg03891050: cgl5046123: cg06439655: cgl 7694130: cg08052292: cg09366118: cg08132573: cg25765104 cgl8456621: cgl2900649: cgl0530767 cg23878564: cg03549146: cg26769927: cg20357538: cgl0590292 cg26363363: cgl6061668: cgl9300307 cgl4642045: cgl4556909 cgll791526: cg07420137 cg27284288: cg24247537: cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128: cgl8887230: cg06787669: cgl6644023: cg25432518: cg20046343: cg00899907: cg03190513: cgll334870: cg03956042: cg27366280: cgl5341833: cg24686918: cg26394055: cg07058988: cg27219182 cg26112797 cg07860918: cg22190721: cg08480068: cg22460896: cg00037681: cg21249754 cg25574765: cgl8842353: cg24165921: cg07119472 cg00862408: cg24301930: cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700: cgl9421584 cg08486903: cgl2192582 cg06488150: cgl6622899 cg20847580: cgl3597051: cg01456691: cg08912922 cgl9266387 cg06825448: cg02233149 cg05352688: cg20685713: cgl7864646: cgl5759721: cg00253248: cg00206490: cgO1660934 cg02914427: cg07116712 cg05596756: cg23147227: cgl4088196: cgl0732611: cgl8215449 cgl4999168: cgl6260696: cgl3395086: cgl0511890: cg23130731: cg27388962: cgl3464240: cg03218479 cgl7984956: cg09335715: cg05098343: cg09450197 cgl2359001: cg03431741: cgl8113826: cgl7207512 cg23021796: cgl3512830: cg25451702 cgl4247287: cgl8384097 cg23589035: cg06153925: cg27023597: cg01722297: cg07644807: cg02358862 cg03653601: cgl0186131: cg03569637 cg01657186: cg03758697 cg24480810: cgl6402452: cg09399878: cg00220455: cg20136100: cg00242035: cg04888360: cg05931497 cgl4633252 cg02609337: cg05177060: cgl2629796: cg07573366: cg20336172 cg01209642: cg07417146: cg04859102 cg20510285: cg24835948: cgl9982684 cg08098128: cg23824762: cgl6266227: cgO1903374 cg27410601: cg02782634: cg22589778: cg00558804 cg23093496: cgO 1990910: cg06380123: cg02522196: cg23764129: cg05398700: cg02053964: cg21376733: cg02874908: cg20826709: cg09153080: cg04314978: cg00907272: cgl3408086: cgl9252956: cgl0351284 cg24107852 cgl6454130: cgl1105292 cg08858130: cgl4564351: cg09001226: cgO 16203 60: cgO1149192 cgl0393744 cg22513455: cgl3821008: cgO 1604601: cgl9675731: cg23612220:
cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930. В некоторых случаях контроль представляет собой профиль метилирования одного или нескольких биомаркеров cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 ncgl7126555.
В некоторых случаях контроль представляет собой положительный контроль, например, профиль метилирования, полученный из образца злокачественной опухоли, или представляет собой отрицательный контроль, например, профиль метилирования, полученный из нормального образца. В некоторых случаях контроль также называют обучающим набором или обучающим набором данных.
Способы детекции
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, используют ряд способов для измерения, детектирования, определения, идентификации и характеристики статуса/уровня метилирования биомаркера (т. е. участка/фрагмента ДНК или участка/фрагмента геномной ДНК (например, содержащего CpG-островки участка/фрагмента)) в ходе развития заболевания или состояния (например, злокачественной опухоли) и, таким образом, диагностики начала, наличия или статуса заболевания или состояния.
В некоторых случаях профиль метилирования создан на основе биологического образца, взятого у индивидуума. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологический образец представляет собой образец биопсии. В некоторых случаях биологический образец представляет собой образец ткани. В других случаях биологический образец представляет собой бесклеточный биологический образец. В других случаях биологический образец представляет собой образец циркулирующей опухолевой ДНК. В соответствии с одним вариантом осуществления, биологический образец представляет собой бесклеточный биологический образец, содержащий циркулирующую опухолевую ДНК.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биомаркер (также называемый в настоящем документе маркером) получают из образца ткани. В некоторых случаях ткань соответствует любой клетке(клеткам). Различные типы ткани соответствуют различным типам клеток (например, ткани печени, легкого, крови, соединительной ткани и т. п.), а также здоровым клеткам относительно опухолевых клеток, или опухолевым клеткам на разных стадиях неоплазий, или покинувшим место первичной локализации злокачественным опухолевым клеткам. В соответствии с
некоторыми вариантами осуществления, образец ткани дополнительно охватывает клинический образец, а также включает клетки в культуре, клеточные супернатанты, органы и т. п. Образцы также содержат свежезамороженные и/или зафиксированные в формалине, залитые парафином тканевые блоки, такие как блоки, приготовленные из клинических или патологических образцов биопсии, подготовленные для патологического анализа или исследования с помощью иммуногистохимии.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биомаркер получают из жидкого образца. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, жидкий образец включает кровь и другие жидкие образцы биологического происхождения (включая без ограничения периферическую кровь, сыворотку, плазму, асцит, мочу, спинномозговую жидкость (CSF), мокроту, слюну, костный мозг, синовиальную жидкость, внутриглазную жидкость, амниотическую жидкость, серу, грудное молоко, бронхоальвеолярную лаважную жидкость, сперму, сок предстательной железы, Куперову жидкость или предэякулят, женский эякулят, пот, слезы, жидкость кисты, плевральную и перитонеальную жидкость, перикардиальную жидкость, асцит, лимфу, химус, хилус, желчь, интерстициальную жидкость, менструальные выделения, гной, кожное сало, рвоту, вагинальные выделения/промывку, синовиальную жидкость, секрецию слизистой оболочки, воду из стула, сок поджелудочной железы, лаважные жидкости из полостей синуса, бронхолегочные аспираты, жидкость сегментационной полости или пуповинную кровь. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биологическая жидкость представляет собой кровь, производное крови или фракцию крови, например, сыворотку или плазму. В соответствии с конкретным вариантом осуществления, образец включает образец крови. В соответствии с другим вариантом осуществления, применяют образец сыворотки. В соответствии с другим вариантом осуществления, образец включает мочу. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, жидкий образец также охватывает образец, который каким-либо образом был обработан после его получения, например, путем центрифугирования, фильтрации, осаждения, диализа, хроматографии, обработки реагентами, был промыт или обогащен в отношении определенных клеточных популяций.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, биомаркер является метилированным или неметилированным в нормальном образце (например, нормальной или контрольной ткани без заболевания или нормальной или контрольной жидкости организма, стуле, крови, сыворотке, амниотической жидкости), что наиболее важно, в здоровом стуле, крови, сыворотке, амниотической жидкости или другой жидкости
организма. В соответствии с другими вариантами осуществления, биомаркер является гипометилированным или гиперметилированным в образце от пациента, у которого есть злокачественная опухоль или присутствует риск ее развития; например, с уменьшенной или увеличенной (соответственно) частотой метилирования по меньшей мере приблизительно на 50%, по меньшей мере приблизительно на 60%, по меньшей мере приблизительно на 70%, по меньшей мере приблизительно на 75%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 85%, по меньшей мере приблизительно на 90%, по меньшей мере приблизительно на 95% или приблизительно на 100% по сравнению с нормальным образцом. В соответствии с одним вариантом осуществления, образец также является гипометилированным или гиперметилированным по сравнению с ранее полученными результатами анализа образца от того же пациента, у которого есть злокачественная опухоль или присутствует риск ее развития, в частности для сравнения прогрессирования заболевания.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, метилом содержит набор биомаркеров, такой как описанный выше биомаркер. В некоторых случаях метилом, который соответствует метилому опухоли организма (например, человека), классифицируют как опухолевый метилом. В некоторых случаях опухолевый метилом определяют с применением опухолевой ткани или бесклеточной (или безбелковой) опухолевой ДНК в биологическом образце. В число других примеров представляющих интерес метиломов входят метиломы органов, которые способствуют попаданию ДНК в жидкость организма (например, метиломы ткани, например, головного мозга, молочной железы, легкого, предстательной железы и почек, плазмы и т. д.).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, метилом плазмы представляет собой метилом, определенный из плазмы или сыворотки животного (например, человека). В некоторых случаях метилом плазмы является примером бесклеточного или безбелкового метилома, поскольку плазма и сыворотка включают бесклеточную ДНК. Метилом плазмы также является примером смешанного метилома, поскольку он является смесью из опухолевого и других представляющих интерес метиломов. В некоторых случаях метилом мочи определяют из образца мочи субъекта. В некоторых случаях клеточный метилом соответствует метилому, определенному из клеток (например, клеток ткани из органа, такого как головной мозг, легкое, молочная железа и т. п.) пациента. Метилом гемоцитов называется метиломом гемоцитов (или метиломом крови).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, ДНК (например, геномную ДНК, такую как экстрагированная геномная ДНК или обработанная геномная ДНК) выделяют любыми стандартами в настоящей области техники способами, включая применение коммерчески доступных наборов. Вкратце, если представляющая интерес ДНК инкапсулирована клеточной мембраной, биологический образец должен быть разрушен и лизирован ферментативными, химическими или механическими способами. В некоторых случаях раствор ДНК затем очищают от белков и других примесей, например, путем расщепления протеиназой К. Затем извлекают ДНК из раствора. В таких случаях это осуществляют с помощью различных способов, включая высаливание, органическую экстракцию или связывание ДНК с твердофазной подложкой. В некоторых случаях на выбор способа влияют несколько факторов, включая время, расход и необходимое количество ДНК.
Если образец ДНК не заключен в мембрану (например, циркулирующая ДНК из бесклеточного образца, такого как кровь или моча), необязательно используют стандартные в настоящей области техники способы выделения и/или очистки ДНК (см., например, Bettegowda et al. Detection of Circulating Tumor DNA in Early- and Late-Stage Human Malignancies. Sci. Transl. Med, 6(224): ra24. 2014). Такие способы предусматривают применение разрушающего белок реагента, например, хаотропной соли, например, гидрохлорида гуанидина или мочевины; или детергента, например, додецилсульфата натрия (SDS), бромистого цианогена. Альтернативные способы предусматривают без ограничения осаждение этанолом или осаждение пропанолом, вакуумное концентрирование, в частности, с помощью центрифуги. В некоторых случаях специалист в настоящей области техники также применяет устройства, такие как фильтрующие устройства, например, ультрафильтрацию, кремнеземные поверхности или мембраны, магнитные частицы, полистироловые частицы, полистироловые поверхности, положительно заряженные поверхности и положительно заряженные мембраны, заряженные мембраны, заряженные поверхности, заряженные переключаемые мембраны, заряженные переключаемые поверхности.
В некоторых случаях после экстрагирования нуклеиновых кислот осуществляют анализ метилирования любыми известными в настоящей области способами. Из уровня техники известен ряд процедур для анализа метилирования, и их можно применять для осуществления на практике настоящего изобретения. Эти анализы позволяют проводить определение состояния метилирования одного или множества сайтов CpG в образце ткани. Кроме того, эти способы можно применять для абсолютной или относительной
количественной оценки метилированных нуклеиновых кислот. Такие анализы метилирования включают, помимо прочих методов, две основные стадии. Первой стадией является специфическая к участкам метилирования реакция или разделение, например, (i) обработка бисульфитом, (ii) специфическое к участкам метилирования связывание или (iii) специфические к участкам метилирования рестрикционные ферменты. Вторая основная стадия предусматривает (i) амплификацию и детекцию или (ii) прямую детекцию рядом способов, такими как (а) ПЦР (специфичная к последовательности амплификация), такая как Taqman(R), (b) секвенирование ДНК не обработанной и обработанной бисульфитом ДНК, (с) секвенирование лигированием модифицированных красителем зондов (в том числе циклическое лигирование и отщепление), (d) пиросеквенирование, (е) одномолекулярное секвенирование, (f) масс-спектроскопия или (g) саузерн-блоттинг.
Кроме того, можно применять расщепление рестрикционными ферментами ПЦР-продуктов, амплифицированных с подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК, например, способом, описанным в работе Sadri и Hornsby (1996, Nucl. Acids Res. 24:50585059), или COBRA (комбинированным бисульфитным рестрикционным анализом) (Xiong and Laird, 1997, Nucleic Acids Res. 25:2532- 2534). Анализ COBRA представляет собой количественный анализ метилирования, пригодный для определения уровней метилирования ДНК в конкретных генных локусах в небольших количествах геномной ДНК. Вкратце, расщепление рестрикционными ферментами применяют для выявления зависимых от метилирования различий в ПЦР-продуктах обработанной бисульфитом натрия ДНК. Зависимые от метилирование различия последовательностей сначала вводят в геномную ДНК путем стандартной обработки бисульфитом в соответствии с процедурой, описанной в работе Frommer и соавт. (Frommer et al, 1992, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 89, 1827-1831). Затем проводят ГЩР-амплификацию подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК с применением праймеров, специфических к представляющим интерес сайтам CpG, с последующим расщеплением рестрикционным эндонуклеазам, гель-электрофорезом и детектированием с применением специфических меченых зондов гибридизации. Уровни метилирования в исходном образце ДНК представлены относительными количествами расщепленного и нерасщепленного ПЦР-продукта в линейно-количественной зависимости по широкому спектру уровней метилирования ДНК. Кроме того, эту методику можно надежно применять в отношении ДНК, полученной из микрообразцов, иссеченных из запечатанных в парафин образцов ткани. Типичные реагенты (например, которые можно найти в типичном наборе на
основе COBRA) для анализа COBRA могут включать без ограничения: ПЦР-праймеры для конкретного гена (или измененной в результате метилирования последовательности ДНК или CpG-островка); рестрикционный фермент и соответствующий буфер; олигонуклеотиды гибридизации с генами; олигонуклеотиды контрольной гибридизации; набор для мечения киназами для олигонуклеотидного зонда; и радиоактивные нуклеотиды. Кроме того, реагенты для бисульфитной конверсии могут включать: буфер для денатурации ДНК; буфер для сульфонирования; реагенты или наборы для выделения ДНК (например, осаждением, ультрафильтрацией, на аффинной колонке); буфер для десульфонирования; и компоненты для выделения ДНК.
В соответствии с одним вариантом осуществления, профиль метилирования выбранных сайтов CpG определяют с помощью специфичной к участкам метилирования ПНР (MSP). MSP позволяет производить оценку статуса метилирования практически любой группы сайтов CpG в CpG-островке, независимо от применения чувствительных к метилированию рестрикционных ферментов (Herman et al, 1996, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 93, 9821- 9826; патенты США № 5786146, № 6017704, № 6200756, № 6265171 (Herman и Baylin); патентная публикация США № 2010/0144836 (Van Engeland и соавт.), содержание которых, таким образом, включено посредством ссылки в их полном объеме). Вкратце, ДНК модифицируют дезаминирующим средством, таким как бисульфит натрия, для конверсии неметилированных, но не метилированных цитозинов, в урацил, а затем амплифицируют с помощью праймеров, специфичных к метилированной, но не к неметилированной ДНК. Типичные реагенты (например, которые можно найти в типичном наборе на основе MSP) для анализа MSP могут включать без ограничения метилированные и неметилированные ПЦР-праймеры для конкретного гена (или измененной в результате метилирования последовательности ДНК или CpG-островка), оптимизированные для ПЦР буферы и дезоксинуклеотиды и специфические зонды. Тест ColoSure(tm) представляет собой коммерчески доступный тест на злокачественную опухоль толстой кишки на основе технологии MSP и для измерения метилирования гена виментина (Itzkowitz et al, 2007, Clin Gastroenterol. Hepatol. 5(1), 111117). Альтернативно можно применять количественную мультиплексированную специфическую к участкам метилирования ПЦР (QM-PCR), которая описана в работе Fackler и соавт. Fackler et al, 2004, Cancer Res. 64(13) 4442-4452; или Fackler et al, 2006, Clin. Cancer Res. 12(11 Pt 1) 3306-3310.
В соответствии с одним вариантом осуществления, профиль метилирования выбранных сайтов CpG определяют с помощью способов MethyLight и/или Heavy
Methyl. Анализы MethyLight и Heavy Methyl представляют собой высокотехнологичный количественный анализ метилирования, в котором используют технологию флуоресцентной ПЦР (Taq Man(R)) в режиме реального времени, которая не требует дальнейших манипуляций после стадии ПЦР (Eads, С.A. et al, 2000, Nucleic Acid Res. 28, e 32; Cottrell et al, 2007, J. Urology 177, 1753, патент США № 6331393 (Laird et al), содержание которых, таким образом, включено посредством ссылки в их полном объеме). Вкратце, способ MethyLight начинают со смешанного образца геномной ДНК, которую конвертируют в реакции с бисульфитом натрия в смешанный пул зависимых от метилирования различий в соответствии со стандартными процедурами (с помощью бисульфитного способа конвертируют неметилированные остатки цитозина в урацил). Затем проводят флуоресцентную ПЦР либо в "несмещенной" (с праймерами, которые не перекрывают известные сайты метилирования CpG), либо в "смещенной" (с ПЦР-праймерами, которые перекрывают известные динуклеотиды CpG) реакции. В некоторых случаях распознание последовательности происходит либо на уровне процесса амплификации, либо на уровне процесса флуоресцентного детектирования, либо в обоих случаях. В некоторых случаях анализ MethyLight применяют в качестве количественного теста на паттерны метилирования в образце геномной ДНК, причем распознание последовательности происходит на уровне гибридизации зонда. В этом количественном варианте реакция ПЦР обеспечивает несмещенную амплификацию в присутствии флуоресцентного зонда, который перекрывает конкретный предполагаемый сайт метилирования. Несмещенный контроль количества входящей ДНК обеспечивают с помощью реакции, в которой ни праймеры, ни зонд не перекрывают какие-либо динуклеотиды CpG. Альтернативно, качественный тест в отношении геномного метилирования осуществляют путем зондирования пула смещенных ПЦР-продуктов с применением либо контрольных олигонуклеотидов, которые не "охватывают" известные сайты метилирования (флуоресцентный вариант методики "MSP"), либо олигонуклеотидов, охватывающих потенциальные сайты метилирования. В число типичных реагентов (например, которые можно найти в типичном наборе на основе MethyLight) для анализа MethyLight могут входить без ограничения: ПЦР-праймеры для конкретного гена (или измененной метилированием последовательности ДНК или CpG-островка); зонды TaqMan(R); оптимизированные для ПЦР буферы и дезоксинуклеотиды; и Taq-полимераза. Технологию MethyLight применяют для коммерчески доступных тестов на злокачественную опухоль легкого (набор для анализа epi proLung BL Reflex Assay); злокачественную опухоль толстой
кишки (набор для анализа epi proColon и набор для анализа mSEPT9) (Epigenomics, Берлин, Германия), РСТ публикация № WO 2003/064701 (Schweikhardt и Sledziewski), содержание которой, таким образом, включено посредством ссылки в полном ее объеме.
Количественный MethyLight предусматривает применения бисульфита для конвертации геномной ДНК, а метилированные сайты амплифицируют с помощью ПЦР с независимыми от метилирования праймерами. Детекторные зонды, специфичные к метилированным и неметилированным сайтам, с двумя различными флуорофорами обеспечивают одновременное количественное измерение метилирования. Методику Heavy Methyl начинают с бисульфатной конверсии ДНК. Затем при помощи специфических блокаторов предотвращают амплификацию неметилированной ДНК. Метилированная геномная ДНК не связывается с блокаторами, и ее последовательности будут амплифицироваться. Амплифицированные последовательности детектируют с помощью специфичного к участкам метилирования зонда. (Cottrell et al, 2004, Nuc. Acids Res. 32:el0, содержание которой, таким образом, включено в настоящий документ посредством ссылки в полном ее объеме).
Методика Ms-SNuPE представляет собой количественный способ оценки различий метилирования в конкретных сайтах CpG на основе обработки бисульфитом ДНК с последующей однонуклеотидной достройкой праймера (Gonzalgo and Jones, 1997, Nucleic Acids Res. 25, 2529-2531). Вкратце, геномную ДНК вводят в реакцию с бисульфитом натрия для конвертации неметилированного цитозина в урацил, при этом оставляя 5-метилцитозин неизмененным. Затем проводят амплификацию необходимой целевой последовательности с использованием ПЦР-праймеров, специфичных к подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК, и полученный продукт выделяют и применяют в качестве матрицы для анализа метилирования в представляющем интерес сайте(сайтах) CpG. В некоторых случаях анализируют небольшие количества ДНК (например, микрообразцы, иссеченные из срезов патологии), и такой способ позволяет избежать использования рестрикционных ферментов для определения статуса метилирования в сайтах CpG. В число типичных реагентов (например, которые можно найти в типичном наборе на основе Ms-SNuPE) для анализа Ms- SNuPE входят без ограничения: ПЦР-праймеры для конкретного гена (или измененной в результате метилирования последовательности ДНК или CpG-островка); оптимизированные для ПЦР буферы и дезоксинуклеотиды; набор для экстракции из геля; праймеры положительного контроля; Ms-SNuPE-праймеры для конкретного гена; реакционный буфер (для реакции Ms-SNuPE); и радиоактивные нуклеотиды. Кроме того, реагенты для
бисульфитной конверсии могут включать: буфер для денатурации ДНК; буфер для сульфонирования; реагенты или набор для выделения ДНК (например, осаждением, ультрафильтрацией, на аффинной колонке); буфер для десульфонирования; и компоненты для выделения ДНК.
В соответствии с другим вариантом осуществления, статус метилирования выбранных сайтов CpG определяют с помощью способов детекции метилирования на основе дифференциального связывания. Что касается идентификации дифференциально метилированных участков, один подход заключается в захвате метилированной ДНК. Этот подход предусматривает применение белка, в котором метилсвязывающий домен MBD2 гибридизирован с Fc-фрагментом антитела (MBD-FC) (Gebhard et al, 2006, Cancer Res. 66:6118-6128; и PCT публикация № WO 2006/056480 А2 (Relhi), содержание которых, таким образом, включено посредством ссылки в их полном объеме). Такой гибридный белок обладает несколькими преимуществами относительно традиционных, специфичных к участкам метилирования антител. MBD FC имеет более высокое сродство к метилированной ДНК и связывает двухцепочечную ДНК. Самое главное, что эти два белка отличаются тем, как они связывают ДНК. Специфические к участкам метилирования антитела связывают ДНК стохастически, а это означает, что можно получить только бинарный ответ. Метилсвязывающий домен MBD-FC, с другой стороны, связывает молекулы ДНК независимо от статуса их метилирования. Прочность такого взаимодействия между белком и ДНК определяется уровнем метилирования ДНК. После связывания геномной ДНК можно применять растворы элюата с увеличивающимися концентрациями солей для фракционирования неметилированной и метилированной ДНК, что позволяет производить более контролируемое разделение (Gebhard et al., 2006, Nucleic Acids Res. 34: e82). Следовательно, с помощью этого способа, называемого метил-СрО-иммунопреципитацией (МСГР), не только обогащают, но и фракционируют геномную ДНК в соответствии с уровнем метилирования, что особенно полезно, если также необходимо исследовать фракцию неметилированной ДНК.
В соответствии с альтернативным вариантом осуществления, антитело к 5-метилцитидину связывает и осаждает метилированную ДНК. Антитела доступны от Abeam (Кембридж, Массачусетс), Diagenode (Спарта, Нью-Джерси) или Eurogentec (к/о AnaSpec, Фримонт, Калифорния). После отделения метилированных фрагментов их можно секвенировать с использованием методик на основе микрочипов, таких как анализ с выделением метилированных CpG-островков (МША) или иммунопреципитация
метилированной ДНК (MeDIP) (Pelizzola et al, 2008, Genome Res. 18, 1652-1659; O'Geen et al, 2006, BioTechniques 41(5), 577-580, Weber et al, 2005, Nat. Genet. 37, 853-862; Horak and Snyder, 2002, Methods Enzymol, 350, 469-83; Lieb, 2003, Methods Mol Biol, 224, 99109). Другая методика предусматривает связывание на колонке с доменами, связывающимися с метил-СрО/разделение частично расплавленных молекул (MBD/SPM, Shiraishi et al, 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96(6):2913-2918).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способы детекции метилирования предусматривают случайное гидродинамическое фрагментирование или случайное фрагментирование геномной ДНК, разрезание ДНК с помощью зависимого от метилирования или чувствительного к метилированию рестрикционного фермента и последующую селективную идентификацию и/или анализ разрезанной или неразрезанной ДНК. Селективная идентификация может включать, например, разделение разрезанной и неразрезанной ДНК (например, по размеру) и количественную оценку представляющей интерес последовательности, которая была разрезана или, альтернативно, не была разрезана. См., например, патент США № 7186512. Альтернативно, способ может предусматривать амплификацию интактной ДНК после расщепления рестрикционным ферментом, тем самым обеспечивая только амплификацию ДНК, которая не была расщеплена рестрикционным ферментом в амплифицируемой области. См., например, патенты США № 7910296, № 7901880 и № 7459274. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, амплификацию можно выполнять с применением праймеров, которые являются геноспецифическими.
Например, существуют метилчувствительные ферменты, которые преимущественно или в основном производят отщепление или расщепление в участке с распознаваемой последовательностью ДНК, если он является неметилированным. Таким образом, образец неметилированной ДНК разрезается на более мелкие фрагменты, чем образец метилированной ДНК. Аналогичным образом, образец гиперметилированной ДНК не расщепляется. И наоборот, существуют метилчувствительные ферменты, которые производят отщепление в участке с распознаваемой последовательностью ДНК, только если он метилирован. В число метилчувствительных ферментов, которые расщепляют неметилированную ДНК, пригодных для использования согласно способам этой технологии, входят без исключения Hpall, Hhal, Maell, BstUI и Acil. В некоторых случаях применяемым ферментом является Hpall, который разрезает только неметилированную последовательность CCGG. В других случаях другим применяемым ферментом является Hhal, который разрезает только неметилированную
последовательность GCGC. Оба фермента доступны от New England BioLabs(R), Inc. Также применяют комбинации из двух или более метилчувствительных ферментов, которые расщепляют только неметилированную ДНК. В число подходящих ферментов, которые расщепляют только метилированную ДНК, входят без ограничения Dpnl, который разрезает только полностью метилированные последовательности 5'-GATC, и МсгВС, эндонуклеаза, которая разрезает ДНК, содержащую модифицированные цитозины (5-метилцитозин, или 5-гидроксиметилцитозин, или №-метилцитозин) и разрезает в сайте распознавания 5'... PumC(N4o-3ooo) PumC... 3' (New England BioLabs, Inc., Беверли, Массачусетс). Специалистам в настоящей области техники хорошо известны способы и процедуры расщепления для выбранных рестрикционных ферментов для разрезания ДНК в конкретных сайтах. Например, многие поставщики рестрикционных ферментов предоставляют информацию об условиях и типах последовательностей ДНК, разрезаемых конкретными рестрикционными ферментами, в том числе New England BioLabs, Pro-Mega Biochems, Boehringer-Mannheim и другие. В работе Sambrook и соавт. (см. Sambrook et al. Molecular Biology: A Laboratory Approach, Cold Spring Harbor, N.Y. 1989) приведено общее описание способов применения рестрикционных ферментов и других ферментов.
В некоторых случаях зависимый от метилирования рестрикционный фермент представляет собой рестрикционный фермент, который производит отщепление или расщепление ДНК в или близко к метилированной последовательности распознания, но не производит отщепления ДНК в или вблизи той же последовательности, если эта последовательность распознания не является метилированной. В число зависимых от метилирования рестрикционных ферментов входят такие, которые производят разрезание в метилированной последовательности распознания (например, Dpnl), и ферменты, которые производят разрезания возле, но не в последовательности распознания (например, МсгВС). Например, последовательностью распознания для МсгВС является 5' RmC (N40-3000) RmC 3', где "R" представляет собой пурин, а "тС" представляет собой метилированный цитозин, в то время как "N40-3000" указывает на расстояние между двумя полусайтами RmC для каждого наблюдаемого события рестрикции. МсгВС обычно производит разрезание вблизи одного полусайта или другого, но положения отщепления обычно распределены на протяжении нескольких пар оснований, примерно на расстоянии 30 пар оснований от метилированного основания. Иногда МсгВС производит разрезание на 3' от обоих полусайтов, иногда на 5' от обоих полусайтов, а иногда между этими двумя сайтами. В число иллюстративных
зависимых от метилирования рестрикционных ферментов входят, например, МсгВС, McrA, MrrA, Bisl, Glal и Dpnl. Специалисту в настоящей области техники будет понятно, что любой зависимый от метилирования рестрикционный фермент, включая гомологи и ортологи описываемых в настоящем документе рестрикционных ферментов, также подходит для применения в настоящем изобретении.
В некоторых случаях чувствительный к метилированию рестрикционный фермент представляет собой рестрикционный фермент, который производит отщепление ДНК в или близко к неметилированной последовательности распознания, но не производит отщепления в или близко к той же последовательности, если эта последовательность распознания является метилированной. Иллюстративные чувствительные к метилированию рестрикционные ферменты описаны, например, в работе McClelland et al, 22(17) NUCLEIC ACIDS RES. 3640-59 (1994). В число подходящих чувствительных к метилированию рестрикционных ферментов, которые не отщепляют ДНК в или вблизи их последовательности распознания, если цитозин в последовательности распознания является метилированным в положении С5, входят, например, Aat II, Aci I, Acd I, Age I, Alu I, Asc I, Ase I, AsiS I, Bbe I, BsaA I, BsaH I, BsiE I, BsiW I, BsrF I, BssH II, BssK I, BstB I, BstN I, BstU I, Cla I, Eae I, Eag I, Fau I, Fse I, Hha I, HinPl I, HinC II, Нра II, Hpy99 I, HpyCH4 IV, Kas I, Mbo I, Mlu I, MapAl I, Msp I, Nae I, Nar I, Not I, Pml I, Pst I, Pvu I, Rsr II, Sac II, Sap I, Sau3 A I, Sfl I, Sfo I, SgrA I, Sma I, SnaB I, Tsc I, Xma I и Zra I. В число подходящих чувствительных к метилированию рестрикционных ферментов, которые не отщепляют ДНК в или вблизи их последовательности распознания, если аденозин в последовательности распознания является метилированным в положении N6, входят, например, Mbo I. Специалисту в настоящей области техники будет понятно, что любой чувствительный к метилированию рестрикционный фермент, включая гомологи и ортологи описываемых в настоящем документе рестрикционных ферментов, также подходит для применения в настоящем изобретении. Специалист в настоящей области техники к тому же поймет, что чувствительный к метилированию рестрикционный фермент, который не может производить разрезание при наличии метилирования у цитозина в или вблизи его последовательности распознания, может быть нечувствительным к наличию метилирования у аденозина в или вблизи его последовательности распознания. Аналогично, чувствительный к метилированию рестрикционный фермент, который не может производить разрезание при наличии метилирования у аденозина в или вблизи его последовательности распознания, может быть нечувствительным к наличию
метилирования у цитозина в или вблизи его последовательности распознания. Например, Sau3AI чувствителен (т. е. может производить разрезание) к наличию метилированного цитозина в или вблизи его последовательности распознания, но не чувствителен (т. е. производит разрезание) к наличию метилированного аденозина в или вблизи его последовательности распознания. Специалисту в настоящей области техники также будет понятно, что некоторые чувствительные к метилированию рестрикционные ферменты блокируются метилированием оснований на одной или обеих цепях ДНК, охватывающих их последовательность распознания, тогда как другие чувствительные к метилированию рестрикционные ферменты блокируются только метилированием на обеих нитях, но могут производить разрезание, если сайт распознавания полуметилирован.
В соответствии с альтернативными вариантами осуществления, к концам случайным образом фрагментированной ДНК необязательно добавляют адаптеры, затем ДНК расщепляют посредством зависимого от метилирования или чувствительного к метилированию рестрикционного фермента, а интактную ДНК после этого амплифицируют с применением праймеров, которые гибридизируются с адапторными последовательностями. В этом случае для определения наличия, отсутствия или количества конкретного гена в амплифицированном пуле ДНК выполняют вторую стадию. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, ДНК амплифицируют с помощью количественной ПЦР в режиме реального времени.
В соответствии с другими вариантами осуществления, способы предусматривают количественную оценку средней плотности метилирования у целевой последовательности в совокупности геномной ДНК. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, способ предусматривает приведение в контакт геномной ДНК с зависимым от метилирования рестрикционным ферментом или чувствительным к метилированию рестрикционным ферментом в условиях, которые позволяют по меньшей мере некоторым копиям потенциальных сайтов расщепления рестрикционным ферментом в локусе оставаться нерасщепленными; количественное определение интактных копий локуса; и сравнение количества амплифицированного продукта с контрольным значением, представляющим количественный показатель метилирования контрольной ДНК, тем самым определяя среднюю плотность метилирования в локусе по сравнению с плотностью метилирования контрольной ДНК.
В некоторых случаях количественный показатель метилирования локуса ДНК определяют путем получения образца геномной ДНК, содержащей такой локус,
расщепления ДНК посредством рестрикционного фермента, который является либо чувствительным к метилированию, либо зависимым от метилирования, а затем определения количества интактной ДНК или определения количества разрезанной ДНК в представляющем интерес локусе ДНК. Количество интактной или разрезанной ДНК будет зависеть от исходного количества геномной ДНК, содержащей локус, степени метилирования в локусе и количества (т. е. доли) нуклеотидов в локусе, которые являются метилированными в геномной ДНК. Степень метилирования в локусе ДНК можно определить путем сравнения количества интактной ДНК или разрезанной ДНК с контрольным значением, представляющим количество интактной ДНК или разрезанной ДНК в аналогичным образом обработанном образце ДНК. Контрольное значение может представлять собой известное или прогнозируемое количество метилированных нуклеотидов. Альтернативно, контрольное значение может представлять количество интактной или разрезанной ДНК из одного и того же локуса в другой (например, нормальной, не пораженной заболеванием) клетке или во втором локусе.
Путем применения по меньшей мере одного чувствительного к метилированию или зависимого от метилирования рестрикционного фермента в условиях, которые позволяют по меньшей мере некоторым копиям потенциальных сайтов расщепления рестрикционным ферментом в локусе оставаться нерасщепленными, а затем количественного определения оставшихся интактных копий и сравнения количества с контролем можно определить среднюю плотность метилирования локуса. Если чувствительный к метилированию рестрикционный фермент привести в контакт с копиями локуса ДНК в условиях, которые позволяют по меньшей мере некоторым копиям потенциальных сайтов расщепления рестрикционным ферментом в локусе оставаться нерасщепленными, тогда оставшаяся интактная ДНК будет прямо пропорциональна плотности метилирования, и, таким образом, ее можно сравнить с контролем для определения относительной плотности метилирования локуса в образце. Аналогичным образом, если зависимый от метилирования рестрикционный фермент привести в контакт с копиями локуса ДНК в условиях, которые позволяют по меньшей мере некоторым копиям потенциальных сайтов расщепления рестрикционным ферментом в локусе оставаться нерасщепленными, тогда оставшаяся интактная ДНК будет обратно пропорциональна плотности метилирования, и, таким образом, ее можно сравнить с контролем для определения относительной плотности метилирования локуса в образце. Такие анализы раскрыты, например, в патенте США № 7910296.
Методика амплификации метилированных CpG-островков (МСА) представляет собой способ, который можно применять для скрининга в отношении измененных паттернов метилирования в геномной ДНК и для выделения конкретных последовательностей, ассоциированных с этими изменениями (Toyota et al, 1999, Cancer Res. 59, 2307-2312, патент США № 7700324 (Issa и соавт.), содержание которых, таким образом, включено посредством ссылки в их полном объеме). Вкратце, рестрикционные ферменты с различными чувствительностями к метилированию цитозина в их сайтах распознавания применяют для расщепления геномных ДНК из первичных опухолей, линий клеток и нормальных тканей перед ПЦР-амплификацией с произвольными праймерами. Фрагменты, у которых наблюдают дифференциальное метилирование, клонируют и секвенируют после разделения ПНР-продуктов на полиакриламидных гелях высокого разрешения. Затем клонированные фрагменты применяют в качестве зондов для саузерн-блоттинга для подтверждения дифференциального метилирования этих участков. В число типичных реагентов (например, которые можно найти в типичном наборе на основе МСА) для анализа МСА могут входить без ограничения: ПЦР-праймеры для взаимодействия геномной ДНК в реакции с произвольными праймерами; буферы и нуклеотиды для ПЦР, рестрикционные ферменты и соответствующие буферы; олигонуклеотиды или зонды гибридизации с генами; олигонуклеотиды или зонды контрольной гибридизации.
В число дополнительных способов детекции метилирования входят такие способы, которые описаны, например, в патентах США № 7553627, № 6331393, патентном документе США с серийным № 12/476981, патентной публикации США № 2005/0069879; Rein, et al, 26(10) NUCLEIC ACIDS RES. 2255-64 (1998); и Olek et al, 17(3) NAT. GENET. 275-6 (1997).
В соответствии с другим вариантом осуществления, статус метилирования выбранных сайтов CpG определяют с помощью чувствительного к метилированию плавления с высокой степенью разрешения (HRM). Недавно Wojdacz и соавт. описали чувствительное к метилированию плавление с высокой степенью разрешения в качестве методики оценки метилирования. (Wojdacz and Dobrovic, 2007, Nuc. Acids Res. 35(6) e41; Wojdacz et al. 2008, Nat. Prot. 3(12) 1903-1908; Balic et al, 2009 J. Mol. Diagn. 11 102-108; и патентная публикация США № 2009/0155791 (Wojdacz и соавт.), содержание которых, таким образом, включено посредством ссылки в их полном объеме). Ряд коммерчески доступных приборов для ПЦР в режиме реального времени имеют HRM-системы, в том числе Roche LightCycler480, Corbett Research RotorGene6000 и Applied Biosystems 7500.
HRM можно объединять в комбинации с другими методиками амплификации, такими как пиросеквенирование, как описано в работе Candiloro и соавт. (Candiloro et al, 2011, Epigenetics 6(4) 500-507).
В соответствии с другим вариантом осуществления, статус метилирования выбранного локуса CpG определяют с помощью анализа с достройкой праймеров, включающего оптимизированную реакцию ШГР-амплификации, которая дает на выходе амплифицированные целевые участки для анализа с помощью масс-спектрометрии. Этот анализ также можно выполнять в мультиплексном режиме. Масс-спектрометрия является особенно эффективным способом детекции полинуклеотидов, ассоциированных с дифференциально метилированными регуляторными элементами. Наличие полинуклеотидной последовательности проверяют путем сравнения массы детектированного сигнала с ожидаемой массой представляющего интерес полинуклеотида. Относительная интенсивность сигнала, например, массовый пик на спектре, для конкретной полинуклеотидной последовательности указывает на относительное количество конкретного аллеля, что позволяет вычислять соотношение аллелей непосредственно из данных. Этот способ подробно описан в РСТ публикации № WO 2005/012578А1 (Beaulieu и соавт.), которая, таким образом, включена в настоящий документ посредством ссылки в полном ее объеме. В ходе анализа метилирования этот анализ можно применять для детекции изменений в последовательности С на Т, которые зависят от метилирования с включением бисульфита. Эти способы особенно пригодны для осуществления мультиплексированных реакций амплификации и мультиплексированных реакций достройки праймеров (например, мультиплексированные масс-анализы на основе достройки однородных праймеров (hME)) в одной лунке для дополнительного увеличения пропускной способности и уменьшения затрат на реакцию для реакций достройки праймера.
Другие способы анализа метилирования ДНК включают рестрикционно-ориентированное геномное сканирование (RLGS, Costello et al., 2002, Meth. Mol Biol, 200, 53-70), метил-чувствительный репрезентативный дифференциальный анализ (MS-RDA, Ushijima and Yamashita, 2009, Methods Mol Biol 507, 1 17-130). Сравнительные высокотехнологичные методики определения относительного метилирования (CHARM) описаны в WO 2009/021141 (Feinberg и Irizarry). Микрочипы Roche(R) NimbleGen(R), в том числе иммунопреципитация хроматина на чипе (СЫР-чип) или иммунопреципитация метилированной ДНК на чипе (MeDIP-чип). Эти инструменты применяют для решения ряда онкологических задач, в том числе при меланоме,
злокачественной опухоли печени и злокачественной опухоли легкого (Koga et al, 2009, Genome Res., 19, 1462-1470; Acevedo et al, 2008, Cancer Res., 68, 2641-2651; Rauch et al, 2008, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 105, 252-257). Другие авторы описывали бисульфатную конверсию, гибридизацию с padlock-зондами, замыкание в кольцо и амплификацию и секвенирование следующего поколения или мультиплексированное секвенирование для высокопроизводительной детекции метилирования (Deng et al, 2009, Nat. Biotechnol 27, 353-360; Ball et al, 2009, Nat. Biotechnol 27, 361-368; патент США № 7611869 (Fan)). В качестве альтернативы бисульфатному окислению, Bayeyt и соавт. описывали селективные окислители, которые окисляют 5-метилцитозин, не вступая в реакцию с тимидином, после чего проводят ГТЦР или пиросеквенирование (WO 2009/049916 (Bayeyt и соавт.). Литературные источники, касающиеся этих методик, таким образом, включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
В некоторых случаях способы количественной амплификации (например, количественную ПЦР или количественную линейную амплификацию) применяют для оценки количества интактной ДНК в локусе, фланкированном амплификационными праймерами после рестрикционного расщепления. Способы количественной амплификации раскрыты, например, в патентах США № 6180349, № 6033854 и № 5972602, а также, например, в работе DeGraves, et al, 34(1) BIOTECHNIQUES 106-15 (2003); Deiman В, et al., 20(2) MOL. BIOTECHNOL. 163-79 (2002); и в работе Gibson et al, 6 GENOME RESEARCH 995-1001 (1996).
После реакции или разделения нуклеиновой кислоты специфическим по метилированию способом, нуклеиновую кислоту в некоторых случаях подвергают анализу последовательности. Например, после определения, что одна конкретная меланомная геномная последовательность является гиперметилированной или гипометилированной по сравнению с доброкачественным аналогом, можно определить количество этой геномной последовательности. Впоследствии эту величину можно сравнить со стандартным контрольным значением, и она может служить индикатором меланомы. Во многих случаях желательно амплифицировать последовательность нуклеиновой кислоты с использованием любой из нескольких процедур амплификации нуклеиновой кислоты, которые хорошо известны из уровня техники. В частности, амплификация нуклеиновой кислоты представляет собой химический или ферментативный синтез копий нуклеиновой кислоты, которые содержат последовательность, комплементарную амплифицируемой (матричной) последовательности нуклеиновой кислоты. Способы и наборы по настоящему
изобретению могут предусматривать применение любых способов амплификации или детекции нуклеиновых кислот, которые известны специалисту в настоящей области, таких как описанные в патенте США № 5525462 (Takarada и соавт.), № 6114117 (Нерр и соавт.), № 6127120 (Graham и соавт.), № 6344317 (Urnovitz), № 6448001 (Oku), № 6528632 (Catanzariti и соавт.) и РСТ публикации № WO 2005/111209 (Nakajima и соавт.); причем все они включены в настоящий документ посредством ссылки в их полном объеме.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, нуклеиновые кислоты амплифицируют с помощью ПЦР-амплификации с применением известных специалисту в настоящей области техники методов. Тем не менее, специалисту в настоящей области техники будет понятно, что амплификацию можно выполнить с помощью любого известного способа, такого как лигазная цепная реакция (LCR), Q-репликазная амплификация, амплификация по типу катящегося кольца, транскрипционная амплификация, самоподдерживающаяся репликация последовательностей, амплификация, основанная на последовательности нуклеиновых кислот (NASBA), каждый из которых обеспечивает достаточную степень амплификации. Технологию разветвленной ДНК также необязательно применяют для качественной демонстрации наличия последовательности указанной технологии, которая представляет конкретный паттерн метилирования, или для количественного определения количества конкретной геномной последовательности в образце. В работе Nolte рассмотрено усиление сигнала от разветвленной ДНК для прямой количественной оценки последовательностей нуклеиновой кислот в клинических образцах (Nolte, 1998, Adv. Clin. Chem. 33:201-235).
Способ ПЦР хорошо известен из уровня техники и включает, например, ПЦР с обратной транскрипцией, опосредованное лигированием ПЦР, цифровую ПЦР (dPCR) или капельную цифровую ПЦР (ddPCR). Обзор способов и протоколов ПЦР см., например, в работе Innis et al, eds., PCR Protocols, A Guide to Methods and Application, Academic Press, Inc., San Diego, Calif. 1990; в патенте США № 4683202 (Mullis). Реагенты и протоколы для ПЦР также доступны от коммерческих поставщиков, таких как Roche Molecular Systems. В некоторых случаях ПЦР проводят как автоматизированный способ с термостабильным ферментом. При таком способе температуру реакционной смеси циклически изменяют на протяжении участка денатурации, участка отжига праймера и участка реакции удлинения цепи. Приборы, специально предназначенные для этой цели, являются коммерчески доступными.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, амплифицированные последовательности также измеряют с помощью реакций инвазивного расщепления,
таких как технология Invader(R) (Zou et al, 2010, Ассоциация клинических химиков (ААСС), стендовый доклад от 28 июля 2010 года, "Sensitive Quantification of Methylated Markers with a Novel Methylation Specific Technology; и патент США № 7011944 (Prudent и соавт.)).
Также широко доступны подходящие технологии секвенирования следующего поколения. В число примеров входит платформа 454 Life Sciences (Roche, Бранфорд, Коннектикут) (Margulies et al. 2005 Nature, 437, 376-380); анализатор генома от lllumina, набор для анализа статуса метилирования от GoldenGate или наборы для анализа статуса метилирования от Infinium, т. е. чип для анализа статуса метилирования Infinium HumanMethylation 27К BeadArray или VeraCode GoldenGate (lllumina, Сан-Диего, Калифорния; Bibkova et al, 2006, Genome Res. 16, 383-393; патенты США № 6306597 и 7598035 (Macevicz), № 7232656 (Balasubramanian и соавт)); ПЦР-система QX200(tm) Droplet Digital(tm) от Bio-Rad; или система для секвенирования ДНК с помощью лигирования, SOLiD (Applied Biosystems/Life Technologies; патенты США № 6797470, № 7083917, № 7166434, № 7320865, № 7332285, № 7364858 и 7429453 (Barany и соавт.); технология секвенирования ДНК Helicos True Single Molecule (Harris et al, 2008 Science, 320, 106-109; патенты США № 7037687 и № 7645596 (Williams и соавт.); № 7169560 (Lapidus и соавт.); № 7769400 (Harris)), одномолекулярная технология секвенирования в режиме реального времени (SMRT(tm)) от Pacific Biosciences (Soni and Meller, 2007, Clin. Chem. 53, 1996-2001); полупроводниковое секвенирование (Ion Torrent; Personal Genome Machine); секвенирование ДНК на наносферах; секвенирование с использованием технологии от Dover Systems (Polonator) и технологии, для которых не нужна амплификация или другая трансформация ДНК перед началом секвенирования (например, Pacific Biosciences и Helicos), такие как стратегии на основе нанопор (например, Oxford Nanopore, Genia Technologies и Nabsys). Такие системы позволяют проводить параллельное секвенирование многих молекул нуклеиновых кислот, выделенных из образца, при высоких порядках мультиплексирования. Каждая из этих платформ позволяет секвенировать клонально размноженные или неамплифицированные одиночные молекулы фрагментов нуклеиновых кислот. Некоторые платформы предусматривают, например, (i) секвенирование путем лигирования модифицированных красителем зондов (включая циклическое лигирование и расщепление), (ii) пиросеквенирование и (ш) одномолекулярное секвенирование.
Пиросеквенирование представляет собой способ секвенирования нуклеиновой кислоты, основанный на секвенировании синтезом, в основе которого лежит детекция
пирофосфата, высвобождаемого при включении нуклеотидов. Обычно секвенирование синтезом предусматривает синтез, по одному нуклеотиду за раз, цепочки ДНК, которая комплементарна цепочке, последовательность которой исследуют. Исследуемые нуклеиновые кислоты можно иммобилизировать на твердом носителе, гибридизировать с секвенирующим праймером, инкубировать с ДНК-полимеразой, АТФ-сульфурилазой, люциферазой, апиразой, аденозин-5'-фосфосульфатом и люциферином. Последовательно добавляют и удаляют растворы нуклеотидов. Правильное включение нуклеотида высвобождает пирофосфат, который взаимодействует с АТФ-сульфурилазой и производит АТФ в присутствии аденозин-5'-фосфосульфата, снабжая топливом реакцию люциферина, в результате которой продуцируется хемилюминесцентный сигнал, позволяющий определять последовательность. Приборы для пиросеквенирования и специфические для метилирования реагенты доступны от Qiagen, Inc. (Валенсия, Калифорния). См. также работу Tost и Gut, 2007, Nat. Prot. 2 2265-2275. Пример системы, которая может быть использована рядовым специалистом, на основе пиросеквенирования обычно включает следующие стадии: лигирование адапторной нуклеиновой кислоты с исследуемой нуклеиновой кислотой и гибридизацию исследуемой нуклеиновой кислоты с гранулой; амплификацию нуклеотидной последовательности в исследуемой нуклеиновой кислоте в эмульсии; сортировку гранул с использованием твердой подложки со множеством лунок пиколитрового объема; и секвенирование амплифицированных нуклеотидных последовательностей с помощью метода пиросеквенирования (например, Nakano et al, 2003, J. Biotech. 102, 117-124). Такую систему можно применять для экспоненциальной амплификации продуктов амплификации, получаемых с помощью описанного в настоящем документе способа, например, путем лигирования гетерологичной нуклеиновой кислоты с первым продуктом амплификации, получаемым с помощью описанного в настоящем документе способа.
Зонды
В некоторых случаях в описанном выше способе секвенирования применяют один или несколько зондов из панели зондов. В некоторых случаях один или несколько зондов из панели зондов представляет собой зонд с формулой I:
Формула I,
где:
А является первым связывающим цель участком; В является вторым связывающим цель участком; и L является линкерным участком;
где А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 30 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775; В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 12 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775; L присоединен к А; а В присоединен либо к А, либо к L. В некоторых случаях L присоединен к А, а В присоединен к L. В некоторых случаях А, В и L соединены так, как проиллюстрировано в формуле 1а:
Формула 1а.
В некоторых случаях множество зондов представляет собой по меньшей мере 10, 20, 30, 50, 100, 200, 500, 1000, 1500, 1775, 1800, 2000 или более зондов. В некоторых случаях множество зондов представляет собой 10, 20, 30, 50, 100 или более зондов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 35 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 40 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 45 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А
содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 50 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 55 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 60 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 65 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 70 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 80 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 90 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 14 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 15 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 18 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 20 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775.
В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 22 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 25 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 28 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 30 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 35 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 40 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 45 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 50 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 55 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 60 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 65 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%,
80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 70 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 80 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775. В некоторых случаях В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 90 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775.
В некоторых случаях множество зондов применяют в реакции секвенирования следующего поколения для создания данных по метилированию CpG. В некоторых случаях множество зондов применяют в реакции секвенирования следующего поколения в растворе для создания данных по метилированию CpG. В некоторых случаях реакция секвенирования следующего поколения включает платформу 454 Life Sciences (Roche, Бранфорд, Коннектикут); анализатор генома от lllumina, набор для анализа статуса метилирования от GoldenGate или наборы для анализа статуса метилирования от Infinium, т. е. чип для анализа статуса метилирования Infinium HumanMethylation 27К BeadArray или VeraCode GoldenGate (lllumina, Сан-Диего, Калифорния); ПЦР-систему QX200(tm) Droplet Digital(tm) от Bio-Rad; систему для секвенирования ДНК с помощью лигирования, SOLiD (Applied Biosystems/Life Technologies); технологию секвенирования ДНК Helicos True Single Molecule; полупроводниковое секвенирование (Ion Torrent; Personal Genome Machine); секвенирование ДНК на наносферах; секвенирование с использованием технологии от Dover Systems (Polonator) и технологии, для которых не нужна амплификация или другая трансформация ДНК перед началом секвенирования (например, Pacific Biosciences и Helicos), такие как стратегии на основе нанопор (например, Oxford Nanopore, Genia Technologies и Nabsys). В некоторых случаях реакция секвенирования следующего поколения в растворе представляет собой способ секвенирования с применением капельной цифровой ПЦР.
В некоторых случаях каждый зонд коррелирует с сайтом CpG. В некоторых случаях каждый зонд коррелирует с биомаркером (например, сайтом CpG), выбранным из таблиц 15-18 и/или 20. В некоторых случаях каждый зонд коррелирует с биомаркером, выбранным из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877,cg21913888, cg26683005,cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555,cgl3911392, cgl8901104, cg25982880,
cgl5797834: cgll252953: cg06853339 cg01409343: cg04147906: cg27598656: cgO1681367 cg09866569: cgl2353452 eg19693177 cg07332880: cgl8158859 cg25954028: cg08075204: cgl5698795: cgl3924996: cg07380416: cg20411756: cg00025044: cg22552736: cg08632810: cgl9021985: cg00282244: cgl0673833: cgl6748008: cg26811313: cg26401541: cg03891050: cgl5046123: cg06439655: cgl 7694130: cg08052292: cg09366118: cg08132573: cg27125093: cgl8456621: cgl2900649: cgl0530767 cg23878564 cg03549146: cg26769927: cg20357538: cgl0590292 cg26363363: cgl6061668: cgl9300307 cgl4642045: cgl4556909 cgll791526: cg07420137 cg27284288: cg24247537: cg04441857 cgl6191087 eg12737392 cg21031128: cgl8887230: cg06787669: cgl6644023: cg25432518: cg20046343: cg00899907: cg03190513: cgll334870: cg03956042: cg27366280: cgl5341833: cg24686918: cgl7518965: cg07058988: cg27219182 cg26112797 cg07860918: cg22190721: cg08480068: cg22460896: cg00037681: cg21249754: cg25574765: cgl8842353: cg24165921: cg07119472 cg00862408: cg24301930: cgl3912307 cg04330884: cg09684112 cgl3925432 cg26769700: cgl9421584 cg08486903: cgl2192582 cg06488150: cgl6622899: cg20847580: cgl3597051: cg01456691: cg08912922: cgl9266387 cg06825448: cg02233149 cg05352688: cg20695297: cgl7864646: cgl5759721: cg00253248: cg00206490: cgO1660934 cg02914427: cg07116712 cg05596756: cg23147227 cgl4088196: cgl0732611: cgl8215449 cgl4999168: cgl6260696: cgl3395086: cgl0511890: cg23130731: cg27388962: cgl3464240: cg03218479 cgl7984956: cg09335715: cg05098343: cg09450197 cgl2359001: cg03431741: cgl8113826: cgl7207512 cg23021796: cgl3512830: cg25451702 cgl4247287: cgl8384097 cg04858553: cg06153925: cg27023597: cg01722297: cg07644807: cg02358862 cg03653601: cgl0186131: cg03569637 cg01657186: cg03758697 cg24480810: cgl6402452: cg09399878: cg00220455: cg20136100: cg00242035: cg04888360: cg05931497 cgl4633252 cg02609337: cg05177060: cgl2629796: cg07573366: cg20336172 cg01209642: cg07417146: cg04859102 cg20510285: cg24835948: cgl9982684 cg08098128: cg23824762: cgl6266227: cg09419005: cg27410601: cg02782634: cg22589778: cg00558804 cg23093496: cgO 1990910: cg06380123: cg02522196: cg23764129 cg05398700: cg02053964: cg21376733: cg02874908: cg20826709: cg09153080: cg04314978: cg00907272: cgl3408086: cgl9252956: cgl0351284 cg24107852 cgl6454130: cgl1105292 cg08858130: cgl4564351: cg09001226: cgO 16203 60: cgO1149192 eg10393744 cg22513455: cgl3821008: cgO 1604601: cgl9675731: cg25490145: cg03297901: cgl8942579 cg07137244: cg05304979: cg07641284: cg00933696: cgl8610205: cgll655490: cg04514998: cgl4058476: cg25922751: cgl6509569 cgl0542975: cgl1436362 cg09902130: cg25225070: cg05979232: cgl3555415: cg00015530: cg23554164 cg25652701: cg26433975: cg05287480: cgl2098228: cg23429794: cg06482498: cgl4083015: cg05614346: cg07428959: cg07186032 cg27405400: cg05656900: cg21461981:
cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930. В некоторых случаях каждый зонд коррелирует с биомаркером, выбранным из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093,cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833,cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930,cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476,cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448,cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280,cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474,cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965,cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20). В некоторых случаях каждый зонд коррелирует с биомаркером, выбранным из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751иcgl7126555.
В некоторых случаях L составляет в длину от 10 до 60, от 15 до 55, от 20 до 50, от 25 до 45 и от 30 до 40 нуклеотидов. В некоторых случаях L составляет в длину приблизительно 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55 или 60 нуклеотидов.
В некоторых случаях L дополнительно содержит адапторный участок. В некоторых случаях адапторный участок содержит последовательность, применяемую для идентификации каждого зонда.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, один или несколько зондов из панели зондов содержат последовательность, которая по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 99% идентична последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-2333. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, один или несколько зондов из панели зондов содержат последовательность, которая по меньшей мере на 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 99% идентична последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1830-2321. В
некоторых случаях один или несколько зондов из панели зондов содержат последовательность, которая приблизительно на 100% идентична последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1830-2321. В некоторых случаях один или несколько зондов из панели зондов состоят из последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1830-2321. В некоторых случаях один или несколько зондов из панели зондов используют в способе секвенирования с применением цифровой П1 IP В некоторых случаях один или несколько зондов из панели зондов используют в способе секвенирования с применением капельной цифровой 1ТЦР (ddPCR).
Способы анализа данных по метилированию CpG
В соответствии с определенными вариантами осуществления, значения метилирования, измеренные для маркеров из панели биомаркеров, объединяют с помощью математических методов и определяют корреляцию объединенного значения с основным диагностическим запросом. В некоторых случаях значения метилированных биомаркеров объединяют с помощью любого подходящего из уровня техники математического способа. Хорошо известные математические способы определения корреляции комбинации маркеров со статусом заболевания предусматривают использование таких способов, как дискриминантный анализ (DA) (например, линейный, квадратический, регуляризованный DA), дискриминантный функциональный анализ (DFA), способы на базе ядра (например, SVM), многомерное шкалирование (MDS), непараметрические способы (например, классификаторы k-ближайших соседей), PLS (частные наименьшие квадраты), способы с использованием древовидных моделей (например, логическая регрессия, CART, способы решающих деревьев, способы бустинга/бэггинга), обобщенные линейные модели (например, логистическая регрессия), способы на основе главных компонент (например, SIMCA), обобщенные аддитивные модели, способы на основе нечеткой логики, нейронные сети и способы на основе генетических алгоритмов. У специалиста в настоящей области не возникнет проблемы в выборе подходящего способа оценки комбинации биомаркеров по настоящему изобретению. В соответствии с одним вариантом осуществления, способ, применяемый при определении корреляции статуса метилирования комбинации биомаркеров по настоящему изобретению, например, для диагностики CRC, выбирают из DA (например, линейного, квадратического, регуляризованного дискриминантного анализа), DFA, способов на базе ядра (например, SVM), MDS, непараметрических способов (например, классификаторов k-ближайших соседей), PLS (частных
наименьших квадратов), способов с использованием древовидных моделей (например, логической регрессии, CART, способов решающих деревьев, способы бустинга) или обобщенных линейных моделей (например, логистической регрессии) и анализа главных компонент. Подробности касательно этих статистических способов приведены в следующих источниках: Ruczinski et al., 12 J. OF COMPUTATIONAL AND GRAPHICAL STATISTICS 475-511 (2003); Friedman, J. H, 84 J. OF THE AMERICAN STATISTICAL ASSOCIATION 165-75 (1989); Hastie, Trevor, Tibshirani, Robert, Friedman, Jerome, The Elements of Statistical Learning, Springer Series in Statistics (2001); Breiman, L., Friedman, J. H, Olshen, R. A., Stone, C. J. Classification and regression trees, California: Wadsworth (1984); Breiman, L., 45 MACHINE LEARNING 5-32 (2001); Pepe, M. S., The Statistical Evaluation of Medical Tests for Classification and Prediction, Oxford Statistical Science Series, 28 (2003); и Duda, R. O., Hart, P. E., Stork, D. O., Pattern Classification, Wiley Interscience, 2nd Edition (2001).
В соответствии с одним вариантом осуществления, коррелирующие результаты для каждой панели метилирования ранжируют путем установления их корреляции с положительным статусом в отношении типа опухоли или заболевания, как, например, с помощью р-критерия, или t-критерия, или F-критерия. Ранжированные (сначала лучшие, т. е. с низким р- или t-значением) маркеры затем последовательно отбирают и вносят в панель метилирования до получения определенного диагностического значения. Такие способы предусматривают идентификацию панелей метилирования или, если шире, генов, которые были дифференциально метилированы среди различных классов, с помощью, например, t-критерия с неизвестной дисперсией (Wright G. W. and Simon R, Bioinformatics 19:2448-2455,2003). Другие способы предусматривают стадию определения уровня значимости, которую будут использовать для определения биомаркеров, которые будут включены в панель биомаркеров. В панель включают биомаркеры, которые дифференциально метилированы среди классов с одномерным параметрическим уровнем значимости ниже указанного порога. Для исключения достаточно ложных результатов выявления не имеет значения, достаточно ли мал указанный уровень значимости. При некоторых проблемах более качественный прогноз получают путем более свободного подхода в отношении панелей биомаркеров, используемых в качестве компонентов. В некоторых случаях панели остаются биологически интерпретируемыми и клинически приемлемыми, даже если включено меньшее количество биомаркеров. Аналогично перекрестной проверке повторяют отбор биомаркеров для каждого обучающего набора, созданного в процессе перекрестной
проверки. Это необходимо для получения несмещенной оценки ошибки прогноза. Панель метилирования для применения с данными по новым образцам пациента является такой, которая получена в результате применения отбора по метилированию и классификатора "известной" информации по метилированию, или контрольной панелью метилирования.
Также можно применять модели для использования профиля метилирования с целью прогнозирования класса будущих образцов. Такие модели могут быть основаны на составном ковариантном предикторе (Radmacher et al. Journal of Computational Biology 9:505-511, 2002), диагональном линейном дискриминантном анализе (Dudoit et al. Journal of the American Statistical Association 97:77-87, 2002), классификации по ближайшим соседям (также Dudoit et al.) и опорно-векторных машинах с линейным ядром (Ramaswamy et al. PNAS USA 98:15149-54, 2001). В этих моделях включены биомаркеры, которые были дифференциально метилированы с заданным уровнем значимости (например, 0,01, 0,05 или 0,1), согласно оценке с помощью t-критерия с неизвестной дисперсией (Wright G. W. and Simon R. Bioinformatics 19:2448-2455, 2003). Можно оценить ошибку прогноза каждой модели с помощью перекрестной проверки, предпочтительно перекрестной проверки по сценарию "исключение по одному" (Simon et al. Journal of the National Cancer Institute 95:14-18, 2003). Для каждого обучающего набора для перекрестной проверки по сценарию "исключение по одному" повторяют весь процесс построения модели, включая процесс отбора биомаркеров. Также можно оценить, является ли результат оценки частоты появления ошибок перекрестной проверки для модели значимо меньшим, чем ожидали в результате случайного прогнозирования. Метки класса можно случайным образом переставить, а затем повторить весь процесс перекрестной проверки по сценарию "исключение по одному". Уровень значимости представляет собой долю случайных перестановок, которая дает подтвержденную в результате перекрестной проверки частоту ошибок, не превышающую подтвержденную в результате перекрестной проверки частоту ошибок, полученную с реальными данными по метилированию.
Другим способом классификации является способ жадных пар, описанный Во и Jonassen (Genome Biology 3(4):research0017.1-0017.11, 2002). Подход жадных пар начинается с ранжирования всех биомаркеров на основе их индивидуальных t-показателей на обучающем наборе. С помощью этого способа пытаются отбирать пары биомаркеров, которые хорошо работают вместе для проведения различия среди классов.
Более того, при использовании профиля метилирования можно использовать классификатор бинарного древа для прогнозирования класса будущих образцов. Первый узел древа включал двоичный классификатор, который позволял различать два подмножества полного набора классов. Отдельные бинарные классификаторы основаны на "опорно-векторных машинах", которые включают биомаркеры, которые дифференциально экспрессировались среди биомаркеров с определенным уровнем значимости (например, 0,01, 0,05 или 0,1), согласно оценке с помощью t-критерия с неизвестной дисперсией (Wright G. W. and Simon R. Bioinformatics 19:2448-2455, 2003). Оценивают классификаторы для всех возможных бинарных разделов и отбирают такой раздел, для которого минимальна ошибка прогнозирования после перекрестной проверки. Затем этот процесс последовательно повторяют для двух подмножеств классов, определенных предыдущим бинарным разделением. Ошибка прогнозирования классификатора бинарного древа может быть оценена путем перекрестной проверки всего процесса построения древа. Такая общая перекрестная проверка включает в себя повторный отбор оптимальных разделов в каждом узле и повторный отбор биомаркеров, применяемых для каждого подтвержденного перекрестной проверкой обучающего набора, как описано в работе Simon и соавт. (Simon et al. Journal of the National Cancer Institute 95:14-18, 2003). В ходе многократной перекрестной проверки, в которой опускают некоторую долю образцов, на основе оставшихся образцов создают бинарное древо, а затем прогнозируют членство в классе для опущенных образцов. Это повторяют несколько раз, каждый раз удерживая иной процент образцов. Образцы случайным образом разбивают на дробные тестовые наборы (Simon R and Lam A. BRB- Array Tools User Guide, version 3.2. Biometric Research Branch, National Cancer Institute).
Такими образом, в соответствии с одним вариантом осуществления, коррелирующие результаты для каждого биомаркера Ь) ранжируют путем установления их правильной корреляции с положительным статусом в отношении типа опухоли или заболевания, предпочтительно с помощью р-критерия. Также можно включить стадию, на которой биомаркеры отбирают d) в порядке их ранга.
В соответствии с дополнительными вариантами осуществления, такие факторы, как значение, уровень, признак, характеристика, свойство и т. д. скорости транскрипции, уровня мРНК, скорости трансляции, уровня белка, биологической активности, клеточной характеристики или свойства, генотипа, фенотипа и т. д., могут быть дополнительно использованы до, во время или после проведения терапии на пациенте для проведения дополнительного анализа статуса злокачественной опухоли у пациента.
Специфичность и чувствительность
Статистическая мощность диагностического теста в отношении правильного прогнозирования состояния обычно измеряют в виде чувствительности анализа, специфичности анализа или области под кривой соотношений правильного и ложного обнаружения сигналов ("ROC"). Чувствительность представляет собой процент истинных положительных результатов, которые, согласно прогнозу с помощью теста, должны быть положительными, в то время как специфичность представляет собой процент истинных отрицательных результатов, которые, согласно прогнозу с помощью теста, должны быть отрицательными. Кривая ROC характеризует чувствительность теста в зависимости от 1 - специфичность. Чем больше площадь под кривой ROC, тем большей статистической мощностью обладает прогнозируемое значение в тесте. Другими пригодными показателями полезности теста являются прогностическая ценность положительного результата и прогностическая ценность отрицательного результата. Прогностическая ценность положительного результата представляет собой процент положительных по результатам теста людей, которые действительно имеют положительный результат. Прогностическая ценность отрицательного результата представляет собой процент отрицательных по результатам теста людей, которые действительно имеют отрицательный результат.
В соответствии с конкретными вариантами осуществления, у панелей биомаркеров по настоящему изобретению можно наблюдать статистическую разницу в различных статусах злокачественной опухоли, составляющую по меньшей мере р <0,05, р <10"2, р <10"3, р <10"4 или р <10"5. Диагностические тесты, которые предусматривают применение таких биомаркеров, могут характеризоваться ROC по меньшей мере 0,6, по меньшей мере приблизительно 0,7, по меньшей мере приблизительно 0,8 или по меньшей мере приблизительно 0,9. Такие биомаркеры дифференциально метилированы у незатронутого индивидуума (или нормального контрольного индивидуума ) и злокачественной опухоли, и такие биомаркеры дифференциально метилированы для каждого типа злокачественной опухоли и поэтому пригодны для облегчения определения статуса злокачественной опухоли. В соответствии с определенными вариантами осуществления, биомаркеры измеряют в образце от пациента с помощью описанных в настоящем документе способов и сравнивают, например, с предопределенными уровнями биомаркеров и устанавливают корреляцию со статусом злокачественной опухоли. В соответствии с другими вариантами осуществления,
корреляцию комбинации биомаркеров в образце пациента сравнивают, например, с предопределенной панелью биомаркеров. В соответствии с еще одним вариантом осуществления, профиль метилирования одного или нескольких генов в образце пациента сравнивают с профилем метилирования выявленных дифференциально метилированных генов, который коррелирует с типом или состоянием опухоли или статусом злокачественной опухоли. В соответствии с конкретными вариантами осуществления, результат(ы) измерения затем можно сравнить с соответствующим диагностическим количеством(количествами), граничным значением(значениями) или показателями многомерной модели, которые позволяют различить положительный статус злокачественной опухоли от отрицательного статуса злокачественной опухоли. Диагностическое количество(количества) представляет собой измеренное количество эпигенетического биомаркера(биомаркеров), выше которого или ниже которого пациента классифицируют как имеющего определенный статус злокачественной опухоли. Как хорошо понятно из уровня техники, путем корректировки конкретного диагностического граничного значения(значений), используемого в анализе, можно повысить чувствительность или специфичность диагностического анализа, в зависимости от предпочтения специалиста по диагностике. В соответствии с конкретными вариантами осуществления, конкретное диагностическое граничное значение можно определить, например, путем измерения величины гиперметилирования или гипометилирования биомаркеров в статистически значимом количестве образцов от пациентов с различными статусами злокачественной опухоли и вычисления граничного значения, удовлетворяющего необходимым уровням специфичности и чувствительности.
Злокачественная опухоль
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в настоящем документе раскрыто применение одного или нескольких описываемых выше биомаркеров для обнаружения, характеристики и/или прогнозирования злокачественной опухоли. В некоторых случаях биомаркеры применяют в диагностических тестах для определения, характеристики, установления статуса и/или оценки злокачественной опухоли. В некоторых случаях в число биомаркеров входят показанные в таблицах 15, 16, 17, 18 и/или 20.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой солидную опухоль или гематологическую злокачественную опухоль. В некоторых случаях
злокачественная опухоль представляет собой карциному, саркому, лимфому или лейкоз. В некоторых случаях злокачественная опухоль является интактной злокачественной опухолью или злокачественной опухолью, которую еще не пробовали лечить конкретным терапевтическим средством. В некоторых случаях злокачественная опухоль является первичной опухолью или первичной злокачественной опухолью, опухолью, которая возникла в локализации или органе, в котором она присутствует, а не метастазировала в эту локализацию из другой локализации. В некоторых случаях злокачественная опухоль является метастатической злокачественной опухолью. В некоторых случаях злокачественная опухоль является рецидивирующей или рефракторной злокачественной опухолью.
В некоторых случаях опухоль или злокачественная опухоль происходит из крови, лимфатического узла, печени, головного мозга/нейробластомы, пищевода, трахеи, желудка, кишечника, толстой кишки, прямой кишки, ануса, поджелудочной железы, горла, языка, кости, яичника, матки, шейки матки, брюшной полости, предстательной железы, яичек, молочной железы, почки, легкого или кожи, из опухоли желудка, толстой и прямой кишок, мочевого пузыря, головы и шеи, носоглотки, эндометрия, желчного протока, ротовой полости, множественной миеломы, лейкоза, саркомы мягких тканей, желчного пузыря, железы внутренней секреции, мезотелиомы, опухоли Вильмса, опухоли двенадцатиперстной кишки, нейроэндокринной опухоли, опухоли слюнной железы, гортани, хориокарциномы, сердца, тонкого кишечника, глаза, герминогенной злокачественной опухоли и тому подобного.
В некоторых случаях опухоль или злокачественная опухоль включает без ограничения острый лимфобластный лейкоз (ALL); острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML); адренокортикальную карциному (АСС); СПИД-ассоциированные злокачественные опухоли; СПИД-ассоциированную лимфому; злокачественную опухоль анального канала; злокачественную опухоль червеобразного отростка; астроцитомы; атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль; базальноклеточную карциному; злокачественную опухоль мочевого пузыря или уротелия мочевого пузыря (BLCA); глиому ствола головного мозга; глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG); опухоль головного мозга (в том числе глиому ствола головного мозга, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, астроцитомы, краниофарингиому, эпендимобластому, эпендимому, медуллобластому, медуллоэпителиому, пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной
дифференцировки, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли и пинеобластому); инвазивную злокачественную опухоль молочной железы или головного мозга (BRCA); бронхиальные опухоли; лимфому Беркитта; злокачественную опухоль без выявленного первичного очага; карциноидную опухоль; карциному без выявленного первичного очага; атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы; эмбриональные опухоли центральной нервной системы; в том числе цервикальную плоскоклеточную карциному и эндоцервикальную аденокарциному (CESC); детские злокачественные опухоли; холангиокарциному (CHOL); хордому; хронический лимфоцитарный лейкоз; хронический миелолейкоз; хронические миелопролиферативные нарушения; злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD); злокачественную опухоль толстой и прямой кишок; краниофарингиому; кожную Т-клеточную лимфому; опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы; злокачественную опухоль эндометрия; эпендимобластому; эпендимому; злокачественную опухоль пищевода (ESCA); эстезионейробластому; саркому Юинга; экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль; внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль; злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей; злокачественную опухоль желчного пузыря; злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта; гастроинтестинальную карциноидную опухоль; опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток; гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST); гестациозную трофобластическую болезнь; глиобластомную мультиформную глиому (GBM); волосатоклеточный лейкоз; злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD); злокачественную опухоль сердца; лимфому Ходжкина; гипофарингеальную злокачественную опухоль; интраокулярную меланому; опухоли островковых клеток поджелудочной железы; саркому Капоши; злокачественную опухоль почки, в том числе хромофобную карциному почки (КШС), светлоклеточную почечно-клеточную карциному (КЖС) и папиллярную почечно-клеточную карциному (KIRP); лангергансоклеточный гистиоцитоз; злокачественную опухоль гортани; злокачественную опухоль губы; злокачественную опухоль печени, в том числе гепатоклеточную карциному печени (LIHC), аденокарциному легкого (LUAD) и плоскоклеточную карциному легкого (LUSC); опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBC); злокачественную фиброзную гистиоцитомную опухоль костей; медуллобластому; медуллоэпителиому; меланому; карциному из клеток Меркеля; карциному кожи из клеток Меркеля; мезотелиому (MESO); метастатическую
сквамозную злокачественную опухоль неизвестного происхождения; злокачественную опухоль ротовой полости; синдромы множественных эндокринных неоплазий; множественную миелому; множественную миелому/плазмаклеточную миелому; фунгоидный микоз; миелодиспластические синдромы; миелопролиферативные неоплазий; злокачественную опухоль полости носа; носоглоточную злокачественную опухоль; нейробластому; неходжкинскую лимфому; немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи; немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого; злокачественную опухоль ротовой полости; злокачественную опухоль полости рта; злокачественную опухоль ротоглотки; остеосаркому; другие опухоли головного и спинного мозга; овариальную злокачественную опухоль, такую как серозная цистаденокарцинома яичника (OV); овариальную эпителиальную злокачественную опухоль; овариальную эмбрионально-клеточную опухоль; овариальную пограничную опухоль; злокачественную опухоль поджелудочной железы, такую как аденокарцинома поджелудочной железы (PAAD); папилломатоз; злокачественную опухоль придаточных пазух носа; злокачественную опухоль паращитовидной железы; злокачественную опухоль почечной лоханки; злокачественную опухоль полового члена; фарингеальную злокачественную опухоль; феохромоцитому и параганглиому (PCPG); пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки; пинеобластому; опухоль гипофиза; плазмаклеточную миелому/множественную миелому; плевролегочную бластому; первичную лимфому центральной нервной системы; первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени; злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD); злокачественную опухоль прямой кишки, такую как аденокарцинома прямой кишки (READ); ренальную злокачественную опухоль; почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки); почечно-клеточную злокачественную опухоль; злокачественную опухоль дыхательных путей; ретинобластому; рабдомиосаркому; злокачественную опухоль слюнной железы; саркому (SARC); синдром Сезари; меланому кожи (SKCM); мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого; злокачественную опухоль тонкого кишечника; саркому мягких тканей; плоскоклеточную карциному; сквамозную злокачественную опухоль шеи; (гастральную) злокачественную опухоль желудка, такую как аденокарцинома желудка (STAD); супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли; Т-клеточную лимфому; злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT); злокачественную опухоль горла; карциному тимуса; тимому (THYM); злокачественную опухоль щитовидной железы
(ТНСА); злокачественную опухоль "переходных" клеток; злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника; трофобластическую болезнь; злокачественную опухоль мочеточника; уретральную злокачественную опухоль; злокачественную опухоль матки; такую злокачественную опухоль матки, как карциносаркома матки (UCS) и карцинома эндометрия тела матки (UCEC); увеальную меланому (UVM); вагинальную злокачественную опухоль; злокачественную опухоль наружных женских половых органов; макроглобулинемию Вальденстрема; или опухоль Вильма. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, злокачественная опухоль включает злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, злокачественную опухоль, гепатоклеточную карциному, злокачественную опухоль печени, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль поджелудочной железы или злокачественную опухоль толстой и прямой кишок.
В некоторых случаях злокачественная опухоль (например, первичная опухоль) включает острый лимфобластный лейкоз (ALL), острый миелоцитарный лейкоз (AML), злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, злокачественную опухоль яичников, злокачественную опухоль поджелудочной железы, злокачественную опухоль предстательной железы, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В некоторых случаях злокачественная опухоль включает неоплазию лимфоидной ткани, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль толстой кишки или толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль предстательной железы, глиому или другие злокачественные опухоли головного/спинного мозга, злокачественную опухоль яичников, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль мочевого пузыря, меланому, злокачественную опухоль молочной железы, миелоидную неоплазию, злокачественную опухоль яичка,
злокачественную опухоль желудка, шейки матки, почки, печени или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает острый лимфобластный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль головного мозга, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, злокачественную опухоль эндометрия, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль желудочно-кишечного тракта, глиому, глиобластому, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, неоплазию лимфоидной ткани, меланому, миелоидную неоплазию, овариальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, плоскоклеточную карциному, злокачественную опухоль яичка, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, тип злокачественной опухоли включает злокачественную опухоль мочевого пузыря, злокачественную опухоль молочной железы, злокачественную опухоль шейки матки, холангиокарциному (CHOL), злокачественную опухоль толстой кишки, злокачественную опухоль пищевода, злокачественную опухоль головы и шеи, злокачественную опухоль почки, злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль поджелудочной железы, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), злокачественную опухоль предстательной железы, злокачественную опухоль прямой кишки, саркому, злокачественную опухоль кожи, злокачественную опухоль желудка или злокачественную опухоль щитовидной железы. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой ALL. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой AML. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль головного мозга. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль толстой кишки. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль легкого. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль молочной железы. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль предстательной
железы. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль мочевого пузыря. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль шейки матки. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой холангиокарциному (CHOL). В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль пищевода. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль головы и шеи. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль почки. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль печени. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль поджелудочной железы. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой феохромоцитому и параганглиому (PCPG). В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль прямой кишки. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой саркому. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль кожи. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль желудка. В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль щитовидной железы.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой лимфому. Лимфома относится к злокачественной опухоли части иммунной системы, называемой лимфатической системой. Ее обычно делят на неходжкинскую и ходжкинскую лимфому.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой неоплазию лимфоидной ткани. В контексте настоящего изобретения неоплазия лимфоидной ткани относится к новообразованию, возникающему в результате злокачественного изменения В- или Т-лимфоцита, и включает без ограничения лимфому любого типа. Двумя основными типами лимфомы являются болезнь Ходжкина и неходжкинская лимфома. Болезнь Ходжкина является относительно простым заболеванием, включающим лишь четыре основных типа. Напротив, неходжкинская лимфома (NHL) является термином, применяемым для многих различных типов злокачественной опухоли лимфатической системы, включая следующие подтипы: лимфому предшественников В-клеток, мелкоклеточную лимфоцитарную лимфому/хронический лимфоцитарный лейкоз, лимфомы из клеток маргинальной зоны (лимфому из клеток маргинальной зоны узлов, внеузловую MALT, селезеночную), волосатоклеточный лейкоз, фолликулярную лимфому, лимфому из клеток мантийной зоны, диффузную В-крупноклеточную
лимфому, лимфому Беркита, анапластическую крупноклеточную лимфому, периферическую Т-клеточную лимфому и фунгоидный микоз. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, другие неоплазмы лимфоидной ткани, которые не имеют жесткой связи с неходжкинской лимфомой, но включены в настоящий документ, включают острый лимфобластный лейкоз, лимфоплазмоцитоидную лимфому, Т-клеточный хронический лимфоцитарный лейкоз/пролимфоцитарный лейкоз и любые другие типы злокачественных опухолей лимфоидного происхождения, которые не поддаются легкой классификации.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль головы и шеи. Злокачественная опухоль головы и шеи представляет собой группу биологически сходных злокачественных опухолей, которые начинаются в верхнем участке пищеварительного тракта и дыхательных путей, в том числе на губе, в ротовой полости (во рту), в носовой полости (в носу), придаточных пазухах, глотке и гортани. 90% злокачественных опухолей головы и шеи являются плоскоклеточными карциномами (SCCHN), происходящими от слизистой оболочки (эпителия) этих участков. Плоскоклеточные карциномы головы и шеи (HNSCC) составляют значительное большинство злокачественных опухолей головы и шеи и возникают на поверхностях слизистых оболочек в данной анатомической области. В их число входят опухоли носовых полостей, придаточных пазух носа, ротовой полости, носоглотки, ротоглотки, гипофаринкса и гортани.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль поджелудочной железы или поджелудочную злокачественную опухоль. Злокачественная опухоль поджелудочной железы происходит от клеток поджелудочной железы, включая без ограничения аденокарциномы, аденосквамозные карциномы, перстневидно-клеточные карциномы, гепатоидные карциномы, коллоидные карциномы недифференцированные карциномы, недифференцированные карциномы с остеокласт-подобными гигантоцитами и карциномы островковых клеток.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль эндометрия. Злокачественная опухоль эндометрия является злокачественным новообразованием, которое возникает из внутренней оболочки матки (эндометрия). Этот термин относится без ограничения к карциномам эндометрия и аденокарциномам эндометрия. В контексте настоящего изобретения злокачественные опухоли эндометрия также включают другие хорошо известные типы клеток, такие как
папиллярная серозная карцинома, гипернефрома, папиллярная эндометриоидная карцинома и слизеобразующая карцинома.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль толстой кишки, также называемую злокачественной опухолью толстой и прямой кишок или колоректальной злокачественной опухолью. Злокачественная опухоль толстой кишки относится к злокачественному новообразованию, которое возникает в толстом кишечнике (толстой кишке) или в прямой кишке (конце толстой кишки) и включает злокачественные образования в толстой кишке, прямой кишке и червеобразном отростке, в том числе аденокарциному. Злокачественной опухоли толстой и прямой кишок предшествуют аденомы, неоплазмы эпителиального происхождения, которые происходят из железистой ткани или имеют четко выраженные железистые структуры.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль предстательной железы. Злокачественная опухоль предстательной железы описывает неконтролируемый (злокачественный) рост клеток, происходящих из предстательной железы.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль почки, также называемой ренальной злокачественной опухолью. Злокачественная опухоль почки представляет собой заболевание, при котором клетки почки становятся злокачественными (раковыми) и выходят из-под контроля, образуя опухоль. Наиболее распространенные злокачественные опухоли почки сначала появляются в выстилке крошечных трубок (канальцев) почки, что представляет собой почечно-клеточную карциному.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль щитовидной железы. Злокачественная опухоль щитовидной железы относится к злокачественной опухоли, происходящей из фолликулярных или парафолликулярных клеток щитовидной железы.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой глиому. Глиома относится к типу злокачественной опухоли, которая начинается в головном мозге или спинном мозге и которая возникает из глиальных клеток и/или их предшественников, включая эпендимомы (глиомы, происходящие из эпендимальных клеток), астроцитомы (глиомы, происходящие из астроцитов и которые включают мультиформную глиобластому, олигодендроглиомы, (глиомы, происходящие из
олигодендроцитов) и смешанные глиомы, такие как олиго-астроцитомы (происходящие из клеток различных типов глии).
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль яичников. Злокачественная опухоль яичника представляет собой группу опухолей, которые возникают в яичниках и включают без ограничения серозную злокачественную опухоль яичников, неинвазивную злокачественную опухоль яичников, злокачественную опухоль яичников со смешанным фенотипом, слизеобразующую злокачественную опухоль яичников, эндометриоидную злокачественную опухоль яичников, светлоклеточную злокачественную опухоль яичников, папиллярную серозную злокачественную опухоль яичников, опухоль Бреннера и недифференцированную аденокарциному.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль легкого. Злокачественная опухоль легкого относится к любому неконтролируемому клеточному образованию в тканях легкого, в том числе без ограничения мелкоклеточную карциному легкого, мелкоклеточную карциному смешанного типа, немелкоклеточную карциному легкого, саркоматоидную карциному, опухоли слюнной железы, карциноидную опухоль, аденосквамозную карциному, плевролегочную бластому и карциноидную опухоль.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль мочевого пузыря. Злокачественная опухоль мочевого пузыря относится к любому из нескольких типов злокачественных образований мочевого пузыря и включает без ограничения переходно-клеточную карциному, плоскоклеточную карциному, аденокарциному, саркому и мелкоклеточную карциному.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой меланому. Меланома относится к любой форме злокачественной опухоли, которая начинается в меланоцитах. Меланома включает без ограничения следующие подтипы: злокачественное лентиго, меланому типа злокачественного лентиго, поверхностную распространяющуюся гематому, акральную лентигинозную меланому, меланому слизистых оболочек, узловую меланому, полипоидную меланому, десмопластическую меланому, амеланотическую меланому, меланому мягких тканей и метастатическую меланому.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль молочной железы. Злокачественную опухоль молочной железы или злокачественную неоплазму молочной железы широко используют в
качестве общего названия для злокачественных опухолей, происходящих из ткани молочной железы, чаще всего из внутренней выстилки молочных протоков или долек, которые снабжают эти каналы молоком. В зависимости от их рецепторного статуса, по результатам детекции с помощью иммуногистохимии, в частности от наличия или отсутствия эстрогенового рецептора (ER), прогестеронового рецептора (PR) и от уровня экспрессии HER2/neu (нормальной экспрессии/недостаточной экспрессии в сравнении со сверхэкспрессией), злокачественные опухоли молочной железы можно разделить на ER-положительную (ER+) злокачественную опухоль молочной железы, ER-отрицательную (ER-) злокачественную опухоль молочной железы, PR-положительную (PR+) злокачественную опухоль молочной железы, PR-отрицательную (PR-) злокачественную опухоль молочной железы, НЕРч2-положительную (HER2+) злокачественную опухоль молочной железы (злокачественную опухоль со сверхэкспрессией HER2), ШШ.2-отрицательную (HER2-) злокачественную опухоль молочной железы (злокачественную опухоль с нормальными уровнями экспрессии HER2 или недостаточной экспрессией HER2 или без экспрессии поддающегося детекции уровня HER2), отрицательную по рецепторам гормонов злокачественную опухоль молочной железы, т. е. злокачественную опухоль молочной железы как без эстрогеновых, так и без прогестероновых рецепторов (сокращенно ER-/PR-злокачественную опухоль молочной железы); и трижды отрицательную злокачественную опухоль молочной железы, т. е. злокачественную опухоль молочной железы как без эстрогеновых, так и без прогестероновых рецепторов и с нормальной экспрессией/недостаточной экспрессией (или с отсутствием поддающегося детекции уровня экспрессии) HER2 (сокращенно ER-/PR-/HER2- злокачественную опухоль молочной железы). В зависимости от их паттерна генной экспрессии злокачественные опухоли молочной железы в некоторых случаях разделяют на злокачественную опухоль молочной железы люминального подтипа А, злокачественную опухоль молочной железы люминального подтипа В, нормальноподобную злокачественную опухоль молочной железы, HER2+ злокачественная опухоль молочной железы и базальноподобную злокачественную опухоль молочной железы (Sorlie et al. (2001) Proc. Nat. Acad. Sci. 98: 10869-10874). Люминальные подтипы А и В преимущественно являются ER-положительными. Напротив, при HER2+ злокачественных опухолях молочной железы наблюдают высокую экспрессию генов, ассоциированную с ампликоном HER2, а для нормальноподобных злокачественных опухолей молочной железы характерны молекулярные признаки нормальной ткани молочной железы.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой миелоидную неоплазму. В числе миелоидных неоплазм входят злокачественные опухоли клеток миелоидного ростка, например, миелоидный (миелоцитарный или миелогенный) лейкоз, происходящий из гранулоцитов (например, нейтрофилов, эозинофилов и базофилов) или моноцитов) или моноцитов. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в число миелоидных неоплазм входят хронический миелоцитарный лейкоз, острый миелоцитарный лейкоз, хронический нейтрофильный лейкоз, хронический эозинофильный лейкоз и миелодиспластические синдромы.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль яичка. Злокачественная опухоль яичка представляет собой злокачественную опухоль семенников. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, злокачественная опухоль яичка включает без ограничения такие злокачественные опухоли, как сперматоцитомы, несеминомы, хориокарцинома, тератокарцинома, незрелая тератома, опухоли желточного мешка, опухоли из клеток Лейдига и Сертоли, PNET, лейомиосаркома, рабдомиосаркома и мезотелиома.
В некоторых случаях злокачественная опухоль представляет собой злокачественную опухоль желудка. Опухоль желудка или злокачественная опухоль желудка относится к любой опухоли или злокачественной опухоли желудка, в том числе, например, аденокарциномам (например, диффузного типа и кишечного типа) и менее распространенным формам, таким как лимфомы, лейомиосаркомы и плоскоклеточные карциномы.
Дополнительные способы
В соответствии с конкретными вариантами осуществления, настоящее изобретение относится к способам определения риска развития злокачественной опухоли у пациента. Проценты, количества и паттерны метилирования биомаркеров характеризуют различные категории риска, например, высокий, средний или низкий. Риск развития злокачественной опухоли определяют путем измерения статуса метилирования соответствующих биомаркеров, а затем либо подстановки их в алгоритм классификации, либо сравнения их с эталонным количеством, т. е. предопределенным уровнем или паттерном метилированных (и/или неметилированных) биомаркеров, который ассоциирован с конкретным уровнем риска.
Определение тяжести злокачественной опухоли
В соответствии с другим вариантом осуществления, настоящее изобретение относится к способам определения тяжести злокачественной опухоли у пациента. Конкретная стадия или тяжесть злокачественной опухоли может иметь характерный уровень гиперметилирования или гипометилирования биомаркера или относительные уровни гиперметилирования или гипометилирования набора биомаркеров (паттерн). В некоторых случаях тяжесть злокачественной опухоли определяют путем измерения статуса метилирования соответствующих биомаркеров, а затем либо подстановки их в алгоритм классификации, либо сравнения их с эталонным количеством, т. е. предопределенным уровнем метилирования или паттерном метилированных биомаркеров, который ассоциирован с конкретной стадией.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента используют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17, 18 и/или 20. В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15. В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 16. В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 17. В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 18.
В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113,cgl2042264, cg27377213,cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880,cgl5797834, cg27125093, cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145,cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721,cg27023597,cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg22460896,
cg07116712, cgl0186131, cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756, cg03569637, cg02522196, cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998,cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476,cgl8158859, cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751,cg25954028, cgl4642045, cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472, cgl4999168,cg09399878,cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415,cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975,cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228,cg26811313, cg25432518,cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015,cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400,cg09366118, cgl5341833,cg02233149, cgl4247287,cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985,cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930.
В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343,cg01903374, cg00907272, cg27125093,
cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149,cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755,cgl8842353, cgl6622899,cgl4999168, cgl3925432,cgl2967050,cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965,cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20).
В некоторых случаях для определения тяжести злокачественной опухоли у пациента применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 ncgl7126555.
Определение прогноза злокачественной опухоли
В соответствии с одним вариантом осуществления, настоящее изобретение относится к способам определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессированию (улучшению) злокачественной опухоли. С течением времени изменяется величина или относительная величина (например, паттерн) метилирования биомаркеров. Например, гиперметилирование или гипометилирование биомаркеров "X" и "Y" в некоторых случаях увеличиваются с развитием злокачественной опухоли. Таким образом, тенденция этих биомаркеров, либо увеличение, либо уменьшение метилирования с течением времени в отношении злокачественной опухоли или отличного от злокачественной опухоли заболевания, указывает на динамику заболевания. Следовательно, этот способ предусматривает измерение уровня метилирования или статуса одного или нескольких биомаркеров у пациента по меньшей мере в двух разных моментах времени, например, в первый раз и во второй раз, и сравнение изменения, при его наличии. На основании результатов этих сравнений определяют динамику злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, один или несколько биомаркеров, выбранных из Таблиц 15, 16, 17, 18 и/или 20, используют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли. В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15, применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли. В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 16, применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли. В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 17, применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли. В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 18, применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли.
В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915,cgl7122157, cg09844573, cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104,cg25982880, cgl5797834, cg27125093, cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005,cg25490145, cgl1252953, cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182,cgl5759721,cg27023597, cg02782634, cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564,
cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg06488150 cgl6622899 cg20847580 cgl3597051 cg01456691 cg08912922 eg19266387 cg06825448 cg02233149 cg05352688 cg20685713 cg21004490 cg26017930
cg00206490
cg07644807
cg00558804
cg05304979
cg27598656
cg03549146,
cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg07116712, cgl0186131, cg06380123,cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg05596756, cg03569637, cg02522196,cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476, cgl8158859, cgl9300307, cgl0732611,cg24480810, cg02053964, cg25922751, cg25954028, cgl4642045, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cgl4999168, cg09399878, cg02874908, cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg23130731,cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cg05098343,cg07573366, cgl1105292,cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg09450197,cg20336172, cg08858130,cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351,cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg03431741, cg07417146, cg09001226,cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl8113826, cg04859102, cg01620360,cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl3512830,cgl9982684, cg22513455,cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cgl4247287,cg23824762, cg01604601,cg05656900, cg08132573, cg24686918, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731,cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg23589035, cg01903374, cg23612220,cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и применяют для определения динамики злокачественной опухоли у
пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса
злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли.
В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25922751,cg25432518,cg23612220, cg23130731,cgl3911392, cgll334870, cgll252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797, cg24166457, cgl9300307,cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346,cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930,cg22513455,cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834,cgl5698795,cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476, cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292,cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367,cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505,cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474,cg20336172,cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008, cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244иcg00025044 (таблица 20) применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли.
В некоторых случаях один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555, применяют для определения динамики злокачественной опухоли у пациента, динамика злокачественной опухоли относится к изменениям статуса злокачественной опухоли с течением времени, в том числе к прогрессированию (ухудшению) злокачественной опухоли и регрессии (улучшению) злокачественной опухоли.
Ведение пациента
В соответствии с определенными вариантами осуществления способов установления статуса злокачественной опухоли такие способы дополнительно
предусматривают ведение лечения пациента на основании такого статуса. Такое ведение включает определенные действия врача или клинициста после определения статуса злокачественной опухоли. Например, если врач ставит диагноз или делает прогноз злокачественной опухоли, то далее последует определенный режим отслеживания. Затем для оценки динамики злокачественной опухоли с помощью способов по настоящему изобретению необходим определенный режим терапии злокачественной опухоли. Альтернативно, после постановки диагноза отличного от злокачественной опухоли заболевания следует дополнительное обследование для определения конкретного заболевания, от которого страдает пациент. Необязательно, дополнительные обследования требуются, если диагностическое обследование дает неубедительный результат по статусу злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для установления статуса злокачественной опухоли используют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17, 18 и/или 20. В некоторых случаях для установления статуса злокачественной опухоли применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15. В некоторых случаях для установления статуса злокачественной опухоли применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 16. В некоторых случаях для установления статуса злокачественной опухоли применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 17. В некоторых случаях для установления статуса злокачественной опухоли применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 18.
В некоторых случаях для установления статуса злокачественной опухоли применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964, cgl1779113, cgl2042264, cg27377213, cg26680502, cgl2504877, cg21913888, cg26683005, cg24166457, cg27141915, cgl7122157, cg09844573,cg03087897, cg24706505, cgl7126555, cgl3911392, cgl8901104, cg25982880, cgl5797834,cg27125093, cgl7518965, cg20695297, cg04858553, cg09419005, cg25490145, cgl1252953,cgl8456621, cg07058988, cgl7864646, cg06153925, cg27410601, cg03297901, cg06853339, cgl2900649, cg27219182, cgl5759721, cg27023597,cg02782634,cgl8942579, cg01409343, cgl0530767, cg26112797, cg00253248, cg01722297, cg22589778, cg07137244, cg04147906, cg23878564, cg07860918, cg00206490, cg07644807, cg00558804, cg05304979, cg27598656, cg03549146, cg22190721, cg01660934, cg02358862, cg23093496, cg07641284, cg01681367, cg26769927, cg08480068, cg02914427, cg03653601, cg01990910, cg00933696, cg09866569, cg20357538, cg22460896, cg07116712,
cgl0186131, cg06380123, cgl8610205, cgl2353452, cgl0590292, cg00037681, cg05596756, cg03569637, cg02522196, cgl1655490, cgl9693177, cg26363363, cg21249754, cg23147227, cg01657186, cg23764129, cg04514998, cg07332880, cgl6061668, cg25574765, cgl4088196, cg03758697, cg05398700, cgl4058476, cgl8158859,cgl9300307, cgl8842353, cgl0732611, cg24480810, cg02053964, cg25922751, cg25954028,cgl4642045, cg24165921, cgl8215449, cgl6402452, cg21376733, cgl6509569, cg08075204, cgl4556909, cg07119472, cgl4999168, cg09399878,cg02874908,cgl0542975, cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137, cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736,cgl6191087, cgl3925432,cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833,cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313,cg25432518, cgl6622899,cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123,cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118,cgl5341833, cg02233149,cgl4247287, cg23824762,cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227,cgl9675731,cg21461981, cg25765104,cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478,cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930.
В некоторых случаях для установления статуса злокачественного заболевания применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927,cg26769700, cg25574765,cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093, cg26112797,
cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346,cg02053964, cg27377213,cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956, cgl8856478,cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015, cgl4058476,cgl2192582, cgl0590292, cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804,cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733,cg20847580,cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168, cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448, cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280, cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474, cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965, cgl6748008,cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925,cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20).
В некоторых случаях для установления статуса злокачественного заболевания применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 ncgl7126555.
Определение терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства
В соответствии с другим вариантом осуществления, настоящее изобретение относится к способам определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства. Эти способы пригодны при проведении клинических испытаний лекарственного средства, а также при отслеживании прогресса пациента на лекарственном средстве.
Терапия или клинические испытания предусматривают введение лекарственного средства в определенном режиме. В некоторых случаях такой режим предусматривает однократную дозу лекарственного средства или множество доз лекарственного средства с течением времени. Доктор или клинический исследователь отслеживает влияние лекарственного средства на пациента или субъекта в процессе его применения. Если лекарственное средство оказывает фармакологическое действие на состояние, то количества или относительные количества (например, паттерн или профиль) гиперметилирования или гипометилирования одного или нескольких биомаркеров по настоящему изобретению изменяются в сторону профиля отличного от злокачественной опухоли заболевания.
В некоторых случаях в ходе лечения следят за динамикой статуса метилирования одного или нескольких биомаркеров у пациента. Соответственно, этот способ предусматривает измерение уровней метилирования одного или нескольких биомаркеров у пациента, который проходит терапию лекарственным средством, и установления корреляции уровней со статусом злокачественной опухоли у пациента (например, путем сравнения с предопределенными уровнями метилирования биомаркеров, которые соответствуют различным статусам злокачественной опухоли). Один вариант осуществления этого способа предусматривает определение уровней метилирования одного или нескольких биомаркеров по меньшей в двух различных моментах времени в ходе терапии лекарственным средством, например, в первый раз и во второй раз, и сравнение изменения уровней метилирования биомаркеров, при его наличии. Например, уровни метилирования одного или нескольких биомаркеров измеряют до и после применения лекарственного средства или в два различных момента времени в процессе применения лекарственного средства. На основании результатов этих сравнений определяют влияние терапии. Если лечение является эффективным, то статус метилирования одного или нескольких биомаркеров имеет тенденцию к нормальному, при этом если лечение является неэффективным, то статус метилирования одного или нескольких биомаркеров имеет тенденцию к признакам злокачественной опухоли.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства используют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблиц 15, 16, 17, 18 и/или 20. В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 15. В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 16. В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 17. В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 18.
В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько
cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg23554164 cg25652701 cg26433975 cg05287480 cgl2098228 cg23429794 cg06482498 cgl4083015 cg05614346 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl9021985 cg00282244 cgl0673833 cgl6748008 cg26811313 cg26401541 cg03891050 cgl5046123 cg06439655 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl9300307 cgl4642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128 cgl8887230 cg06787669 cgl6644023 cg25432518 cg20046343 cg00899907 cg03190513 cgl1334870 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cgl9421584 cg08486903 cgl2192582 cg06488150 cgl6622899 cg20847580 cgl3597051 cg01456691 cg08912922 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cgl3395086 cgl0511890 cg23130731 cg27388962 cgl3464240 cg03218479 cgl7984956 cg09335715 cg05098343 cg09450197 cgl2359001 cg03431741 cgl8113826 cgl7207512 cg23021796 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cg01657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cg02609337 cg05177060 cgl2629796 cg07573366 cg20336172 cgO1209642 cg07417146 cg04859102 cg20510285 cg24835948 cgl6911583, cgl2042264, cg27141915, cgl8901104, cg09419005, cg27410601, cg02782634, cg22589778, cg00558804, cg23093496, cgO1990910, cg06380123, cg02522196, cg23764129, cg05398700, cg02053964, cg21376733, cg02874908, cg20826709, cg09153080, cg04314978, cg00907272, cgl3408086, cgl9252956, cgl0351284, cg24107852, cgl6454130, cgl1105292, cg08858130, cgl4564351, cg09001226, cgO1620360, cgO1149192, cgl0393744,
cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292,cg27366280, cg06825448,cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688,cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713,cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985,cgl8856478,cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 iicg26017930.
В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25922751, cg25432518, cg23612220, cg23130731, cgl3911392, cgl1334870, cgl1252953, cgl0542975, cg08098128, cg02874908, cg26769927, cg26769700, cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cgl7126555, cgl4247287, cg07420137, cg05098343, cg01903374, cg00907272, cg27125093,cg26112797, cg24166457, cgl9300307, cgl7122157, cgl3555415, cgl1436362, cgl0673833, cg09866569, cg08075204, cg05614346, cg02053964, cg27377213, cg24480810, cg24301930, cg22513455, cgl9693177, cgl9675731, cgl9252956,cgl8856478, cgl6509569, cgl5797834, cgl5698795, cgl5341833, cgl4556909, cgl4083015,cgl4058476,cgl2192582, cgl0590292,cg06787669, cg06439655, cg02522196, cg02233149, cg00558804, cg26680502, cg23013029, cg22552736, cg21376733, cg20847580, cgl9704755, cgl8842353, cgl6622899, cgl4999168,cgl3925432, cgl2967050, cgl1105292, cg09419005, cg09153080, cg07380416, cg06825448,cg05596756, cg03891050, cg01681367, cg01456691, cg00015530, cg27410601, cg27366280,cg26683005, cg25666403, cg24706505, cg24107852, cg23824762, cg23021796, cg21122474,cg20336172, cgl8610205, cgl8456621, cgl7518965,cgl6748008,cgl6191087, cgl6061668, cgl4642045, cgl3924996, cgl2353452, cg09335715, cg08858130, cg08480068, cg08052292, cg07428959, cg06153925, cg04147906, cg03431741, cg00282244 и cg00025044 (таблица 20).
В некоторых случаях для определения терапевтической эффективности фармацевтического лекарственного средства применяют один или несколько биомаркеров, выбранных из cg25574765, cg25490145, cgl8384097, cg25922751 и cgl7126555.
Создание алгоритмов классификации для установления статуса злокачественной опухоли
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, один или несколько способов распознания паттернов применяют при анализе значений метилирования,
измеряемых для маркеров в панели биомаркеров, которые корреляционно связаны с основным диагностическим запросом. В некоторых случаях способ распознания паттерна предусматривает линейное комбинирование уровней метилирования или нелинейное комбинирование уровней метилирования для извлечения вероятности, что биологический образец получен от пациента, у которого отсутствуют признаки заболевания, у которого присутствует системная злокачественная опухоль или у которого присутствует биохимический рецидив, а также для установления различия между этими стадиями и типами заболевания, особенно типа первичной опухоли. В некоторых случаях модели и/или алгоритмы представлены в машиночитаемом формате, и их применяют для установления корреляции уровней метилирования или профиля метилирования со стадией заболевания и/или для определения способа лечения пациента или класса пациентов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, анализ уровня метилирования для множества целей предусматривает применения алгоритма или классификатора. Массивом данных управляют, его классифицируют и анализируют с использованием методик, известных в настоящей области техники и описанных в настоящем документе. В некоторых случаях анализ уровня метилирования для множества целей предусматривает моделирование набора зондов и предварительную обработку данных. В некоторых случаях моделирование набора зондов и предварительная обработка данных производят с помощью алгоритма Robust Multi-Array (RMA) и его вариантов GC-RMA, RMA, алгоритма Probe Logarithmic Intensity Error (PLIER) или его варианта iterPLIER. Для предварительной обработки данных с использованием алгоритма RMA применяют фильтры отклонений или интенсивности, например, путем удаления целевых последовательностей соответственно со средним квадратичным отклонением <10 или средней интенсивностью <100 единиц интенсивности нормализованного диапазона данных.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, данные, которые были созданы с помощью таких образцов, как "известные образцы" или "контроль", затем используют для "обучения" модели классификации. "Известный образец" представляет собой образец, который был предварительно классифицирован, такой как, например, подходящий контроль (например, биомаркеры) от не пораженного заболеванием или пораженного отличным от злокачественной опухоли заболеванием "нормального" образца и/или подходящего контроля (например, биомаркеры из ткани известного типа или стадии опухоли или статуса злокачественной опухоли. Данные, которые применяют
для формирования модели классификации, называют "набором обучающих данных". В некоторых случаях набор обучающих данных, который применяют для формирования модели классификации, включает необработанные данные или предварительно обработанные данные. После обучения модель классификации распознает паттерны в данных, полученных с применением неизвестных образцов. В некоторых случаях такую модель классификации затем применяют для классификации неизвестных образцов на классы. Это полезно, например, при прогнозировании того, ассоциирован ли конкретный биологический образец с определенным биологическим состоянием (например, пораженный против не пораженного заболеванием).
После построения и подтверждения модели, ее объединяют в пакет, доступный конечным пользователям. Например, это предусматривает реализацию приложения для работы с электронными таблицами или альтернативной формы для визуального представления, в которое была встроена модель, создание сценария статистического программного пакета или реструктуризацию кода модели в жестко запрограммированное приложение сотрудниками отдела по информационным технологиям.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, модели классификации формируют и применяют на любом подходящем цифровом компьютере. В число подходящих цифровых компьютеров входят микро, мини или большие компьютеры с использованием любой стандартной или специализированной операционной системы, такой как операционная система Unix, Windows(r) или Linux(tm). В вариантах осуществления с применением масс-спектрометра используемый цифровой компьютер физически отделен от масс-спектрометра, который применяют для создания представляющих интерес спектров, или же он соединен с масс-спектрометром.
Набор обучающих данных и модели классификации в соответствии с вариантами осуществления настоящего изобретения реализованы в виде компьютерного кода, который выполняется или используется цифровым компьютером. Компьютерный код хранят на любом подходящем машиночитаемом носителе, в том числе на оптических или магнитных дисках, накопителях, лентах и т. д., и он может быть написан на любом подходящем языке программирования вычислительной машины, в том числе R, С, С++, visual basic и т. д.
Описанные выше обучающие алгоритмы полезны как для разработки алгоритмов классификации уже обнаруженных биомаркеров среди биомаркеров, так и для поиска новых биомаркеров среди биомаркеров. Алгоритмы классификации, в свою очередь,
образуют основу для диагностических обследований, предоставляя диагностические значения (например, граничные точки) для биомаркеров, применяемые отдельно или в комбинации.
Компьютерные системы, платформы и программы
В соответствии с некоторыми аспектами, описываемое настоящее изобретение относится к компьютерной системе или платформе, которая снабжена средствами для реализации одного или нескольких описываемых в настоящем документе способов. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, в состав компьютерной системы входит: (а) по меньшей мере одно запоминающее устройство, содержащее по меньшей мере одну компьютерную программу, предназначенную для управления работой компьютерной системы с целью реализации способа, который предусматривает: (i) получение данных по метилированию ДНК, например, профиль метилирования CUP и профиль метилирования одной или нескольких первичных опухолей, (ii) определение степени идентичности между профилем метилирования CUP и профилем метилирования первичных опухолей, и (Ь) по меньшей мере один процессор для выполнения этой компьютерной программы. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, платформа содержит одну или несколько компьютерных систем.
Другой описываемый в настоящем документе аспект относится к компьютерной программе для управления компьютерной системой для выполнения стадий согласно одному или нескольким описываемым в настоящем документе способам.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, компьютерная система относится к содержащей компьютер системе, где компьютер содержит машиночитаемый носитель, на котором содержится программное обеспечение для управления компьютером. В некоторых случаях компьютерная система включает в себя один или несколько процессоров общего или специального назначения и ассоциированную с ними память, в том числе энергозависимые и энергонезависимые запоминающие устройства. В некоторых случаях память компьютерной системы хранит программное обеспечение или компьютерные программы для управления работой компьютерной системы для создания системы специального назначения в соответствии с настоящим изобретением или для реализации системы с целью осуществления способов в соответствии с настоящим изобретением. В некоторых случаях компьютерная система включает в себя одноядерный или многоядерный центральный процессор (CPU) Intel или AMD х86, процессор ARM или аналогичный компьютерный процессор для обработки данных. В
некоторых случаях CPU или микропроцессор представляет собой любой обычный однокристальный или многокристальный микропроцессор общего назначения, такой как процессор Intel Pentium, процессор Intel 8051, процессор RISC или MISS, процессор Power PC или процессор ALPHA. В некоторых случаях микропроцессор представляет собой любой обычный или специальный микропроцессор, такой как цифровой сигнальный процессор или графический процессор. Микропроцессор обычно имеет обычные адресные магистрали, обычные шины передачи данных и одну или несколько обычных управляющих шин. Как описано ниже, программное обеспечение по настоящему изобретению выполняется на специализированной системе или на компьютере общего назначения с DOS, СРМ, Windows, Unix, Linux или другой операционной системой. В некоторых случаях система включает в себя энергонезависимую память, такую как дисковая память и твердотельная память, для хранения компьютерных программ, программного обеспечения и данных, и энергозависимую память, такую как быстродействующая оперативная память для выполнения программ и программного обеспечения.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, машиночитаемый носитель относится к любому накопителю, применяемому для хранения данных, доступных компьютеру, а также к любым другим средствам для обеспечения компьютеру доступа к данным. Примеры машиночитаемого носителя по типу накопителя включают в себя: магнитный жесткий диск; гибкий магнитный диск; оптический диск, такой как CD-ROM и DVD; магнитную ленту; однокристальное запоминающее устройство. Машиночитаемый физический носитель данных, пригодный в различных вариантах осуществления настоящего изобретения, может включать в себя любой физический машиночитаемый носитель данных, например, твердотельную память (такую как флэш-память), магнитные и оптические машиночитаемые носители и накопители и память, которая использует другие технологии постоянной памяти. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, машиночитаемый носитель представляет собой любой материальный носитель, который позволяет компьютеру получать доступ к компьютерным программам и данным. Машиночитаемые носители могут включать в себя энергозависимые и энергонезависимые, съемные и несъемные материальные носители, реализованные любым способом или технологией, способные хранить информацию, такую как машиночитаемые инструкции, программные модули, программы, данные, структуры данных и информацию в виде базы данных. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящего изобретения,
машиночитаемые носители включают в себя без ограничения RAM (оперативное запоминающее устройство), ROM (постоянное запоминающее устройство), EPROM (стираемое программируемое постоянное запоминающее устройство), EEPROM (электрически стираемое программируемое постоянное запоминающее устройство), флэш-память или другую технологию памяти, CD-ROM (постоянное запоминающее устройство на компакт-дисках), DVD диски (универсальные цифровые диски) или другие оптические накопители, магнитные кассеты, магнитную ленту, запоминающее устройство на магнитных дисках или другие магнитные накопители, другие типы энергозависимой и энергонезависимой памяти и любой другой материальный носитель, который можно применять для хранения информации и который может считываться компьютером, включая и любую подходящую комбинацию вышеизложенного.
В некоторых случаях один или несколько описываемых в настоящем документе способов реализуют на автономном компьютере или как часть сетевой компьютерной системы или вычислительной платформы. В автономном компьютере все программное обеспечение и данные могут располагаться на локальных запоминающих устройствах, например, для хранения программного обеспечения компьютера для реализации настоящего изобретения, а также данных можно применять оптический диск или устройство флэш-памяти. В соответствии с альтернативными вариантами осуществления, программное обеспечение, или данные, или как первое, так и вторые могут быть доступны через сетевое соединение с удаленными устройствами. В соответствии с одним вариантом осуществления сетевой компьютерной системы или вычислительной платформы, настоящим изобретением предусмотрено применение клиент-серверной среды по общедоступной сети, такой как интернет, или частной сети для подключения к данным и ресурсам, хранящимся в удаленных и/или расположенных на централизированных местоположениях. В соответствии с этим вариантом осуществления, сервер, включающий в себя веб-сервер, может предоставлять доступ, либо открытый доступ, либо оплачиваемый по факту потребления, либо доступ по подписке к информации, предоставляемой в соответствии с настоящим изобретением. В клиент-серверной среде клиентский компьютер, выполняющий клиентское программное обеспечение или программу, такую как веб-браузер, подключается к серверу по сети. Клиентское программное обеспечение или веб-браузер предоставляет пользовательский интерфейс для пользователя настоящего изобретения для ввода данных и информации и получения доступа к данным и информации. В некоторых случаях клиентское программное обеспечение просматривают на дисплее локального компьютера или
другом устройстве вывода, и оно может позволять пользователю вводить информацию, например, с помощью компьютерной клавиатуры, мыши или другого устройства ввода. Сервер выполняет одну или несколько компьютерных программ, которые позволяют клиентскому программному обеспечению вводить данные, обрабатывать данные в соответствии с настоящим изобретением и выводить данные пользователю, а также предоставлять доступ к локальным и удаленным компьютерным ресурсам. Например, пользовательский интерфейс может включать в себя графический пользовательский интерфейс, содержащий элемент доступа, такой как текстовое поле, которое позволяет вводить данные, полученные в результате анализа, например, уровни данных по метилированию ДНК или уровни генной экспрессии ДНК целевых генов эталонной популяции плюрипотентных стволовых клеток и/или представляющей интерес популяции плюрипотентных стволовых клеток, а также элемент отображения, который может обеспечивать графический вывод результатов сравнения в виде оценочной карты или наборов данных, переданных или предоставленных процессором после выполнения инструкций, закодированных на машиночитаемом носителе. Применяемый в контексте настоящего изобретения термин "программное обеспечение" применяют взаимозаменяемо с термином "программа", и он относится к предписанным правилам для работы с компьютером. Примеры программного обеспечения включают: программное обеспечение; сегменты кода; инструкции; компьютерные программы; и программируемую логику.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, профили метилирования от первичных опухолей, которые применяют в качестве эталонных, могут быть записаны в электронном виде или в цифровой форме, аннотированы и извлечены из баз данных, включая без ограничения базы данных по белкам и ДНК GenBank (NCBI), такие как genome, ESTs, SNPS, Traces, Celara, Ventor Reads, Watson reads, HGTS и т. д.; база данных от Швейцарского института биоинформатики (Swiss Institute of Bioinformatics), такие базы данных, как ENZYME, PRO SITE, S WIS S-2DP AGE, Swiss-Prot и TrEMBL; программный пакет Melanie или www-сервер ExPASy и т. д., SWISS-MODEL, Swiss-Shop и другие сетевые вычислительные инструменты; база данных Comprehensive Microbial Resource (от Института геномных исследований (The institute of Genomic Research)). В некоторых случаях полученную в результате информацию хранят в реляционной базе данных, которую используют для определения гомологий между эталонными данными или генами или белками в геноме и среди геномов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, система сравнивает данные в "модуле сравнения", который использует множество доступных программных продуктов и форматов для операции сравнения, с целью сравнения информации последовательности, определенной в модуле определения, с эталонными данными. В соответствии с одним вариантом осуществления, модуль сравнения предназначен для использования методов распознавания образов для сравнения информации последовательности из одной или нескольких записей с одним или несколькими паттернами эталонных данных. Модуль сравнения можно сконфигурировать с использованием существующего коммерчески доступного или свободно доступного программного обеспечения для сравнения паттернов и можно оптимизировать под проводимые сравнения конкретных данных. Модуль сравнения также может предоставлять машиночитаемую информацию, относящуюся к информации последовательности, которая может включать, например, детекцию наличия или отсутствия сайтов метилирования CpG в последовательностях ДНК; определение уровня метилирования.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, модуль сравнения обеспечивает машиночитаемый результат сравнения, который может быть обработан в машиночитаемой форме по предопределенным критериям или критериям, заданным пользователем, с предоставлением отчета, который содержит информационный материал, отчасти основанное на результате сравнения, который может быть сохранен и выведен по запросу пользователя с помощью дисплейного модуля. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, дисплейный модуль позволяет отображать информационный материал, отчасти основанный на результате сравнения, пользователю, причем информационный материал представляет собой отчет, в котором показаны результаты сравнения профиля метилирования представляющего интерес CUP с профилем метилирования опухолевой клетки.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, дисплейный модуль позволяет отображать отчет или информационный материал, отчасти основанный на результате сравнения, конечному пользователю, причем информационный материал представляет собой отчет, в котором показаны результаты сравнения профиля метилирования CUP с профилем метилирования избранных первичных опухолей. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, этого аспекта и всех других аспектов настоящего изобретения, модуль сравнения или любой другой модуль по настоящему изобретению может включать в себя операционную систему (например,
UNIX, Windows), на которой запускается система управления реляционными базами данных, веб-приложение и веб-сервер. Веб-приложение может включать в себя исполняемый код, необходимый для создания операторов языка базы данных [например, операторов стандартного языка запроса (Standard Query Language - SQL)]. Исполняемые модули могут включать в себя встроенные операторы SQL. Кроме того, веб-приложение может включать в себя файл конфигурации, который содержит указатели и адреса для различных программных элементов, входящих в состав сервера, а также различные внешние и внутренние базы данных, к которым необходимо получать доступ для обслуживания запросов пользователей. Файл конфигурации также направляет запросы к серверным ресурсам на соответствующее оборудование, которое может потребоваться, если сервер будет распределен между двумя или более отдельными компьютерами. В соответствии с одним вариантом осуществления, вебсервер поддерживает протокол TCP/IP. Такие локальные сети иногда называют сетями "Интранет". Преимущество таких сетей Интранет заключается в том, что они позволяют легко обмениваться данными с базами данных с открытым доступом, находящимися в интернете (например, на веб-сайте GenBank или Swiss Pro), такими как The Cancer Genome Atlas (TCGA) или International Cancer Genome Consortium (ICGC) и тому подобное. Таким образом, в соответствии с конкретным вариантом осуществления настоящего изобретения, пользователи могут получать прямой доступ к данным (например, через гипертекстовые ссылки), находящимся в интернет-базах данных, с помощью интерфейса HTML, предоставляемого веб-браузерами и веб-серверами. В соответствии с другими вариантами осуществления настоящего изобретения, для соединения с интернет-базами данных можно использовать другие интерфейсы, такие как HTTP, FTP, SSH и VPN интерфейсы.
В некоторых случаях компьютерные инструкции реализуются в программном обеспечении, программно-аппаратном средстве или аппаратном обеспечении и включают в себя любой тип программируемого шага, выполняемого модулями системы обработки информации. В некоторых случаях компьютерная система подключена к локальной сети (LAN) или глобальной сети (WAN). Одним примером локальной сети может быть корпоративная вычислительная сеть, включающая доступ к Интернету, к которой подключены компьютеры и вычислительные устройства, составляющие систему обработки данных. В соответствии с одним вариантом осуществления, в LAN для связи применяются стандартные сетевые протоколы управления передачей/межсетевые протоколы (TCP/IP). Протокол управления
передачей/межсетевой протокол (TCP) можно использовать в качестве протокола транспортного уровня для обеспечения надежной связи с установлением соединения между транспортными уровнями среди компьютерных систем. Сетевой уровень обслуживает транспортный уровень. С помощью схемы двусторонней связи TCP обеспечивает механизм для создания, поддержки и завершения логических соединений между компьютерными системами. В качестве своего протокола сетевого уровня транспортный уровень TCP использует ГР. Кроме того, TCP предоставляет порты протокола для дифференцировки нескольких программ, выполняемых на одном устройстве, путем включения номера порта назначения и номера порта источника с каждым сообщением. TCP выполняет такие функции, как передача байтовых потоков, определения потока данных, подтверждения данных, повторную передачу потерянных или поврежденных данных и мультиплексирование нескольких соединений через одно сетевое соединение. Наконец, TCP отвечает за включение информации в структуру датаграммы. В соответствии с альтернативными вариантами осуществления, LAN может поддерживать другие сетевые стандарты, в том числе без ограничения, стандарт взаимодействия открытых систем Международной организации по стандартизации, SNA от ГВМ, Netware от Novell и Banyan VINES.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, модуль сравнения обеспечивает машиночитаемые данные, которые могут быть обработаны в машиночитаемой форме по предопределенным критериям или критериям, заданным пользователем, с предоставлением загружаемого информационного материала, который может быть сохранен и выведен по запросу пользователя с помощью дисплейного модуля. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, настоящего изобретения, компьютеризированная система может включать в себя или быть оперативно связана с дисплейным модулем, таким как компьютерный монитор, сенсорный экран или система отображения видеоинформации. Дисплейный модуль позволяет представлять пользователю системы пользовательские инструкции, просматривать введенные в систему данные и выводить системе результаты пользователю как часть пользовательского интерфейса. Необязательно, компьютеризованная система может включать в себя печатающее устройство, или может быть оперативно соединена с ним, для производства печатных копий выводимой системой информации.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, веб-браузер можно применять для предоставления пользовательского интерфейса, позволяющего
пользователю взаимодействовать с системой для ввода информации, создания запросов и отображения загруженного информационного материала. Кроме того, для использования веб-браузера с целью создания пользовательского интерфейса можно адаптировать различные функциональные модули системы. С помощью веб-браузера пользователь может создавать запросы на получение данных из источников данных, таких как базы данных, и взаимодействовать с модулем сравнения для выполнения сравнений и сопоставления паттернов. Пользователь может указывать и кликать на элементы пользовательского интерфейса, такие как кнопки, выпадающие меню, полосы прокрутки и т. д., обычно используемые в графических пользовательских интерфейсах для того, чтобы взаимодействовать с системой и заставить систему осуществлять способы по настоящему изобретению. Запросы, составленные с помощью веб-браузера пользователя, могут быть переданы по сети веб-приложению, которое может обрабатывать или форматировать запрос для создания поискового запроса в одной или нескольких базах данных, которые могут быть использованы для получения соответствующей информации, связанной с уровнями метилирования ДНК и уровни генной экспрессии, загружаемого информационного материала, обработки этой информации и вывода результатов.
Сервер
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, представленные в настоящем документе способы обрабатывают на сервере или компьютерном сервере (фиг. 2). В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер 401 включает в себя центральный процессор (CPU, также "процессор") 405, который является одноядерным процессором, многоядерным процессором или множеством процессоров для параллельной обработки. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, процессор, используемый как часть блок управления, представляет собой микропроцессор. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер 401 также включает в себя память 410 (например, оперативное запоминающее устройство, постоянное запоминающее устройство, флэш-память); электронный блок 415 хранения (например, жесткий диск); коммуникационный интерфейс 420 (например, сетевой адаптер) для коммуникации с одной или несколькими другими системами; и периферийные устройства 425, которые включают в себя кэш, другую память, хранилище данных и/или электронные дисплейные адаптеры. Память 410, блок 415 хранения, интерфейс 420 и периферийные устройства 425 сообщаются с процессором
405 через коммуникационную шину (сплошные линии), такую как материнская плата. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, блок 415 хранения является блоком хранения данных для хранения данных. Сервер 401 функционально связан с компьютерной сетью ("сетью") 430 с помощью коммуникационного интерфейса 420. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, процессор с помощью дополнительного аппаратного обеспечения также функционально связан с сетью. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сеть 430 представляет собой интернет, интранет и/или экстранет, интранет и/или экстранет, которые находятся в коммуникации с интернетом, телекоммуникационной сетью или сетью передачи данных. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сеть 430 с помощью сервера 401 реализует одноранговую сеть, которая позволяет устройствам, соединенным с сервером 401, выполнять роль клиента или сервера. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер способен передавать и принимать машиночитаемые инструкции (например, протоколы или параметры работы устройства/системы) или данные (например, результаты измерения датчиков, необработанные данные, полученные в результате детекции метаболитов, анализ необработанных данных, полученных в результате детекции метаболитов, интерпретация необработанных данных, полученных в результате детекции метаболитов, и т. д.) посредством электронных сигналов, передаваемых по сети 430. Более того, в соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сеть используют, например, для передачи или приема данных через международную границу.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер 401 находится в коммуникационной связи с одним или несколькими устройствами 435 вывода, такими как дисплей или принтер, и/или с одним или несколькими устройствами 440 ввода, такими как, например, клавиатура, мышь или джойстик. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, дисплей представляет собой сенсорный дисплей, и в этом случае он функционирует как дисплейное устройство, а также как устройство ввода. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, присутствуют различные и/или дополнительные устройства ввода, такие как извещатель тревожной сигнализации, динамик или микрофон. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер использует любую из ряда операционных систем, такую как, например, любая из нескольких версий Windows(r), или MacOS(r), или Unix(r), или Linux(r).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, блок 415 хранения хранит файлы или данные, связанные с работой устройства, систем или описываемых в настоящем документе способов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер находится в коммуникационной связи с одной или несколькими удаленными компьютерными системами через сеть 430. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, одна или несколько удаленных компьютерных систем включают в себя, например, персональные компьютеры, лаптопы, планшеты, телефоны, смартфоны или персональные цифровые помощники.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, блок управления включает в себя один сервер 401. В других ситуациях система включает в себя множество серверов, находящихся в коммуникационной связи друг с другом через интранет, экстранет и/или интернет.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, сервер 401 приспособлен для хранения параметров работы устройства, протоколов, описываемых в настоящем документе способов и другой имеющей потенциальное отношение информации. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, такая информация хранится в блоке 415 хранения или на сервере 401, и такие данные передаются через сеть.
Наборы и изделия
В соответствии с другим аспектом, настоящее изобретение относится к наборам для детекции и/или характеристики статуса злокачественной опухоли и/или создания базы данных по профилям метилирования CpG, причем набор содержит множество праймеров или зондов для детекции или измерения статуса метилирования/уровней одного или нескольких описываемых в настоящем документе образцов. Такие наборы содержат в некоторых случаях по меньшей мере один полинуклеотид, который гибридизируется по меньшей мере с одной из последовательностей-биомаркеров метилирования по настоящему изобретению, и по меньшей мере один реагент для детекции метилирования гена. В число реагентов для детекции метилирования входят, например, бисульфат натрия, полинуклеотиды, сконструированные для гибридизации с последовательностью, которая является продуктом маркерной последовательности, если маркерная последовательно не метилирована (например, содержащая по меньшей мере одну C-U конверсию), и/или чувствительный к метилированию или зависящий от
метилирования рестрикционный фермент. В некоторых случаях в наборах представлены твердые подложки в форме аналитического устройства, которое адаптировано для применения в анализе. В некоторых случаях наборы дополнительно содержат детектируемые метки, функционально связанные с полинуклеотидом, например, зонд в наборе.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы по настоящему изобретению содержат один или несколько (например, 1, 2, 3, 4 или более) различных полинуклеотидов (например, праймеров и/или зондов), которые могут специфически амплифицировать по меньшей мере часть участка ДНК биомаркера по настоящему изобретению. В некоторых случаях наборы содержат панель зондов, причем каждый зонд в указанной панели зондов содержит последовательность, которая приблизительно на 60-99% идентична зонду под SEQ Ш N0: 1-1775. Необязательно, в набор также входит один или несколько меченых детектируемой меткой полипептидов, которые могут гибридизироваться с амплифицируемой частью. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы содержат достаточно праймеров для амплификации 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более различных участков ДНК или их частей и необязательно включают меченные детектируемой меткой полинуклеотиды, которые могут гибридизироваться с каждым амплифицируемым участком ДНК или его частью. Наборы дополнительно могут содержать зависимый от метилирования или чувствительный к метилированию рестрикционный фермент и/или бисульфит натрия.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы содержат бисульфит натрия, праймеры и адаптеры (например, олигонуклеотиды, которые можно лигировать или иным образом связать с геномными фрагментами) для амплификации всего генома и полинуклеотиды (например, меченные детектируемой меткой полинуклеотиды) для количественной оценки наличия конвертированной метилированной и или конвертированной неметилированной последовательности по меньшей одним с цитозином из участка ДНК биомаркера по настоящему изобретению.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы содержат чувствительные к метилированию рестрикционные ферменты (например, зависимый от метилирования рестрикционный фермент и/или чувствительный к метилированию рестрикционный фермент), праймеры и адаптеры для амплификации всего генома и полинуклеотиды для количественной оценки числа копий по меньшей мере части участка ДНК биомаркера по настоящему изобретению.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы содержат связывающийся с участком метилирования фрагмент и один или несколько полинуклеотидов для количественной оценки числа копий по меньшей мере части участка ДНК биомаркера по настоящему изобретению. Связывающийся с участком метилирования фрагмент обозначает молекулу (например, полипептид), который специфически связывается с метил-цитозином.
В число примеров входят рестрикционные ферменты и их фрагменты, которые лишены ДНК-разрезающей активности, но сохраняют способность связывать метилированную ДНК, антитела, которые специфически связываются с метилированной ДНК, и т. д.).
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, набор включает упаковочный материал. Применяемый в контексте настоящего изобретения термин "упаковочный материал" может относиться к физической структуре, содержащей компоненты набора. В некоторых случаях упаковочный материал поддерживает стерильность компонентов набора и выполнен из материала, который традиционно применят для таких целей (например, бумаги, гофрированной фибры, стекла, пластика, фольги, ампул и т. д.). В наборы включены и другие материалы, пригодные при выполнении анализов, в том числе пробирки для проведения тестов, пипетки для переноса материала и т. п. В некоторых случаях наборы также включают письменные инструкции по применению одного или нескольких из этих реагентов в любом из описываемых в настоящем документе анализов.
В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы также включают буферное средство, консервант или стабилизатор белка/нуклеиновой кислоты. В некоторых случаях наборы также включают другие компоненты реакционной смеси, которые описаны в настоящем документе. Например, наборы включают одну или несколько аликвот описываемой в настоящем документе термостабильной ДНК-полимеразы и/или одну или несколько аликвот dNTP. В некоторых случаях наборы также включают контрольные образцы с известными количествами молекул матричной ДНК, несущих отдельные аллели локуса. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, наборы включают образец отрицательного контроля, например, образец, который не содержит молекул ДНК, несущих отдельные аллели локуса. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, набор включает образец положительного контроля, например, образец, содержащий известные количества одного или нескольких аллелей локуса.
Некоторые термины
Если не указано иное, все используемые в настоящем документе технические и научные термины имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в области техники, к которой относится заявляемый предмет изобретения. Следует понимать, что приведенное выше общее описание и последующее подробное описание являются иллюстративными и пояснительными и не ограничивают ни один из заявляемых предметов изобретения. В настоящей заявке применение форм единственного числа включает формы с множественным числом, если специально не указано иное. Нужно отметить, что используемые в настоящем описании и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа включают объекты в форме множественного числа, если контекст явно не диктует иное. В настоящей заявке применение "или" означает "и/или", если не указано иное. Более того, применение термина "включающий", а также других форм, таких как "включать", "включает" и "включенный", не является ограничивающим.
Применяемые в контексте настоящего изобретения диапазоны и количества могут быть выражены в виде "приблизительно" конкретного значения или диапазона. "Приблизительно" также включает точное количество. Таким образом, "приблизительно 5 мкл" означает "приблизительно 5 мкл", а также "5 мкл". Как правило, термин "приблизительно" включает в себя количество, которое, согласно ожиданиям, будет находиться в пределах экспериментальной ошибки.
Применяемые в контексте настоящего изобретения заголовки разделов предназначены только для организационных целей и не должны истолковываться как ограничивающие описываемый предмет изобретения.
Применяемые в контексте настоящего изобретения термины "индивидуум(ы)", "субъект(ы)" и "пациент(ы)" означают любое млекопитающее. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, млекопитающим является человек. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, млекопитающим является отличное от человека животное.
"Сайт" соответствует одному сайту, который может быть положением одного основания или группой положений скоррелированных оснований, например, сайтом CpG. "Локус" соответствует участку, который включает в себя несколько сайтов. В некоторых случаях локус включает в себя один сайт.
Применяемый в контексте настоящего изобретения "по сравнению" относится к оценке того, как статус метилирования, доля, уровень или геномная локализация одного или нескольких биомаркеров в образце от пациента относится к статусу метилирования, доле, уровню или геномной локализации соответствующего одного или нескольких биомаркеров в стандартном или контрольном образце. Например, "по сравнению" может относиться к оценке того, является ли статус метилирования, доля, уровень или клеточная локализация одного или нескольких биомаркеров в образце у пациента таким же, большим или меньшим или отличающимся от статуса метилирования, доли, уровня или клеточной локализации соответствующего одного или нескольких биомаркеров в стандартном или контрольном образце. В соответствии с одним вариантом осуществления термин "по сравнению" относится к оценке одного или нескольких образцов в сравнении (такой же, больше или меньше или отличающийся) со множеством стандартных или контрольных образцов.
Термин "статистически значимый" или "значимо" относится к статистической значимости и обычно обозначает двойное стандартное отклонение (2 SD) ниже нормы, или еще ниже, концентрации маркера. Этот термин относится к статистическому доказательству того, что имеет место различие. Его определяют как вероятность принятия решения об отказе от нулевой гипотезы, если нулевая гипотеза фактически истинна. Решение зачастую принимают с помощью р-значения.
Термин "создание прогноза" или "предсказывать" относится к прогнозу или расчету риска развития злокачественной опухоли или заболевания или типа опухоли, и насколько пациент будет прогрессировать, и есть ли шанс излечения. "Создание прогноза злокачественной опухоли" обычно относится к прогнозу или предсказанию возможного протекания или исхода в отношении злокачественной опухоли и/или пациента, оценке риска возникновения или рецидива злокачественной опухоли, определения способа лечения или определения эффективности лечения или ответов на него. При создании прогноза можно использовать информацию от индивидуума, а также внешние данные для сравнения относительно информации от индивидуума, такие как данные, полученные от населения, скорость ответа у оставшихся в живых, семейная или другая генетическая информация и тому подобное. "Создание прогноза" также применяют в контексте прогнозирования прогрессирования заболевания, в частности, для прогнозирования терапевтических результатов определенной терапии заболевания, в частности, неопластических состояний или типов опухолей. Создание прогноза терапии применяют, например, для прогнозирования шанса на успех (т. е. излечения от
заболевания) или шанса уменьшения тяжести заболевания до определенного уровня. В целом, маркеры, по которым проводят скрининг с этой целью, предпочтительно получают из выборочных данных от пациентов, которые проходили лечение в соответствии с подлежащей прогнозированию терапией. Наборы маркеров также можно применять для отслеживания пациента в отношении появления терапевтических результатов или положительных результатов прогрессирования заболевания.
Термин "уровень злокачественной опухоли" или "статус злокачественной опухоли" относится к тому, присутствует ли злокачественная опухоль, к стадии злокачественной опухоли, размеру опухоли, есть ли метастазы, к общей опухолевой нагрузке на организм, локализации и/или происхождению злокачественной опухоли и/или к другому показателю тяжести злокачественной опухоли. Уровень злокачественной опухоли может быть выражен числом или другими символами. В некоторых случаях уровень равен нулю. В некоторых случаях уровень злокачественной опухоли также включает предопухолевые или предраковые состояния (статусы), ассоциированные с мутациями или рядом мутаций.
Применяемый в контексте настоящего изобретения термин "проведение лечения" и "лечение" относится к введению субъекту эффективного количества композиции, так чтобы у субъекта имело место уменьшение по меньшей мере одного симптома заболевания или ослабление заболевания, например, имели место благоприятные или необходимые клинические результаты. В контексте настоящего изобретения в число благоприятных или необходимых клинических результатов входят без ограничения облегчение одного или нескольких симптомов, уменьшение степени заболевания, стабилизированная (например, не ухудшающаяся) стадия заболевания, отсрочка или замедление прогрессирования заболевания, облегчение или ослабление болезненного состояния и ремиссия (либо частичная, либо полная), либо детектируемая, либо не детектируемая. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, проведение лечения относится к увеличению выживаемости по сравнению с ожидаемой выживаемостью без получения лечения. В некоторых случаях лечение включает профилактику. Альтернативно, лечение является "эффективным", если прогрессирование заболевания уменьшается или прекращается. В соответствии с некоторыми вариантами осуществления, термин "лечение" также означает увеличение выживаемости по сравнению с ожидаемой выживаемостью без получения лечения. В число нуждающихся в лечении входят уже диагностированные с заболеванием или состоянием, а также те, у кого может развиться заболевание или состояние из-за
генетической предрасположенности или других факторов, которые вносят свой вклад в развитие заболевания или состояния, так, в качестве неограничивающего примера, масса, рацион и состояние здоровья субъекта являются факторами, которые могут вносить свой вклад в вероятное развитие у субъекта сахарного диабета. В число нуждающихся в лечении также входят субъекты, нуждающиеся в медицинской или хирургической помощи, обслуживании или ведении. Субъект обычно является больным или пострадавшим или имеет повышенный риск стать больным, в сравнении со среднестатистическим гражданином, и нуждается в такой помощи, обслуживании или ведении.
Без дополнительного уточнения полагают, что специалист в настоящей области техники, с помощью приведенного выше описания, может использовать настоящее изобретение в полной мере. Последующие примеры являются лишь иллюстративными и никоим образом не ограничивают остальную часть раскрытия.
Примеры
Настоящие примеры представлены лишь в иллюстративных целях и не ограничивают объем представленной в настоящем документе формулы изобретения.
Пример 1
Экстракция бесклеточной ДНК из мочи для неинвазивной диагностики Стабилизация и исходный материал
Одобрения
Настоящий проект был одобрен IRB SYSU и Сычуаньским университетом. От всех пациентов было получено им ф ор м и р о в а н н ое согласие. Опухолевые и нормальные ткани были получены после подписи пациентами информированного согласия.
3 стадии: стабилизирующий буфер для мочи - центрифугирование -замороженный супернатант
Стабилизирующий буфер для мочи
Стабилизирующий буфер для мочи был составлен для стабилизации ДНК из мочи и защиты бесклеточной ДНК. Консервант стабилизировал клетки в моче, предотвращая высвобождение геномной ДНК, что позволяло выделять высококачественную бесклеточную ДНК. Образцы, собранные в стабилизирующем буфере для мочи, были
стабильны в течение 14 дней при комнатной температуре, что обеспечивало удобный сбор, транспортировку и хранение образцов.
Состав стабилизирующего буфера для мочи:
2,2% цитрата натрия
0,8% лимонной кислоты
0,245%) декстрозы
500 мМ EGTA
1% глутаральдегида или 1% формальдегида
Центрифугирование
Образцы мочи центрифугировали на высокой скорости (например, 11000 х g) в течение 15 минут, а супернатант использовали для экстракции нуклеиновых кислот. При помощи него из образца удаляли клеточный материал и клеточные нуклеиновые кислоты.
Исходный материал
При долгосрочном хранении исходного материала супернатант хранили при температуре от -20°С до -80°С. Процедура:
1. Перенести до 40 мл мочи в коническую пробирку.
2. На каждый 1 мл мочи добавить 50 мкл стабилизирующего буфера для мочи. Тщательно перемешать смесь мочи путем переворачивания пробирки более 10 раз. После добавления и перемешивания мочи со стабилизирующим буфером для мочи мочу можно хранить до 14 дней при температуре окружающей среды.
3. Центрифугировать на 11000 х g в течение 15 минут.
4. Не нарушая осадок, осторожно перенести супернатант мочи на новую коническую пробирку.
5. Затем бесклеточную мочу (супернатант мочи) либо хранить при температуре от -20°С до -80°С в качестве исходного материала, либо обработать для экстракции ДНК.
Экстракция ДНК
4 стадии: лизис - связывание - промывка - элюирование
Лизирование образцов
Образцы мочи лизировали в жестких денатурирующих условиях при повышенных температурах в присутствии протеиназы К и буфера для лизиса ДНК, которые вместе обеспечивали инактивацию ДНКаз и полное высвобождение нуклеиновых кислот от связанных с ними белков, липидов и везикул.
Связывание ДНК
Высвобожденные нуклеиновые кислоты из мочи после лизирования избирательно связывали с колонкой с наполнителем из мембраны на основе диоксида кремния или гранулами на ее основе.
Условия связывания регулировали путем добавления буфера Bing для обеспечения оптимального связывания циркулирующих нуклеиновых кислот с мембраной на основе диоксида кремния. Затем лизаты переносили на мембрану на основе диоксида кремния, а циркулирующие нуклеиновые кислоты абсорбировали из большого объема на небольшую мембрану на основе диоксида кремния по мере прохождения через нее лизата под разреженным давлением.
Солевые и рН условия буфера для связывания обеспечивали, чтобы белки и другие примеси, которые в некоторых случаях ингибируют ПЦР и другие последующие ферментативные реакции, не сохранялись на мембране на основе диоксида кремния.
Промывка
Нуклеиновые кислоты оставались связанными с мембраной, в то время как примеси эффективно смывались за 3 стадии промывки.
Элюирование чистых нуклеиновых кислот
Высокочистые циркулирующие нуклеиновые кислоты элюировали в элюирующем буфере за одну стадию.
Выход и размер нуклеиновых кислот
Для определения выходов использовали набор Qubit ds DNA HS или количественные способы амплификации. Выход зависел от объема образца и концентрации циркулирующих нуклеиновых кислот в образце. Абсолютный выход циркулирующей ДНК и РНК, полученной из образца, значительно варьировал среди
образцов от разных индивидуумов, а также зависел от других факторов, например, пола, определенных стадий заболевания. Распределение размеров циркулирующих нуклеиновых кислот, очищенных с помощью такой процедуры, проверяли с помощью электрофореза в агарозном геле.
Пример 2
Выделение свободной циркулирующей бесклеточной ДНК из мочи
С помощью набора QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit производили выделение из 4 мл мочи, которые представляли собой супернатант, обработанный стабилизирующим буфером для мочи и центрифугированный, как описано выше. Образцы мочи были либо свежие, либо замороженные, а затем им позволяли уравновеситься с комнатной температурой.
Процедура
1. Пипеткой отобрать 500 мкл протеиназы К QIAGEN в пробирку объемом 50 мл (не поставляется в наборе).
2. Внести 4 мл мочи в пробирку объемом 50 мл.
3. Внести 4 мл буфера ACL (при необходимости с РНК-носителем) и 1,0 мл буфера ATL; закрыть крышку и перемешивать встряхиванием на вортексе в течение 30 секунд.
4. Инкубировать при 60°С в течение 30 мин.
5. Поместить пробирку обратно на лабораторный стол и отвинтить крышку.
6. Внести 9,0 мл буфера АСВ в лизат, закрыть крышку и тщательно перемешать встряхиванием на вортексе в течение 15-30 секунд.
7. Инкубировать смесь лизата - буфера АСВ в течение 5 минут на льду.
8. Вставить колонку QIAamp Mini в приемник VacConnector на устройстве QIAvac 24 Plus. Вставить 20 мл трубковый удлинитель в открытую колонку QIAamp Mini. Убедиться, что трубковый удлинитель прочно вставлен в колонку QIAamp Mini во избежание утечки образца.
9. Тщательно внести лизат со стадии 7 в трубковый удлинитель колонки QIAamp Mini. Включить вакуумный насос. После полной прокачки всех лизатов через колонки выключить вакуумный насос и опустить давление до 0 мбар. Осторожно удалить и выбросить трубковый удлинитель.
1.
10. Внести 600 мкл буфера ACW1 в колонку QIAamp Mini. Оставить крышку колонки открытой и включить вакуумный насос. После прокачки всего буфера ACW1 через колонку QIAamp Mini выключить вакуумный насос и опустить давление до 0 мбар.
11. Внести 750 мкл буфера ACW2 в колонку QIAamp Mini. Оставить крышку колонки открытой и включить вакуумный насос. После прокачки всего буфера ACW2 через колонку QIAamp Mini выключить вакуумный насос и опустить давление до 0 мбар.
12. Внести 750 мкл этанола (96-100%) в колонку QIAamp Mini. Оставить крышку колонки открытой и включить вакуумный насос. После прокачки всего этанола через колонку QIAamp Mini выключить вакуумный насос и опустить давление до 0 мбар.
13. Закрыть крышку колонки QIAamp Mini, удалить ее из вакуумного коллектора и выбросить коннектор VacConnector. Поместить колонку QIAamp Mini в чистую пробирку для сбора объемом 2 мл (сохраненную со стадии 8) и центрифугировать на полной скорости (20000 х g, 14000 об./мин.) в течение 3 минут.
14. Поместить колонку QIAamp Mini в новую пробирку для сбора объемом 2 мл, открыть крышку и инкубировать сборку при температуре 56°С в течение 10 минут до полного высушивания мембраны.
15. Поместить колонку QIAamp Mini в чистую 1,5 мл пробирку для элюирования и удалить пробирку для сбора со стадии 14. Аккуратно внести 20-150 мкл буфера AVE в центр мембраны колонки QIAamp Mini. Закрыть крышку и инкубировать при комнатной температуре в течение 3 минут.
16. Центрифугировать на полной скорости (20000 х g, 14000 об./мин.) в течение 1 минуты для элюирования нуклеиновых кислот.
Свободно циркулирующую бесклеточную ДНК элюировали в буфер AVE, готовую для использования в реакциях амплификации или для хранения при температуре от -15 до -30°С. Очищенные нуклеиновые кислоты не содержали белков, нуклеаз и других примесей. Выделенная ДНК идеально подходила для ПЦР, анализов на чипах, детекции метилирования и т. д.
Пример 3
Создание маркеров метилирования
Источники данных
Данные по метилированию ДНК получали из различных источников, в том числе от Атласа ракового генома (The Cancer Genome Atlas - TCGA). Статус метилирования 485000 сайтов получали с помощью чипа Infinium 450К Methylation Array.
Дополнительные данные получали из следующих наборов данных GSE: GSE46306, GSE50192, GSE58298 и GSE41826. Были проанализированы профили метилирования для опухолей и их соответствующей нормальной ткани (таблица 1).
Файлы с данными по метилированию получали в формате ШАТ с пропорциональными показателями каждой гранулы, которая была отсканирована. Для преобразования этих файлов данных в показатель, который называется бета-значением, использовали пакет minfi от Bioconductor.
После получения бета-значений для всех образцов были исключены все маркеры, которые не были во всех 20 наборах данных.
Нормальная печень
Злокачественная опухоль легкого
839
Нормальное легкое
Злокачественная опухоль поджелудочной железы
184
Нормальная поджелудочная железа
Феохромоцитома и параганглиома (PCPG)
179
Норма без феохромоцитомы и параганглиомы (PCPG)
Злокачественная опухоль предстательной железы
501
Нормальная предстательная железа
Злокачественная опухоль прямой кишки
Нормальная прямая кишка
Саркома
261
Норма без саркомы
Меланома кожи (SKCM)
104
Норма без меланомы кожи (SKCM)
Злокачественная опухоль желудка
393
Нормальный желудок
Злокачественная опухоль щитовидной железы
507
Нормальная щитовидная железа
Идентификация приоритетных маркеров в каждом сравнении Идентификацию специфической для типа злокачественной опухоли сигнатуры производили путем сравнения попарного различия метилирования между конкретным типом злокачественной опухоли и окружающей его нормальной тканью, различия между двумя разными типами злокачественной опухоли, а также различия между двумя различными нормальными тканями. Все 485000 сайтов метилирования CpG исследовали в обучающей группе из 1100 образцов опухолей и 231 образца соответствующих смежных нормальных тканей.
Сравнивали профиль каждой группы со всеми остальными группами. При общей сложности 20 групп злокачественных опухолей, перечисленных выше (таблица 1), всего было проведено 20 * 19/2 = 190 различных групповых сравнений. Для всех 450 тыс. маркеров проводили сравнения из одной группы с другой с использованием функции colttests() в пакете R genefilter. С помощью этого анализа было получено р-значение с t-статистикой и различием в средней доле метилирования между категориями для каждого маркера в сравнении. После этого сравнения маркеры сортировали и ранжировали по абсолютному значению t-статистики для идентификации маркеров, с помощью которых, вероятнее всего, можно было бы проводить дифференцировать на две категории. Десять наиболее приоритетных маркеров из каждого сравнения отбирали для последующего проверочного анализа. Из 190 групп сравнения было выбрано 10x190=1900 маркеров для будущего анализа. После удаления дубликатов было выбрано 958 уникальных маркеров для панели для различных форм злокачественных опухолей, которые были протестированы в группе проверочного анализа, состоящей из 4000 опухолей и 1000 нормальных тканей. Эту панель затем использовали для обследования образцов плазмы и жидкости организма от пациентов со злокачественной опухолью легких, молочной железы, печени и толстой и прямой кишок, а также от контролей без злокачественной опухоли для подтверждения их диагностических и прогностических значений. Паттерны метилирования коррелировали с профилями генной экспрессии маркеров в этой панели.
Расчет весовых значений для десяти наиболее приоритетных маркеров в каждом сравнении
Анализ главных компонент применяли к десяти наиболее приоритетным маркерам в каждой группе сравнения с использованием функции в среде для расчета статистики: prcomp(), и получали весовые значения первой главной компоненты в каждой группе, и сопоставляли эти весовые значения с десятью соответствующими маркерами в каждой группе. Было 190 группировок весовых значений с маркерами.
Создание переменных
Для каждого образца в данных было создано 190 переменных. С помощью комбинации весовое значение/маркер рассчитывали каждую переменную V с использованием следующего уравнения:
v = ^\w *М)
где W представляет собой весовое значение, а М представляет собой бета-значение метилирования от 0 до 1 для соответствующего маркера.
Создавали матрицу, размеры которой представляли собой (1) количество образцов на (2) 190 переменных.
Классификация образцов
Вышеупомянутую матрицу использовали для классификации образцов. Было несколько алгоритмов классификации, которые были использованы в данном случае, включая логистическую регрессию, по ближайшим соседям (NN) и опорно-векторные машины (SVM).
Для создания опорно-векторных машин использовали библиотеку kernlab для R. Алгоритм по Crammer, Singer имел несколько лучшие результаты, чем алгоритм по Weston, Watson. В анализе наблюдали четыре возможных типа ошибок классификации:
1. Неправильная ткань. Она имела место, если ткань толстой кишки была идентифицирована как ткань легкого.
2. Ложноотрицательный
3. Ложноположительный
4. Правильная ткань и прогноз. Неверный тип злокачественной опухоли. Например, это имело место в случае, когда светлоклеточная почечно-клеточная карцинома была идентифицирована как папиллярная почечно-клеточная карцинома.
Для подтверждения результатов были использованы три способа. Первые два были проверены с последней стадией.
1. Образцы разделяли на пять равных частей и 4 части использовали для обучения, а пятую часть использовали для тестирования результатов.
2. Использовали сценарий "исключение по одному", при котором для обучения были использованы все образцы, кроме одного. Оставшийся один использовали для тестирования. Цикл повторяли для каждого образца, пока все они не были протестированы.
3. В двухэтапном репликационном исследовании в начале процесса образцы разделяли на два набора. С помощью обучающего набора было идентифицировано 10 маркеров в каждом сравнении с наиболее высокими t-критериями. Эти маркеры затем
1.
были использованы для создания главных компонент, а затем использовали эти переменные для создания SVM. Полученные маркеры затем применяли к тестовому набору для создания главных компонент и результатов от SVM.
Для каждого из этих способов точность прогнозирования была выше 95%. Количество ошибок тканей составляло менее 1%. Специфичность составляла приблизительно 95%, а чувствительность составляла почти 99% с тестовым набором данных.
Кроме того, также применяли РСА в комбинации с ICA. Полагали, что в ICA процессы-компоненты суммировались с измеренными значениями метилирования без предварительно заданных шумовых составляющих, хотя некоторые компоненты были включены или были представлены как один или несколько типов "шума" в данных. Например, в этом случае количество переменных (например, 117 тыс. значений метилирования) было намного больше, чем количество образцов (например, 7706 образцов). Разложение с помощью 1С А, осуществленное без понижения размерности, в некоторых случаях не сходилось, поскольку для ICA необходимо достаточное количество образцов для обучения несмешивающейся матрицы из вводимых данных. Стадии дополнительно проиллюстрированы на фиг. 36 и рассмотрены ниже.
Неконтролируемое обучение - часть 1: отбор маркеров
Эта часть заключалась в отборе N наиболее информативных маркеров (например, N составляло 5000) из общего объема необработанных маркеров (117 тыс.). В результате этого получали экономичный и точный массив маркеров для забора клеток крови для последовательной категоризации образца крови. В число дополнительных модификаций входили увеличение значения N или дублирование одного и того же набора маркеров (т. е. размещение каждого из 5000 маркеров в двух разных локализациях) для увеличения отношения сигнал/шум (SNR) при заборе клеток крови.
Стадия 1: анализ независимых компонент (1СА)
С помощью ICA получали "несмешивающуюся" матрицу W, которая линейно не смешивала матрицу входных данных X (7176 х 117 тыс.) в пространственно независимой исходной матрице U, где U=WX. Строки оцениваемой исходной матрицы U (активации-компоненты) имели формы кривых 1С по каждому из маркеров. На этой стадии ICA-анализ давал 7176 компонент для последующего анализа. Полагали, что в 1С А процессы-компоненты суммировались с измеренными значениями метилирования без предварительно заданных шумовых составляющих, хотя некоторые компоненты могли фактически включать или представлять собой один или несколько типов "шума" в
данных.
Стадия 2: стандартизация путем Z-преобразования для компоненты-активации Для правильной оценки вклада каждого маркера среди 7176 1С, к компонентам-активации применяли стандартизацию путем Z-преобразования. В частности, каждая компонента-активация (одна строка из U) извлекала свое среднее значение и делила значение на стандартное отклонение с получением нулевого среднего и единичной дисперсии. С помощью этой процедуры создавали нормализованную U компоненту-активации (т. е. со взвешенными значениями маркеров) в так называемых Z-значениях. Стадия 3: ранжирование Z-оцененного маркера для каждой компоненты Эта стадия заключалась в идентификации ценности 117 тыс. маркеров для каждой из 7176 компонент. Для каждой компоненты все маркеры в соответствии с абсолютными Z-значениями ранжировали таким образом, чтобы каждый маркер был помечен меткой от 1 до 117 тыс. Маркер, обозначенный как "1", был выявлен как вносивший наибольший вклад, в то время как маркер, обозначенный как "117 тыс.", был наименее ценным. После этой стадии каждый маркер ассоциировали с 7176 значениями; каждое из них указывало на вклад в каждый из 7176 компонент.
Стадия 4: извлечение N приоритетных маркеров с наибольшим вкладом среди всех компонент
Эта стадия заключалась в извлечении N наиболее значимых маркеров из 117 тыс. Поиск начинали с коллекции маркера, помеченного как "1" по любой компоненте, затем шли маркеры, помеченные как "2" по любым компонентам, и так далее. Поиск завершали при полном сборе необходимого числа маркеров с наибольшим вкладом.
Часть 2: извлечение параметра на основе 1С А
После отбора маркеров с наибольшим вкладом (5000 из 117 тыс.) применяли разложение с помощью 1С А (описанное выше) к усеченной по маркерам матрице (7176 х 5000) для получения компонент, обозначаемых параметрами. Перед разложением с помощью ICA использовали анализ главных компонент (РСА) для уменьшения размера с 7176 до 25. Таким образом, РСА и 1С А на этой стадии создавали матрицу параметров 35 на 5000 для классификации образцов крови.
Часть 3: классификация образцов крови
После сравнения k-ближайших соседей (KNN) и опорно-векторной машины (SVM), SVM, оснащенная керн-функцией радиальной базисной функции (RBF), превосходила KNN и давала эффективность классификации 93,99% для правильного распознания одного из 7176 образцов из 30 классов (KNN=91,54%, где К=5).
В сравнении с эффективностью классификации 95,55%, полученной с использованием всех необработанных маркеров (117 тыс.), усеченная по маркерам матрица давала сопоставимую эффективность (93,99%).
Выделение ДНК/РНК и количественная ПЦР
Характеристики пациентов и тканей: в качестве контролей использовали соответствующую смежную нормальную ткань. Для этих нормальных тканей было подтверждено с помощью гистологического исследования, что они не имеют никаких признаков злокачественной опухоли.
Образцы опухоли и соответствующих удаленных участков были получены у пациентов, перенесших хирургическое удаление опухоли; образцы замораживали и хранили при -80 ? до использования. Выделение ДНК и РНК из образцов проводили с использованием набора AllPrep DNA/RNA Mini kit (Qiagen, Валенсия, Калифорния) и РНК подвергали расщеплению на колонке с ДНКазой. РНК количественно оценивали с использованием Nanodrop 2000 (Thermo Scientific), 200 нг РНК каждого образца использовали для комплементарного синтеза ДНК с использованием набора для синтеза кДНК iScript (Bio-rad, Inc) в соответствии с инструкциями производителя. Вкратце, образцы инкубировали в течение 5 минут при 25°С, 30 минут при 42°С, а затем проводили инкубацию при 85°С в течение 5 минут. qPCR проводили при помощи 40 циклов амплификации с применением геноспецифических праймеров и мастер-микса Power SYBR Green PCR Master Mix на системе для ПЦР в режиме реального времени 7500 Real Time PCR system (Applied Biosystems). Измерения проводили в трех повторностях, а результаты нормализовали к эндогенным уровням АСТВ. Относительное кратное изменение экспрессии рассчитывали с использованием способа ААСТ (пороговые значения цикла <30). Данные представлены как среднее ± среднее квадратичное отклонение на основе трех повторностей.
Обширное профилирование метилирования генома выявляло специфические сигнатуры метилирования в различных злокачественных опухолях
Для выявления специфической сигнатуры типа злокачественной опухоли производили попарное сравнение различий метилирования между конкретным типом злокачественной опухоли и окружающей его нормальной тканью, различий между двумя разными типами злокачественной опухоли, а также различий между двумя нормальными тканями. Профиль метилирования полногеномной ДНК от обучающей группы
пациентов со злокачественными опухолями двенадцати типов, в том числе двумя NSCLC подтипами злокачественной опухоли легкого (аденокарциномой и плоскоклеточной карциномой) и злокачественных опухолей толстой и прямой кишок анализировали с помощью микрочипа от lllumina для исследования метилирования 450000 CpG. При общей сложности 21 группа тканей, в том числе 12 групп опухолей и 9 групп нормальных тканей, проводили всего 21 * 20/ 2 = 210 уникальных попарных сравнений. Для 450 тыс. маркеров проводили сравнения из одной группы с другой группой с использованием функции colttests() в пакете R genefilter. Маркеры ранжировали с наименьшими р-значениями с помощью t-статистики и с наибольшим различием в средней доле метилирования между каждым сравнением и десятью наиболее приоритетными маркерами в каждой группе и отбирали для последующего проверочного анализа. После 190 сравнений были получены 958 уникальных неизбыточных маркеров в форме панели для различных форм злокачественных опухолей. Каждый маркер взвешивали путем применения анализа главных компонент к десяти наиболее приоритетным маркерам в каждой группе сравнения с использованием функции в среде для расчета статистики: prcompO, и получали весовые значения первой главной компоненты в каждой группе, и сопоставляли эти весовые значения с десятью соответствующими маркерами в каждой группе. Эти маркеры использовали для классификации образцов с помощью нескольких алгоритмов, включая нейронные сети, логистическую регрессию, ближайших соседей (NN) и опорно-векторные машины (SVM), причем все они давали согласованные результаты. Было обнаружено, что анализ с использованием SVM был наиболее надежным, и поэтому его использовали во всех последующих анализах. Из этих 958 сайтов CpG с наиболее высоким рангом строили график независимо для образцов со злокачественными опухолями и нормальных образцов.
Иерархическая кластеризация позволяла с высокой специфичностью и чувствительностью проводить различие типа злокачественной опухоли. С учетом, что выявление наличия и местоположения злокачественной опухоли, наиболее вероятно, будет обеспечивать максимальную клиническую полезность, для оценки эффективности алгоритма злокачественные опухоли, возникающие из одной и той же ткани, были объединены. В число комбинированных опухолей входили злокачественные опухоли толстой и прямой кишок, плоскоклеточная карцинома и аденокарцинома легких, карцинома клеток почечных сосочков и светлоклеточная почечно-клеточная карцинома и глиома с низкой степенью злокачественности и мультиформная глиобластома. Алгоритм был достаточно эффективен в проведении различия между злокачественными
опухолями, возникающими из одной и той же ткани, за исключением злокачественной опухоли толстой и прямой кишок, что, по-видимому, отражало схожую биологию у этих опухолей. Обучающая группа состояла из 2852 образцов злокачественной опухоли и 1278 нормальных образцов. 4087 из 4130 или 98,9% образцов были правильно идентифицированы как злокачественная опухоль или нормальные. Лишь 2 из образцов злокачественной опухоли были правильно идентифицированы в отношении злокачественной опухоли, но неправильно в отношении ткани. Общая чувствительность к злокачественной опухоли составляла 99,5% и была совместима между отдельными злокачественными опухолями, тогда как специфичность составляла 97,8%, при этом было большее варьирование между типами тканей. В частности, как предстательная железа, так и щитовидная железа имели низкие показатели специфичности, составлявшие соответственно 74,1% и 75%, что, возможно, отражало ограничения в алгоритме, низкие количества образцов, доступные для обучения, или высокую распространенность медленно растущего злокачественного новообразования в этих тканях. Способность алгоритма выявлять злокачественные опухоли проверяли на независимой группе, состоящей из 1220 образцов злокачественных опухолей и 550 нормальных образцов. Аналогичные результаты были получены и в этой группе, причем 98,7% образцов были правильно идентифицированы как злокачественная опухоль или нормальный и лишь 4 образца злокачественной опухоли были неправильно идентифицированы в отношении типа ткани. Общая чувствительность и специфичность в группе проверки составляли соответственно 98,9% и 98,4% с очень похожими характеристиками прогнозирования, как и в обучающей группе. В целом, из этих результатов видна устойчивая природа этих паттернов метилирования при выявлении наличия злокачественного новообразования, а также места ее происхождения.
Профиль метилирования злокачественной опухоли коррелировал с паттерном ее генной экспрессии
С учетом, что метилирование ДНК является существенным эпигенетическим регулятором генной экспрессии, в группе исследовали корреляцию дифференциального метилирования сайтов генов в опухолевых и нормальных тканях с генной экспрессией. В частности, интерес представляли те сайты метилирования, которые предсказывали наличие злокачественного новообразования в вышеуказанном алгоритме. Отбирали наиболее приоритетные маркеры, у которых наблюдали гиперметилирование по типу злокачественной опухоли по сравнению с таковым у их соответствующего нормального
аналога ткани, и идентифицировали их соответствующие гены в злокачественной опухоли молочной железы, печени, легких и толстой кишки. Данные последовательностей РНК от TCGA использовали в качестве группы обнаружения для вычисления дифференциальной экспрессии этих генов, а в качестве группы проверки использовали коллекцию тканей злокачественных опухолей. Почти каждый выбранный ген характеризовался заметным гиперметилированием CpG относительно нормального, и в каждом из этих генов наблюдали сниженную экспрессию, р-значение 1,21x10-21 определяли с использованием рангового критерия Уилкоксона. В некоторых случаях выбранные гены ассоциировались с канцерогенезом.
Панель для различных форм злокачественной опухоли для ранней диагностики злокачественных опухолей
После проверки 8000 маркеров метилирования и их проверки во второй группе пациентов со злокачественными опухолями, их применение для детекции ранней стадии злокачественной опухоли изучали путем обследования бесклеточной ДНК опухоли в плазме и моче.
Пример 4
Маркеры метилирования различных форм злокачественной опухоли в диагностике и прогнозировании распространенных форм злокачественной опухоли
Одобрения
Данные от Атласа ракового генома (TCGA) скачивали с веб-сайта TCGA. Настоящий проект был одобрен IRB SYSU и Сычуаньским университетом. От всех пациентов было получено информированное согласие. Опухолевые и нормальные ткани были получены после подписи пациентами информированного согласия.
Источники данных
Данные по метилированию ДНК из начального обучающего набора и первого тестового набора были получены от Атласа ракового генома (TCGA). Клинические характеристики и молекулярное профилирование, в том числе данные по метилированию для обучающей группы из 4032 образцов опухолей и соответствующих смежных нормальных тканей, а также группы проверки из 1150 образцов опухолей и соответствующих нормальных тканей от пациентов были получены от TCGA. Создавали отдельную группу проверки из 810 китайских пациентов со злокачественной опухолью
с использованием способа бисульфитного секвенирования из Западно-Китайской больницы (West China Hospital) и онкологического центра при университете Сунь Ятсена (Sun Yat-sen University Cancer Center). Клинические характеристики пациентов в группах исследования приведены в таблице 2 и на фиг. 37-40. Образцы соответствующих смежных нормальных тканей собирали одновременно с опухолью у одного и того же пациента и подтверждали гистологией, что у них отсутствовали признаки злокачественной опухоли. Статус метилирования 485000 сайтов получали с помощью чипа Infinium 450К Methylation Array. Дополнительные данные получали из следующих наборов данных GSE: GSE46306, GSE50192, GSE58298 и GSE41826. Файлы с данными по метилированию получали в формате ШАТ с пропорциональными показателями каждой гранулы, которая была отсканирована. Для преобразования этих файлов данных в показатель, который называется бета-значением, использовали пакет minfi от Bioconductor. После получения бета-значений для всех образцов были исключены все маркеры, которые не были во всех 20 наборах данных.
злокачественная
опухоль толстой/прямой
кишки метастазирует в
печень
нормальная толстая/прямая
164
214
кишки
злокачественная
597
164
793
опухоль почки
нормальная почка
205
297
злокачественная
238
356
опухоль печени
нормальная печень
140
злокачественная
838
199
1084
опухоль легкого
нормальное легкое
143
всего
4032
1150
810
5992
Создание набора маркеров для различных форм злокачественной опухоли Специфическую сигнатуру типа злокачественной опухоли выявляли путем сравнения попарного различия метилирования между конкретным типом злокачественной опухоли и ее соответствующей нормальной тканью, различия между двумя разными типами злокачественной опухоли, а также различия между двумя различными нормальными тканями, в общей сложности было 12 групп тканей, в том числе 6 групп опухолей и 6 групп нормальных тканей. Случайным образом разделяли образцы пациентов от TCGA, которые представляли 9 типов злокачественных опухолей из 6 различных тканей с соответствующей смежной нормальной тканью, в обучающую группу и группу проверки. Для этого было проведено всего 12 * 11/2 = 66 уникальных попарных сравнений. С помощью микрочипа lllumina для анализа метилирования 450000 CpG проводили сравнения 450 тыс. маркеров из одной группы с другой группой с использованием функции [column t test] colttestsQ в пакете R genefilter. Маркеры
ранжировали с наименьшими р-значениями с помощью t-статистики, и наибольшее различие в средней доле метилирования между каждым сравнением и десятью наиболее приоритетными маркерами в каждой группе отбирали для последующего проверочного анализа. После 450 сравнений были получены 432 уникальных неизбыточных маркеров в форме панели для различных форм злокачественных опухолей. Из этих 432 сайтов CpG с наиболее высоким рангом строили график независимо для образцов каждого типа злокачественной опухоли и нормальных образцов (фиг. 8).
Иерархическая кластеризация этих образцов согласно дифференциальному метилированию сайтов CpG таким образом позволяла проводить различие злокачественного происхождения ткани, а также нормальной ткани в обучающей группе TCGA (таблица 3). Общая степень правильной диагностики составляла 99,2%. Затем эти маркеры применяли к группе проверки TCGA (таблица 4) со схожей степенью правильной диагностики, составлявшей 97,9%. Результаты также были подтверждены в третьей независимой группе китайских пациентов со злокачественной опухолью (таблица 5) со степенью правильной диагностики 95,2%, причем анализ метилирования проводили с использованием альтернативного способа бисульфитного секвенирования на отличном этническом и географическом фоне от TCGA (достаточные количества случаев глиомы с низкой степенью злокачественности (LGG) и мультиформной глиобластомы (GBM) не были доступны в китайской группе).
Изучали 20 метастаз злокачественных опухолей молочной железы и 30 метастаз злокачественных опухолей толстой и прямой кишок. Иерархическая кластеризация этих метастаз в сравнении с первичной злокачественной опухолью молочной железы, первичной злокачественной опухолью толстой и прямой кишок, первичной злокачественной опухолью печени и нормальной печению проиллюстрирована на фиг. 41. Из результатов анализа виден диагноз 19/20 метастаз злокачественных опухолей молочной железы и 29/30 метастаз злокачественных опухолей толстой и прямой кишок (таблица 5). Два неправильных диагноза были идентифицированы как нормальная печень, что свидетельствовало, что причиной ошибки было загрязнение тканей.
Таблица 3. Обучающая группа TCGA
Обучающая группа
Злокачественная опухоль головного мозга
Злокачественная опухоль молочной железы
Злокачественная опухоль толстой кишки
Злокачественная опухоль почки
Злокачественная опухоль печени
Злокачественная опухоль легкого
Нормальный головной мозг
Нормальная молочная железа
Нормальная толстая кишка
Нормальная почка
Нормальная печень
Нормальное легкое
Злокачественная
опухоль головного мозга
(.4"
'()(>
2 ч
х2~
Злокачественная
опухоль молочной железы
Злокачественная опухоль толстой кишки
Злокачественная опухоль почки
Злокачественная опухоль печени
Злокачественная опухоль легкого
Нормальный головной мозг
14(.
Нормальная молочная железа
Нормальная толстая кишка
Нормальная почка
Нормальная печень
Нормальное легкое
/ .1
Всего
Всего
649
790
306
597
238
838
150
205
4032
Правильные
647
783
306
597
235
827
146
205
4000
Ложно положител ьный
Ложноотрицатель ный
Неправильная ткань
Правильные (%)
99,7
99,1
100
100
98,7
98,7
97,3
96,9
100
100
98,6
99,2
Тестовая группа 2
" о я v
% о S -а
я я
м н о
" о я v
% о
Щ 03
pa s
О hQ
о S
и и
M H
о 00 о
я я
н о
00 о я
о о
и и
н о
ч о
я я
м н о
00 §
ч о
я я
м н о
и о
S a
о н
S а о
S v
о в
S а о нЯ
S а о (L> 1-Н
а о
Злокачественная опухоль молочной железы
Злокачественная
опухоль толстой/прямой кишки
IS4
Злокачественная опухоль почки
1 ^
-И 1
Злокачественная опухоль печени
Злокачественная опухоль легкого
Нормальная молочная железа
Нормальная толстая кишка
И.4
Нормальная почка
Нормальная печень
Нормальное легкое
Всего
Всего
194
30 29
164
810
Правильные
184
164
771
Ложно по ложите льный
Ложноотрицательный
Неправильная ткань
Правильные (%)
89,0
95,0
94,8
96,7
100
93,8
91,5
91,1
100
94,7
98,6
89,1
95,2
Алгоритм отличал тканевое происхождение злокачественного новообразования и злокачественные опухоли, возникающие из одной и той же ткани. В выборе и прогнозе терапии участвовали гистологические подтипы. Поэтому дополнительно исследовали способность алгоритма проводить различия гистологического подтипа, происходящего из общей ткани, для случаев глиомы с низкой степенью злокачественности (LGG) относительно мультиформной глиобластомы (GBM) (фиг. 9А, таблица 6), аденокарциномы легкого (LUAD) относительно плоскоклеточной карциномы (LUSC) (фиг. 9В, таблица 7) и светлоклеточной почечно-клеточной карциномы (КЖС) относительно папиллярной почечно-клеточной карциномы (KIRP) (фиг. 9С, таблица 8). Теплокарты, иллюстрирующие неконтролируемую иерархическую кластеризацию гистологических подтипов, приведены на фиг. 9А-9С, а результаты классификации на основе метилирования показаны в таблицах 6-8. Эти сигнатуры метилирования позволяли правильно идентифицировать гистологический подтип у 97,6% злокачественных опухолей головного мозга, 95,5% злокачественных опухолей легкого и 98% злокачественных опухолей почки в группе TCGA. В подавляющем большинстве неправильных случаев классификации была правильно идентифицирована
злокачественная опухоль, но неправильно идентифицирован гистологический подтип; менее 1% образцов были ошибочно идентифицированы как нормальная ткань.
Нормальное легкое
Всего
Всего
469 369
912
Правильные
458 340
871
Близкие
8 22
Ложноположительный
0 0
Ложноотрицательный
3 2
Неправильная ткань
0 5
Правильные (%)
97,7 92,1
98,6
95,5
Таблица 8. Группа оп Группа опухоли почки
ухоли почки
KIRP
Нормальная почка
KIRC
314
KRIP
267
Нормальная почка
и 205
Всего
Всего
322
275
205
802
Правильные
314
267
205
786
Близкие
Ложноположительный
Ложноотрицательный
Неправильная ткань
Специфичность (%)
100
100
Чувствительность (%)
97,5
97,1
Расчет весовых значений для десяти наиболее приоритетных маркеров в каждом сравнении
Анализ главных компонент применяли к десяти наиболее приоритетным маркерам в каждой группе сравнения с использованием функции в среде для расчета статистики: prcomp(), и получали весовые значения первой главной компоненты в каждой группе, и сопоставляли эти весовые значения с десятью соответствующими
маркерами в каждой группе. Было 45 группировок весовых значений с маркерами. Эти маркеры использовали для классификации образцов с помощью нескольких алгоритмов, включая нейронные сети, логистическую регрессию, ближайших соседей (NN) и опорно-векторные машины (SVM), причем все они давали согласованные результаты. Было обнаружено, что анализ с использованием SVM был наиболее надежным, и поэтому его использовали во всех последующих анализах.
Для каждого типа опухоли образцы делили на две группы на основе полученных сигнатур метилирования, и строили кривые их выживаемости с использованием кривых Каплана-Мейера (фиг. 10А - фиг. 10В). Также анализировали подгруппы на основе стадии опухоли и наличия остаточной опухоли после лечения. Такие профили метилирования позволяли прогнозировать очень статистически значимые различия в выживаемости для всех типов опухолей и в большинстве исследованных подгрупп. Несколько конкретных результатов оказались потенциально клинически значимыми. У всех пациентов с LGG, а также у пациентов с остаточной опухолью с помощью метилирования идентифицировали подгруппу индивидуумов с особенно благоприятной выживаемостью (фиг. 10А - фиг. 10В, Р <0,001). При светлоклеточной почечно-клеточной карциноме (KIRC) с помощью анализа идентифицировали небольшую подгруппу пациентов с относительно малой выживаемостью по сравнению с группой с относительно более лучшей выживаемостью среди пациентов без остаточной опухоли после лечения (86,3% относительно 34,8%) (фиг. 10А - фиг. 10В). При KIRP с помощью алгоритма выявляли пациентов с особенно неблагоприятным прогнозом в подгруппах пациентов с остаточной опухолью после лечения или с поздней стадией заболевания (фиг. 10А - фиг. 10В). Хотя и была статистически значимой, оценка величины этого эффекта ограничена низкими количествами в этих группах. Подгруппа пациентов с LUAD без остаточной опухоли после лечения была дополнительно идентифицирована с особенно благоприятным прогнозом по сравнению с большинством пациентов (фиг. 1 OA - фиг. 10В), что свидетельствовало о низкой частоте рецидива у этих пациентов. Наконец, при LUSC паттерны метилирования давали прогноз аналогичной превосходящей выживаемости у подмножества пациентов без остаточной опухоли после лечения (фиг. 10А - фиг. 10В). Эти результаты подчеркивали возможность использования паттернов метилирования для дополнения гистологии при прогнозировании выживаемости и, в нескольких описанных выше примерах, выявления групп пациентов, которым может быть необходимо более или менее агрессивное отслеживание или лечение.
Проводили эксперименты для проверки того, добавляли ли соматические мутации только дополнительную прогностическую информацию по сигнатуре метилирования или же сигнатура метилирования коррелировала с соматическими мутациями. При трех типах злокачественных опухолей (LGG, LIHC и КЖС) было обнаружено, что прогнозирование на основе метилирования ДНК коррелировало с соматическими мутациями и что комбинация анализа метилирования и соматических мутаций давала повышенную эффективность прогнозирования 5-летней выживаемости. Распределение и относительная частота соматических мутаций показаны на фиг. 43 А -фиг. 43В. При LGG мутации либо в ШН1, либо в ШН2 были общими и взаимоисключающими, причем мутации чаще встречались в ШН1, чем в IDH2. Мутации LLH1 или ШН2 присутствовали в 92% образцов с сигнатурой метилирования, которая давала улучшенный прогноз, и только у 42% в сигнатуре метилирования был плохой прогноз (фиг. ПА). Что интересно, мутаций ШН2 вообще не наблюдали в группе с сигнатурой метилирования, которая давала плохой прогноз. Единственно, что среди соматических мутаций для типа опухоли статус ШН1/ШН2 независимо давал улучшенный прогноз в дополнение к сигнатуре метилирования (фиг. 11В). Несмотря на то, что IDH1 и положительная сигнатура метилирования давали отличный прогноз, при мутациях ШН2 прогнозировали, по-видимому, еще лучшую выживаемость. Не было обнаружено смертельных случаев среди мутантов ШН2 в наборе образцов, хотя это наблюдение было ограничено размером выборки, составлявшей 22 образца. Известно, что мутации ШН1 и ШН2 распространены при LGG, и по ним дают хороший прогноз касательно этой опухоли, при этом для LGG без мутаций ШН1/2 наблюдали клиническую картину, более схожую с GBM. IDH1 и ШН2 вовлечены в метаболические процессы в клетке; полагают, что мутации в этих генах препятствуют гидроксилированию и деметилированию сайтов mCpG. Примечательно, что сигнатура метилирования, которая давала прогноз, не была ассоциирована ни с соматическими мутациями, ни с гистологическими маркерами, в том числе с экспрессией HER2 и ER/PR.
При ЬШС общее количество соматических мутаций было ассоциировано с сигнатурой метилирования, дающей худший прогноз (фиг. ПС). Что касается KLRC, на фиг. 11D показаны неконтролируемая иерархическая кластеризация и теплокарты, ассоциированные с профилем метилирования и часто мутировавшими генами, а на фиг. 42А показано, что общее количество соматических мутаций было ассоциировано с сигнатурой метилирования, которая давала худший прогноз. Кроме того, для создания прогноза использовали комбинацию сигнатуры метилирования и соматических мутаций
одного из трех генов (ВАР1, ТР53 и РТСН1) (фиг. 42В, р <0,0001) и идентифицировали небольшую подгруппу с особенно плохой выживаемостью жизни при такой злокачественной опухоли, при которой в ином случае был благоприятный прогноз.
Профиль метилирования злокачественной опухоли коррелировал с паттерном ее генной экспрессии и ее функцией
Дополнительно изучали дифференциальное метилирование сайтов в генах опухолевой ткани в сравнении с нормальной тканью, которое коррелировало с генной экспрессией. Отбирали наиболее приоритетные маркеры со средним значением метилирования <5% в нормальной ткани и > 50% в ткани злокачественной опухоли, у которых наблюдали хорошую корреляцию уровней метилирования и генной экспрессии как в ткани злокачественной опухоли, так и в нормальной ткани. Для расчета дифференциальной экспрессии этих генов использовали данные РНК-секвенирования от TCGA (фиг. 15А). Гиперметилирование CpG наблюдали в образцах злокачественной опухоли относительно нормальных образцов, и в них имела место обратно сниженная экспрессия в соответствующем гене. Дополнительно проверяли гены, у которых были выявлены вновь обнаруженные супрессорные в отношении опухоли функции. ZSCAN18 был отобран для проверки его функциональной значимости для биологии злокачественной опухоли, aZNF502 был вовлечен в патогенез злокачественной опухоли молочной железы. ZNF502 гиперметилирован в злокачественной опухоли молочной железы с обратно сниженной генной экспрессией (р=хх, р=хх) (фиг. 15А - фиг. 15Е). Кроме того, экспрессия ZNF502 была супрессирована в злокачественной опухоли молочной железы, а также наблюдали снижение роста опухоли в культуре клеток и у "голых" мышей (фиг. 15G). Аналогичным образом, уровни метилирования в FUZ были увеличены в злокачественной опухоли печени с обратно сниженными уровнями генной экспрессии, и было показано ингибирование роста опухоли в культуре клеток и у "голых" мышей (фиг. 15F - фиг. 15J)
Создание переменных
Для каждого образца в данных было создано 45 переменных. С помощью комбинации весовое значение/маркер рассчитывали каждую переменную V с использованием следующего уравнения:
v = ^\w *М)
где W представляет собой весовое значение, а М представляет собой бета-значение метилирования от 0 до 1 для соответствующего маркера. Создавали матрицу, размеры которой представляли собой (1) количество образцов на (2) 190 переменных.
Классификация образцов
Вышеупомянутую матрицу использовали для классификации образцов. Было несколько алгоритмов классификации, которые были использованы в данном случае, включая логистическую регрессию, по ближайшим соседям (NN) и опорно-векторные машины (SVM). Во всех последующих анализах использовали анализ с помощью SVM.
Для создания опорно-векторных машин использовали библиотеку Лаборатория машинного обучения на базе ядра (Kernel-Based Machine Learning Lab - kernlab) для R. Наилучшие результаты были с ядром "RBF". Алгоритм по Crammer, Singer имел несколько лучшие результаты, чем алгоритм по Weston, Watson. В анализе наблюдали четыре возможных типа ошибок классификации:
1. Неправильная ткань; например, ткань толстой кишки была идентифицирована как ткань легкого.
2. Ложноотрицательный; например, злокачественную опухоль легких была идентифицирована как нормальное легкое
3. Ложноположительный; например, нормальная толстая кишка была идентифицирована как злокачественная опухоль толстой кишки
4. Правильная ткань, неправильный тип злокачественной опухоли; например, светлоклеточная почечно-клеточная карцинома была идентифицирована как папиллярная почечно-клеточная карцинома.
Для подтверждения результатов были использованы три способа:
1. Образцы разделяли на пять равных частей и 4 части использовали для обучения, а пятую часть использовали для тестирования результатов.
2. Использовали сценарий "исключение по одному", при котором для обучения были использованы все образцы, кроме одного. Оставшийся один использовали для тестирования. Цикл повторяли для каждого образца, пока все они не были протестированы.
3. Двухэтапное репликационное исследование: в начале процесса образцы разделяли на два набора. С помощью обучающего набора было идентифицировано 10 маркеров в каждом сравнении с наиболее высокими t-критериями. Эти маркеры затем были использованы для создания главных компонент, а затем использовали эти переменные для создания SVM. Полученные маркеры применяли к тестовому набору и получали главные компоненты и результаты от SVM.
Экстракция ДНК из опухоли
Экстракцию геномной ДНК из кусочков свежезамороженной здоровой ткани или ткани злокачественной опухоли проводили с помощью набора QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen) в соответствии с рекомендациями производителя. Для получения в среднем 5 мкг геномной ДНК использовали около 0,5 мг ткани. ДНК хранили при -20°С и анализировали в течение одной недели после получения.
Экстракция ДНК из образцов FFPE
Геномную ДНК из замороженных образцов FFPE экстрагировали с помощью набора QIAamp DNA FFPE Tissue Kit с некоторыми модификациями. ДНК хранили при -20°С для дальнейшего анализа.
Бисулъфитная конверсия геномной ДНК
1 мкг геномной ДНК конвертировали в бис-ДНК с помощью набора EZ DNA Methylation-Lightning(tm) Kit (Zymo Research) в соответствии с протоколом производителя. Полученная в результате бис-ДНК имела распределение по размерам -200-3000 и.о. с пиком около -500-1000 и.о. Эффективность бисульфитной конверсии составляла > 99,8%, по результатам проверки с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК и анализа соотношения С/Т конверсий в динуклеотидах СН (не-CG).
Определение уровней метилирования ДНК второй группы проверки с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК захваченной зондами с молекулярной инверсией (замыкающимися в кольцо при лигировании -padlock)
Маркеры CpG, уровни метилирования которых значительно различались при любом сравнении между тканью злокачественной опухоли и нормальной тканью, использовали для разработки padlock-зондов для секвенирования. Padlock-захват и
секвенирование бис-ДНК были основаны на методике, разработанной G. Church и коллегами (Porreca GJ, Nat Methods. 2007Nov;4 (11):931-6.) и К. Zhang и коллегами (Diep, D Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-2, Deng, J. et al. Nat. Biotechnol. 27, 353-360 (2009)) с модификациями.
Разработка и синтез зондов
Padlock-зонды были разработаны с использованием программного обеспечения ppDesigner (Diep, D, Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-272). Средняя длина захватываемого участка составляла 70 п. о. с маркером CpG, расположенным в центральной части захватываемого участка. Для предупреждения ошибки случайной выборки, вводимой неизвестным статусом метилирования маркеров CpG, плечи захвата были расположены исключительно в последовательности, лишенной динуклеотидов CG. Линкерная последовательность между плечами содержала последовательности связывания для амплификационных праймеров, разделенные вариабельным фрагментом из многочисленных С для получения зондов равной длины. Средняя длина зондов составляла 91 п. о. Зонды включали последовательность с уникальным молекулярным идентификатором (UMI) из 6 п. о., позволяющую идентифицировать отдельные события молекулярного захвата и осуществлять точную оценку уровней метилирования ДНК.
Зонды синтезировали в виде отдельных олигонуклеотидов с использованием стандартных коммерческих способов синтеза. Для экспериментов по захвату зонды смешивали, in-vitro фосфорилировали с помощью Т4 PNK (NEB) в соответствии с рекомендациями производителя и очищали с использованием колонок Р-30 Micro Bio-Spin (Bio-Rad).
Захват бис-ДНК
20 нг подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК смешивали в определенном молярном соотношении с padlock-зондами в 20 мкл реакционных смесей, содержащих IX буфер Ampligase (Epicenter). Оптимальное мольное отношение зондов к ДНК было экспериментально определено как равное 20000:1. Реакционные смеси покрывали 50 мкл минерального масла для предотвращения испарения. Для гибридизации зондов с ДНК после 30-секундной денатурации при 95°С проводили медленное охлаждение до 55°С со скоростью 0,02°С в секунду. Гибридизации позволяли проходить до завершения в течение 15 часов при 55°С. Для заполнения гэпов между гибридизированными плечами в каждую реакционную смесь добавляли 5 мкл следующей смеси: 2 ед. полимеразы
PfuTurboCx (предварительно активированной в течение 3 минут при 95°С (Agilent)), 0,5 ед. Ampligase (Epicentre) и 250 пмоль каждого dNTP в IX буфере для Ampligase. Спустя 5 часов инкубирования при 55°С реакционные смеси подвергали денатурации в течение
2 минут при 94°С и быстро охлаждали на льду. Вносили 5 мкл смеси экзонуклеаз (20 ед. Exo I и 100 ед. ЕхоШ, обе от Epicentre) и осуществляли разрушение одноцепочечной ДНК при 37°С в течение 2 часов с последующей инактивацией ферментов в течение 2 минут при 94°С.
Кольцевые продукты сайт-специфического захвата амплифицировали с помощью П1 IP с сопутствующим штрих-кодированием отдельных образцов. Амплификацию осуществляли с использованием праймеров, специфичных к линкерной ДНК в padlock-зондах, один из которых содержал специфичные штрих-коды из 6 п. о. Оба праймера содержали адапторные последовательности для секвенирования следующего поколения lllumina. ПЦР проводили следующим образом: IX мастер-микс Phusion Flash Master Mix,
3 мкл захваченной ДНК и 200 нМ конечного [с] праймеров, с применением следующего цикла: 10 с при 98°С, 8Х по (1 с при 98°С, 5 с при 58°С, 10 с при 72°С), 25Х по (1 с при 98°С, 15 с при 72°С), 60 с при 72°С. Реакционные смеси для 1ТЦР смешивали и полученную библиотеку подвергали отбору по размеру с включением эффективных последовательностей захвата (-230 п. о.) и исключением "пустых" последовательностей захвата (-150 п. о.) с применением гранул Agencourt AMPure ХР (Beckman Coulter). Чистоту библиотек проверяли с помощью 1ТЦР с применением праймеров к адаптерам для проточной ячейки lllumina (Р5 и Р7) и определяли концентрации с использованием аналитического набора Qubit dsDNA HS (Thermo Fisher). Библиотеки секвенировали с помощью систем MiSeq и HiSeq2500 (Alumina).
Оптимизация однородности охвата у последовательностей захвата
По результатам глубокого секвенирования в исходных первоначальных
экспериментах по захвату были видны значительные различия между количеством
считываний, полученных с помощью наиболее эффективных зондов и неэффективных
зондов (60-65% захваченных участков с охватом > 0,2 от среднего). Для его
усовершенствования рассчитывали относительные эффективности из данных
секвенирования, а зонды смешивали в скорректированных мольных соотношениях. Это
увеличивало однородность захвата до 85% участков с > 0,2 от среднего охвата.
Анализ данных секвенирования
Картирование результатов считывания при секвенировании проводили с помощью программного инструмента bisReadMapper (Diep, D, Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-272) с некоторыми модификациями. Сначала извлекали UMI из каждого результата считывания при секвенировании и связывали с заголовками в считываниях в файлах FASTQ с использованием специального скрипта, великодушно предоставленного D.D. Считывание осуществляли "на лету", результаты которого конвертировали, как если бы все С были неметилированными, и картировали на конвертированных in-silico цепях ДНК генома человека, также как если бы все С были неметилированными, с помощью Bowtie2 (Langmead В, Salzberg S. Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nature Methods. 2012, 9:357-359). Исходные результаты считывания объединяли и фильтровали по одному UMI, т. е. результаты считывания, несущие одинаковый UMI, отбрасывали, оставив один единственный. Значения частоты метилирования извлекали для всех маркеров CpG, для которых были разработаны padlock-зонды. Из анализа исключали маркеры с менее чем 20 результатами считывания в любом образце. Это в результате давало -600 маркеров CpG, для которых определяли уровень метилирования с точностью приблизительно 5% или более.
Выделение ДНК/РНК и количественная ПЦР
Образцы опухоли и соответствующих удаленных участков были получены у пациентов, перенесших хирургическое удаление опухоли; образцы замораживали и хранили при -80 ? до использования. Выделение ДНК и РНК из образцов проводили с использованием набора AllPrep DNA/RNA Mini kit (Qiagen, Валенсия, Калифорния) и РНК подвергали расщеплению на колонке с ДНКазой. РНК количественно оценивали с использованием Nanodrop 2000, 200 нг РНК каждого образца использовали для комплементарного синтеза ДНК с использованием набора для синтеза кДНК iScript (Bio-rad, Inc) в соответствии с инструкциями производителя. Вкратце, образцы инкубировали в течение 5 минут при 25 ?, 30 минут при 42?, а затем проводили инкубацию при 85°С в течение 5 минут. qPCR проводили при помощи 40 циклов амплификации с применением геноспецифических праймеров (таблица 9) и мастер-микса Power SYBR Green PCR Master Mix на системе для ПЦР в режиме реального времени 7500 Real Time PCR system (Applied Biosystems). Измерения проводили в трех повторностях, а результаты нормализовали к эндогенным уровням АСТВ. Относительное кратное изменение экспрессии рассчитывали с использованием способа ААСТ (пороговые
значения цикла <30). Данные представлены как среднее ± среднее квадратичное отклонение на основе трех повторностей.
JDP2
CACTTCCTGGAGGTGAAACTGG (SEQ Ш NO: 1804)
GAAACTCCGTGCGCTCCTTCTT (SEQ Ш NO: 1805)
KHDRBS2
GCTTGGACCAAGAGGAAACTCC (SEQ Ш NO: 1806)
CAAGTGGGCATATTTGGCTTCCC (SEQ Ш NO: 1807)
LIFR
CACCTTCCAAAATAGCGAGTATGG (SEQ Ш NO: 1808)
ATGGTTCCGACCGAGACGAGTT (SEQ Ш NO: 1809)
MAS1L
CTCTCAGAGTGATTCTCCAACGG (SEQ Ш NO: 1810)
GGTTC ТС С AC ATGC TGAGT AGAG (SEQ Ш NO: 1811)
NR3C2
AAATCACACGGCGACCTGTCGT (SEQ Ш NO: 1812)
ATGGCATCCTGAAGCCTCATCC (SEQ Ш NO: 1813)
NR5A2
GGCTTATGTGCAAAATGGCAGATC (SEQ Ш NO: 1814)
GCTCACTCCAGCAGTTCTGAAG (SEQ Ш NO: 1815)
NODI
CAACGGCATCTCCACAGAAGGA (SEQIDNO: 1816)
CCAAACTCTCTGCCACTTCATCG (SEQIDNO: 1817)
PRKCE
AGCCTCGTTCACGGTTCTATGC (SEQ Ш NO: 1818)
GCAGTGACCTTCTGCATCCAGA (SEQ Ш NO: 1819)
RAPGEF2
GTTGGATTGCCGACTGGAAGGA (SEQ Ш NO: 1820)
CTCTCAGACTCCAAGGATGTGG (SEQ Ш NO: 1821)
RGS6
GGCACCTTTTATCGTTTCCAGGC (SEQ Ш NO: 1822)
TCTGCCAGTTCCAGCCTTGCTT (SEQ Ш NO: 1823)
ST AT5A
GTTCAGTGTTGGCAGCAATGAGC (SEQ Ш NO: 1824)
AGCACAGTAGCCGTGGCATTGT (SEQ Ш NO: 1825)
SMAD7
TGTCCAGATGCTGTGCCTTCCT (SEQ Ш NO: 1826)
CTCGTCTTCTCCTCCCAGTATG (SEQ Ш NO: 1827)
TGFBR2
GTCTGTGGATGACCTGGCTAAC (SEQ Ш NO: 1828)
GACATCGGTCTGCTTGAAGGAC (SEQ Ш NO: 1829)
ZNF502-1
GATGTTAATATGCAAGGAGCT (SEQ Ш NO: 2322)
CAGTTTTCCAGACCTGAAGTGT (SEQ Ш NO: 2323)
ZNF502-2
CTTCAAATGTAGAATCTTGGT (SEQ Ш NO: 2324)
CAATTTTACAGACATCCTGCT (SEQ Ш NO: 2325)
FUZ-F1
CAGTTATTGCCTCATCGACAGCT (SEQ Ш NO: 2326)
CATCACCCTCATTGTTCTGTCAT (SEQ Ш NO: 2327)
FUZ-R1
CTCAGCGAACCCGGAGAGGGCT
GAAGCTGTCGATGAGGCATAACT
(SEQ Ш NO: 2328)
(SEQ Ш NO: 2329)
Дополнительно исследовали корреляцию дифференциального метилирования сайтов CpG в генах с генной экспрессией в ткани опухоли по сравнению с нормальной тканью в группе. Отбирали наиболее приоритетные дифференциально метилированные маркеры CpG, у которых наблюдали гиперметилирование либо в злокачественной опухоли молочной железы, либо в злокачественной опухоли печени по сравнению со статусом метилирования их соответствующей нормальной ткани. Данные РНК-секвенирования от TCGA использовали в качестве группы обнаружения для расчета дифференциальной экспрессии этих генов в сравнении с соответствующей нормальной тканью (фиг. 12 и фиг. 13А - фиг. 13С). RT-qPCR применяли для характеристики экспрессии этих генов в коллекции тканей злокачественной опухоли в качестве группы проверки (фиг. 14). Сниженную экспрессию наблюдали в каждом из этих гиперметилированных генов.
Ксенотрансплантат опухоли
Все исследования на животных проводили в соответствии с ведомственными и международными нормами обращения с животными. Протоколы для животных были одобрены Институциональным комитетом по содержанию и использованию животных онкологического центра при университете Сунь Ятсена и Западно-Китайской больницы. Бестимусных самок BALB/c "голых" мышей (4-5 недель, 18-20 г) приобретали у поставщика (лабораторный центр по разведению животных провинции Гуандун, Гуанчжоу, Китай). Опухолевые клетки суспендировали в 100 мкл бессывороточной среды и вводили подкожной инъекцией мышам. Рост опухолей отслеживали каждые 3 дня путем обследования до тех пор, пока наибольшая опухоль не достигла опухолевой нагрузки, заданной 10 мм или более. Размеры опухолей измеряли с помощью штангенциркуля, а объем опухоли рассчитывали в соответствии со следующим уравнением: объем опухоли (ммЗ) = (длина (мм) х ширина (мм)2) х 0,5. Иллюстративные данные получали от пяти мышей на экспериментальную группу. Статистический анализ осуществляли при помощи однофакторного дисперсионного анализа повторных измерений.
Пример 5
Сигнатуры на основе метилирования ДНК и диагностика и прогноз злокачественной опухоли толстой кишки и ее метастаз
Одобрения
Этот проект был одобрен LRB онкологического центра при университете Сунь Ятсена и Западно-Китайской больницы. От всех пациентов было получено информированное согласие. Опухолевые и нормальные ткани были получены после подписи пациентами информированного согласия.
Бессимптомная злокачественная опухоль
В это исследование были вовлечены пациенты с метастатической аденокарциномой неизвестного происхождения. У них наблюдали прогрессирующую потерю массы тела, усталость и слабость. Обследование включало подробную историю болезни, полное обследование, включая тазовые, ректальные, тестикулярные ткани, лабораторные тесты, в том числе СВС, CMP, UA, скрытую кровь в стуле, гистопатологию, диагностическую визуализацию эндоскопию.
Характеристики пациентов и тканей
Поскольку целью была диагностика злокачественной опухоли толстой кишки и ее метастаз, помимо сигнатур злокачественной опухоли толстой кишки было необходимо создать точные сигнатуры злокачественной опухоли для злокачественной опухоли печени и аденокарциномы легкого, поскольку печень и легкое являются наиболее частыми местами метастаз. Таким образом, были исследованы 2487 пациентов со злокачественными опухолями и нормальных пациентов (таблица 10 и фиг. 21). В качестве контроля использовали смежную нормальную ткань, полученную от тех же пациентов. Для этих нормальных тканей было подтверждено с помощью гистологического исследования, что они не имели признаков злокачественной опухоли. Характеристики пациентов подытожены на фиг. 44А - фиг. 44В.
Таблица 10. Краткое описание трех групп злокачественных опухолей
Обучающая Тестовая 1 Тестовая2 всего
злокачественная 390 124 161 675
опух оль_тол стой/прямой кишки
нормальная_толстая/пряма 45 12 164 221
я кишки
Злокачественная 0 0 33 33
опух оль_тол стой/прямой
кишки, которая метастазировала в печень
Злокачественная 0 0 34 34
опух оль_тол стой/прямой
кишки, которая метастазировала в печень
злокачественная 238 70 48 356
опухольпечени
нормальная_печень 50 17 73 140
злокачественная 311 199 47 557
опухоль_легкого
нормальное_легкое 74 23 46 143
всего 1108 445 606 2159
Создание набора маркеров злокачественной опухоли
Для выявления специфической для типа злокачественной опухоли сигнатуры производили сравнения для выявления различий метилирования между конкретным типом злокачественной опухоли и окружающей его нормальной тканью для злокачественной опухоли толстой кишки, печени и легкого. Проводили три попарных сравнительных анализа для создания сигнатур метилирования специфичных для злокачественной опухоли и ткани: 1) попарное различие метилирования между конкретным типом злокачественной опухоли и ее соответствующей нормальной тканью, 2) различие между двумя различными типами злокачественной опухоли и 3) различие между двумя различными нормальными тканями. При общей сложности 6 групп тканей, в том числе 3 группы опухолей и 3 группы нормальных тканей, проводили всего 15 уникальных попарных сравнений (6*5/2). С помощью микрочипа lllumina для анализа метилирования 470000 CpG использовали 450000 маркеров для сравнения с применением функции [column t test] colttests() в пакете R genefilter. Маркеры ранжировали как с наименьшими р-значениями, которые были определены с помощью статистических t-критериев, так и с наибольшим различием в средней доле
метилирования между каждым сравнением и десятью наиболее приоритетными маркерами в каждой группе для последующего проверочного анализа. После 15 сравнений были получены 127 уникальных неизбыточных маркеров в форме панели злокачественных опухолей.
Производили попарные сравнения различий между различными типами злокачественной опухоли, а также различий между тремя нормальными тканями. Проводили анализ профиля метилирования цельногеномной ДНК (полученного с помощью микрочипа lllumina в ходе анализа метилирования 470000 CpG) в обучающей группе из 1108 пациентов от TCGA. Были получены 786 уникальных неизбыточных маркеров в форме панели злокачественных опухолей. Иерархическую кластеризацию этих 786 сайтов CpG с наиболее высоким рангом представляли в виде графика независимо для 939 образцов злокачественной опухоли и 169 нормальных образцов (фиг. 16). Затем различные типы злокачественных опухолей (злокачественная опухоль толстой кишки, печени, легкого) сравнивали с применением 939 образцов злокачественной опухоли и 169 нормальных образцов при помощи других 311 маркеров (фиг. 17).
Иерархическая кластеризация позволяла отличать каждый тип злокачественной опухоли от остальных и от нормальной ткани. Образцы от TCGA случайным образом разделали в обучающую группу и тестовую группу, и обучающая группа состояла из 939 образцов злокачественной опухоли и 169 нормальных образцов. Иерархическую кластеризацию обучающей группы использовали для проведения различия типов злокачественной опухоли и нормальных тканей на основании паттерна метилирования (таблица ПА). 926 из 939 образцов злокачественной опухоли и 166 из 169 нормальных образцов были идентифицированы правильно, что давало общую чувствительность 98,6% и специфичность 99%. Для каждой отдельной злокачественной опухоли наблюдали неизменно высокую специфичность и чувствительность (таблица ПА). Способность алгоритма выявлять злокачественные опухоли проверяли на отдельной тестовой группе от TCGA, состоящей из 393 образцов злокачественных опухолей и 52 нормальных образцов (таблица 11В). В этой группе были получены аналогичные результаты, причем 384 образца были правильно идентифицированы как злокачественная опухоль, а 47 были правильно идентифицированы как нормальные. Общая степень правильной идентификации в этой группе проверки составляла 96,9%. Этот алгоритм затем тестировали на другой тестовой группе, состоящей из 323 образцов злокачественной опухоли и 283 нормальных образцов (таблица 11С). И в этот раз снова общая степень правильной диагностики составляла 95,9%. Третью группу образцов
тестировали с использованием платформы для секвенирования следующего поколения, таким образом уменьшая возможность ошибки случайной выборки или систематической ошибки платформы. Для 33 случаев метастазирования злокачественной опухоли толстой и прямой кишок в печень и 34 случаев метастаз ирования злокачественной опухоли толстой и прямой кишок в легкое правильно было идентифицировано соответственно 93,9% и 94,1% образцов. 4 неправильно диагностированных образца были спрогнозированы как нормальная ткань органа с метастазами, что свидетельствовало о потенциальном загрязнении ткани биоптата, что и привело к постановке ошибочного диагноза.
Ложноотрицательн ый
Неправильная ткань
Правильные (%)
99,5
98,7
97,4
100,0
98,0 97,3
98,6
Таблица НС. Китайская тестовая группа (тестовая группа 2)
Тестовая группа 2
Злокачественная опухоль толстой/прямой кишки
Злокачественная опухоль толстой/прямой кишки метастазирует в печень
Злокачественная опухоль толстой/прямой кишки метастазирует в легкое
Злокачественная опухоль печени
Злокачественная опухоль легкого
Нормальная толстая/прямая кишка
Нормальная печень
Нормальное легкое
Злокачественная
опухоль толстой/ прямой
кишки
153 31
Злокачественная опухоль печени
Злокачественная опухоль легкого
Нормальная толстая/прямая кишка
Нормальная печень
Нормальное легкое
Всего
Всего
161
164
606
Правильные
153
164
581
Ложноположительн ый
Ложноотрицательн ый
Неправильная ткань
Правильные (%)
95,0
93,9
94,1
93,8
91,5
100
98,6
89,1
95,9
Затем изучали возможность применения сигнатур метилирования для определения наличия злокачественной опухоли и ткани происхождения в метастазах. В группе китайских пациентов собирали образцы различных нормальных тканей и злокачественных очагов (таблица 10). С помощью этой сигнатуры можно было воспроизводимо идентифицировать происхождение злокачественной опухоли при метастатических поражениях в печени, легком и лимфатических узлах. Более того, была
протестирована панель злокачественных опухолей неизвестного происхождения и было установлено, что все они могли быть спрогнозированы из первичных аденокарцином толстой кишки (фиг. 18).
Расчет весовых значений для десяти наиболее приоритетных маркеров в каждом сравнении
Анализ главных компонент применяли к десяти наиболее приоритетным маркерам в каждой группе сравнения с использованием функции prcomp() в среде для расчета статистики. Получали весовые значения первой главной компоненты в каждой группе, и сопоставляли эти весовые значения с десятью соответствующими маркерами в каждой группе. Всего было 45 группировок весовых значений с маркерами. Эти маркеры использовали для классификации образцов с помощью нескольких алгоритмов, включая нейронные сети, логистическую регрессию, ближайших соседей (NN) и опорно-векторные машины (SVM), причем все они давали согласованные результаты. Было обнаружено, что анализ с использованием SVM был наиболее надежным, и поэтому его использовали во всех последующих анализах.
Поскольку паттерны метилирования могут отражать различия в лежащей в основе биологии конкретных опухолей, исследовали возможность с помощью сигнатур метилирования прогнозировать общую выживаемость в группах пациентов со злокачественными опухолями толстой и прямой кишок, легких и печени. Для каждой злокачественной опухоли сравнивали пациентов, которые были живыми или мертвыми через 5 лет, и использовали анализ главных компонент (РСА) для получения сигнатуры метилирования для прогнозирования 5-летней выживаемости. Значимо отличающаяся общая выживаемость для группы злокачественной опухоли толстой кишки и каждой подгруппы была спрогнозирована на основе определения стадии (фиг. 19А - фиг. 19Е). Прогноз по сигнатуре метилирования давал 5-летнюю OS для 81,2% в группе с хорошим прогнозом против 42% в группе с плохим прогнозом для всех пациентов. При анализе подгрупп пациентов со злокачественной опухолью толстой кишки I-II стадии (фиг. 19В) была идентифицирована группа пациентов со 100% OS против 51,3% OS через 5 лет. Эти результаты свидетельствовали о том, что профилирование метилирования этих опухолей может играть важную роль в постановке прогноза и потенциально при руководстве в выборе лечения. Распределение и относительная частота соматических мутаций показаны на фиг. 45.
Источники данных
Данные по метилированию ДНК были получены из нескольких источников, в том числе от Атласа ракового генома (TCGA), анализа 485000 сайтов, произведенного с помощью чипа Infinium для 450 тыс. анализов по метилированию, и дополнительных данных из следующих наборов данных GSE: GSE46306, GSE50192, GSE58298 и GSE41826. Были проанализированы профили метилирования для опухолей и их соответствующей нормальной ткани. Файлы с данными по метилированию получали в формате ШАТ с пропорциональными показателями каждой гранулы, которая была отсканирована. Для преобразования этих файлов данных в показатель, который называется бета-значением, использовали пакет minfi от Bioconductor. Были исключены бета-значения для всех маркеров, которые не были во всех 20 наборах данных.
Создание переменных
Для каждого образца в данных было создано 45 переменных. С помощью комбинации весовое значение/маркер рассчитывали каждую переменную V с использованием следующего уравнения:
где W представляет собой весовое значение, а М представляет собой бета-значение метилирования от 0 до 1 для соответствующего маркера. Создавали матрицу, размеры которой представляли собой (1) количество образцов на (2) 190 переменных.
Классификация образцов
Вышеупомянутую матрицу использовали для классификации образцов. Было несколько алгоритмов классификации, которые были использованы в данном случае, включая логистическую регрессию, по ближайшим соседям (NN) и опорно-векторные машины (SVM). Все они давали согласованные результаты. Тем не менее, результаты анализа с использованием SVM был намного лучшими и наиболее надежными, и поэтому их использовали во всех последующих анализах.
Для создания опорно-векторных машин использовали библиотеку Лаборатория машинного обучения на базе ядра (Kernel-Based Machine Learning Lab - kernlab) для R. Наилучшие результаты были с ядром "RBF". Алгоритм по Crammer, Singer имел
несколько лучшие результаты, чем алгоритм по Weston, Watson. В анализе наблюдали четыре возможных типа ошибок классификации:
1. Неправильная ткань; например, ткань толстой кишки была идентифицирована как ткань легкого.
2. Ложноотрицательный.
3. Ложноположительный.
4. Правильная ткань и прогноз, неправильный тип злокачественной опухоли. Использовались три способа проверки результатов:
1. Образцы делили на пять равных частей. Четыре части использовали для обучения, а пятый - для тестирования результатов.
2. Сценарий "исключение по одному", при котором все образцы были использованы для обучения за исключением одного, использовали для тестирования оставшейся группы. Цикл повторяли для каждого образца, пока все они не были протестированы.
3. Двухэтапное репликационное исследование: В начале процесса образцы разделяли на два набора. С помощью обучающего набора было отобрано 10 маркеров в каждом сравнении с наиболее высокими t-критериями. Эти маркеры затем были использованы для создания главных компонент, а полученные переменные использовали для создания SVM. Полученные маркеры затем применяли к тестовому набору и получали главные компоненты и результаты от SVM.
Для каждого из этих способов точность прогнозирования была выше 95%. Количество ошибок тканей составляло менее 1%. Специфичность составляла приближенно 95%, а чувствительность составляла почти 99% с тестовым набором данных.
Экстракция ДНК из опухоли
Начиная с приближенно 0,5 мг ткани, геномную ДНК экстрагировали с помощью набора QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen) в соответствии с протоколом производителя. Использовали образцы как опухоли, так и соответствующей нормальной и пораженной метастазами ткани и получали в среднем 5 мкг общей ДНК. ДНК хранили при -20°С и анализировали в течение одной недели после получения.
Экстракция ДНК из образцов FFPE
Геномную ДНК из образцов FFPE экстрагировали с помощью набора QIAamp DNA FFPE Tissue Kit с некоторыми модификациями. ДНК хранили при -20°С и анализировали в течение одной недели после получения.
Бисулъфитная конверсия геномной ДНК
1 мкг геномной ДНК от здоровой, опухолевой и пораженной метастазами ткани конвертировали в бис-ДНК с помощью набора EZ DNA Methylation-Lightning(tm) Kit (Zymo Research) в соответствии с протоколом производителя. Исходя из результатов анализа на программном обеспечении TapeStation (Agilent), полученная в результате бис-ДНК имела распределение по размерам -200-3000 п. о. с пиком около -500-1000 п. о. Эффективность бисульфитной конверсии составляла > 99,8%, по результатам проверки с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК и анализа соотношения С/Т конверсий в динуклеотидах СН (не-CG).
Количественная оценка метилирования CpG с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК, захваченной зондами с молекулярной инверсией (замыкающимися в кольцо при лигировании -padlock)
Маркеры CpG, уровни метилирования которых значительно различались при любом сравнении между тканью злокачественной опухоли и нормальной тканью, использовали для разработки padlock-зондов для секвенирования. Padlock-захват и секвенирование бис-ДНК были основаны на методике, разработанной G. Church и коллегами (Porreca GJ, Nat Methods. 2007Nov;4 (11):931-6.) и К. Zhang и коллегами (Diep, D Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-2; Deng, J. et al. Nat. Biotechnol. 27, 353-360 (2009)) с модификациями.
Разработка и синтез зондов
Padlock-зонды были разработаны с использованием программного обеспечения ppDesigner (Diep, D, Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-272) со средней длиной участка захвата 70 п. о. Маркеры CpG были расположены в центральной части захватываемого участка. Плечи захвата были расположены исключительно в участках, где отсутствовали динуклеотиды CG, для предупреждения непреднамеренной ошибки выборки, вводимой неизвестными статусами метилирования посторонних маркеров CpG. Плечи захвата были соединены линкерной последовательностью, которая содержала последовательности связывания для амплификационных праймеров. Вариабельный
фрагмент повторяющихся С был вставлен между праймерными сайтами для получения зондов, которые составляли в длину в среднем 91 п. о. Зонды включали последовательность с уникальным молекулярным идентификатором (UMI) из 6 п. о., позволяющую идентифицировать отдельные события молекулярного захвата и осуществлять точную оценку уровней метилирования ДНК.
Зонды синтезировали в виде отдельных олигонуклеотидов с использованием стандартных коммерческих способов синтеза. Для экспериментов по захвату зонды смешивали, in-vitro фосфорилировали с помощью Т4 PNK (NEB) в соответствии с рекомендациями производителя и очищали с использованием колонок Р-30 Micro Bio-Spin (Bio-Rad).
Захват бис-ДНК
20 нг подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК смешивали в определенном молярном соотношении с padlock-зондами (1:20000, что было определено экспериментально) в 20 мкл реакционных смесей, содержащих IX буфер Ampligase (Epicenter). Для предотвращения испарения реакционные смеси покрывали 50 мкл минерального масла (Sigma). ДНК денатурировали в течение 30 секунд при 95°С с последующим медленным охлаждением до 55°С со скоростью 0,02°С в секунду, чтобы позволить зондам гибридизироваться с ДНК. Гибридизации позволяли проходить до завершения в течение 15 часов при 55°С. Для полимеризации участка захвата в каждую реакционную смесь добавляли 5 мкл следующей смеси: 2 ед. полимеразы PfuTurboCx (предварительно активированной в течение 3 минут при 95°С (Agilent)), 0,5 ед. Ampligase (Epicentre) и 250 пмоль каждого dNTP в IX буфере для Ampligase. Спустя 5 часов инкубирования при 55°С реакционные смеси подвергали денатурации в течение 2 минут при 94°С и быстро охлаждали на льду. Вносили 5 мкл смеси экзонуклеаз (20 ед. Exo I и 100 ед. ЕхоШ, обе от Epicentre) и осуществляли разрушение одноцепочечной ДНК при 37°С в течение 2 часов с последующей инактивацией ферментов в течение 2 минут при 94°С.
Кольцевые продукты сайт-специфического захвата амплифицировали с помощью ПНР с сопутствующим штрих-кодированием отдельных образцов. Амплификацию проводили с использованием праймеров, специфичных к линкерной ДНК в padlock-зондах, одна из которых была общим сайтом для амплификационных праймеров на всех зондах, а все остальные содержали уникальные штрихкоды из 6 п. о. Оба праймера содержали адапторные последовательности для секвенирования следующего поколения
lllumina. ПЦР проводили следующим образом: IX мастер-микс Phusion Flash Master Mix, 3 мкл захваченной ДНК и 200 нМ конечного [с] праймеров, с применением следующего цикла: 10 секунд при 98 С, 8Х по (1 секунду при 98 С, 5 секунд при 58 С, 10 секунд при 72 С), 25Х по (1 секунду при 98 С, 15 секунд при 72 С), 60 секунд при 72 С. Смешивали по 5 мкл от каждой реакционной смеси для ПЦР и полученную библиотеку подвергали отбору по размеру с включением эффективных последовательностей захвата (-230 п. о.) и исключением "пустых" последовательностей захвата (-150 п. о.) с применением гранул Agencourt AMPure ХР (Beckman Coulter). Чистоту библиотек проверяли с помощью ПЦР с применением праймеров к адаптерам для проточной ячейки lllumina (Р5 и Р7) и определяли концентрации с использованием аналитического набора Qubit dsDNA HS (Thermo Fisher). Библиотеки секвенировали с помощью систем MiSeq и HiSeq2500 (Alumina).
Оптимизация однородности охвата у последовательностей захвата По результатам глубокого секвенирования в исходных первоначальных экспериментах по захвату были видны значительные различия между количеством считываний, полученных с помощью наиболее эффективных зондов и неэффективных зондов (60-65% захваченных участков с охватом > 0,2 от среднего). Для его усовершенствования рассчитывали относительные эффективности из данных секвенирования, а зонды смешивали в скорректированных мольных соотношениях. Это увеличивало однородность захвата до 85% участков с > 0,2 от среднего охвата.
Анализ данных секвенирования
Результаты считывания при секвенировании картировали с помощью программного инструмента bisReadMapper (Diep, D, Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270272) с некоторыми модификациями. Сначала извлекали UMI из каждого результата считывания при секвенировании и связывали с заголовками в считываниях в файлах FASTQ с использованием специального скрипта, великодушно предоставленного D.D. Считывание осуществляли "на лету", результаты которого конвертировали, как если бы все С были неметилированными, и картировали на конвертированных in-silico цепях ДНК генома человека, также как если бы все С были неметилированными, с помощью Bowtie2 (Langmead В, Salzberg S. Fast gapped-read alignment with Bowtie 2. Nature Methods. 2012, 9:357-359). Исходные результаты считывания объединяли и фильтровали по одному UMI, т. е. результаты считывания, несущие одинаковый UMI, отбрасывали
для исключения дублирующих результатов считывания. Значения частоты метилирования извлекали для всех маркеров CpG, для которых были разработаны padlock-зонды. Из анализа исключали маркеры с менее чем 20 результатами считывания в любом образце. Это в результате давало -600 маркеров CpG, для которых определяли уровень метилирования с точностью приблизительно 5% или более.
Выделение ДНК/РНК и количественная ПЦР
С учетом, что метилирование ДНК является существенным эпигенетическим регулятором генной экспрессии, в нашей группе исследовали корреляцию
Образцы опухоли и соответствующих удаленных участков были получены у пациентов, перенесших хирургическое удаление опухоли; образцы замораживали и хранили при -80 ? до использования. Выделение ДНК и РНК из образцов проводили с использованием набора AllPrep DNA/RNA Mini kit (Qiagen, Валенсия, Калифорния) в соответствии с рекомендациями производителя и РНК подвергали расщеплению на колонке с ДНКазой. РНК количественно оценивали с помощью Nanodrop 2000 (Thermo Scientific). 200 нг РНК из каждого образца использовали для синтеза кДНК с помощью набора для синтеза кДНК iScript (Bio-rad, Inc) в соответствии с инструкциями производителя. qPCR проводили с помощью стандартного протокола амплификации за 40 циклов с применением геноспецифических праймеров (таблицы 9 и 12) и мастер-микса Power SYBR Green PCR Master Mix на системе для ПЦР в режиме реального времени 7500 Real Time PCR system (Applied Biosystems). Эксперименты проводили в трех повторностях, а результаты нормализовали к эндогенным уровням АСТВ. Относительное кратное изменение экспрессии рассчитывали с использованием способа ААСТ (пороговые значения цикла <30). Данные представлены как среднее ± среднее квадратичное отклонение на основе трех повторностей.
дифференциального метилирования сайтов генов в опухолевых и нормальных тканях с генной экспрессией. В частности, интерес представляли те сайты метилирования, которые предсказывали наличие злокачественного новообразования в вышеуказанном алгоритме. Отбирали наиболее приоритетные маркеры, у которых наблюдали гиперметилирование по типу злокачественной опухоли по сравнению с таковым у их соответствующего нормального аналога ткани, и идентифицировали их соответствующие гены в злокачественной опухоли толстой кишки. Данные РНК-секвенирования от TCGA использовали в качестве группы обнаружения для вычисления дифференциальной экспрессии этих генов и из коллекции тканей злокачественной опухоли в качестве группы проверки (см. фиг. 20А - фиг. 20F и фиг. 22). Большинство выбранных генов характеризовались заметным гиперметилированием CpG относительно нормального, и в каждом из этих генов наблюдали сниженную экспрессию, р-значение 1,21х10"21 определяли с использованием рангового критерия Уилкоксона. Важно отметить, что выбранные гены известны как важные в канцерогенезе, что предусматривает возможность осуществления биологической проверки этих маркеров как предикторов злокачественного новообразования. Неудивительно, что в число этих выбранных генов, причем все они супрессированы, входили известные опухолевые супрессоры, так и некоторые только что обнаруженные гены. PCDH17 был выбран для тестирования его функциональной значимости для биологии злокачественной опухоли. PCDH17 (cg02994463) является гиперметилированным в злокачественной опухоли толстой кишки с обратно сниженной генной экспрессией. С помощью анализа образования колоний в культуре клеток и анализа образования опухоли у "голых" мышей было показано, что повышенная экспрессия PCDH17 супрессирует рост злокачественной опухоли в культуре клеток и in vivo (фиг. 23 А - фиг. 23Е).
Клеточная линия
Линия злокачественной опухоли толстой и прямой кишок человека DLD-1 была получена от АТСС. Эту клеточную линию трансфицировали для стабильной экспрессии GFP или необходимой гибридной конструкции GFP и сортировали на FACS для очистки. Клетки поддерживали в DMEM, дополненной 10% FBS, 1% пенициллина-стрептомицина и 1% незаменимых аминокислот.
Способы оценки клоногенности.
Клетки, выращенные в описанных выше условиях культивирования, обрабатывали трипсином и подсчитывали с помощью автоматического счетчика клеток. 500 клеток высевали в каждую лунку 6-луночного планшета и позволяли сформироваться колониям. Спустя 7-10 дней клетки фиксировали в 10 об. % уксусной кислоты/метанола и окрашивали посредством 0,1% кристаллического фиолетового. Количество колоний определяли путем ручного подсчета из лунок в трех повторностях.
Анализ на мягком агаре
1% очищенный агар (Gifco) разводили до 0,5% в 2Х культуральной среде, соответствующей каждой клеточной линии, с 20% FBS, 2% пенициллина -стрептомицина и 2% незаменимых аминокислот при 42°С. 1,5 мл 0,5% смеси агара и культуральной среды помещали в каждую лунку 6-луночной чашки и давали ей остыть до комнатной температуры в течение 45 минут. Клетки, выращенные в описанных выше условиях культивирования, обрабатывали трипсином и подсчитывали с помощью автоматического счетчика клеток и разводили в 2Х культуральной среде до 4000 клеток/мл. 0,6% мягкого агара смешивали с равным объемом разведенных клеток при 42°С до конечной концентрации 0,3%. 1,5 мл высевали в каждую лунку на поверхность нижнего слоя агара и позволяли остывать до комнатной температуры в течение 45 минут. Планшеты выращивали при 37°С и добавляли 100 мкл среды дважды в неделю. Спустя 3 недели колонии фиксировали посредством 10 об. % уксусной кислоты/метанола и окрашивали посредством 0,005% кристаллического фиолетового. Количество колоний определяли путем ручного подсчета из лунок в трех повторностях для каждой клеточной линии-конструкции.
Ксенотрансплантат опухоли
Все исследования на животных проводили в соответствии с ведомственными и международными нормами обращения с животными. Протоколы для животных были одобрены Институциональным комитетом по содержанию и использованию животных при университете Сунь Ятсена и Западно-Китайской больницы. Бестимусных самок BALB/c "голых" мышей (4-5 недель, 18-20 г) приобретали у поставщика (лабораторный центр по разведению животных провинции Гуандун, Гуанчжоу, Китай). Опухолевые клетки суспендировали в 100 мкл бессывороточной среды и вводили подкожной инъекцией мышам. Рост опухолей отслеживали каждые 3 дня посредством обследования. Размеры опухолей измеряли с помощью штангенциркуля, а объем
опухоли рассчитывали в соответствии со следующим уравнением: объем опухоли (мм3) = (длина (мм) х ширина (мм)2) х 0,5. Спустя 3-4 недели всех животных умерщвляли и собирали ксенотрансплантаты. Иллюстративные данные получали от пяти мышей на экспериментальную группу. Статистический анализ осуществляли при помощи однофакторного дисперсионного анализа повторных измерений.
Пример 6
Маркеры метилирования ДНК в диагностике и прогнозировании распространенных типов лейкоза
Одобрения
Данные от Атласа ракового генома (TCGA) скачивали с веб-сайта TCGA. Этот проект был одобрен IRB Центра женщин и детей Гуанчжоу, Западно-Китайской больницы. От всех пациентов было получено информированное согласие. Опухолевые и нормальные ткани были получены после подписи пациентами информированного согласия.
Характеристика пациентов
Клинические характеристики и молекулярное профилирование, в том числе данные по метилированию для группы исследования, включавшей 232 образца AML 161 ALL и 647 образцов нормальной крови. Клинические характеристики пациентов в группах исследования приведены в таблице 13.
Таблица 13. Клинические характеристики пациентов в группах исследования.
<
Характеристика Всего (п)
194
161
356
Пол
Женщины, кол-во (%) Мужчины, кол-во (%)
104
106
Возраст при постановке диагноза - лет Среднее
5.4
6.8
Диапазон Белая раса-кол-во/всего кол-во (%)
Белые
Азиаты
Остальные Количество лейкоцитов при диагностике
Среднее
Медианное Подтип FAB ~ кол-во (%) AML с минимальным созреванием: МО AML без созревания: Ml AML с созреванием: М2 Острый промиелоцитарный лейкоз: МЗ
Острый миеломоноцитарный лейкоз: М4
Острый монобластный или
моноцитарный лейкоз
Острый эритроидный лейкоз: Мб
Острый мегакариобластный
лейкоз: М
Другой подтип Группа цитогенетического риска-кол-во (%)
Благоприятный
Промежуточный
Неблагоприятный
Данные отсутствуют Иммунофенотип - кол-во (%)
CD33+
18-88 1-13 1-13
176 О
2 161 16 О
37,94±30,7
8,7+11,78
2 17
19 О
42 1
43 7
19 10
41 4
22 8
3 1
3 2
82 41 19
2 10 4
36 49
ПО 72
43 22
3 18
153 13 24
CD34+ 119 63 16
TDT 9 30 4
Источники данных
Данные по метилированию ДНК из начального обучающего набора и первого тестового набора были получены от Атласа ракового генома (TCGA). Статус метилирования 470000 сайтов получали с помощью чипа Infinium 450К Methylation Array. Данные по метилированию ДНК второй группы китайских пациентов со злокачественной опухолью получали с использованием способа бисульфитного секвенирования.
Расчет весовых значений для десяти наиболее приоритетных маркеров в каждом сравнении
Анализ главных компонент применяли к десяти наиболее приоритетным маркерам в каждой группе сравнения с использованием функции в среде для расчета статистики: prcomp(), и получали весовые значения первой главной компоненты в каждой группе, и сопоставляли эти весовые значения с десятью соответствующими маркерами в каждой группе. Было 45 группировок весовых значений с маркерами. Эти маркеры использовали для классификации образцов с помощью нескольких алгоритмов, включая нейронные сети, логистическую регрессию, ближайших соседей (NN) и опорно-векторные машины (SVM), причем все они давали согласованные результаты. Было обнаружено, что анализ с использованием SVM был наиболее надежным, и поэтому его использовали во всех последующих анализах.
Классификация образцов
Вышеупомянутый способ машинного обучения использовали для классификации ALL, AML и образцов нормальной крови. Было несколько алгоритмов классификации, которые были использованы в данном случае, включая логистическую регрессию, по ближайшим соседям (NN) и опорно-векторные машины (SVM). Все они давали согласованные результаты. Во всех последующих анализах дополнительно использовали анализ с помощью SVM.
Для создания опорно-векторных машин использовали библиотеку Лаборатория машинного обучения на базе ядра (Kernel-Based Machine Learning Lab - kernlab) для R. Наилучшие результаты были с ядром "RBF". Алгоритм по Crammer, Singer имел
несколько лучшие результаты, чем алгоритм по Weston, Watson. В анализе наблюдали четыре возможных типа ошибок классификации:
1. Неправильная ткань;
2. Ложноотрицательный; например, ALL был идентифицирован как нормальная кровь
3. Ложноположительный; например, нормальная кровь была идентифицирована как ALL или AML
4. Правильная ткань, неправильный тип лейкоза; например, ALL идентифицирован как AML.
Экстракция ДНК из опухоли
Экстракцию геномной ДНК из кусочков свежезамороженной здоровой ткани или ткани злокачественной опухоли проводили с помощью набора QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen) в соответствии с рекомендациями производителя. Для получения в среднем 5 мкг геномной ДНК использовали около 0,5 мг ткани. ДНК хранили при -20°С и анализировали в течение одной недели после получения.
Бисулъфитная конверсия геномной ДНК
1 мкг геномной ДНК конвертировали в бис-ДНК с помощью набора EZ DNA Methylation-Lightning(tm) Kit (Zymo Research) в соответствии с протоколом производителя. Полученная в результате бис-ДНК имела распределение по размерам -200-3000 и.о. с пиком около -500-1000 и.о. Эффективность бисульфитной конверсии составляла > 99,8%, по результатам проверки с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК и анализа соотношения С/Т конверсий в динуклеотидах СН (не-CG).
Определение уровней метилирования ДНК второй группы проверки с помощью глубокого секвенирования бис-ДНК захваченной зондами с молекулярной инверсией (замыкающимися в кольцо при лигировании -padlock)
Маркеры CpG, уровни метилирования которых различались при любом сравнении между тканью злокачественной опухоли и нормальной тканью, использовали для разработки padlock-зондов для секвенирования. Padlock-захват и секвенирование бис-ДНК были основаны на методике, разработанной G. Church и коллегами (Porreca GJ, Nat Methods. 2007 Nov;4 (11):931-6.) и К. Zhang и коллегами (Diep, D Nat Methods. 2012 Feb 5;9(3):270-2, Deng, J. et al. Nat. Biotechnol. 27, 353-360 (2009)) с модификациями.
Разработка и синтез зондов
Padlock-зонды были разработаны с использованием программного обеспечения ppDesigner. Средняя длина захватываемого участка составляла 70 п. о. с маркером CpG, расположенным в центральной части захватываемого участка. Для предупреждения ошибки случайной выборки, вводимой неизвестным статусом метилирования маркеров CpG, плечи захвата были расположены исключительно в последовательности, лишенной динуклеотидов CG. Линкерная последовательность между плечами содержала последовательности связывания для амплификационных праймеров, разделенные вариабельным фрагментом из многочисленных С для получения зондов равной длины. Средняя длина зондов составляла 91 п. о. Зонды включали последовательность с уникальным молекулярным идентификатором (UMI) из 6 п. о., позволяющую идентифицировать отдельные события молекулярного захвата и осуществлять точную оценку уровней метилирования ДНК.
Зонды синтезировали в виде отдельных олигонуклеотидов с использованием стандартных коммерческих способов синтеза. Для экспериментов по захвату зонды смешивали, in-vitro фосфорилировали с помощью Т4 PNK (NEB) в соответствии с рекомендациями производителя и очищали с использованием колонок Р-30 Micro Bio-Spin (Bio-Rad).
Захват бис-ДНК
20 нг подвергнутой бисульфитной конверсии ДНК смешивали в определенном молярном соотношении с padlock-зондами в 20 мкл реакционных смесей, содержащих IX буфер Ampligase (Epicenter). Оптимальное мольное отношение зондов к ДНК было экспериментально определено как равное 20000:1. Реакционные смеси покрывали 50 мкл минерального масла для предотвращения испарения. Для гибридизации зондов с ДНК после 30-секундной денатурации при 95 С проводили медленное охлаждение до 55 С со скоростью 0,02°С в секунду. Гибридизации позволяли проходить до завершения в течение 15 часов при 55°С. Для заполнения гэпов между гибридизированными плечами в каждую реакционную смесь добавляли 5 мкл следующей смеси: 2 ед. полимеразы PfuTurboCx (предварительно активированной в течение 3 минут при 95°С (Agilent)), 0,5 ед. Ampligase (Epicentre) и 250 пмоль каждого dNTP в IX буфере для Ampligase. Спустя 5 часов инкубирования при 55°С реакционные смеси подвергали денатурации в течение 2 минут при 94°С и быстро охлаждали на льду. Вносили 5 мкл смеси экзонуклеаз (20 ед. Exo I и 100 ед. ЕхоШ, обе от Epicentre) и осуществляли разрушение одноцепочечной ДНК
при 37°С в течение 2 часов с последующей инактивацией ферментов в течение 2 минут при 94°С.
Кольцевые продукты сайт-специфического захвата амплифицировали с помощью П1 IP с сопутствующим штрих-кодированием отдельных образцов. Амплификацию осуществляли с использованием праймеров, специфичных к линкерной ДНК в padlock-зондах, один из которых содержал специфичные штрих-коды из 6 п. о. Оба праймера содержали адапторные последовательности для секвенирования следующего поколения lllumina. ПЦР проводили следующим образом: IX мастер-микс Phusion Flash Master Mix, 3 мкл захваченной ДНК и 200 нМ конечного [с] праймеров, с применением следующего цикла: 10 секунд при 98 С, 8Х по (1 секунду при 98 С, 5 секунд при 58 С, 10 секунд при 72 С), 25Х по (1 секунду при 98 С, 15 секунд при 72 С), 60 секунд при 72 С. Реакционные смеси для ПЦР смешивали и полученную библиотеку подвергали отбору по размеру с включением эффективных последовательностей захвата (-230 п. о.) и исключением "пустых" последовательностей захвата (-150 п. о.) с применением гранул Agencourt AMPure ХР (Beckman Coulter). Чистоту библиотек проверяли с помощью ПЦР с применением праймеров к адаптерам для проточной ячейки lllumina (Р5 и Р7) и определяли концентрации с использованием аналитического набора Qubit dsDNA HS (Thermo Fisher). Библиотеки секвенировали с помощью систем MiSeq и HiSeq2500 (Alumina).
Оптимизация однородности охвата у последовательностей захвата
По результатам глубокого секвенирования в исходных первоначальных
экспериментах по захвату были видны значительные различия между количеством
считываний, полученных с помощью наиболее эффективных зондов и неэффективных
зондов (60-65% захваченных участков с охватом > 0,2 от среднего). Для его
усовершенствования рассчитывали относительные эффективности из данных
секвенирования, а зонды смешивали в скорректированных мольных соотношениях. Это
увеличивало однородность захвата до 85% участков с > 0,2 от среднего охвата.
Анализ данных секвенирования
Картирование результатов считывания при секвенировании проводили с помощью программного инструмента с некоторыми модификациями. Сначала извлекали UMI из каждого результата считывания при секвенировании и связывали с заголовками в считываниях в файлах FASTQ с использованием специального скрипта, великодушно
предоставленного D.D. Считывание осуществляли "на лету", результаты которого конвертировали, как если бы все С были неметилированными, и картировали на конвертированных in-silico цепях ДНК генома человека, также как если бы все С были неметилированными, с помощью Bowtie2. Исходные результаты считывания объединяли и фильтровали по одному UMI, т. е. результаты считывания, несущие одинаковый UMI, отбрасывали, оставив один единственный. Значения частоты метилирования извлекали для всех маркеров CpG, для которых были разработаны padlock-зонды. Из анализа исключали маркеры с менее чем 20 результатами считывания в любом образце. Это в результате давало -600 маркеров CpG, для которых определяли уровень метилирования с точностью 5% или более.
Обширное профилирование метилирования генома выявляло специфические сигнатуры метилирования при лейкозе
Для выявления специфичной к типу лейкоза сигнатуры, проводили попарное сравнение полногеномных различий в метилировании между образцами ALL или AML относительно образцов нормальной крови. Маркеры CpG с наибольшими различиями в метилировании ранжировали. Из этих 50 сайтов CpG с наиболее высоким рангом строили график независимо для образцов AML относительно образцов нормальной крови (фиг. 24). AML была дифференцирована от образцов нормальной крови (фиг. 24, таблица 14А). Результаты дополнительно воспроизводили на группе китайских пациентов с AML (фиг. 25 и таблица 14С). Аналогично, образцы ALL были дифференцированы от образцов нормальной крови (фиг. 26, таблица 14В). В совокупности из этих данных видно, что по дифференциальному метилированию сайтов CpG можно было со специфичностью и чувствительностью отличать конкретный тип лейкоза от нормальной крови (таблица 14). Общая чувствительность составляла приблизительно 98%, а специфичность составляла приблизительно 97%. В целом, из этих результатов видна устойчивая природа этих паттернов метилирования при выявлении наличия конкретного типа лейкоза.
Таблица 14А. Обучающая группа TCGA
Тестовая группа 2
ALL
AML
Нормальная кровь
ALL AML
15Х 2 (.)
1 36 0
2 о о
ALL/AML
Нормальная кровь Всего
161
356 356
Всего 555
Правильные
158
356
550
Ложноположительный
Ложноотрицательный
Неправильная ткань
Специфичность (%)
100
Чувствительность (%)
98,1
94,8
100
97,5
Профили метилирования позволяют различать различные формы лейкоза Способ позволял проводить различие между образцами с конкретным типом лейкоза и нормальной кровью, поэтому исследовали способность алгоритма производить различие различных типов лейкозных злокачественных опухолей (ALL и AML), происходящие из костного мозга, в отношении ALL и AML (таблица 14С). Каждый подтип опухоли был отличен от остальных с более 90% чувствительностью и специфичностью (фиг. 27). Из этих совместных результатов видна эффективность применения паттернов метилирования для точной диагностики гистологического подтипа злокачественной опухоли.
Профили метилирования позволяют прогнозировать достоверность прогноза и степень выживаемости
Каждый подтип лейкоза (AML и ALL) анализировали с использованием анализа главных компонент (РСА) для идентификации сигнатуры метилирования, с помощью которой прогнозировали выживаемость (в частности, живые относительно мертвых через 5 лет после постановки диагноза). Для каждого типа лейкоза образцы делили на две группы на основе полученных сигнатур метилирования, и строили кривые их
выживаемости с использованием кривой Каплана-Мейера (фиг. 28А - фиг. 28В). Такие профили метилирования позволяли прогнозировать очень значимые различия в выживаемости при ALL и AML.
Пример 7
Анализ образцов ткани и бесклеточной ДНК с помощью цифровой капельной ПЦР
Обработка образцов бесклеточной ДНК
Образцы плазмы центрифугировали на 1500 g в течение 5 минут при температуре 4°С для удаления клеточного дебриса. После центрифугирования бесклеточную ДНК лимфоцитов (cfDNA) экстрагировали из супернатанта с помощью набора QIAamp Blood DNA Mini Kit (Qiagent) в соответствии с протоколом производителя.
Геномную ДНК преобразовывали в бис-ДНК с помощью набора EZ DNA Methylation-Lightning(tm) Kit (Zymo Research) в соответствии с протоколом производителя. Бис-ДНК дополнительно количественно оценивали с помощью набора для анализа одноцепочечной ДНК Qubit(tm).
Обработка образцов геномной ДНК из опухолевых тканей
Экстракцию геномной ДНК из кусочков свежезамороженной здоровой ткани или ткани злокачественной опухоли проводили с помощью набора QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen) в соответствии с рекомендациями производителя. Для получения в среднем 5 мкг геномной ДНК использовали около 0,5 мг ткани. ДНК хранили при -20°С и анализировали в течение одной недели после получения.
1 мкг геномной ДНК конвертировали в бис-ДНК с помощью набора EZ DNA Methylation-Lightning(tm) Kit (Zymo Research) в соответствии с протоколом производителя. Полученная в результате бис-ДНК имела распределение по размерам -200-3000 и.о. с пиком около -500-1000 и.о.
Капельная цифровая ПЦР (ddPCR)
Капельную цифровую ПЦР (ddPCR) осуществляли с использованием системы для капельной цифровой ПЦР QX200(tm) в соответствии с рекомендациями производителя (Bio-Rad). ddPCR проводили согласно рекомендованному Bio-Rad двухступенчатому протоколу термоциклирования. Последовательности праймеров и зондов проиллюстрированы в таблицах 17-18. От приблизительно 1 нг до приблизительно 20 нг
образца бис-ДНК использовали для каждой реакции с приблизительно 0,4-0,8 мкМ прямого и обратного праймеров и с приблизительно 0,2 мкМ каждого зонда. Анализ данных проводили с использованием QuantaSoft (Bio-Rad).
Результаты профилирования метилирования позволяют дифференцировать типы злокачественной опухоли и подтипы злокачественной опухоли
Степени метилирования иллюстративных сайтов CpG (cg06747543, cgl5536663, cg22129276 и cg07418387) в образце как ткани злокачественной опухоли толстой кишки, так и ткани нормальной толстой кишки (Farsite) проиллюстрированы на фиг. 29. Каждый столбец представляет среднее из 24 образцов. Эти четыре сайта CpG наряду с сайтом CpG cgl4519356 дополнительно анализировали в образцах ткани злокачественной опухоли толстой кишки, которая метастазировала в легкое. На фиг. 30 проиллюстрированы степени метилирования этих пяти сайтов CpG в образце ткани метастатической злокачественной опухоли толстой кишки, эталонном образце первичной злокачественной опухоли толстой кишки и эталонном образце геномной ДНК нормальных лимфоцитов. Степени метилирования cgl5536663 и cgl4519356 были схожими при сравнении образцов метастатической злокачественной опухоли толстой кишки с эталонными образцами их соответствующей первичной злокачественной опухоли толстой кишки. Тем не менее, степени метилирования cg06747543, cg22129276 и cg07418387 отличались при сравнении образцов метастатической злокачественной опухоли толстой кишки с эталонными образцами их соответствующей первичной злокачественной опухоли толстой кишки. Аналогичным образом, степени метилирования этих пяти сайтов CpG также отличались при сравнении образцов метастатической злокачественной опухоли толстой кишки с эталонными образцами геномной ДНК их соответствующих нормальных лимфоцитов. Степени метилирования пяти сайтов CpG свидетельствовали о различном паттерне метилирования для метастатической злокачественной опухоли толстой кишки, первичной злокачественной опухоли толстой кишки и образца нормальных лимфоцитов.
Сигнатуры метилирования из образцов бесклеточной ДНК (cfDNA), полученных из злокачественной опухоли толстой кишки, проиллюстрированы на фиг. 31А - фиг. 31С. На фиг. 31А показаны метилированные участки геномной cfDNA, а на фиг. 31В проиллюстрированы неметилированные участки геномной cfDNA. На фиг. 31С проиллюстрированы степени метилирования сайтов CpG eg 10673 833 от трех пациентов (2043089, 2042981 и 2004651), эталонного образца нормальной cfDNA, эталонного
образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки и эталонного образца нормальной крови. У пациентов 2043089 и 2042981 имела место первичная злокачественная опухоль толстой кишки, а у пациента 2004651 была метастатическая злокачественная опухоль толстой кишки.
Профили метилирования для первичных злокачественных опухолей печени, молочной железы и легкого проиллюстрированы на фиг. 32А - фиг. 32С. На фиг. 32А показана степень метилирования сайта CpG cg00401797 в образце cfDNA злокачественной опухоли печени, образце нормальной cfDNA, эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли печени (геномной ДНК) и в эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). На фиг. 32В показана степень метилирования сайта CpG cg07519236 в образце cfDNA злокачественной опухоли молочной железы, образце нормальной cfDNA, эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли молочной железы (геномной ДНК) и эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). На фиг. 32С показана степень метилирования сайта CpG cg02877575 в образце cfDNA злокачественной опухоли легкого, образце нормальной cfDNA, эталонном образце ткани первичной злокачественной опухоли легкого (геномной ДНК) и эталонном образце нормальных лимфоцитов (геномной ДНК).
На фиг. ЗЗА - фиг. 33В показаны два различных зонда, которые позволяют дифференцировать первичную злокачественную опухоль толстой кишки от нормального образца. На фиг. ЗЗА показан зонд Cob-2, который нацелен на сайт CpG cgl0673833, и профили метилирования из образцов cfDNA от трех пациентов со злокачественной опухолью толстой кишки, образца нормальной cfDNA, эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки (геномной DNA) и эталонного образца нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). У двух из трех пациентов (2043089 и 2042981) была первичная злокачественная опухоль толстой кишки. У оставшегося пациента (2004651) была метастатическая злокачественная опухоль толстой кишки. Степень метилирования у cgl0673833 отличалась при сравнении cfDNA образца первичной злокачественной опухоли толстой кишки и cfDNA образца метастатической злокачественной опухоли толстой кишки; в то время как степени метилирования у cfDNA образца метастатической злокачественной опухоли толстой кишки и эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки были схожими. На фиг. 33В показан зонд Brb-2, который нацелен на сайт CpG cg07974511, и профили метилирования из образцов cfDNA от двух пациентов с первичной злокачественной опухолью толстой кишки (2043089 и 2042981), образца нормальной cfDNA, эталонного
образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки (геномной DNA) и эталонного образца нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). В сайте CpG cg07974511 степени метилирования между cfDNA образца злокачественной опухоли толстой кишки и эталонного образца ткани первичной злокачественной опухоли толстой кишки были схожими, но отличались от степеней метилирования образца нормальной cfDNA и эталонного образца нормальных лимфоцитов (геномной ДНК).
На фиг. 34А - фиг. 34D показаны результаты анализа cfDNA от пациентов со злокачественной опухолью молочной железы. Использовали четыре зонда (Brb-3, Brb-4, Brb-8 и Brb-13). Степень метилирования cfDNA первичной злокачественной опухоли молочной железы сравнивали с образцом нормальной cfDNA, эталонным образцом ткани первичной злокачественной опухоли молочной железы (геномной ДНК) и эталонным образцом нормальных лимфоцитов (геномной ДНК). С помощью всех четырех зондов можно было детектировать наличие злокачественной опухоли молочной железы в образцах cfDNA.
На фиг. 35А и фиг. 35В показано, что с помощью каждого из двух зондов, соЬ З и brb_13, можно было детектировать метастатическую злокачественную опухоль толстой кишки в образцах ткани от 49 пациентов. На фиг. 35А показан профиль метилирования от 49 пациентов в сравнении с эталонным образцом ткани злокачественной опухоли толстой кишки, эталонным образцом ткани злокачественной опухоли легкого и эталонного образца нормальной ткани легкого, полученный с помощью зонда cob_3. Степени метилирования у приблизительно 47 из 49 пациентов были выше в сравнении со степенью метилирования эталонного образца нормальной ткани легкого. На фиг. 35В, где показано применение зонда brb_13, видно, что приблизительно 30 из 49 пациентов имели более низкие степени метилирования в сравнении со степенью метилирования эталонного образца нормальной ткани легкого.
Пример 8
Результаты профилирования метилирования дифференцируются с лечением
Образцы плазмы обрабатывали как описано в примере 7. На фиг. 46 проиллюстрированы изменения в профиле метилирования для двух иллюстративных сайтов CpG (сайт 1 CpG и сайт 2 CpG) с помощью двух различных зондов злокачественных опухолей толстой кишки (cob-2 и cob-9). На фиг. 47 проиллюстрированы изменения в профиле метилирования для зондов злокачественной
опухоли толстой кишки cob-2 и cob-9 в образцах от четырех пациентов (пациентов 2045021, 2044629, 2044645 и 2045021) после хирургической операции. В профилях метилирования образцов от четырех пациентов видны отличающиеся профили, полученные с помощью зонда cob-2, в сравнении с профилем метилирования от образца нормальной cfDNA. Для зонда cob-9 профили метилирования оставались одинаковыми среди образцов четырех пациентов и образцом нормальной cfDNA.
Пример 9
Результаты профилирования метилирования дифференцируются со стадиями злокачественной опухоли
Образцы плазмы обрабатывали как описано в примере 7. На фиг. 48 проиллюстрированы изменения профиля метилирования для зондов злокачественной опухоли толстой кишки cob-2 и cob-9 в образцах с различной стадией злокачественной опухоли.
Пример 10
Результаты профилирования метилирования дифференцируются у нормального образца и образца опухолевой бесклеточной ДНК
Образцы плазмы обрабатывали как описано в примере 7. На фиг. 49А - фиг. 49J проиллюстрированы изменения профилей метилирования десяти иллюстративных сайтов CpG (cg02874908, cg08098128, cgl0542975,cgl1252953, cgl1334870, cgl3911392, cg23130731, cg23612220, cg25432518 и cg25922751) для 19 образцов различных типов злокачественной опухоли и нормальной крови. В число типов злокачественной опухоли входят злокачественная опухоль мочевого пузыря, злокачественная опухоль молочной железы, злокачественная опухоль шейки матки, холангиокарцинома (CHOL), злокачественная опухоль толстой кишки, злокачественная опухоль пищевода, злокачественная опухоль головы и шеи, злокачественная опухоль почки, злокачественная опухоль печени, злокачественная опухоль легкого, злокачественная опухоль поджелудочной железы, феохромоцитома и параганглиома (PCPG), злокачественная опухоль предстательной железы, злокачественная опухоль прямой кишки, саркома, злокачественная опухоль кожи, злокачественная опухоль желудка и злокачественная опухоль щитовидной железы.
На фиг. 50 проиллюстрированы изменения профилей метилирования приблизительно 280 сайтов CpG (биомаркеров) для образца злокачественной опухоли
молочной железы, злокачественной опухоли толстой кишки, злокачественной опухоли печени, злокачественной опухоли легкого и нормальной крови.
В таблице 19 проиллюстрированы Р-значения для каждого типа злокачественной опухоли для сайта CpG cg25922751.
аденокарцинома желудка (STAD)
197,2738161
0,634868339
опухоли половых клеток яичка (TGCT)
62,80674383
0,469291291
карцинома щитовидной железы (ТНСА)
259,7002251
0,753319407
матки
150,0130503
0,724290607
Пример 11 Таблицы
В таблицах 15 и 16 проиллюстрированы сайты CpG, применяемые с одним или несколькими из следующего: способа, системы, машиночитаемого носителя с постоянной записью или наборов, которые описаны в настоящем документе.
В таблицах 17 и 18 проиллюстрированы сайты CpG и зонды, пригодные с одним или несколькими из следующего: способа, системы, машиночитаемого носителя с постоянной записью или наборов, которые описаны в настоящем документе.
В таблице 20 проиллюстрированы сайты CpG (или маркеры CpG), пригодные с одним или несколькими из следующего: способа, системы, машиночитаемого носителя с постоянной записью или наборов, которые описаны в настоящем документе.
g00198436 g00201819 g00207279 g00208153 g00208218 g00209424 g00215224 g00218406 g00220413 g00220455 g00221494 g00221718 g00226923 g00228799 g00236832 g00237391 g00239071 g00239171 g00240378 g00242035 g00253228 g00253248 g00253379 g00253398 g00253681 g00257920 g00261690 g00261781 g00264298 g00268149 g00269725 g00273124 g00273198 g00275449 g00280270 g00282267 g00283535 cg00283857 cg00287122 cg00289053 cg00292135 cg00292135 cg00293303 cg00294025 cg00294382 cg00299230 cg00300298 cg00300879 cg00302479 cg00306851 cg00310375 cg00311883 cg00313498 cg00317020 cg00317837 cg00318899 cg00319334 cg00319761 cg00321286 cg00321478 cg00321478 cg00325866 cg00327185 cg00329411 cg00332153 cg00332680 cg00332950 cg00333226 cg00334274 cg00334507 cg00335591 cg00336376 cg00338893 cg00339769 cg00340958 cg00341885 cg00342530 cg00343092 cg00344372 cg00345443 cg00347746 cg00347863 cg00348992 cg00354381 cg00356811 cg00363813 cg00364339 cg00370106 cg00370123 cg00370229 cg00371195 cg00372375 cg00381755 cg00387445 cg00387524 cg00394718 cg00394823 cg00396667 cg00397479 cg00400165 cg00400221 cg00401797 cg00401972 cg00405198 cg00407537 cg00409434 cg00409636 cg00411097 cg00412772 cg00414077 cg00415011 cg00415665
cg00415993 cg00417823 cg00421144 cg00422461 cg00423486 cg00428457 cg00429618 cg00429618 cg00430287 cg00431187 cg00431549 cg00432953 cg00443307 cg00444151 cg00446235 cg00450617 cg00451642 cg00456593 cg00458454 cg00458607 cg00460589 cg00461901 cg00462430 cg00463859 cg00466268 cg00481951 cg00484711 cg00486113 cg00487187 cg00488514 cg00489401 cg00489795 cg00489988 cg00491404 cg00491404 cg00491577 cg00491603 cg00498211 cg00500498 cg00501272 cg00506168 cg00510149 cg00510718 cg00512404 cg00513611 cg00515905 cg00516092 cg00516481 cg00517511 cg00518941 cg00519299 cg00522231 cg00524374 cg00529371 cg00532451 cg00532492 cg00533827 cg00535514 cg00535785 cg00537979 cg00538495 cg00542992 cg00545804 cg00546897 cg00549566 cg00552087 cg00555456 cg00558804 cg00560747 cg00562180 cg00563229 cg00563229 cg00563352
cg00563566 cg00566369 cg00567872 cg00569091 cg00571634 cg00571809 cg00573410 cg00575744 g00576689 g00579402 g00582524 g00584456 g00584840 g00585790 g00588853 g00589493 g00590251 g00595472 g00600684 g00602295 g00607630 g00612828 g00616624 g00619628 g00620628 g00622702 g00630164 g00637104 g00641409 g00643293 g00645755 g00651016 g00652796 g00653387 g00655552 g00660272 g00661222 cg00661970 cg00663986 cg00664406 cg00664454 cg00665374 cg00668685 cg00671600 cg00675160 cg00679556 cg00679731 cg00679763 cg00685614 cg00687306 cg00687714 cg00688591 cg00689225 cg00689340 cg00690049 cg00690082 cg00690280 cg00690554 cg00692173 cg00695416 cg00696323 cg00698602 cg00705992 cg00710456 cg00713400 cg00714309 cg00721170 cg00727310 cg00729275 cg00729875 cg00731304 cg00732878 cg00733324 cg00733722 cg00734931 cg00738178 cg00739120 cg00739667 cg00740813 cg00744433 cg00746446 cg00747160 cg00748072 cg00748589 cg00748589 cg00750225 cg00752047 cg00753248 cg00756058 cg00756450 cg00759427 cg00761129 cg00766220 cg00767581 cg00768439 cg00768487 cg00773370 cg00777121 cg00778807 cg00779313 cg00781839 cg00784161 cg00785620 cg00786305 cg00786761 cg00791430 cg00794055 cg00794174 cg00799748 cg00804354 cg00806214 cg00806644 cg00806900 cg00808492 cg00812096 cg00813135 cg00814909 cg00817367 cg00819233 cg00819310 cg00830492 cg00831127 cg00836482 cg00839584 cg00839584 cg00840310 cg00840403 cg00840516 cg00842351 cg00842351 cg00849267 cg00850073 cg00850538 cg00852549 cg00852549 cg00852603 cg00852705 cg00857907 cg00859478 cg00861010 cg00862408 cg00862588 cg00866690 cg00870269 cg00881370 cg00881370 cg00881378 cg00882451 cg00883166 cg00883831 cg00888336 cg00895174 cg00897875 cg00900735 cg00901574 cg00904548 cg00907204 cg00907272 cg00907810 cg00909286 cg00909706 cg00911351 cg00912247 cg00912407 cg00913787 cg00916635 cg00916635 cg00916659 cg00916899 cg00917847 cg00920960 cg00926267 cg00926420 cg00926926 cg00928751 cg00929635 cg00933411 cg00933696 cg00934037 cg00935388 cg00937515 cg00940560 cg00942552 cg00943287 cg00945862
$00951599 $00952822 $00953154 $00954931 $00957698 $00958560 $00960772 $00962254 $00968270 $00969162 $00970396 $00974685 $00981877 $00982974 $00983904 $00987534 $00988056 $00990613 $00993830 $00994629 $00995986 $00998124 $00999988 $01002242 $01002529 $01009664 $01013031 $01013171 $01021743 $01023808 $01027937 $01029395 $01029592 $01030534 $01031400 $01031616 ?01041405
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1043831 1044293 1049530 1051318 1055543 1056358 1063813 1066220 1066494 1074325 1077100 1077846 1080862 1083652 1086868 1092546 1103730 1105356 1106881 1107741 1108476 1109219 1112778 1116137 1117384 1119135 1119718 1120308 1122251 1126560 1128482 1132893 1133779 1135626 1136458 1138020 1138020
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1140660 1141445 1141572 1141838 1142676 1143454 1143454 1144086 1144768 1149192 1149677 1150411 1150683 1151686 1152019 1152056 1157780 1159194 1161811 1168833 1177854 1178099 1179095 1181105 1182973 1185755 1189072 1191815 1196744 1207684 1209642 1212848 1213573 1214054 1219549 1219924 1221209
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1224366 1228636 1233786 1233897 1233922 1234063 1234420 1235983 1236137 1238435 1240931 1243312 1246254 1246622 1248445 1254505 1259423 1261503 1261503 1262913 1262913 1263942 1267797 1267899 1268541 1269048 1269795 1271812 1274916 1280080 1280080 1281718 1283300 1284306 1287833 1288258 1288598
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1289769 1289874 1291474 1293346 1295785 1301117 1302240 1302853 1303372 1304499 1305625 1306747 1308827 1312316 1316378 1318557 1321962 1324261 1327474 1330456 1334682 1335367 1335980 1336162 1340312 1341572 1342196 1343313 1344452 1345354 1346152 1346152 1346718 1351315 1352882 1354473 1359274
1359809 1360605 1361361 1361499 1362776 1364755 1367992 1368075 1372811 1373595 1377268 1377459 1377911 1381846 1383890 1384111 1388889 1391063 1391084 1392544 1393234 1394199 1397046 1399219 1400685 1401337 1401824 1402746 1402832 1405040 1406317 1406381 1408508 1408558 1409343 1410472 1413582
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1413632 1414185 1414882 1414934 1423916 1426125 1426303 1429360 1429360 1433297 1434562 1437411 1438291 1439631 1440489 1440570 1441777 1441777 1445163 1446907 1448098 1449715 1450522 1452189 1452847 1453281 1456691 1459453 1462546 1472101 1473816 1484075 1484156 1484686 1485157 1487468 1489441
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1489756 1490004 1492909 1493303 1493379 1493517 1494399 1495509 1497527 1504784 1506917 1509427 1510990 1513078 1516005 1517033 1518459 1518607 1518723 1519063 1519261 1520586 1521036 1526089 1527394 1528542 1529552 1530101 1531198 1534423 1534527 1537445 1538731 1539484 1540102 1541443 1541629
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1541867 1541867 1542423 1544351 1546047 1546430 1549977 1550148 1551699 1552919 1555431 1556552 1557297 1558777 1558960 1560185 1561719 1561916 1564135 1566460 1574390 1575836 1577165 1578341 1578875 1579299 1580568 1585794 1586116 1586779 1588438 1588725 1589580 1589587 1589998 1590338 1593385
cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO cgO
1594214 1595717 1596292 1602153 1602345 1604946 1609275 1610488 1612366 1614759 1616225 1620164 1623438 1623438 1635061 1637125 1641368 1644850 1649611 1654312 1655008 1655356 1655898 1656216 1656853 1660407 1660934 1676795 1678313 1681367 1688202 1692842 1693305 1696784 1697163 1699293 1699430
g01702055 gO1707076 gO1712428 g01712737 g01715699 g01718602 g01719854 gO1720033 gO1720945 gO1722297 gO1725199 g01725531 gO1726775 g01727317 g01729491 g01733599 g01737507 gO1743020 g01754267 g01755369 gO1759672 gO1760189 gO1760983 g01765152 g01767053 g01767116 g01768686 gO1770400 g01777397 g01778994 g01781725 g01782486 g01782486 g01790002 g01792117 g01793387 gO1793445
1794555
1794853
1795894
1797036
1805480
1805540
1811100
cgO
1812499
[812894
[813877
[815912
[816936
[817009
[819995
cgO
[820374
?0J
[824466
jO]
[824804
jO]
[824933
jO]
[829817
jO]
[830154
jO]
[835489
835695
cgOl
841651
;0]
843018
844321
851378
;0]
852522
;0]
854776
;0]
860897
cgO]
861509
50J
867320
50]
868729
50]
868869
50]
873977
50]
876130
50]
877606
50]
878308
cgO
1879723
cgO
1881255
cgO
1884681
cgO
1886570
cgO
1887353
cgO
1888566
cgO
1889169
cgO
1891736
cgO
[897823
cgO
[897823
cgO
[897944
cgO
[899676
cgO
[899937
cgO
[901579
cgO
[902849
cgO
[903374
cgO]
[904393
cgO]
[907476
cgO]
[915433
cgO]
[915885
cgO]
[919632
cgO]
921845
cgOl
923775
cgO]
935096
cgO]
937809
cgO]
938825
cgO]
939117
cgO]
940181
cgO]
942226
cgO]
946401
cgO]
946574
cgO]
951274
cgO]
951459
cgO]
953456
cgO]
956420
cgO]
959238
cgO]
962821
cgO1962969 cgO1962969 cg01963059 cgO1963702 cg01965552 cgO1968178 cgO1968178 cgO1968793 cgO1969473 cg01970383 cgO1971120 cg01971813 cgO1973029 cgO1974091 cgO1974375 cgO1975093 cg01978213 cg01980591 cg01983216 cg01985965 cgO1987702 cgO1987925 cg01988129 cg01993576 cgO1994252 cgO1996643 cgO1997629 cg02001991 cg02003272 cg02007434 cg02008770 cg02009103 cg02013838 cg02014003 cg02016985 cg02017041 cg02021180 cg02021919 cg02025879 cg02026204 cg02029908 cg02030542 cg02030908 cg02034222 cg02034328 cg02035605 cg02037307 cg02043000 cg02043070 cg02043697 cg02044879 cg02046017 cg02046143 cg02047577 cg02050376 cg02050917 cg02055963 cg02059176 cg02059952 cg02061820 cg02064106 cg02064267 cg02064724 cg02066936 cg02071712 cg02072492 cg02072495 cg02075142 cg02076020 cg02076607 cg02077558 cg02077702 cg02078292 cg02078525
g02081065 g02082342 g02084814 g02085507 g02085953 g02091489 g02092098 g02093951 g02094018 g02094337 g02098460 g02100848 g02101355 g02101812 g02104162 g02106850 g02108623 g02111865 g02113429 g02115818 g02119494 g02125365 g02126424 g02127509 g02130905 g02131155 g02131853 g02131967 g02132909 g02136690 g02137970 g02138098 g02138331 g02144647 g02145220 g02145310 g02149446 cg02152290 cg02154765 cg02159381 cg02164046 cg02164225 cg02164574 cg02164615 cg02166532 cg02168857 cg02184413 cg02187822 cg02192117 cg02192855 cg02192965 cg02194211 cg02194211 cg02196651 cg02196805 cg02198617 cg02205073 cg02211805 cg02213663 cg02215357 cg02216727 cg02225720 cg02225988 cg02227217 cg02228185 cg02229757 cg02231590 cg02234352 cg02235659 cg02237342 cg02244431 cg02252828 cg02253760 cg02254407 cg02254581 cg02257681 cg02258444 cg02259047 cg02259775 cg02261780 cg02262553 cg02264079 cg02276817 cg02277520 cg02280309 cg02284014 cg02286549 cg02289040 cg02289754 cg02297063 cg02297831 cg02298612 cg02298862 cg02300825 cg02307880 cg02311193 cg02321903 cg02323003 cg02326386 cg02328239 cg02328326 cg02329038 cg02329430 cg02329886 cg02330106 cg02330271 cg02330500 cg02334775 cg02338271 cg02339888 cg02343648 cg02345417 cg02345886 cg02346342 cg02347984 cg02348751 cg02355411 cg02361013 cg02363202 cg02364279 cg02366931 cg02370667 cg02370923 cg02371119 cg02371376 cg02374207 cg02376703 cg02377021 cg02381853 cg02384546 cg02387639 cg02387679 cg02388150 cg02394186 cg02395363 cg02396020 cg02396797 cg02397064 cg02399455 cg02400595 cg02411088 cg02412345 cg02419362 cg02423318 cg02430183 cg02431260 cg02433515 cg02436686 cg02436686 cg02443732 cg02449461 cg02451670 cg02452500 cg02452586 cg02452985 cg02454464 cg02456451 cg02459569 cg02462868 cg02463253 cg02464551 cg02466801 cg02470521 cg02470959 cg02473540 cg02474926 cg02479575 cg02479744 cg02482497 cg02483101 cg02487823 cg02490034 cg02490626 cg02495743 cg02497558 cg02497758 cg02501155 cg02501779 cg02502358 cg02505676 cg02506353 cg02512860 cg02515899 cg02516530 cg02520804
g02523400 g02525997 g02530753 g02534164 g02534659 g02535060 g02535674 g02537838 g02537838 g02539882 g02541125 g02543462 g02543636 g02547035 g02547426 g02548364 g02551743 g02552255 g02560310 g02561482 g02563407 g02564061 g02564175 g02565132 g02569718 g02571436 g02573176 g02573703 g02574861 g02579959 g02580045 g02582754 g02584498 g02584537 g02585598 g02585702 g02586182 cg02587316
cg02587606 cg02592743 cg02596427 cg02597128 cg02597698 cg02598430 cg02600394 cg02603784 cg02605601 cg02606218 cg02606840 cg02607544 cg02607810 cg02609337 cg02609724 cg02610327 cg02612270 cg02613803 cg02620147 cg02621287 cg02621779 cg02627286 cg02627403 cg02627455 cg02629506 cg02630207 cg02631838 cg02631838 cg02632314 cg02632362 cg02633729 cg02633924 cg02634861 cg02635407 cg02637253 cg02637352 cg02638348 cg02642549 cg02642958 cg02643834 cg02645135 cg02647408 cg02647835 cg02647998 cg02649608 cg02650121 cg02650128 cg02650266 cg02654411 cg02657012 cg02660440 cg02666566 cg02672397 cg02672493 cg02673417 cg02676052 cg02678414 cg02692785 cg02693157 cg02693857 cg02697979 cg02698806 cg02699898 cg02706018 cg02708922 cg02710485 cg02711212 cg02711397 cg02711479 cg02712464 cg02713960 cg02716635 cg02716792 cg02716826 cg02720618 cg02721902 cg02723533 cg02724472 cg02733444 cg02733650 cg02734358 cg02735486 cg02737268 cg02737619 cg02738255 cg02746684 cg02746913 cg02747390 cg02751839 cg02752037 cg02754470 cg02756056 cg02756735 cg02756856 cg02762475 cg02762634 cg02762689 cg02764093 cg02768721 cg02770252 cg02770672 cg02770745 cg02770835 cg02771299 cg02772121 cg02782634 cg02784696 cg02785101 cg02785814 cg02786912 cg02788637 cg02791765 cg02791973 cg02793948 cg02794358 cg02794695 cg02794695 cg02798280 cg02799905 cg02805890 cg02806156 cg02813863 cg02816425 cg02823132 cg02825887 cg02827572 cg02828785 cg02829601 cg02829654 cg02830202 cg02830438 cg02830438 cg02831294 cg02832915 cg02837128 cg02838683 cg02838877 cg02840535 cg02848097 cg02850602 cg02853152 cg02854902 cg02855558 cg02861178 cg02861260 cg02861615 cg02862885
cg02863947 cg02867102 cg02867102 cg02868790 cg02873991 cg02874908 cg02877575 g02878439 g02879423 g02880679 g02883503 g02884826 g02885519 g02886033 g02886284 g02886375 g02888748 g02891048 g02891522 g02891945 g02896768 g02896872 g02898159 g02901122 g02902770 g02905065 g02905426 g02907064 g02908942 g02909176 g02909298 g02912007 g02912476 g02914427 g02916283 g02917603 g02919422 cg02921122 cg02922879 cg02924834 cg02926868 cg02927346 cg02928476 cg02930963 cg02935338 cg02935904 cg02936049 cg02939078 cg02942159 cg02946294 cg02951514 cg02952451 cg02954123 cg02955287 cg02958004 cg02959277 cg02959939 cg02963229 cg02963973 cg02965078 cg02965295 cg02965892 cg02968890 cg02970919 cg02971546 cg02971920 cg02973693 cg02973883 cg02973971 cg02974085 cg02975107 cg02977810 cg02978297 cg02983090 cg02983451 cg02985617 cg02988698 cg02988755 cg02989244 cg02992118 cg02992645 cg02993013 cg03000603 cg03001305 cg03003434 cg03004249 cg03007522 cg03009240 cg03009363 cg03010018 cg03014495 cg03014882 cg03016571 cg03017264 cg03017653 cg03019505 cg03020951 cg03024537 cg03025825 cg03027227 cg03030267 cg03030757 cg03032180 cg03032497 cg03033176 cg03038685 cg03042666 cg03043665 cg03044281 cg03046812 cg03048372 cg03050022 cg03052099 cg03052794 cg03057072 cg03061518 cg03063658 cg03064067 cg03064642 cg03065202 cg03071808 cg03074946 cg03076324 cg03077492 cg03078239 cg03080142 cg03081478 cg03082589 cg03085712 cg03085719 cg03087203 cg03089651 cg03090436 cg03092551 cg03096803 cg03098643 cg03103549 cg03104936 cg03106245 cg03110787 cg03112433 cg03112433 cg03119829 cg03122511 cg03124318 cg03124636 cg03130910 cg03134947 cg03135023 cg03136712 cg03137700 cg03137792 cg03138091 cg03138091 cg03140412 cg03143441 cg03143486 cg03146625 cg03147185 cg03148927 cg03150108 cg03158400 cg03161476 cg03161803 cg03165378 cg03165700 cg03169170 cg03169557 cg03170670 cg03172688 cg03176917 cg03177025 cg03177025 cg03178232 cg03179450 cg03180552 cg03181524 cg03184424 cg03187713 cg03189082 cg03190219 cg03191794 cg03194038 cg03196720 cg03199983
g03213374 g03216043 g03217587 g03217954 g03217995 g03218909 g03218909 g03223172 g03223734 g03223894 g03224418 g03224621 g03232342 g03232484 g03232620 g03239970 g03240301 g03241461 g03241649 g03243768 g03249630 g03251079 g03256198 g03257417 g03260021 g03261004 g03268893 g03270167 g03272310 g03276401 g03278564 g03280622 g03283421 g03283842 g03284113 g03286774 g03289548 cg03290131 cg03290213 cg03292149 cg03292149 cg03292388 cg03294491 cg03296204 cg03301058 cg03301282 cg03301331 cg03301331 cg03302287 cg03302822 cg03307103 cg03312643 cg03314977 cg03315407 cg03317811 cg03317820 cg03320754 cg03322057 cg03323953 cg03326606 cg03327829 cg03329576 cg03329755 cg03330678 cg03331229 cg03331474 cg03332546 cg03332903 cg03334213 cg03339057 cg03339247 cg03340408 cg03343063 cg03346415 cg03347632 cg03347739 cg03352106 cg03353885 cg03354554 cg03355526 cg03355690 cg03358468 cg03359362 cg03359508 cg03361085 cg03364486 cg03364683 cg03367387 cg03369247 cg03370106 cg03383268 cg03387497 cg03389789 cg03391568 cg03393769 cg03395546 cg03399905 cg03399971 cg03399971 cg03403265 cg03409187 cg03420580 cg03421440 cg03422651 cg03427120 cg03428945 cg03429348 cg03430067 cg03430116 cg03431741 cg03431918 cg03435866 cg03442712 cg03444722 cg03445151 cg03445663 cg03447880 cg03447908 cg03449456 cg03454705 cg03455736 cg03459656 cg03459809 cg03464224 cg03464573 cg03466124 cg03467001 cg03471346 cg03472880 cg03473387 cg03473518 cg03473532 cg03475821 cg03476195 cg03476195 cg03477080 cg03479710 cg03490200 cg03494430 cg03494648 cg03495868 cg03497652 cg03498081 cg03498175 cg03501128 cg03501666 cg03512098 cg03514843 cg03517024 cg03519577 cg03520624 cg03521774 cg03528946 cg03529641 cg03530168 cg03533858 cg03534410 cg03535099 cg03537810 cg03539204 cg03541903 cg03544320 cg03545227 cg03547631 cg03548415 cg03548673 cg03549705 cg03550864 cg03554051 cg03558010 cg03560685 cg03562120 cg03562978 cg03565081 cg03565868 cg03567830 cg03572011 cg03574306 cg03577157 cg03579904 cg03580247 cg03581459 cg03582371 cg03585122 cg03585323
cg03587557 cg03593014 cg03594078 cg03594790 cg03595018 g03595580 g03599855 g03605686 g03606269 g03607117 g03607117 g03612357 g03613525 g03614132 g03615683 g03619586 g03622664 g03629458 g03632704 g03635766 g03641225 g03642518 g03645007 g03647436 g03649649 g03651493 g03652715 g03653573 g03653601 g03653726 g03654273 g03655330 g03662459 g03663556 g03664992 g03664992 g03665785 cg03672021 cg03673694 cg03675171 cg03679305 cg03679305 cg03679394 cg03681481 cg03684977 cg03685063 cg03687070 cg03689129 cg03691170 cg03695871 cg03696327 cg03696327 cg03696603 cg03697308 cg03699566 cg03699623 cg03705558 cg03707168 cg03707599 cg03714676 cg03716852 cg03716999 cg03718677 cg03722909 cg03723845 cg03724882 cg03727333 cg03731131 cg03734783 cg03735592 cg03739378 cg03742137 cg03742214 cg03743861 cg03746015 cg03750478 cg03750587 cg03750778 cg03752885 cg03754582 cg03760191 cg03762081 cg03762535 cg03763391 cg03764161 cg03764585 cg03766264 cg03767807 cg03770548 cg03771456 cg03771840 cg03772020 cg03777405 cg03778207 cg03779937 cg03781123 cg03782130 cg03782220 cg03783110 cg03787988 cg03794445 cg03796224 cg03799530 cg03800922 cg03812546 cg03820795 cg03821727 cg03833604 cg03837313 cg03837909 cg03837935 cg03840259 cg03840259 cg03841065 cg03841638 cg03844762 cg03844838 cg03846767 cg03847535 cg03847796 cg03848555 cg03850117 cg03852144 cg03852551 cg03854913 cg03855388 cg03856411 cg03858703 cg03860051 cg03860252 cg03860400 cg03867465 cg03868944 cg03874199 cg03875496 cg03876618 cg03877767 cg03882242 cg03887092 cg03889263 cg03889767 cg03890877 cg03891302 cg03891346 cg03900284 cg03900314 cg03900378 cg03900492 cg03906434 cg03907174 cg03907363 cg03909081 cg03913989 cg03915012 cg03915740 cg03915932 cg03917666 cg03918304 cg03918304 cg03920003 cg03923561 cg03925970 cg03929366 cg03929747 cg03930153 cg03934354 cg03934354 cg03944099 cg03945895 cg03946324 cg03950009 cg03953626 cg03954048 cg03954858 cg03954918 cg03957095 cg03958344 cg03959079 cg03959306 cg03961010 cg03961189 cg03966486 cg03966751 cg03966785 cg03967798
g03969696 g03971454 g03972745 g03973663 g03977657 g03977657 g03979241 g03979258 g03980224 g03984209 g03986665 g03991152 g03991547 g03992069 g03992638 g03993087 g03993463 g03995457 g03997145 g03998606 g04001668 g04002454 g04002794 g04005707 g04007987 g04008703 g04008888 g04009429 g04011470 g04011995 g04014609 g04016660 g04017769 g04021962 g04025049 g04025244 g04027043 cg04029455 cg04030848 cg04035064 cg04036593 cg04037732 cg04037970 cg04039397 cg04042305 cg04044188 cg04048249 cg04049033 cg04051396 cg04052038 cg04057485 cg04057956 cg04062040 cg04062576 cg04064583 cg04065767 cg04067249 cg04070692 cg04070986 cg04073934 cg04075990 cg04081402 cg04084026 cg04084157 cg04085447 cg04085768 cg04089246 cg04089901 cg04093633 cg04096619 cg04100595 cg04104695 cg04105511 cg04106196 cg04110105 cg04111078 cg04111789 cg04112704 cg04115878 cg04117375 cg04118910 cg04124962 cg04126261 cg04127342 cg04148163 cg04152767 cg04155718 cg04155862 cg04156293 cg04158612 cg04170535 cg04176452 cg04180868 cg04185310 cg04194001 cg04195454 cg04196119 cg04203238 cg04203702 cg04205041 cg04205769 cg04209913 cg04212021 cg04212239 cg04213384 cg04214430 cg04215055 cg04216051 cg04218124 cg04218548 cg04218899 cg04219544 cg04221117 cg04221521 cg04222933 cg04223956 cg04225368 cg04227591 cg04228042 cg04232128 cg04233664 cg04245294 cg04246521 cg04249706 cg04254916 cg04256470 cg04259001 cg04259358 cg04262428 cg04263215 cg04263436 cg04266474 cg04268405 cg04270085 cg04272613 cg04273148 cg04273573 cg04275695 cg04276057 cg04276084 cg04278702 cg04280772 cg04281204 cg04284192 cg04291025 cg04293307 cg04297093 cg04297329 cg04298323 cg04301104 cg04301614 cg04302388 cg04303335 cg04303901 cg04307587 cg04308657 cg04308797 cg04311964 cg04312209 cg04314111 cg04317399 cg04318855 cg04319611 cg04320956 cg04323365 cg04324995 cg04329382 cg04330449 cg04330884 cg04332422 cg04333785 cg04337594 cg04340430 cg04340928 cg04342737 cg04344997 cg04348872 cg04351205 cg04352288 cg04352505 cg04353438 cg04355435 cg04356381 cg04357789 cg04358131
cg04361015 cg04362586 cg04365699 cg04366815 cg04382468 cg04383154 cg04389398 g04389994 g04391800 g04394967 g04396791 g04399899 g04400972 g04411625 g04413147 g04413148 g04413148 g04414816 g04415132 g04416414 g04416734 g04420917 g04421553 g04422896 g04424621 g04424621 g04427860 g04428853 g04431596 g04434339 g04437648 g04439215 g04439215 g04440811 g04441857 g04444771 g04448487 cg04448487 cg04450037 cg04450797 cg04453552 cg04454951 cg04455137 cg04455999 cg04456029 cg04456219 cg04456238 cg04456238 cg04456754 cg04457051 cg04457794 cg04460185 cg04460364 cg04462931 cg04463638 cg04464446 cg04465078 cg04468081 cg04468741 cg04470060 cg04472592 cg04473302 cg04474832 cg04476286 cg04477010 cg04478698 cg04481096 cg04482075 cg04483460 cg04486940 cg04488647 cg04488758 cg04489066 cg04490349 cg04493432 cg04493740 cg04495354 cg04497684 cg04498511 cg04498913 cg04499514 cg04499792 cg04502601 cg04503093 cg04504004 cg04505023 cg04505435 cg04508649 cg04509882 cg04511534 cg04512966 cg04515001 cg04523661 cg04528477 cg04528819 cg04528819 cg04528829 cg04531704 cg04531710 cg04534765 cg04546097 cg04548715 cg04549583 cg04552418 cg04554720 cg04561753 cg04563543 cg04563996 cg04563996 cg04569190 cg04576021 cg04581327 cg04581938 cg04586563 cg04586928 cg04588356 cg04588840 cg04589975 cg04593859 cg04596071 cg04598121 cg04601090 cg04603031 cg04605980 cg04607671 cg04608811 cg04609694 cg04619381 cg04619437 cg04631202 cg04638710 cg04648402 cg04650676 cg04650789 cg04652957 cg04658021 cg04660410 cg04661040 cg04663487 cg04664309 cg04665565 cg04667640 cg04674060 cg04678315 cg04678916 cg04680919 cg04682845 cg04683210 cg04684516 cg04687437 cg04688645 cg04693379 cg04693928 cg04697056 cg04698114 cg04701618 cg04702045 cg04704193 cg04704531 cg04705952 cg04711063 cg04717485 cg04717534 cg04718342 cg04718845 cg04718883 cg04719574 cg04719766 cg04720330 cg04721934 cg04725426 cg04725442 cg04728296 cg04730794 cg04735123 cg04737131 cg04739485 cg04739485 cg04740046 cg04742135 cg04745805 cg04747619 cg04747693 cg04751149 cg04754011
g04757389 g04759439 g04761267 g04761824 g04761824 g04762412 g04763558 g04765675 g04768463 g04770088 g04771413 g04772818 g04777726 g04778178 g04779752 g04786142 g04789318 g04791718 g04793527 g04794690 g04797323 g04797496 g04801085 g04807108 g04809136 g04814352 g04817300 g04818331 g04820159 g04822177 g04822621 g04827551 g04828792 g04832450 g04832557 g04833050 g04834502 cg04835051 cg04836038 cg04836038 cg04837898 cg04838847 cg04844534 cg04848452 cg04848693 cg04851465 cg04853218 cg04854189 cg04854343 cg04855433 cg04856689 cg04858709 cg04859102 cg04859826 cg04860664 cg04863197 cg04865506 cg04867634 cg04868764 cg04869122 cg04869380 cg04872593 cg04872689 cg04873098 cg04874286 cg04875041 cg04875128 cg04875128 cg04875162 cg04877910 cg04880138 cg04880751 cg04882759 cg04886221 cg04890851 cg04892766 cg04894958 cg04897892 cg04897900 cg04899446 cg04900186 cg04907244 cg04907257 cg04907664 cg04908960 cg04909529 cg04911005 cg04911139 cg04914221 cg04915044 cg04915566 cg04918350 cg04918708 cg04920951 cg04921315 cg04926361 cg04928049 cg04934595 cg04936619 cg04939326 cg04940570 cg04940570 cg04941630 cg04942260 cg04947157 cg04948892 cg04951051 cg04951371 cg04951797 cg04952324 cg04952694 cg04954111 cg04958703 cg04970352 cg04973183 cg04977376 cg04978107 cg04981492 cg04982308 cg04983687 cg04984818 cg04987071 cg04988978 cg04993279 cg04993605 cg04994456 cg04996020 cg04996873 cg04997017 cg04999691 cg05000339 cg05005343 cg05006142 cg05006473 cg05008975 cg05010623 cg05012676 cg05028274 cg05029288 cg05038216 cg05039004 cg05041265 cg05044994 cg05047401 cg05048259 cg05048927 cg05050042 cg05050341 cg05050858 cg05054998 cg05062854 cg05063999 cg05073044 cg05075562 cg05078091 cg05081953 cg05083414 cg05088356 cg05089897 cg05091653 cg05091653 cg05093315 cg05093535 cg05094216 cg05097899 cg05098566 cg05105110 cg05106191 cg05109049 cg05110391 cg05110962 cg05111779 cg05116002 cg05118364 cg05120944 cg05124021 cg05127574 cg05127924 cg05128003 cg05129610 cg05130485 cg05130485 cg05134987 cg05138892 cg05139187
g05140806 g05142677 g05143530 g05144259 g05145233 g05154546 g05155595 g05155595 g05159732 g05159799 g05159909 g05163329 g05163588 g05165862 g05167251 g05168229 g05170342 g05170759 g05171937 g05173913 g05175020 g05179645 g05179757 g05186455 g05187247 g05189127 g05189517 g05190718 g05191839 g05194316 g05194362 g05200313 g05205842 g05207048 g05207048 g05207067 g05209514 cg05213661 cg05215004 cg05215004 cg05221167 cg05221664 cg05222671 cg05222924 cg05224741 cg05233128 cg05235171 cg05240166 cg05241143 cg05245070 cg05251000 cg05254747 cg05255168 cg05256043 cg05256204 cg05256612 cg05258294 cg05258757 cg05259836 cg05260236 cg05260466 cg05265234 cg05266796 cg05270106 cg05270634 cg05279137 cg05279738 cg05287481 cg05288172 cg05290695 cg05293510 cg05303999 cg05304729 cg05307752 cg05307957 cg05308317 cg05308617 cg05308819 cg05309179 cg05309505 cg05309989 cg05311180 cg05314394 cg05314622 cg05316065 cg05316065 cg05317396 cg05321960 cg05323683 cg05327192 cg05330472 cg05330921 cg05335030 cg05336982 cg05337753 cg05338167 cg05338167 cg05338384 cg05341539 cg05342835 cg05342945 cg05343689 cg05345286 cg05345310 cg05346878 cg05347108 cg05347334 cg05347898 cg05347965 cg05348366 cg05348708 cg05350879 cg05354929 cg05360477 cg05364072 cg05364884 cg05368762 cg05373256 cg05374956 cg05377162 cg05377587 cg05379509 cg05381692 cg05385282 cg05386769 cg05389236 cg05391892 cg05398700 cg05398883 cg05400732 cg05402891 cg05409038 cg05409218 cg05412696 cg05413628 cg05415840 cg05422883 cg05425699 cg05427381 cg05427639 cg05429117 cg05429895 cg05433391 cg05433642 cg05434870 cg05440289 cg05441133 cg05441133 cg05442902 cg05445326 cg05447100 cg05447556 cg05450477 cg05451210 cg05458052 cg05460571 cg05464506 cg05468303 cg05469118 cg05469695 cg05471495 cg05478818 cg05480110 cg05481929 cg05485379 cg05486872 cg05487105 cg05490023 cg05490233 cg05492113 cg05501357 cg05503433 cg05516390 cg05516499 cg05516773 cg05519105 cg05524246 cg05525374 cg05526364 cg05526731 cg05527091 cg05535113 cg05539265 cg05539509 cg05543520
cg05545635 g05546038 g05546264 g05547777 g05547778 g05548488 g05554936 g05558712 g05560951 g05561386 g05566397 g05568054 g05569131 g05572370 g05573829 g05575213 g05576974 g05576974 g05578055 g05579652 g05580991 g05585149 g05587158 g05587394 g05590294 g05590982 g05592959 g05593669 g05593715 g05595345 g05596756 g05597181 g05597349 g05598886 g05599160 g05602356 g05602648 cg05603252 cg05605029 cg05605377 cg05608541 cg05613718 cg05617027 cg05617798 cg05617980 cg05618647 cg05618767 cg05621339 cg05623392 cg05624196 cg05626226 cg05627441 cg05628549 cg05629781 cg05633152 cg05633523 cg05635754 cg05642264 cg05647567 cg05647756 cg05648303 cg05653400 cg05654163 cg05655953 cg05656364 cg05656364 cg05656374 cg05659947 cg05664039 cg05664072 cg05664352 cg05670596 cg05671644 cg05672569 cg05674437 cg05675373 cg05675373 cg05675373 cg05679002 cg05684195 cg05684891 cg05687083 cg05687091 cg05696153 cg05696406 cg05696678 cg05696950 cg05697249 cg05697976 cg05698069 cg05709468 cg05711710 cg05714496 cg05715492 cg05715998 cg05718034 cg05718253 cg05721858 cg05726109 cg05726239 cg05729480 cg05739476 cg05739816 cg05745631 cg05749855 cg05750926 cg05755408 cg05757907 cg05764061 cg05765734 cg05766064 cg05766140 cg05767159 cg05769344 cg05769889 cg05777919 cg05778820 cg05782888 cg05784193 cg05784951 cg05786601 cg05788638 cg05795157 cg05797594 cg05797770 cg05798059 cg05798125 cg05798126 cg05798147 cg05798501 cg05798664 cg05801374 cg05807991 cg05809668 cg05819268 cg05820959 cg05826295 cg05828992 cg05832051 cg05833610 cg05834895 cg05839235 cg05840553 cg05845533 cg05847233 cg05849676 cg05852143 cg05852537 cg05854261 cg05855347 cg05857825 cg05859264 cg05859264 cg05861567 cg05869392 cg05874478 cg05875410 cg05876174 cg05877497 cg05878337 cg05878558 cg05879334 cg05884705 cg05887405 cg05887405 cg05888583 cg05889541 cg05890550 cg05890855 cg05892329 cg05895353 cg05895507 cg05898545 cg05898591 cg05901196 cg05906024 cg05907976 cg05911990 cg05915004 cg05916707 cg05917732 cg05917748 cg05921889 cg05921905 cg05923681
g05926314 g05926640 g05926784 g05927017 g05934333 g05936004 g05938409 g05940691 g05941634 g05947740 g05948372 g05948763 g05949173 g05949331 g05949640 g05956452 g05957544 g05958352 g05959508 g05959508 g05959932 g05960024 g05963604 g05963690 g05966228 g05967596 g05968188 g05968369 g05971966 g05973398 g05973772 g05976325 g05979232 g05980719 g05981907 g05984244 g05986288 cg05989312 cg05989861 cg05991442 cg05995220 cg05995267 cg05999324 cg06000556 cg06005169 cg06008435 cg06010390 cg06010724 cg06013113 cg06021088 cg06022562 cg06023345 cg06024930 cg06029308 cg06029700 cg06030535 cg06033531 cg06033721 cg06035970 cg06038201 cg06039355 cg06043201 cg06043315 cg06048436 cg06051311 cg06055392 cg06059810 cg06061966 cg06062571 cg06064964 cg06069441 cg06070445 cg06072835 cg06074534 cg06075311 cg06077738 cg06079273 cg06079710 cg06080300 cg06085890 cg06093719 cg06096336 cg06097580 cg06098276 cg06099014 cg06101212 cg06104877 cg06107816 cg06113789 cg06114334 cg06119575 cg06120000 cg06121469 cg06130322 cg06131338 cg06134860 cg06137032 cg06139749 cg06142324 cg06144905 cg06147895 cg06148264 cg06149733 cg06150803 cg06151165 cg06151171 cg06154570 cg06154597 cg06155620 cg06156376 cg06158434 cg06161697 cg06162324 cg06172871 cg06173663 cg06175036 cg06176929 cg06182311 cg06184926 cg06185532 cg06186245 cg06186808 cg06197966 cg06198069 cg06201642 cg06202585 cg06204101 cg06204730 cg06204948 cg06206670 cg06206957 cg06209035 cg06209197 cg06210783 cg06211724 cg06213287 cg06213287 cg06214007 cg06216883 cg06218079 cg06219103 cg06228542 cg06228828 cg06232466 cg06235390 cg06237151 cg06240947 cg06241101 cg06243866 cg06244417 cg06257052 cg06257378 cg06269753 cg06271128 cg06275788 cg06277849 cg06282059 cg06285337 cg06285340 cg06290096 cg06294470 cg06294561 cg06295238 cg06298519 cg06298740 cg06302803 cg06305609 cg06306636 cg06310844 cg06315390 cg06316121 cg06319919 cg06320380 cg06322557 cg06325209 cg06325540 cg06326072 cg06328338 cg06329392 cg06330323 cg06332339 cg06334857 cg06336792 cg06338119 cg06339573
g06339606 g06341701 g06341721 g06346857 g06349174 g06352352 g06352750 g06353345 g06353720 g06354543 g06356912 g06357940 g06358171 g06358671 g06359931 g06361405 g06362313 g06363129 g06363801 g06366981 g06371489 g06372779 g06374962 g06376598 g06378107 g06379876 g06380725 g06385583 g06386517 g06386983 g06387622 g06388350 g06388363 g06389019 g06392426 g06392426 g06393679 cg06393830 cg06394229 cg06394229 cg06396724 cg06398643 cg06399427 cg06400745 cg06407371 cg06410591 cg06413794 cg06415153 cg06417460 cg06417962 cg06419432 cg06419846 cg06420903 cg06431953 cg06432753 cg06433467 cg06436185 cg06436854 cg06442489 cg06444781 cg06452129 cg06454084 cg06457357 cg06460328 cg06464468 cg06466782 cg06470626 cg06475541 cg06475764 cg06475764 cg06478823 cg06482904 cg06483795 cg06485706 cg06486088 cg06487082 cg06487870 cg06488150 cg06488678 cg06489418 cg06493994 cg06495233 cg06495961 cg06496222 cg06496728 cg06502570 cg06503456 cg06507244 cg06510617 cg06514371 cg06516124 cg06516502 cg06517181 cg06518271 cg06518271 cg06520450 cg06520821 cg06521347 cg06522833 cg06523556 cg06525453 cg06525670 cg06528306 cg06534853 cg06540636 cg06544111 cg06547766 cg06549275 cg06550165 cg06550629 cg06554069 cg06555468 cg06556593 cg06557376 cg06560754 cg06564132 cg06564900 cg06567855 cg06570224 cg06570224 cg06570358 cg06571387 cg06572160 cg06580318 cg06582663 cg06585203 cg06590173 cg06593906 cg06594281 cg06601666 cg06604467 cg06606949 cg06610259 cg06610548 cg06612355 cg06613392 cg06614002 cg06615154 cg06615380 cg06616710 cg06617528 cg06620254 cg06620390 cg06620723 cg06621784 cg06625767 cg06625767 cg06627043 cg06627617 cg06630241 cg06634717 cg06634862 cg06635797 cg06636541 cg06637330 cg06637550 cg06637618 cg06638156 cg06638451 cg06638913 cg06639320 cg06639320 cg06640279 cg06640593 cg06641366 cg06643882 cg06646494 cg06650260 cg06650260 cg06655100 cg06655216 cg06657721 cg06660522 cg06663068 cg06665109 cg06665322 cg06667574 cg06668073 cg06675538 cg06676049 cg06677151 cg06679087 cg06680481 cg06681566 cg06682039
g06685111 g06685737 g06688182 g06691343 g06692050 g06694381 g06694561 g06694734 g06699564 g06702718 g06703803 g06706670 g06706813 g06707993 g06708237 g06708255 g06710672 g06713098 g06717565 g06717750 g06720467 g06721601 g06721712 g06722069 g06723829 g06724019 g06724078 g06724588 g06728055 g06733794 g06738887 g06739004 g06740897 g06746318 g06748147 g06749053 g06752054 cg06754197 cg06757810 cg06760830 cg06761530 cg06765947 cg06766367 cg06769202 cg06769820 cg06774703 cg06778853 cg06780032 cg06781209 cg06783429 cg06786219 cg06787669 cg06788514 cg06790324 cg06792154 cg06794543 cg06794581 cg06795722 cg06800962 cg06801857 cg06801994 cg06811300 cg06815112 cg06818532 cg06818777 cg06820990 cg06823060 cg06824394 cg06825878 cg06836020 cg06837040 cg06841832 cg06844526 cg06848185 cg06848775 cg06850687 cg06855803 cg06856155 cg06856687 cg06857116 cg06864391 cg06867822 cg06869505 cg06871974 cg06872331 cg06872381 cg06873916 cg06874016 cg06874144 cg06879394 cg06880420 cg06880930 cg06882877 cg06888121 cg06888746 cg06889746 cg06893273 cg06893273 cg06894812 cg06898823 cg06900821 cg06901238 cg06906087 cg06909248 cg06909646 cg06911113 cg06911354 cg06911744 cg06912282 cg06913345 cg06913958 cg06931356 cg06933965 cg06939307 cg06942770 cg06945634 cg06945807 cg06951326 cg06954481 cg06958829 cg06960457 cg06960600 cg06961025 cg06967304 cg06980053 cg06981182 cg06983551 cg06986263 cg06989253 cg06991495 cg06991732 cg06993191 cg06995003 cg06995715 cg06998238 cg06998238 cg07002058 cg07002201 cg07006325 cg07006526 cg07006935 cg07007400 cg07009002 cg07011913 cg07014174 cg07017114 cg07024339 cg07025312 cg07025989 cg07027075 cg07027075 cg07028533 cg07028914 cg07029024 cg07030727 cg07031797 cg07036035 cg07038187 cg07039180 cg07039423 cg07041323 cg07042007 cg07044458 cg07046030 cg07053114 cg07053546 cg07056057 cg07064050 cg07064544 cg07065759 cg07067993 cg07068768 cg07071449 cg07075930 cg07082267 cg07085167 cg07086380 cg07089056 cg07092805 cg07093485 cg07099000 cg07101841 cg07101926 cg07103618 cg07104706
g07113653 g07118376 g07119315 g07120346 g07120889 g07125991 g07126783 g07126979 g07128900 g07131274 g07132492 g07133930 g07135032 g07136054 g07137244 g07139440 g07139440 g07140459 g07141504 g07142893 g07144026 g07145664 g07148645 g07151747 g07154944 g07158339 g07160420 g07160602 g07160871 g07161369 g07162000 g07164133 g07166171 g07174665 g07175582 g07178563 g07178825 cg07180212 cg07180538 cg07184578 cg07185131 cg07185664 cg07186138 cg07186138 cg07186962 cg07188523 cg07190763 cg07195577 cg07197230 cg07204724 cg07205203 cg07207670 cg07214314 cg07216133 cg07216194 cg07216436 cg07220152 cg07221258 cg07221454 cg07221454 cg07223106 cg07224221 cg07229767 cg07230792 cg07230999 cg07236190 cg07237830 cg07237830 cg07237939 cg07241170 cg07243141 cg07248223 cg07249730 cg07250128 cg07251141
cg07259687 cg07265541 cg07266350 cg07266404 cg07266412 cg07268431 cg07269138 cg07273304 cg07275179 cg07280105 cg07281370 cg07283896 cg07285167 cg07292237 cg07292816 cg07294541 cg07297322 cg07297896 cg07298431 cg07299510 cg07300408 cg07302959 cg07305933 cg07307078 cg07308257 cg07309102 cg07313162 cg07313319 cg07313504 cg07314337 cg07315493 cg07317846 cg07318983 cg07319315 cg07324116 cg07327468 cg07328796 cg07330114 cg07338464 cg07339393 cg07344019 cg07347049 cg07347148 cg07351322 cg07352054 cg07354008 cg07354440 cg07354440 cg07355507 cg07356342 cg07356549 cg07359545 cg07360250 cg07361056 cg07363637 cg07366188 cg07366553 cg07367113 cg07368069 cg07372034 cg07374632 cg07380416 cg07380496 cg07384961 cg07385362 cg07388493 cg07390647 cg07392324 cg07395000 cg07398429 cg07399288 cg07403228 cg07405796 cg07409471 cg07414392 cg07418387 cg07419011 cg07420137 cg07420232 cg07423149 cg07424155 cg07428907 cg07433769 cg07438401 cg07439056 cg07441272 cg07442479 cg07443710 cg07448060 cg07450210 cg07451370 cg07451524 cg07452799 cg07455685 cg07455975 cg07457785 cg07458272 cg07459019 cg07460010 cg07463059 cg07463059 cg07464206 cg07467716 cg07469445 cg07469594 cg07470207 cg07471052 cg07472373 cg07473175 cg07477924
g07478098 g07479030 g07484220 g07486017 g07486252 g07493499 g07498879 g07498879 g07499032 g07507559 g07516307 g07519235 g07522403 g07525077 g07526974 g07530759 g07531516 g07532183 g07533148 g07533511 g07536914 g07537750 g07537821 g07538039 g07541559 g07544187 g07544187 g07547549 g07550267 g07551060 g07553761 g07553761 g07554046 g07555102 g07555397 g07556151 g07558153 cg07558704 cg07559526 cg07560096 cg07560587 cg07567376 cg07571734 cg07573965 cg07580128 cg07581973 cg07583137 cg07585069 cg07585257 cg07589342 cg07589991 cg07597386 cg07598052 cg07601148 cg07602008 cg07602984 cg07602998 cg07613752 cg07618085 cg07623567 cg07627464 cg07636142 cg07641284 cg07641807 cg07643912 cg07644807 cg07645228 cg07646467 cg07651914 cg07651914 cg07652854 cg07654934 cg07658508 cg07661480 cg07664000 cg07664029 cg07665060 cg07665466 cg07665510 cg07668993 cg07669260 cg07670266 cg07671949 cg07672479 cg07675184 cg07675656 cg07675682 cg07677157 cg07684152 cg07685034 cg07686872 cg07690734 cg07690768 cg07693270 cg07695771 cg07697227 cg07697256 cg07700837 cg07705908 cg07706776 cg07708516 cg07710481 cg07713361 cg07713361 cg07717632 cg07721569 cg07725925 cg07727358 cg07728579 cg07733247 cg07733918 cg07734975 cg07736115 cg07737063 cg07739205 cg07740599 cg07740640 cg07740705 cg07747924 cg07749074 cg07749951 cg07756788 cg07759857 cg07761912 cg07763768 cg07763768 cg07769421 cg07771727 cg07772309 cg07776993 cg07777540 cg07778315 cg07780118 cg07782795 cg07783183 cg07785552 cg07785936 cg07786675 cg07786995 cg07789083 cg07790638 cg07795766 cg07799299 cg07802350 cg07803375 cg07804470 cg07805542 cg07806886 cg07808712 cg07811634 cg07816074 cg07817608 cg07818646 cg07823492 cg07824422 cg07832674 cg07833420 cg07837085 cg07837534 cg07838427 cg07839536 cg07842386 cg07846220 cg07846737 cg07850154 cg07850477 cg07850967 cg07858728 cg07858728 cg07859439 cg07860918 cg07863354 cg07864632 cg07864632 cg07864883 cg07864976 cg07866001 cg07869023 cg07871153 cg07873488 cg07876051 cg07879785 cg07880109 cg07883333 cg07883457
g07885191 g07887891 g07890238 g07890954 g07895149 g07897701 g07897871 g07903860 g07903860 g07904452 g07906688 g07906724 g07907670 g07908654 g07910680 g07911353 g07911905 g07912922 g07915117 g07917502 g07920503 g07920503 g07921144 g07922606 g07925867 g07926491 g07927379 g07927379 g07927953 g07928191 g07932300 g07935264 g07936037 g07940011 g07945906 g07946277 g07946977 cg07948480 cg07949060 cg07949863 cg07953015 cg07955887 cg07955995 cg07955995 cg07958192 cg07960360 cg07965335 cg07972322 cg07974511 cg07974890 cg07982208 cg07982740 cg07989221 cg07991621 cg07993112 cg07999415 cg08000684 cg08003150 cg08008692 cg08010865 cg08015762 cg08016257 cg08018572 cg08021727 cg08024766 cg08024992 cg08028295 cg08032476 cg08034413 cg08036764 cg08041408 cg08041603 cg08044694 cg08047457 cg08047907 cg08056069 cg08056146 cg08057038 cg08057475 cg08059845 cg08060322 cg08068820 cg08071700 cg08071719 cg08076018 cg08076158 cg08077071 cg08077673 cg08079330 cg08080923 cg08082763 cg08084788 cg08087868 cg08089301 cg08090772 cg08090772 cg08093097 cg08093568 cg08097417 cg08097417 cg08098128 cg08100149 cg08102516 cg08105396 cg08105834 cg08106279 cg08106393 cg08106973 cg08110785 cg08111895 cg08118241
$08123444
$08126211
$08128361
$08128734
$08128768
$08130265
$08131059
$08135379
$08137085
$08139247
$08141395
$08147187
$08151470
$08155116
$08155625
$08157310
$08157638
$08161491
$08169778
$08173959
$08179530
$08182975
$08183300
$08185095
$08186362
$08189989
$08191854
$08196106
$08196512
$08200851
$08201451
$08203284
$08203715
$08208317
$08209184
$08210297
$08219183
cg08220149 cg08223235 cg08224212 cg08224238 cg08224785 cg08233909 cg08234504 cg08237401 cg08239282 cg08241465 cg08241785 cg08243465 cg08247289 cg08248751 cg08249424 cg08250921 cg08253808 cg08254089 cg08255233 cg08256691 cg08258650 cg08261094 cg08261841 cg08261841 cg08262534 cg08263647 cg08264885 cg08264906 cg08268099 cg08269188 cg08269316 cg08270005 cg08278554 cg08278731 cg08282819 cg08284213 cg08287471
g08293531 g08294044 g08296903 g08301503 g08305436 g08308801 g08310400 g08310837 g08311321 g08313420 g08314996 g08315613 g08321272 g08324862 g08327151 g08328160 g08331313 g08332074 g08337959 g08341874 g08342134 g08342194 g08343834 g08349093 g08351489 g08354372 g08360728 g08361180 g08363345 g08363794 g08365738 g08368520 g08368654 g08370996 g08371532 g08373573 g08374799 cg08376310 cg08378742 cg08379987 cg08381620 cg08383315 cg08383315 cg08385097 cg08390172 cg08393516 cg08396985 cg08399444 cg08399733 cg08400124 cg08400494 cg08401628 cg08403043 cg08408433 cg08409642 cg08411881 cg08415592 cg08415731 cg08418978 cg08422599 cg08422793 cg08424966 cg08425796 cg08432452 cg08432727 cg08441170 cg08441314 cg08441806 cg08441850 cg08442149 cg08443563 cg08443845 cg08446038 cg08448479 cg08452327 cg08452348 cg08452964 cg08454015 cg08457178 cg08457620 cg08461840 cg08465346 cg08466082 cg08467103 cg08467371 cg08468689 cg08469255 cg08469834 cg08469834 cg08472583 cg08474164 cg08474786 cg08480068 cg08482837 cg08483376 cg08483876 cg08483876 cg08489309 cg08491681 cg08494871 cg08495126 cg08495878 cg08495878 cg08497239 cg08499046 cg08501292 cg08501402 cg08504583 cg08504583 cg08505243 cg08506113 cg08507270 cg08508455 cg08508763 cg08514736 cg08517455 cg08519905 cg08523456 cg08525145 cg08528170 cg08528204 cg08529529 cg08539620 cg08540945 cg08542351 cg08543028 cg08545136 cg08548498 cg08549335 cg08552167 cg08554257 cg08558886 cg08560874 cg08564172 cg08570458 cg08572611 cg08577953 cg08578703 cg08583240 cg08586426 cg08595667 cg08597067 cg08598221 cg08604594 cg08605773 cg08610901 cg08614481 cg08614481 cg08615333 cg08618173 cg08621624 cg08621778 cg08621957 cg08622198 cg08625803 cg08626653 cg08626653 cg08627125 cg08628428 cg08636573 cg08639762 cg08639799 cg08643646 cg08643928 cg08644341 cg08647446 cg08651590 cg08654960 cg08655844 cg08655953 cg08659204 cg08660295 cg08663109 cg08663890 cg08667600 cg08667721 cg08667721 cg08670465 cg08677617 cg08679238 cg08680085 cg08684511 cg08687163 cg08687386 cg08687753
g08688393 g08693490 g08695223 g08696107 g08696192 g08698523 g08703595 g08704934 g08705647 g08706141 g08706258 g08706258 g08709276 g08709385 g08711067 g08716982 g08717880 g08718097 g08719712 g08719712 g08724517 g08724636 g08725319 g08730070 g08730743 g08731435 g08732352 g08734053 g08734477 g08736918 g08744726 g08749443 g08752433 g08757624 g08758887 g08761208 g08761396 cg08762247 cg08764162 cg08764925 cg08771408 cg08773462 cg08775230 cg08779649 cg08779777 cg08779982 cg08783253 cg08785133 cg08790491 cg08796240 cg08797471 cg08798116 cg08802944 cg08804013 cg08804013 cg08804892 cg08804892 cg08806408 cg08808720 cg08808812 cg08810397 cg08811259 cg08812108 cg08813925 cg08818337 cg08818866 cg08818984 cg08822227 cg08823554 cg08823975 cg08823985 cg08824221 cg08826839 cg08830105 cg08830300 cg08831594 cg08833741 cg08836954 cg08839808 cg08841544 cg08845722 cg08846002 cg08846566 cg08847737 cg08847775 cg08857906 cg08858649 cg08858751 cg08861115 cg08862479 cg08872550 cg08875705 cg08877357 cg08878368 cg08879910 cg08884974 cg08886154 cg08887400 cg08888905 cg08889009 cg08890883 cg08891110 cg08893839 cg08897054 cg08900426 cg08901662 cg08905080 cg08906015 cg08908855 cg08911152 cg08924430 cg08924430 cg08924619 cg08934785 cg08939850 cg08943045 cg08943107 cg08944236 cg08945711 cg08946844 cg08951452 cg08951958 cg08954277 cg08954352 cg08956101 cg08957484 cg08957484 cg08960448 cg08965235 cg08965337 cg08965685 cg08972170 cg08975445 cg08981777 cg08988543 cg08992581 cg09007236 cg09011038 cg09014775 cg09018810 cg09018824 cg09019648 cg09022325 cg09022584 cg09022808 cg09025324 cg09029193 cg09036996 cg09037813 cg09038267 cg09038676 cg09038914 cg09038962 cg09039672 cg09042277 cg09043518 cg09046168 cg09050670 cg09051630 cg09053536 cg09053680 cg09059945 cg09061733 cg09062638 cg09064486 cg09067465 cg09068128 cg09069446 cg09075787 cg09077096 cg09080173 cg09081544 cg09083627 cg09083627 cg09089421 cg09092280 cg09093409 cg09095122 cg09101941 cg09107055 cg09109383 cg09115473 cg09118625 cg09119494 cg09119665
g09120035 g09129067 g09130288 g09134314 g09138892 g09146232 g09147068 g09153080 g09158314 g09159452 g09163035 g09167825 g09169117 g09169796 g09169874 g09173768 g09175724 g09175724 g09179845 g09183671 g09186006 g09187107 g09190408 g09192940 g09193479 g09203199 g09222115 g09225287 g09226692 g09226692 g09227119 g09227533 g09229231 g09229912 g09229960 g09234616 g09238199 cg09238677 cg09238992 cg09240095 cg09244071 cg09244707 cg09247255 cg09247619 cg09249152 cg09250087 cg09251197 cg09252677 cg09256448 cg09257635 cg09270514 cg09272948 cg09274810 cg09276158 cg09279942 cg09283043 cg09286367 cg09287096 cg09287864 cg09293816 cg09297468 cg09298313 cg09299055 cg09300089 cg09303236 cg09303642 cg09305503 cg09307985 cg09308639 cg09311052 cg09313745 cg09318283 cg09318763 cg09319815 cg09321019 cg09322259 cg09325711 cg09326702 cg09331986 cg09334629 cg09336988 cg09337563 cg09340279 cg09340639 cg09340639 cg09341015 cg09342997 cg09347151 cg09347582 cg09349409 cg09349530 cg09350274 cg09353052 cg09354037 cg09356442 cg09356916 cg09358071 cg09360041 cg09362796 cg09363735 cg09365002 cg09366118 cg09373786 cg09374838 cg09374949 cg09375033 cg09376583 cg09377980 cg09383816 cg09387749 cg09394128 cg09394600 cg09396068 cg09396865 cg09399281 cg09400037 cg09401099 cg09401099 cg09404617 cg09408143 cg09410271 cg09410389 cg09410512 cg09410871 cg09411922 cg09412069 cg09412619 cg09412707 cg09414535 cg09414827 cg09418984 cg09421083 cg09425279 cg09427944 cg09430118 cg09433910 cg09434500 cg09434500 cg09435227 cg09435920 cg09436823 cg09440340 cg09450200 cg09451235 cg09452568 cg09453760 cg09458420 cg09459339 cg09460229 cg09461420 cg09462575 cg09469554 cg09469667 cg09470010 cg09470059 cg09471455 cg09473180 cg09473585 cg09476997 cg09479286 cg09480190 cg09481404 cg09481537 cg09482780 cg09483043 cg09491709 cg09494609 cg09496762 cg09499629 cg09499629 cg09499698 cg09499844 cg09503045 cg09506001 cg09507934 cg09510077 cg09510476 cg09510752 cg09511662 cg09511741 cg09513469 cg09522147 cg09527126 cg09527670 cg09531959
g09532502 g09536336 g09537259 g09537621 g09539538 g09540676 g09541248 g09541794 g09547190 g09548403 g09548780 g09550083 g09550909 g09554443 g09555736 g09556515 g09557149 g09561365 g09563216 g09564133 g09569432 g09571345 g09571369 g09574499 g09577651 g09578475 g09580336 g09582042 g09588360 g09592463 g09595079 g09595163 g09595185 g09596645 g09596975 g09597022 g09599740 cg09600715 cg09606564 cg09607548 cg09610332 cg09615821 cg09621330 cg09621472 cg09626984 cg09630706 cg09632029 cg09632136 cg09632273 cg09634469 cg09634469 cg09634659 cg09635866 cg09636525 cg09636715 cg09638208 cg09639735 cg09639964 cg09640070 cg09643186 cg09643186 cg09643398 cg09644974 cg09645888 cg09645993 cg09646593 cg09647671 cg09647884 cg09650180 cg09651136 cg09652142 cg09654261 cg09657114 cg09664216 cg09666573 cg09667289 cg09667303 cg09667606 cg09669754 cg09676390 cg09678836 cg09678939 cg09682183 cg09683258 cg09685096 cg09686013 cg09688546 cg09692396 cg09694403 cg09698220 cg09704415 cg09706243 cg09709457 cg09712216 cg09716613 cg09721047 cg09721047 cg09726703 cg09727050 cg09728102 cg09728393 cg09728487 cg09729182 cg09729848 cg09729848 cg09730500 cg09731211 cg09731745 cg09734418 cg09744051 cg09747827 cg09748975 cg09755102 cg09755872 cg09759289 cg09761080 cg09761224 cg09762021 cg09768859 cg09769113 cg09774287 cg09774917 cg09775312 cg09781994 cg09787504 cg09789650 cg09790137 cg09791621 cg09797337 cg09797390 cg09798023 cg09800500 cg09804503 cg09806262 cg09806318 cg09806934 cg09809672 cg09809672 cg09814128 cg09816180 cg09818397 cg09822907 cg09827048 cg09827833 cg09831553 cg09832911 cg09835220 cg09836395 cg09837648 cg09837977 cg09839592 cg09842331 cg09844573 cg09845205 cg09847626 cg09851343 cg09852744 cg09853702 cg09854011 cg09858224 cg09859040 cg09863441 cg09864325 cg09864712 cg09866303 cg09866569 cg09867883 cg09869144 cg09869167 cg09870609 cg09871315 cg09871315 cg09872616 cg09882118 cg09884146 cg09887589 cg09890400 cg09891226 cg09893305 cg09895029 cg09896345 cg09896412 cg09899868 cg09902130 cg09902130
$09905852 $09906995 $09908110 $09911316 $09914773 $09915444 $09919917 $09921821 $09923855 $09927251 $09931909 $09933836 $09935667 $09936561 $09937039 $09938227 $09938408 $09938881 $09940675 $09947844 $09948350 $09948419 $09954385 $09960553 $09962377 $09962952 $09964625 $09965668 $09966895 $09967440 $09967487 $09975620 $09978533 $09987889 $09988116 $09988805 ?09992387
eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg
cg09994356
10003766 10005998 10007534 10009801 10010780 10011232 10012393 10013716 10018933 10020892 10024587 10025514 10025586 10029411 10030684 10031651 10037005 10037913 10039299 10045881 10045881 10047173 10049535 10052840 10055471 10055580 10056482 10057264 10061770 10062065 10064162 10064162 10068464 10077746 10078415 10078415
eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg
10080732 10084370 10088985 10089145 10090241 10090326 10096100 10097313 10098888 10098888 10099209 10099572 10100220 10106388 10108296 10110271 10113231 10114327 10119288 10120807 10122103 10126181 10126234 10126372 10126903 10135483 10136560 10140240 10141942 10142237 10143751 10146216 10148280 10150530 10150813 10151248 10151367
eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg
10153214 10156217 10156302 10157208 10157926 10158280 10159529 10161111 10163955 10165071 10165847 10166090 10170214 10170504 10172783 10173075 10174683 10174687 10175203 10183885 10185478 10186347 10187713 10190509 10191240 10194536 10194829 10195215 10199606 10203943 10210094 10211252 10211776 10211877 10219037 10221896 10222534
eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg eg
10224037 10226546 10228500 10235116 10235741 10235741 10237362 10237911 10244368 10245048 10249506 10249734 10256052 10256976 10257049 10259521 10259872 10261191 10261191 10262747 10266490 10268345 10271186 10272731 10275766 10278046 10283505 10283844 10284771 10287137 10288525 10293925 10294820 10298741 10299448 10300684 10307052
10310595
L0402715
10503138
10568796
10665616
10313047
10415021
10503298
10569414
10667970
10317145
10416814
10504392
10570544
10668926
10319505
10417457
10505610
10572670
10669449
10319857
10418263
10506618
10580335
10671066
10322876
10418626
10507231
10581876
10673740
10328877
10419849
10507988
10584024
10673833
10328877
10420756
10508783
10586672
10680621
10329579
10423607
10510478
10586756
10681065
10329928
10427868
10518264
10588962
10681065
10331100
10434728
10522770
10589577
10681125
10331779
10435245
10523019
10590292
10681137
10331989
[0440196
10523019
10591174
10687219
L0334121
[0441691
10523671
10593400
10690440
L0345936
[0445708
10523671
10594510
10692870
L0347828
[0451565
10525372
10597661
10700634
10351284
[0452704
10525372
10599446
10700718
10351808
[0453365
10528989
10599948
10704263
10356463
[0454596
10528989
10601002
10707788
10361765
[0455321
[0530767
10602180
[0708675
10362475
[0456035
[0531355
10608333
[0708739
10362842
eg]
[0458216
[0536999
10608341
[0708793
10364040
eg]
[0463451
[0539700
10609310
[0713002
10367244
eg]
0464529
[0539808
10612997
[0713589
10369688
eg]
0474368
[0540679
10621597
[0714284
10369955
eg]
0475153
10542975
10627737
10715426
[0370591
eg]
0475433
cgl
[0546562
10628699
[0720966
[0371483
eg]
0488141
eg]
[0547050
10629165
eg]
[0722267
[0375964
eg]
0488141
eg]
[0548978
10634551
eg]
[0722799
[0376161
eg]
0490577
eg]
[0549973
10646968
eg]
[0723020
[0378521
eg]
0491452
eg]
[0550416
10651637
eg]
[0725344
[0379653
eg]
0493436
eg]
0552385
10653926
eg]
0725623
[0381113
cgl
0496150
eg]
0556636
[0655371
eg]
0727820
eg]
[0393811
cgl
0498502
eg]
0557552
[0657965
eg]
0728503
eg]
[0395252
cgl
0500167
eg]
0558740
[0660136
eg]
0732834
eg]
[0398682
eg]
0500219
eg]
0559416
[0660256
eg]
0734665
eg]
[0398761
eg]
0501210
eg]
0562586
[0663144
eg]
0735211
10735319
10808195
10878966
10977667
eg]
1081833
Ю746447
10809560
10881071
10977795
eg]
1083235
10750182
10818284
10884539
10981439
eg]
1084015
10752575
10820936
10888111
10982851
eg]
1084035
10753836
10821226
10894453
10983853
eg]
1084266
10754777
10824722
10894512
10985914
eg]
1084518
10762199
10827768
10894512
10991454
eg]
1086066
10764068
10830496
10896609
10993460
eg]
1090582
10764357
10830649
10896774
10996148
eg]
1091914
10765212
10833014
10899274
10996589
eg]
1093142
10767216
10833014
10899768
10999312
eg]
1099899
10768321
10834893
10900049
11003133
eg]
1100658
10768932
10835083
10904856
11005826
eg]
1100795
10769844
10835286
10905180
11009596
eg]
1104416
10770662
10836733
10918927
11009695
eg]
1105292
10773016
10837843
10920224
11011736
eg]
1108115
10775551
10841253
10924857
11014468
eg]
1113216
10775595
10841756
10925082
11014921
eg]
1114141
10777461
10845380
10925991
11028052
eg]
1114242
10784030
10846328
10928544
11032640
eg]
1114465
10784090
10849854
10931190
11033833
eg]
1116288
10784341
10850791
10933959
11036962
eg]
1118198
10784511
10850791
10935064
11042320
eg]
1119131
10784519
10851763
10935064
11051843
eg]
1119596
10786043
10857807
10944063
11052516
eg]
1119760
10787197
10858686
10947827
11052535
eg]
1119767
10790704
10861751
10949007
11053489
eg]
1122255
10791260
10861751
10949322
11055493
eg]
1123720
10791260
10861897
10950111
11055795
eg]
1124350
10791959
10862567
10950297
11057497
eg]
1132661
10792302
10863207
10952925
11065271
eg]
1136886
10797850
10863922
10954765
11066209
eg]
1142013
10798171
10865887
10956857
11067179
eg]
1146550
10801752
10872447
10958452
11069338
eg]
1148581
10803871
10874403
10960632
11073558
eg]
1155222
10804656
10876767
10969178
11073811
eg]
1157816
10805254
10878307
10976772
11075693
eg]
1158374
cgl
1161417
cgl
1243304
cgl
1314274
cgl
1394785
cgl
1482422
cgl
1164400
cgl
1246695
cgl
1314684
cgl
1395414
cgl
1484353
cgl
1166108
cgl
1247674
cgl
1316131
cgl
1397957
cgl
1484576
cgl
1171719
cgl
1251858
cgl
1319403
cgl
1399508
cgl
1484721
cgl
1172483
cgl
1252765
cgl
1321156
cgl
1403907
cgl
1486694
cgl
1176159
cgl
1252953
cgl
1328885
cgl
1404751
cgl
1507178
cgl
1176990
cgl
1254361
cgl
1334870
cgl
1407345
cgl
1508406
cgl
1176990
cgl
1254532
cgl
1335133
cgl
1408395
cgl
1508714
cgl
1179695
cgl
1255230
cgl
1335171
cgl
1413133
cgl
1510131
cgl
1180129
cgl
1255590
cgl
1339587
cgl
1416290
cgl
1510182
cgl
1180966
cgl
1257728
cgl
1340260
cgl
1418389
cgl
1511084
cgl
1183227
cgl
1271605
cgl
1342468
cgl
1420192
cgl
1525409
cgl
1192895
cgl
1272332
cgl
1343177
cgl
1421073
cgl
1526198
cgl
1194132
cgl
1272491
cgl
1343941
cgl
1422964
cgl
1526413
cgl
1196788
cgl
1272874
cgl
1344572
cgl
1423130
cgl
1528101
cgl
1197101
cgl
1276198
cgl
1345909
cgl
1423517
cgl
1528176
cgl
1197258
cgl
1282353
cgl
1345955
cgl
1423891
cgl
1528914
cgl
1197945
cgl
1284147
cgl
1346669
cgl
1429271
cgl
1530678
cgl
1198895
cgl
1285496
cgl
1348165
cgl
1430077
cgl
1534596
cgl
1199506
cgl
1285912
cgl
1350833
cgl
1432797
cgl
1534680
cgl
1200568
cgl
1286122
cgl
1351709
cgl
1432797
cgl
1536940
cgl
1201447
cgl
1286122
cgl
1354603
cgl
1433866
cgl
1540997
cgl
1204212
cgl
1290188
cgl
1356247
cgl
1436025
cgl
1542165
cgl
1208222
cgl
1290225
cgl
1357542
cgl
1436113
cgl
1542336
cgl
1209394
cgl
1290265
cgl
1358199
cgl
1441617
cgl
1544522
cgl
1213150
cgl
1290720
cgl
1360860
cgl
1445797
cgl
1544657
cgl
1214889
cgl
1291003
cgl
1363527
cgl
1447335
cgl
1546385
cgl
1219400
cgl
1291009
cgl
1365617
cgl
1452043
cgl
1547724
cgl
1219883
cgl
1296937
cgl
1366178
cgl
1452329
cgl
1550234
cgl
1225528
cgl
1300809
cgl
1377136
cgl
1456838
cgl
1550865
cgl
1226328
cgl
1304234
cgl
1380051
cgl
1464160
cgl
1558551
cgl
1227141
cgl
1306767
cgl
1384014
cgl
1464842
cgl
1559446
cgl
1228682
cgl
1308319
cgl
1389172
cgl
1468363
cgl
1566244
cgl
1233153
cgl
1310496
cgl
1389756
cgl
1468953
cgl
1571702
cgl
1235297
cgl
1312353
cgl
1391732
cgl
1469587
cgl
1572340
cgl
1235787
cgl
1313468
cgl
1393848
cgl
1472424
cgl
1574745
cgl
1240230
cgl
1314042
cgl
1393995
cgl
1473104
cgl
1576424
cgl
1582226
cgl
1653466
cgl
1738724
cgl
1822932
cgl
1884933
cgl
1582403
cgl
1653864
cgl
1739297
cgl
1822964
cgl
1886187
cgl
1582717
cgl
1654662
cgl
1743827
cgl
1825899
cgl
1893698
cgl
1584098
cgl
1656547
cgl
1748640
cgl
1829371
cgl
1895696
cgl
1584690
cgl
1657808
cgl
1750962
cgl
1829528
cgl
1902362
cgl
1584936
cgl
1659747
cgl
1752275
cgl
1832281
cgl
1903177
cgl
1585071
cgl
1667117
cgl
1753018
cgl
1834106
cgl
1903920
cgl
1586448
cgl
1668844
cgl
1754185
cgl
1836119
cgl
1905488
cgl
1588197
cgl
1669824
cgl
1754778
cgl
1838152
cgl
1906718
cgl
1590700
cgl
1672772
cgl
1756734
cgl
1840467
cgl
1911305
cgl
1591485
cgl
1676024
cgl
1761622
cgl
1841231
cgl
1911769
cgl
1592951
cgl
1684826
cgl
1775215
cgl
1841704
cgl
1912239
cgl
1594833
cgl
1691300
cgl
1779113
cgl
1846905
cgl
1924260
cgl
1597131
cgl
1692070
cgl
1780549
cgl
1847636
cgl
1930477
cgl
1598720
cgl
1692191
cgl
1782635
cgl
1847992
cgl
1932387
cgl
1599981
cgl
1692307
cgl
1783497
cgl
1847992
cgl
1934832
cgl
1600161
cgl
1693019
cgl
1784887
cgl
1854877
cgl
1935248
cgl
1609668
cgl
1693709
cgl
1786338
cgl
1855117
cgl
1936809
cgl
1611676
cgl
1693709
cgl
1786870
cgl
1855555
cgl
1938832
cgl
1615029
cgl
1700490
cgl
1791526
cgl
1855643
cgl
1946165
cgl
1617144
cgl
1701148
cgl
1793332
cgl
1857093
cgl
1946165
cgl
1617484
cgl
1701148
cgl
1796233
cgl
1857142
cgl
1946583
cgl
1619216
cgl
1703007
cgl
1797226
cgl
1859594
cgl
1947493
cgl
1624479
cgl
1706911
cgl
1800672
cgl
1861709
cgl
1948055
cgl
1625107
cgl
1707035
cgl
1801524
cgl
1862144
cgl
1948766
cgl
1629889
cgl
1713515
cgl
1802899
cgl
1863609
cgl
1953516
cgl
1630242
cgl
1719784
cgl
1804789
cgl
1865119
cgl
1953749
cgl
1631271
cgl
1721464
cgl
1806672
cgl
1865578
cgl
1954355
cgl
1631592
cgl
1722990
cgl
1807829
cgl
1868461
cgl
1956819
cgl
1638399
cgl
1723565
cgl
1809014
cgl
1873482
cgl
1962524
cgl
1638842
cgl
1727338
cgl
1809476
cgl
1873482
cgl
1963912
cgl
1639651
cgl
1729934
cgl
1812748
cgl
1875028
cgl
1964578
cgl
1639815
cgl
1732134
cgl
1815363
cgl
1876012
cgl
1970797
cgl
1642382
cgl
1732301
cgl
1816577
cgl
1880367
cgl
1976592
cgl
1645155
cgl
1735358
cgl
1818555
cgl
1883737
cgl
1976790
cgl
1648471
cgl
1737879
cgl
1821702
cgl
1884546
cgl
1976790
cgl
1652360
cgl
1738543
cgl
1821702
cgl
1884704
cgl
1983245
11984608
12058385
12136256
12217400
12319004
11985321
12058875
12136716
12218406
12320986
11985341
12062464
12137206
12219838
12322132
11985754
12063992
12139707
12221087
12326299
11986760
12067547
12144852
12224045
12332316
11988036
12070159
12146829
12224131
12332526
11989407
12071073
12149986
12226735
12332674
11990902
12072001
12157941
12228707
12334079
11991516
12073537
12160258
12229172
12336540
11993160
12074585
12162100
12229555
12347429
11994229
12074915
12163132
12232308
12347740
11997708
12075498
12163490
12235073
12351310
11998200
12077754
12164282
12238593
12351433
11998307
12081303
12164955
12242373
12352622
12003230
12083852
12165551
12243738
12355586
12004206
12087643
12165685
12250841
12359904
12005186
12087643
12165758
12254430
12361088
12010995
12090052
12167239
12258785
12361772
12014181
12096762
12177087
12273284
12363903
12019109
[2100791
12177677
12278179
12365667
12028674
[2100791
12178980
12278653
12371569
12031346
[2102235
12181751
12279125
12371587
12032049
[2103152
12182453
12279138
12372106
12033125
[2105450
12186771
12280317
12373771
12038710
[2109455
12192582
12284769
12373771
12038710
[2109968
[2193277
12286194
[2378888
[2039611
[2111137
[2194594
12286415
[2380764
[2041387
[2111714
[2198729
12293634
[2382415
[2041387
eg]
[2112870
[2198841
12294121
[2385643
[2042587
eg]
2116288
[2199321
12297440
[2389346
[2042714
eg]
2117658
[2200412
12298996
[2390011
[2047425
eg]
2124767
[2201155
12299554
[2391048
[2048965
cgl
2127282
[2204395
12299795
[2393623
eg]
[2052661
cgl
2128839
eg]
[2205429
12306086
eg]
[2396057
eg]
[2052661
cgl
2130672
eg]
[2206093
12313149
eg]
[2396523
eg]
[2054453
eg]
2133664
eg]
[2209075
12314682
eg]
[2397349
eg]
[2055515
eg]
2134633
eg]
[2210457
12315997
eg]
[2401842
12402318
12491710
12593746
12680131
12763668
12402427
12492087
12596182
12681370
12765028
12406559
12492380
12598025
12682870
12779301
12406559
12496975
12598575
12684668
12793924
12407867
12497564
12600631
12687215
12797070
12409547
12502325
12609665
12689285
12804104
12410980
12504877
12610744
12690127
12813108
12416830
12505085
12610744
12691004
12813754
12416856
12505184
12611448
12691330
12813802
12420683
12506930
12615766
12691620
12815916
12421110
12508214
12616487
12693135
12827283
12422539
12513975
12616923
12694870
12829687
12422844
12520276
12620645
12697139
12830671
12423473
12522311
12622519
12699648
12833018
12423493
12525219
12624523
12701603
12840248
12427162
12526997
12624523
12703333
12840847
12427264
12527909
12629325
12706396
12845432
12433395
12530994
12634591
12708841
12847373
12433486
12531542
12635790
12710519
12852187
12441066
[2534216
12637448
12715395
12855851
12441928
[2536279
12638776
12720921
12861034
12458003
[2542656
12639192
12727795
12865888
12459502
[2550866
12643917
12729838
12866104
12460187
[2551813
12649238
12730381
12866112
12461735
[2554573
12653105
12732155
12869058
12462916
[2555233
[2655250
12734024
[2872238
[2471171
[2556991
[2656653
12737497
[2873903
[2472603
[2559197
[2658387
12737833
[2876594
[2473697
eg]
2561776
[2658982
12738765
[2878228
[2475142
eg]
2565635
[2659158
12739119
[2881520
[2476487
eg]
2571005
[2661744
12741420
[2892471
12483340
cgl
2577610
12663253
12744812
12894883
eg]
[2483545
eg]
2579212
cgl
[2663253
12754854
eg]
[2901917
eg]
[2485020
eg]
2581598
eg]
[2663550
12755471
eg]
[2903530
eg]
[2486308
eg]
2587213
eg]
[2671632
12756312
eg]
[2906108
eg]
[2486795
eg]
2593223
eg]
[2676149
12760508
eg]
[2911732
eg]
[2491643
eg]
2593515
eg]
2679308
12762799
eg]
[2914511
12914657
13007988
13092901
13187539
13278004
12914733
13007988
13096278
13187885
13278353
12918213
13014333
13096701
13191127
13283691
12921750
13015534
13098071
13191508
13285213
12921750
13015534
13098379
13191951
13285387
12922751
13030332
13100965
13192013
13287621
12924936
13030404
13102133
13197521
13288195
12929027
13030790
13102585
13197551
13288195
12930100
13035254
13104185
13203394
13291607
12932195
13035743
13106758
13204568
13292703
12935350
13036944
13120814
13204798
13294602
12935656
13042288
13123964
13207733
13294849
12937434
13042575
13131015
13208438
13298147
12942038
13045134
13131015
13208922
13300301
12946225
13049992
13132121
13209335
13301391
12947224
13050884
13136655
13213799
13302154
12951282
13055709
13137458
13214190
13304638
12951282
13057576
13144059
13220900
13305823
12952341
13057898
13149307
13221458
13306921
12958836
[3058623
13150021
13221924
13307782
[2961069
[3060154
13150925
13224852
13308137
[2961842
[3064571
13153394
13225830
13310671
[2962542
[3066703
13153865
13230197
13316433
[2962778
[3067635
13154413
13234063
13320291
[2966875
[3070763
13155549
13235059
13320558
[2967050
[3072717
[3158481
13239713
[3321114
eg]
[2970724
[3073773
[3159388
13241681
[3324103
eg]
[2971694
cgl
[3078381
[3166577
13245983
[3325261
eg]
[2972064
eg]
3078911
[3168187
13247663
[3327911
eg]
[2985235
eg]
3078969
[3169065
13249256
[3331610
eg]
2989128
eg]
3083037
[3172906
13249591
[3335054
eg]
2994228
eg]
3084525
[3173392
13255096
[3337949
eg]
2999109
eg]
3090007
eg]
[3173536
13255398
eg]
[3338734
eg]
3001142
eg]
3090402
eg]
[3179056
13259290
eg]
[3339825
eg]
3001868
eg]
3090969
eg]
[3183496
13260377
eg]
[3341441
eg]
3003878
eg]
3091717
eg]
[3184872
13269964
eg]
[3341668
eg]
3005202
eg]
3092487
eg]
3187009
13270625
eg]
[3343687
13345558
13420744
13476777
13564459
13624631
13349346
L3423076
13476901
13567205
13626676
13351583
13424446
13480937
13567404
13629753
13353311
13425174
13482233
13567542
13631913
13353550
13425335
13485320
13568258
13633560
13354872
13428086
13486532
13568432
13633756
13358873
13431037
13488078
13573358
13635184
13359415
13431342
13488201
13573513
13636014
I3372658
13432294
13488570
13575139
13636189
13374701
13432339
13494954
13577076
13636952
L3380204
13434842
13496041
13577149
13640200
13381110
13436110
13496662
13578303
13641903
13382100
13436343
13500819
13578647
13643585
13387826
[3445604
13502686
13582457
13647527
13389211
13445938
13504059
13582950
13648550
13391244
[3446584
13514955
13584608
[3649056
13393408
[3446622
13517866
13585930
[3649056
13394216
[3449535
13520715
13586051
[3651876
13395373
[3450266
13523386
13588954
[3655635
13396713
[3451483
13525639
13590711
[3660477
13399773
[3454226
13526264
13591701
[3663170
13399952
[3458651
13531977
13595556
[3663218
[3401339
[3459104
[3536080
13597051
[3665060
[3403636
[3459217
[3538637
13597317
[3667243
[3404054
[3460409
[3540312
13598409
eg]
[3667389
[3404331
eg]
[3462082
[3540805
13599477
eg]
[3668207
[3406860
eg]
3462557
[3544966
13603214
eg]
[3672348
[3408086
eg]
3463203
[3545874
13603551
eg]
3673094
[3408795
eg]
3464448
[3548810
13606025
eg]
3673094
eg]
[3409449
eg]
3464573
[3549444
13609040
eg]
3673779
eg]
[3411789
eg]
3466809
eg]
[3554018
13609053
eg]
3675051
eg]
[3413719
eg]
3468685
eg]
[3555415
13611006
eg]
3680844
eg]
[3413982
eg]
3469457
eg]
[3557031
13612317
eg]
3686042
eg]
[3414270
eg]
3471188
eg]
[3557530
13615963
eg]
3686042
eg]
[3415628
eg]
3471209
eg]
3559306
13616930
eg]
3687834
eg]
3417862
eg]
3473894
eg]
3562542
13617047
eg]
3688808
eg]
3420366
cgl
3474750
eg]
3563298
[3617795
cgl
3688966
L3692426
13771629
13836627
13894813
13978156
13699808
13774505
13840968
13897627
13978767
13699808
13777730
13842648
13899108
13980454
13700912
13781158
13844922
13900763
13980719
13702005
13781408
13847724
13901526
13982505
13703737
13781956
13848598
13905899
13982505
13705888
13782301
13848598
13906823
13982956
13706058
13784017
13849691
13908977
13983182
13707793
13784312
13850063
13909661
13985518
13709271
13784855
13851334
13912117
13985639
13712197
13786163
13853046
13912641
13991631
13714026
13787850
13853198
13914324
13992911
[3714344
13788381
13853198
13916928
13994241
13715502
13791131
13855729
13917504
13995599
13717541
13793584
13857210
13917560
13997435
13718960
13794641
13858127
[3917614
14001429
13725825
13798885
13858900
[3920460
14001486
13726166
13799919
13860281
[3920529
14001914
[3731761
13800802
13860360
[3920529
14002682
[3732582
13804838
13863396
[3924510
14003974
[3733394
13805761
13865347
[3926833
14011077
[3738327
13808058
13868604
[3929065
14011229
[3739345
13808071
13868855
[3929328
14012294
[3739417
13809441
[3869942
[3932501
14013040
[3744194
13814654
[3870494
[3945749
14015502
[3745870
13814677
[3870866
eg]
[3946956
14016554
eg]
[3747967
13815872
[3875033
eg]
[3951190
14022202
eg]
3750214
13816042
[3877315
eg]
3957558
14022995
eg]
3752933
13821008
[3878066
eg]
3958426
14023309
eg]
3755270
13823136
[3880868
eg]
3961587
14023451
eg]
3755795
13823144
13882988
eg]
3966609
14024937
eg]
3756879
[3828227
eg]
[3883576
eg]
3969327
14026971
eg]
3759513
[3828701
eg]
[3884295
eg]
3972124
14027204
eg]
3761284
[3829089
eg]
[3887966
eg]
3973086
14028684
eg]
3765278
[3831540
eg]
[3889934
eg]
3974531
14029001
eg]
3765685
[3832604
eg]
[3890706
eg]
3975362
14029170
eg]
3766329
[3836518
eg]
[3893555
eg]
3977623
14029580
14029663
14085017
14155482
14218435
14290576
14030258
14086599
14155831
14219938
14293129
14033039
14088811
14156751
14221460
14294758
14034870
14089474
14156905
14221831
14295960
14037652
14094063
14160480
14221831
14297867
14037665
14098951
14161399
14223017
14299572
14040131
14102055
14161477
14226064
14302083
14041701
14103123
14164262
14228238
14302214
L4044057
14106234
14164596
14228460
14302224
14044216
14106263
14165142
14228484
14304073
L4046477
14106308
14170597
14229404
14305701
14046757
14111334
14173736
14233838
14312114
14047153
14112075
14175304
14247287
14312334
14051662
14114282
14175438
14249872
14313748
14054357
14117138
14175438
14252059
14323109
14054582
14117297
14179401
[4255337
14326210
14055379
14118226
14181956
[4255981
14326909
14055502
14118546
14185860
[4258143
14326991
14059339
14118946
14187266
[4258250
14327531
14060417
14119680
14187585
[4258285
14327759
14063008
14120476
14189614
[4260643
14328477
14063129
14120703
14189614
[4260918
14329889
14063191
14120784
[4189678
[4262681
14333338
[4063654
14127589
[4191134
[4264773
14333454
[4066298
14127954
[4192401
[4264994
14333454
[4073057
14129040
[4193007
eg]
[4265043
14338451
[4073497
14129735
[4193097
eg]
4270002
14338590
[4076977
14132388
[4196790
eg]
4274357
14338887
[4078070
14137625
[4196998
eg]
4275095
14339007
14078687
14145194
14200572
cgl
4275273
14339466
[4079785
[4145667
eg]
[4202477
eg]
4278148
[4340110
[4080001
[4150115
eg]
[4204619
eg]
4282850
[4340336
eg]
[4082127
[4151158
eg]
[4204735
eg]
4283454
[4341579
eg]
[4082893
[4153649
eg]
[4205126
eg]
4287742
[4344095
eg]
4083015
[4153654
eg]
[4210311
eg]
4288086
[4361627
eg]
4083421
[4154651
eg]
4210817
eg]
4288464
[4361627
eg]
4083603
[4155446
eg]
4213581
eg]
4289511
[4362814
14364903
14422315
14488466
14540297
14630692
14369455
14423778
14490428
14541915
14632485
14369981
14424070
14494313
14549256
14633742
14370448
14425294
14494812
14549524
14633820
14374347
14425564
14495753
14549976
14635955
14376625
14426428
14496282
14550145
14637919
14377152
14431024
14496909
14550559
14642045
14377791
14433074
14498227
14553740
14642259
14378057
14434062
14500070
14553824
14642832
14379462
14435109
14500486
14554869
14644871
14381712
14436056
14502651
14556683
14645721
14383135
14436231
14502651
14556683
14646111
14384093
[4437534
14506515
14564351
14646244
14384532
[4442841
14507146
14565903
14649566
14385738
[4444126
14507433
14567917
14653284
14391855
[4444297
14509809
14568971
14654385
14395060
14445229
14513680
14575790
14659008
14395885
14448116
14515791
14578247
[4661464
14397893
[4454796
14517217
14585967
14662379
14398860
[4458834
14518209
14591340
[4664464
14399060
[4461974
14518346
14592365
14665203
14400528
[4463853
14519350
14592406
14665366
14401837
[4463995
14520214
14599596
14667273
14405197
[4464791
14520360
14601053
14669524
14405528
[4467464
14520448
14601621
14671011
[4407437
[4467840
14520571
L4602087
14672128
[4408969
[4470792
[4520947
14602471
[4673904
[4409083
[4470851
[4520957
14602839
[4674582
[4412322
eg]
[4473662
[4523847
14606858
[4676272
[4414154
eg]
4476745
[4527029
14607642
[4679230
[4415629
eg]
4480035
[4528056
14611152
[4687785
[4415956
eg]
4482093
[4532519
14612966
[4689122
[4417329
eg]
4483162
[4533068
14614211
[4689338
eg]
[4417498
eg]
4483244
cgl
[4533595
14615559
[4689537
eg]
[4418802
eg]
4483391
eg]
[4534144
14621763
eg]
[4691671
eg]
[4419051
eg]
4487292
eg]
[4537332
14625604
eg]
[4692377
eg]
[4420953
eg]
4487665
eg]
[4539231
14629075
eg]
[4696311
14696348
14769121
14848772
L4993167
15083233
14696396
14774364
14859749
14994947
15084433
14697743
14777768
14861934
14997942
15084543
14699932
14779376
14864022
14999168
15087147
14701867
14781394
14870271
15001032
15087178
14703002
14789818
14880184
15002250
15089387
14705010
14789828
14886269
15003194
15089567
14708360
14793844
14891195
15008991
15090198
14708893
14795528
14893129
15010903
15095335
14710465
14799696
14893163
15013768
15103195
14711067
14800014
14893163
15014458
15103675
14719055
14802771
14895775
15016062
15105060
14719722
14802951
14901243
15021292
15106134
14719959
14804903
14906976
15022359
15108590
14721213
14807945
14908245
15028339
15108590
14723977
14808739
14908307
[5028458
15108645
14727763
14809191
14913777
[5030949
15110243
14729148
14813485
14917572
[5031579
15110300
14732540
14822966
14918082
[5034135
15114328
14737571
14823429
14921884
[5034300
15115728
14738921
14825976
14929421
[5034393
15118204
14740860
14826331
14940165
[5037004
15121267
14741228
14827198
14945937
[5045356
[5121420
[4741474
14827502
[4947787
[5045441
[5121420
14743346
14830740
14947955
[5045441
[5122358
[4744463
14831085
14952949
eg]
[5046123
[5123730
[4747813
14832904
14957660
eg]
5046675
[5124540
[4748455
14833385
14960043
eg]
5046675
[5127443
[4750144
14835138
14960043
eg]
5056105
[5128898
[4751552
14836522
14975347
eg]
5061008
[5131282
[4752089
[4839134
[4976276
eg]
5067583
eg]
[5136129
[4752598
[4839558
[4977059
eg]
5068552
eg]
[5139063
eg]
[4753321
[4839898
[4978242
eg]
5070677
eg]
[5147841
eg]
[4754581
[4844236
[4981637
eg]
5075988
eg]
[5148918
eg]
4762436
[4846244
[4987309
eg]
5076217
eg]
[5151364
eg]
4764357
[4846380
[4991487
eg]
5078958
eg]
[5155209
eg]
4764876
[4846965
[4991487
eg]
5081886
eg]
5156078
15156712
15289427
15403961
15502231
15609734
15161959
15289899
15407570
15503752
15612947
15164103
15294851
15408889
15503752
15622619
15165154
15299978
15412772
15512851
15626285
15170942
15302379
15418783
15514848
15626828
15171154
15307891
15422147
15515265
15632826
15172734
15309006
15424477
15520279
15633699
15180617
15310162
15427232
15523238
15636365
15181441
15310162
15431659
15526708
15644756
15186638
15312298
15436123
15534366
15645309
15187606
15313459
15438314
15536552
15648345
15191648
15314382
15441973
15536663
15651925
15202954
15315385
15444217
15540820
15652212
15207619
15319576
15447231
15541401
15654779
15208689
15320905
15449049
15543284
15665276
15210526
15322542
15452204
15544721
15665792
15210851
15323253
15452970
15547534
15669228
15212038
15335334
15458504
15547534
15679095
15215114
15339026
[5464481
15549927
15684563
15221831
[5339605
[5465439
15554678
15684563
15226532
[5341575
[5470102
15559700
15689969
15227982
[5341833
[5472071
15560495
15690721
15228639
[5343119
[5473502
15564098
15690721
15228639
[5350036
[5474318
15571405
15698065
15233062
[5351652
[5476602
15571730
15698795
15233681
[5357078
[5477363
15575641
[5700197
[5246232
[5361231
eg]
[5477500
15577272
[5701111
[5247093
[5364131
eg]
[5480475
15580355
[5701203
[5250073
eg]
5368868
eg]
[5485247
15587792
[5703377
[5254559
eg]
5370732
eg]
[5488978
15600935
[5705813
[5260951
eg]
5375311
eg]
5489301
15602037
[5707428
[5261730
eg]
5375883
eg]
5494597
15602241
[5711404
eg]
[5264162
cgl
5378605
eg]
5495091
15602548
eg]
[5718289
eg]
[5275965
cgl
5379858
eg]
5496336
15605448
eg]
[5722679
eg]
[5281283
cgl
5387123
eg]
5496956
15607311
eg]
[5723222
eg]
[5288779
eg]
5393490
eg]
5500658
15607445
eg]
[5723350
eg]
[5288800
eg]
5395971
eg]
5500658
15609272
eg]
[5731815
15732530
15808835
15900979
15986251
16072777
15733114
15814508
15905200
15988232
16073958
15733367
15815843
15905979
15991104
16076997
15736336
15815843
15908367
15994519
16076997
15741583
15817130
15913725
15995714
16078836
15746620
15818800
15924102
15996480
16078836
15746620
15821319
15928106
15996534
16080552
15746719
15822346
15931471
15996914
16085649
15749858
15822346
15936446
15997512
16086237
15749858
15824056
15937958
15998761
16087541
15752885
15825304
15942368
15999165
16097772
15754594
15829056
15945235
16000989
16100355
15765212
15829092
15948795
16003672
16102706
15765889
15832847
15949277
16008966
16107553
15767955
15833565
15952725
16009558
16109012
15768226
15835542
15955277
16016036
16110314
15768443
15837470
15958289
16018002
16118539
15770446
15839913
15961716
16018972
16118817
15770585
15840891
15963913
16020346
16119522
15770687
15840949
15963988
16021428
16122424
15771683
15840985
15964018
16028753
16123421
15777760
15844365
15966757
16028753
16126079
15777781
15853125
15967525
16031528
16142313
15778745
15862841
15972148
16031973
16143804
15781838
15864571
15972264
16034546
16145324
15783800
15868692
15972294
16038120
16148454
15784615
15871766
15972572
16040900
16151538
15787039
15874481
15975802
16041660
16152753
15788059
15877915
15975865
16047279
16155382
15791248
15878685
15976404
16048006
16163756
15792134
15879316
15976539
16053334
16163847
15797110
15879716
15977272
16054275
16170708
15798153
15889057
15980539
16055914
16173067
15803671
15889594
15982099
16061668
16175725
15804973
15893493
15982595
16065538
16176600
15804973
15895121
15982700
16068038
16176929
15806880
15898840
15983520
16071029
16177830
16179125
16248515
16342115
16423337
16525761
16181396
16260696
16342780
16426459
16527041
16187635
16266227
16343134
16429070
16527877
16189954
16266672
16348316
16430687
16528345
16193203
16268473
16352830
16431433
16532438
16193278
16268734
16353624
16431978
16541275
16199747
16269097
16354345
16434190
16547579
16200531
16272084
16356622
16435601
16549994
16201038
16272981
16357921
16438432
16553083
16203758
16274678
16361890
16440299
16553500
16204205
16282910
16361890
16440978
16554164
16204559
16283183
16364085
16442712
16556145
16205058
16284684
16364675
16444607
16559361
16206090
16289449
16366685
16445423
16565031
16206341
16292885
16367511
16447680
16565154
16206504
16296417
16367976
16447823
16565696
16208206
16296442
16368146
16449219
16567330
16209517
16297030
16369288
16456087
16567723
16209630
16299358
16370398
16462075
16569650
16214492
[6301617
16371477
16465939
16571836
[6223546
[6306670
16371538
16468729
16573346
[6223976
[6308533
16372520
16471830
16574134
[6226586
[6311302
16382322
16472853
16577647
[6227072
[6311740
16384355
16474725
16578568
[6228365
[6312163
16389901
16478236
16585820
[6231917
[6312870
[6391792
[6478792
[6589843
eg]
[6232979
cgl
[6315582
[6391792
[6480008
[6592658
eg]
[6233036
eg]
[6321975
[6393012
[6482314
[6592897
eg]
6236157
eg]
6323293
[6393935
[6484162
[6597993
eg]
6240480
eg]
6324409
[6396919
[6493416
[6600991
eg]
6240480
eg]
6326123
[6396948
eg]
[6499607
[6601231
eg]
6240683
eg]
6326402
eg]
[6397176
eg]
[6509569
eg]
[6605590
eg]
6241867
eg]
6332927
eg]
[6406892
eg]
[6510010
eg]
[6607065
eg]
6243359
eg]
6335762
eg]
[6411279
eg]
[6514513
eg]
[6608407
eg]
6243644
eg]
6337763
eg]
[6415646
eg]
[6516490
eg]
[6616769
eg]
6245261
eg]
6340268
eg]
6417374
eg]
[6518861
eg]
[6620032
eg]
6247183
cgl
6341836
eg]
6419235
eg]
6519399
eg]
6624482
16627358
16719865
16789707
16900604
17000343
16628641
16721321
16789995
16904580
17001430
16629695
16723180
16791781
16907514
17004733
16632715
16726435
16792800
16911583
17009731
16636571
16729899
16797751
16912563
17010895
16642299
16731016
16797831
16914035
17016175
16643169
16731240
16801887
16927606
17017189
16644366
16735881
16807089
16927606
17022488
16645705
16739530
16808481
16932672
17026456
16647844
16739580
16821992
16934178
17028039
16648841
16740364
16822666
16936421
17031727
16660591
16744710
16823064
16937611
17039022
16661654
16744741
16823466
16937769
17041511
16663891
16744741
16826777
16940012
17046586
16665765
16747164
16840616
16941656
17049328
16669455
16748008
16842485
16944597
17051543
L6669650
16755475
16842767
[6944941
[7052756
L6676292
16755500
16848937
[6953816
[7053854
L6677112
16757724
16849046
[6954385
[7054691
L6677191
16759976
16852955
[6956999
[7061156
L6678564
16761390
16855929
[6957313
[7063929
16679837
16762778
16855929
[6959747
[7067993
16682903
[6763574
[6858415
[6962115
[7069313
16686273
[6764781
[6859884
eg]
[6963144
eg]
[7069650
16687447
[6765268
[6862361
eg]
[6964716
eg]
7070073
16689634
[6765393
[6863382
eg]
6964946
eg]
7076780
16696234
[6767590
[6863795
eg]
6969207
eg]
7080697
[6698623
eg]
[6773043
[6865446
eg]
6969368
cgl
7087974
[6698623
eg]
[6777510
eg]
[6867657
eg]
6970232
cgl
7090600
[6701105
eg]
[6782117
eg]
[6867657
eg]
6971991
eg]
7094249
[6702815
eg]
[6782524
eg]
[6869622
eg]
6973527
eg]
7094363
[6703390
eg]
6783204
eg]
6873443
eg]
6979445
eg]
7095279
eg]
[6703466
eg]
6783349
eg]
6875629
cgl
6982087
cgl
7095315
eg]
[6705777
eg]
6784970
eg]
6890093
eg]
6983159
cgl
7097782
eg]
[6708264
eg]
6785291
eg]
6895493
cgl
6987638
eg]
7101296
eg]
[6711124
eg]
6787600
eg]
6896134
eg]
6990083
eg]
7103081
eg]
[6712828
eg]
6787652
eg]
6897462
eg]
6990945
eg]
7104824
17105014
17209188
17290127
17352045
17426146
17107017
17212304
17291001
17352215
17427305
17107572
17213381
17294620
17352995
17427639
17108141
17213713
17295878
17356718
17429587
17117243
17214456
17297305
17362483
17430228
17117459
17216758
17297775
17367884
17430393
17122157
17217691
17298352
17369196
17434008
17125472
17224401
17298733
17374433
17438636
17127702
17224754
17301223
17375585
17444849
17127769
17226042
17304276
17378193
17445157
17130457
17229173
17304678
17380661
17446142
17141577
17229197
17304878
17383329
17453456
17142134
17229197
17306740
17383853
17455261
17142134
17231524
17307479
17384323
17457560
17142183
17231690
17309904
17388996
17459225
17143606
17236709
17316030
17390562
17462417
17152436
17238065
17319142
17391620
17463527
17153122
17239876
17319788
17393267
17464436
17162024
17241310
17321561
17393917
17465631
17162031
[7247026
17321954
17394304
17467525
[7164954
[7251713
17324339
17394649
17468459
[7165158
[7253459
17326597
17394978
17469978
[7165284
[7267493
17327492
17395738
17470674
[7167468
[7272620
17329518
17397420
17470942
[7167920
[7274064
17330097
17397493
17473377
[7169998
[7274072
[7330765
17398312
[7475456
eg]
[7171539
[7274742
[7334453
17403397
[7475813
eg]
[7178220
cgl
[7274881
[7335108
17404289
[7477273
eg]
[7178888
eg]
7276002
[7335199
17412974
[7480760
eg]
[7178922
eg]
7276535
[7339202
17415265
[7481047
eg]
7180633
eg]
7277892
[7342283
17416146
[7483510
eg]
7184704
eg]
7277939
[7342973
17417584
[7487741
eg]
7186066
eg]
7277939
eg]
[7344516
17419626
eg]
[7489690
eg]
7195771
eg]
7279839
eg]
[7347253
17419731
eg]
[7490196
eg]
7202781
eg]
7284236
eg]
[7347634
17420968
eg]
[7494034
eg]
7204557
eg]
7285663
eg]
[7349352
17423650
eg]
[7494199
eg]
7208060
eg]
7288471
eg]
7352004
17425818
eg]
[7496661
17496788
17611742
17706173
17810944
17892556
17496921
17617228
17721879
17810944
17892629
17501395
17621438
17724627
17811994
17895254
17501774
17624536
17725019
17813310
17901038
17504394
17624891
17726575
17820022
17907628
17509039
17625535
17729667
17820591
17910564
17511707
17627559
17729667
17823004
17915429
17516247
17627654
17738213
17824690
17922226
17518550
17630294
17740399
17825194
17927096
17520027
17631429
17741572
17829314
17943672
17522207
17631451
17746316
17837492
17945323
17522249
L7632579
17750946
17843665
17945789
17525406
17636366
17751550
17844448
17945976
17526573
L7637342
17754510
17846016
17947992
17541528
L7644208
17754680
17846621
17950095
17543123
17644611
17755554
17849156
17952262
L7547742
17646392
17758721
[7849194
[7953300
L7548735
17647273
17766305
[7851392
[7961200
17552650
17648080
17771150
[7851657
[7962854
L7560267
17654660
17771150
[7851725
[7971328
17566735
17655614
17774559
[7852482
[7972789
17571559
17657618
17775621
17854440
17975443
17575314
[7665601
[7777592
[7857870
[7982102
17578322
[7667625
[7778120
eg]
[7863076
[7983632
17578639
[7670496
[7778867
eg]
[7864469
eg]
7988310
17582336
[7673897
[7779002
eg]
7868307
eg]
7991430
17583432
[7677524
[7783401
eg]
7870484
eg]
7994788
[7586302
eg]
[7680767
[7786959
eg]
7872757
cgl
7998964
[7589056
eg]
[7681527
eg]
[7792192
eg]
7875483
cgl
8002480
[7591574
eg]
[7682828
eg]
[7792315
eg]
7882867
eg]
8003231
[7596249
eg]
[7687282
eg]
[7793621
eg]
7884169
eg]
8003231
[7601191
eg]
7688525
eg]
7794788
eg]
7884698
eg]
8003970
eg]
[7602167
eg]
7694130
eg]
7795586
cgl
7884766
cgl
8007957
eg]
[7605084
eg]
7697633
eg]
7799287
cgl
7885542
cgl
8010302
eg]
[7605084
eg]
7697873
eg]
7802486
cgl
7886959
cgl
8011099
eg]
[7606785
eg]
7701886
eg]
7804348
eg]
7887993
eg]
8011672
eg]
[7607231
eg]
7702736
eg]
7804348
eg]
7888086
eg]
8016148
18019810
18109874
18205668
18303215
18387839
18023080
18113826
18208742
18304242
18389827
18023283
18119407
18211633
18304305
18393747
18024037
18119407
18220920
18309286
18393958
18025275
18121066
18226096
18316500
18394120
18025409
18125090
18226700
18317554
18394496
18031675
18127648
18229049
18320188
18396865
18035229
18129786
18231184
18321976
18397653
18035229
18138484
18232347
18322510
18399451
18044543
18139806
18234130
18322569
18401785
18044585
18144247
18235799
18325866
18409845
18050139
18147485
18236477
18326022
18413218
18053228
18147865
18236877
18328612
18413706
18056600
18148314
18238808
18330203
18414381
18058230
18151030
18239753
18334392
18414381
18063278
18151275
18240331
18334681
18416503
18066946
18151345
18245890
18335068
18418928
18067859
18154283
18247054
18337287
18419977
18068521
18155853
18247090
18343292
18420781
18073874
18157896
18247124
18346402
18421360
18074297
18160302
18248586
18348337
18422423
18081104
18163452
18252903
18351099
18422443
18082082
18165707
18257996
18352516
18422587
18082788
18166376
18262591
18363192
18424134
18084554
18167466
18263587
18365383
18428265
18085517
18172358
18264728
18367631
18430152
18085627
18174404
18265162
18368125
18431127
18085683
18174834
18269493
18368411
18433086
18093120
18185189
18269526
18373158
18434152
18096388
18188010
18270343
18373623
18440188
18096987
18188653
18270687
18374393
18440692
18099488
18189236
18275316
18375441
18442019
18100008
18189994
18275321
18378955
18443359
18103150
18191540
18278184
18382893
18443378
18104285
18192417
18279625
18383585
18443412
18104645
18200783
18280126
18384097
18445088
18108818
18203466
18281723
18384588
18445088
L8449048
18542098
18631798
18738906
18829411
18450254
18546419
18633230
18738985
18830118
18453621
18552413
18633600
18740289
18832348
18456803
18553732
18638180
18742441
18833140
18456933
18555277
18638769
18748374
18833880
18457597
18558767
18641463
18749563
18836576
18458509
18560264
18645150
18750756
18836689
18458993
18561589
18650367
18750756
18842353
18459806
18565510
18660898
18750960
18843682
18461584
18566177
18663307
18752527
18843739
18463686
18566883
18669406
18758482
18844900
18466173
18571045
18671950
18759732
18851795
18469036
[8572214
18672030
18760534
[8854666
[8470710
[8573383
18674980
18760621
[8854872
[8471471
[8573842
18675847
18766210
[8855030
[8473521
[8576301
18677603
18766847
[8857467
[8477949
[8580385
18679487
18771538
[8864227
[8482593
[8580491
18690385
18773937
[8866599
[8488157
[8584265
18692273
18776876
[8867659
[8488855
[8586886
[8698699
18776945
eg]
[8869061
eg]
[8489009
[8587984
[8702935
18783374
eg]
[8869368
eg]
[8489440
eg]
[8588835
[8703066
18783781
eg]
[8869709
eg]
[8502142
eg]
8592026
[8703983
18790143
eg]
[8873878
eg]
[8505593
eg]
8592195
[8710162
18792528
eg]
[8879177
eg]
8505752
eg]
8592964
[8712231
18793688
eg]
8881778
eg]
8507125
eg]
8595324
[8715793
18801945
eg]
8884037
eg]
8512948
eg]
8604215
eg]
[8716912
18807515
eg]
8886444
eg]
8515872
cgl
8606700
eg]
[8723409
18809076
eg]
8887230
eg]
8517369
eg]
8607961
eg]
[8725573
18811423
eg]
8887458
eg]
8518074
eg]
8610205
eg]
[8725867
18817955
eg]
8890112
eg]
8525352
eg]
8613421
eg]
8727700
18818075
eg]
8890249
cgl
8526140
cgl
8621256
eg]
8728025
18818531
cgl
8891604
eg]
8530299
cgl
8621299
cgl
8733230
18824330
eg]
8894440
cgl
8532316
cgl
8621299
eg]
8733925
18825221
eg]
8894781
eg]
8533397
eg]
8623836
eg]
8736168
18826274
eg]
8899777
eg]
8541042
eg]
8630667
eg]
8736431
18826637
eg]
8899999
eg]
8541087
eg]
8630748
eg]
8736448
18827756
eg]
8900271
18901104
19003304
19122260
19234412
19328583
L8904477
19004465
19125370
19236431
19328711
18907202
19005210
19125584
19240213
19331876
18908499
19005335
19126169
19240857
19334176
18919659
19008097
19129336
19244312
19339179
18920088
19008877
19129687
19247032
19341309
18923230
19014295
19130973
19248557
19343088
18925726
19017254
19138325
19252956
19343464
18929240
19022006
19138538
19253379
19343707
18933331
19023977
19139832
19254118
19345165
18934187
19030682
19140262
19255783
19358202
18936620
19032799
19140928
19257200
19358373
[8940674
19033073
19168338
19258425
19358397
18942579
19034132
19177125
19266387
19358493
[8944451
19035792
19184818
19268652
19358493
[8950779
19035966
19184897
19271142
19358805
[8951352
19042062
19190519
19275091
19361542
[8952647
19045700
19193136
19283806
19362874
[8954434
[9049194
19194595
19285799
19365151
[8956547
[9051213
19198386
19287349
19365614
[8959422
[9051802
19201019
19289072
19366479
eg]
[8959478
[9055098
19205041
19290577
19369955
eg]
[8961101
[9058262
19206010
19300307
19381810
eg]
8971054
[9060371
19206146
19303187
19382136
eg]
8973101
[9062108
19213703
19307543
19387750
eg]
8975416
[9062189
[9216056
[9310430
[9389370
eg]
8978493
eg]
[9062478
[9216286
[9312305
[9392138
eg]
8982286
eg]
[9064601
[9216731
[9314470
[9392831
eg]
8982286
eg]
9090437
[9219366
[9317715
[9393677
eg]
8984165
eg]
9091784
[9219778
[9318393
[9395441
eg]
8988110
eg]
9095187
[9220282
eg]
[9319558
[9396666
cgl
8994063
eg]
9096475
eg]
[9220719
eg]
[9323289
eg]
[9398115
eg]
8994063
cgl
9101893
eg]
[9220825
eg]
[9324462
eg]
[9401923
eg]
8997129
eg]
9103536
eg]
[9220825
eg]
[9324627
eg]
[9402939
eg]
8999185
eg]
9108718
eg]
[9222405
eg]
[9325985
eg]
[9403021
eg]
9001226
eg]
9118289
eg]
9223129
eg]
[9326876
eg]
[9403377
cgl
9002941
cgl
9120695
eg]
9225923
eg]
9326876
eg]
9403541
19407266
19497444
19592185
19688752
19757176
19408398
19497702
19592277
19689330
19757631
19410471
19504860
19594666
19690984
19758859
19412295
19505136
19596983
19693031
19759366
19412478
19505546
19598567
19693177
19761273
19412663
19506623
19598584
19698340
19770281
19418951
19516647
19600494
19699893
19770715
19419246
19519964
19601328
19700658
19770748
19419519
19524009
19601666
19702397
19773474
19420720
19530831
19607387
19704755
19773547
19421752
19530885
19609242
19706900
19776833
19428417
19533443
19611886
19708418
19777001
19429405
19533977
19612309
19709355
19780563
19439331
19534945
19612574
19709585
19783626
19445598
19536922
19614321
19710184
19786733
19446077
19537511
19618438
19711602
19786751
19446385
19539004
19618706
19714737
19788754
19452316
19539224
19619014
19714940
19789466
19453726
19552441
19620383
19717150
19790294
19453938
[9561297
19622138
19717150
19790321
[9455306
[9561774
19628988
19717586
19791630
[9456540
[9563433
19630665
19718306
19794481
[9456540
[9565262
19630689
19718686
19795594
[9465268
[9570749
19643252
19722698
19797376
[9466563
[9572242
19658522
19722847
19798224
[9468528
[9573230
[9659642
[9722847
[9799702
eg]
[9470159
cgl
[9574297
[9661309
[9724470
[9800670
eg]
[9470372
eg]
[9576422
[9664945
[9728382
[9804027
eg]
9477977
eg]
9576843
[9665882
[9734228
[9807685
eg]
9480263
eg]
9579005
[9668476
[9737787
[9809052
eg]
9480965
eg]
9580263
[9670883
eg]
[9738463
[9814116
eg]
9481953
eg]
9580810
eg]
[9671395
eg]
[9744122
eg]
[9817118
eg]
9482842
eg]
9580930
eg]
[9674669
eg]
[9747465
eg]
[9817882
eg]
9483007
eg]
9584803
eg]
[9675731
eg]
[9750321
eg]
[9817912
eg]
9484481
eg]
9586165
eg]
[9680850
eg]
[9752861
eg]
[9819654
eg]
9485539
eg]
9589427
eg]
9687152
eg]
[9753174
eg]
[9822110
cgl
9494591
cgl
9591417
eg]
9688652
eg]
9755108
eg]
9823847
19826026
19826026
19827182
19829001
19830147
19831356
19834563
19836199
19836199
19837259
19838043
19839798
19841005
19841369
19841506
19842134
19845249
19846154
19846609
19848683
19850370
19852827
19853703
19853760
19855470
19855470
[9856705
[9858214
[9861260
[9861914
[9864130
[9881895
[9882093
eg]
[9882915
eg]
[9884658
eg]
[9893316
eg]
[9893664
cgl9895380 cgl9896142 cgl9903229 cgl9903229 cgl9909613 cgl9921353 cgl9921577 cgl9926480 cgl9927214 cgl9928247 cgl9931596 cgl9935065 cgl9936016 cgl9942459 cgl9945912 cgl9946699 cgl9949137 cgl9953799 cgl9970883 eg19974227 cgl9975917 cgl9978416 cgl9982609 cgl9988449 cgl9999567 cg20000602 cg20000847 cg20002177 cg20003368 cg20004634 cg20004910 cg20006618 cg20010076 cg20011134 cg20011352 cg20017590 cg20018782 cg20021784 cg20024687 cg20026576 cg20029347 cg20030711 cg20031845 cg20042662 cg20045394 cg20050484 cg20050826 cg20051324 cg20052760 cg20059312 cg20060185 cg20060685 cg20061155 cg20061378 cg20070090 cg20071744 cg20073153 cg20073320 cg20074593 cg20074593 cg20076468 cg20080624 cg20080878 cg20082641 cg20085077 cg20086219 cg20087093 cg20088477 cg20088535 cg20090497 cg20091107 cg20091215 cg20093139 cg20095338 cg20098659 cg20099458 cg20101529 cg20102280 cg20107668 cg20116555 cg20118424 cg20122518 cg20122645 cg20124376 cg20135230 cg20136100 cg20137312 cg20140940 cg20146030 cg20146909 cg20147100 cg20149362 cg20151221 cg20151301 cg20153751 cg20155035 cg20161965 cg20162599 cg20165746 cg20166027 cg20168806 cg20172563 cg20173014 cg20175702 cg20181739 cg20181887 cg20182358 cg20189761 cg20191453 cg20194314 cg20195319 cg20199333 cg20199333 cg20199655 cg20199655 cg20202112 cg20202760 cg20205704 cg20208398 cg20209308 cg20209308 cg20211134 cg20217872 cg20218460 cg20218614 cg20225745 cg20228731 cg20230305 cg20231444 cg20238525 cg20242781 cg20249071 cg20251943 cg20253855 cg20255231 cg20260127 cg20261167 cg20262021 cg20263853 cg20264543 cg20270863 cg20272146 cg20274462 cg20275344 cg20277282 cg20284239 cg20284982 cg20285002
g20288341 g20289346 g20289911 g20289911 g20290850 g20291049 g20293609 g20294319 g20295442 g20300129 g20309677 g20312012 g20312687 g20315995 g20318272 g20324165 g20326248 g20326647 g20329303 g20330472 g20338754 g20340242 g20340501 g20341504 g20342079 g20342105 g20342184 g20348298 g20353227 g20355731 g20356637 g20358834 g20361429 g20366397 g20373326 g20377232 g20378628 cg20379239 cg20382675 cg20384325 cg20384620 cg20392842 cg20393620 cg20402382 cg20402658 cg20402783 cg20403938 cg20404150 cg20407483 cg20410114 cg20414082 cg20422318 cg20424400 cg20425058 cg20425130 cg20425384 cg20426866 cg20426994 cg20426994 cg20427865 cg20427879 cg20429911 cg20431191 cg20442697 cg20445283 cg20448594 cg20449048 cg20449670 cg20449726 cg20459035 cg20459849 cg20465207 cg20468081 cg20468939 cg20475322 cg20478261 cg20481312 cg20481640 cg20482698 cg20482698 cg20483374 cg20485084 cg20487608 cg20488657 cg20493497 cg20498685 cg20504007 cg20504202 cg20510033 cg20511548 cg20514061 cg20516209 cg20518446 cg20522398 cg20522483 cg20525486 cg20539816 cg20540913 cg20541039 cg20543651 cg20544605 cg20544605 cg20550118 cg20555507 cg20555562 cg20556304 cg20556517 cg20557104 cg20558320 cg20559594 cg20560283 cg20561863 cg20562447 cg20567361 cg20568402 cg20570179 cg20574732 cg20577468 cg20583073 cg20584732 cg20585500 cg20585500 cg20587968 cg20588069 cg20592017 cg20592700 cg20604286 cg20608783 cg20610594 cg20617977 cg20618610 cg20623503 cg20623506 cg20627916 cg20629021 cg20629315 cg20630151 cg20632978 cg20634074 cg20637223 cg20639396 cg20640246 cg20640374 cg20640432 cg20643991 cg20644425 cg20646500 cg20650545 cg20651018 cg20651995 cg20659752 cg20661303 cg20666386 cg20666585 cg20670302 cg20671578 cg20673075 cg20674521 cg20676716 cg20681747 cg20683151 cg20683151 cg20685713 cg20690667 cg20691436 cg20692268 cg20692569 cg20692569 cg20699586 cg20700740 cg20702527 cg20706495 cg20711218 cg20713492 cg20721467 cg20726195 cg20736065 cg20737266 cg20740434 cg20740711 cg20744163 cg20754145 cg20759626 cg20761322 cg20761322
g20763327 g20764656 g20765408 g20770175 g20775254 g20775959 g20777796 g20778600 g20778688 g20780180 g20783697 g20785674 g20790030 g20791593 g20792294 g20792833 g20793665 g20795401 g20805475 g20806040 g20807254 g20810046 g20816612 g20817822 g20822579 g20822628 g20822990 g20826416 g20826709 g20827128 g20834178 g20837735 g20837735 g20844771 g20849032 g20851030 g20853370 cg20856064 cg20860112 cg20861314 cg20861822 cg20863673 cg20865778 cg20869844 cg20873136 cg20873416 cg20885179 cg20888386 cg20893838 cg20895877 cg20896113 cg20903900 cg20906291 cg20910303 cg20910746 cg20912752 cg20916523 cg20927547 cg20928429 cg20933239 cg20934096 cg20935165 cg20937139 cg20937934 cg20943999 cg20947849 cg20953047 cg20953047 cg20963814 cg20967028 cg20967028 cg20967220 cg20968595 cg20968743
cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2
cg20969242 cg20969242 cg20969424 cg20971407 cg20971527 cg20972917 cg20975074 cg20978460 cg20978858 cg20980592 cg20981848 cg20986887 cg20988616 cg20989409 cg20993403 cg20993403 cg20995753 cg20999427
002542 004490 005369 007342 008894 009747 011133 013395 019662 022435 026469 031128 033440 035142 037527 038780 039380 040575 041775
cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2
1042749 1046413 1046874 1049501 1049762 1050001 1052383 1058822 1058973 1059878 1063899 1067465 1068610 1072795 1073927 1082028 1086153 1088108 1091985 1092324 1096345 1100638 1104449 1106505 1111471 1111471 1113318 1115346 1115691 1118367 1119074 1122774 1128569 1132536 1137417 1139312 1144587
cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2 cg2
1147203 1147829 1150921 1151432 1155100 1156756 1156912 1157873 1163617 1164509 1166964 1167532 1167817 1171130 1172011 1179088 1182103 1186296 1186299 1186299 1186955 1188037 1194776 1194776 1198455 1198502 1199093 1199922 1201401 1201572 1201830 1205663 1210758 1211187 1213593 1215337 1218627
221690
cg2
1303011
cg2
1435375
1523812
cg2
1615663
222370
cg2
1304163
cg2
1436413
1529807
cg2
1618333
222426
cg2
1304234
cg2
1441211
1531389
cg2
1623633
222559
cg2
1311834
cg2
1446955
1533262
cg2
1629166
225548
cg2
1319932
cg2
1449569
1538216
cg2
1629591
230435
cg2
1324456
cg2
1450888
1544931
cg2
1632975
232671
cg2
1328082
cg2
1452219
1545720
cg2
1632975
233879
cg2
1331510
cg2
1455600
1547649
cg2
1634602
234032
cg2
1338747
cg2
1457147
1548340
cg2
1635858
234506
cg2
1340500
cg2
1458907
1550483
cg2
1638219
235151
cg2
1346043
cg2
1459645
1552014
cg2
1641834
236655
cg2
1351483
cg2
1460081
1554552
cg2
1643045
236845
cg2
1353724
cg2
[461300
[559386
cg2
[643178
238457
cg2
1363050
cg2
[468971
[561712
cg2
[655444
239439
cg2
1363348
cg2
[473407
[565960
cg2
[658616
240283
cg2
1365602
cg2
[475076
[569714
cg2
[660130
241823
cg2
1366688
cg2
[475402
[571135
cg2
[661379
242356
cg2
1368161
cg2
[478137
[571160
cg2
[663341
243631
cg2
1370255
cg2
[486341
[572722
cg2
[663580
245729
cg2
1373996
cg2
[487856
?2]
[572722
cg21
[663580
249091
cg2
1374307
cg2]
[488156
?2]
[572997
cg2]
[663667
249829
cg2
[376733
cg2]
[488876
?2]
[574271
cg2]
[664636
253087
cg2
[377950
cg2]
[491443
?2]
[576525
cg2]
[665774
255438
cg2
[382382
cg2]
[492378
?2]
[581873
cg2]
[667878
255438
cg2
[382890
cg2]
493727
?2]
[582785
cg2]
669679
263566
cg2
1383284
cg21
493768
S2J
582831
cg21
672992
270593
cg2
[385746
cg21
494075
?21
585100
cg2J
683390
270847
cg2
[394171
cg21
494776
?21
591742
cg21
684012
273036
cg2]
[402071
cg21
495715
?21
593030
cg21
685565
275690
cg2]
[404851
cg21
499869
?21
596858
cg21
691367
279316
cg2]
405929
cg21
501234
?21
602520
cg21
698310
286782
cg2]
406271
cg2]
501358
?21
605283
cg2J
703138
292981
cg21
407899
cg21
502154
;2i
607649
cg21
710826
296230
cg21
413797
cg2J
505334
;2i
608605
cg2]
712678
299491
cg2]
430752
cg2]
509846
;2i
609808
cg2]
715751
300373
cg2]
432842
cg2]
510284
;2i
613549
cg2]
730858
302133
cg2]
434530
cg2]
523751
;2i
614107
cg2]
743182
745586
cg2
1861151
cg21949194
$22074858
cg22188918
747271
cg2
1861233
cg21950534
$22076123
cg22189618
748136
cg2
1864730
cg21954542
^22076311
cg22191277
752469
cg2
1865249
cg21957174
$22079102
cg22192069
753652
cg2
1870038
cg21959598
$22093306
cg22192489
766592
cg2
1870229
cg21961149
> 22095263
cg22198044
770617
cg2
1870884
cg21961766
$22098115
cg22199080
772178
cg2
1870884
cg21964649
$22101249
cg22203219
775245
cg2
1872383
cg21966410
$22103601
cg22210627
777166
cg2
1876918
cg21966860
$22108360
cg22213042
788615
cg2
1879102
cg21968796
$22108469
cg22213242
790626
cg2
1879272
cg21972382
$22110839
cg22220722
801378
cg2
1880888
cg21979032
$22112832
cg22225849
801378
cg2
1881093
cg21988461
$22118112
cg22227345
808053
cg2
1883598
cg21995304
$22118297
cg22231400
812277
cg2
[887193
cg22004774
$22121647
cg22232859
812313
cg2
[889604
cg22007110
$22122715
cg22233512
814178
cg2
[890423
cg22008490
$22123885
cg22239213
820677
cg2
[890646
cg22009751
$22124221
cg22242539
820890
cg2
[896720
cg22009908
$22124564
cg22243439
821308
cg2
[898046
cg22013564
$22125433
cg22254463
827203
cg2]
[899777
cg22016779
$22125968
cg22261226
830368
cg2]
[902327
cg22016949
$22127491
cg22261669
838625
cg2]
903395
cg22022716
$22143285
cg22262702
842274
cg2]
912556
cg22024479
$22143352
cg22262704
843902
cg21
913376
cg22029275
$22148827
cg22269291
844956
cg21
916461
cg22031964
$22153994
cg22269795
845390
cg21
920221
cg22032528
$22156456
cg22271353
845794
cg2]
926883
cg22036487
$22158769
cg22274117
850852
cg2]
932672
cg22037648
$22158769
cg22274745
851553
cg2]
932814
cg22043361
$22162847
cg22275125
851937
cg2]
935981
cg22046121
$22167515
cg22277567
853021
cg21
936959
cg22047295
$22169990
cg22278901
854332
cg21
937886
cg22049858
$22171613
cg22280238
857843
cg2]
939215
cg22059812
$22181664
cg22280705
858764
cg21
942218
cg22061523
$22184944
cg22281697
860846
cg2]
944234
cg22063056
$22188058
cg22282410
cg22282410 cg22283058 cg22284302 cg22285878 g22286764 g22289360 g22291711 g22292753 g22295573 g22304262 g22306009 g22306015 g22310062 g22319147 g22327646 g22328746 g22328895 g22332339 g22335801 g22338446 g22346461 g22350438 g22352818 g22359581 g22359781 g22365167 g22365276 g22366001 g22367264 g22368262 g22375009 g22376758 g22377389 g22379472 g22381196 g22388634 g22391205 cg22392708 cg22396755 cg22399111 cg22403851 cg22407458 cg22407942 cg22413209 cg22413388 cg22415591 cg22416916 cg22417733 cg22418909 cg22424284 cg22433862 cg22436086 cg22436753 cg22437221 cg22443975 cg22445447 cg22449854 cg22452170 cg22453656 cg22453826 cg22454011 cg22454022 cg22454769 cg22455694 cg22459664 cg22461758 cg22462657 cg22469841 cg22482278 cg22485938 cg22486630 cg22488568 cg22490695 cg22493809 cg22497969 cg22498143 cg22500132 cg22500261 cg22501608 cg22502502 cg22512670 cg22512779 cg22514229 cg22518433 cg22522688 cg22523050 cg22529396 cg22530691 cg22537280 cg22541143 cg22542731 cg22544485 cg22544679 cg22547775 cg22561647 cg22566058 cg22566906 cg22571393 cg22572820 cg22575127 cg22575966 cg22581200 cg22584911 cg22585988 cg22588546 cg22589778 cg22591964 cg22598885 cg22601215 cg22610620 cg22614759 cg22617819 cg22618405 cg22618720 cg22627427 cg22627427 cg22630169 cg22632947 cg22637941 cg22638505 cg22647018 cg22648929 cg22658846 cg22660578 cg22660933 cg22674717 cg22682161 cg22688012 cg22689909 cg22692158 cg22694318 cg22696167 cg22699768 cg22701534 cg22702056 cg22708087 cg22710840 cg22711111 cg22714942 cg22718139 cg22719241 cg22720029 cg22721827 cg22727783 cg22729726 cg22730004 cg22731271 cg22731578 cg22732549 cg22733608 cg22734058 cg22734085 cg22734236 cg22736354 cg22736354 cg22738281 cg22740835 cg22740835 cg22745143 cg22749810 cg22753340 cg22755142 cg22756211 cg22756951 cg22758916 cg22762091 cg22764497 cg22768487 cg22770294 cg22771548 cg22771904 cg22772747 cg22775000 cg22777467 cg22778957 cg22779765 cg22783363 cg22785294 cg22786486 cg22788953 cg22789318 cg22792176 cg22792862 cg22792910 cg22793129
cg22793142 cg22795216 cg22795345 cg22796363 cg22796704 cg22797514 cg22797884 g22799321 g22800400 g22801799 g22803868 g22804475 g22805688 g22808478 g22809047 g22809047 g22809683 g22820108 g22821606 g22822219 g22844623 g22848982 g22851944 g22855020 g22862656 g22864500 g22867729 g22871227 g22872553 g22872857 g22873165 g22879834 g22881914 g22885000 g22886323 g22887467 g22887845 cg22888181 cg22892373 cg22895377 cg22901840 cg22901840 cg22905097 cg22906709 cg22909609 cg22911462 cg22920873 cg22924545 cg22929506 cg22932313 cg22932808 cg22933646 cg22934200 cg22934449 cg22940273 cg22943986 cg22945824 cg22947000 cg22954906 cg22958315 cg22969108 cg22977481 cg22979615 cg22980079 cg22980079 cg22985172 cg22985785 cg22986569 cg22986597 cg22987116 cg22988566 cg22988581 cg22989407 cg22991506 cg22995449 cg22997040 cg22999099 cg23002761 cg23004031 cg23007087 cg23008404 cg23010507 cg23013029 cg23015118 cg23016776 cg23021014 cg23023970 cg23024047 cg23028772 cg23029021 cg23031103 cg23032032 cg23032032 cg23033014 cg23034818 cg23037132 cg23037321 cg23041410 cg23042148 cg23044884 cg23046231 cg23047271 cg23047544 cg23049142 cg23049737 cg23051392 cg23055735 cg23060646 cg23067085 cg23068499 cg23069297 cg23078268 cg23079252 cg23079727 cg23080818 cg23082393 cg23085167 cg23089272 cg23090583 cg23091758 cg23091758 cg23093496 cg23093496 cg23098693 cg23099587 cg23105697 cg23108580 cg23109867 cg23114594 cg23119977 cg23124755 cg23125970 cg23126152 cg23126915 cg23128495 cg23130254 cg23130731 cg23132327 cg23138261 cg23141355 cg23141855 cg23146358 cg23152667 cg23152743 cg23163013 cg23167351 cg23171972 cg23173301 cg23174919 cg23174932 cg23175074 cg23181133 cg23186333 cg23190089 cg23192683 cg23193870 cg23194776 cg23199335 cg23201812 cg23205648 cg23206160 cg23206851 cg23207054 cg23208881 cg23209285 cg23209302 cg23211949 cg23212751 cg23213217 cg23213217 cg23213449 cg23214249 cg23216434 cg23219570 cg23220769 cg23222278 cg23229016 cg23239344 cg23240479 cg23241914 cg23243267 cg23244913 cg23246666 cg23248910 cg23250795
g23250906 g23251798 g23255934 g23257220 g23259694 g23261319 g23261343 g23264429 g23266398 g23266869 g23267110 g23278418 g23282674 g23287005 g23290313 g23290344 g23297477 g23301563 g23303685 g23311108 g23314200 g23314364 g23314826 g23317857 g23320056 g23320056 g23322242 g23322523 g23331981 g23334507 g23336143 g23336996 g23340218 g23341299 g23342718 g23344780 g23346408 cg23346622 cg23348155 cg23352492 cg23352712 cg23355126 cg23355126 cg23361092 cg23361127 cg23366752 cg23367119 cg23371476 cg23371584 cg23371754 cg23373850 cg23379806 cg23382741 cg23382741 cg23383149 cg23383189 cg23387863 cg23394391 cg23395449 cg23398076 cg23402986 cg23404366 cg23404877 cg23412850 cg23413697 cg23414595 cg23416081 cg23416667 cg23418467 cg23418591 cg23430295 cg23432345 cg23432368 cg23438015 cg23441616 cg23444894 cg23445604 cg23455982 cg23457901 cg23462242 cg23464619 cg23466059 cg23466491 cg23471848 cg23478225 cg23487226 cg23489273 cg23489434 cg23491790 cg23492432 cg23497016 cg23497020 cg23499956 cg23500537 cg23502378 cg23502772 cg23503691 cg23505966 cg23507945 cg23510258 cg23510527 cg23512958 cg23516310 cg23517605 cg23520347 cg23521140 cg23528975 cg23531640 cg23531697 cg23533683 cg23533881 cg23538468 cg23539753 cg23541975 cg23542968 cg23551494 cg23553480 cg23553912 cg23555120 cg23555120 cg23557926 cg23558337 cg23558764 cg23563866 cg23567627 cg23571857 cg23577865 cg23580024 cg23586595 cg23587176 cg23590202 cg23595413 cg23601905 cg23602690 cg23606718 cg23606718 cg23608384 cg23610820 cg23612220 cg23614811 cg23620639 cg23621817 cg23625106 cg23625458 cg23628350 cg23629187 cg23630423 cg23635560 cg23639692 cg23640701 cg23641267 cg23646375 cg23651728 cg23651872 cg23655939 cg23656110 cg23661000 cg23661721 cg23663476 cg23663476 cg23669081 cg23670779 cg23670794 cg23673974 cg23674202 cg23674602 cg23677000 cg23678254 cg23679141 cg23679492 cg23680451 cg23681213 cg23681599 cg23681687 cg23681745 cg23683800 cg23684198 cg23684410 cg23685856 cg23686014 cg23689080 cg23689428 cg23690893 cg23695504 cg23696618
g23696712 g23696886 g23696886 g23696949 g23697093 g23700859 g23704082 g23704362 g23704802 g23705113 g23710218 g23717696 g23719367 g23719367 g23719713 g23722790 g23732024 g23736307 g23741639 g23743114 g23744638 g23749046 g23749482 g23752752 g23756272 g23757461 g23757899 g23759826 g23768572 g23769785 g23777479 g23777956 g23778596 g23780488 g23780491 g23782145 g23788167 cg23797100 cg23797100 cg23804620 cg23811057 cg23815853 cg23817637 cg23817981 cg23821329 cg23821359 cg23827531 cg23828876 cg23829949 cg23833452 cg23834593 cg23835646 cg23836413 cg23839180 cg23841186 cg23845773 cg23855093 cg23855989 cg23856138 cg23859313 cg23866403 cg23871507 cg23873021 cg23873415 cg23877608 cg23881601 cg23881926 cg23882019 cg23888462 cg23889010 cg23892310 cg23894219 cg23894287 cg23894539 cg23895495 cg23898073 cg23912072 cg23914969 cg23918047 cg23920251 cg23924222 cg23924737 cg23924887 cg23929194 cg23931819 cg23933216 cg23933289 cg23935616 cg23936476 cg23937059 cg23937582 cg23941599 cg23942526 cg23945952 cg23947872 cg23949925 cg23953396 cg23953820 cg23966363 cg23972301 cg23972738 cg23975564 cg23979832 cg23981150 cg23983887 cg23987257 cg23989963 cg23999170 cg24000223 cg24000797 cg24000908 cg24002003 cg24002149 cg24002183 cg24003306 cg24003542 cg24003542 cg24009074 cg24010336 cg24014538 cg24016044 cg24027780 cg24029028 cg24030037 cg24032190 cg24033742 cg24034992 cg24038764 cg24039081 cg24039697 cg24042452 cg24046474 cg24047926 cg24054700 cg24065807 cg24067911 cg24075745 cg24079702 cg24079727 cg24082460 cg24083702 cg24088438 cg24088438 cg24090529 cg24091474 cg24092253 cg24094897 cg24098131 cg24101049 cg24101359 cg24103651 cg24107674 cg24112628 cg24114556 cg24114813 cg24121001 cg24122922 cg24123824 cg24126880 cg24127874 cg24133115 cg24136780 cg24137774 cg24138691 cg24141135 cg24141153 cg24141382 cg24141991 cg24145118 cg24147582 cg24147596 cg24148817 cg24151207 cg24152251 cg24152976 cg24154336 cg24155668 cg24157982 cg24158259 cg24163360 cg24164564 cg24164786 cg24169915 cg24170040 cg24172570
g24173049 g24174557 g24175188 g24179734 g24183173 g24194539 g24201034 g24203709 g24211304 g24211388 g24212240 g24216701 g24217704 g24219058 g24222580 g24227481 g24228306 g24230696 g24232083 g24232444 g24239961 g24242051 g24245352 g24247370 g24248317 g24248317 g24249542 g24249925 g24249973 g24251111 g24251890 g24254196 g24258886 g24260359 g24274665 g24276395 g24278076 cg24280925 cg24281697 cg24290574 cg24290948 cg24296761 cg24299913 cg24300607 cg24304714 cg24315421 cg24315815 cg24323726 cg24327132 cg24328095 cg24331162 cg24331475 cg24332422 cg24332577 cg24334634 cg24335051 cg24339574 cg24340657 cg24340657 cg24341236 cg24341800 cg24348240 cg24350011 cg24361385 cg24363858 cg24366168 cg24371033 cg24371954 cg24376214 cg24376776 cg24377694 cg24386135 cg24390871 cg24391122 cg24391122 cg24392479 cg24393783 cg24396400 cg24397007 cg24398933 cg24401262 cg24402880 cg24402880 cg24404630 cg24407065 cg24408469 cg24408776 cg24409539 cg24411488 cg24414363 cg24428372 cg24429708 cg24430580 cg24430580 cg24433302 cg24434387 cg24436462 cg24436715 cg24436906 cg24439686 cg24439713 cg24441440 cg24441810 cg24441911 cg24446823 cg24447890 cg24450303 cg24452260 cg24452260 cg24454932 cg24455236 cg24457118 cg24459563 cg24459563 cg24459792 cg24460268 cg24461194 cg24461337 cg24463509 cg24464265 cg24466100 cg24467387 cg24467535 cg24472375 cg24478966 cg24480453 cg24484138 cg24492778 cg24495017 cg24495062 cg24496349 cg24497819 cg24499411 cg24499605 cg24500294 cg24501381 cg24506130 cg24508475 cg24509919 cg24512303 cg24516799 cg24517066 cg24525461 cg24526433 cg24530432 cg24536349 cg24537836 cg24538396 cg24541021 cg24541176 cg24541835 cg24542714 cg24543939 cg24544082 cg24545967 cg24546446 cg24547575 cg24553417 cg24562819 cg24563501 cg24570211 cg24572204 cg24575128 cg24576945 cg24578875 cg24579224 cg24579851 cg24579896 cg24580199 cg24580782 cg24582500 cg24585690 cg24586870 cg24586978 cg24592790 cg24597774 cg24599017 cg24600608 cg24602369 cg24603444 cg24603926 cg24606533 cg24606701 cg24607642 cg24616382
cg24617171 cg24619618 cg24620436 cg24621042 cg24623244 g24625388 g24628744 g24629380 g24630516 g24630957 g24634333 g24635971 g24640577 g24640610 g24642468 g24642820 g24643393 g24645679 g24648061 g24653772 g24653967 g24662107 g24662961 g24669449 g24670715 g24672624 g24674703 g24674703 g24675098 g24677093 g24679317 g24681499 g24681845 g24683222 g24686957 g24687051 g24687806 cg24688939 cg24689976 cg24691330 cg24691336 cg24694549 cg24697184 cg24702147 cg24704287 cg24704593 cg24709511 cg24713122 cg24715988 cg24717401 cg24717490 cg24719901 cg24722577 cg24724428 cg24724428 cg24724513 cg24724587 cg24725201 cg24726121 cg24727122 cg24729617 cg24734575 cg24741563 cg24743122 cg24743310 cg24746666 cg24746938 cg24747122 cg24748548 cg24750391 cg24750752 cg24753061 cg24753998 cg24754199 cg24754277 cg24755163 cg24757310 cg24757926 cg24762359 cg24765446 cg24769295 cg24769846 cg24775616 cg24776480 cg24777950 cg24778614 cg24787470 cg24787755 cg24788090 cg24794433 cg24795748 cg24796546 cg24799830 cg24803202 cg24808754 cg24809973 cg24811290 cg24812523 cg24812523 cg24815529 cg24816460 cg24818418 cg24822053 cg24823222 cg24829483 cg24830730 cg24833277 cg24834740 cg24838345 cg24839386 cg24842753 cg24844046 cg24844295 cg24855780 cg24858591 cg24860886 cg24861272 cg24864241 cg24864831 cg24865623 cg24866923 cg24867501 cg24868271 cg24869815 cg24870273 cg24870391 cg24870568 cg24871414 cg24872425 cg24873093 cg24875415 cg24876577 cg24884444 cg24885937 cg24887211 cg24887387 cg24888257 cg24890045 cg24900666 cg24901637 cg24902339 cg24903006 cg24910675 cg24911837 cg24914860 cg24916358 cg24921221 cg24922143 cg24926185 cg24928687 cg24929896 cg24935409 cg24935900 cg24938727 cg24938752 cg24939196 cg24940706 cg24950894 cg24951263 cg24952936 cg24959428 cg24960947 cg24961970 cg24965479 cg24966958 cg24967811 cg24969820 cg24970181 cg24971112 cg24973226 cg24974704 cg24976262 cg24980213 cg24980653 cg24980904 cg24983752 cg24984423 cg24985525 cg24986868 cg24988451 cg24989962 cg24997231 cg24997562 cg24997562 cg25002125
g25004840 g25009498 g25010752 g25011252 g25015277 g25020204 g25021051 g25021182 g25021247 g25021247 g25023994 g25026013 g25028189 g25028308 g25032595 g25033993 g25036707 g25039325 g25042226 g25055477 g25063165 g25063515 g25064331 g25065535 g25067197 g25069807 g25071429 g25073700 g25074170 g25076881 g25080182 g25082710 g25090604 g25095697 g25095814 g25096745 g25098793 cg25101936 cg25102206 cg25104555 cg25105990 cg25110734 cg25113462 cg25115460 cg25115460 cg25117091 cg25121227 cg25123470 cg25124406 cg25124433 cg25132230 cg25132276 cg25135333 cg25141674 cg25141674 cg25142500 cg25148589 cg25149122 cg25151376 cg25152942 cg25153233 cg25154482 cg25156443 cg25159149 cg25161029 cg25164996 cg25170017 cg25174412 cg25174438 cg25177139 cg25179876 cg25181507 cg25182523 cg25186492 cg25189564 cg25195968 cg25196088 cg25198340 cg25198847 cg25203286 cg25203980 cg25210609 cg25212701 cg25212763 cg25214346 cg25214966 cg25215834 cg25221625 cg25221625 cg25225756 cg25227803 cg25228126 cg25228995 cg25234611 cg25242556 cg25245569 cg25247520 cg25248094 cg25249728 cg25250358 cg25259754 cg25261059 cg25261181 cg25264265 cg25268678 cg25277632 cg25282976 cg25286715 cg25287482 cg25288034 cg25288675 cg25292098 cg25296103 cg25296314 cg25298754 cg25302419 cg25305774 cg25305879 cg25309567 cg25310241 cg25313172 cg25319570 cg25321549 cg25321549 cg25322094 cg25329734 cg25334660 cg25334934 cg25335258 cg25336579 cg25340403 cg25341726 cg25343388 cg25343661 cg25344503 cg25351353 cg25353399 cg25355904 cg25356006 cg25362585 cg25363807 cg25365421 cg25368651 cg25369015 cg25370039 cg25371267 cg25373579 cg25373595 cg25374649 cg25375420 cg25376316 cg25376593 cg25378917 cg25382573 cg25384089 cg25384897 cg25388882 cg25391092 cg25397054 cg25397840 cg25407979 cg25408237 cg25408314 cg25410010 cg25410668 cg25416149 cg25418001 cg25420952 cg25422943 cg25423135 cg25425078 cg25426743 cg25426743 cg25431916 cg25432518 cg25433648 cg25433648 cg25441338 cg25446086 cg25449862 cg25454110 cg25459280 cg25459300 cg25462303 cg25463688
g25467973 g25468928 g25469406 g25474373 g25477769 g25478614 g25479682 g25481253 g25483003 g25486399 g25488206 g25488206 g25490145 g25492645 g25495650 g25499099 g25502267 g25504868 g25509174 g25509184 g25511807 g25515269 g25518968 g25528121 g25535999 g25538571 g25539628 g25547580 g25547580 g25552768 g25561140 g25562664 g25564800 g25564800 g25567048 g25570495 g25574024 cg25574175 cg25574765 cg25578176 cg25579180 cg25580656 cg25581222 cg25587069 cg25587233 cg25588852 cg25588935 cg25590181 cg25602692 cg25603108 cg25607249 cg25616787 cg25620220 cg25623339 cg25626264 cg25633678 cg25634000 cg25637473 cg25638611 cg25649000 cg25649765 cg25650964 cg25652701 cg25655096 cg25663823 cg25664034 cg25665528 cg25666403 cg25668058 cg25669504 cg25670076 cg25670376 cg25670583 cg25671716 cg25673591 cg25678929 cg25684105 cg25686746 cg25690715 cg25691167 cg25692621 cg25698726 cg25701444 cg25701646 cg25703346 cg25706012 cg25718402 cg25718467 cg25719378 cg25719851 cg25720804 cg25726549 cg25727025 cg25730564 cg25736145 cg25737218 cg25737491 cg25737664 cg25738116 cg25739715 cg25739938 cg25741452 cg25743043 cg25746092 cg25748441 cg25748958 cg25750259 cg25750259 cg25750363 cg25752514 cg25752703 cg25753473 cg25754195 cg25758828 cg25761326 cg25763788 cg25765315 cg25769469 cg25769980 cg25772418 cg25778166 cg25778262 cg25778479 cg25781162 cg25782293 cg25788549 cg25790133 cg25792581 cg25797455 cg25799059 cg25799109 cg25799864 cg25799986 cg25814383 cg25816127 cg25817430 cg25819429 cg25821785 cg25823926 cg25826226 cg25827710 cg25835936 cg25840318 cg25840378 cg25840536 cg25854298 cg25856811 cg25859998 cg25865120 cg25865553 cg25866075 cg25868126 cg25870420 cg25871890 cg25872855 cg25874782 cg25883066 cg25883149 cg25883405 cg25885280 cg25886621 cg25890678 cg25892168 cg25893679 cg25898146 cg25908434 cg25913233 cg25913233 cg25913612 cg25915982 cg25916282 cg25919221 cg25922751 cg25928199 cg25929976 cg25933726 cg25934700 cg25936138 cg25939644 cg25941083 cg25941716 cg25941751 cg25942990 cg25943276 cg25945374
g25945642 g25946605 g25946646 g25947619 g25947970 g25949502 g25951430 g25953239 g25953692 g25954028 g25956089 g25960038 g25961432 g25963511 g25964007 g25966705 g25969122 g25976672 g25978327 g25981920 g25981998 g25985778 g25987020 g25993718 g25999267 g25999578 g25999604 g25999637 g26003222 g26005082 g26006910 g26007358 g26008272 g26008877 g26009832 g26010218 g26013975 cg26015513 cg26015888 cg26016267 cg26016985 cg26018685 cg26019295 cg26021007 cg26023389 cg26024843 cg26026416 cg26026558 cg26026748 cg26027052 cg26029997 cg26030804 cg26031954 cg26033586 cg26034341 cg26039954 cg26046204 cg26050734 cg26050975 cg26052885 cg26053480 cg26053840 cg26055747 cg26061357 cg26063719 cg26065488 cg26065841 cg26066361 cg26069745 cg26070379 cg26071414 cg26071556 cg26073060 cg26079753 cg26079857 cg26080305 cg26087625 cg26088629 cg26093687 cg26096837 cg26099164 cg26099316 cg26099316 cg26103845 cg26109030 cg26109154 cg26109199 cg26109568 cg26110064 cg26110834 cg26111030 cg26111283 cg26112797 cg26113512 cg26116400 cg26117023 cg26117023 cg26118821 cg26119740 cg26120093 cg26120636 cg26124016 cg26127425 cg26132947 cg26134665 cg26140366 cg26140475 cg26144567 cg26146561 cg26147845 cg26149678 cg26150462 cg26152017 cg26152051 cg26158959 cg26159905 cg26160564 cg26161816 cg26162147 cg26164488 cg26164907 cg26165146 cg26166817 cg26170660 cg26174326 cg26182406 cg26186727 cg26188212 cg26189303 cg26189983 cg26190381 cg26193427 cg26196087 cg26200347 cg26200585 cg26203328 cg26203383 cg26205890 cg26207503 cg26207909 cg26209169 cg26214026 cg26216618 cg26216760 cg26217402 cg26218269 cg26221105 cg26226555 cg26228280 cg26232412 cg26233468 cg26236972 cg26238727 cg26246138 cg26251865 cg26252167 cg26255314 cg26259171 cg26259363 cg26264032 cg26267038 cg26267310 cg26273417 cg26275543 cg26275858 cg26279336 cg26280326 cg26285698 cg26285698 cg26285749 cg26290632 cg26291600 cg26292910 cg26293512 cg26296574 cg26296653 cg26297005 cg26299169 cg26301689 cg26306289 cg26306329 cg26311782 cg26312920 cg26314534 cg26314765
g26316946 g26317555 g26328335 g26328757 g26333660 g26334507 g26334888 g26335251 g26337312 g26340149 g26342670 g26344532 g26348487 g26353287 g26353877 g26361535 g26362368 g26363363 g26363759 g26364809 g26365553 g26365553 g26365925 g26366109 g26376241 g26379012 g26380756 g26385097 g26385256 g26385286 g26386472 g26390598 g26391080 g26393630 g26394055 g26401551 g26401673 cg26407106 cg26407316 cg26407558 cg26408382 cg26412358 cg26417346 cg26418880 cg26422458 cg26424013 cg26427777 cg26428825 cg26429042 cg26429629 cg26430059 cg26431815 cg26433975 cg26439963 cg26441910 cg26449680 cg26450149 cg26451373 cg26453360 cg26456435 cg26456957 cg26456957 cg26457013 cg26457248 cg26457700 cg26461695 cg26466801 cg26469379 cg26469895 cg26472036 cg26472133 cg26473189 cg26474124 cg26474549 cg26478401 cg26482939 cg26485376 cg26487259 cg26495393 cg26495711 cg26496307 cg26496307 cg26501139 cg26508200 cg26511075 cg26511507 cg26514793 cg26515926 cg26517376 cg26518580 cg26521139 cg26521404 cg26523005 cg26524347 cg26531174 cg26533595 cg26535992 cg26536164 cg26537478 cg26537639 cg26537941 cg26538442 cg26538442 cg26539736 cg26539823 cg26541218 cg26541233 cg26552030 cg26556065 cg26561401 cg26561681 cg26565660 cg26568031 cg26570233 cg26570804 cg26570844 cg26573382 cg26575622 cg26578983 cg26579578 cg26583078 cg26584983 cg26589025 cg26591066 cg26595828 cg26595893 cg26598899 cg26601431 cg26608199 cg26610808 cg26614073 cg26619296 cg26619317 cg26619790 cg26619894 cg26620655 cg26620747 cg26621088 cg26624294 cg26624628 cg26624794 cg26626042 cg26632897 cg26639906 cg26640110 cg26644395 cg26645082 cg26649504 cg26650359 cg26653714 cg26654807 cg26655004 cg26655340 cg26656452 cg26658846 cg26661922 cg26663636 cg26665274 cg26668608 cg26671477 cg26673195 cg26673629 cg26673975 cg26674160 cg26675129 cg26675485 cg26675523 cg26676129 cg26676405 cg26680502 cg26681770 cg26682499 cg26683005 cg26684319 cg26687072 cg26687173 cg26692085 cg26697605 cg26700215 cg26701826 cg26704078 cg26705561 cg26706403 cg26711820 cg26719625
g26720010 g26720338 g26720338 g26723847 g26727372 g26727372 g26728422 g26728709 g26731187 g26735478 g26738880 g26740249 g26745032 g26746309 g26750002 g26750742 g26752613 g26755793 g26757793 g26758857 g26764980 g26765385 g26766373 g26767154 g26767897 g26769927 g26775866 g26776722 g26779330 g26780125 g26786253 g26788142 g26789038 g26791879 g26798861 g26799416 g26799474 cg26804423 cg26806924 cg26807340 cg26807961 cg26808293 cg26811313 cg26814100 cg26814635 cg26817382 cg26817546 cg26817573 cg26817877 cg26818489 cg26819590 cg26823505 cg26827987 cg26830108 cg26831119 cg26832211 cg26834244 cg26841277 cg26842024 cg26842024 cg26842802 cg26845300 cg26845300 cg26847438 cg26849830 cg26851107 cg26851650 cg26853371 cg26856604 cg26864905 cg26873457 cg26873935 cg26876680 cg26876703 cg26880525 cg26881535 cg26889552 cg26889659 cg26894575 cg26895804 cg26896255 cg26898077 cg26904406 cg26905768 cg26906629 cg26907768 cg26908825 cg26909981 cg26912890 cg26915558 cg26915799 cg26916966 cg26917873 cg26917899 cg26919387 cg26921881 cg26923629 cg26923862 cg26924825 cg26924967 cg26928972 cg26931208 cg26931990 cg26931990 cg26932693 cg26937148 cg26937389 cg26938676 cg26940122 cg26940261 cg26942829 cg26945748 cg26946259 cg26946259 cg26954174 cg26954609 cg26955512 cg26959257 cg26959655 cg26960083 cg26960719 cg26962618 cg26963545 cg26964636 cg26966989 cg26968025 cg26971042 cg26971928 cg26974444 cg26975459 cg26976437 cg26978172 cg26980692 cg26983710 cg26984694 cg26986438 cg26987690 cg26987699 cg26988523 cg26988617 cg26992600 cg26999360 cg27000120 cg27000496 cg27000590 cg27002325 cg27002516 cg27005749 cg27009392 cg27010096 cg27012424 cg27018070 cg27019278 cg27022827 cg27032781 cg27039662 cg27041619 cg27043531 cg27048140 cg27048684 cg27049094 cg27049766 cg27051231 cg27051260 cg27057525 cg27067618 cg27067621 cg27067781 cg27067781 cg27070162 cg27079341 cg27080119 cg27083891 cg27084746 cg27089675 cg27090029 cg27090784 cg27092248 cg27092594 cg27093918 cg27093944 cg27094698 cg27104173 cg27105990 cg27107685
g27107970 g27108984 g27109650 g27115788 g27115863 g27117792 g27120405 g27121758 g27126442 g27127903 g27130993 g27133310 g27134365 g27138018 g27142354 g27143049 g27143664 g27150896 g27152661 g27160395 g27160952 g27165456 g27165836 g27169020 g27173971 g27176614 g27177296 g27178401 g27178567 g27179101 g27188703 g27189973 g27190138 g27197276 g27197524 g27198071 g27198931 cg27201679 cg27208307 cg27209395 cg27214856 cg27215131 cg27215236 cg27215768 cg27221338 cg27222162 cg27223047 cg27225068 cg27226147 cg27239243 cg27243507 cg27244120 cg27244482 cg27246571 cg27252696 cg27255275 cg27255653 cg27256309 cg27257408 cg27258272 cg27261219 cg27261397 cg27262041 cg27262850 cg27265499 cg27268486 cg27271368 cg27273946 cg27275023 cg27276079 cg27277403 cg27278017 cg27284288 cg27285599 cg27285599 cg27285720 cg27285720 cg27288226 cg27289137 cg27292389 cg27294268 cg27295118 cg27297441 cg27306986 cg27307240 cg27307781 cg27308319 cg27309098 cg27316811 cg27317813 cg27318546 cg27320213 cg27322071 cg27324804 cg27332026 cg27333706 cg27333993 cg27335855 cg27338109 cg27340480 cg27345111 cg27347290 cg27351449 cg27353308 cg27353361 cg27357306 cg27358154 cg27362010 cg27365208 cg27365701 cg27366162 cg27369307 cg27372015 cg27373390 cg27377213 cg27377213 cg27377289 cg27377863 cg27380915 cg27385126 cg27387888 cg27391679 cg27391934 cg27392775 cg27394486 cg27395654 cg27398499 cg27400772 cg27405706 cg27405731 cg27408345 cg27412093 cg27412857 cg27413290 cg27415283 cg27416337 cg27420224 cg27433088 cg27436184 cg27436952 cg27444290 cg27446570 cg27449041 cg27449114 cg27452922 cg27453857 cg27455540 cg27456707 cg27461254 cg27463491 cg27465569 cg27468976 cg27470554 cg27471192 cg27478167 cg27480371 cg27485596 cg27496339 cg27499925 cg27500983 cg27507473 cg27508545 cg27512727 cg27523417 cg27526549 cg27526774 cg27527798 cg27528330 cg27531236 cg27534624 cg27536151 cg27537125 cg27537972 cg27539060 cg27539480 cg27545367 cg27547841 cg27549944 cg27550918 cg27553890 cg27558485 cg27563027 cg27565067 cg27567206 cg27569300
cg27569446 cg27570256 cg27571590 cg27572068 cg27573017 cg27579745 cg27583010 cg27586249 cg27587141 cg27592331 cg27596297 cg27598340 cg27598583 cg27601809 cg27606396 cg27607584 cg27608806 cg27610561 cg27614534 cg27616751 cg27619475 cg27620946 cg27622679 cg27624162 cg27625732 cg27626102 cg27628340 cg27629453 cg27635271 cg27637521 cg27638288 cg27641239 cg27641628 cg27648216
cg27648556
cg27648858
cg27650175
cg27651480
cg27652350
cg27661846
cg27662412
cg27665659
ch.l.l356605F
ch.L1604750R
ch.L171672612F
ch.l.219558214F
ch.l.234902740R
ch.l.2582316R
ch.l.3056292F
ch.l.3128389F
ch.l.3280899F
ch.l.3571292R
ch.l.38337696R
ch.L4512450F
ch.l.64660926R
ch.l0.14508944R
ch.l0.1700276F
ch.l0.20960905R
ch.l0.2166669R
ch.l0.2480690F
ch.l0.2563868F
ch.l0.2610459F
ch.l0.2770541R
ch.l0.2988224F
ch.l0.31370070F
ch.l0.80061816F ch.l 1.102211250F
ch.ll.H0310046R
ch.ll.H0329410F
ch.H.1435292F
ch.H.1877857R
ch.H.1980478F
ch.ll.2716790F
ch.l2.105153690R
ch.l2.1173053R
ch.l2.1993261F
ch.l2.2480290F
ch.l2.2506678F
ch.l3.39564907R
ch.l3.470465F
ch.l3.654879R
ch.l5.1197129R
ch.l5.814613R
ch.l5.920727F
ch.l5.934240F
ch.l6.364290R
ch.l6.406779R
ch.l6.49831971R
ch.l6.50203954R
ch.l6.82520294R
ch.l6.83989841F
ch.l6.97779F
ch.l7.45797972F
ch.l8.265776F
ch.l8.310800R
ch.l9.1066737F
ch.l9.36684304F
ch.l9.931611R
ch.2.119267486F ch.2.16090152F
ch.2.168147954R
ch.2.1904845F
ch.2.200609314R
ch.2.216208170F
ch.2.217478R
ch.2.217484879F
ch.2.226789810F
ch.2.2729437F
ch.2.4104651R
ch.2.4116732R
ch.2.47286786F
ch.2.66207210F
ch.2.740763F
ch.20.1019750F
ch.20.12652500F
ch.20.1295406F
ch.20.209864F
ch.20.22943799F
ch.21.40139802R
ch.21.825836R
ch.3.1083063F
ch.3.3021133F
ch.3.3371471R
ch.3.72737075R
ch.3.82259654F
ch.4.1463482R
ch.4.1889364R
ch.5.2313526R
ch.5.2522686R
ch.5.3304132F
ch.5.5396883R
ch.5.58219013F ch.5.762713R
ch.6.107549394R
ch.6.113866684R
ch.6.115952F
ch.6.2510917R
ch.6.2958553R
ch.6.3068315F
ch.6.33611621F
ch.7.114512964F
ch.7.1147807F
ch.7.135065R
ch.7.137597056R
ch.7.1427355R
ch.7.2184863F
ch.7.2902493F
ch.7.313144R
ch.7.3189261R
ch.7.33727552F
ch.7.45985950F
ch.7.51839018F
ch.7.93764192R
ch.8.120035F
ch.8.128185533F
ch.8.2343166R
ch.8.842844F
ch.8.903080R
ch.8.91748119F
ch.8.93711588R
ch.9.1241711R
ch.9.1395144F
ch.9.837340R
ch.9.84078312F
cg25428494
cgl5103195
-16.751974190985
-0.124544533442909
7.148638465739e-49
AP1S1
cg25564800
-16.7513583409591
-0.203278491745982
7.19360359893161e-49
KPNA1;KPNA1
cg06385324
-16.739649101605
-0.0802841036382095
8.1043573080769e^9
SNHG9;SNORA78;RPS2
cg25743481
-16.6073950720582
-0.085520617708043
3.11138617204601e-48
KF15;KIF15;KIAA1143
cg03622664
16.5875108377517
0.173164656349484
3.80810204611931e~4S
XP04
cg05845376
16.5529366092749
0.345734119282022
5.41054101359894e-48
SLC25A2
cg23049737
16.5418988327734
0.194612180860708
6.05232087811392e~48
RERE;RERE;RERE
cg04880751
-16.5240043296113
-0.232072776266277
7.25820657297687e^l8
KMO
cgl7726575
-16.5236852119725
-0.297693801618786
7.28175953884864e-48
E2F6;E2F6;E2F6;E2F6;E2F6
cg03663556
-16.4866436193502
-0.238915487473683
1.06050985836159e^47
cg01504784
16.4403197737016
0.203194205657518
1.69666349175639e-47
KHSRP
cgl2551813
16.329927878381
0.163909037547665
5.19293256947523e-47
CAMSAP1L1
cgl0255237
-16.2577100029378
-0.382963769596819
1.07852003828709e-46
ch.2.217478R
-16.1278732067056
-0.082806210832541
4.00557724045975e-46
cg24579224
16.1256201991789
0.253714839925411
4.09773328511391e-46
SKI
cg22720029
-16.1065002941557
-0.155462511653003
4.97008496294075e-46
cg22310062
-16.0660917444665
-0.0827904126444746
7.47192675789654e-46
ESCOl
cgl2352399
-16.0476923183733
-0.354253208479164
8.99543986715439e-46
TOP2B
ch.4.194519R
-16.0237045058865
-0.0910256256794298
1.14565936757733e-45
cg22454022
-15.9793499492721
-0.287333714498312
1.79128442750003e-45
C8orf34
cg02397064
15.9032981698878
0.176244015747242
3.85192774818228e-45
SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9
cg08847919
15.8605490438808
0.140431146956435
5.92120511681486e-45
TPCN2
cg20765408
-15.8556369203745
-0.307441302134877
6.22097566829647e-45
PARP4
cg09853702
-15.802931571161
-0.345413560080071
1.05653760687489e-44
cgl7306740
-15.6869108879714
-0.209360449489875
3.38486660471907e44
ZBP1 ;ZBP 1 ;ZBP 1 ;ZBP 1 ;ZBP 1 ;ZBP 1 ;ZBP 1; ZBP1
cgO1205324
-15.5859142782972
-0.0711817357993311
9.30920672207116e-44
cgl6561172
-15.5355012967092
-0.109147569080023
1.5414868485462e-43
cg08404702
15.529429689078
0.113698207926064
1.63796945215574e43
TSC2;TSC2;TSC2
cg05256204
15.5263375067131
0.222404308989926
1.6894001272086e-43
cg09086037
15.5026226372848
0.0755773120908412
2.14132030227917e43
TRIO
cg00660272
-15.4954170497564
-0.133150340741212
2.30119471388011e43
CNR2
cg21052656
-15.4684447694063
-0.290403018693104
3.01283536279913e-43
AIP
cg24888989
-15.449978802621
-0.0567217615689298
3.62292415436116e-43
KIF15;KIF15;KIAA1143
cgl8773937
-15.4277555395569
-0.261673570571674
4.52274858665317e43
IL1B
cg02632314
-15.3988743733308
-0.291663031565454
6.03324728078442e43
ELF1;ELF1
cgl3289869
-15.3781053871552
-0.0557901490427667
7.42176177711632e-43
OTX1
cgl8867912
15.3768690231623
0.123527014929543
7.51382267566571e43
WDR88;WDR88
cg00702638
-15.3705340973473
-0.0675036873705257
8.00371639962428e-43
KIF15;KIF15;KIAA1143
cg21151287
15.3281406690675
0.121593231211836
1.22116951707282e-42
TRIO
cgl5186638
-15.3234867831995
-0.206940228427436
1.27911551006608e42
cg05337753
15.3203317248242
0.170299083976909
1.31995 248355669e42
SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9
cgl4119680
15.3186054248203
0.118845068069845
1.34284471300444e-42
ABL1;ABL1
cgOl176748
-15.3102506846408
-0.0697288092449808
1.45936080245404e-42
HAUS4;HAUS4;HAUS4
cgl4723977
15.3005218568819
0.156262757606449
1.60781392801197e42
WIZ
cg24803059
15.2984446114526
0.0573679678333138
1.64141352427486e42
HCCA2
cg06580800
-15.2668764930113
-0.324150316320211
2.24739007855848e42
cg25159927
15.1602861535578
0.157024417948677
6.48383863294124e42
M0N1A;M0N1A
cg05948763
15.130606948801
0.210365107002299
8.70540662639626e-42
SKI
cg05110391
-15.1274351212782
-0.243529352905369
8.98378708279514e^42
cg25336332
-15.0808229770578
-0.180860902021758
1.42644891650142e-41
THRB;THRB;THRB
cg22699768
15.0740326324395
0.222570691793268
1.52578134624218e^41
cgl0569694
-15.0223770580604
-0.0814091493043428
2.54546439716553e-41
RNF216L;RNF216L;RNF216L
cg08202226
-15.0061831442839
-0.379753733233799
2.9881472879607e-41
GATAD2B
cg04470557
-14.9627407489508
-0.248600599381384
4.59297336898272e^ll
SLC22A4
cgl3802506
14.9567396512101
0.216738090217469
4.87382958913407e^41
NINJ1
cg06761530
14.9305491381733
0.146857513258864
6.3143502801326e-41
SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9
cg26109199
-14.9304531327008
-0.156289150185094
6.32034509808577e41
cg26698460
14.9091293398436
0.319241059988894
7.802915073 8824e-41
ZNF274;ZNF274;ZNF274
cg26660541
-14.9072503138242
-0.032813653206089
7.9491230023415e-41
RNF216L;RNF216L;RNF216L
cg26353287
14.8714018609483
0.199390189759146
1.13259206322928e-40
cg25204094
-14.8487380146482
-0.0882349920855498
1.41650844002121e-40
ANP32B
cg25790133
14.83367786072
0.211513897517561
1.64341339235483e^0
FAM193A
cg26026748
-14.8296633576986
-0.263327380705373
1.70979532142312e^l0
PBX1
cg21182694
-14.8199262453844
-0.0924974601564864
1.88213079968268e-40
MRPS22
cg02457644
14.8091440438139
0.123587871072898
2.0932527378478e-40
LIN37
cg20364632
-14.8008103004197
-0.283525245166125
2.27248686872866e-40
cg21341586
-14.7988704594071
-0.161732512795683
2.31635765444485e^l0
EIF4E;EIF4E;EIF4E;EIF4E;EIF4E
cg09340639
-14.7908871508181
-0.26925047053685
2.50597999179135e-40
FCRL1 ;FCRL 1 ;FCRL 1
cgl1493223
-14.7799391133037
-0.267490449375599
2.79145326926776e^l0
TMC8;TMC6
cg24554061
-14.7675310684351
-0.0441714202452504
3.15440863713318e-40
NAA40
cg23262094
-14.7366745913472
-0.155501226578603
4.27439871739769e40
cgl1468193
-14.729880250485
-0.229503944286454
4.57002947291767e-40
cgO1440489
-14.6946252123989
-0.306763872359896
6.46480585606763e^0
ELF1;ELF1
cgl9565757
-14.6789091409542
-0.124466669836929
7.54516892755599e-40
PAIP1;PAIP1;PAIP1
cg06346138
14.6786634845174
0.295182570876251
7.56341320274081e^0
MST1P9
cgl3394216
14.6654137338755
0.205551211854111
8.61550602131046e-40
GMDS
cg05602648
-14.6622009053701
-0.0717043625912714
8.89188424441108e-40
COG2;COG2
cg25840354
-14.6560825587025
-0.229711859297867
9.44290135664162e^0
TLR10;TLR10
ch.20.12652500F
-14.6378642391032
-0.0657485612416234
1.12936903548154e-39
cg08517455
14.6345900499645
0.187452107638178
1.16627833972131e-39
C2orf55
Злокачественная опухоль молочной железы
cgl9533977
-37.0048080979213
-0.342721378582159
2.22579941799523e-181
CLTC
cgl4789818
36.9792527990063
0.411244760478912
3.22156810280072e-181
eg18265162
-36.1385973550742
-0.240474879086228
6.36406304788676e-176
Clorfl33;SERTAD4
cg23690893
35.4738053194879
0.383606880012756
1.02074662062821e-171
TECR
eg17046586
35.1959481134669
0.333380238390852
5.89909695081148e-170
LIMA1;LIMA1
cg05434287
34.9126300380338
0.309281563032565
3.71316899971703e-168
MAU1L1;MAU1L1;MAU1L1
cg20699586
34.8198666220897
0.408129343624993
1.4430517944147e-167
cgl8675097
34.627060191877
0.484406224304343
2.42900632399687e-166
NKAPL;NKAPL
cg08658787
34.6112807059863
0.356116360732656
3.060733077105e-166
eg18269493
-34.5727235044718
-0.312985777748994
5.3848697999714e-166
RERE;RERE
cg08549335
-34.2676498410046
-0.368962427709201
4.71968351224556e-164
ZNRF2
cg01393234
-34.2277454925606
-0.30869060185155
8.47651030869139e-164
cgl5602548
-33.5725460455918
-0.281884254670567
1.28717130117867e-159
SPTBN1;SPTBN1
cg22001208
33.2461465662174
0.208838151040861
1.5725675915448e-157
cg27616751
33.2353360277949
0.204821715163955
1.8440506013445e-157
F1S1
cgl7901038
32.1899059239539
0.169409589242318
9.23802291052125e-151
UBE20
cg24974704
31.7726799009563
0.296044616347763
4.41495062438843e-148
ZC3H3
cg05890855
-31.7377268620397
-0.352799478526305
7.40470815765416e-148
cg09887059
31.254800757396
0.504027031741788
9.42118448178679e-145
cg06471596
31.0749199218047
0.411158759207863
1.35277199441002e-143
CUX1;CUX1;CTJX1
cg06173663
30.9790440849484
0.420744886832563
5.59890316998092e-143
CUX1;CUX1;CUX1
cgO1817009
30.9287458517079
0.228936852058296
1.17968104971752e-142
SLC12A4; SLC12 A4;SLC 12A4;LCAT;SLC 12 A4;SLC12A4
cg04009429
30.9199877418857
0.152642595254005
1.34314894665209e-142
FIS1
cg06794543
30.7490635669418
0.373438581454567
1.69114455769013e-141
ZFP106
cg20192747
30.4984106388471
0.323137710762694
6.94687673071716e-140
cg00692173
30.4428753249702
0.359158283939246
1.58257472078784e-139
ZYG11B
cgl9130973
30.4203979248605
0.311669244151221
2.20848621505746e-139
IQSEC1;IQSEC1
cgl4231297
30.2691159946399
0.424825785400388
2.08096202702229e-138
ZSCAN18;ZSCAN18
cg08951958
30.1947281996488
0.180315426993702
6.2707942607704e-138
ABL1;ABL1
cg21821308
30.19122516185
0.270008816761491
6.60515169751241e-138
ASAP2;ASAP2
cgl8115040
30.1830788065392
0.366567693232514
7.45327453761938e-138
HOXD10
cgl2492087
30.155712122465
0.369378519228657
1.11839884235038e-137
ZFP106
cg07241170
30.0171404596787
0.226289112853981
8.73142151531264e-137
C6orfl45
cg25198340
29.9894753364861
0.251548462362805
1.31605406705205e-136
IL17RD
cg09851343
29.9477300376437
0.27494041092219
2.44430917847526e-136
LMF1
cg!7780246
29.8969465012737
0.360916264816594
5.19111291519097e-136
CACNG8
cg02196651
-29.8759046919612
-0.294585031955127
7.09244176608341e-136
LNX1
cg07315493
29.7707982370532
0.1551599389724
3.37151496515864e-135
IFT140
cg05336395
29.6934561094698
0.357454686955679
1.06175724131112e-134
PCDH8;PCDH8
cgl2157941
29.5947400021749
0.108649569471167
4.59106926471409e-134
RBM33
cgl5084543
29.5340478488511
0.395439302839266
1.12945597176272e-133
ELTD1;ELTD1
cg25766247
-29.5121374578432
-0.28298363705399
1.56317459521664e-133
cg25790133
29.357342230494
0.261754500152872
1.55284533028655e-132
FAM193A
cg20353227
29.3385120987763
0.229067429187395
2.05315353061022e-132
SMAD3;SMAD3;SMAD3
cg24546446
-29.3188434253197
-0.255419390203644
2.74862465129347e-132
LNX1
cg22954906
29.263351240883
0.305028014756694
6.2597851158387e-132
LOC121952
cgl7391620
29.1863898824977
0.281492339480862
1.96011683953147e-131
C6orf27
cgl0172584
29.1768543217146
0.226299826765045
2.25788178729323e-131
YJEFN3
cgl5174623
29.1394928912366
0.301377152452034
3.92958143608801e-131
cg00909706
29.1308231712644
0.218549545508484
4.46876346111931e-131
MIR34A
cg02030908
29.0780342359224
0.222470449579923
9.7766899331934e-131
THRA;NR1D1
cgl7127702
-29.0505576278305
-0.250145725237444
1.46946756059717e-130
PARP1
cg27418434
29.0194797771027
0.257309832787325
2.32980249975576e-130
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1B;PRKAR1B
cgl2681370
28.9993255588433
0.262937319241361
3.14138868703822e-130
TNS1
cg07651914
28.9942354063683
0.221268084813228
3.38769545006292e-130
CLDN15
cg03170670
28.9873380066505
0.232913427487807
3.75254826970477e-130
C3orf21
cgl0284771
-28.9516226366547
-0.216148125391034
6.37299733893761e-130
cg27478167
28.9419700566806
0.147704066641901
7.353738487073 le-130
HEATR2
cg24541176
28.8902078545336
0.234138655791603
1.58437840786754e-129
TMEM106C;TMEM106C;TMEM106C;TME
M106C
cgl0427868
28.8623990198476
0.261226830330997
2.39300374653191e-129
ZMIZ1
cg07799299
28.8327383163512
0.344507948016193
3.71491630304353e-129
ASAP1
cgl9593741
28.8213369849193
0.306999554036297
4.39914980181354e-129
C6orf27
cgl6081096
28.8136995564219
0.280805392281698
4.92663203562989e-129
IQSEC1;IQSEC1
cgll303301
28.7686870126953
0.196670943186191
9.60290038554889e-129
ZC3H3
cg26080154
28.7571589936443
0.173019959329851
1.13928825765697e-128
TOLLIP
cg05386769
28.7545987419722
0.26623628963293
1.18336706501207e-128
TNS1
cg08296903
28.6337266311139
0.196407621833958
7.10207452271195e-128
ERCC4
cg09165441
28.6148861420469
0.462159554688228
9.39042914283713e-128
cg07204662
28.6001172088786
0.28119725507688
1.16888034518508e-127
ESRRA
cgl3387113
28.5514256546646
0.407595102581443
2.40570298101609e-127
MXRA7;MXRA7;MXRA7
cg06905453
28.452312462064
0.362718631340345
1.04535976679632e-126
RFX1
cgl6766632
28.4487333603753
0.280607934382
1.1023108515326e-126
LRP1
cgl5574321
28.4445600583698
0.28352428461218
1.17264633177887e-126
WNT11
cgl7094249
-28.3988504612112
-0.346891451170991
2.3087842780045e-126
cgl0628699
28.3841278466098
0.319124426934243
2.87172970004715e-l 26
LOC121952
cgl0715092
28.3615792814823
0.48243764617549
4.01116578652206e-126
MIR663
cg20271620
28.3116700371767
0.110622709559236
8.40387067184859e-126
TBCD
cg23746497
28.2794030658487
0.435789242141912
1.3556015569442e-125
cg26444528
28.2726254430281
0.413454065435096
1.49881433026216e-125
PCDH17
cgO1877606
-28.2337181711744
-0.263088443573083
2.66757879490457e-125
LNX1
cg03998066
28.2286912325199
0.252056154961521
2.87385340025292e-125
TGFB1I1;TGFB1I1
cg03143486
28.2275756012878
0.228534776406635
2.92175260763207e-125
HEATR2
cg05422883
28.2163816568672
0.171359916456639
3.44884097600532e-125
cg05207048
-28.2007186476137
-0.254809947427781
4.34968478074527e-125
ODZ2
cg22871253
-28.1870588467091
-0.316104870063545
5.32537857381444e-125
EZR;EZR
cg05937737
28.1705831972055
0.419343009692935
6.79765018114287e-125
SLC7A14
cgl1624060
-28.1268305896423
-0.220266749058254
1.29974798483805e-124
cg05979020
28.1192500620933
0.281835425210015
1.45421761156651e-124
HOXD10
cg02744216
-28.1030564025974
-0.341246894488261
1.84846436199365e-124
cg03162410
28.0992553048535
0.279574417125867
1.9555321216717e-124
TECR
cgl8397073
28.0480712206768
0.259898460471069
4.17382941287248e-124
POU2F2
cg05342467
28.0418513328035
0.141832370355527
4.5766259767284e-124
MAD1L1;MAD1L1;MAD1L1
cgll213690
28.0278895531668
0.474399996895933
5.62802191199461e-124
cgl2669271
27.9862915750655
0.230420097988479
1.04213557885928e-123
EXT1
cg08443563
-27.9765990728792
-0.372976589134304
1.20300018305009e-123
cgl0773016
-27.974408370695
-0.114979721761202
1.2426704378255e-123
cg23811057
-27.9704572437146
-0.300801425027653
1.31755538359706e-123
eg15430661
27.9634222930868
0.166883903439189
1.46223064855704e-123
GRASP
cg03517024
27.9493439373987
0.228685146945036
1.80120179203294e-123
TRAF7
cgl2711760
-27.9316596732831
-0.185731444888063
2.34043747189459e-123
NAV2;NAV2;NAV2;NAV2
Холангиокарцинома
cg08105396
-35.5588718210826
-0.663078367941125
1.60755728150535e-33
S100A2
cg21409833
35.3498989126245
0.395050851024056
2.05436546893024e-33
DOCK7;ANGPTL3
cgl9128723
-33.8859129289166
-0.392194922080842
1.19061898456519e-32
OBFC1
cg04852323
31.8190974037391
0.428985471667184
1.61035732801726e-31
cgl9525780
31.0212296710856
0.394454034760035
4.58989656558616e-31
С 14orf80;C 14orf80;C 14orf80
cg06154084
-30.0305700483033
-0.364078942275408
1.7448317112177e-30
PDZD7;SFXN3
cg01449469
29.2698027702947
0.519663275236754
5.00128240138825e-30
KIAA1949 ;KIAA 1949
cg00946753
28.7051003094237
0.35517486083572
1.11063565610279e-29
C14orf68
cgl7213304
28.1162473427951
0.372750853555482
2.59118684709784e-29
BHMT2;DMGDH
cg23679798
27.9030274660195
0.433122183872061
3.53536949374174e-29
ZNF444
cg07573965
27.870787748986
0.501175143793242
3.70610949826421e-29
HMGXB4 ;HMGXB4
cg03595672
27.8001494873523
0.362947629337897
4.1102908867006e-29
GLYATL1
cgl5029138
27.4757828857784
0.400129835527321
6.63168443855356e-29
PNPLA3
cg03582736
27.4570030464261
0.403634971791905
6.818976012445 7e-29
TMEM56
cg03353699
27.3313913379001
0.47131744713065
8.21885259091284e-29
KIAA1949 ;KIAA 1949
cgl8554976
27.2145946406481
0.55983731119579
9.783896246750 lle-29
FXYD1;FXYD1
cg08865625
27.1054173477006
0.450104259959515
1.15222369409695e-28
HLF
cg03610629
26.8687191623829
0.350171311896986
1.64588817150787e-28
PHRF1
cg25503540
26.3449991834911
0.430071523494753
3.65941459653826e-28
FASN
cgl3613439
26.2333809543819
0.402898985253898
4.34669354877006e-28
PHYHD1 ;PHYHD 1 ;PHYHD 1 ;PHYHD 1 ;PH YHD1
cg25068915
26.187179718213
0.357438681824676
4.6685394716433 le-28
FASN
cgl9276318
26.1205472321249
0.357482221372874
5.17615268687014e-28
APOF
cg03641958
25.9293735146078
0.384267791056771
6.96914867164816e-28
cgl3478974
25.795537467099
0.423311250097119
8.59234260246262e-28
C12orf51
cg24904145
-25.7611475160698
-0.485558601980159
9.06868307838953e-28
LRCH4
cgl6161418
25.4485202649957
0.349787115861829
1.48537035763967e-27
KIAA1949 ;KIAA 1949
cg06795960
25.3368259863052
0.41123676847625
1.77401368200759e-27
ARL4D
cg06131338
25.2537209670575
0.435773868675077
2.02550249341548e-27
ACACB
cg08929133
25.117899403296
0.440600694187515
2.51761616898294e-27
AHSG
cg26507988
24.6781803930873
0.428289537005601
5.127259173999e-27
CCDC57
cg05359249
-23.808994437275
-0.39694994598902
2.16185546746435e-26
CHPF
cg23672425
23.7544426343141
0.390471205229331
2.36975761585126e-26
MTOR;ANGPTL7
cg09516529
23.6656708769834
0.404424916698531
2.75273826134295e-26
cgl2228061
23.4741982759108
0.386028380340417
3.80902257264916e-26
cgll024165
23.4642256231895
0.312820199621553
3.87424402100121e-26
cg05896042
-23.4595327391191
-0.535591648700761
3.9053292505236e-26
RAB3D
cgl5391151
23.4538023444835
0.358355636128762
3.9436326148548e-26
Clorfl77;Clorfl77
cg06086933
23.4519600624549
0.374718184874275
3.95602822781083e-26
AGL;AGL;AGL;AGL;AGL;AGL
cgll971852
23.3876008297076
0.506822232345526
4.41499815830466e-26
BIRC6
cgl2589486
23.3744623682254
0.354036646897076
4.5151903964239e-26
NDST1
cg07064050
23.1047654502863
0.353301971275107
7.17413655578156e-26
ARMC6
cg09872523
23.0913059237227
0.41168174068474
7.34273656699873e-26
GRK5
cg20118424
23.0898867967805
0.443863088190225
7.360747452133 89e-26
ABCB11
cg03880458
23.0580731814092
0.418670717173586
7.77657542036821e-26
cgO1808050
23.0136588679495
0.448423325322603
8.39759514109578e-26
ADI1
cg26282205
22.9279616259612
0.465140687300116
9.74296475471423e-26
CAMK2G;CAMK2G;CAMK2G;CAMK2G;C AMK2G
cgl7278960
22.8115460094632
0.416403602692968
1.1931377818444e-25
FGGY;FGGY
cg04505897
22.6715774360354
0.39782195815084
1.52405721598972e-25
LAMP1
cgl3414629
-22.6427240021248
-0.453497651355862
1.60319259187615e-25
FREQ
cg!2590346
22.6173540048069
0.355463541935364
1.67623780344694e-25
TOLLIP
cg09797971
22.4921357909317
0.381534864791574
2.08983151915634e-25
KCNS1
cg02094018
22.4623355943709
0.500117732649428
2.202779862073 lle-25
PEMT;PEMT
cg00089100
22.4105342258607
0.422056080687961
2.4141778690776e-25
TPST2;TPST2
cg25189201
22.3885792181384
0.426167582762562
2.50992323027587e-25
cgl3640769
22.361665678885
0.481969659684665
2.63260438729914e-25
C14orf68
cgl3928068
22.3181766647589
0.398701523399129
2.84393428833833e-25
MICAL3;MICAL3
cg07726085
22.2173620703372
0.414427673209405
3.40305908555024e-25
SLC27A5
cg02967812
22.2125701827805
0.400340988358036
3.43227445171715e-25
CCDC57
cg22840650
22.1681958430371
0.342996030396284
3.7152939654075 le-25
UBTD1
cg21423557
21.9473250412204
0.409658350465903
5.52256479930779e-25
C2orf3
cg07659663
21.8779905483952
0.343615718263111
6.25865162090617e-25
CHID1
cg04756168
21.8640454653782
0.379343848514058
6.41841066584808e-25
APOC3
cg03776042
21.8382304436886
0.385458166695023
6.72523476330569e-25
C22orf9
cg23251170
21.7762791722096
0.441303189533732
7.52415417188652e-25
GPD1
cg03741653
21.7759997709383
0.441396579578269
7.52796884867159e-25
BMP1;BMP1;BMP1
cg19351617
21.7550656391967
0.3242843297332
7.81947494716375e-25
SIG1RR; SIGIRR;SIGIRR
cg25007781
21.7241949318701
0.301748050038511
8.27053144655803e-25
С 14orf80;C 14orf80;C 14orffi0
cgl3139203
-21.5823669935132
-0.306424617435288
1.07103521536822e-24
CllorfM
cg21009747
21.5724624405171
0.493947545041035
1.09060417656941e-24
MYH9
cg09276315
-21.5343734644159
-0.590730859443169
1.16932382802483e-24
ZC3H4
cgl6719582
21.5106223715962
0.370759864479941
1.22132535942885e-24
FBRSL1
cgl4153069
21.4711817370139
0.399188193488142
1.31295293551023e-24
PHYHD1 ;PHYHD 1 ;PHYHD 1 ;PHYHD 1 ;PH YHD1
cg03385262
21.4103738371832
0.418296876136988
1.4681895673114e-24
C4orf29
cgl8736775
21.3582841654806
0.374621495389809
1.61602520851861e-24
NAT2
cg04658027
-21.2693479362949
-0.436633570334032
1.90450909140081e-24
CLIC1
cg03193893
21.2030315630162
0.402277585855672
2.15345714652244e-24
KIAA1949;KIAA1949
cg07031551
-21.1638796315723
-0.236601730547612
2.31579429564093e-24
ARAP1
cgl7232254
21.1418896060184
0.208767523717478
2.41239973708666e-24
JMJD1C;JMJD1C
cgl4399839
21.1177961075115
0.409370886008809
2.52298088553149e-24
NAIF1
cg08954701
21.116547158873
0.290673148513395
2.52885229608161e-24
C16orf70
cg03956606
21.0985121368169
0.401782423847267
2.61520886131241e-24
MTOR;ANGPTL7
cgl6745091
21.0829123471158
0.440694004625513
2.69233142956501e-24
CLASP 1 ;CLASP 1 ;CLASP 1
cg04471375
20.9979679756764
0.337764600194331
3.1549672803792e-24
GOT2
cg05296180
20.9682073411025
0.351162305832231
3.33562314314036e-24
ANG;RNASE4;ANG;RNASE4
cg24062571
20.9434740295192
0.355402985388624
3.49378125911109e-24
PON1
cgl9786751
20.8662006497594
0.406828250839906
4.03904363415086e-24
ACACB
cgl3907255
20.8295369717043
0.449296403904411
4.32742095240209e-24
cg26481896
20.8055825429712
0.443537974588346
4.5271096717778e-24
WWP2;WWP2
cgl9879265
20.7692202472955
0.450460431478502
4.84837920888933e-24
С 14orf80;C 14orf80;C 14orf80
eg14574905
20.7649878187767
0.474868298612802
4.88725643168667e-24
CLASP 1 ;CLASP 1 ;CLASP 1
cglll55222
20.7142852698056
0.436191608673197
5.37851036825859e-24
PTPRK;PTPRK
cgl2393104
20.6745160550926
0.365499754192156
5.7989278460791 le-24
RTN4R
cgl5936999
-20.6686424574824
-0.336018404861063
5.86380475209209e-24
UNCI 3D
cg20465207
-20.6172738059145
-0.542944488138249
6.46375683986977e-24
ARHGEF2 ;ARHGEF2 ;ARHGEF2
eg14524724
20.5744754275152
0.433162882080129
7.01129831199633e-24
cgl6724148
20.5111183542802
0.380839242038398
7.91017035070975e-24
AGL;AGL;AGL;AGL;AGL;AGL
cg02744699
20.5079449770064
0.418016709588568
7.95817084337566e-24
cgl0190509
20.4901187915863
0.512567019438628
8.23339165335734e-24
CCL16
cg10004976
20.4694946743231
0.306370768711813
8.56396650424532e-24
COL18A1 ;COL 18A1 ;COLl 8A1
cg05919312
20.4641306640015
0.346666249669482
8.65214363184255e-24
CYB5R2
Злокачественная опухоль толстой кишки
cg03130910
-46.0343592095821
-0.50426673282509
1.09769361570054e-145
cg00664697
-41.9765490197336
-0.389400811810812
2.19007558931344e-134
cg04456219
-41.011889665991
-0.494314110307472
1.37426457522538e-131
cg22689909
-39.7563053459646
-0.332971765019239
7.02102925399839e-128
GLRX;GLRX
cg20175702
-38.2581538036396
-0.537027633495984
2.35959056490536e-123
cg23558337
-37.9180772933123
-0.27488574734339
2.60641102962285e-122
C20orf94
cgl2628196
37.7904238440188
0.549442941266251
6.4438750625488e-122
SND1;LRRC4
cg02853152
-36.5620579711223
-0.347084577241345
4.31170486018452e-118
cg03301058
-36.3922091190272
-0.469533407076475
1.47829767557868e-117
GABRR2
cg02861178
-36.0730727545474
-0.387388446420649
1.51108037808086e-116
C20orf94
cg09296001
35.7715670209753
0.621980675683589
1.373890992023e-115
SND1
cg09087503
35.515324650804
0.427902719978029
9.04614794362037e-115
SND1;LRRC4
cg03800922
-35.3963130819993
-0.349005706095442
2.17671213958731e-114
cg24032190
-35.2910603133633
-0.526670015417972
4.73889940607341e-114
SMAD3;SMAD3;SMAD3
cg20873416
-35.2321606824926
-0.511092483379825
7.32841652758907e-114
cgl7304678
35.1268249892703
0.374069304936184
1.59981822389659e-l 13
RGMB
cg05259836
-34.5495731005873
-0.283643580201282
1.18209956519602e-l 11
cg07220152
-34.2911942044368
-0.39502040501788
8.2187441623853 le-111
cg23683800
-34.166683165247
-0.353910338723702
2.09851041315398e-l 10
cg00269245
34.0836951162467
0.337503298587948
3.92386758782552e-110
NUP93
cgl9592277
33.1082187289293
0.397348441166111
6.55301596992688e-107
GPR75;LOC 100302652
cgl3405887
32.8758923632209
0.504614968961261
3.90463986090199e-106
C9orf50
cgl9017254
32.5616689523798
0.369505972575271
4.41191713865239e-105
TRPM4
cg04786142
-32.5498709331609
-0.552388705736569
4.83359438681153e-105
cg09287864
-32.5443824621846
-0.444168454794595
5.04329938249457e-105
cg22882523
32.2327401523501
0.407304540354065
5.65859526249196e-104
OPLAH
cgl4129735
-31.7475076151683
-0.420361702001893
2.500920229843 le-102
cgl6601494
31.7209106334673
0.599568884004578
3.08077188234098e-102
Clorf70;Clorf70
cg02627455
31.5964929995698
0.409071416282719
8.18087743342346e-102
HOXA3;HOXA3
cg03716852
31.2502444704801
0.422119491056831
1.2520112549495 8e-100
TRPM4
cgl3895235
31.1871101401237
0.646212075763485
2.06228703325528e-100
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1B;PRKAR1B
cg02037307
31.186989874128
0.489547207154852
2.06424952432287e-100
PITX1
cg26140475
-30.848940926835
-0.268883521642137
3.01293231388426e-99
cg05433391
-30.7824299128161
-0.489321894308414
5.11427888241003e-99
cgl0784519
-30.5561430804099
-0.309988744494129
3.10748772815681e-98
cgl7301223
30.474278302428
0.56243805974059
5.97849859635783e-98
OPLAH
cg01588438
30.2692760593367
0.573477266925622
3.08909457007169e-97
ADHFE1
cg06197966
-30.1987037605709
-0.446071339396285
5.44369592013129e-97
SVIL
cg22932808
-30.1904130345227
-0.545404661052853
5.818602693796e-97
cg20493497
-30.1053847522898
-0.341380627461032
1.15261092586678e-96
cg05649391
-30.0434569405592
-0.380774587597229
1.89732667160012e-96
MYBPC3
cgl2451530
30.036827326335
0.388916124299843
2.001369523393 le-96
LOC100302652;GPR75
cg23811057
-30.000523405376
-0.308447999718531
2.68121812155353e-96
cg16971991
-29.8178506477959
-0.264001285460201
1.17078328512867e-95
cg05847233
29.7504206138603
0.236303294222108
2.01943841921514e-95
AFG3L2
cg23023970
-29.6720983516537
-0.36079354071098
3.80660566131051e-95
INPP5A
cgl3356253
29.4915545690108
0.318807326964162
1.64598221716658e-94
LOC100302652;GPR75
cgl1209394
29.2674187617315
0.303718922504194
1.01929138663351e-93
ZNF775
cg07128900
29.254417625051
0.490966439771851
1.13322114807232e-93
MTSS1L
cg27539480
29.1151898496043
0.327237132940892
3.5291467002191e-93
HOX A3 ;HOXA3; HOXA3
cg27093918
-29.0888303253563
-0.34730009018604
4.37716091026669e-93
cgl9664945
29.0413932625947
0.426190964978664
6.45047929945886e-93
LOC100302652;GPR75
cg02973693
29.0368939757404
0.29258207545646
6.69222510616915e-93
ZFHX3
cgl0299448
-29.0355669461671
-0.238007247094918
6.76524453340615e-93
GAS7
cg25063165
-28.9944792334226
-0.319635090132463
9.46790210530583e-93
cgl5487867
28.9589709504522
0.587752562750697
1.26612143273137e-92
Clorf70
cg20295442
28.9563686754354
0.643992434509462
1.29338659281513e-92
ADHFE1
cgll838152
-28.9206532959724
-0.451263851068872
1.732843943 896e-92
ITGBL1
cg23804620
-28.7849624931488
-0.188514123790839
5.27234103721285e-92
cg09129067
-28.7759692425577
-0.431754343955213
5.67631649058639e-92
cg02001991
-28.6841323203573
-0.379601185756212
1.20707810073555e-91
cg05336982
-28.5698253756979
-0.28467841911615
3.09176305027171e-91
cgO1817009
28.5204007358249
0.226159991239395
4.64557148804258e-91
SLC 12A4;SLC 12A4; SLC 12A4;LCAT;SLC 12 A4;SLC12A4
cg08738570
28.4637432204565
0.460038506866043
7.41157389440189e-91
Clorf70
cgl4642259
-28.4225341746286
-0.605787322809401
1.04129438840241e-90
MYBPC3
cgl3414270
-28.3983686328215
-0.305009832474428
1.27118055162853e-90
cg08611810
28.2437500653528
0.326206664262161
4.56301304395e-90
LOCI 003 02652;GPR75
cgl9453938
-28.2078905391659
-0.251340633314612
6.13988825024428e-90
cgl6306898
28.0775399586896
0.531514762168848
1.80851638526531e-89
Clorf70
cg20912169
27.9295958927024
0.621216816063042
6.17869146815109e-89
ADHFE1 ;ADHFE 1
cgl7520027
27.8939557015202
0.352214169419306
8.31014991275538e-89
NR5A2;NR5A2
cgl2305431
27.8746119761273
0.453750334043868
9.76102792270698e-89
HOXA3;HOXA3
cgl7698295
27.8172201541475
0.592981341869349
1.57384400007897e-88
OPLAH
cg00813378
27.7781497596252
0.533748928966367
2.17919796245736e-88
Clorf70
cg23272088
27.5615509868133
0.426504446292249
1.32826239985069e-87
KCNQ1;KCNQ1
cg01029623
27.5228160023691
0.422480053631603
1.8362181919442e-87
KDM2B;KDM2B
cgl5661389
-27.4902757107658
-0.371569649666198
2.41064540120998e-87
GAS7
cgl6616514
-27.4661690083084
-0.502891231816849
2.94945192649867e-87
PPP2R2C;PPP2R2C
cgl3324103
-27.4478782074574
-0.443717454905755
3.43742729966424e-87
SVIL
cgl0773016
-27.3320336878768
-0.186672999876806
9.07330310849036e-87
cgl3415566
-27.3221229209757
-0.354862122612324
9.85963531898321e-87
cg26256223
27.287620353137
0.505554157788273
1.3169231826915e-86
OPLAH
cgll868461
-27.2528608521591
-0.43290865757686
1.76302528485845e-86
cgl8601167
27.2504067341793
0.655176318548664
1.79972499483633e-86
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1B;PRKAR1B
cg26199906
27.2257525258748
0.459474727108914
2.21366364400971e-86
OPLAH
cg09383816
27.2182452969855
0.559950015102034
2.35773063774009e-86
ADHFE 1
cg21410293
27.1662664695865
0.212389392833636
3.64893839758851e-86
KIAA0427;KIAA0427
cg06825878
-26.9005838531493
-0.356858893580967
3.41843364458815e-85
cg06786372
26.7542396942969
0.395781701019566
1.17648872899491e-84
HOXA2
cg05168229
-26.7238081154878
-0.346306224322757
1.52174535472018e-84
cgll315991
26.6527072738249
0.386192357700732
2.7773472302165e-84
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1B;PRKAR1B
cgl3661519
26.6313286218699
0.387205525823339
3.3284709237897e-84
HOXA2
cg25969107
-26.6262568687218
-0.320169234526163
3.47454758754718e-84
cgl4118226
-26.6052922518403
-0.188156844087624
4.14971506971613e-84
cgl5446845
-26.5236793631838
-0.332482999850655
8.28800455219642e-84
cg03241244
26.5218178269469
0.409333909432153
8.41989282769872e-84
KDM2B;KDM2B
cg25223771
26.4394328212554
0.411177740846718
1.69406460469803e-83
cg00466116
-26.3458166164013
-0.213223395453262
3.75284223779443e-83
cgl8058689
26.2609154593661
0.503029207291655
7.72705536285821e-83
GPC6;GPC6
cg23084245
-26.2472977120568
-0.300434414577925
8.67673263330387e-83
Злокачественная опухоль пищевода
cgl8733925
16.0051907288097
0.235405775094019
1.32770491433033e-37
EIF4H;EIF4H
cgl8421360
15.6100766592907
0.284779114566978
2.13959435642747e-36
GPR98;GPR98
cgl0395252
15.4706108778419
0.220331144870498
5.71851644931084e-36
TTLL5
cg03143486
15.358981838572
0.244390243813657
1.25688877569656e-35
HEATR2
cg00664697
-15.180799203229
-0.303113774951929
4.42275351364958e-35
cg25688164
14.755219044418
0.238012970418897
8.96855156958882e-34
WDR1;WDR1
cg20740711
-14.7292633017696
-0.248791677922156
1.07773621694686e-33
cg06523556
-14.649118048338
-0.33575213753181
1.90077640696229e-33
CHRNA6
cgOl817009
14.5002156389832
0.291416048469144
5.45651979040918e-33
SLC12A4;SLC12A4;SLC12A4;LCAT;SLC12
A4;SLC12A4
cg20252769
14.4154956900164
0.240822109534837
9.94424925914453e-33
SUV420H1;SUV420H1
cg06379876
14.3779498703566
0.208579807257543
1.29749050407986e-32
NFYC ;NFYC ;NFYC ;NFYC ;NFYC ;MIR30E
cg25837213
14.3377457070437
0.202599801830366
1.72514593690151e-32
TBCD
cgl0364040
14.2370521594591
0.470060039049629
3.52152315812055e-32
HOXD10
cg09698220
14.2242856395031
0.210565549469104
3.85500842765573e-32
C7orf50;C7orf50;C7orf50
cg06733794
14.2197137597775
0.427192263969094
3.98196583870015e-32
TACC2;TACC2;TACC2;TACC2
cg25974626
14.1377469889688
0.281946349333895
7.11872986502901e-32
RP9P
cg02983090
-14.0511215843301
-0.265674610346249
1.31542502012326e-31
IL21R;IL21R;IL21R
cgl0788213
14.0240679676056
0.207144020006533
1.59348915709336e-31
F AM 118 A;F AM 118A
cgl4723977
13.9599830695028
0.266096237657517
2.50976345103533e-31
WIZ
cg24040595
13.9156522949335
0.336435480389141
3.43640128489917e-31
HOXA6
cgl8397073
13.8618824953603
0.389792158840037
5.03072373822808e-31
POU2F2
cgl6085649
13.8508729265434
0.295807631833667
5.43903873745435e-31
AKAP13;AKAP13
cgl7304678
13.8359526523728
0.267747569936455
6.045777093 85679e-31
RGMB
cg05753046
13.7562203583432
0.260883825388072
1.0638680168234e-30
NDUFS8
cg08282819
-13.7499324847068
-0.251273522511733
1.11235286316521e-30
IL21R;IL21R;IL21R
cgl0523671
13.7211731503934
0.285008496808649
1.36384631797635e-30
SLC15A2;SLC15A2
cgl6284684
13.6889882372941
0.216814319185672
1.71328085384614e-30
C7orf50;C7orf50;C7orf50
cg00704780
13.6797571406367
0.288267279380513
1.82911271227575e-30
HDLBP;HDLBP
cgl1360546
13.6148254850831
0.209114661257689
2.89786666172017e-30
C7orf50;C7orf50;C7orf50
cg01814495
13.5636860003017
0.223933867580616
4.16343745820322e-30
CDIPT
cgl8990050
13.5455904520341
0.419383013628431
4.73297545912262e-30
C7orf50;C7orf50;C7orf50
cg26034341
13.5213753157956
0.308968517647042
5.61880115292004e-30
VPS53;VPS53
cgl1201447
-13.4649963059195
-0.4121338983037
8.3772930119654e-30
MIR1204;PVT1
cg07953015
13.3296693805854
0.411886195005017
2.184483499414 82e-29
SEPW1
cg03885270
13.3210492551001
0.303627776608947
2.32197145111883e-29
PIP4K2A
cg27371456
13.3085349295772
0.169178912530882
2.53710698378352e-29
FBXW4
cg21037180
-13.2806524739014
-0.217174234324867
3.09080719795149e-29
cgl4904697
13.2771744922813
0.195374176062452
3.1678558966545 le-29
AKAP8L
cgl0888281
13.2248081894875
0.43448204461841
4.58939188651274e-29
CEP68
cgl5347156
13.2203338435724
0.146256185227529
4.73706214099773e-29
MMRN2
cg20989443
13.2192766658297
0.215784167987901
4.77264093909192e-29
GALNT2
cgl6803678
13.1990418074937
0.278926321664449
5.50752384687168e-29
RYK;RYK
cgl6615776
13.1919713309481
0.193767417349975
5.79012955738703e-29
CAPN10;CAPN10;CAPN10;CAPN10
cg09792881
13.1699754295379
0.34835415541959
6.76536041174789e-29
DMRTA2
cg04267184
13.1629644123418
0.187620450021749
7.10947264109723e-29
GNRH2;GNRH2;GNRH2
cg21011133
-13.1029816891796
-0.230781951969855
1.08680109126407e-28
ADCY3
cgl6400238
13.0904382716724
0.14346941064472
1.1876445569752e-28
PHF12
cg09470010
13.071640487841
0.26942845759485
1.35654259178892e-28
GBF1
cg06761530
12.9943351155727
0.255680395964511
2.34346398496042e-28
SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9
cg26353287
12.9670052614434
0.173871890735054
2.842967943 77676e-2 8
cg07171687
12.9309133204999
0.303065779387559
3.66918025110322e-28
P1P4K2A
cgl6180796
12.9160947672079
0.318261986176348
4.07430174264877e-28
cg25247520
-12.9056460503124
-0.35772988342348
4.38654047300558e-28
MIR1204;PVT1
cg07746514
12.8990309019047
0.151328292826318
4.59646715065399e-28
MLEC
cgl6732616
12.8924967875521
0.405900025494843
4.81367418321746e-28
DMRTA2
cg22274117
-12.8881766178904
-0.313620891261368
4.9628873282213e-28
ATXN1;ATXN1
cgl9523667
12.868201916564
0.227025263888537
5.71515694033297e-28
ZMIZ2;ZM1Z2
cgl7277615
12.8499633164111
0.285519179726435
6.501115997 8415e-28
PIP4K2A
cg09343092
12.8454402781812
0.263185644839857
6.71219438929173e-28
HOXA6
cgl3938187
12.8226084146867
0.247327542642088
7.88689740654786e-28
OAZ2
cg07834408
12.8040381500809
0.0854347414247083
8.9922178460697 le-28
DGKD;DGKD
cgl4274357
12.7561518412755
0.263502426913035
1.26100261954106e-27
АКТ 1; АКТ 1; АКТ 1
cg20935317
12.7421786561947
0.260472818473003
1.39173759391592e-27
CASZ1;CASZ1
cgl0512745
12.7253435925895
0.485767675581536
1.56735571234122e-27
DMRTA2
cg04588356
12.7205601866108
0.267009742451503
1.6211777537279e-27
TTC15
cgl8471029
12.7144967998475
0.149810469764542
1.69206340763192e-27
MAP3K5
cg00283857
12.681364997603
0.24054223184023
2.13776779560955e-27
ZDHHC14;ZDHHC14
cg23051392
12.6506589399508
0.342494415326161
2.65489656215092e-27
С1QTNF3; С1QTNF3
cg03498081
-12.6463808736417
-0.301053413500302
2.73624122668659e-27
cgl3895004
12.59413577134
0.181608720310221
3.95533602882548e-27
PTPN3;PTPN3
cgl8926450
12.5804857752493
0.260587311525033
4.35494830538602e-27
GIT2;GIT2;GIT2;GIT2;GIT2
cg09129067
-12.5500659952284
-0.336499538350683
5.39658593973755e-27
cg07493435
12.5478080740449
0.285937629015425
5.48316396964796e-27
cg23783444
12.5318240195729
0.195917887671938
6.13704378673913e-27
GPER;C7orf50;GPER;C7orf50;C7orf50;GPE R
cg24586978
12.5179061641077
0.222542748500842
6.769508037495 84e-27
DOCK9;DOCK9;DOCK9;DOCK9
cg05314639
12.4931424785565
0.221820798096685
8.06005333102632e-27
cg07046870
12.4895831024875
0.208291144811193
8.26473319282236e-27
PDIA5;PDIA5
cg25307318
12.4823896958256
0.426944209479186
8.69436918657197e-27
TACC2;TACC2;TACC2;TACC2
cg21647227
12.4721749122274
0.367423958358937
9.34306260514595e-27
TBX15
cg27045835
12.4622478820317
0.205367028548273
1.00197614882076e-26
TMEM159
cgl9257274
12.4238149642962
0.358499269604519
1.31341922981223e-26
LOC148696
cg23683800
-12.42197790596
-0.228587343019544
1.33051854914911e-26
cg06507244
12.4206318255529
0.294028548725975
1.34318882235034e-26
DHX32;DHX32
cgO1871498
12.4130410278894
0.250941439198765
1.41692795140204e-26
GLYR1
cgl3191508
12.4076429542122
0.124088152818834
1.47181319523602e-26
ZC3H3
cgl6237565
12.4042098494105
0.273096689217733
1.50781889050475e-26
PCSK6;PCSK6;PCSK6;PCSK6;PCSK6;PCS K6;PCSK6
cgl0024406
12.390501806565
0.210684320066322
1.66057024222559e-26
MIR1178;CIT
cg27000590
12.3889684944941
0.245748531942844
1.67858964702149e-26
PRAGMIN
cgl4297867
12.3531741581395
0.240714286869851
2.15947098270268e-26
MOBKL2B ;IFNK
cg03130910
-12.338667188316
-0.353082828027426
2.39153185039807e-26
cg21385480
12.3320670609193
0.341113699196952
2.50519787627402e-26
LRIG1
cgl2083852
12.3266646145977
0.254304622399113
2.60224129027583e-26
PI4KB
cg00539976
12.321574608603
0.36818131903881
2.69710418218306e-26
IRX4
cg03366858
12.3133989811857
0.166845105776138
2.85675457061186e-26
LRP8;LRP8;LRP8;LRP8
cgl4377973
12.3040569151634
0.158876199411743
3.05076624263925e-26
C7orf50;C7orf50;C7orf50
cgl0783149
12.3002990374884
0.222636759241332
3.13246973356668e-26
cg08566455
12.2891239231464
0.344180088669618
3.3885762422178e-26
cgl2600530
12.2818426676143
0.219891479219035
3.56658985603381e-26
RASA1;RASA1
cgl0406264
12.2672663685477
0.232658012425978
3.9515013692486e-26
DIAPH3;DIAPH3
cgl6686174
12.2594010596005
0.282152834637333
4.17615126421344e-26
SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9;SEPT9
Мультиформная глиобластома
ch.7.51839018F
-75.8587187403596
-0.491476763548468
5.09151728525694e-191
cgl2421032
-69.9391135659963
-0.0607104927626321
1.78575111377e-181
ETV3;ETV3
cg04366381
-69.8490407998874
-0.0523129719365328
2.52677647246638e-181
FAM49B
cg07146173
-68.3430393144459
-0.0485084730406751
8.8909406798476e-179
ALKBH5; ALKBH5
cg09981184
-68.2698198139737
-0.0539403260964843
1.18580467024348e-178
FAM135A;FAM135A;FAM135A;FAM135A
cg22798045
-68.2107263138668
-0.0409213084738305
1.49636224873993e-178
HIPK3;HIPK3
cgOl158046
-68.0041958932997
-0.0695273345522558
3.37847883446052e-178
MED23;MED23
cg25548615
-67.9260278045372
-0.042176677986444
4.6007893582244e-178
WHSC2
cgl7335108
-67.9215160823397
-0.481205585654996
4.68357166615753e-178
cg01087645
-67.8330098119324
-0.0361740474573771
6.64659206096588e-178
CLN3;CLN3;CLN3
cg26775961
-67.5735784088984
-0.0616481050892107
1.85874839732551e-177
UTP3
cg09105479
-66.9443292903113
-0.0478141078922517
2.28463689330095e-176
HCFC2
cgl9455421
-66.7668334399572
-0.0406609357728355
4.65369499785506e-176
C7orf41;C7orf41
cg22491961
-66.726214446135
-0.0680341990523695
5.47782568270957e-176
LASS4
cgl3220109
-66.7141574804142
-0.0278203599934497
5.74955431190832e-176
LHPP;LHPP
cg03697856
-66.6170393539529
-0.0402215714380071
8.4941352099639e-176
C19orf36;C19orf36;MOBKL2A
cgl3889422
-66.5922996077709
-0.0505490523442806
9.38271011694331e-176
SLC4A3;SLC4A3
cg08522707
-66.5588194421542
-0.047295928955503
1.07355789953637e-175
MRPS33;MRPS33;MRPS33
ch.l2.2480290F
-66.5536203705981
-0.520386626684005
1.09625530695085e-175
CCDC64
cg20201566
-66.5404412959476
-0.042185233769518
1.15597147456496e-175
MMAB;MMAB;MVK;MVK
cgl6940617
-66.5388567546626
-0.0507026628256645
1.16336761928351e-175
MRPL32;MRPL32;PSMA2
cgl0557147
-66.3133725231859
-0.0611656932354101
2.88713326074403e-175
SESN3
cg06334857
-66.2419439813638
-0.0513424564809562
3.85266392164952e-175
PIGT
cg00034416
-66.2172690458901
-0.0486664119969241
4.25668516170659e-175
FDPS;FDPS;FDPS;FDPS;FDPS;FDPS
cg04276524
-66.0543325657348
-0.0716769644541208
8.2303877126126e-175
cg23981504
-65.6819539699432
-0.0484549946967239
3.73406914678428e-174
SNX3;SNX3;SNX3;SNX3
ch.5.2313526R
-65.6350199229682
-0.66047628312808
4.52054952607937e-174
cg01094684
-65.6336468315935
-0.0511489525132478
4.54590654050128e-174
UQCR
cg07772309
-65.6305845889541
-0.0351589991178273
4.60297247862812e-174
NELF;NELF;NELF;NELF
cgl5535093
-65.5515094384
-0.0421087260191793
6.35358619121112e-174
TNKS1BP1
cgl1297382
-65.5066100949226
-0.0404375371434976
7.63073864882166e-174
ATP5G2;ATP5G2;ATP5G2
cgl7205461
-65.4810672964643
-0.0716332006763666
8.46918809878592e-174
TAX1BP1;TAX1BP1;TAX1BP1;TAX1BP1
cg05780074
-65.4590064401908
-0.039035715425611
9.26739353146471e-174
SEC31A;SEC31A;SEC31A;SEC31A;SEC31 A;SEC31 A;SEC31A;SEC31A;SEC31A;SEC3 1A
cg23099587
-65.3386184464357
-0.645306323123966
1.51572227850422e-173
cg08845510
-65.1914349376021
-0.0530176320621327
2.7688945559746e-173
CLSTN1 ;CLSTN1 ;CLSTN 1 ;CLSTN1
cg02396888
-65.1767422016111
-0.0422001397428602
2.94074875764621e-173
MATN1
cg02941219
-65.147438969005
-0.0526356919628953
3.31611784788677e-173
NUDT21 ;OGFOD 1 ;NUDT21
cgl0667044
-65.030909686395
-0.0452252265228173
5.34938916834283e-173
EIF4B;EIF4B
cg24048759
-64.9807701424519
-0.0531008448217842
6.57296297793986e-173
BAI2
cg24734865
-64.8926417229277
-0.0474970615639179
9.44371196700312e-173
EFHA1
eg18634086
-64.8076869657606
-0.09753340461987
1.33978021478359e-172
PTPN12;PTPN12;PTPN12
cg27628854
-64.7922855279462
-0.0457439774712197
1.4275405414122e-l 72
SNTB1
ch.7.1427355R
-64.748972660078
-0.499459406677671
1.70651723237616e-172
TYW1
cg09827037
-64.6537611052163
-0.040822883284484
2.52744367451807e-172
cgl0594818
-64.4800662988205
-0.0465709077812265
5.18107653906461e-172
ACAD 11 ;UB A5; ACAD 11 ;UB A5
cg26447968
-64.3892992277017
-0.0887276993007257
7.54424180970719e-172
INO80B;INO80B
cg05830192
-64.3161044091399
-0.0481235399206959
1.02179348565028e-171
BEND3
cg06986705
-64.2643879830678
-0.0527769897172755
1.26627865145817e-171
UBTF;UBTF;UBTF
cg08219302
-64.2543733636048
-0.0585356371382559
1.32001231064043e-171
SUPT5H; SUPT5 H; SUPT5H;SUPT5H;SUPT5 H
cgl9948397
-64.215679338863
-0.0506629917090509
1.5500179963339e-171
Cllorf61
cg09726208
-64.1381878615558
-0.0906137576546357
2.13870502339553e-171
PRR11;SKA2;SKA2
cgl0203522
-64.1230863008447
-0.04908231048111
2.27727269281377e-171
NUDT16L1
cg06080267
-64.1080952249392
-0.0387717301725355
2.42373564930883e-171
MANIC 1
cgl5407226
-64.1054059865667
-0.0575133147370201
2.45099225986762e-171
ERN1
cg00386581
-64.0717823648898
-0.0434133965861409
2.81890368797276e-171
UBXN1
cg02244269
-64.067445495219
-0.0418530061690451
2.87022838815449e-171
ATP6V0C;ATP6V0C
cg24885126
-64.0077640819698
-0.0536115571950443
3.67960109508416e-171
RHOU;RHOU
cgl4029891
-63.9738431921362
-0.0493363351270662
4.23796666772257e-171
COG5;COG5;COG5;DUS4L
cg26984694
-63.9133462656565
-0.0546535860138437
5.45325641119192e-171
MAPK7;MAPK7;MAPK7 ;MAPK7
cg21982467
-63.8325049739234
-0.0463446244910493
7.64043511591707e-171
MPV17L2;MPV17L2
cgl2748915
-63.8173244015367
-0.0537600775529228
8.14027549421453e-171
PDLIM5 ;PDLIM5 ;PDLIM5 ;PDLIM5;PDLIM 5
cg08056863
-63.7895409237759
-0.0337605304294832
9.14161223831129e-171
SPC24;SPC24
cg06135725
-63.6421191026103
-0.0612623016509357
1.69310222036524e-170
DGCR6L
cgl5797843
-63.5795987059336
-0.0420574961031579
2.19967503067861e-170
FAM134C;FAM134C;TUBG1;FAM134C
cg27105478
-63.5577572523237
-0.0367316619167249
2.410426053401 le-170
ZSWIM6
cg25052180
-63.5361333728215
-0.0395527756383085
2.63903386720272e-170
GOLT1 B;RECQL;RECQL;GOLT 1В
cgl7973889
-63.5261294367324
-0.0543971598140653
2.75203573851024e-170
IDH3B;IDH3B;IDH3B
cg02976405
-63.4757859523913
-0.0547492681254523
3.39880934621943e-170
C7orflO;C7orfll
cg01260085
-63.4120587625948
-0.0320661687230164
4.44079904006177e-170
PDXDC2
cg20041683
-63.3858583104598
-0.0555533403073267
4.95721037613878e-170
MAGOHB
cg03000603
-63.3351468388305
-0.0880046620913777
6.1341990520671e-170
DHX34;DHX34
cg25931580
-63.2649223227231
-0.0597648700298429
8.24109933116333e-170
PDHX;PDHX;PDHX;PDHX;APIP;PDHX
cgl2796428
-63.2166721427978
-0.044854785316994
1.00962413447796e-l 69
STK19;STK19;DOM3Z;STK19
cg25108382
-63.1075902361271
-0.0726339174384702
1.59851347121482e-169
MICALL2
cg04218270
-63.0685486522319
-0.0565981368946922
1.88457062800052e-169
ASXL1; ASXL1; ASXL1; ASXL1
cg09173344
-63.0519570648363
-0.0453776619648569
2.02119351586282e-169
CANX;CANX
cgl1710924
-63.0023502388778
-0.04111529451973
2.4918852488072e-169
YIPF4;YIPF4
cg24930634
-62.9925869917568
-0.0378826262408107
2.59674660506258e-169
ANKRD13A
cg20208648
-62.9525571104288
-0.0572289502785893
3.07504902686098e-169
POLD2;POLD2
cg06541550
-62.9130668291521
-0.0417044574337747
3.63349384722306e-169
PYCRL
cg20483962
-62.8782741442222
-0.0619866600705505
4.20928628653952e-169
DVL2
cgl8482098
-62.8744508103678
-0.0457936291865875
4.27789858813468e-169
MTIF2;MTIF2
cg00945244
-62.8118750478465
-0.0609864894921143
5.57456664743089e-169
POM121C
cg05943368
-62.7994023829392
-0.0409320210192668
5.87680149881591e-169
cg21532378
-62.7513860692667
-0.0401185940852826
7.2019757818644e-169
ZNF498
cgl0348543
-62.7397372202435
-0.0631962246703145
7.56632166604052e-169
MOSPD3;MOSPD3;MOSPD3;MOSPD3
cgl3018071
-62.7325303512523
-0.0449943104999131
7.80093586155282e-169
NRF1
cgl8631920
-62.6860858068234
-0.0410691830891643
9.49826934147556e-169
COG5 ;COG5 ;COG5 ;DUS4L
cg25573740
-62.6779232820975
-0.0387010242141866
9.83277691113032e-169
DYNLL1;SFRS9
cg03527422
-62.6722452394041
-0.0450057724751909
1.00724145047397e-168
POU3F2;POU3F2
cg06514371
-62.6717973598669
-0.0406009101616134
1.00915644090977e-168
RAP2B
cgl9939555
-62.6514234645433
-0.0351810538382413
1.10024303508594e-168
CRTC2
cgl8973778
-62.6409486189567
-0.0431311460965983
1.15023911389081e-168
SNAPC1;SNAPC1
cg22431590
-62.5941433784951
-0.0585385059125674
1.40300469530976e-168
ZBTB48
cg04001935
-62.5843916883833
-0.0481990130135673
1.46231311166159e-168
LOC100128731
cgl2811552
-62.5749230568524
-0.0487615684537823
1.52230617002209e-168
ATP6V0E1; ATP6 V0E1
cg07308931
-62.5710688956075
-0.0402984633208857
1.54742759227967e-168
TPJP13;TRIP13;BRD9;TRIP13;TRIP13;BRD 9;BRD9
cg06680214
-62.567379321418
-0.0395621759956247
1.57186581151869e-168
ZBTB9;ZBTB9
cg02705895
-62.5195943174382
-0.0301316353996373
1.92567300295709e-168
MRFAP1
cg25124965
-62.5094013056762
-0.0426627643943503
2.01093015329086e-168
PAIP2;PAIP2;PAIP2
Злокачественная опухоль головы и шеи
cg07470207
-35.3013691665723
-0.336570713209517
3.5861542658662e-146
eg10364040
32.9983455202795
0.505043983300548
7.17665678470701e-135
HOXD10
cgO1712948
-32.4072939494312
-0.394775543045875
6.26813486425099e-132
cg22674699
32.2494159949326
0.519925600780261
3.85008173608471e-131
HOXD9
cg02259047
32.1971575942784
0.335374417931334
7.02519045885345e-131
XRCC3;XRCC3;XRCC3
cgl5811515
32.0840754581026
0.477791738783793
2.58381234111484e-130
CSDAP1
cg26450106
-31.6227244412756
-0.421623841106516
5.3166077345287e-128
CST7
cg05057720
31.283058566786
0.442930188370353
2.7208828674027e-126
CLEC14A
cgl6717008
-31.2307065308465
-0.283082053351953
4.99528954361226e-126
cg09853702
-30.9585787776298
-0.298558529751288
1.18006367872962e-124
cg23597178
-30.1475356694696
-0.230117411508112
1.5231260400465e-120
cg03663556
-29.9749892510481
-0.240661051209146
1.14975270958837e-119
cg08566455
29.8450772984137
0.417100257205185
5.27592796909092e-119
cg04227922
29.6316888959535
0.363312976851816
6.46434621877491e-118
cgl3299942
-29.3931709215426
-0.254407967184718
1.06869022233551e-116
CCDC60
cgl2305431
29.0199469022912
0.384731399153329
8.69437836604022e-115
HOXA3;HOXA3
cg07953015
28.898395645934
0.388707168281104
3.65116751385036e-114
SEPW1
cg06051311
-28.827096975801
-0.424772190253925
8.47632255292612e-l 14
TRIM15;TR1M15
cgO1719405
-28.6760561627386
-0.392199488687687
5.05384925460023e-113
cg01477835
28.6462164169977
0.327381250153774
7.19284473006961e-113
AFF1;AFF1
cgl6404157
28.6337954331482
0.363886852969581
8.33128821533844e-113
CLEC14A
cg26353287
28.6202928602403
0.25085447527864
9.77430175264744e-l 13
cgl9685205
-28.5702130560975
-0.315041814261293
1.76781333964166e-112
CLEC4D
cg03078269
28.4980267528235
0.475654660252658
4.15457844496576e-112
cgl7518550
-28.28113882663
-0.386332363757523
5.42573534284309e-lll
Clorfl50
cg07537821
-27.6425714182318
-0.252807137744128
1.06667048006949e-107
CRT AM
cg09887059
27.6193223797127
0.407918197431626
1.40655610853358e-107
cg04715649
27.5527274678598
0.260612957111062
3.10691542271213e-107
CDC42BPB
cgl3768872
-27.5473105766435
-0.303843126963098
3.3138272439485e-107
MAPKAP1 ;MAPKAP 1 ;MAPKAP 1; МАРКА P1;MAPKAP1
cg03282689
-27.3159496414455
-0.266774230149625
5.21150014731198e-106
F AM40B ;F AM40B
cg23641672
-27.310061865448
-0.230871866121132
5.59027124305559e-106
RABGAP1L
cgl5834072
27.2860991703593
0.280101188151672
7.43793377028748e-106
DCHS2;DCHS2
cg26835440
-27.2186102840078
-0.305461298009668
1.66271741303136e-105
cgl2579640
-27.2046284345044
-0.232840355192099
1.96431645647189e-105
cg22956811
-27.1380547372917
-0.182850252207612
4.34481152188405e-105
cg23669081
26.9764330032058
0.465909551939379
2.98802233457701e-104
HOXB7
cg05592278
-26.9473229641467
-0.280682482458913
4.22937647951184e-104
LRRC37A3
cg06962177
26.9143724055201
0.444527484644641
6.26757409137649e-104
cgl7527177
-26.9110135972535
-0.356951452413114
6.52399579829013e-104
cg21806580
-26.7831533075514
-0.357310488661616
3.00337220309602e-103
cg27052900
-26.7472109565822
-0.229816571647088
4.61396192028275e-103
cg05661282
26.7233477281793
0.45113995007778
6.13605265057279e-103
ZNF154;ZNF154
cg04146553
-26.7013223211687
-0.231661663265194
7.98324280192104e-103
BLOClS2;BLOClS2
cg20649017
26.6684634904047
0.392413811874885
1.1822342304674e-102
HOXD10
cg05666526
-26.6220046324596
-0.231496844450826
2.05989475993432e-102
cg20779964
26.5942218241725
0.316914869196126
2.87125103087242e-102
CBLN4
cg02627455
26.4991496627497
0.306107807106228
8.94805786793555e-102
HOXA3;HOXA3
cgl0659886
26.414689293144
0.251798856583692
2.45717593539403e-101
ZSCAN18;ZSCAN18
cg26364809
26.3514785794337
0.302174333504725
5.23429802148527e-101
cg05937737
26.3440663469114
0.352135333761752
5.71972266086164e-101
SLC7A14
cg02772121
-26.1706629883028
-0.482758193821262
4.55752676168878e-100
TRIM 15
cg22990967
-26.1637185545271
-0.309952802824616
4.95265272475351e-100
cgl6073378
26.1314349909265
0.370073371448524
7.2897457925079e-100
cg05697849
26.110569601918
0.42085285231982
9.35884149030317e-100
ELAVL4;ELAVL4
cg27446570
26.0839920959126
0.260171068722888
1.28661430195836e-99
Clorfl74
cgl3944175
26.0563353647957
0.341835641817897
1.7918449574656e-99
HAS1
cg20763327
26.0063648285124
0.252390908920142
3.26022033050257e-99
MYO10
cgO1195545
-26.0005932160788
-0.300503916146228
3.49360293522636e-99
cg02614785
-25.9566725526485
-0.223358985886024
5.91271709882515e-99
cgl3305823
-25.9345806952971
-0.30261481704248
7.70442244578617e-99
MAS1L
cgl7974575
-25.9200009121839
-0.373104603488503
9.17506156241149e-99
ABL2;ABL2;ABL2;ABL2;ABL2;ABL2;ABL 2;ABL2;ABL2
cg00863654
-25.854710274738
-0.239811740833379
2.00633608200596e-98
cg21587238
25.8463937429564
0.500924984410659
2.21661642358305e-98
cg22824635
25.8176482505767
0.439435221964763
3.12835979613805e-98
NFIX
cg22167515
25.7981826728666
0.426203248495928
3.95044648201816e-98
cg03192598
25.7910981678573
0.443739195429817
4.30057492997098e-98
cg06383163
25.6414112961857
0.256125374045627
2.5878306918491e-97
FAM135B
cg08475953
25.6279036729115
0.388296583321396
3.04288091303646e-97
COL23A1
cg05649391
-25.5942882630997
-0.32675328781375
4.55374257004637e-97
MYBPC3
cgl8705773
25.5908444822368
0.448705638602675
4.74576300217195e-97
cgl5446845
-25.5899694611942
-0.252816908138348
4.79583001361898e-97
cgl0255237
-25.5336929647256
-0.314796112425298
9.41919395032498e-97
cgl6057598
-25.5220853972357
-0.0725920284023779
1.08263980778563e-96
DLX2
cgl3471932
25.518837492801
0.243190981606373
1.12565276850053e-96
RALGDS;RALGDS
cg21771528
-25.4623665322215
-0.385404579980122
2.21625 85443284 le-96
cgl6971991
-25.4533035694223
-0.164990650766263
2.47082868427805e-96
cg22720790
25.4413529183844
0.333984815012988
2.85175767572696e-96
ZNF274 ;ZNF274 ;ZNF274
cgl8862481
25.4218325906879
0.359497768583043
3.6043666545653e-96
TRH;TRH
cgl1653519
-25.4167995974748
-0.309119332223791
3.8287376335053e-96
cg07883457
25.4118201049102
0.195182785297365
4.06446857945974e-96
cg09340639
-25.3687883017865
-0.237839826258604
6.81169795627628e-96
FCRL1;FCRL1;FCRL1
cg27288226
25.3049140291716
0.352219424431872
1.46610199195731e-95
cg06809342
-25.3011662234168
-0.210288781504998
1.53355373699977e-95
cg21054521
25.2912514213597
0.353195408799517
1.72734479274633e-95
cgl9303187
-25.2798058443694
-0.245342338790583
1.98170724980539e-95
DLX2
cg03943218
25.2750715406646
0.483576761753537
2.09757575152794e-95
cg05696153
25.2507598451523
0.179840073537101
2.80833821206066e-95
CMIP;CMIP
cg24845535
-25.1594023561848
-0.274807933781668
8.40881175315786e-95
cg23575099
25.1463364814261
0.299252008323577
9.836935049461 le-95
LGALS3;LGALS3
cgl8343437
25.1350732835683
0.356818397055287
1.12612675133775e-94
cg05926314
-25.1344654749078
-0.393086569655532
1.13437458850135e-94
PTPRN2;PTPRN2;PTPRN2
cgl3987334
-25.0775404473901
-0.262455642055291
2.2469292762377e-94
cgl2492087
25.0480076843588
0.343268004680502
3.20331171826186e-94
ZFP106
cg01521036
-25.0402274042425
-0.278636545564277
3.51701175495686e-94
F AM90A14 ;F AM90A13
cg03964958
25.0373749313493
0.310673928661768
3.6395674933663 le-94
HOXD12
cg22541735
25.0091164217761
0.480563884315919
5.11004968077844e-94
HOXD9
cg06794543
25.0058799781618
0.36566477474354
5.31256769382488e-94
ZFP106
cgl0333594
24.9991335286278
0.259582006192738
5.76089863196126e-94
CRAMP 1L
cg20157003
-24.9453075914293
-0.226037839536201
1.09959142980542e-93
ANKRD45
cg04074004
24.9317063458005
0.343977819024489
1.29471957736444e-93
DDAH2
Злокачественная опухоль почки
cg20003368
-60.3900722320859
-0.325008707302119
5.9798581600785 le-312
cgl9680850
-53.8691711199639
-0.145774222230352
3.93211962823944e-278
ZC3H12A
cgl7983632
53.0637178798889
0.42077254545006
8.49546495318266e-274
cg00981877
-52.4471446480175
-0.113497640598598
1.86649122108422e-270
ATP9A
cgl7888086
-50.964582509955
-0.155952929339574
2.46055439260289e-262
ZC3H12A
cg26221105
-49.1314424699443
-0.142672420148813
3.94813567576085e-252
CAPN2;CAPN2
cg25799109
-48.5562790791931
-0.352513262137342
6.85518927340736e-249
ARHGEF3;SPATA12
cgl3415371
48.3259087903109
0.142224473246049
1.375983480093 06e-247
BRD3;NCRNA00094
cg06349174
-47.4859055351042
-0.167474565812389
8.17649173845152e-243
STIM1;STIM1
cgl6382778
-46.6974882461924
-0.144200393982585
2.67844462277155e-238
S100A11
cgl4601621
46.2155572735033
0.315804149926263
1.60070076176455e-235
C9orf3
cg04999352
-46.1166279912886
-0.283594787441432
5.96729042388871e-235
RARRES3
cg05194102
45.8768427843977
0.22347079123807
1.45565502336083e-233
SLC9A3R2;SLC9A3R2
cg05575213
45.0797475111477
0.217571024219073
6.25919707365498e-229
cg07283896
-44.2878924621317
-0.277782306847482
2.70713729016347e-224
cgl6468729
-44.1964335663665
-0.3622287542471
9.33394905247846e-224
IL8
cg04075990
-43.692992035977
-0.303241943817197
8.64563081414196e-221
cg24185397
-43.6480054488419
-0.190207015288007
1.59415990020605e-220
cgl7094249
-43.2299626929264
-0.211375487132757
4.75165118210345e-218
cgO1343313
-43.1301913060418
-0.302673880614885
1.85645664902618e-217
cg05101437
-43.0893395798105
-0.353716799777689
3.24460017233852e-217
CDK6;CDK6
cgl8456803
-43.0130517900391
-0.266341242439949
9.20862886080582e-217
ELF1
cg22537280
42.7735844739035
0.119833607196772
2.44440504650325e-215
SSBP3;SSBP3;SSBP3
cg07093324
-42.6977808321425
-0.375998918201606
6.91091288808288e-215
ACTR3
cg22164891
-42.6795327404545
-0.342722811091531
8.87634437317273e-215
ZNF217
cgl7113029
-42.6230762457996
-0.372948584473776
1.92590587792926e-214
cgl5364131
-42.366731865164
-0.112091645252315
6.51757545691273e-213
C22orf24;YWHAH
cgl5103195
-41.8824129715592
-0.0690511235427278
5.15953178372732e-210
AP1S1
cg09029902
-41.7716774845487
-0.375774700774562
2.38206464436899e-209
ZNF217;ZNF217
cg21243631
-41.6718810883978
-0.243841096942398
9.466340425 97579e-209
NPC1
cgl5759721
-41.658611829117
-0.301592459009803
1.13734987026059e-208
MIR21
cg08141142
41.5704192747238
0.311368404449801
3.85396450623343e-208
MTA1
cg00319761
-41.5664851663617
-0.0476155629889706
4.06967238726996e-208
PKMYT1 ;PKMYT 1 ;PKMYT 1 ;PKMYT 1
cgl7367884
41.4919115687013
0.245532274197034
1.14297191235958e-207
TBC1D16
cg07495389
-41.3020328819572
-0.38487125641321
1.58911589092802e-206
MAPRE3
cg08943045
-40.9372944114835
-0.290143056970123
2.52251653245607e-204
cg02284014
-40.759896534263
-0.157098825676918
2.98172551912239e-203
TFEB;TFEB
cg27115863
-40.6756372159191
-0.357478287067862
9.64853387788963e-203
cg25743481
-40.5537367870245
-0.135640596734871
5.28293330061597e-202
KIF15;KIF15;KIAA1143
cg02064267
-40.5514856408056
-0.269445655483411
5.45152536544385e-202
cg05228359
-40.2107107301382
-0.206282285429371
6.37507317742469e-200
cg20979153
-40.1158375701983
-0.29964411378308
2.4053256559696e-199
ZNF217
cgl5034393
-39.8805537517927
-0.164945956182979
6.50333362064497e-198
cg22720029
-39.8732402190802
-0.124247357816791
7.20588815855202e-198
cg26203328
-39.6758345558622
-0.385182871780517
1.15114892344021c-196
cg09228833
-39.6517578837613
-0.352539096510539
1.61447302704262e-196
ZNF217
cg02515217
-39.612988894734
-0.329961280735937
2.78373189345726e-l 96
MIR21
cg24680129
-39.21076057827
-0.181040168006266
8.00363454993226e-194
cg01346158
39.1526301507387
0.157808794863553
1.81639069333392e-193
SLC9A3R2;SLC9A3R2
cg22274117
-39.1378318389702
-0.407393312386085
2.23789861383251e-193
ATXN1;ATXN1
cg20968743
-39.1159953558447
-0.27001288618924
3.04504620393294e-193
TSPAN18
cgl9782880
-39.0960329710454
-0.163566793233788
4.03539838377962e-193
CPNE9
cg21182694
-38.8191309954381
-0.130777053691537
2.01384076348508e-191
MRPS22
cgO1077100
-38.8000118898782
-0.286330290905886
2.63875216570993e-191
BTBD16
cg21469505
-38.7963464442886
-0.242622019046428
2.77909136554106e-191
cgl1993160
-38.7229883621987
-0.190633698167034
7.841715137203 89e-l 91
cg02896970
38.5870863208311
0.146901288577342
5.36570521505889e-190
ZCCHC14
cg22193385
-38.5706929142184
-0.203109085792361
6.76751942332117e-190
KRT7
cg03272310
-38.5551364879808
-0.382741175004781
8.43521665674044e-190
cg07846737
38.5545228982048
0.0906727581343537
8.50882950931761e-190
KDM4B
cg00702638
-38.1627712946091
-0.132687299058321
2.19986224438419e-l 87
KF15;KIF15;KIAA1143
cgl9453938
-38.1139074991994
-0.154006531612487
4.40316625131859e-187
cg02776128
37.7943758592612
0.111371529875803
4.13923820727945e-185
SLC26A1;IDUA;SLC26A1;SLC26A1
cgO1582066
-37.7772673113776
-0.158607322946221
5.28063508580316e-185
cgl6206504
-37.6527952994898
-0.475903212760675
3.10838158242134e-184
cg03890877
-37.5943027070999
-0.143383186047252
7.15355050353108e-184
TWF2
cg02632314
-37.5113779531716
-0.226214586861512
2.33316267150501e-183
ELF1;ELF1
cgl2682870
-37.451451678713
-0.222740213484942
5.48460823710287e-l 83
cg21410293
37.4116596130239
0.246787906607671
9.67626987229963e-183
KIAA0427 ;ECIAA0427
cgl7962854
-37.3731016141544
-0.209265550916089
1.6775812331588e-182
ST3GAL1;ST3GAL1
cg25247183
-37.3137214760311
-0.124601372568968
3.91584821356717e-182
LGALS1
eg12433486
-37.2830835526306
-0.147211498897595
6.06495710510428e-182
PKM2;PKM2;PKM2
cg01106881
-37.2738535115597
-0.368036448760463
6.91950932754663e-182
cg08404702
37.2370332512386
0.109062394075342
1.17079039139474e-181
TSC2;TSC2;TSC2
cg24704287
-37.1583829352188
-0.276467792362888
3.60197811279709e-181
cg20740711
-36.9689620871158
-0.262784381821276
5.40717105555544e-180
cg01298102
-36.9620086963142
-0.264600039552263
5.97284928457102e-180
cg07101841
-36.758910345992
-0.308618298499297
1.09430168190119e-178
SEPT9;SEPT9;SEPT9
cg22790839
-36.6751084139317
-0.287441794227773
3.6367116970185e-178
cgl6094145
-36.6455013023948
-0.174654040210914
5.55958521824922e-178
NINJ2
cg08282819
-36.5317765900485
-0.0838479856077166
2.8404976366169e-177
IL21R;IL21R;IL21R
cg00406023
36.5310858861486
0.14761242964453
2.86878534410686e-177
OAF
cgl2315892
-36.5229946142075
-0.113323819954701
3.22191640836723e-177
cgl6581738
36.4123892094335
0.211272115267876
1.57590971140815e-176
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1B;PRKAR1B
cg07690326
36.3375964853747
0.22294961015979
4.61293482557108e-176
PLEC1 ;PLEC 1 ;PLEC 1 ;PLEC 1 ;PLEC 1 ;PLEC 1
cg00697703
-36.3374153567122
-0.104881120079345
4.62495144360566e-176
OSBPL3;OSBPL3;OSBPL3;OSBPL3
cg08016257
-36.2653204388269
-0.156248551994578
1.302929858147e-175
TMEM140
cg20414098
-36.2307802264034
-0.105304079347125
2.14037804078869e-175
SLC25A45;SLC25A45
cg00513611
36.1907233469585
0.0830437329764637
3.80665759010193e-175
KDM4B
cgl3763287
36.0790843574259
0.215878677929682
1.89560590056479e-174
cg07181702
-36.0586502618925
-0.270879938828817
2.543374939333e-174
MIR21
cg00524374
-36.0281457933108
-0.151685733302331
3.94470943904156e-l 74
cgl6033151
-36.0124794314051
-0.184322394784503
4.94217070245091e-174
SSH2
cgl9154027
-36.0001001078434
-0.0756899670112879
5.90588676827428e-174
YAP1;YAP1
cgO1904393
-35.9678674978859
-0.243953309609604
9.3919410791145e-174
cgl4292522
-35.9033784726255
-0.265780686633161
2.37658800796425e-173
UHRF1 BP 1 L;UHRF 1 BP 1L
cgl5063366
-35.8433238741081
-0.127508541177265
5.6436209821614e-173
cg06093152
-35.7852124119271
-0.28033637309162
1.30354973761052e-172
cg22074858
-35.7270400208755
-0.226987203225944
3.01435938750049e-172
GBP3;GBP3
cgO1645729
-35.6520311105925
-0.22995257607102
8.88798610890922e-172
Глиома головного мозга с низкой степенью злокачественности
cg07311968
127.432001935759
0.0424137310600108
MEPCE;ZCWPW1
cgl7025484
125.322520431113
0.0532209214380451
ZKSCAN5 ;ZKSCAN5 ;ZKSCAN5
cgl9983815
122.659229072904
0.0449046968821236
ATP6V0C
cgO1067724
121.592960650843
0.0493749326094194
CCDC102A
cg05203615
121.158763208274
0.0545503859805657
SLC38A10;SLC38A10
cg21705063
120.513283674587
0.0727006811437691
SEC63;SEC63
cg05456022
119.618048913949
0.0377248541463961
FAM96B;FAM96B;CES2;CES2
cg07026259
119.547256867156
0.0665351616663283
NFATC3;NFATC3;NFATC3 ;NFATC3
cg27332026
119.534998049794
0.0397724768414041
SLC39A6;ELP2;ELP2;SLC39A6
cg05584166
119.25010575468
0.0333098563775184
GPR172A;FBXL6;FBXL6
cgl0450921
118.139154728145
0.0346403234053113
C16orf91
cgl5110300
116.774260609348
0.0554081659458187
CCM2;CCM2;CCM2;CCM2
cgl0507099
116.514851624399
0.0519315219123975
FHODl;SLC9A5
cglOl13231
115.50916018328
0.0506706551587445
NKIRAS1;RPL15
cg03860051
115.36138407783
0.0439464448319326
IKZF5;ACADSB
cg22804475
114.967114077503
0.0403625306613353
ATP6V1B2
cgl5535093
114.56574038531
0.0423805382558422
TNKS1BP1
cg03976895
114.229071729411
0.0416260396275087
ARF6
cgl6877606
113.825720604473
0.0414355171613119
FXC1;FXC1;ARFIP2
cg23354319
113.774410780672
0.099881394765007
ING4;ING4;ING4;ING4;ING4;ING4
eg14326210
113.739668867132
0.0696282778264073
TPX2;TPX2
$06709324
113.076603701421
0.0342519458499082
SOAT1
$11871345
111.828266149217
0.0428914981010427
SOX12
$18526602
111.468233003125
0.0431692741711436
DAGLB;DAGLB
$26407106
111.306657724731
0.0491633861877907
ARFIP1; ARFIP1 ;TIGD4;ARFIP 1
$00511731
111.131128265051
0.0449945128552503
BMF
$26576481
111.079346618816
0.055927365639034
NAP1L1;NAP1L1
$16659480
110.786813168314
0.109308229821386
CYB5B
$14664464
110.773680469528
0.0399511840971694
LMBR1
$15487992
110.741864882507
0.0380002683139628
UBL5;UBL5
$24712108
110.740465431642
0.0420992279612518
B9D2;TMEM91
$07200850
110.722895377441
0.0519437548935887
FA2H
$19225923
110.636255921545
0.0392132258932752
GTPBP4
$13895172
110.616186283516
0.0401471156283577
EIF4ENIF1 ;EIF4ENIF 1 ;EIF4ENIF 1
$26448406
110.483574737285
0.0434975165844416
PISD
$01055543
110.270082244049
0.0733854724731464
MRPL33;MRPL33
$02289741
110.253750697042
0.0527967277530644
PAK4;PAK4;PAK4;PAK4;PAK4
$04366381
110.223420099742
0.0525495874517619
FAM49B
$01439854
110.052904050917
0.0600566915065098
AARS;AARS
$05284480
109.968253141515
0.0359753542252536
RNPS1;RNPS1
$13086581
109.842377188053
0.0397489541342044
GLUL;GLUL;GLUL;GLUL
$06125055
109.641188055398
0.0710926972962954
FKBP7;MIR54 8N;FKBP7
$05377417
109.494549279696
0.0819268590730886
BRIP1
$25589039
109.222610207167
0.0416584548185497
C6orf70;TCTE3
$26094646
109.144446314243
0.0493420852788431
DVWA;CAPN7
cg07917502
109.135845621906
0.0446357453448343
PREPL;PREPL;C2orf34;PREPL;PREPL;PRE PL
cg05827058
109.102274659714
0.0872318814882328
cg27167184
109.028836645152
0.0546599999831815
METTL13;METTL13;METTL13
cg03898805
108.988250470132
0.0478082437304087
MIR548G;C3orf26;C3orf26
cg08056863
108.924908341163
0.0339578570059739
SPC24;SPC24
cgl4921691
108.717647056475
0.0543857456464987
DGKA;DGKA;DGKA;DGKA
cgl2198729
108.597325274431
0.0698900086669551
BTRQBTRC
cg05981907
108.578426149213
0.0747231478872462
CDC6
cg24717401
108.459544448762
0.04935649510242
CCM2;CCM2;CCM2;CCM2
cg07308931
108.447148400752
0.0407576216668551
TRIP13;TRIP13;BRD9;TRIP13;TRIP13;BRD 9;BRD9
cgl8907202
108.385140067921
0.0268608885036449
CCDC41 ;CCDC41 ;CCDC41 ;CCDC41 ;LOC 1 44486
cgl5215114
108.338477810883
0.0449014177831978
C17orf61
cgl0488141
108.250772968399
0.0357429785564022
SUFU
cg26800462
108.082624264717
0.0327107811408955
SPSB3;NUBP2;SPSB3
cg04263685
108.012265118822
0.0371065268725429
ATP6V1H;ATP6V1H;ATP6V1H
cg08569242
107.922329298943
0.0465237576274884
PRKAR1A;PRKAR1A;PRKAR1A
cg03254627
107.819345163253
0.0536354009103054
PSME3;PSME3
cg22341865
107.781365009049
0.0314797966121219
PGD
cg00461901
107.609665870785
0.0879870576409467
PPFIA3
cgl5042995
107.551660183949
0.0442817543025952
CYFIP2;CYFIP2
cg08262582
107.433143048155
0.0371506978804749
SFRS13 A; SFRS13 A; SFRS13 A; SFRS13 A
cgl0063233
107.294586865294
0.0313647619351982
LMBR1;LMBR1
cg09437885
107.283172648164
0.0474339411840465
GMIP
cg27505984
107.277091243753
0.0369514193436807
DDX55
cgl8207141
107.254089451322
0.146184551487881
MRPS18B;PPP1R10
cg04301102
107.21345141072
0.0321222649775362
SEPT8;SEPT8;SEPT8;SEPT8
cg20979732
107.162328236532
0.045017924697572
SF1;SF1;SF1;SF1
cg07914309
107.11222820622
0.0485360432317424
RGS2
cg23172884
107.015476112072
0.0335007107028745
LOC100188947;HECTD2;HECTD2
cg05348272
106.986706723159
0.0500191116316726
TBCD;TBCD
cg03176453
106.932807119182
0.0290320294726412
PRR3;PRR3 ;PRR3 ;GNL 1 ;PRR3 ;GNL 1
cgl4835062
106.915405574937
0.0443437041898348
C12orf53
cg04748923
106.804210759888
0.0625935586210725
HSDllBlL;C19orf70;HSDllBlL;HSDllBl L;HSD11B1L;HSD11B1L;HSD11B1L
cg27185138
106.790182595059
0.0424782838584063
AFF1;AFF1
cg25632672
106.635568504401
0.0386654175272393
GTPBP1
cgl7414580
106.538055076201
0.0427102810925721
KPNA4
cgl0815543
106.292039517991
0.0429755879006439
TTPA
cgl5719572
106.185994617372
0.0417288807683601
CAP1;CAP1;CAP1;CAP1
cg06157539
106.076958237575
0.0556565784473559
MAPRE2;MAPRE2;MAPRE2;MAPRE2
cg23845773
105.768444411064
0.0451193024371821
TAF10
cg22812972
105.732428703101
0.0349323702095137
EIF4B;EIF4B
cg01394138
105.661788357301
0.0625422732371145
RECQL5;SAP30BP;RECQL5;RECQL5
cgl8603466
105.455040978153
0.0550586330416612
RAD51L3;RAD51L3;RAD51L3
cg22431433
105.432529265081
0.0441367677054154
RAB4A
cgO1590844
105.402666005626
0.0542766638010672
XRCC2
cgl2528753
105.350326213216
0.0614004007431217
ASPM
cgl7281556
105.33164453737
0.0471502279221896
C12orf35
cgl9593314
105.311738757716
0.0345989774967558
C5orf56
cg22127491
105.292887412563
0.0509082154821186
NDUFC1
cgl7871792
105.076375732476
0.0344094277481292
LOC400657
cgl8313148
105.00503456306
0.0458441857355395
ZNF271 ;ZNF3970S ;ZNF271 ;ZNF3970S
cgl0557147
104.95658296998
0.0608454599905247
SESN3
cg26828320
104.813246329924
0.0543428694192704
С 12orf49;RNFT2;RNFT2
cg23618323
104.769295400937
0.037508097047315
EDEM3;EDEM3
cg23615779
104.685323636452
0.044700101440252
ZYX;ZYX
Злокачественная опухоль печени
cgl3814654
30.9709845255001
0.293933543981331
6.32207772820339e-lll
TBC1D8
cg26915558
28.3845572057094
0.327788240058423
4.41249117443706e-100
LRP5
cgl3053914
27.5322313891312
0.194177333806826
1.94406055757072e-96
RHBDD2;RHBDD2
cgl3894813
27.4969546293556
0.296312700039045
2.75575669717984e-96
LRP5
ch.l9.1066737F
-25.478323601239
-0.156774637525223
1.5793476898546e-87
ANKRD27
ch.7.135065R
-25.2072851779025
-0.243724440822715
2.43528087154233e-86
TTYH3
cg07688052
24.7363496763099
0.266270830939742
2.86388050419788e-84
CHERP
cg24985525
24.561015931201
0.363554147162534
1.6969845076265 le-83
LRP5
ch.7.2902493F
-24.4330998743783
-0.13831000003906
6.22364001069419e-83
UBN2
cg06621784
-24.3498832920825
-0.140436995527416
1.45034558946021e-82
SCP2;SCP2;SCP2;SCP2
ch. 10.2610459F
-23.9459696035691
-0.0829050024226206
8.86825042383636e-81
FGFR2;FGFR2;FGFR2;FGFR2;FGFR2;FGF
R2;FGFR2;FGFR2 ;FGFR2
cg27000120
23.911210184607
0.30036082140768
1.2641197048608e-80
GALNS
cgl9786751
23.7714820489124
0.332495655903509
5.26002119999026e-80
ACACB
ch.H.1435292F
-23.6402476025728
-0.104219788148484
2.00924187213904e-79
IGHMBP2
ch.l9.50335620F
-23.2876345106276
-0.133842475104186
7.39838409764619e-78
cg00981877
-23.2129613112858
-0.106329925795167
1.5892281703624e-77
ATP9A
ch.l5.1197129R
-23.0717921381343
-0.164855890711103
6.74962780504676e-77
ARID3B
cgl0905180
-22.9440662601859
-0.225730485162975
2.50005244274369e-76
OR51E2
cgl4054357
22.8485488022654
0.319758790858638
6.65962297875037e-76
KIAA0664
ch. 1.219558214F
-22.8031688002729
-0.118175454397103
1.06089104063832e-75
cg05375100
22.7680424781058
0.133288697620473
1.52134927327009e-75
RAB11FIP3;RAB11F1P3
ch.l0.2988224F
-22.4014714438213
-0.134926796034033
6.56862149810298e-74
TUBGCP2
ch.21.825836R
-22.3580901245368
-0.16116997086082
1.02602601512882e-73
PCNT
cg21072795
-22.2258888067042
-0.349669473090075
3.99570129799932e-73
NCKAP1L
ch.7.313144R
-21.9917195030094
-0.111854938915938
4.447485676490 8 le-72
cg03497652
21.8422997702625
0.391653036686768
2.07155588259614c-71
ANKS3
ch.l2.2506678F
-21.7780890689987
-0.188464210467625
4.01353691815706e-71
UNC119B
cgl0505257
21.7384777614787
0.312609356530504
6.03592931197231e-71
MGRN1; MGRN1 ;MGRN 1 ;MGRN 1
cgl8842353
-21.6603545680503
-0.300492220893749
1.34993825830779e-70
ch.l0.1700276F
-21.6494289080006
-0.111661453902534
1.51080156582495e-70
ch. 16.97779F
-21.645310732957
-0.198181620856486
1.57629339926837e-70
CRAMP 1L
cg25564800
-21.6211181661925
-0.155191864731003
2.02258734864115e-70
KPNA1;KPNA1
ch.3.1083063F
-21.5914407357184
-0.158326191833915
2.74620503760167e-70
SEMA3F
ch. 10.633958 IF
-21.4567271040697
-0.0911771593368788
1.10097757463221e-69
ch.l.3128389F
-21.389995772352
-0.0983176672864604
2.19061645214681e-69
ch.l5.814613R
-21.1889665467698
-0.206158658012661
1.74139380828141e-68
MYOIE
ch.6.168367002R
-21.1293390601918
-0.166097065231839
3.22108857277755e-68
cg27143049
-20.9813546152405
-0.145883262683201
1.4825308696994e-67
PDE3B;PSMA1;PDE3B
ch.9.1395144F
-20.900922065011
-0.169837567885193
3.39942836029904e-67
FANCC
ch.2.226789810F
-20.7999270252865
-0.0804023337187208
9.63789010736451e-67
cgl3678641
-20.7276073292956
-0.0364519319789314
2.03272802246707e-66
AURKB
ch.2.200726997F
-20.6964998793371
-0.13388512956724
2.80214082003257e-66
ch.l.2582316R
-20.6843946962571
-0.065897253651393
3.17497953338289e-66
PSMA5
cgl5602548
-20.5788281510241
-0.0997857608484757
9.43760031743091e-66
SPTBN1;SPTBN1
ch.6.3068315F
-20.5619580450567
-0.0980475250245069
1.12323351029581e-65
ARID 1В ;ARID 1В ;ARID 1В
cgl0537708
-20.5386843483977
-0.356414110548366
1.4281652599593e-65
ch.H.1980478F
-20.5174560111008
-0.174126494081213
1.77795258622166e-65
AMOTL1
ch.l.3056292F
-20.3893543971762
-0.151492931619203
6.66880400607692e-65
CCT3;CCT3;CCT3
cgl4096180
-20.372053681723
-0.0664737275018358
7.9723369565781e-65
CLCF1 ;LOC 100130987;CLCF 1 ;CLCF 1
ch.l.4512450F
-20.3612874815502
-0.0784523375848128
8.90916496196778e-65
URB2
cg08269316
-20.3586312904673
-0.148791140734289
9.15674972772146e-65
HMGB2;HMGB2;HMGB2
cgl8110520
20.2884899407988
0.255349429204541
1.88839102713264e-64
CAPN5
ch. 10.2770541R
-20.2784694910316
-0.113631454241305
2.09411006120044e-64
FAM196A;D0CK1
cgl8476530
-20.2705335389994
-0.128845185892406
2.27282000570861e-64
LOC 1001309 87;CLCF 1 ;CLCF 1
ch.l5.934240F
-20.2512825966347
-0.182428690955831
2.77229144591574e-64
SNX1;SNX1;SNX1
ch.l5.920727F
-20.2439747908128
-0.121045359694535
2.9894331669229e-64
HERC1
ch.l6.406779R
-20.235668652028
-0.115210717947485
3.25696184061368e-64
CLEC16A
ch.7.2184863F
-20.1940051735212
-0.212128354937819
5.006380052491 le-64
CUX1;CUX1;CUX1
ch.L1603567F
-20.1751094154016
-0.0581071526413584
6.08417432492772e-64
MRPL37
ch.9.1241711R
-20.1462561382741
-0.0598589390429582
8.19407334152305e-64
SECISBP2
cg00738178
-20.1327759894242
-0.381799016528551
9.41686716067609e-64
SCP2;SCP2;SCP2;SCP2
ch.2.216208170F
-20.0156085812868
-0.192413760865411
3.15441169621867e-63
ch.l.2975077F
-19.8816786124152
-0.0544485993052248
1.25589068280519e-62
GATAD2B
ch. 12.105153690R
-19.8619808708892
-0.120477831495458
1.53883525718986e-62
ch.l0.80061816F
-19.8540452241081
-0.2488582234024
1.67009359161019e-62
cg22113807
-19.7861167586844
-0.166061662048093
3.36523681748462e-62
UBOX5;FASTKD5;UBOX5
ch.l7.1150167F
-19.7214820837648
-0.125489587785178
6.55394361599873e-62
HDAC5;HDAC5
cgl8456803
-19.7027085015299
-0.385429827281805
7.95388972689925e-62
ELF1
cg21009747
19.6616210258667
0.407427279555618
1.21500326891469e-61
MYH9
cg23679141
-19.6208675977105
-0.175923127398167
1.84954028369906e-61
MARCH 1;ANP32C
cg04703620
-19.5925336077977
-0.451018913459556
2.47701479206194e-61
ch.4.77087090F
-19.5553152920005
-0.183632076328146
3.63546787005426e-61
cg05750824
-19.5465528634627
-0.309679381094385
3.97913647925598e-61
ch.l7.45797972F
-19.5387636463936
-0.106858090689702
4.31181080394805e-61
cgl9685205
-19.5176465097666
-0.242197291449909
5.3603583877627e-61
CLEC4D
ch.l5.1530357F
-19.4852966960436
-0.0675676878242108
7.48174923914055e-61
POLG;POLG
cg25792518
19.4378660620973
0.439065651525786
1.21982567414246e-60
ACSF2;CHAD
cg25641145
-19.4313704975334
-0.202481252496334
1.30427498045045e-60
ANKRD46
cg01651915
-19.3959559987161
-0.215877948423431
1.87871261091607e-60
ch.8.842844F
-19.381288160939
-0.134923466943989
2.18523938331085e-60
UNC5D
ch. 12.2545474F
-19.3772410017864
-0.105404948073623
2.27829313059724e-60
TMEM120B
cg24721350
19.3401394396815
0.105550441629175
3.33906624282345e-60
RHBDD2;RHBDD2
ch,16.2085963R
-19.3266072639418
-0.105452152754962
3.83859137062674e-60
KLHDC4
cg26914705
-19.3133264131928
-0.149972988721195
4.40141012166586e-60
C22orf24;YWHAH
ch,12.1173053R
-19.2979010844264
-0.156016090892035
5.1594499626264e-60
ESYT1
cgl1009596
-19.2171975717518
-0.229550239261227
1.18470240328334e-59
AURKB
cg05009047
19.1971773065683
0.200327121499001
1.45596175443679e-5 9
FAM100A
cg24035245
19.1869337407768
0.418794205716242
1.61793853145443e-59
cgl5364131
-19.1433534202296
-0.227940176913957
2.53423709613732e-59
C22orf24;YWHAH
cg26435670
-19.1007857175179
-0.153227458787093
3.9280346748955 le-59
BMPR1A
cgl8529294
-19.0635646423732
-0.1518180086696
5.76200273596645e-59
C2orf79;CENPO
cgl7295666
-19.0581117830914
-0.198033041510934
6.0946493914263 8e-5 9
UBOX5;FASTKD5;UBOX5
ch.l5.465126R
-19.0452708094763
-0.120009526576027
6.95581812899221e-59
ZFP106
cgl2371587
-19.029769780879
-0.164136329099197
8.1589540346653e-59
C22orf46
ch.3.2410502F
-19.0289592629221
-0.0607044832662739
8.22729773743669e-59
PTPLB
ch.l.64660926R
-19.0202378027011
-0.2560144385226
8.99991341324652e-59
ch.3.38006391R
-18.9489249069132
-0.0532184005534698
1.87467322411446e-58
ch.l6.82520294R
-18.944520123564
-0.225563813245258
1.96158410169333e-58
ch.22.533187F
-18.9339332914114
-0.0441881935303353
2.18730491311508e-58
HMOX1
cg21878746
-18.9300806526769
-0.396637528296776
2.27573957484973e-58
LAIR1 ;LAIR1
Злокачественная опухоль легкого
cg03169557
44.7260711971417
0.247836550880329
4.61418979758284e-232
SPG7;SPG7
cg02627286
43.4990530706925
0.208383505836363
1.45763279465325e-224
SPG7;SPG7
cg02075410
43.1724795598899
0.251300196532306
1.48710067478744e-222
LRBA;MAB21L2 ;MAB21L2
cgl4789818
42.7483230306733
0.467780803826933
6.15 266796650162e-220
cg20699586
41.0140564319255
0.478504040046711
3.78182448876408e-209
cg08943107
40.6646060097964
0.201308221731291
5.86792274759529e-207
MACF1;MACF1
cgl3531667
-40.6124492505219
-0.250983187790336
1.24720 8230673 02e-206
MCC
cg09325711
-39.5878848652573
-0.1917784357526
3.5707011190700 le-200
RALA
cg25386676
39.5836751043877
0.320829958283862
3.7964456294357e-200
cg05336395
38.9069542545006
0.389234087288719
7.39282027951585e-196
PCDH8;PCDH8
cg03286774
38.8088910677529
0.200475362496636
3.10425858420544e-195
SPG7;SPG7
cgO1772014
-38.0001437232442
-0.176642348366363
4.42401243 84645e-190
C20orfl60
cg08566455
37.6596118454676
0.551510952759785
6.66012821873494e-188
cgl4823851
37.3486068559556
0.323840073250382
6.54793941303481e-186
TBX4
cg03663556
-36.175027895587
-0.288496717528049
2.32295643749365e-178
cg09464735
35.5410895061832
0.220981799020792
2.905054178143e-174
cgl3394216
35.2816000491821
0.223838553032839
1.39229485202496e-172
GMDS
cg03177025
-35.2735593413643
-0.175471685640618
1.569776895301e-172
BRE;BRE;BRE;BRE;RBKS;BRE;LOC 10030 2650
cgO1839430
-35.2563424979422
-0.167266857818171
2.02962398291855e-172
ATIC
cgl7701921
35.2201669145247
0.159768081199215
3.48246908899358e-172
CDC34
cg05945615
-34.862335201787
-0.086256471197359
7.29702382397104e-170
SH3BP1
cgOO129232
34.6482705855197
0.194790763775366
1.79245462404266e-168
ST ARD3; STARD3; STARD3
cg25351606
34.623591517771
0.39567749662279
2.59304913519603e-168
cg02174232
-34.4636261094903
-0.156925135252835
2.84205627386401e-167
АРЕН
cgl0707788
34.3643587007104
0.256447460437565
1.25668140542093e-l 66
GMDS
cgl5628956
-34.1877862435497
-0.134809854955896
1.77082688568409e-165
TENC1 ;TENC 1 ;TENC 1
cg07195577
-34.1676216933338
-0.17590566347358
2.39570908108853e-165
TLCD1;TLCD1
cg15938260
34.0781485451288
0.284764085807831
9.16139966498101e-165
TBCD
cg23413697
-34.0320783641018
-0.194932010934781
1.82802294603043e-164
cg23209302
33.6020399605075
0.170832216584055
1.16092270310685e-l 61
CCNL2;CCNL2;CCNL2;CCNL2
cg02580005
33.2063559973266
0.215267912830955
4.43782264670949e-159
LRBA;MAB21L2
cg23023126
33.0780217262848
0.234809927942776
3.05759035959582e-158
MIER2
cg23746497
32.9713494244524
0.442376118827722
1.52172293083188e-157
cg01280080
-32.9242500824801
-0.233176530371585
3.09121875248342e-157
ATIC
cg27616751
32.8881454402486
0.196059494134073
5.32230762430268e-157
FIS1
cg04864807
32.7509753012977
0.536673371164181
4.19576856185448e-156
cg01552919
32.7237294433446
0.238463428340874
6.32355700347545e-156
GAK
cg26521404
32.6458446068087
0.481360829049637
2.04308655304138e-155
HOXA9
cg25774643
32.6145822392402
0.560527549415833
3.27154976685005e-155
SCT
cgl9211880
32.2540398197325
0.283408672612201
7.48005405814547e-153
AMOTL2
cgl2433486
-32.2333605358463
-0.22377491406864
1.02158239341364e-152
PKM2;PKM2;PKM2
cg06525280
-32.0688560788805
-0.216858891828279
1.21994639458203e-151
ATIC
cg06962177
32.0394837083248
0.543595122419031
1.8997167444945e-151
cg24035245
31.9597990109748
0.440126483835943
6.31781400810054e-151
cg25602159
-31.8811320708151
-0.110228692485176
2.06944874066721e-150
ADCK4;ITPKC;ADCK4
cg00310375
-31.871951865708
-0.123461392437625
2.37679665460738e-150
cg06491116
-31.8632216513985
-0.112475120393182
2.71133077612723e-150
MPZL3
cg08328160
31.8469575314678
0.17834756379272
3.46520503843605e-150
AGER;AGER
cg05696153
31.8263810085006
0.188815521745608
4.72639812773351e-150
CMIP;CMIP
cg04834502
-31.8203773688887
-0.135877669986187
5.17442838355374e-150
N4BP1
cg04549287
31.8087729432599
0.191943459600774
6.16436640309819e-150
THSD1;THSD1
cgl6768018
31.7493573531895
0.476206256208943
1.51067632087547e-149
ZIC4;ZIC4;ZIC4;ZIC4;ZIC4
cg24586978
31.6798325225869
0.3021703451981
4.31258117992376e-149
DOCK9;DOCK9;DOCK9;DOCK9
cg26993251
-31.4857308590565
-0.122908943259586
8.06976038897683e-148
MACROD1
cg03517024
31.4604084723399
0.215566709626287
1.18262662660156e-147
TRAF7
cg07450698
31.3920436201255
0.222006781775515
3.31897996424706e-147
TBCD
cg25588852
-31.3479452932013
-0.166793453130813
6.4581336949206e-147
MREG
cgl3153865
-31.3031333947266
-0.107349964988116
1.27029362395288e-146
OSGIN2;OSGIN2;OSGIN2
cg08171483
31.2745179341201
0.203874099875352
1.95669052042891e-146
CTDSPL;CTDSPL;MIR26A1
cg01059331
31.2732193819178
0.268657672288356
1.995429032964 8e-146
cg09479241
-31.2362608637736
-0.194396787921821
3.48630738096344e-146
TLCD1;TLCD1
cg24251800
31.164218980245
0.17090952899208
1.03456816013677e-145
cg07883457
31.0159887288742
0.245807224870301
9.70173772622603e-145
cgl4754787
30.9053376411184
0.46384037808464
5.15924996536649e-144
LHX1
cg06783737
30.8018114805016
0.533657915821956
2.46407223126108e-143
cgl5672768
30.7869142420846
0.367940494321671
3.08584694954473e-143
PCDHGA4;PCDHGA2;PCDHGB2;PCDHGA 1 ;PCDHGB 1 ;PCDHGA3 ;PCDHGB2
cg09317554
30.6962725892614
0.223974038493306
1.21331929718633e-142
LRBA;MAB21L2
cg03964958
30.6752896207181
0.399659355734893
1.66581335507289e-142
HOXD12
cgl9069882
-30.6601980233081
-0.147229601520218
2.09233113139607e-142
MPZL3
cgl1563680
30.6505798396593
0.379590306544365
2.41951430494553e-142
cg20906291
30.646834590387
0.329039524742423
2.56034266909224e-142
cgl8675097
30.6256320306278
0.40728560999834
3.5269060067798e-142
NKAPL;NKAPL
cg01399319
30.6230670759927
0.131472605476598
3.66624045353459e-142
CCNL2;CCNL2;CCNL2;CCNL2
cg!5105326
30.6131498035839
0.30466290706874
4.2587502432825e-142
ZIC4;ZIC4;ZIC4;ZIC4;ZIC4
cg08443563
-30.3689670998091
-0.338199466851754
1.70336887114586e-140
cg06024289
-30.3613642278358
-0.0931750722416427
1.9106962164483e-140
KRT18;KRT18
cg07961632
-30.3241584326472
-0.178655046917449
3.35198971540068e-140
SYTL1
cg26319363
30.2961994554443
0.190581136833356
5.11382376984454e-140
PCGF3
cgl3014333
-30.2845936496127
-0.168329368846094
6.09387453702532e-140
VARS
cgl3283952
30.282941407814
0.464306420986787
6.24790149092617e-140
cg26908825
30.2101097207601
0.18209467558494
1.87758300533592e-139
GMDS
cg09496762
-30.1868536424465
-0.101527047380666
2.66801551439127e-139
cg03738025
30.1472371409965
0.487491952186808
4.8542612209181e-139
cgl1302791
30.1193394067537
0.20327497907103
7.3989161297819e-139
PINX1
cg08491487
30.0509648314833
0.366218720749433
2.07870499868939e-138
RNF39;RNF39
cg07452625
30.0224475672278
0.161260988796476
3.19817409381668e-138
SPG7;SPG7
cg03915012
29.998263602443
0.184381008703549
4.60870595730428e-138
GAK
cgl3382100
-29.9889532763176
-0.115768206708092
5.30476556291043e-138
PUS1;PUS1;PUS1
cg09887059
29.9638525669243
0.488808446826414
7.75099251568685e-138
cg21870038
-29.9434181689268
-0.163279003624625
1.05543443960707e-137
RFFL;RFFL;RFFL
cg08722200
29.7751356318626
0.197036011873264
1.34134040089396e-136
cg08139247
29.7748247186889
0.324950017138526
1.34765542341373e-136
CLEC14A;CLEC14A
cg22270027
29.7597610238007
0.312153562570759
1.69203506637373e-136
cgl0659886
29.7279158982469
0.314906429781818
2.73739931931197e-136
ZSCAN18;ZSCAN18
cgl7276002
-29.7034342996286
-0.198487933412634
3.96236546472636e-136
ANXA7;ANXA7
cg02597246
29.6592850484077
0.234040981056107
7.71968812184923e-136
CMIP;CMIP
cg06972019
-29.641401665646
-0.214291237867499
1.01140128289557e-135
ENOl
cg06029935
-29.6039606686048
-0.186613641592634
1.78053734506875e-135
PLEC1;PLEC1
cgl6919569
29.5314332565169
0.383651843614408
5.32529681352267e-135
NBLA00301 ;HAND2
cg07004744
29.4948820773882
0.239179286390657
9.24948579143744e-l 35
ERICH 1
Злокачественная опухоль поджелудочной железы
cg24748548
10.876926634944
0.502467918066604
8.920894899725 84e-22
cg20157572
10.8473693396081
0.497154795274002
1.0901430048017e-21
DCUN1D2
cg27324804
10.7176157545963
0.110441233709022
2.62480228623554e-21
CUX1;CUX1;CUX1
cgl0858686
10.0183494856111
0.435887035131395
2.85403345721393e-19
SORCS2
cgl1964578
9.76222260678036
0.4886942206199
1.55416857589136e-18
LMNB2
cg02396020
9.69412735441034
0.45981295110368
2.4332233493978e-18
cgl8736168
9.64871288746107
0.421456658215597
3.27927017865414e-18
HDGF2;HDGF2
cg07077277
9.33714475208013
0.261190444081113
2.50807448119758e-17
HIST 1 H2AA;HIST 1H2BA
cgl3682223
-9.30250372661071
-0.208415120000779
3.14018418705022e-17
HYAL3;NAT6
cg02564175
9.05997864227821
0.214642030164514
1.50194212630964e-16
cg00763315
8.93785016517477
0.450136464628692
3.28373038934644e-16
NCRNA00182;MIR374B;MIR421
cg02708922
8.57925462404981
0.0938895304575148
3.18559567956016e-15
ADI1
cg23942526
8.54929499651289
0.201382613573337
3.84487111565422e-15
JAZF1
cg27529346
8.48184619117641
0.443158129073166
5.8661126973557e-15
HLA-B
cgl7902007
8.45920172875149
0.149442048172008
6.75781702120952e-15
A2LD1
cg22789318
8.45065971295339
0.186806743028766
7.12804904179683e-15
ABR;ABR;ABR
cg01289769
8.4390049049404
0.293673720404533
7.66584255055063e-15
ZNF148
cg08858649
8.42298221491452
0.358653872277243
8.47143535799456e-15
TRIM 15
cgl0277836
8.40096280492132
0.253562962594049
9.7171208648939e-15
SLC30A6
cgl1903177
8.38103122022852
0.217186928860068
L1000444602494e-14
MED9
cgl5485247
8.35360718669386
0.126424373531442
1.30449472818035e-14
ABR;ABR;ABR
cgl3283691
-8.32864111664935
-0.172190362496808
1.52316200075668e-14
cg24288527
8.29598671699935
0.266572598721667
1.86483919898801e-14
PPP1R3C
cg00228281
8.27883780592001
0.166176237852898
2.07366813444726e-14
GRB 10;GRB10;GRB10
cg27226147
8.26741836817315
0.38499203594354
2.2254206741098e-14
cgl4037652
8.21647267803407
0.231334314429353
3.04804586391642e-14
PPP1R3C
cg02229757
-8.14613564334794
-0.211453423561079
4.6989237084009e-14
cg05757474
8.14251773180924
0.216137649303584
4.80449067761014e-14
MACROD1
cg22424284
8.11043807150333
0.338552820422463
5.84948306903359e-14
FAM46C
cg00132509
8.08481564356487
0.261888210370785
6.84339536784927e-14
SLC22A23;SLC22A23
cg00733324
8.03024784105445
0.215561902099595
9.5517801491726e-14
EIF2S1
cgl9240319
7.97650093813682
0.179370767793281
1.32516053541479e-13
cgl4001664
7.96695962686845
0.31654737189174
1.40430782276722e-13
cg02747390
7.96593920576003
0.164732371887772
1.41304466604105e-13
SRPK2
cg03256198
7.94616365628383
0.275826624883829
1.59339868722407e-13
GALNT2
cg00690554
7.92856779018925
0.237137714643411
1.77292774667082e-13
ZFYVE21
cgl4156751
7.90778986663778
0.30176540539352
2.01084857497174e-13
cgl3580196
7.89844799084456
0.24134519765218
2.12787031379173e-13
PDE8A;PDE8A
cg04051396
7.88299902660004
0.260168791328223
2.33636014096286e-13
PLEKHG7
cg25397945
7.85211625027355
0.379190163685361
2.81562202338047e-13
ZNF529;ZNF529;ZNF529;ZNF382;ZNF529; ZNF529
cg27015161
7.84651538778348
0.192579771780324
2.9124213520565e-13
NCOA1 ;NCOA 1 ;NCOA 1
cg09326087
7.80999218910263
0.221017697941033
3.62958242914258e-13
CABC1
cg02386420
-7.80641525978118
-0.177682573651122
3.70858203886119e-13
RPTOR;RPTOR
ch.l.3056292F
-7.79961139724736
-0.0838892987081369
3.86357699232609e-13
CCT3;CCT3;CCT3
cgl6855929
7.78748355625777
0.274741566038735
4.15591353227943e-13
EGLN1
cgl9163395
-7.78697257594082
-0.349686465202603
4.16869971298572e-13
HDAC5;HDAC5
cg03544320
7.7711904853663
0.391874310767393
4.58336721786216e-13
CRMP1
cg20989443
7.77047384014319
0.215631071166015
4.60313590554025e-13
GALNT2
cgl4473102
7.76485970734245
0.39844183053159
4.76094937479144e-13
HOXD8
cg07675334
-7.7597377576151
-0.201975917843174
4.90959133439561e-13
MAZ;MAZ
cg26099837
7.75565621684185
0.109612437308457
5.031319607517e-13
АКТ 1; АКТ 1; АКТ 1
cg23811057
-7.73514636676316
-0.257585816594137
5.68969700540066e-13
cg01058717
7.73456976646418
0.194387317881353
5.709388367672 le-13
SSU72
cgl6583088
7.73443982062353
0.236624266410546
5.71383542336003e-13
cgl8422423
7.73317565324604
0.216733675769513
5.75727746545371e-13
RAD54L2
cgl7927493
7.71975097485417
0.202493004149458
6.23925157840507e-13
SEL1L
cg05784193
7.71931807296456
0.263796127334509
6.25544057541293e-13
cgl8354248
7.70973135063042
0.177054933171031
6.62479230312423e-13
PPP1R3C
cg01385836
7.70867324497751
0.143218736562951
6.66685752040397e-13
ORMDL1; ORMDL1
cgl9728601
-7.69428766927037
-0.0968945773741529
7.26566870220514e-13
GJC3
cgl5834072
7.68327323961855
0.296538516365375
7.75984092587261e-13
DCHS2;DCHS2
cg09194815
7.68007173417184
0.218021267847172
7.9096156515383e-13
PCCA;PCCA
cg07037852
7.67940982516604
0.2484640432123
7.94093633350853e-13
cg09641127
7.65872506322656
0.301371630243591
8.98400854941535e-13
KLF11
cg02148562
7.65678670560492
0.266969753575067
9.08843551911661e-13
cg07877257
7.64422774959783
0.263172522613008
9.794730728681 le-13
cg02209075
7.64348849590243
0.121865320776882
9.83795659329992e-13
HIC2
cgl8466420
7.64266501997519
0.200260956309092
9.88632927586753e-13
ERP27
cg04588455
-7.63995123693156
-0.219464940593604
1.0047413456491e-12
MAZ;MAZ
cg26650359
-7.63341505259323
-0.233076583100922
1.04461192695713e-12
R3HDM2
cgl8022344
7.62431281750507
0.16538532331032
1.10275398514487e-12
METTL9;IGSF6;METTL9
cg26997966
7.60939707196806
0.125085523498643
1.20502494528388e-12
RNF214;RNF214
cgl4928149
7.60022626783846
0.170287076673068
1.27250408499312e-12
RBM33
cgO1294808
7.57533709701558
0.292839028304656
1.47505124696838e-12
IRX1
cgl3114125
7.56290631605433
0.0799735485574017
1.58783540226695e-12
BRF1
cgl9962424
7.56120593375413
0.296639326835039
1.60391148391152e-12
cg02923485
-7.5500227988345
-0.265411700869749
1.71372452939779e-12
CAPN2;CAPN2
cgl8690385
7.53846122513456
0.214250050997344
1.835067548303 le-12
MOBKL2C;MOBKL2C
cgl2201110
7.52475719080665
0.147296509222481
1.98993393660628e-12
cgl9333201
7.52284389702812
0.161027330060883
2.01255909447537e-12
PRKG1;PRKG1
cg05336395
7.52267985184612
0.293014407761819
2.0145107622408e-12
PCDH8;PCDH8
cgl2904880
7.5145818191807
0.385517799653285
2.11321563871423e-12
TRIM 15
cgl6784745
7.51032404058962
0.247489161450218
2.16701476125653e-12
MIR148B;COPZl
cgO1383799
-7.48618518667648
-0.249854743693082
2.49861883969984e-12
MAZ;MAZ
cg03663556
-7.48513675963331
-0.292144979243432
2.51410559009842e-12
cg24613080
7.47969828863064
0.337850246524396
2.59597467529235e-12
ACCN1
cg20146541
7.47705725612639
0.36246099031453
2.63667691828791e-12
TRIM58
cg24709001
7.46871258651993
0.144577023082265
2.76947027948257e-12
HTT
cg20297544
-7.45986001569912
-0.211180353963636
2.91757401217763e-12
EPHB2;EPHB2
cgl3048147
7.4583957278939
0.206172199278162
2.94281480511081e-12
ATP5H;ATP5H;KCTD2
cg26034658
7.45356638187075
0.221742912298741
3.02760029363772e-12
PACS1
cg04210254
7.45012838819408
0.246730087164741
3.08942522249094e-12
CELA3A
cg05305413
7.44950116380382
0.158972835529912
3.10083831135511e-12
CELA3A
cg08712082
7.44767470148312
0.19729734601105
3.13431079222945e-12
GARS
cg06876872
7.44220536156056
0.183878262998406
3.23669420049882e-12
ARL8A
cgl4023291
7.4239037013934
0.197074610615438
3.60391838300890e-12
TTLL11
cg05037270
7.4214711380203
0.188813721616941
3.65572919754224e-12
EIF4G3
cg07187971
7.41132292115514
0.207476925123494
3.87993094810114e-12
PHLPP1
cg05834895
7.40794983343195
0.406801270819574
3.95741854825375e-12
LMOD3
cgl4754787
7.40301986459384
0.360089281679965
4.07342916862779e-12
LHX1
Феохромоцитома и параганглиома
cgO1022974
-23.7644396067065
-0.563944057100413
2.12165124538845e-57
TRIM2
cgl3966609
20.0525363037273
0.114281765098129
9.49354890055815e-48
DSC AML 1
cg03905413
-19.0775976041127
-0.216473918891258
4.30192895620467e-15
cg00349895
-19.0090856899751
-0.557929304900766
6.6393437834963e-45
TRIM2
cg23049847
-18.7305750532075
-0.198315187917113
3.89601166883805e-44
CRMP1;CRMP1
cgl5802555
-18.7262856915055
-0.196756602321208
4.00392017785009e-44
MPP2;MPP2
cg01191815
18.3433988584953
0.463461973746453
4.62560625570327e-13
TLN2
eg18588504
-18.1323892320091
-0.204238397648226
1.79376708711645e^42
STARD9
cg05300184
17.8161796408115
0.419512485164187
1.37921125650062e~41
cg09308026
-17.5525749475331
-0.414132156816056
7.61254941436441e-ll
FAM57B;FAM57B
cg04770433
17.3436656426444
0.297165471039214
2.962294661673 98e-40
NCOR2;NCOR2
cgl8549292
-17.2493837069445
-0.334723473361261
5.47705012215413e-10
eg18784943
-17.1377149175496
-0.294691000748522
1.13544297603968e-39
cg20381798
-17.0643655841741
-0.386243895447803
1.83405778249139e-39
SHH
cg17108838
-16.8185640977139
-0.207935903269244
9.18002055614181e-39
ADM
cg02760939
-16.5897015259282
-0.171892834621615
4.13223487031992e-38
MPP2
cg04367486
-16.5356045733577
-0.544575436747673
5.9007282811017e-38
CD200;CD200;CD200;CD200
cgl7838182
16.324345517824
0.488149674982759
2.37762075082441e-37
CANT 1 ;CANT 1 ;CANT 1
cg24604988
16.2065400210073
0.46290635391055
5.1800402702735e-37
CHMP4B
cg03557733
-16.0830506945384
-0.219387301922702
1.17314839868847e-36
MPP2
cg27188703
-15.940850743837
-0.351226901617455
3.01157942556308e-36
FAIM2;FAIM2
cg01029590
15.937936024197
0.4393788608072
3.07039095610747e-3 6
FDFT1
cg23561934
-15.9074513631696
-0.29538776924928
3.75887412673547e-36
cgl7693013
15.9019248563822
0.456890438600101
3.89932727861232e-36
NCRNA00171
cgl0944379
15.8995582536195
0.480711797634655
3.96106954724654e-36
CCNY;CCNY
cgl8479798
15.8703326430047
0.294337533823592
4.80931153123052e-36
SF1;SF1;SF1
cgl2378722
-15.8466721991639
-0.092906703460184
5.62763996970096e-36
cg06873452
-15.8086157212483
-0.275275224507927
7.24650826818117e-36
cg13441983
-15.7988972360915
-0.137673306940648
7.72994314827733e-36
ADM
cg27351813
-15.7574891077807
-0.237780761951127
1.01791782865495e-35
SHANK1
cg06422108
-15.746613596318
-0.304418282507416
1.09425046481775e-35
ZEB1 ;ZEB 1 ;ZEB 1 ;ZEB 1 ;ZEB 1 ;ZEB 1
cg20982476
-15.5962299468081
-0.16171776868387
2.97665494273307e-35
HBXIP
cgO1004056
-15.5358151162261
-0.464121799846854
4.45160041021192e-3 5
cgl3520026
-15.4555852797378
-0.307562388538338
7.5996271836802e-35
C9orf3
cg24561348
15.4159994440418
0.487589069417648
9.89612007743217e-35
SERINC3;SERINC3
cgl6448037
15.3997438434629
0.471620979404653
1.10297801921398e-34
EIF4EBP2
cg21096141
15.261585554694
0.446510683951951
2.77446128979954e-34
SCD5;SCD5
cg25556690
-15.2403343885519
-0.238485625995774
3.19774918044078e-34
cg09234297
15.1957818038823
0.578146433798543
4.30688012935887e-34
IRF2
cgl5266705
-15.1650620504774
-0.286169127097379
5.2888257061307e-34
cgl5855170
-15.1604589796962
-0.200206490326986
5.45414346011742e-34
cg07363543
-15.114004861021
-0.371800593603974
7.4414664453035 le-34
cgl4001992
-15.0780863286228
-0.426431558474026
9.46291015568712e-34
TRIM2
cg20929387
15.0709150685097
0.428676216096068
9.92808577398498e-34
AFAP1 ;AFAP 1 ;LOC84740
cgl3407601
14.9794529491888
0.50883906681788
1.83136752085486e-33
EHMT1;EHMT1
cg25052374
14.9730804681765
0.573240114406066
1.91121538869991e-33
CANT 1 ;CANT 1 ;CANT 1
cgl8941211
14.9720665973905
0.51411269715841
1.92423684080119e-33
SOAT1
cgl4131555
14.9496034734978
0.448303823054829
2.23665816208914e-33
LAMP1
cgl4769121
14.9122650340067
0.450867430130186
2.87233766627393e-33
SMURF1;SMURF1
cg09006015
-14.9121704335701
-0.363569089493721
2.87415888298796e-33
CD200;CD200
cgO1979157
-14.8995736374419
-0.125892703177674
3.12728958472285e-33
SKI
cg05354171
-14.8820409917483
-0.251998720506272
3.51718195299209e-33
FAM20C
cg09914182
14.8668093394086
0.38989672477095
3.89520455033381c-33
MICALL2
cgl7639265
-14.8579256753606
-0.183841375111208
4.134192242845 le-33
SRPK1
cg21770622
-14.8546717447961
-0.41058057218241
4.22535601237614e-33
DGKZ;DGKZ;DGKZ;DGKZ
cg24712249
-14.8134827173744
-0.164911640819404
5.56916228584654e-33
SYT11
cgl0281478
-14.7984305382559
-0.334191472908325
6.1606283011441 le-33
DYNC111 ;DYNC 111 ;DYNC 111
cg03329165
-14.7681995530124
-0.3740687701283
7.54533199351423e-33
CD200;CD200
cg07251099
-14.7545397980496
-0.446976290625205
8.26934523454933e-33
CD200;CD200
cg25166006
14.7339093208767
0.225438011100558
9.49681133481676e-33
cg27324804
14.698228843276
0.512148634747529
1.206570738923 le-32
CUX1;CUX1;CUX1
cgl3849495
14.6930088168839
0.390628466543228
1.24958664896169e-32
RAD23B
cg04663790
-14.6871962544601
-0.385381601644766
1.29929427035561e-32
cg26493193
14.6559167600984
0.487663395781124
1.60282204952904e-32
HDAC4
cg06223466
-14.6443422209998
-0.235488006706092
1.73232424166179e-32
RADIL
cgl1694223
14.6325775670162
0.495643305494672
1.87469207498391e-32
CLU
cg03470207
-14.6138673704071
-0.273742543587657
2.12562375270943e-32
cg21109167
-14.6008555184203
-0.496543401874165
2.31969623855773e-32
MLH1 ;MLH 1 ;MLH 1 ;EPM2 AIP1 ;MLH 1
cgl6115588
-14.5960584614289
-0.246139592584288
2.39563656366708e-32
FAIM2;FAIM2
cg09311630
-14.5766636033323
-0.158686037114817
2.72889701705991e-32
ch.l2.4168779F
-14.5605365758439
-0.18341092671186
3.04107978003094e-32
cg00651401
-14.529438355745
-0.186222204579106
3.74758093865419e-32
TNK2;TNK2
cg21365287
14.5209739311724
0.588816640907648
3.96686467430789e-32
PPP2R2D;PPP2R2D;PPP2R2D
cg00381131
-14.4953657610303
-0.298494632292359
4.71162987874964e-32
TRIM2
cg26017564
14.4836820204629
0.460050348419932
5.09644958160415e-32
FNDC3B;FNDC3B
cgl8616091
-14.4525914411412
-0.436404476541397
6.28073593048659e-32
MPP2
cgl1447335
14.4519029207963
0.273386334017055
6.30986803126761e-32
BRD9;BRD9;BRD9
cg26253438
-14.442091205
-0.189162370280223
6.74001472518487e-32
ATP2B4;ATP2B4
cgl1746341
14.4202904988701
0.448161011647677
7.80374798950925e-32
PLEKHA2
cg21104798
14.396150397204
0.393670335419159
9.17876191236069e-32
CRLF1
cg06223736
14.3894729714037
0.453658070173279
9.60022878200023e-32
HDAC4
cgl2892054
14.3838229382241
0.463241882244223
9.97194162572114e-32
PHF3
cgl4368691
14.2991899498989
0.311899082171506
1.76184889279978e-31
CNNM2;CNNM2
cg00786138
14.2909197374752
0.207490475581119
1.86264230141703e-31
RERE;RERE;RERE
cg04726821
-14.2143855352881
-0.562082567755972
3.11720625316644e-31
MLH 1 ;MLH 1 ;MLH 1 ;EPM2 AIP 1 ;MLH 1
cg20143982
-14.1976149395527
-0.199747166395577
3.48964245900749е-31
РЕХ5;РЕХ5;РЕХ5;РЕХ5
cg14230238
-14.1715721835309
-0.416732021630399
4.15818320338418е-31
RFX2;RFX2
cgl0606269
14.1582994356165
0.479503549781188
4.54677215168543е-31
cgl2719510
-14.1483834577265
-0.342560691733441
4.86061909785725е-31
ADAM 15; ADAM 15; AD AM 15; AD AM 15; AD AM15;ADAM15
cgl3710586
14.1375183375474
0.398310910481215
5.22945191994057е-31
RALGAPA1 ;RALGAPA1
cg05409391
14.1364353496933
0.433295221303744
5.26771673327873е-31
LSP1
cgl3957113
14.1351891183936
0.40025024433514
5.31209619928456е-31
ROR2
cg24789596
-14.1214483152774
-0.29722098247544
5.82693608504559е-31
cg01031032
-14.0770814742257
-0.502007161695103
7.85548024708575е-31
CD200;CD200
cg07562821
-14.0377460839966
-0.3246407280629
1.02379410582067е-30
MAPI A
cg23568341
-14.0203158782602
-0.353154746039169
1.15131602738065е-30
ABR;ABR;ABR
cgl3445608
-13.9842944824409
-0.431352243221007
1.46745 540996169е-30
cgl7552029
-13.9781207387676
-0.341543002677596
1.52976902565208е-30
MPP2
cg02155796
-13.9614329863951
-0.371290725984639
1.71177623205334е-30
CRIP2
cg26216857
13.9534329437366
0.444022317923438
1.80656120995477е-30
TMEM50A
Злокачественна
я опухоль предста
тельной железы
cg23119604
23.1142267537722
0.285221601548098
4.59511003284204е-83
HLA-L
cg24033558
22.6672002321667
0.48078974717753
8.71735908463361е-81
SHF
cg08879910
21.2754321327747
0.460371725225109
1.04776548513362е-73
HLA-J;NCRNA00171
cgl8004701
21.0319305258372
0.354096704581173
1.80077647136369е-72
PTPRN2;PTPRN2;PTPRN2
cg27134365
20.8002574819599
0.364378171083158
2.68712221339074е-71
DHRS4L2
cgl8713646
20.7542669339314
0.30785346146619
4.59343394042092е-71
HLA-J;NCRNA00171
cgl7397631
20.6336947398412
0.438667730242647
1.87200343470728e-70
CPLX1
cg08163199
20.6275045899288
0.476896006467487
2.01196798543704e-70
HLA-J;NCRNA00171
cgl8582992
20.5416550090811
0.434842981538284
5.46755327763135e-70
SHF
cg04978107
20.4483847189153
0.386375386252431
1.61895383230669e-69
DHRS4L2
cg25318809
20.3717846379444
0.461790334949304
3.94644107243795e-69
HLA-J;NCRNA00171
cg26206183
20.3367361628305
0.369026964771764
5.93198521582026e-69
DHRS4L2
cg00817367
20.2271118910851
0.532415376463188
2.12095405909756e-68
GRASP
cg08901662
20.2167328612079
0.546970689425489
2.39275381160363e-68
cgll716106
20.1095234790917
0.417336093529433
8.30980358426075e-68
cg02125316
20.0854874157838
0.321070650003851
1.09838653553031e-67
FGF18
cg09296001
20.0101768880481
0.495867291918432
2.63179190815788e-67
SND1
cg24922143
19.9070203382454
0.481915291750611
8.70390104045908e-67
cg23483840
19.9067349824268
0.338719625230568
8.73273588012969e-67
HLA-J;NCRNA00171
cg06409824
19.8792174304455
0.205345416132994
1.20129254628312e-66
HLA-L
cgl2628196
19.7582207152069
0.418521903084745
4.8783574211336e-66
SND1;LRRC4
cg08300419
19.7525360221281
0.384750091958643
5.21018738459099e-66
PACSIN3
cg07519235
19.7236526041125
0.485014780000878
7.2785266879907e-66
GPRC5B
cgO1030534
19.5855757613815
0.535381062646447
3.59443927621633e-65
FAM115A
cg24847366
19.571676613508
0.265855305815414
4.22088344542156e-65
cg07198194
19.5644235007274
0.448455506328971
4.58996946826425e-65
PFKP
cg08325845
19.552985200328
0.426143489652888
5.23864180257782e-65
HLA-J;NCRNA00171
cg25720815
19.5507731406405
0.372186868426513
5.37428104410824e-65
HLA-J;NCRNA00171
cgO1934626
19.5217071025307
0.4340945261811
7.51923779543485e-65
SCGB3A1
cg!6794576
19.5177449911001
0.435964045768851
7.87141414343387e-65
HLA-J;NCRNA00171
cg06733794
19.4757962122136
0.401852211373471
1.27784171243671e-64
TACC2;TACC2;TACC2;TACC2
cg21013866
19.4479995755721
0.385843802095836
1.76143585580162e-64
EFS;EFS
cg04879832
19.4245637854314
0.418003925543704
2.30866487803978e-64
CYBA;CYBA
cgl3247663
19.3815313625881
0.452321049688371
3.79345551833305e-64
FAM110B
cg08862890
19.3276914632272
0.501804016946572
7.05914411159531e-64
D0CK2
cg08843517
19.3184837581813
0.512879732148942
7.849920204954 82e-64
CYBA
cgl4781281
19.3181838531103
0.380705243357602
7.87711400604837e-64
HLA-J;NCRNA00171
cg00970396
19.3154634566768
0.465117026739917
8.12812466024554e-64
cgl2433395
19.2677023929345
0.327762785533355
1.40964700735234e-63
NUAK1 ;NUAK 1
cg26250609
19.2413760098739
0.290132974118187
1.90927402006744e-63
GSTP1;GSTP1
cg04207084
19.1521427918
0.352455277980499
5.33588021353019e-63
PTPRN2;PTPRN2;PTPRN2
cg26075747
19.1500795443372
0.244649167653066
5.46413676156681e-63
HLA-E
cgl5267232
19.1365947346877
0.455887540754496
6.38168572896352e-63
GATA3;GATA3
cg26537639
19.1147664565599
0.39293272766222
8.204284575949e-63
CYBA
cg08535928
19.1143098958548
0.428280044711042
8.24750343909488e-63
LOC 149134
cg23855505
19.0423373964361
0.508774332870296
1.8875174260956e-62
CHST11
cg09087503
19.0268104762028
0.319404340493135
2.25645601947873e-62
SND1;LRRC4
cgl3011388
19.0134090149478
0.361655437887266
2.6323208863288e-62
EFS;EFS
cg22473620
19.0133556706087
0.509058129330246
2.63393560488022e-62
cg03596016
19.0019654523766
0.519194302835697
3.00239439792325e-62
LOC 149134
cg25888561
18.9263300700569
0.387254400902094
7.1594894097773 le-62
cgl6755500
18.922275276884
0.441078466115111
7.50078077044446e-62
cgl2615766
18.8761970855854
0.341439267199468
1.27312703470142e-61
FAM110B
cgl4736058
18.8752444362794
0.405487600301259
1.28712530807576e-61
PROM 1 ;PROM 1 ;PROM 1
cg05415131
18.8633217679537
0.499300978614384
1.47588589142153e-61
DTX4
cg22859061
18.837186778156
0.409311987128681
1.9920615314507e-61
SCGB3A1
cg00929635
18.81721375309
0.332579974606356
2.50505702294354e-61
DBNDD2;DBNDD2;DBNDD2;DBNDD2;SY S1 -DBNDD2;DBNDD2;DBNDD2
cgl4117138
18.8045888848604
0.546254293881629
2.89540361860427e-61
HIF3A
cgl3555354
18.7736925091369
0.418256501952953
4.12651600243052e-61
DHRS4L2
cgl4001664
18.7396509681442
0.350871210668924
6.09620607478608e-61
cgl5726260
18.7264557341654
0.407394716095873
7.09144160585841e-61
HLA-J;NCRNA00171
cg21286782
18.6896892038482
0.315331022406595
1.0806253823956e-60
F AM 19 A3 ;F AM 19 A3
cgl3338877
18.6784576586607
0.293147567051296
1.22898019540243e-60
HLA-J;NCRNA00171
cg22178238
18.6767332999172
0.440043352800654
1.253492718475 86e-60
PTPRN2;PTPRN2;PTPRN2
cg08857994
18.6598745993149
0.326016333028527
1.52043418901628e-60
cgl2162377
18.654724476757
0.419709002794717
1.61279134247554e-60
B3GNT7
cgl7759274
18.6259860023412
0.39565709110649
2.24109675476679e-60
cgl4088357
18.6049559562259
0.386355088353459
2.85093588104042e-60
Hff3A;HIF3A
cg09500443
18.5799070379847
0.295930748304081
3.79712987022275e-60
SCGB3A1;SCGB3A1
cg24375409
18.5525921831205
0.428336685690433
5.18967765846525e-60
EPHA10
eg18844382
18.4781600028808
0.446230508620651
1.21520697938405e-59
EFS;EFS
cgl9023309
18.4729307914829
0.423114656719008
1.29002291970662e-59
cg08965276
18.4728415565572
0.242966676222614
1.29133877756979e-59
SOX8
cgl7403609
18.4618206826329
0.397319007976362
1.46460280458978e-59
FLT4;FLT4
cg05157171
18.4435238294911
0.237796521076873
1.8050223479422e-59
HLA-A
cgl9943330
18.443451011742
0.292684964920316
1.80652409837433e-59
DHRS4L1
cg20927242
18.4250038294412
0.355718011601894
2.23013541776673e-59
HLA-F;HLA-F;HLA-F
cgl9759135
18.4191319735227
0.394863168668594
2.3847775091697e-59
LTC4S;LTC4S
cg01940855
18.4015843474916
0.430790063026685
2.91372197372824e-59
CHST11
cgl2539796
18.3857720117035
0.586613985321341
3.4900242402565e-59
C5orf49
cg21908235
18.3636706753531
0.40253794023185
4.49113976903267e-59
cg07153010
18.3344551054526
0.403520429064349
6.26749060654859e-59
cg06928838
18.3315278441292
0.417021166304624
6.48026384314416e-5 9
GSTP1
cgl8349298
18.301513666398
0.357395732919765
9.12481907841713e-59
RARRES1 ;RARRES 1
cgl1867546
18.2888225351135
0.377282880207809
1.0545180663679 le-5 8
HLA-J;NCRNA00171
cgl1448068
18.2071829029578
0.382948204754607
2.67286806687342e-58
C2orf88;C2orf88;C2orf88;C2orf88
cg22399133
18.1929215247765
0.526290942447326
3.14407691354398e-58
CRYGD;CRYGD
cg05063999
18.1553287748742
0.428707861004941
4.82288612432526e-58
cg00489401
18.1097143244405
0.357951307711893
8.1029772465302e-58
FLT4;FLT4
cg05745631
18.109410049446
0.419562833965584
8.13106224533074e-58
cgl4329059
18.1023748291502
0.430328275047335
8.80823891778246e-58
DTX4
cgl7588266
18.0993573655438
0.374893150271439
9.11568080638904e-58
CYP11A1 ;CYP11A1;CYP11A1
cgOO157477
18.0978007431978
0.417524390487816
9.2784485093956e-58
HLA-H
cg23026024
18.0944921311418
0.362188101832536
9.63411897624218e-5 8
HLA-J;NCRNA00171
cg24826644
18.0855892309053
0.202316622541158
1.06602505287176e-57
HLA-E
cg22059073
18.0832648745172
0.292801752534588
1.09456698632732e-57
CECR6;CECR6
cgl5338327
18.0817286424128
0.339998681921961
1.11384882048056e-57
cg24938632
18.0587439659014
0.327935681187712
1.44635677697003e-57
cgl0069493
18.0549511643173
0.516716090466143
1.51005488877091e-57
ALOX5
cg01837657
18.0519541686301
0.440249695469708
1.56236346818996e-57
RHCG
Злокачественная опухоль прямой кишки
cg24974704
27.2855581509205
0.194453061042956
2.11206326851255e-18
ZC3H3
cg04659689
-23.4220124751005
-0.18201048829792
1.30181052549096e^2
cg08544002
22.3854095068441
0.187858714199327
6.05975435716722e-41
EXOC2
cg03301058
-22.1124308053654
-0.473150584849413
1.69948402003078e-40
GABRR2
cg21084119
21.3974875395347
0.112158228080927
2.63503770887919e-39
EXOC2
cg09296001
19.8499653686515
0.668261269176783
1.22155511600576e-36
SND1
cg21324456
-19.282828075757
-0.261563289039876
1.24592111712716e-35
ATP9A
cg03183540
-18.9604429675542
-0.269486091537888
4.7479084247893 le-35
cg05336982
-18.9571957296876
-0.230735738687783
4.81263755599566e-35
cg22882523
17.9899229046488
0.428242742206368
2.88197292744579e-33
OPLAH
cg09705456
17.4219415197743
0.0291167469951576
3.36688238767162e-32
MACROD1
cg09087503
17.2541490835603
0.471125184226734
7.01456934417443e-32
SND1;LRRC4
cg04456219
-17.1307750972708
-0.451245211324086
1.20608672124746e-31
cg00664697
-17.0947602598407
-0.417225565437296
1.41334225318659e-31
cg20765408
-16.9887072221652
-0.219168307732873
2.25663417659095e-31
PARP4
cg03130910
-16.7701677691134
-0.504208632398431
5.94527417106187e-31
cgl1209394
16.656916396009
0.321714011560788
9.84526738456283e-31
ZNF775
cgl9599827
16.5725477250335
0.256341761815072
1.43507910895481e-30
EXOC2
cg05309989
-16.5352706860445
-0.201696011164782
1.69553249192036e-30
cg27215236
16.511328928628
0.117370482947528
1.88740834640682e-30
TJNC84A;UNC84A
cg02853152
-16.5036636232575
-0.332359328847849
1.9533466323094e-30
cgl9453938
-16.4960943250469
-0.188487371076152
2.02073397695436e-30
cgl2593746
-16.4919001386965
-0.224069849458411
2.0590759688022e-30
cg22689909
-16.4446744503132
-0.338813366509508
2.54480985857836e-30
GLRX;GLPvX
cgl9017254
16.3212914898199
0.39086990103933
4.43149175390568e-30
TRPM4
cg09287864
-16.1567315005883
-0.457147300565301
9.31402507489159e-30
cg23804620
-16.1236859146072
-0.146373191279977
1.08167142494465e-29
cg07220152
-16.0094676096612
-0.395194549950717
1.81582599686757e-29
cgl7304678
15.95220433153
0.376574864627532
2.35578083973705e-29
RGMB
cg02520816
15.9509683510748
0.426309656260474
2.36906607661842e-29
ADCY9
cg23572908
15.9485584677002
0.514329748911867
2.3951864481018e-29
VIPR2
cg05649391
-15.934248706948
-0.456177105950737
2.55636722691887e-29
MYBPC3
cg27539480
15.803072807197
0.381427101878323
4.64961607720617e-29
HOXA3 ;HOXA3 ;HOXA3
cgl3327911
-15.714472410996
-0.359686822394318
6.97297560112744e-29
COL21A1
cgl7373442
15.7075065867039
0.487818279709504
7.199021686623e-29
CHST2
cg00269245
15.6009950977164
0.25723486407243
1.17342673402471e-28
NUP93
cgl3700197
15.5774995119662
0.181990343679864
1.30720624024535e-28
PTCH1 ;PTCH 1 ;PTCH 1 ;PTCH 1 ;PTCH 1 ;PTC H1;PTCH1
cg22262702
15.4466871434964
0.201642226684242
2.38746992701132e-28
TAF4
cg24190603
15.4152124963462
0.457223322992194
2.7606846342662 le-28
SNAP91;SNAP91
cgl0077746
-15.3785652817533
-0.47747463170223
3.26985829641266e-28
DUSP6;DUSP6
cgl0507988
15.2655424269186
0.103801427552418
5.51693320931869e-28
EPAS1
cg08100687
15.1156424870649
0.422035993511641
1.10671319148796e-27
cg03653726
15.1147013618102
0.117798673652928
1.11157054070322e-27
GNA12
cgl9579005
-15.1092342032668
-0.381889682740893
1.14021476792717e-27
cgO1483824
15.047982135597
0.130282732034826
1.51666835813047e-27
GRIN2D
cg06947694
15.0264511068406
0.116293326445792
1.67684038392008e-27
TNRC18
cgl2628196
15.0231037837718
0.563540284451018
1.70322633980762e-27
SND1;LRRC4
cg20873416
-14.9781204747565
-0.515729260753143
2.10112443695697e-27
cgl0784519
-14.9732733648577
-0.299818535763043
2.14923062383169e-27
cgl4318199
-14.8283895900361
-0.290704838956816
4.23364298566133e-27
cg01233786
14.8199598244348
0.177491606501215
4.4043197454857e-27
ATP11A;ATP11A
cg07153966
14.7856919488993
0.429882929240947
5.17240848494225e-27
HOXA3;HOXA3;HOXA3
cgl4653814
14.7464446765783
0.140647413480685
6.21908138020239e-27
EXOC2
cg27395654
-14.6840423692026
-0.347157642444919
8.33953624939644e-27
CHRNA6
cg06762332
-14.673934699094
-0.436839726950755
8.74579117298684e-27
cg21037180
-14.5743022294119
-0.177794957706674
1.39862404457614e-26
cg05847233
14.569504361381
0.27430519229171
1.43064831426867e-26
AFG3L2
cg24553673
14.4982683351017
0.495176951005508
2.0028566351633 le-26
NR5A2;NR5A2
cgl2894883
14.4573641420834
0.0298447565963309
2.43034648504291e-26
PPM IF
cg05168229
-14.4313670021536
-0.361254127193605
2.74859814358357e-26
cg23056703
-14.4240438466339
-0.354090624898194
2.84558694172356e-26
cgl3207733
-14.4181022881264
-0.268864196217159
2.92680043916443e-26
cg06761167
14.3784288941244
0.0565680022602503
3.5321858276237e-26
cgl0007534
14.303794664908
0.13458347659549
5.03339504246936e-26
C21orf70
cg05633070
14.2958235079983
0.125204484400008
5.22764091994687e-26
AB R; ABR; ABR
cgl7301223
14.2745787459862
0.611092681860932
5.78295610150581e-26
OPLAH
cg02912476
14.2540248604816
0.098254927586765
6.37660871461155e-26
PRKCZ;PRKCZ;PRKCZ
cg06460652
14.2462828752448
0.0347547910033134
6.61577888092827e-26
FGFR4;FGFR4;FGFR4
cg08404702
14.2354074281995
0.149467530703697
6.96705885797789e-26
TSC2;TSC2;TSC2
cgl0773016
-14.234777831017
-0.148291886531011
6.98795980286756e-26
cg07723598
14.210039997846
0.0956755862629012
7.86106050858941e-26
HDAC4
cg00806214
14.2005428808141
0.130275542105897
8.22467758772648e-26
RAB11FIP3
cg25969107
-14.1798327624701
-0.401816356451076
9.07732698861383e-26
cg20402747
14.1687190387561
0.13488626575939
9.57096285942292e-26
TBC1D16
cg24803059
14.1382040036423
0.130047498901594
1.10696016135784e-25
HCCA2
cgl0503655
-14.113960361595
-0.205939093825132
1.24267442051913e-25
cg20175702
-14.0266458152791
-0.549147127587554
1.88576068754793e-25
cg23558337
-14.0242058845424
-0.26892869360552
1.90789058348643e-25
C20orf94
cgl3802506
14.004788920548
0.167641618331823
2.09356350662853e-25
NINJ1
cgO1586506
14.0038763812071
0.131490789746291
2.10272321247515e-25
SOX 10
cg23023970
-13.9703847909236
-0.293518191634951
2.46828476514629e-25
INPP5A
cg03409187
13.9497121672372
0.490330832631944
2.72515482123748e-25
cg02627455
13.894026769242
0.364207450820684
3.55886686270242e-25
HOXA3;HOXA3
cgl9273773
-13.881432576981
-0.196827831998305
3.78050641816587e-25
NAPEPLD;NAPEPLD
cg05460425
13.8403889822838
0.144509086858435
4.60375013133746e-25
EXOC2
cgl7494199
-13.7474857575235
-0.482279325153154
7.19584873800287e-25
cg03716852
13.69868155162
0.431887957473032
9.10215433766767e-25
TRPM4
cgl7868307
13.6947676942644
0.385459395242105
9.27542843341729e-25
EIF4H;EIF4H
cg24951263
-13.6899091380036
-0.284107660776486
9.4951441831643 8e-25
cg25189564
13.6624037145887
0.429958367175279
1.08413584480714e-24
VIPR2
cgl7504135
13.5870976140378
0.189537825220453
1.55925874094278e-24
MED 16
cg26987690
13.5658337385706
0.354856158491972
1.72795891999626e-24
UNC84A;UNC84A
cg25063165
-13.5463996179794
-0.317824340217298
1.89813877824487e-24
cg22098115
13.5443428305328
0.328152547947732
1.91710736171058e-24
ARHGEF4 ;ARHGEF4
cg06332339
13.5401927578408
0.0256031132162133
1.95596289642516e-24
NPTN;NPTN;NPTN;NPTN
cgl8488157
13.5238404327171
0.476696285247683
2.11692000478736e-24
cgl4642259
-13.4858716617809
-0.655211462062888
2.54387566095236e-24
MYBPC3
cgl9783626
-13.4776104606862
-0.153855143768991
2.64768089841396e-24
cg01515802
-13.4396361594953
-0.441258761894351
3.18236344255464e-24
LAIR1 ;LAIR1
cg22617773
13.4180122442632
0.53806374360552
3.53401392161588e-24
Саркома
cg00702638
-16.5161269323054
-0.0753997839924838
1.58039169462552e-42
KIF15;KIF15;KIAA1143
cgl4210311
13.6849900201637
0.138291988324612
1.48292132663639e-32
ERI3
cg27648858
12.0468392412554
0.225827653657815
6.57416710110833e-27
PIK3R2
ch. 12.199326 IF
-11.5528197831951
-0.136264382478259
3.05249512267458e-25
AN04
ch,11.110310046R
-10.5898242409115
-0.214980351744475
4.64604178994258e-22
ch.8.93711588R
-10.4777872800919
-0.120679339029355
1.07328081634042e-21
ch.6.33611621F
-10.1555845425481
-0.133899333815588
1.16895767480262e-20
cg24888989
-10.0101121426176
-0.0405173488252353
3.40109152847357e-20
KIF15;KIF15;KIAA1143
ch.l6.49831971R
-9.83215066212292
-0.21462195000902
1.24477668713048e-19
cgl2914733
9.72612785241844
0.289247208530218
2.68324722794727e-19
AP2A2
cg25743481
-9.45473669800729
-0.067579414562581
1.88350358194634e-18
KF15;KIF15;KIAA1143
ch.20.12652500F
-9.41687411725854
-0.187347576774975
2.46687777372208e-18
ch.7.114512964F
-9.26065864245822
-0.100345539429779
7.46858595681921e-18
cg22359581
9.16054749239728
0.162970157380363
1.51177935554567e-17
EHD2
ch.2.168147954R
-9.13791481270924
-0.091862894148047
1.772135029803 le-17
ch.ll.l 10329410F
-9.10720631345078
-0.0855041668198817
2.19782673374723e-17
cgl0503298
8.95047226501412
0.0470955935742418
6.55737000307888e-17
CTBP1;CTBP1
cg00719108
8.88724565913778
0.0720575747425746
1.01637042281286e-16
ABCB6
ch.21.40139802R
-8.82921365702984
-0.0838808193336502
1.51749078333095e-16
ch.2.217484879F
-8.79899531352636
-0.0612943060787002
1.86868240653405e-16
ch.8.91748119F
-8.78307727877093
-0.0885874967378503
2.08494833997713e-16
ch.l 1.1877857R
-8.70887490959487
-0.0704512082933723
3.46897147188625e-16
ch.l6.50203954R
-8.68770875923312
-0.11336002480149
4.00949451926077e-16
ch.7.137597056R
-8.5703209387298
-0.0793924793951838
8.92056033684462e-16
ch.l.234902740R
-8.567884330937
-0.0830387551949259
9.06930993947441e-16
ch.l6.83989841F
-8.56253857002057
-0.109146576404938
9.40432171451764e-16
ch.6.2510917R
-8.53726826924761
-0.0848465510780976
1.11615330542915e-15
ch.l9.36684304F
-8.45678609217553
-0.0607312286583866
1.92251631518943e-15
ch.9.84078312F
-8.43115856588713
-0.144802083259866
2.28459194031459e-15
cgl2427264
8.30398663496321
0.0464059685106536
5.35574664265954e-15
STX11
cgll316510
8.30012809238888
0.309252414261576
5.49538071425015e-15
RARA;RARA;RARA;RARA
cg00891608
-8.27324947408043
-0.153582951867912
6.57327135042199e-15
C19orf40;CCDC123
ch.2.4104651R
-8.25004893819137
-0.139256496991226
7.67021839000834e-15
P ARD3 В; P ARD3 В; P ARD3 В
cgl3953735
8.22045149515025
0.111309551554598
9.33600175421425e-15
EHD2
cg26625629
-8.21559969583149
-0.0750385137119883
9.64131057008702e-15
C2orf43
cg08514736
-8.14431086716857
-0.0864937083556962
1.54503375233845e-14
CCNO;CCNO
ch.3.1083063F
-8.11185983443477
-0.110143510134809
1.91349991499296e-14
SEMA3F
ch.7.45985950F
-8.07193803310051
-0.0941830632616179
2.48778396801724e-14
ch.l0.31370070F
-8.05181498097589
-0.0886561199771362
2.83886862221759e-14
ch.3.2787532R
-8.01607552358676
-0.075817728944818
3.58729564857012e-14
ch.l5.68126615R
-7.88031789389457
-0.134799597214926
8.67724016610615e-14
ch.20.22943799F
-7.87186859747445
-0.0603770773671872
9.16495047314563e-14
ch.8.903080R
-7.85725718094766
-0.182785435633358
1.00730994377163e-13
WHSC1L1;WHSC1L1
ch.X.652438R
-7.8262130962189
-0.0756037179891682
1.23081910901781e-13
MED 14
cg09340639
-7.80872895447767
-0.369910843838201
1.3775921457056e-13
FCRL1;FCRL1;FCRL1
cgl3648312
-7.78110053835795
-0.0386819877101882
1.64551415827154e-13
LOC285830;LOC285830
cg08581512
-7.74367860653161
-0.0636982961503184
2.09209356158086e-13
CYP2R1
cgl0546562
7.70742411199986
0.136212217036154
2.63827737796581e-13
TNRC18
cg20844771
-7.68701382456835
-0.068850475625202
3.00544673123728e-13
CCNA2
cg08707110
7.68382634947277
0.0903647611197548
3.06717336128199e-13
SNX32
ch.5.3304132F
-7.66986501172497
-0.0823502055631923
3.35262633759084e-13
STC2
cgl5926099
-7.66620024159406
-0.166547126051385
3.43180574830791e-13
C6orf48;C6orf48
ch.X.772254F
-7.66484156867102
-0.115741404770415
3.46162753659387e-13
UBA1;UBA1;INE1
ch.l7.1364760R
-7.61839094339668
-0.073028501074676
4.65055705110791e-13
CA10;CA10;CA10
ch.l.64660926R
-7.51598609554976
-0.163186269165556
8.88199486635021e-13
ch.l2.105153690R
-7.47771119290641
-0.110389427297438
1.12964104716403e-12
cgl7758721
-7.46332438715541
-0.061599571110919
1.23625683592257e-12
SNRPB;SNRPB
ch.8.90327161R
-7.44907434884482
-0.126992952117625
1.35163259228723e-12
cgl9791003
-7.44445382861946
-0.0410431624308308
1.39127616218042e-12
SLC36A4
ch.6.2132867R
-7.4282573789613
-0.0634086876731622
1.53951376448179e-12
ch.9.2049598F
-7.41870136939405
-0.0914630485461767
1.63417454982857e-12
MAPKAP1 ;MAPKAP 1 ;MAPKAP 1 ;MAPKA P1;MAPKAP1
ch.l9.50335620F
-7.41029563917959
-0.100982754834969
1.72217291743254e-12
ch.2.1685112F
-7.35142425062508
-0.0644390864658684
2.48404076069853e-12
MTHFD2;MTHFD2
ch.9.109447758R
-7.34336132318368
-0.125750215369144
2.61146745889349e-12
cgl5732530
7.3285829604077
0.0748761313344324
2.8619812505612e-12
ZNF296
cg04377850
7.30164204323865
0.214309119644156
3.38111673891697e-12
ZC3H18
ch.4.1463482R
-7.29797304185761
-0.071681494339898
3.45864699458318e-l 2
PARM1
ch. 12.41530717F
-7.28649745951529
-0.142333698450245
3.71263129977057e-12
cg05470389
-7.27261915665446
-0.0378504105016094
4.04445804802671e-12
SYN3;TIMP3 ;TIMP3 ;S YN3 ;S YN3
ch.2.200609314R
-7.26570795811334
-0.119831012161779
4.22044296264604e-12
ch.5.762713R
-7.23434673236346
-0.121633634598647
5.11865820590117e-12
PRLR
ch.l0.296387R
-7.15951667935811
-0.104643754422329
8.09420122755246e-l 2
ch.7.33727552F
-7.15578173585825
-0.133634565992611
8.28081149709614e-12
ch. 2.472 86786F
-7.15309747155409
-0.207164150564691
8.41753821837376e-12
cg06839483
7.14631056646786
0.107095564301733
8.77323987421281e-12
KIAA1161
cg05991442
7.14203169966362
0.115982026184988
9.00506482262228e-12
RECQL5 ;LOC643008 ;LOC643 00 8
ch. 10.2770541R
-7.13467811001666
-0.166716290750606
9.41765604752786e-12
FAM196A;DOCKl
ch.2.2729437F
-7.1159499182628
-0.0876165117754084
1.05544479984868e-ll
cgl8423737
7.08779364067545
0.139266518129493
1.25223705205556e-ll
ch.l2.1667570F
-7.07222009783818
-0.0643421099062496
1.3761769367525e-ll
TMTC2
ch.2.740763F
-7.05078629821993
-0.122969101873783
1.56671668636073e-ll
ALK
cg06503715
7.03206499559067
0.0634491824614292
1.75424154446569e-ll
FOXK2
ch.l6.406779R
-7.0253862977641
-0.104791277549113
1.82635277353469e-ll
CLEC16A
cg20606662
6.97953230574179
0.13271314069851
2.4066390735644e-ll
HEATR2
ch.l.55746252R
-6.95984489498283
-0.0868055665017709
2.70833160280322e-ll
ch.l0.1515233F
-6.95448066154241
-0.124072174963508
2.79679550016677e-ll
UNC5B
ch.9.945770F
-6.95168685269652
-0.092792555009334
2.84398968772787e-ll
ch.l2.602695F
-6.94499187058384
-0.102192531067471
2.96029759374094e-ll
ITPR2
cg19484481
6.92035867009189
0.256624535493559
3.42995835784773e-ll
FOX03;FOX03
cg04885475
-6.88695344478324
-0.0381238491392921
4.18580302430128e-ll
RSRC1;RSRC1
ch.l.227329902F
-6.88423369284765
-0.0827607156949081
4.25410741294131e-ll
ch.2.2570960F
-6.87460043580334
-0.0763759054511965
4.50497703703347e-ll
ch.l5.76992553F
-6.86022152756587
-0.0980528130489383
4.90673736863229e-ll
ch.7.130936447R
-6.84301044070062
-0.0482788067144982
5.43417146313211e-ll
ch.l 0.73 3293 20R
-6.84100076089407
-0.0811996512074259
5.4992826664459e-ll
ch. 15.97746216F
-6.82982223917104
-0.184487979830579
5.87570654281245e-ll
cgl3596910
6.81618586759015
0.0497717071978323
6.36933857228342e-ll
C17orf65;ASB16
cg02974976
6.81428559043818
0.161579373576853
6.4412893478518e-ll
CD58;CD58;CD58
ch.2.66207210F
-6.80752138099528
-0.0788243482778235
6.70395173390376e-ll
ch.l0.1700276F
-6.79380991391167
-0.117662104393555
7.26911846977972e-ll
Меланома кожи
cgl6956999
24.2244354406851
0.247468278502374
1.464663367984 82e-44
POLK
cgl6662267
-20.8168283279685
-0.299113752270544
7.09372061591857e-39
CBR1
cg27197524
18.3234613118133
0.295576787635172
2.44784073027098e-34
POLE
cgO1804345
-16.244553604195
-0.386410823334185
2.70147612426903e-30
cgl8675847
15.923705328238
0.170751750020602
1.19305261928653e-29
AFF1
cg20361429
15.5162186030892
0.246064338421025
8.01506887504273e-29
POLE
cg09396850
14.6777847531127
0.305453421132458
4.30161908780774e-27
ATP11A;ATP11A
cg03841977
-14.6069019920183
-0.313828503468586
6.04686729958853e-27
CBR1
cg27586410
14.3967589545927
0.233507968288827
1.66527520244128e-26
TBCD
cg20039257
13.5034290188471
0.444748047826878
1.30537532161008e-24
NCALD;NCALD;NCALD;NCALD;NCALD; NCALD;NCALD;NCALD
cg00695416
-13.1988235654282
-0.31151625364519
5.88916552435061e-24
CBR1
cg06725997
-12.9657591234995
-0.297499931503382
1.87671811950922e-23
cgl6964533
12.5578794973096
0.251492209286204
1.4441562134404e-22
POM121L9P
cgl6719517
-12.3071816429647
-0.324889842667155
5.09878193703715e-22
CBR1;CBR1
cg05876635
-11.8833316958773
-0.199261813140417
4.35176179132109e-21
cg04838847
11.6709797007189
0.345301195426321
1.28034054800304e-20
GOLSYN;GOLSYN;GOLSYN;GOLSYN;GO LSYN;GOLSYN;GOLSYN;GOLSYN;GOLS YN;GOLSYN;GOLSYN;GOLSYN;GOLSYN ;GOLSYN;GOLSYN
cg05364750
-11.5027352584385
-0.349954162401204
3.016779667041e-20
FLJ36031
cgl7262328
-10.8862158752464
-0.332774526620527
7.06708418992563e-19
cgl5996592
10.7715226935415
0.17910526690437
1.27308014018351e-18
ATP11A;ATP11A
cg27307781
-10.6366525017334
-0.328895221516761
2.54498050971758e-18
CBR1;CBR1
cgl7802005
10.4844827694926
0.214927079002439
5.56373642359089e-18
cg03629458
-10.4586148378143
-0.0221506642442869
6.35527298161307e-18
C3orf75
cg08583240
10.3236888939475
0.302526811686891
1.27215037365176e-17
MAP4K4;MAP4K4;MAP4K4
cg08247289
10.2065297144895
0.31722637117156
2.32461749984612e-17
ATP11A;ATP11A
cgl4498227
10.1998570980232
0.362424573143841
2.40582849693644e-17
cg09731745
10.1732695764704
0.204721004064027
2.75860132020635e-17
INPP5A
cgO1962969
-10.1583885807102
-0.167068742849417
2.97817151887457e-17
CBR1
cg08945711
10.1457072838879
0.452856418511695
3.17902863660045e-17
cgl2997166
-10.1157941658155
-0.361710917427
3.70814596716128e-17
PMS2;PMS2;AIMP2;PMS2
cg03347632
10.0979595141384
0.465432186715955
4.06464086462979e-17
PGBD5
cgOOO10672
10.0618700850928
0.550726398091936
4.89433514461693e-17
cgl4041701
10.0079172339681
0.314527977227948
6.46097675484226e-17
cg07697256
9.95602225006924
0.186896799855877
8.43922440128685e-17
EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;E XOC7
cgl8107611
-9.95072869811468
-0.415624995434401
8.67232302557803e-17
cg05546264
9.85597838387695
0.349435459490108
1.41229660764706e-16
cg06773963
9.8523749291165
0.157862930571062
1.43873250521355e-16
SPSB1
cg27309098
9.81453881363042
0.277089333820042
1.74801543862351e-16
AGAP1;AGAP1
cg06149733
9.80269379263429
0.240150133661326
1.85788207543239e-16
cgl8365383
9.80049913658864
0.367022293097024
1.87898362092716e-16
cg08940097
9.79066495210609
0.157979518208339
1.97651991271661e-16
EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;E XOC7
cg05377587
9.75340672865503
0.182978436962507
2.39422152985087e-16
TBCD
cg07756788
9.75088654540747
0.337839023977197
2.42547085671936e-16
cgl7725019
9.74553360080892
0.232994986703702
2.49320448483726e-16
P1K3IP1;PIK3IP1
cg05869392
9.73593167659558
0.176844973478289
2.61947465731266e-16
KIAA0913
cg22793142
9.72333473957875
0.362650798176464
2.79487411707337e-16
LOC148696
cgl7983632
9.71392308766346
0.395117444660023
2.93354039663672e-16
cg24371155
9.71364561409295
0.267152279432201
2.93773125491879e-16
MY016
cg06670039
9.71321593299769
0.3819833496939
2.944232809789 lle-16
SNX29
cgl8009376
-9.69607783390897
-0.108523888896856
3.21561976884989e-16
FASN
cg25750363
9.67681192716482
0.266660256807305
3.5506595114367e-16
FBRSL1
cg05892329
9.63987676802124
0.472943292405015
4.29360905361817e-16
TPvAPPC9;TRAPPC9
cg05265234
9.63424619317086
0.293862493338457
4.41977619350628e-16
DDX17;DDX17;DDX17;DDX17;DDX17;DD X17
cg26591066
9.60726946856527
0.316756794119219
5.07759477172218e-16
ZZEF1
cgl8754842
9.58634189342836
0.310672681335854
5.65456605977617e-16
KDM6A
cgO1921845
9.58102139357644
0.150146429061361
5.81141415594328e-16
АКТ 1; АКТ 1; АКТ 1
cg00171166
9.58075122741086
0.0913775539179866
5.81949360825152e-16
C20orfll7;C20orfll7
cg21496408
-9.56099819209026
-0.303374691818775
6.44166528249444e-16
FLJ36031;FLJ36031
cgl6123421
9.52603280578062
0.191796408787768
7.7103440365935e-16
1NPP5A
cg07428697
-9.51715344564602
-0.172393964935186
8.07046777403307e-16
FLJ36031
cg07395000
9.49885685770487
0.225740912141204
8.86638662721412e-16
TECPR1
cgl6990083
9.47896668143073
0.271820958209676
9.82082318492944e-16
L0C728661;CDK11B;CDK11B;CDK11B;C DK11B;CDK11B;CDK1 IB
cg26986438
9.471296667789
0.266242400124752
1.0215709229881e-15
FOXK2
cgl4454796
9.44199954843967
0.21040127571772
1.18756465676303e-15
MTERFD2;MTERFD2; SNED1 ;MTERFD2
cg04311722
9.39988071267713
0.304946974971242
1.47449381401487e-15
cg04099036
9.39433573062972
0.184239188831617
1.5171006909439e-15
TBCD
cgl5391499
-9.38958981813037
-0.079751125445274
1.55454284040157e-15
MCC;MCC
cg23486580
9.34434750376909
0.250315636379931
1.96120481054348e-15
BRF1;BRF1
cg09827048
9.32991566217322
0.310182227300368
2.11207256958477e-15
RPS15AP10;GPBP1L1
cg21541120
-9.30891538122269
-0.22419954473724
2.35254339387643e-15
MCC;MCC;MCC
cgl1385003
-9.30348342804804
-0.266683165901465
2.4190744954043e-15
PDXK
cgl7477946
9.2928149352038
0.317606325795655
2.55526110237993e-15
TBCD
cg!6586152
-9.2585029757536
-0.223540953572826
3.04735124546574e-15
FLJ36031
cg24003542
-9.24787429765943
-0.0995968930834876
3.21818803449827e-15
MCC;MCC
cg03685063
9.24489182235278
0.290190885395768
3.267821338091 le-15
CLRN2
cg02853497
9.24179075912166
0.332284771922976
3.32023872562032e-15
RPS15AP10;GPBP1L1
cgO1800442
9.2289045560751
0.0579555350548749
3.54719857133529e-15
EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;EXOC7;E XOC7
cgl2460765
9.20823519186748
0.17607761437032
3.94402360858632e-15
EIF3B;EIF3B
cg07207833
9.15903464564403
0.218645602961862
5.07611001618754e-15
EPHA2
cg21353724
9.12098390234458
0.173077918618258
6.16954129030306e-15
SNX8
cgl8466378
9.06741297727446
0.285444823271988
8.11853401248393e-15
RNF213;LOC 100294362
cg08696303
9.0550467085099
0.226368923560843
8.64948139686271e-15
BCCIP;DHX32;BCCIP
cgl5425061
9.04648402952047
0.25924167251369
9.03728961173081e-15
RALB
cg20076468
9.02429158580048
0.167108148915149
1.01250765356646e-14
PROZ
cgl1183227
9.01949067393847
0.238176225994678
1.03770728481963e-14
MAN2A2
cgl2555233
9.00092026947326
0.215819257599342
1.14121502281098e-14
MAN2A2
cgl4930335
8.98319357829581
0.208011858888996
1.24961430581349e-14
AGAP1;AGAP1
cg21864730
8.96582144850279
0.272805449795868
1.36580432120428e-14
THRSP
cg01813877
8.94090485330515
0.121300462524282
1.55151534450164e-14
TRAF3 ;TRAF3 ;TRAF3
cg05575213
8.92391856440775
0.237882603068035
1.69235749158998e-14
eg14444297
8.91760847325465
0.504271068425332
1.74786686906454e-14
cgl8606700
8.89690213605531
0.194223625314012
1.94309680656051e-14
LRP5L;LRP5L;LRP5L
cg07710971
8.89547571658227
0.247372411489372
1.95732025915972e-14
GPT2;GPT2
cgl8969029
8.88980747374726
0.270647270906731
2.01487455528474e-14
HDLBP;HDLBP
cg08204939
8.88958461071329
0.268709008769203
2.01717163684498e-14
MAD1L1;MAD1L1;MAD1L1
cgl4379462
8.87043016317011
0.249064826806124
2.22468089462082e-14
SURF4
cgO1666796
8.86534003828339
0.219244584335505
2.28331886916223e-14
TLE3 ;TLE3 ;TLE3
cgl7287998
8.8509159749569
0.142839677203177
2.45799161090464e-14
PDE4D
cg20410537
8.83763321716028
0.184603472963638
2.63060552914464e-14
TRIM62
cgl3461718
8.83252710836422
0.11235950529953
2.70013286026801e-14
TRAF2
cg24607755
-8.82038224390718
-0.0988443139901188
2.87295584701163e-14
LDLRAD3
Злокачественная опухоль желудка
cg08314021
-13.6505542607786
-0.136684793979411
5.37704329231194e-35
TSPO;TSPO
cg22513169
-12.7073609291567
-0.149729315966022
3.12417804749266e-31
RAB11FIP1;RAB11FIP1;RAB11FIP1;RAB1 1FIP1
cgl0788213
10.6723687893586
0.303203505631008
1.60675834593496e-23
FAM118 A;F AM 118 A
cg21395152
-10.0437300944305
-0.0806132512914668
2.80107104722042e-21
ATF3
cg08847724
-9.52381032121276
-0.128647629123054
1.7446885207291 le-19
LRP6
cg05009141
-9.48179532830809
-0.155735407264141
2.42235111330293e-19
PLXNB1;PLXNB1
cgl8369257
-9.35958408496502
-0.125613926179094
6.26047254928176e-19
Cllorf9
cg05767788
-9.35477431585958
-0.0599319909685562
6.49784656898872e-19
HSPD1;HSPD1;HSPD1;HSPE1
cg03631331
-9.29166591570888
-0.088614553834325
1.05769268818372e-18
Cllorf9
eg12618546
-9.12757524465734
-0.065631590720675
3.71840207846957e-18
cgl3703737
8.96573612018963
0.30578865621425
1.26724765267893e-17
SLC22A23;SLC22A23
cg05923587
-8.93184701561226
-0.0946318916504394
1.63531500249813e-17
BCAR1;BCAR1;BCAR1;BCAR1;BCAR1;B CAR1 ;BCAR1 ;BC AR1 ;BC AR1
cg09445727
-8.64849638996196
-0.114760405871329
1.34555608245381e-16
BCAR1 ;BCAR1 ;BCAR1 ;BCAR1 ;BCAR1 ;B CAR1;BCAR1
cgl5631966
-8.52169334269509
-0.103990511383402
3.40607940539398e-16
ACADS;ACADS
cg07240673
-8.50288425824812
-0.159289652955929
3.90615906691689e-16
CLUAP1
cg04931063
-8.45556354707162
-0.21056726559193
5.50863626136955e-16
BACE2;BACE2;BACE2
cg02638755
8.4170351155668
0.413746251497185
7.28096625093464e-16
RPTOR;RPTOR
cg03243768
8.25772383825633
0.494355519394682
2.28646281896386e-15
FLJ46111
cg00318865
-8.23241896432981
-0.144929658444789
2.7385009400764e-15
ACVR1B;ACVR1B;ACVR1B
cgl9646445
-8.20863372961478
-0.120663206961904
3.24345410105853e-15
KCTD3
cg04664153
-8.1450394799111
-0.26220552169426
5.0909476689668e-15
GPR39
cgl6841327
-8.12276515090949
-0.112555146343801
5.95840270770797e-15
cg09235125
8.11028072605445
0.097572168319399
6.50687497816131e-15
TULP4;TULP4
cgl3191129
-8.02733502440011
-0.0646966453784718
1.16527258885 77 le-14
ACVR1B; ACVR1B; ACVR1В
cg04645063
8.00952812863204
0.0531875584274928
1.31983634237616e-14
ZNF205;ZNF205
cg20390150
-8.00479566172545
-0.0759148134357941
1.364212716519e-14
TSPO;TSPO;TSPO;TSPO
cgl2275723
-8.00469713083478
-0.308167698035408
1.3651521301239e-14
CASZ1;CASZ1
cgl4902356
-7.99501271227701
-0.0546892097866049
1.46067175212306e-14
ANKRD5 ;ANKRD5
cg21716444
-7.98875773737019
-0.305876338420804
1.5258438432737e-14
CARD 10
cgO1439669
-7.98514570355352
-0.0853954854663747
1.56477788420264c-14
ENC1
cgl0338082
-7.94391841320111
-0.284000147236023
2.08500615672026e-14
KALRN;KALRN;KALRN
cg25793630
-7.88721626524568
-0.0704473182392215
3.08900931251385e-14
cgl4917572
7.80966357400676
0.369303269681654
5.271360169038e-14
cgl3584608
-7.80580125064937
-0.0960401038034941
5.41302537166343e-14
HNRPLL;HNRPLL
cgl5201400
-7.78572699973487
-0.0361522132056796
6.21207501536064e-14
GNPDA1
ch.l2.59779038F
-7.69840366417559
-0.328816407966907
1.12743378189286e-13
cgO1909551
7.69721826471676
0.242346701919417
1.13655582404289e-13
cg02566698
-7.65431603430621
-0.144934253409438
1.52053656678339e-13
CLUAP1
cgl7792315
-7.62588712561009
-0.202700805289877
1.84282057114499e-13
RGNEF
cgl3904493
-7.61329531465267
-0.0403039361604375
2.00627493362881e-13
KIAA1804
cg04616797
-7.58764085689695
-0.292586421367972
2.38479455263505e-13
DSP;DSP;DSP;DSP
cg05314639
7.56207738133043
0.257859669755903
2.8318199980382e-13
cg27266479
-7.51358466969807
-0.173779012354888
3.91842582289898e-13
H6PD;H6PD
cgl2004206
-7.50819123265874
-0.236914601005441
4.06217708471667e-13
NACC2;NACC2
cg04000140
-7.50218660472362
-0.0789940937556956
4.22833865775126e-13
SDC4;SDC4
cg20448717
-7.49631327060555
-0.292879421770374
4.39734273683568e-13
DSP;DSP;DSP;DSP
cg05604112
-7.41778693455576
-0.163143552861656
7.41026679210953e-13
GALM;GALM
cg05183229
-7.41407779058109
-0.0895140096962896
7.59445651187181e-13
ARHGAP21 ;ARHGAP21
cg21205463
-7.40631351581526
-0.114072301427008
7.99474431688872e-13
cg09951650
-7.40277621632384
-0.0630345849404699
8.1839347255948e-13
AP4E1
cgl9306368
-7.37584909373865
-0.352657666710314
9.77620187241317e-13
cg22356593
-7.36406812965033
-0.0629124295830979
1.05653935728192e-12
KCTD3
cg02259047
7.35208271678242
0.181664616105183
1.14326330991671e-12
XRCC3;XRCC3;XRCC3
cgl7178966
-7.32548816667278
-0.267715246118042
1.3615166299537e-12
LRP6
cg05999255
-7.31668867330415
-0.10965304895221
1.4423969102784e-12
CKAP4
cgO1814495
7.28638369687936
0.238258851974912
1.75885018588764e-12
CDIPT
cg25251249
-7.25014651803672
-0.135247161398423
2.22789058121772e-12
FAM18B
cg04233664
-7.2236567943191
-0.220524193075846
2.64671199384315e-12
CTBP2;CTBP2
cg00734483
-7.19840311306881
-0.220292409419602
3.11775714147475e-12
BACE2;BACE2;BACE2;BACE2;BACE2;BA CE2
cg25678929
-7.19773706938496
-0.265310898924973
3.13123710639863e-12
TLCD2;TLCD2
cgl2148919
-7.19154949688025
-0.270165628969816
3.25924027835384e-12
PTPRK;PTPRK;PTPRK;PTPRK
cgl9522900
-7.17969412750802
-0.0866790246236306
3.5190457936301 le-12
KALRN;KALRN
cg00148892
7.1744951183828
0.285488312208193
3.63931140742199e-12
GATA6
cg22869239
-7.1685283274325
-0.214367407386447
3.78232838483439e-12
LRP6
cg26078244
-7.15134995934547
-0.180394541661857
4.22568003286253e-12
SLC12A7;SLC12A7
cg27005179
-7.137348662112
-0.144031000958868
4.62453897449256e-12
ERBB2;ERBB2
eg18644710
-7.13193289662667
-0.107600364869129
4.78856249074163e-12
SPATS2L;SPATS2L;SPATS2L;SPATS2L
cgl2116939
-7.12872985264896
-0.197489587074601
4.88825086894331e-12
CDC42BPB
cg24633648
-7.11899199350659
-0.156827243196119
5.20403173809495e-12
TC2N;TC2N;TC2N
cgl0631582
-7.11492329252311
-0.0840410759595744
5.34184105848295e-12
JAG1
cg24836204
-7.10199299580095
-0.0755247090621632
5.80407091183953e-12
RHPNl;C8orf51
cg03267342
-7.0617179805219
-0.152529077210001
7.51077961509514e-12
KLF4
cg01580613
-7.05708262255838
-0.0386578906210398
7.73641491708484e-12
ANKRD5 ;ANKRD5
cg26220018
-7.00155811220856
-0.363037292535488
1.10162654417052e-ll
cgl3309429
6.98960378334434
0.341021436786754
1.18840371208439e-ll
KIAA1244;PBOVl
cgl6232504
-6.98867551125329
-0.250074887598137
1.19541661689193e-ll
SNX7;SNX7
cg01349858
-6.98639202906809
-0.024091600328428
1.21284148227959e-l 1
cgl3742648
-6.94170037763761
-0.291526486831847
1.60879327800457e-ll
NACC2;NACC2
cgl4169521
-6.92291239377297
-0.233005348041334
1.81094714533689e-ll
ARL4A;ARL4A;ARL4A
cgl9350682
-6.92073894875184
-0.245145226702038
1.83588642928415e-ll
EPHB4
cgl1176889
-6.89562334354614
-0.320905605616725
2.14974039129117e-ll
FKBP9;FKBP9
cg09770904
-6.89551264308771
-0.0626308522383452
2.15123425 829618e-11
CD9;CD9
cgl0168763
-6.87367739763469
-0.123357658106897
2.46674355748054e-l 1
ADCY9
cg25764464
-6.87088163711223
-0.217312571310156
2.5102905537862e-ll
PLEKHA5 ;PLEKHA5
cg05040544
-6.85772398181393
-0.133809973351048
2.72559108385805e-ll
EFNB2
cgl9970200
-6.85765849708355
-0.105220221557005
2.726706735153e-ll
cgl9496782
-6.83239643947392
-0.218016643624802
3.19232427022887e-ll
GATA6
cg25906419
-6.82782093643803
-0.16140452382728
3.28464088351366e-ll
BACE2;BACE2;BACE2
cg25591867
-6.80679719658252
-0.203878558592074
3.74365917019516e-ll
CKAP4
cg05471509
6.76966238375313
0.247357708481087
4.7132146555695e-ll
cg09654562
-6.76963707222042
-0.0375234873527704
4.71395307115413e-ll
cgl0739132
6.76913016962558
0.289226995417043
4.7287649284908e-ll
FXR1;FXR1;FXR1
cg00313498
6.76161380677572
0.14145873199723
4.95383420565817e-ll
AFAP1;AFAP1
cg07882171
-6.74628865126064
-0.0505942522975802
5.44580777148780e-11
SDC4
cgl3898166
6.73954978894211
0.401207165040929
5.67704002457683e-ll
LOC84740
cgl0599345
-6.73687127767194
-0.169298295531879
5.77160221748559e-ll
MAP3K5
cg06780358
-6.73066340204316
-0.220765845057885
5.99675113558577e-ll
PTPRJ;PTPRJ
cg02519037
-6.70285922276
-0.281734561040993
7.11559473790116e-ll
TACC2;TACC2
cg20989443
6.6903740940147
0.272068241027949
7.68240209437992e-ll
GALNT2
cg03473387
-6.68313529198687
-0.230040525235401
8.03108992452286e-ll
GATA6
Злокачественная опухоль щитовидной железы
cg05375100
33.8127454460814
0.102111198842301
1.77366680940227e-137
RAB11FIP3;RAB11FIP3
cgl2218406
32.3749842818033
0.118592598950599
1.79673199819827e-130
ARRDC2; ARRDC2
cgl6956999
31.5085363760679
0.0932214333519589
3.33274114901156e-126
POLE
cg00327072
30.7221268377159
0.194438673132775
2.66326340306316e-122
NEURL1B
cg00474840
29.7298266341022
0.069568652161927
2.43351410876814e-117
ARRDC2; ARRDC2
cg27197524
27.8282127772563
0.0387072790776717
9.86876540104792e-108
POLE
cg26996201
-26.6543181622455
-0.164468810293175
9.57011092303138e-102
PAK1;PAK1
cg27320213
-25.6223085306593
-0.0627403621783125
1.86419796924485e-96
STAT6;STAT6
cg08597067
24.8019931557442
0.433883532578124
3.07434143869217e-92
ELOVL5
cgl3324103
-24.5156316436152
-0.0943973002313781
9.15749896705433e-91
SVIL
cg22648929
24.1082798099543
0.0961662931283654
1.14725957703189e-88
PXDN
cgl0174683
23.9511718057647
0.295319532374164
7.39618731603954e-88
cg05402891
-23.8350542519118
-0.373670250543354
2.93252937634107e-87
TCL1B;TCL1B
cg09705456
23.3490589807446
0.210143971321384
9.35884678129709e-85
MACROD1
cg26915558
23.1210533816836
0.0822898815853444
1.39907948789949e-83
LRP5
cg08543028
-22.6387087913665
-0.328052116037539
4.26403370420953e-81
cgl6528272
21.6286024232804
0.053475603374374
6.65505861184997e-76
cg27166177
-21.6271132803194
-0.331563103411799
6.77322569566603e-76
cg26016985
21.4605247766599
0.226261227970375
4.84826072388741e-75
PTK2;PTK2
cg03014882
21.1717658527072
0.13382164252068
1.46467393073782e-73
ARRDC2; ARRDC2
cg22112832
-20.9613218337541
-0.176479507312629
1.75030011557888e-72
cg23780491
20.9238472619629
0.0670899605138615
2.72166567038099e-72
Cllorf41
cgl3678641
-20.5178174043647
-0.0397400869116685
3.2311097279959e-70
AURKB
cg01056358
20.4899158617352
0.0461316238097735
4.484464723 8687e-70
RPS6KA2;RPS6KA2
cgl2840248
-20.4839427590406
-0.0622173652904327
4.81042009789901e-70
HLA-DMB;HLA-DMB
cgl5547534
-20.4690790131596
-0.0449097703249518
5.72804651277033e-70
C7orf47
cg27362010
-20.3897825392049
-0.239887691946526
1.45340061462409e-69
LUC7L;LUC7L
cgl4848772
-20.3052009936855
-0.339942898527632
3.92162560099559e-69
HIST1H2AG
cg03042666
20.2440141491058
0.0621993782983301
8.0379934887147e-69
HDAC4
cg20392842
-20.142185877394
-0.192209005636367
2.65177771469104e-68
HLA-DMB
cg25743481
-20.1154639390522
-0.157784186533844
3.62665880890988e-68
KIF15;KIF15;KIAA1143
cg26808293
-20.0325904728709
-0.105093542024025
9.57218843623273e-68
TNFRSF12A
cgl1037750
19.9875925091209
0.266855054403451
1.62091137542181e-67
TGFB1
cgl7202086
-19.9719953298246
-0.0758238248120152
1.94548680372647e-67
PAK1;PAK1
cg02743256
19.9428844099124
0.0681002684484072
2.73495728024055e-67
MAD 1L1 ;MAD 1L1 ;MAD 1L1
cg08224212
-19.8882644196517
-0.0497779059636209
5.18079323310913e-67
ABTB2
cgl6484162
19.8726886963791
0.322466769463586
6.21571059840531e-67
RIC3;RIC3
cgl2833018
-19.8391220936789
-0.235723805730886
9.20255715608429e-67
SCGB2A2
cg00702638
-19.80637429949
-0.141909282773601
1.34934137502409e-66
Kffl5;KIF15;KIAA1143
cg26650359
-19.7187005111089
-0.327877954240187
3.75734635857164e-66
R3HDM2
cg09571345
-19.6004481023578
-0.295035224452567
1.49351313073088e-65
LOC731789
cg24667575
19.5594454828979
0.193840104040632
2.40916497554315e-65
NEURL1B
cgl8236877
19.4223025129318
0.554539521542301
1.19079972083179e-64
CASZ1;CASZ1
cgl9691260
-19.410165046264
-0.32465580259662
1.37155250078369e-64
SPTBN5
cgl8011672
-19.3896473392635
-0.321178661333996
1.74158450557954e-64
cg05460965
-19.3499492583302
-0.292687882517368
2.76431516114991e-64
CDKN1A;CDKN1A
cg04858709
19.3456943367586
0.145117130602548
2.90461220231957e-64
TMEM90A
cgO1504784
19.1522488023607
0.129687574648312
2.7517011960763e-63
KHSRP
cg20805475
-19.101118117751
-0.297657160397298
4.98170168814631e-63
cg00718470
-19.0812804067263
-0.223812620549574
6.27121553015058e-63
cg08111857
18.9937445628112
0.137532377940015
1.73076359943202e-62
CNTNAP1
cg04483460
18.921587756522
0.395308299524849
3.99339472874489e-62
LRP8;LRP8;LRP8;LRP8
cgl8309286
-18.9044341498157
-0.0447843535122213
4.8710015902517e-62
PAK1;PAK1
cgl2965095
18.8803411573071
0.0465457273214285
6.43825450002973e-62
ARRDC2 ;ARRDC2
cg04456029
18.8675538630276
0.13673368577939
7.46542411802466e-62
DTX1
cg22074858
-18.8235822919402
-0.0893182675922927
1.24177452 894425e-61
GBP3;GBP3
cg08639762
-18.7071870359285
-0.297539850093341
4.76934846746937e-61
PHLDA3
cgl6581738
18.6896277946897
0.085119288368767
5.84188051848212e-61
PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 B;PRKAR1 В ;PRKAR1 B;PRKAR1 В
cg05889541
-18.688247657457
-0.0698841990909554
5.93575459742098e-61
cgl3755270
18.6230132172903
0.312074474304152
1.26061462433199e-60
cg23037321
-18.6117687473187
-0.288291757005903
1.43528846714949e-60
MR1
cg20584732
-18.586386985446
-0.206713809812474
1.92363508765653e-60
cg21574271
-18.5743477599658
-0.332620313832444
2.21021758993807e-60
BMPR1B
cg26450149
18.5576267207237
0.273331743859234
2.68031932261211e-60
TNS3
cg09677252
-18.4855182153861
-0.272556826697855
6.15399589658957e-60
cgl0944063
-18.4460712685837
-0.265789338782329
9.69360432355172e-60
SCTR
cg09007236
-18.3696801623355
-0.0477384384574307
2.3352524060024e-59
cg04519462
-18.3443273805519
-0.234714859936164
3.12591632327839e-59
HRNBP3
cg24888989
-18.3389611897011
-0.1070718060058
3.32489050952271e-59
Kffl5;KIF15;KIAA1143
cgl7180633
-18.3368905675475
-0.19757817744139
3.405006947043 84e-59
cg21724796
-18.3317571254605
-0.0495741789571307
3.6120445473222e-59
AURKB
cg20324356
-18.3245450810563
-0.0591968759846633
3.92432738112849e-59
CARS ;CARS ;C ARS ;CARS
cg26600753
18.2928563778667
0.0673808140694911
5.64879965650799e-59
TRIM7;TR1M7;TRIM7;TRIM7;TRIM7
cgl1412248
-18.2664221137429
-0.297499050516227
7.65358790695903e-59
CHRNB4
cgl8499250
18.2406775394683
0.251873471532752
1.0286955017978e-58
CTDSPL;CTDSPL
cg03643998
-18.1515513048997
-0.0927196156625921
2.86104412878835e-58
C1QTNF1;C1QTNF1;C1QTNF1
cg24726783
18.1309252164233
0.0456102552795263
3.62454955135557e-58
SVIL;SVIL
cg07209244
-18.1237355261796
-0.292062037631507
3.93600581779777e-58
NEURL1B
cgl5495463
18.0877302139454
0.190796568935651
5.9469272602808 le-5 8
MBP;MBP;MBP;MBP;MBP;MBP
cg08178956
-18.0205240111492
-0.526901747184591
1.28411392372928e-57
cg06968164
-17.970972778944
-0.258327035178225
2.26403802044296e-57
cg26875135
-17.9616753868566
-0.266823734308043
2.51810529410092e-57
cg06399735
-17.9357822364063
-0.236476796961925
3.38594431098603e-57
PSD3
cg26108976
-17.888518406158
-0.058793838495996
5.81168976502162e-57
KIAA0247
cg22016779
-17.8603933176059
-0.253412180644757
8.01382368076475e-57
DNER
cg26904406
-17.7739530620103
-0.0335275140469841
2.14944105070594e-56
TRAF3IP2;TRAF3IP2;TRAF3IP2;TRAF3IP2 ;TRAF3IP2
cg07596819
17.7644241887274
0.306971877908853
2.39621452909679e-56
STOX2
cg20703579
17.7642683568276
0.0528911634782505
2.40047691969242e-5 6
N4BP3
cg20943461
-17.7628153908177
-0.311586761885111
2.44058538232825e-56
TMC8;TMC6;TMC8
cg23715749
-17.7312485801959
-0.18943023224591
3.49786482831034e-56
GRIK3
cgOO175838
-17.7159745332107
-0.362730639439416
4.16301397835301e-56
DDAH2
cgl4756202
17.677629613035
0.0516785987212949
6.44364368390913e-56
ATP11A;ATP11A
cgO1890836
-17.6691977150782
-0.430388872261105
7.0930935505532e-56
MPRIP;MPRIP
cg02861178
-17.6459985042426
-0.0462860014350513
9.23741267244616e-56
C20orf94
cg05301494
17.639502663871
0.185850491976228
9.94633771759137e-56
RAB4B
cgl5001032
-17.6358486390887
-0.190955072721925
1.03687354293506e-55
DDC;DDC
cg25053413
-17.5564297071973
-0.138564401511779
2.55887536563759e-55
C14orfl82
cgl2449974
17.5230575221341
0.271096309176339
3.73899694990403e-55
COR02B
cgl6005145
-17.4939687897367
-0.0478996537502431
5.20292117406169e-55
PSPC1;PSPC1
cg!1062417
17.4642517425324
0.29489246901848
7.29067844476201e-55
PDE8B;PDE8B;PDE8B;PDE8B;PDE8B
lub_19
PTPN6
eg19693177
cgl9693177_lub_PTPN6-F 5'-TTAGTGGAGTGGTAGTTTTAGA
1862
cgl9693177_lub_PTPN6-R 5'-TCAAAAACTAAACCTCAAATACA
1863
lub_20
PRSS8
cg03363863
cg03363863_lub_PRSS8-F 5'-TGTGGAIGAGTTATTAGTA
1866
cg03363863_lub_PRSS8-R 5'-AIGAAACCCAACCAATAAA
1867
cob 1
BIN2
eg10590292
cgl0590292_cob_BIN2-F 5'-TGTTAGTTTTTATGGAAGTTT
1870
cgl0590292_cob_BFN2Tt 5'-AAAIGAACAAAATACTCAAA
1871
cob 2
MYOIG
cgl0673833
cgl0673833_cob_MYOlG-F 5'-GTTTTATAAGGAGGTTGTGTT
1874
cgl0673833_cob_MYOlG-R 5'-AAIGAAAAACCCTCCAAA
1875
cob_3
BCAT1
cg20399616
cg20399616_cob_BCATl-F 5'-GGTTATGGGGAGGTTG
1878
cg20399616_cob_BCATl-R 5'-GCIGAAACTTAACCAC
1879
cob 6
ARHGEF1
cg24296761
cg24296761_cob_ARHGEFl-F 5'-GATTTGTTGTTGTTGTTTTAG
1882
cg24296761_cob_ARHGEFl-R 5'-CIGCAACATAATCTTACC
1883
cob_9
HOXA3
eg16748008
cgl6748008_cob_HOXA3-F 5'-ATGGTATATTGTAGAGTAATTTG
1886
cgl6748008_cob_HOXA3-R 5'-AIGCC TTCTTTCTTCA
1887
cob 12
COL4A2
cg08924619
cg08924619_cob_COL4A2-F 5'-GGTGATGTTTGTTATTATGT
1890
cg08924619_cob_COL4A2-R 5'-
AAIGACTAATATAAAACTTAATCT
1891
cob_13
RMI2
cg00933696
cg00933696_cob_RMI2-F 5'-GTTATGTGAIGAGATTAGG
1894
cg00933696_cob_RMI24^ 5'-CCIGCCAAACACAAC
1895
cob_16
NCKAP1L
eg16509569
cgl6509569_cob_NCKAPlL-F 5'-
GTGGTTATTATGTTTTTGATATTTG
1898
cgl6509569_cob_NCKAPlL-R 5'-CCCATTATTCATACTTACCTTCTTA
1899
cob_17
TNFAIP8L2
cg23612220
cg23612220_cob_TNFAIP8L2-F 5'-GTAATGGTGGTAGAGGAAT
1902
cg23612220_cob_TNFAIP8L2-R 5'-AAAACT AAAC T AAACTCTAC AAA
1903
cob_18
MAFK
cgl6622899
cgl6622899_cob_MAFK-F 5'-GTIGTAGATGATTTGTATTAGG
1906
cgl6622899_cob_MAFK-R 5'-CCCCACAACAACAACT
1907
cob_20
OGFOD3
cgl1252953
cgl 1252953_cob_OGFOD3-F 5'-TTAGGGGTTATGGAAGGAG
1910
cgl 1252953_cob_OGFOD3-R 5'-CACTTTAACCACTTCCTTTT
1911
brb_l
GPvASP
cg00817367
cg00817367_br_GRASP-F 5'-GATTTTTTATAGGGTTTGTTGAT
1914
cg00817367_br_GRASP-R 5'-CATAAAAIGIGAAATTAAAAACCA
1915
brb_2
0TX1
cg07974511
cg0797451 l_br_OTXl-F 5'-IGTTGAGTATATTAGTTGTTTT
1918
cg0797451 l_br_OTXl-R 5'-AACTAC1GCCCTAACC
1919
brb_3
F2RL3
cg08066035
cg08066035_br_F2RL3-F 5'-TGATTTTAGGAAAGGTTTAGA
1922
cg08066035_br_F2RL3-R 5'-TACCAAACCAACAAAATACAA
1923
brb_4
CUEDC1
cg07665510
cg07665510_br_CUEDCl-F 5'-AGGAGGTTTTTATAGTTTTATGGT
1926
cg07665510_br_CUEDC 1-R 5'-AAAAACTCCCCTCCAATAAAAA
1927
brb_6
CA3
cgl7480760
cgl7480760_br_CA3-F 5'-AGGGGTTAGGAGTTAC
1930
cgl7480760_br_CA3-R 5'-AAAACCAATAAATTCCAAAA
1931
brb_7
ITGA5
cg03826594
cg03826594_br_ITGA5-F 5'-GAGTTIGTTTTTAGTTTTAG
1934
cg03826594_br_ITGA5-R 5'-TCCCTCTCCTTTCTC
1935
brb_8
BBX
cg06818532
cg06818532_br_BBX-F 5'-
TGTGTAATAGTTTATTAGATTGAT
AGAG
1938
cg06818532_br_BBX-R 5'-AACACAAACAATACTAACTACTT
1939
brb_13
PROM1
cg04203238
cg04203238_br_PROMl-F 5'-
GGGGATTTGTTTTAGTTATTTAAA
1942
cg04203238_br_PROMl-R 5'-
AAAAAATTAAACAAACACCTCTA
1943
brb_15
KLF6
cgl3454226
cgl3454226_br_KLF6-F 5'-
1946
cgl3454226_br_KLF6-R 5'-
1947
GTGAGGATTTGTTTGTTTTG
AAACTCCCACTTAAAAACAC
brb_17
UBXN11
cg00768487
cg00768487_br_UBXNl 1-F 5'-GGGGTTAGGAGAGGATAAA
1950
cg00768487_br_UBXNl 1-R 5'-
AAACATATATCACCAAAACTCAA
1951
brb_18
MAML2
cg08141395
cg08141395_br_MAML2-F 5'-TAGTTATIGGAGATTTTTATTTAAT
1954
cg08141395_br_MAML2-R 51-ACTTCCTTCCTATAACTTTTTT
1955
brb_20
MAP3K14
cg00897875
cg00897875_br_MAP3K14-F 5'-TAGGATTGATTTTGTTTTTAAGA
1958
cg00897875_br_MAP3K14-R 5'-CAATAAACAACACATAAACTTTC
1959
brb_22
IFFOl
cg00363813
cg00363813_br_IFFOl-F 5'-GTIGGATGGGGTTGA
1962
cg00363813_br_IFFOl-R 5'-TACTTCCTAACCAAAATACA
1963
lib_l
SCP2
cg00738178
cg00738178_li_SCP2-F 5'-GGTGTAAAGGTGGTTTTGTA
1966
cg00738178_li_SCP2-R 5'-
ATTAACTAACACACAAAACTCTAA
1967
lib_3
PRDM16
cg00401797
cg00401797_li_PRDM16-F 5'-TTIGAGTTTGGTAGATTAGTA
1970
cg00401797_li_PRDM16-R 5'-
CAATCTTCATAACAAAACAAAAAT
1971
lib_5
CACNA1C
cg05579652
cg05579652_li_CACNAlC-F 5'-GAGTGATTGATATTGTTTTTGTTTA
1974
cg05579652_li_CACNAlC-R 5'-ACCAAACACCAATTTCCTATTA
1975
lib_6
B3GNTL1
cgO1826354
cg01826354_li_B3GNTLl-F 5'-TTAGATTTGTTTTGAAAGTAGAA
1978
cg01826354_li_B3GNTLl-R 5'-
CCATAAAACTATCTATTTTCAATA
ATAC
1979
lib_7
NFE2L3
cgl0536999
cgl0536999_li_NFE2L3-F 5'-GGAIGATGTGAAGGA
1982
cgl0536999_li_NFE2L3-R 5'-AIGAACAACAATTAAACTAAA
1983
lib_8
SPP1
cg20261167
cg20261167_li_SPPl-F5'-
1986
cg20261167_li_SPPl-R5'-
1987
TAGTAGTAGTAGGAGGAGGTAG
AATACACAACCCAATAACAAAC
lib_12
CRTC1
cg07614018
cg07614018_li_CRTCl-F 5'-GGIGTTTGGGATTGG
1990
cg07614018_li_CRTCl-R 5'-ACAAACCCCTACAACC
1991
lib_13
TFPI2
cgl6934178
cgl6934178_li_TFPI2-F 5'-GGGGTTTATGGTGTAGG
1994
cgl6934178_li_TFPI2-R 5'-ACCACCCCTCAAACT
1995
lib_18
E2F6
cgl7726575
cgl7726575_li_E2F6-F 5'-AGTGTTGATGTTTAGTAAATG
1998
cgl7726575_li_E2F6-R 5'-CCCAATATCTAACACTATAAATC
1999
lib_20
NSMCE2
cgl6296417
cgl6296417_li_NSMCE2-F 5'-TTTGTTGAAAGTTAGGATTAG
2002
cgl6296417_li_NSMCE2-R 5'-CCTTCCCATATTTATCAATAAAC
2003
Co-6
CYP27A1
cg02930667
5'-
GAGATATTTGTGGTAGTTATAATT TAG
2006
5'-
ATTATACAATAACAACCCAAAATT ACTC
2007
Co-10
ELL
cg06747543
5 '-GAAAGGGTGAGGAGGAATTTTT
2010
5'-
AAAAACCAAAAATAACTCCAAAC ATT
2011
Co-12
FMN2
cg07418387
5'-TAGTTTTGGGAAGTAAAGA
2014
5'-CTCCAAATCATATACCTAACTA
2015
Co-13
DHRS9
cg22129276
5'-AATGGGAGTGATTTAT AGAG
2018
5'-AAATTATACCACCCTAACC
2019
Co-20
EPB41L4A
cgl5536663
5 '-TTT AGTTGAAGGTAGT AAGT
2022
5'-GACAATCACATAACCTTATAAA
2023
Co-21
SEMA3E
cgl4519356
5 '-TAGGT ATGGTGAAAATATGT
2026
5'-TCAATCTAACTCAACTAAAC
2027
Lu-8
CCR7
cg07248223
cg07248223_lu_CCR7-F 5'-TGAGTTTAAGTTTAIGTTTAC
2030
cg07248223_lu_CCR7-R 5'-TCATTTCTCCCTAACAATC
2031
Lu-9
SEMA4A
cg05047401
cg05047401_lu_SEMA4A-F 5'-CGGIGAAAAGTTGTTGT
2034
cg05047401_lu_SEMA4A-R 5'-ACCCTACTACTCACCACTA
2035
Lu-17
ZFP106
cg06794543
cg06794543_lu_ZFP106-F 5'-
2038
cg06794543_lu_ZFP106-R 5'-
2039
TATATTTATGGTGTTAGTTGTATTT AGAAG
ATTAACTACGCCACCTACTC
Lu-19
SIPA1L9
cg02058870
cg02058870_lu_SIPAlLl-F 5'-GTTTGTTTTGGAGGTAGGAAGT
2042
cg02058870_lu_SIPAlLl-R 5'-
TTTAAATTCTTACCAAATACATAT
2043
Lu-21
NTM
cg02877575
cg02877575_lu_NTM-F 5'-
AAATTACGGAGGTTGTTAAATATT
2046
cg02877575_lu_NTM-R 5'-
TCTAACCTATATAACTATAAAATC
TACTC
2047
ZNRF2
cg08549335
cg08549335_br_ZNRF2-F 5'-AAGTAGTTAAAGTGTTTAAGTTAG
2050
cg08549335_br_ZNRF2-R 5'-TCCCAACATACAACATAATA
2051
Br-5
F2RL3
cg08066035
cg08066035_br_F2RL3-F 5'-TGATTTTAGGAAAGGTTTAGA
2054
cg08066035_br_F2RL3-R 5'-TACCAAACCAACAAAATACAA
2055
Br-7
C22orf9
cg07795766
cg07795766_br_C22orf9-F 5'-TCGATTTAAAGGGATAGTC
2058
cg07795766_br_C22orf9-R 5'-AAACCCAAATCTTCCCTAC
2059
Br-8
CUEDC1
cg07665510
cg07665510_br_CUEDCl-F 5'-AGGAGGTTTTTATAGTTTTATGGT
2062
cg07665510_br_CUEDC 1-R 5'-AAAAACTC CCC TCC AATAAAAA
2063
Br-9
GPRC5B
cg07519235
cg07519235_br_GPRC5B-F 5'-GGGTTTTGTTTAGGTGTTT
2066
cg07519235_br_GPRC5B-R 5'-TAACCAATCCTCCCTTTC
2067
Br-11
C7orf23
cg06824394
cg06824394_br_C7orf23-F 5'-
GAAATTATTTGTGAGATTAGGATA
2070
cg06824394_br_C7orf23-R 5'-AAAIGACACAATAACCACTTC
2071
Br-17
PRDM16
cg00401797
cg00401797_br_PRDM16-F 5'-GGGATTTGGAGGAGGTTTT
2074
cg00401797_br_PRDM16-R 5'-
CCTCACATCTTATTTATCATATCTA
2075
Br-18
PITX1
cg00396667
cg00396667_br_PITXl-F 5'-
2078
cg00396667_br_PITXl-R 5'-
2079
ATTIGGAGTGGGAAGTG
GTACC AATACAACAAC T AAC
IGGA/BHQ1/-3'
TTTIGGAA/BHQ1/-3'
lub_16
FERMT3
cgO1447914
cg01447914_lub_FERMT3-M 576-
FAM/ATTGGGGAGTCGTATATIGG/
BHQ1/-3'
1860
cgO 1447914_lub_FERMT3-NM
5 7HEX/GTTATTGGGGAGTTGTAT A
TIGG/BHQ1/-3'
1861
lub_19
PTPN6
cgl9693177
cgl9693177_lub_PTPN6-M 576-
FAM/AGGIGGTTCGGTATTGG/BHQ
1/-3'
1864
eg 19693177_lub_PTPN6-NM
57HEX/AGGIGGTTTGGTATTGGG/B
HQ1/-3'
1865
lub_20
PRSS8
cg03363863
cg03363863_lub_PRSS8-M 576-
FAM/GTTTGGTTACGTAGGGTTTTT
TTAG/BHQ1/-3'
1868
cg03363863_lub_PRSS8-NM
5 7HEX/GTTTGGTT ATGT AGGGTTTT
TTT AGG/BHQ1 /-3'
1869
cob 1
BIN2
cgl0590292
cgl0590292_cob_BIN2-M 576-
FAM/TGGGAGAGCGGGAGAT/BHQ
1/-3'
1872
cgl0590292_cob_BIN2-NM
57HEX7TTTGGGAGAGTGGGAGATT
T/BHQ1/-3'
1873
cob_2
MYOIG
cgl0673833
cgl0673833_cob_MYOlG-M 576-
FAM/GAGGGGTCGGATGTTGG/BH
Q1/-3'
1876
cgl0673833_cob_MYOlG-NM
57HEX7GAGGGGTTGGATGTTGGG/
BHQ1/-3'
1877
cob 3
В С ATI
cg20399616
cg20399616_cob_BCATl-M 576-
FAM/GGTAGTGGTACGGAGIG/BHQ
1/-3'
1880
cg20399616_cob_BCATl-NM
57HEX7GTAGTGGTATGGAGIGIG/B
HQ1/-3'
1881
cob_6
ARHGEF1
cg24296761
cg24296761_cob_ARHGEFl-M 576-
FAM/GT1GGATATTGACGTTTAIGTT
/BHQ1/-3'
1884
cg24296761_cob_ARHGEFl-NM
5 7HEX/ATAGTIGGAT ATTGATGTTT
AIGTT/BHQ1/-3'
1885
cob_9
HOXA3
cgl6748008
cgl6748008_cob_HOXA3-M 546-FAM/AGTTGGTCGIGTAGGAG/BHQ
1888
cgl6748008_cob_HOXA3-NM 57HEX7AGTTGGTTGIGTAGGAGG/B
1889
1/-3'
HQ1/-3'
cob 12
COL4A2
cg08924619
cg08924619_cob_COL4A2-M 576-FAM/TTTTTATTATTGCGTIGTTGTT TATGA/BHQ1/-3'
1892
cg08924619_cob_COL4A2-NM
57HEX/TTTTTATTATTGTGTIGTTGT
TTATGATG/BHQ1/-3'
1893
cob_13
RMI2
cg00933696
cg00933696_cob_RMI2-M 576-
FAM/ATTTTAATTIGGCGATTTTTTI
GAAG/BHQ1/-3'
1896
cg00933696_cob_RMI2-NM 57HEX/ATTTTAATTIGGTGATTTTT TIGAAGA/BHQ1/-3'
1897
cob 16
NCKAP1L
cgl6509569
cgl6509569_cob_NCKAPlL-M 576-
FAM/TTTTGAATGATCGIGGTTAGG
G/BHQ1/-3'
1900
eg 165 095 69_cob_NC КАР1L-NM
57HEX/TTTTGAATGATTGIGGTTAG
GGG/BHQ1/-3'
1901
cob_17
TNFAIP8L2
cg23612220
cg23612220_cob_TNFAIP8L2-M 576-FAM/TGTGAAATTTTCGTTTGTATA ATTTTTGG/BHQ1/-3'
1904
cg23612220_cob_TNFAIP8L2-NM 57HEX/TGTGAAATTTTTGTTTGTAT AATTTTTGGG/BHQ1/-3'
1905
cob_18
MAFK
cgl6622899
cgl6622899_cob_MAFK-M 576-
FAM/GIGGTGATACGGGTTTTTTAG/
BHQ1/-3'
1908
cgl6622899_cob_MAFK-NM
57HEX/GIGGTGATATGGGTTTTTTA
GG/BHQ1/-3'
1909
cob_20
OGFOD3
cgl1252953
cgll252953_cob_OGFOD3-M 576-
FAM/GATTAGGGCGAATTTGTTGTT
TG/BHQ1/-3'
1912
cgl 1252953_cob_OGFOD3-NM 57HEX/GATTAGGGTGAATTTGTTG TTTGTG/BHQ1/-3'
1913
brb_l
GRASP
cg00817367
cg00817367_br_GRASP-M 576-FAM//BHQ1/-3'
1916
cg00817367_br_GRASP-NM
57HEX//BHQ1/-3'
1917
brb_2
OTX1
cg07974511
cg0797451 l_br_OTXl-M 576-
FAM/ATGTAGIGTTTCGTAGTTGTA
G/BHQ1/-3'
1920
cg0797451 l_br_OTXl-NM
57HEX/ATGTAGIGTTTTGTAGTTGT
AGG/BHQ1/-3'
1921
brb_3
F2RL3
cg08066035
cg08066035_br_F2RL3-M 5V6-
F AM/AT AGGGTTGTC GTGAGAATA
GT/BHQ1/-3'
1924
cg08066035_br_F2RL3-NM 5VHEX/GATAGGGTTGTTGTGAGAA TAGTG/BHQ1/-3'
1925
brb_4
CUEDC1
cg07665510
cg07665510_br_CUEDCl-M 5V6-FAM/AGGGTCGGGIGGT/BHQ1/-3'
1928
cg07665510_br_CUEDCl-NM 5 VHEX/AGGGTTGGGIGGTG/BHQ1/3'
1929
brb_6
CA3
cgl7480760
cgl7480760_br_CA3-M 5'/6-FAM/GAGGGGCGTGGGTG/BHQ1/-3'
1932
cgl7480760_br_CA3-NM
5VHEX/GGAGGGGTGTGGGTG/BHQ
1/-3'
1933
brb_7
ITGA5
cg03826594
cg03826594_br_ITGA5-M 5V6-
FAM/GTGTTAGGGTTTTCGTATTIG
T/BHQ1/-3'
1936
cg038265 94_br_ITGA5 -NM
5VHEX/AGTGTTAGGGTTTTTGTATT
IGT/BHQ1/-3'
1937
brb_8
BBX
cg06818532
cg06818532_br_BBX-M 546-
FAM/GATGGATGTTTACGTTGTTTA
TAAATT/BHQ1/-3'
1940
cg068185 32_br_BBX-NM
5VHEX/GGATGGATGTTTATGTTGT
TTATAAATT/BHQ1/-3'
1941
brb_13
PROM1
cg04203238
cg04203238_br_PROMl-M 546-
FAM/TTGATTGGATCGGTTGAGTTG
/BHQ1/-3'
1944
cg04203238_br_PROMl-NM
5VHEX/TTGATTGGATTGGTTGAGT
TGT/BHQ1/-3'
1945
brb_15
KLF6
cgl3454226
cgl3454226_br_KLF6-M 576-GGG/BHQ1/-3'
1948
cgl3454226_br_KLF6-NM 5VHEX/GTAGTTAGGTTTGGTTTTTT TTAGGG/BHQ1/-31
1949
brb_17
UBXN11
cg00768487
cg00768487_br_UBXNl 1-M 546-
FAM/AGTTTGTAGTATAAATCGTAT
TATIGT/BHQ1/-3'
1952
cg00768487_br_UBXNl 1-NM 5VHEX/TAGTTTGTAGTATAAATTG TATTATIGTA/BHQ1/-3'
1953
brb_18
MAML2
cg08141395
cg08141395_br_MAML2-M 5V6-
FAM/AATAGTAATCGTATTTTTTAG
AAAGAGT/BHQ1/-3'
1956
cg08141395_br_MAML2-NM 5'/HEX/TAAATAGTAATTGTATTTTT TAGAAAGAGT/BHQ1/-3'
1957
brb_20
MAP3K14
cg00897875
cg00897875_br_MAP3K14-M 5V6-
FAM/TAGTTTTTTATCGAGGTAGGT
AGG/BHQ1/-3'
1960
cg00897875_br_MAP3K14-NM 5VHEX/TTAGTTTTTTATTGAGGTAG GTAGGA/BHQ1/-3'
1961
brb_22
IFFOl
cg00363813
cg00363813_brJFFOl-M 5V6-
FAM/TTTTTTTAGCGTTTGTTGTAG
TTGT/BHQ1/-3'
1964
cg003 63 813_br_IFFO 1 -NM 5VHEX/TATTTTTTTTAGTGTTTGTT GTAGTTGT/BHQ1/-3'
1965
lib_l
SCP2
cg00738178
cg00738178_li_SCP2-M 5V6-
FAM/GTTTTTIGGAAGTCGTTAGGT
G/BHQ1/-3'
1968
cg0073 8178_li_SCP2-NM
57HEX/GTTTTT1GGAAGTTGTTAGG
TGA/BHQ1/-3'
1969
lib 3
PRDM16
cg00401797
cg00401797_li_PRDM16-M 5V6-
FAM/TTTIGGTTTTTCGGGGTTATTA
G/BHQ1/-3'
1972
cg00401797_li_PRDM16-NM
57HEX/TTTIGGTTTTTTGGGGTTAT
TAGG/BHQ1/-3'
1973
lib_5
CACNA1C
cg05579652
cg05579652_li_CACNAlC-M 5V6-FAM/AATAAAAAAAATCGGTGTTT TTATATTTAGT/BHQ1/-3'
1976
cg05579652_li_CACNAlC-NM S'/HEX/AAATAAAAAAAATTGGTGT TTTTATATTT AGT/BHQ1 /-3'
1977
lib_6
B3GNTL1
cgO1826354
cg01826354_li_B3GNTLl-M 576-FAM/AAT AGTT AATC GTTGTTTATA TTGGGG/BHQ1/-3'
1980
cgO 1826354_li_B3GNTL 1-NM
5VHEX/AATAGTTAATTGTTGTTTAT
ATTGGGGT/BHQ1/-3'
1981
lib_7
NFE2L3
cgl0536999
cgl0536999_li_NFE2L3-M 576-
FAM/TGTTTTTAAGAACGATTTTTTI
GGT/BHQ1/-3'
1984
cgl0536999_li_NFE2L3-NM 5'/HEX/TATGTTTTTAAGAATGATTT TTTIGGTT/B HQ 1 /-3'
1985
lib_8
SPP1
cg20261167
cg20261167_li_SPPl-M 5У6-FAM/TTTTTTAGTTAAACGTIGATT AAGGTAT/BHQ1/-3'
1988
cg20261167_li_SPPl-NM 57HEX/TTTTTTAGTTAAATGTTGAT TAAGGTATAG/BHQ1/-3'
1989
lib_12
CRTC1
cg07614018
cg07614018_li_CRTCl-M 576-FAM/GGTIGAGCGTGTT1GT/BHQ1/3'
1992
cg07614018_li_CRTCl-NM
5YHEX/GAGGTIGAGTGTGTTIGT/BH
Q1/-3'
1993
lib_13
TFPI2
cgl6934178
cgl6934178_li_TFPI2-M 576-
FAM/TGTTTTAGGCGGTT1GGG/BH
Q1/-3'
1996
cgl6934178_li_TFPI2-NM
5YHEX/TGTTTTAGGTGGTTIGGGTG
/BHQ1/-3'
1997
liblS
E2F6
cgl7726575
cgl7726575_li_E2F6-M 576-FAM/ATATTATTGTGGAATCGTTTT ATTTTTGT/BHQ1/-3'
2000
cgl7726575_li_E2F6-NM 5'/HEX/ATATTATTGTGGAATTGTTT T ATTTTTGTTT/BHQ1 /-3'
2001
lib_20
NSMCE2
cgl6296417
cgl6296417_li_NSMCE2-M 576-FAM/TGTTATAGTTTATTAAAGACG TT AGTGAGA/B HQ 1/-3'
2004
cgl6296417_li_NSMCE2-NM 5'/HEX/TGTTATAGTTTATTAAAGA TGTTAGTGAGATA/BHQ1/-3'
2005
Co-6
CYP27A1
cg02930667
576-
FAM/GTAAIGTATATTATTGTCGGT TATAA/BHQ1/-3'
2008
5YHEX/GTAAIGTATATTATTGTTGG TTATAATA/BHQ1/-3'
2009
Co-10
ELL
cg06747543
576-
FAM/TTTATTTTTAGGTCGAGTGAT TAGTT/BHQ1/-3'
2012
5YHEX/AATTTATTTTTAGGTTGAGT GATTAGTT/BHQ1/-3'
2013
Co-12
FMN2
cg07418387
576-
FAM/GGGTGATTTTTCGAATTTGTG /BHQ1/-3'
2016
5YHEX/GGGTGATTTTTTGAATTTGT GTT/BHQ1/-3'
2017
Со-13
DHRS9
cg22129276
5V6-
FAM/ATTTAGGTATTTCGATTTTAA GAGGA/BHQ1 /-3'
2020
5VHEX/ATTTAGGTATTTTGATTTTA AGAGGATT/BHQ1/-3'
2021
Со-20
EPB41L4A
cgl5536663
5V6-
FAM/GGGTGGTTCGTAGGGT/BHQ1 A3'
2024
5VHEX/GTGGGTGGTTTGTAGGGT/B HQ1/-3'
2025
Со-21
SEMA3E
cgl4519356
5'16-
FAM/TTGATATATCGTTATATTTGA GAGGG/BHQ1 /-3'
2028
5VHEX/TTTTGATATATTGTTATATT TGAGAGGG/BHQ1/-3'
2029
Lu-8
CCR7
cg07248223
cg07248223_lu_CCR7-M 5V6-
FAM/GGTIGAGTTTCGAGGTTT/BH
Q1/-3'
2032
cg07248223_lu_CCR7-NM
5VHEX/AGGTIGAGTTTTGAGGTTT/
BHQ1/-3'
2033
Lu-9
SEMA4A
cg05047401
cg05047401_lu_SEMA4A-M 5V6-
FAM/TGTATTTAGTCGGGGTAGTTG
T/BHQ1/-3'
2036
cg0504740 l_lu_SEMA4A-NM 5VHEX/TTGTATTTAGTTGGGGTAG TTGTT/BHQ1/-3'
2037
Lu-17
ZFP106
cg06794543
cg06794543_lu_ZFP106-M 5V6-FAM/TTGGTGATAGC GTTTAT ATTT AATTT/BHQ1/-3'
2040
cg06794543_lu_ZFP 106-NM
5VHEX/TTGGTGATAGTGTTTATATT
TAATTTTT/BHQ1/-3'
2041
Lu-19
SIPA1L9
cg02058870
cg02058870_lu_SIPAlLl-M 5У6-
FAM/AGGTIGTTTTTCGGTGTTAG/B
HQ1/-3'
2044
cg02058870_lu_SIPAlLl-NM
5VHEX/TAGGTIGTTTTTTGGTGTTA
GA/BHQ1/-3'
2045
Lu-21
NTM
cg02877575
cg02877575_lu_NTM-M 5V6-FAM/GGAGGTTTTAGAACGTTTTA GAATTG/BHQ1/-31
2048
cg02877575_lu_NTM-NM 5VHEX/TGGAGGTTTTAGAATGTTT TAGAATTG/BHQ1 /-3'
2049
ZNRF2
cg08549335
cg08549335_br_ZNRF2-M 5Y6-
FAM/TTTTGAGATCGGTTGTTTTAT
TAGTT/BHQ1/-3'
2052
cg08549335_br_ZNRF2-NM 5VHEX/TTTTGAGATTGGTTGTTTTA TTAGTTG/BHQ1/-3'
2053
Br-5
F2RL3
cg08066035
cg08066035_br_F2RL3-M 576-
FAM/ATAGGGTTGTCGTGAGAATA
GT/BHQ1/-3'
2056
cg08066035_br_F2RL3-NM 5VHEX/GATAGGGTTGTTGTGAGAA TAGTG/BHQ1/-3'
2057
Br-7
C22orf9
cg07795766
cg07795766_br_C22orf9-M 576-
FAM/AGGGAGATAGTATTCGTTTT
ATTTTTG/BHQ1/-3'
2060
cg07795766_br_C22orf9-NM 5VHEX/AGGGAGATAGTATTTGTTT TATTTTTGT/BHQ1/-3'
2061
Br-8
CUEDC1
cg07665510
cg07665510_br_CUEDCl-M 576-FAM/AGGGTCGGGIGGT/BHQ1/-3'
2064
cg07665510_br_CUEDCl-NM 5VHEX/AGGGTTGGGIGGTG/BHQ1/3'
2065
Br-9
GPRC5B
cg07519235
cg07519235_br_GPRC5B-M 576-FAM/T AATGTGGCGIGTGGG/B HQ 1/ -3'
2068
cg07519235_br_GPRC5B-NM
5VHEX/TTAATGTGGTGIGTGGGT/B
HQ1/-3'
2069
Br-11
C7orf23
cg06824394
cg06824394 br C7orf23-M 576-FAM/TTTTCGATGTTTTTAGAATTT GTAGT/BHQ1/-31
2072
cg06824394 br C7orf23-NM 5YHEX/TTTTTTTGATGTTTTTAGAA TTTGTAGT/BHQ1/-3'
2073
Br-17
PRDM16
cg00401797
cg00401797_br_PRDM16-M 576-
FAM/GTTTTTCGGGGTTATTAGGTA
TTG/BHQ1/-3'
2076
cg00401797_br_PRDM16-NM
5YHEX/GTTTTTTGGGGTTATTAGGT
ATTGA/BHQ1/-3'
2077
Br-18
PITX1
cg00396667
cg00396667_br_PITXl-M 576-FAM/GTTTGIGAGTCGGGGT/BHQ113'
2080
cg00396667_br_PITXl-NM
5YHEX/GGTTTGIGAGTTGGGGT/BH
Q1/-3'
2081
АСА
BRCA
cg22532061
ELAC1
cg22532061_brs_ELACl-F 5'-GIGGTAGGGTATATTAGAG
2118
cg22532061_brs_ELACl-R 5'-GCTCCCCAAACTTAAATCC
2119
COAD
cgO1452506
DNAJB12
cg01452506_cos_DNAJB12-F 5'-GGATATAGTIGTTGTGTTT
2122
cg01452506_cos_DNAJB12-R 5'-CCATAAAATCCAACAAAAATAA
2123
COAD
cg04346272
NME1
cg04346272_cos_NMEl-F 5'-AGAGAAGAAAGTAAGTAGTTAAT
2126
cg04346272_cos_NMEl-R 5'-TTCCTCTTAAAAATAAACAATCAT
2127
COAD
cg07797431
NIPBL
cg07797431_cos_NIPBL-F 5'-GTTAGGAGTTGGAGATTAG
2130
cg07797431_cos_NIPBL-R 5'-TTCTCCTACCTCAACTTAC
2131
COAD
cg08601574
PYGB
cg08601574_cos_PYGB-F 5'-
TAAGTAAATAGTTGGTATTTTTAG
2134
cg08601574_cos_PYGB-R 5'-TIGAAAAAACTAATTACAACTTA
2135
COAD
cgl2090388
RPL11
cgl2090388_cos_RPLll-F 5'-GTGAGTAGTTGGGATTTGG
2138
cgl2090388_cos_RPLl 1-R 5'-AACATTAIGAACTCCATATTC
2139
COAD
cgl5096432
LGR6
cgl5096432_cos_LGR6-F 5'-TGGTGGGATTTTAGTTTTAGG
2142
cgl5096432_cos_LGR64^ 5'-
AAACTATAAACAACTCAACTAATT
АТС
2143
COAD
cgl6066221
CCDC55
cgl6066221_cos_CCDC55-F 5'-GGAAAGAAAGGGATTTTTATAGG
2146
cgl6066221_cos_CCDC55-R 5'-CCCTTTTCCATACTCTATC
2147
COAD
cgl7542225
HMMR
cgl7542225_cos_HMMR-F 5'-GGGATAGAATTGGAATTAGTG
2150
cgl7542225_cos_HMMR-R 5'-CCCACCCACCCAATC
2151
COAD
cg22288235
GAK
cg22288235_cos_GAK-F 5'-GAGTTTAIGGTATTTATTAAATAG
2154
cg22288235_cos_GAK-R 5'-GACTACAAACCAAAATAAAAAA
2155
COAD
cg22946679
PPP1R10
cg22946679_cos_PPPlR10-F 5'-
2158
cg22946679_cos_PPPlR10-R 5'-
2159
GGTGGTTATGGGGTTT
AACCCTAAIGAAAAAATAAATACC
KIRC
cgl6419354
FAM163A
cgl6419354_kis_FAM163A-F 5'-GAGTTTGGGGTTAGGATA
2162
cgl6419354_kis_FAM163A-R 5'-TIGCCIGCTCTAAAA
2163
KIRC
eg13944175
HAS1
cgl3944175_kis_HASl-F 5'-GTTTTTAGGGTTGGTGGTAG
2166
cgl3944175_kis_HASl-R 5'-GIGTCCTCATAATAATAAATAAC
2167
KIRC
cg06135139
BHLHE23
cg06135139_kis_BHLHE23-F 5'-ATGTTGAGTIGTAGAGAT
2170
cg06135139_kis_BHLHE23-R 5'-CAAAIGAIGAAAAACAA
2171
KIRC
cg02237470
NPBWR1
cg02237470_kis_NPBWRl-F 5'-GTAGAATIGGGTTTTAGGA
2174
cg02237470_kis_NPBWRl-R 5'-AIGAAAIGTTATCCATCTC
2175
KIRC
eg14047094
cgl4047094_kis_-F 5'-GTTTIGGGAAATTTGTG
2178
cgl4047094_kis_-R5'-AAATCCCAAACCAAATAAAC
2179
KIRC
cg24496475
NKX1-1
cg24496475_kis_NKXl-l-F 5'-GTGIGGGTTTIGAATT
2182
cg24496475_kis_NKXl-l-R 5'-GAIGAAAAACIGACATAAAC
2183
KIRC
cg22346124
ASCL2
cg22346124_kis_ASCL2-F 5'-TAGGAAGGTGTAGGTAGAG
2186
cg22346124_kis_ASCL2-R 5'-CACCACTAAACCTCCTATC
2187
KIRC
eg19292062
CSNK2A1
cgl9292062_kis_CSNK2Al-F 5'-TGGTTGTTTTTTAGGTATTTG
2190
cgl9292062_kis_CSNK2ALR 5'-CAACCTIGCTCTAATCC
2191
KIRC
cgl8485844
ASCL2
cgl8485844_kis_ASCL2-F 5'-GTAGGAAGGTGTAGGTAGAG
2194
cgl8485844_kis_ASCL2-R 5'-CCACTAAACCTCCTATCC
2195
KIRC
cgl8279094
FOXD3
cgl8279094_kis_FOXD3-F 5'-GGTAGIGTTTATGGTTATTTATTA
2198
cgl8279094_kis_FOXD3-R 51-
C AAAAAC TATCIGAAAAATAAC A
2199
LIHC
cg23217126
DOK6
cg23217126_lis_DOK6-F 5'-GAAGGTGAGIGTTAGAA
2202
cg23217126_lis_DOK6-R 5'-GAAATIGCCTACAAAAC
2203
LIHC
cg21217886
HSPB1
cg21217886_lis_HSPBl-F 5'-
2206
cg21217886_lis_HSPBl-R5'-
2207
GGGAAAAATAGGATTTTTGAT
AAIGCTAAAATTACAAAACA
LIHC
cg20979703
PYGB
cg20979703_lis_PYGB-F 5'-TTTTGTIGGGTTTGTTT
2210
cg20979703_lis_PYGB-R 5'-
CTCATAACTAAAATCTCTAATATA
АТС
2211
LIHC
cgl7213048
ATAD2
cgl7213048_lis_ATAD2-F 5'-GAATTGTGGTGTAGTTAGAAG
2214
cgl7213048_lis_ATAD2-R 5'-CTCCCATCTACCTTAAAATTC
2215
LIHC
eg12362404
KCTD14
cgl2362404_lis_KCTD14-F 5'-TTTAGGATGGGTTTGAAATAG
2218
cgl2362404_lis_KCTD14-R 5'-ACTCAAAACTAACAAAAATATTC
2219
LIHC
cgl2199165
MGEA5
cgl2199165_lis_MGEA5-F 5'-GGATAGAAIGTGTTAGTG
2222
cgl2199165_lis_MGEA5-R 5'-GAIGATAACIGAAACTAC
2223
LIHC
cg09910998
SGCE-PEG10
cg09910998_lis_SGCE-PEG10-F 5'-GAGTATGIGGTGAGG
2226
cg09910998_lis_SGCE-PEG10-R 5'-TTCTAAAATACTACTCCATCTC
2227
LIHC
cg03550506
DEPDC5
cg03550506_lis_DEPDC5-F 5'-TGTGGGGAGATTATTGAG
2230
cg03550506_lis_DEPDC5-R 5'-CCTIGAACACTAAAACC
2231
LIHC
cg03404362
ULK1
cg03404362_lis_ULKl-F 5'-GGGGTAAGGAATTAATATTGAG
2234
cg03404362_lis_ULKl-R 5'-CATTAIGAAACIGAAT AAAC
2235
LIHC
cg00477582
CAPN10
cg00477582_lis_CAPN10-F 5'-TTGTAATGAGAGGTTTGTTAAT
2238
cg00477582_lis_CAPN10-R 5'-CTAAATATIGCAAAAAACTCTT
2239
LUAD
cg00980698
RNASE6
cg00980698_lus_RNASE6-F 5'-GTGTTTAGGATGTTAGATTAG
2242
cg00980698_lus_RNASE6-R 5'-TCTTTACTATCTTCCCTATTC
2243
LUAD
cg03781098
GDF3
cg03781098_lus_GDF3-F 5'-
GTTTGGTTTAAAGTTAGAATTAAT
2246
cg03781098_lus_GDF3-R 5'-
CAAC CTCTAAATT ATTAAACAATC
2247
LUAD
cg05214511
cg05214511_lus_-F5'-
2250
cg05214511_lus_-R5'-
2251
ATTGAGAAATTTTAAATAGGTATT AT
GCTCTATTTATATACTTTTAATTTT TCAT
LUAD
cg05875696
BICD2
cg05875696_lus_BICD2-F 5'-TTAGGGGTGATGGTAGTG
2254
cg05875696_lus_B!CD2-R 5'-CCCAAAAAACTACTAACTCCTAA
2255
LUAD
cg08535411
GAL-KMT
cg08535411_lus_GAL-KMT-F 5'-GAATTTIGGGGAGGATT
2258
cg0853541 l_lus_GAL-KMT-R 5'-ACCTAAACCCCACCAAA
2259
LUAD
cg08821811
RMI2
cg08821811_lus_RMI2-F 5'-
TGTAGATTTTTTIGATATTATTATT
2262
cg0882181 l_lus_RMI2-R 5'-TAAACCCCAACTAACAACTA
2263
LUAD
cgl1959316
PPAP2B
cgl 1959316_lus_PPAP2B-F 5'-TTTGGGAGTAGTTTATTAGGTAA
2266
cgl 1959316_lus_PPAP2B-R 5'-
CIGCTATACCCAAAAATATAATAA
2267
LUAD
cgl7252884
SH3BP5
cgl7252884_lus_SH3BP5-F 5'-
TGAAAAGGTTAGTTAGTAATTTAG
2270
cgl7252884_lus_SH3BP5-R 5'-
AATATTTCCTACCTAACTCTAAAA
2271
LUAD
cg23526087
RAD51L1
cg23526087_lus_RAD51Ll-F 5'-GGGGGATAAAGGAGAAG
2274
cg235 260 87_lus_RAD51L1 -R 5 '-CAAAATTTCCCTCAATTTCC
2275
LUAD
cg27525876
ZNF778
cg27525876_lus_ZNF778-F 5'-ATGTAAGTAGTGTGGTAAAGT
2278
cg27525876_lus_ZNF778-R 5'-CCACAATCCTTACATTCATAA
2279
PAAD
cg02365862
DSP
cg02365862_pas_DSP-F 5'-GGGGATIGAGGAAATTTT
2282
cg02365862_pas_DSP-R 5'-AACCCAAAIGCCCTAA
2283
PAAD
cg05299198
GLBL1
cg05299198_pas_GLBLl-F 5'-GAGAATTTTTATTAGGGTTTTG
2286
cg05299198_pas_GLBLl-R 5'-TCAACAACIGCTAAACATC
2287
PAAD
cg07881228
PLEKHA8
cg07881228_pas_PLEKHA8-F 5'-
2290
cg07881228_pas_PLEKHA8-R 5'-
2291
AGTIGAGGGTTTAGGT
CAIGCTATTCACAAAAAA
PAAD
cgl0733616
ADD1
cgl0733616_pas_ADDl-F 5'-GGAGGGTAGGGTTTTT
2294
cgl0733616_pas_ADDl-R 5'-AAIGCCAAATCATAACTTC
2295
PAAD
cg05513509
RBBP8
cg05513509_pas_RBBP8-F 5'-TGGGGTTGTGTTTGAT
2298
cg05513509_pas_RBBP8-R 5'-GAAAAAIGCTTCCTCA
2299
PAAD
cg06663668
CD3EAP
cg06663668_pas_CD3EAP-F 5'-GGGTTTTTGATTTTAGTAATATAG
2302
cg06663668_pas_CD3EAP-R 5'-TIGACTCCIGATCTA
2303
PAAD
cg07911682
FAF1
cg07911682_pas_FAFl-F 5'-GIGTIGAGGGGTT
2306
cg07911682_pas_FAFl-R 5'-CIGAAAIGCCTAAAAATTAC
2307
PAAD
cg24038180
ECHS1
cg24038180_pas_ECHSl-F 5'-GAIGTAGGATAGTAGGATA
2310
cg24038180_pas_ECHSl-R 5'-GAAAIGAACCCTAAAAAAC
2311
PAAD
cg00371627
PTPN12
cg00371627_pas_PTPN12-F 5'-TIGIGATTATTTATTGTTTAT
2314
cg00371627_pas_PTPN12-R 5'-TTACCTIGACCCTCCTA
2315
PAAD
cgl2271199
JUN
cgl2271199_pas_JTJN-F 5'-TGGGTTGAAGTTGTTGA
2318
eg 12271199_pas_JUN-R 5 '-TCAAIGAAACAAACATAATAA
2319
TGTATGGGTGGAGTATTT ATAG
FAM/ATTTTTATTCGTTTG
TTTTATGATAGAGAT/BH
Q1/-3'
5УНЕХ/ТТТАТТТТТАТТТ
GTTTGTTTTATGATAGAG
AT/BHQ1/-3'
BRCA
cg0200 1200
HCG14
cg02001200_brs_HCG14-F 5'-
TTATAGGGATTATTATAT GGGTAA
cg02001200_brs_HCG14-M 5V6-
FAM/GTTIGIGTCGAGGGA T/BHQ1/-3'
2088
cg02001200_brs_HCG14-NM
5VHEX/TGTTIGIGTTGAGG GAT/BHQ1/-3'
2089
BRCA
cg0314 2856
TCTEX1 D4
cg03142856_brs_TCTEXlD4 -F5'-
AAGAGIGAGGTGTTG
cg03142856_brs_TCTEXlD4 -M 5V6-
FAM/GGTTAGTTTATCGIG 1GTT/BHQ1/-3'
2092
cg03142856_brs_TCTEXlD4 -NM
5VHEX/AGGTTAGTTTATT G1GIGTT/BHQ1/-3'
2093
BRCA
cg0556 2828
ZZEF1
cg05562828_brs_ZZEFl-F 5'-
GTTGGTGTTGGTTTAGTT AT
cg05 562 828_brs_ZZEF 1 -M 5V6-
FAM/TTTAGATGGAIGCG TTTGTTT/BHQ1/-3'
2096
cg05562828_brs_ZZEFl-NM 5VHEX/GGTTTAGATGGAI GTGTTTGTTT/BHQ1/-3'
2097
BRCA
cgO809 6946
DIRC2
cg08096946_brs_DIRC2-F 5'-GGGTTGGGGGTTTTT
cg08096946_brs_DIRC2-M 5V6-
FAM/TTGTTGGCGTTIGTT TAGG/BHQ1/-3'
2100
cg08096946_brs_DIRC2-NM 5VHEX/TTGTTGGTGTTTG TTTAGGG/BHQ1 /-3'
2101
BRCA
eg1287 0876
ICA1L
cgl2870876_brs_ICAlL-F 5'-
GTTTGAGGGGGAATAGG
cgl2870876_brs_ICAlL-M 5V6-
FAM/TIGTTTTTTCGTTTT TTIGGG/BHQ1/-3'
2104
cgl2870876_brs_ICAlL-NM 5VHEX/TIGTTTTTTTGTTT TTTIGGGT/BHQ1/-31
2105
BRCA
eg1540
RPS15
cgl5408407_brs_RPS15-F 5'-
cgl5408407_brs_RPS15-M
2108
cgl5408407_brs_RPS15-NM
2109
8407
TTTTGAGGATTIGGTAAG A
5У6-
FAM/GGTGAGTGTTGCGA TTTGG/BHQ1/-3'
5'/HEX/TGGTGAGTGTTGT GATTTGG/BHQ1 /-3'
BRCA
cgl821 9532
DMTF1
eg 182195 32_brs_DMTF 1 -F
5'-
TAGTATTGAGATTATTGG
cgl8219532_brs_DMTFl-M
5У6-
FAM/GAATTATGAAAATC GGTAIGIGA/BHQ1 /-3'
2112
cgl 8219532_brs_DMTF 1-NM
5yHEX/GGAATTATGAAA ATTGGTAIGIGA/BHQ1/-3'
2113
BRCA
cg2137 8238
CACNA1
cg21378238_brs_CACNAlE-F5'-
TTTTTAGAAATTGGGTAT TTTTAAG
cg2137823 8_brs_CACNA 1EM 5У6-
FAM/GTTTTATTATTCGTT TTTTTTTTTTTTTTTTT/BH Q1/-3'
2116
cg21378238_brs_CACNAlE-NM
5'/HEX/AGTTTTATTATTT GTTTTTTTTTTTTTTTTTT TT/BHQ1/-3'
2117
BRCA
cg2253 2061
ELAC1
cg2253206 l_brs_ELAC 1 -F 5'-
GIGGTAGGGTATATTAGA G
cg22532061 _brs_ELAC 1 -M 5У6-
FAM/TTIGGGATTCGTIGG TT/BHQ1/-3'
2120
cg22532061_brs_ELACl-NM
5'/HEX/TTTTTIGGGATTTG TIGGTT/BHQ1/-3'
2121
COAD
cgO145 2506
DNAJB12
cgO 14525 06_cos_DNAJB 12-F5'-
GGATATAGTIGTTGTGTT T
cgO 1452506_cos_DNAJB 12-M 5У6-
FAM/TTTGAGGGCGATGT TGATATAG/BHQ1/-3'
2124
cg01452506_cos_DNAJB12-NM
5'/HEX/GGTTTTGAGGGTG ATGTTGATATAG/BHQ1/3'
2125
COAD
cg0434 6272
NME1
cg04346272_cos_NME 1-F 5'-
AGAGAAGAAAGTAAGTA
cg04346272_cos_NMEl-M 5У6-
FAM/GAAAAAGTTAGCGT
2128
cg04346272_cos_NME 1 -NM 5'/HEX/TTGAAAAAGTTA GTGTIGGAAGT/BHQ1/-3'
2129
GTTAAT
1GGAAGT/BHQ1/-3'
COAD
cg0779 7431
NIPBL
cg0779743 l_cos_NIPBL-F 5'-
GTTAGGAGTTGGAGATT AG
cg0779743 l_cos_NIPBL-M
5У6-
FAM/TGGIGGTGCGTTTTT G/BHQ1/-3'
2132
cg0779743 l_cos_NIPBL-NM 5 '/HEX/TGGIGGTGTGTTT TTGTAA/BHQ1/-3'
2133
COAD
cgO860 1574
PYGB
cg08601574_cos_PYGB47 5'-
TAAGTAAATAGTTGGTA
TTTTTAGA
cg08601574_cos_PYGB-M 5У6-
FAM/ATAGAGAAGATCG GGTTTAGTAGG/BHQ1/-3'
2136
cg086015 74_cos_PYGB-NM 5 УНЕХ/GAT AGAGAAGAT TGGGTTTAGTAGG/BHQ1/ -3'
2137
COAD
cgl209 0388
RPL11
cgl 20903 88_cos_RPLl 1-F 5'-
GTGAGTAGTTGGGATTT GG
cgl2090388_cos_RPLl 1-M 5У6-
FAM/TGTTTTTTTTTATTC GTIGTTATTTATGG/BHQ1/ -3'
2140
cgl2090388_cos_RPLl 1-NM 5'/HEX/TGTTTTTTTTTATT TGTIGTTATTTATGGT/BH Q1/-3'
2141
COAD
cgl509 6432
LGR6
cgl5096432_cos_LGR6-F 5'-TGGTGGGATTTTAGTTTT AGG
eg 15 096432_cos_LGR6-M 5У6-
FAM/GTGTAGTATTCGGT TTTTAGGTGG/BHQ1/-31
2144
cgl5096432_cos_LGR6-NM 5 '/HEX/GGTGTAGTATTTG GTTTTTAGGTGG/BHQ1/3'
2145
COAD
cgl606 6221
CCDC55
cgl 606622 l_cos_CCDC55-F 5'-
GGAAAGAAAGGGATTTT TATAGG
cgl6066221_cos_CCDC55-M 5V6-
FAM/AAATTAAGGGCGA GGGATTAAAG/BHQ1 /-3'
2148
cgl6066221_cos_CCDC55-NM
5 УНЕХ/GAT AAATTAAGG GTGAGGGATTAAAGA/B HQ1/-3'
2149
COAD
cgl754
HMMR
eg 17542225_cos_HMMR-F
cgl7542225_cos_HMMR-M
2152
cgl7542225_cos_HMMR-
2153
2225
5'-
GGGATAGAATTGGAATT AGTG
5У6-
FAM/GGAAGTGCGTTTGI GT/BHQ1/-3'
5'/HEX/GGGAAGTGTGTTT GIGTAA/BHQ1/-3'
COAD
cg2228 8235
GAK
cg22288235_cos_GAK-F 5'-GAGTTTAIGGTATTTATT AAATAG
cg22288235_cos_GAK-M 5У6-
FAM/AGAAGTGAGC GTAT TGTGGT/BHQ1/-3'
2156
cg22288235_cos_GAK-NM 5'/HEX/TGAGAAGTGAGT GTATTGTGGT/BHQ1/-3'
2157
COAD
cg2294 6679
PPP1R10
cg22946679_cos_PPP 1R10-F 5'-GGTGGTTATGGGGTTT
cg22946679_cos_PPPlR10-M 5У6-
FAM/TTTTTATTTATGTTT TCGTTAGGGTTTT/BHQ1/3'
2160
cg22946679_cos_PPP 1 Rl 0-NM
5УНЕХ/ТТАТТТТТАТТТА
TGTTTTTGTTAGGGTTTT/
BHQ1/-3'
2161
KIRC
cgl641 9354
FAM163 A
cgl6419354_kis_FAM163A-F5'-
GAGTTTGGGGTTAGGAT A
cgl6419354_kis_FAM163A-M 5У6-
FAM/GGGGTIGCGGTGTT T/BHQ1/-3'
2164
cgl6419354_kis_FAM163A-NM
5'/HEX/TGGGGTIGTGGTG TTTTT/BHQ1/-3'
2165
KIRC
eg1394 4175
HAS1
cgl3944175_kis_HASl-F 5'-GTTTTTAGGGTTGGTGGT AG
cgl3944175_kis_HAS 1-M 546-
FAM/GGGTTTTC GTTAGIG AAGAT/BHQ1 /-31
2168
cgl3944175_kis_HASl-NM 5'/HEX/GGGGTTTTTGTTA GIGAAGAT/BHQ1 /-3'
2169
KIRC
cg0613 5139
BHLHE2 3
cg06135139_kis_BHLHE23-F5'-
ATGTTGAGTIGTAGAGAT
cg06135139_kis_BHLHE23-M 5У6-
FAM/GTTIGAAGGCGTIGT TTT/BHQ1/-3'
2172
cg06135139_kis_BHLHE23 -NM
5'/HEX/TTGTTIGAAGGTG TIGTTTT/BHQ1 /-3'
2173
KIRC
cg0223 7470
NPBWR1
cg02237470_kis_NPBWRl-F 5'-
GTAGAATIGGGTTTTAGG A
cg02237470_kis_NPBWRl -M 5У6-
FAM/GAIGTTAGGTCGTIG GTT/BHQ1/-3'
2176
cg02237470_kis_NPBWRl-NM
5'/HEX/GGAIGTTAGGTTG TIGGTT/BHQ1/-3'
2177
KIRC
cgl404 7094
cgl4047094_kis_-F 5'-GTTTIGGGAAATTTGTG
cgl4047094_kis_-M 5Y6-
FAM/TTTGTGTGCGIGAA
AGTT/BHQ1/-3'
2180
cgl4047094_kis_-NM
5'/HEX/GAATTTGTGTGTG
IGAAAGTTTA/BHQ1/-3'
2181
KIRC
cg2449 6475
NKX1-1
cg24496475_kis_NKX 1 -1 -F 5'-GTGIGGGTTTIGAATT
cg24496475_kis_NKX 1-1 -M 5У6-
FAM/GGTAGCGIGGGAAT GT/BHQ1/-3'
2184
cg24496475_kis_NKX 1-1-NM
5'/HEX/GGTAGTGIGGGAA TGTTTT/BHQ1/-3'
2185
KIRC
cg2234 6124
ASCL2
cg22346124_kis_ASCL2-F 5'-
TAGGAAGGTGTAGGTAG AG
cg22346124_kis_ASCL2-M 5V6-
FAM/TGGTAIGGCGTIGTT AG/BHQ1/-3'
2188
cg22346124_kis_ASCL2-NM 5'/HEX/TGGTAIGGTGTIGT TAGG/BHQ1/-31
2189
KIRC
cgl929 2062
CSNK2A 1
cgl9292062_kis_CSNK2Al-F5'-
TGGTTGTTTTTTAGGTAT TTG
cgl9292062_kis_CSNK2Al-M 5У6-
FAM/GGIGGTCGTTTTTTT TTTTGT/BHQ1/-3'
2192
cgl9292062_kis_CSNK2Al-NM
5'/HEX/GGIGGTTGTTTTTT TTTTTGTTTA/BHQ1/-3'
2193
KIRC
cgl848 5844
ASCL2
eg 184 85844_kis_ASCL2-F 5'-
GTAGGAAGGTGTAGGTA GAG
eg 18485 844_kis_ASCL2-M 5У6-
FAM/GAAAATTGTGGCGT TTTAAGGG/BHQ1/-3'
2196
eg 184 85844_kis_ASCL2-NM 5'/HEX/GGAAAATTGTGG TGTTTT AAGGG/B HQ 1/-3'
2197
KIRC
cgl827
FOXD3
cgl8279094_kis_FOXD3-F
cgl8279094_kis_FOXD3-M
2200
cgl8279094_kis_FOXD3-
2201
9094
5'-
GGTAGIGTTTATGGTTAT TTATTA
546-
FAM/TIGTTGAGTCGGAIG ATT/BHQ1/-3'
57HEX/TIGTTGAGTTGGAI GATTGT/BHQ1/-3'
LIHC
cg2321 7126
DOK6
cg23217126_lis_DOK6-F 5'-GAAGGTGAGIGTTAGAA
cg23217126_lis_DOK6-M 546-
FAM/AGGGTTGGCGIGGT T/BHQ1/-3'
2204
cg23217126_lis_DOK6-NM
5VHEX/GGAGGGTTGGTGI
GGTT/BHQ1/-3'
2205
LIHC
cg2121 7886
HSPB1
cg21217886_lis_HSPBl-F 5'-
GGGAAAAATAGGATTTT
TGAT
cg21217886_lis_HSPBl-M 546-
FAM/AGTGIGGGTCGTTTT TAAG/BHQ1/-3'
2208
cg21217886_lis_HSPBl-NM 5VHEX/AGTGIGGGTTGTT TTT AAGG/BHQ1 A3'
2209
LIHC
cg2097 9703
PYGB
cg20979703_lis_PYGB-F 5'-TTTTGTIGGGTTTGTTT
cg20979703_lis_PYGB-M 546-
FAM/TGGATAGGTCGTTG TIGTT/BHQ1/-3'
2212
cg20979703_lis_PYGB-NM 5VHEX/GTGGATAGGTTGT TGTIGTTT/BHQ1 A3'
2213
LIHC
cgl721 3048
ATAD2
cgl7213048_lis_ATAD2-F 5'-
GAATTGTGGTGTAGTTA GAAG
cgl7213048_lis_ATAD2-M
546-
FAM/AAGAGTTTTTTCGT AAATTATGATTTGT/BHQ 1/-3'
2216
cgl7213048_lis_ATAD2-NM 5VHEX/TTTAAGAGTTTTT TTGTAAATTATGATTTGT /BHQ1A3'
2217
LIHC
cgl236 2404
KCTD14
cgl2362404_lis_KCTD14-F 5'-
TTTAGGATGGGTTTGAA ATAG
eg 12362404_lis_KCTD 14-M 546-
FAM/TTGGGGCGGTIGAT G/BHQ1/-3'
2220
cgl2362404_lis_KCTD14-NM
5VHEX/GTTGGGGTGGTIG ATGA/BHQ1A31
2221
LIHC
cgl219 9165
MGEA5
eg 12199165_lis_MGE A5-F 5'-
GGATAGAAIGTGTTAGTG
cgl2199165_lis_MGEA5-M 5V6-
FAM/ATTTTTTATTATATC GTAGAGGAATIGT/BHQ1/3'
2224
cgl 2199165_lis_MGEA5-NM
5 УНЕХ/ТТТ ATTTTTTATT
ATATTGTAGAGGAATIGT
/BHQ1/-3'
2225
LIHC
cg0991 0998
SGCE-PEG10
cg09910998_lis_SGCE-PEG10-F 5'-
GAGTATGIGGTGAGG
cg09910998_lis_SGCE-PEG10-M 5Y6-FAM/TAIGTTTATTTTTCG TGTTTATIGG/BHQ1/-3'
2228
cg09910998_lis_SGCE-PEG10-NM
5 VHEX/T AIGTTT ATTTTTT GTGTTTATIGGG/BHQ1/-31
2229
LIHC
cg0355 0506
DEPDC5
cg03550506_lis_DEPDC5-F 5'-
TGTGGGGAGATTATTGA G
cg03550506_lis_DEPDC5-M 5V6-
FAM/ATGGATTTATTTCG GATAGATTAGGAG/BHQ1
1-У
2232
cg03550506_lis_DEPDC5-NM
5 VHEX/T ATGGATTTATTT TGGATAGATTAGGAGG/B HQ1/-3'
2233
LIHC
cg0340 4362
ULK1
cg03404362_lis_ULKl-F 5'-GGGGTAAGGAATTAATA TTGAG
cg03404362_lis_ULKl-M 5V6-
FAM/GGIGGGTTCGTTGTT G/BHQ1/-3'
2236
cg03404362_lis_ULKl-NM 5 '/HEX/GGIGGGTTTGTTG TTGG/BHQ1/-3'
2237
LIHC
cg0047 7582
CAPN10
cg004775 82_lis_CAPNl 0-F 5'-
TTGTAATGAGAGGTTTGT TAAT
cg004775 82_lis_C APN10-M 546-
FAM/TTTTGTGTAGGCGTI GATATTTA/BHQ1 /-3'
2240
cg004775 82_lis_CAPNl 0-NM
5 '/HEX/TTTTGTGTAGGTG TIGATATTTAGG/BHQ1/-3'
2241
LUAD
cg0098 0698
RNASE6
cg00980698_lus_RNASE6-F 5'-
cg00980698_lus_RNASE6-M 5V6-
2244
cg00980698_lus_RNASE6-NM
2245
GTGTTTAGGATGTTAGAT TAG
FAM/TTGTAGTTTTGTATT TTTCGAGAGAAG/BHQ1 /3'
5VHEX/TTTTGTAGTTTTG TATTTTTTGAGAGAAG/B HQ1/-3'
LUAD
cg0378 1098
GDF3
cg03781098_lus_GDF3-F 5'-
GTTTGGTTTAAAGTTAGA
ATTAATAG
cg03 781098_lus_GDF3-M 5V6-
FAM/GTTGTTAGATCGGG GAGAGT/BHQ1 /-3'
2248
cg03781098_lus_GDF3-NM 5VHEX/GGTTGTTAGATTG GGGAGAGT/BHQ1/-3'
2249
LUAD
cg0521 4511
cg05214511_lus_-F 5'-
ATTGAGAAATTTTAAAT
AGGTATTAT
cg0521451 l_lus_-M 5V6-FAM/TGGTTATTTTAATT ACGTAGAAATGAATT/BH Q1/-3'
2252
cg05214511_lus_-NM 5VHEX/TTTGGTTATTTTA ATTATGTAGAAATGAAT TT/BHQ1/-3'
2253
LUAD
cg0587 5696
BICD2
cg05875696_lus_BICD2-F 5'-
TTAGGGGTGATGGTAGT G
cg05875696_lus_BICD2-M 5У6-
FAM/GGTTGTTGTTTTTC GTTTT ATTATTTGT/BHQ1 / -3'
2256
cg05875696_lus_BICD2-NM 5VHEX/GGGTTGTTGTTTT TTGTTTTATTATTTGT/BH Q1/-3'
2257
LUAD
cgO853 5411
GAL-KMT
cg0853541 l_lus_GAL-KMT-F5'-
GAATTTIGGGGAGGATT
cg0853541 l_lus_GAL-KMT-
M 5V6-
FAM/AGGIGGCGGTAAGT G/BHQ1/-3'
2260
cg0853541 l_lus_GAL-KMT-NM
5VHEX/AGGIGGTGGTAAG TGTT/BHQ1/-3'
2261
LUAD
cg0882 1811
RMI2
cg08821811_lus_RMI2-F 5'-
TGTAGATTTTTT1GATATT
ATTATTT
cg0882181 l_lus_RMI2-M 5У6-
FAM/GTATTTGTTTGACG GGAAAGAGA/BHQ1/-3'
2264
cg0882181 l_lus_RMI2-NM 5VHEX/GGTATTTGTTTGA TGGGAAAGAGA/BHQ1/-3'
2265
LUAD
cgl195 9316
PPAP2B
cgl 1959316_lus_PPAP2B-F 5'-
TTTGGGAGTAGTTTATTA GGTAA
cgl 1959316_lus_PPAP2B-M 5У6-
FAM/ATAGAGAGTGACG AGTATGTGAT/BHQ1/-3'
2268
cgl 1959316_lus_PPAP2B-NM
5VHEX/TGTTATAGAGAGT GATGAGTATGTGAT/BHQ 1/-3'
2269
LUAD
cgl725 2884
SH3BP5
cgl7252884_lus_SH3BP5-F 5'-
TGAAAAGGTTAGTTAGT AATTTAGT
cgl7252884_lus_SH3BP5-M 5У6-
FAM/TAGTTIGTTTTTTAT ACGGTTTTAAATG/BHQ1/ -3'
2272
cgl7252884_lus_SH3BP5-NM
5'/HEX/TTTTAGTTIGTTTT
TTATATGGTTTTAAATG/
BHQ1/-3'
2273
LUAD
cg2352 6087
RAD51L1
cg23526087_lus_RAD51L1-F5'-
GGGGGATAAAGGAGAA G
cg23526087_lus_RAD51L1-M 5У6-
FAM/GGTTGTGTGTTCGT GTATGTA/BHQ1/-3'
2276
cg23526087_lus_RAD51L1-NM
5VHEX/TGGTTGTGTGTTT GTGTATGTA/BHQ1/-3'
2277
LUAD
cg2752 5876
ZNF778
cg27525876_lus_ZNF778-F 5'-
ATGTAAGTAGTGTGGTA AAGT
cg27525 876_lus_ZNF778-M 5У6-
FAM/TTTATAGGGCGTTT AGGTTTTATTAAAT/BHQ 1/-3'
2280
cg27525876_lus_ZNF778-NM
5VHEX/TTTATAGGGTGTT TAGGTTTTATTAAATATA T/BHQ1/-3'
2281
PAAD
cg0236 5862
DSP
cg02365862_pas_DSP-F 5'-GGGGATIGAGGAAATTTT
cg02365 862_pas_DSP-M 5У6-
FAM/AAGTIGGGTTACGT ATTTTTAGTT/BHQ1 /-3'
2284
cg02365862_pas_DSP-NM 5VHEX/AAAAGTIGGGTTA TGT ATTTTTAGTT/BHQ 1/3'
2285
PAAD
cg0529
GLBL1
cg05299198_pas_GLBLl-F
cg05299198_pas_GLBLl-M
2288
cg05299198_pas_GLBLl-
2289
9198
5'-
GAGAATTTTTATTAGGGT TTTG
5Y6-
FAM/GAGTTTTTTAGTTTI GC GTTTTT ATATT/BHQ113'
5 YHEX/GGAGTTTTTTAGT
TTIGTGTTTTTATATTT/B
HQ1/-3'
PAAD
cg0788 1228
PLEKHA 8
cg07881228_pas_PLEKHA8-F5'-
AGTIGAGGGTTTAGGT
cg07 881228_pas_PLEKHA8-M 5Y6-
FAM/GTTIGTCGTATTTTG GAGGTT/BHQ1/-3'
2292
cg07881228_pas_PLEKHA8-NM
5 YHEX/GTTIGTTGT ATTTT GGAGGTTT/BHQ1 /-31
2293
PAAD
eg1073 3616
ADD1
cgl0733616_pas_ADDl-F 5'-GGAGGGTAGGGTTTTT
cgl0733616_pas_ADDl-M 5V6-
FAM/AGGGGTTIGTCGTA GTTTATT/BHQ1/-3'
2296
cgl0733616_pas_ADDl-NM 5 YHEX/AGGGGTTIGTTGT AGTTTATTTG/BHQ1/-3'
2297
PAAD
cg0551 3509
RBBP8
cg05513509_pas_RBBP8-F 5'-TGGGGTTGTGTTTGAT
cg05513509_pas_RBBP8-M 5V6-
FAM/GGGTTTTTCGIGIGG/ BHQ1/-3'
2300
cg05513509_pas_RBBP8-NM
5 YHEX/TGGGTTTTTTGIGI GG/BHQ1/-3'
2301
PAAD
cg0666 3668
CD3EAP
cg06663668_pas_CD3EAP-F 5'-
GGGTTTTTGATTTTAGTA ATATAG
cg06663668_pas_CD3EAP-M 5V6-
FAM/AGATTTTTTTTTCG GTTTTTTGTTTTG/BHQ1/3'
2304
cg06663668_pas_CD3EAP-NM
5 YHEX/AGATTTTTTTTTT
GGTTTTTTGTTTTGT/BHQ
1/-3'
2305
PAAD
cg0791 1682
FAF1
cg07911682_pas_FAFl-F 5'-GIGTIGAGGGGTT
cg07911682_pas_FAFl-M 5V6-
FAM/AAGIGTT AGGC GTT
2308
cg07911682_pas_FAFl-NM 5YHEX/GGAAGIGTTAGGT GTTTATGTAT/BHQ1 /-3'
2309
TATGTATT/BHQ1/-3'
PAAD
cg2403 8180
ECHS1
cg24038180_pas_ECHS 1-F 5'-
GAIGTAGGATAGTAGGA ТА
cg24038180_pas_ECHSl-M 5V6-
FAM/TTTTTGGATTTTTCG TTIGGTTT/BHQ1/-31
2312
cg24038180_pas_ECHS 1-NM
5VHEX/GTTTTTTGGATTT TTTGTTIGGTTT/BHQ1 /-3'
2313
PAAD
cg0037 1627
PTPN12
cg003 71627_pas_PTPN 12-F 5'-
TIGIGATTATTTATTGTTT AT
cg00371627_pas_PTPN12-M 546-
FAM/TGTAGGTCGGGGGG G/BHQ1/-3'
2316
cg003 71627_pas_PTPN 12-NM
5VHEX/GTGTAGGTTGGG GGGG/BHQ1/-31
2317
PAAD
eg1227 1199
JUN
cgl2271199_pas_JUN-F 5'-TGGGTTGAAGTTGTTGA
cgl2271199_pas_JUN-M
546-
FAM/TIGTTGTCGTTGTTT TTTGTTAT/BHQ1/-3'
2320
eg 12271199_pas_JirN-NM
5YHEX/GTIGTTGTTGTTGT
TTTTTGTTAT/BHQ1/-3'
2321
Несмотря на то, что в настоящем документе были показаны и описаны предпочтительные варианты осуществления настоящего изобретения, специалистам в настоящей области техники будет очевидно, что такие варианты осуществления приведены лишь в качестве примера. Теперь специалистами в настоящей области техники смогут внести многочисленные изменения, модификации и замены без отступления от настоящего изобретения. Следует понимать, что при осуществлении на практике настоящего изобретения могут быть использованы различные альтернативы описанным в настоящем документе вариантам осуществления настоящего изобретения. Предполагается, что приведенная далее формула изобретения определяет объем настоящего изобретения и что таким образом охватываются способы и структуры, входящие в объем настоящей формулы изобретения, и их эквиваленты.
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> ЗЕ РЕДЖЕНТС ОФ ЗЕ ЮНИВЕРСИТИ ОФ КАЛИФОРНИЯ ЮСХЕЛС БАЙОТЕК, ЛИМИТЕД ХОУ, ЖУЙ ЧЖАН, КАН ЧЖЭН, ЛИНХУН
<120> СПОСОБ И СИСТЕМА ОПРЕДЕЛЕНИЯ СТАТУСА ЗЛОКАЧЕСТВЕННОЙ ОПУХОЛИ
<130> 49697-701.601
<140> To be Assigned <141> Filed herewith
<150> 14/986,520
<151> 2015-12-31
<150> 62/104,785 <151> 2015-01-18
<160> 2333
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1
tccaactttt ctccccacct ctcacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca acatcttaaa tacaacaa 118
<210> 2 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 2
tcataatctt cctactacta accacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac tttacttcta ctactacc
118
<210> 3 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 3
acccacaaca aatctacaac cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaata taaacacacc aaaaaccc 118
<210> 4 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 4
tcctcttttt aaaactctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaataaac aaaataccct ccccaatt 118
<210> 5 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 5
tcctaataac ttcctcttca acaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcctacc ccctaaaa 118
<210> 6 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 6
ccataaacct actataaaca cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaca cacaaaaata tttatctt 118
<210> 7 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 7
actccacttt actaattaat ttacacacat cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatcc caatttacta tatctcct 118
<210> 8 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 8
ccttacatac ccaacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc tctaaacaaa ccaaattt
118
<210> 9 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 9
acttctaact cccctaactc ccatccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacctaaac ctaaacacaa tcactttt 118
<210> 10 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 10
atacccacct atcaacccca cctacgttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ccccctccct atctttaaaa ctaatttc 118
<210> 11 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 11
ccacactacc ataacaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaattctcct ctcctcct
118
<210> 12 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 12
acaacaactc cctccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc tatctcctcc tctctcca 118
<210> 13 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 13
aaaaccacac aaacccctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac tctaaaaaca caacaaaa 118
<210> 14 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 14
actcctcctc ccctacctcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaattta aaacaactcc actaatta 118
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 15
ctaaaaataa cccaaatatt ttaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa cattctatta actcaaca 118
<210> 16 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 16
actaaaaacc aacacaaaca cacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tcctaaacat acaaacaa 118
<210> 17 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 17
actatcactt cttcctcttc ttattatccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttttt accacaaaat aaaaacct 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 18
acctccaatt cttttattta tttcttttaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttcc ccataacccc aataacta 118
<210> 19 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 19
actccacaca ccatcctcta acttattaca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat aatcccaaat ccctttct 118
<210> 20 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 20
tctttcctct ctctactaac acaaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc ttcaaaatac aaaacact 118
<210> 21 <211> 118
<212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 21
accaccaact actaaacccc tatcgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ccataaaatt caataactat ttaaaaat 118
<210> 22 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 22
ctaccacctc ctcaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntactttat cataaaaacc tctcaaaa 118
<210> 23 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 23
ctctccacta ccactacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acaaacttaa cctaaaat 118
<210> 24 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 24
ccaataaatt aaaccaatac taacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccaacaca aaacaaaa 118
<210> 25
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 25
acccaaaact taattctttc ttaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaccaata acccctattt aaactctt 118
<210> 26 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 26
aaactcaaaa ttccaacaac ttagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacctttaca aactttct 118
<210> 27 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 27
aaactaaacc ccctaatatt cctttaattc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaattaa aatattataa aacccaaa 118
<210> 28 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 28
tcccaacacc ttcctccctt caagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctcaataaac ttattcct 118
<210> 29 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 29
ctatacctaa ataaccccct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccatcct ctaaccaa 118
<210> 30 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 30
ccctacaaaa actacctaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tacctcttca taaacaaa 118
<210> 31 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 31
ccaaaccctc aaacttagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcttttta tcttctacta aaaacata 118
<210> 32 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 32
ctctaccaac ctcccccaaa atctccaaaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatttt aatttcaacc catcccca 118
<210> 33 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 33
accctactac atatccagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttcctaac cccaaaat 118
<210> 34 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 34
tactaataaa acttcaaata aacaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca cttaattata aacccctc 118
<210> 35 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 35
atctcctata aaccaataaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcccacct ccaccctt 118
<210> 36 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 36
atccttcaac ccccaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cacacactta aaaacaaa 118
<210> 37 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 37
acccaactat attcctttaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ctcaaattaa aatctaaata tttactta 118
<210> 38 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 38
ccataaaaac tcaatacctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac taataaacaa ctaaaact 118
<210> 39 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 39
aacccaaaca acctatactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaaccttcct attacact 118
<210> 40 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 40
attcccaacc actacaaaat attaccaacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc tcctaaatat aattccct 118
<210> 41 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 41
cctaaaaact cctatcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa aacctcttca aaataatt 118
<210> 42 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 42
ctacaaactc taaactacta aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ccacctaata atctacaa 118
<210> 43 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 43
cttctcatac aacttcctta cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccctcaccc tactaact 118
<210> 44 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 44
ctatttaact atccctatca tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aatcctttca acaataaa 118
<210> 45 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 45
caattcctct ccttcaccac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat ctaacaccat attcaatt 118
<210> 46 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 46
atctttataa aaactccttt taatctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnctaat ctactactca aaataaaa 118
<210> 47 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 47
atccactacc aaacaaacat ttcccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntacctaaa cttaaaataa ttctccta 118
<210> 48 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 48
accaacctat acaatcctct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataaaac caactatcaa tttctaaa 118
<210> 49 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 49
acccaacaaa cacaaaacaa aaacttcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntacctaac accccataaa aataaatt 118
<210> 50 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 50
cactttacat ttatacttct taactgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc acattaacaa aaatcaaa 118
<210> 51 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 51
acctattcta taaaactatt tcttacagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntccc ttaatctaat aataccaa 118
<210> 52 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 52
actcctccaa tacctaaatt agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taactaacac acaaaact 118
<210> 53 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 53
acctaaccct cctctaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatcttaac tcacaaac 118
<210> 54 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 54
cccaactata ttaaaaacaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ctctcctaaa atctaacc 118
<210> 55 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 55
atttaattta atcccttccc accgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ttccaattaa aacttccaaa acaattaa 118
<210> 56 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 56
atcactaaaa ccacttcctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aaaactaaac cacaaaaa 118
<210> 57 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 57
acaatttata aacttataat ctataccctt ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc
caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natattaaaa tataaattct ttcttttt 118
<210> 58 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 58
accatatcct cctacactct aaacaatctc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaatccct ccataaacct ccattatt 118
<210> 59 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 59
ccaccaatct tctcaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acctcattcc aaaattat 118
<210> 60 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
aaaaatcaaa tccacaaaca ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactattt taacctaaaa actaaata 118
<210> 61 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 61
acacaaccta caataaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc tacccaccta ataaatca 118
<210> 62 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 62
ctaacttaat cctccctttt cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc tcaaaacttt caactaaa 118
<210> 63 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 63
attcaaaaat cttaaaaaca aaatcaatcc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnataa actttcctaa caaaccta
118
<210> 64
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 64
ataccacaca ccccacacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaataata taactttacc aataaaat 118
<210> 65 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 65
attcaaacta acaaatacct atacatacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttttaa cctctattta tttaaaaa 118
<210> 66 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 66
caccaatccc taacataagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac taaactaaca aaaccttt
118
<210> 67 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 67
ataaaaacat ataaccccac aaaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaaaata aaacatataa taaaacct 118
<210> 68 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 68
acaccctcca aaaaccccaa tccacagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc ttattacaaa aatacatt 118
<210> 69 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 69
caccttataa ctatttccta aacactgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaactaccac acctactt 118
<210> 70 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 70
acacaaacta aaccccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaacacaa ttcaacac 118
<210> 71 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 71
cctaaatcaa aactactaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact tatttctaca taaaacca 118
<210> 72 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 72
taattcctaa aaaccaacac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa taaaactacc ttaatcca
118
<210> 73 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 73
cacaataatt tatatttctc cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa aaccatcact tctaactc 118
<210> 74 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 74
aaacaaacta cacttctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntac tacactcttc taaaacta 118
<210> 75 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 75
acaaataaaa ctaccccctc aaaaaccccg ttggaggctc atcgttccta ttccccccca 60
ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccaatca cctataacct ataaccat
118
<210> 76 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 76
attccaacac cctcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa ctactaatca aaacactt 118
<210> 77 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 77
cctacattat cctaataacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ctatacctaa acccaaaa 118
<210> 78 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 78
caactaccta aatcaaactt tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ataccaatta accaactt 118
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 79
ctccataacc caaacaaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc tcaatttcac taaaatta 118
<210> 80 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 80
acttcactac atccaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttcc ttacataaat ctcaaaaa 118
<210> 81 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 81
aaacacaaac caaactcctt acacccacta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnactaccac aaaaccac 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 82
aaaacatctc aaaaacaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ataattcttc acaaccct 118
<210> 83 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 83
acattctccc aaattcctcc cctctacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaattc atatcttatt ctaatcat 118
<210> 84 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 84
actcctacca ctctctccac aactaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat attttaattc caccacat 118
<210> 85 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 85
taatattttt cctcataaat taaattaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacctccct aaactactta ccctaccc 118
<210> 86 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 86
ctcaaaacaa acctctaaaa accctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacctccaa aatcaaca 118
<210> 87
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 87
acccatcaac ctcattaaac ataactttcg ttggaggctc atcgttccta ttccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc cccttctacc cttacactct ttactaaa 118
<210> 88 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 88
aaaacctcaa acccccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttaatt tatcaccaaa tttaaaaa 118
<210> 89 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 89
tattaaaacc tttaataaaa acactctaaa cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaacttct cctacccc 118
<210> 90 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 90
aaatactcat ctcctacaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ctttaaacta caaaaact 118
<210> 91 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 91
ttataacctt ttctcctaca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttataaat ctaaccttat attcacac 118
<210> 92 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 92
aaaccactac aaataaaata aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt aaaacaacta ccataaca 118
<210> 93 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 93
tcaaccctac tatctataca actccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttctta atacttaaaa ctaaaaac 118
<210> 94 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 94
acatcaccaa cccacaacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naatatcaaa aatctaaacc caacataa 118
<210> 95 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 95
attccccaaa ctacctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaatcaaa caccaaaa 118
<210> 96 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 96
actcaaatac caaatcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ccaaataaca aatctaaa 118
<210> 97 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 97
aaaaactccc ctacctatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacatct aaaacaaaaa cataaaaa 118
<210> 98 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 98
ccaaaaatct ccattcatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacaataat tcaacccc 118
<210> 99 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 99
aatacaaacc ccctacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc aattcaaact taaaccca 118
<210> 100 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 100
aatcaaaatc ccaaatacac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ccacatctac caaataaa 118
<210> 101 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 101
ctcatctcac aactcattgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaacct aaataaacac atatacat 118
<210> 102 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 102
atttctacac aatcacaacc caatgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taccaacaaa tcttatcata ttcctctt 118
<210> 103 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 103
atcctaaaaa tataaaaata acaacttaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaatc tcctatttct cttcctaa 118
<210> 104 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 104
aaacaaatct cttaaaataa aaactgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta tactctcaat ccctccca 118
<210> 105 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 105
ctcccaccaa ccaatcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttcc tctcattcta aataaaaa 118
<210> 106 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 106
ctctaacaca cctaaaaatt tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aatacaacca aataaacc 118
<210> 107
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 107
atccccaaca atctataaac cacaactttc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaatttctt actctcatta aaaataat 118
<210> 108 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 108
acaaacaact cacctaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaattaaa acaattcaca aaacattt 118
<210> 109 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 109
actaaacccc tccccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacttcaac tcctccat 118
<210> 110 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 110
atccctcctt tatatacaca ccacccaacc tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntatttca aaaacaaata ctccccta 118
<210> 111 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 111
acccaaccca aactacaatc ataacaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaactaa cccaaaacac taatccct 118
<210> 112 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 112
acttaaactt atttcctaat tcaaccctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcctattaat caaatattaa taaaaatt 118
<210> 113 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 113
accccaaaac aattctacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nccctaacaa aaacccca 118
<210> 114 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 114
ttttaccact taatcccaac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnncctaaa cttccttcct ctataacc 118
<210> 115 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 115
aaaattaaac acattttccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa cctaatacat tacaaaca 118
<210> 116 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 116
catcccataa aacaaatctc acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctc tttctaaaac aatttaaa 118
<210> 117 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 117
atctatactt tcattactaa taccacccta ccgttggagg ctcatcgttc ctattcccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cttaaacaaa tctatacatc tccctaaa 118
<210> 118 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 118
attcctacaa accttactag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacaaaaca ctaacaaa 118
<210> 119 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 119
aacaaaatat aaacacatcc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca actaaactaa acaaaaca 118
<210> 120 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 120
aaataaaaca aatcactctc aaaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttttccct ccaaactt 118
<210> 121 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 121
ataccccaaa ccttattttc cctcaaaacg ttggaggctc atcgttccta ttccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta taaaaataca atttcctcac tttaaaaa 118
<210> 122 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 122
cccccaaacc aaaatagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaattctt ctaattattt tacttctt 118
<210> 123 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 123
ctaaaaactc cttacaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaacaaca acctaatatc cttcacat 118
<210> 124 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
actacctcta ccataaaacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc
cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntctataccc caatccca 118
<210> 125 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 125
atacatccta aaatactacc caccctaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttttctttta ctaattaaaa ataaaaat 118
<210> 126 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 126
acttcactca aataacaacc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata cacacctatt acaacaaa 118
<210> 127 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 127
atctatacta actaataaaa atctcacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acattatttc cccaaaaa
118
<210> 128
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 128
ataaacaaaa ccacaaccta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact ttaaaaccaa acctaaaa 118
<210> 129 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 129
tcctcctcca actattacta tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa taatctacac caaactac 118
<210> 130 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 130
accctaccct ccaatacaaa aacttaaccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacctcctc tttcctatca tactaaaa
118
<210> 131 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 131
acttaatcta caacaaaaat caatgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttaacattcc acactaaa 118
<210> 132 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 132
acccccttcc caacacctcc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nataaaaaca atactatcaa aacttaat 118
<210> 133 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 133
atccacccct ctctaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatt taacatctct actaacat 118
<210> 134 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 134
ccctataact aaaacctaac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctaatccca aactactt 118
<210> 135
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 135
acacaaacct ctcatcaaca ataacttaac acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntccca aatattttca ataatact 118
<210> 136 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 136
accaacccca ataacctagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacaac aaacttttta aaataaaa
118
<210> 137 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 137
ccaccaataa aataaaatta aaacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacatcttcc tttcacct 118
<210> 138 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 138
ccctacaaca aaaatacaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaaccaaaac ctcaaaaa 118
<210> 139 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 139
actcctaaaa acaaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaccaatt caacaacc
118
<210> 140 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 140
tctccaacaa ctaacaaata tcccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttccccacc caaaacaata atcttatt 118
<210> 141 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 141
tcctaactct ttcaatccct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnacaaatt actctaacta atttattt 118
<210> 142 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 142
acctactata cccaaaataa tattttaccc cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaata aataacccct aattctca 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 143
cttcctaaaa ataccacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn caatttttcc caaaacct 118
<210> 144 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 144
atcaaactca ccctactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaactac attaaataca tacaaatt 118
<210> 145 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 145
ccataaataa aaacctctaa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn actccaatcc tcattcaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 146
acctaaccct cctctaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcttaactca caaacacc 118
<210> 147 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 147
atccaataac cttataaaac aaacccaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn atttcctttt ataattttaa atcttaat 118
<210> 148 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 148
acccccaaca cactcctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaatact ctccccca 118
<210> 149 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 149
tacctattaa ttttccttta cccacaatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacaaccttt aacctaaa 118
<210> 150 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 150
cccctaaaat tttctatttc ttccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcttt acactaaaca tataaaaa 118
<210> 151 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 151
taattcctta tatactaaac acttccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacca ccttttacta ctcaactc 118
<210> 152 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 152
tcccaaattt accctctcaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaattct aaatacttcc taacaatt 118
<210> 153 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 153
cttcactaaa attccctctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttta caacttttca ccaataac 118
<210> 154 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 154
tctcctcatc aaaccaactc tctaacttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaccaaaacc aactacca 118
<210> 155 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 155
acctaccacc tcctcagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cataaaaacc tctcaaaa 118
<210> 156 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 156
atccctaccc tcctacaaaa cacacttcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacca tttaacaaca ttttataa 118
<210> 157
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 157
actacaaaac tctaaaaata aaccaaaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcatcataat acaattttaa taataaca 118
<210> 158 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 158
tcctatctca aatctatttc cttgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa cctcctaaat tcttctaa 118
<210> 159 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 159
attctaactc caaaacccac actgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnctctcaa tattaattat aattcatt 118
<210> 160 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 160
acccacaaaa ccaccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc taaaaatcct aaccctaa 118
<210> 161 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 161
atacaaaact ataaataacc attacatatc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaatcct aaaattaaac catacctt 118
<210> 162 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 162
ataccaaatt ccataccaaa ccccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcacta acttctcata aataccta 118
<210> 163 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 163
tccaccccac accttaaacc tcataatatt aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caataacaaa cctacaaa 118
<210> 164 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 164
accctaccaa tactaactct aaataaaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnattc caaaccctac tctattat 118
<210> 165 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 165
ctatatcacc ctttcctacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttctc tttcccacaa ataccaaa 118
<210> 166 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 166
aatccaaaat cttaccatta cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ttccaaaaac aacttttt 118
<210> 167 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 167
accaactatc tcaattcacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaattat acccaactaa attaaatt 118
<210> 168 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 168
cattaaaatc ctaaactcac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa caacctaaac tacaaaaa 118
<210> 169 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 169
acacccaaca aaacaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acacaaaact aactttaa 118
<210> 170 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 170
actccaaaac aactatcaaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ataatcttca actttactca ctataatt 118
<210> 171 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 171
tcaaaaccct aatccaaaac ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcct aaatataacc taaaatct 118
<210> 172 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 172
ccttcttaac tactcaccta atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttttt cttcacaaat tttacaca 118
<210> 173 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 173
caacatctta aaaacttccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcacctctct cctcaacctc caaaactt 118
<210> 174 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 174
ccacaattat acaaacaaca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact tattttacaa ttaaatct 118
<210> 175 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 175
cttccctata ctaacaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncctc tctaaactat aaaaattt 118
<210> 176 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 176
aaactctatc cctttaacac aaacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaacaaa ttattacttt tccttact 118
<210> 177 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 177
ctcatccaaa acctcataaa actattgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacactcaac aactacaa 118
<210> 178 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 178
acccatttcc tactctccaa aattaaccac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaccc taccaaattt accaaaat 118
<210> 179 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
modified_base
(92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 179
ctcccaccaa ccaatcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt cctctcattc taaataaa 118
<210> 180 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 180
attaactaat ccacctaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaacctta cttctccc 118
<210> 181 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 181
ataactaacc taaaacttcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa taaaaacaac acctacta 118
<210> 182 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 182
ccacacaaaa tacactacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaactc cttaatataa ttttaaaa 118
<210> 183 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 183
cttcaacaac ttaaaacacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa cacaatatcc actaaaaa 118
<210> 184 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 184
ttcctactac aataataaac tacctccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt caattttcct ttctactt 118
<210> 185 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 185
accataaaac taacacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnctcctccc aaccccca 118
<210> 186 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 186
aaccaacaat ctccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca cctaacaaat aataaaat 118
<210> 187 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 187
aaacactata ccactccaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cccaactcaa aataaaaa 118
<210> 188 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
atttttataa ctaaaactaa tttctaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc
ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttataaaa caaccaacaa ctttctct 118
<210> 189 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 189
ccaaatctac ctacttaaat acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac caatcctaac tcaactca 118
<210> 190 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 190
atccaaccta ccaaacagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ctaacaacat taactcta 118
<210> 191 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 191
acaaaaacat ccccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cccaaacacc aatccccc
118
<210> 192
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 192
ctaaacccta ttacccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa taaattttcc ttaaccaa 118
<210> 193 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 193
ctaaatctat aatacaaaaa cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnncaaaaa taaactaaac aataaaaa 118
<210> 194 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 194
cccactattt tctcttccta cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaac tcaacaatct taactttt
118
<210> 195 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 195
atactttctt taaatatata cctaaataaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaactc tttaaataaa actaaata 118
<210> 196 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 196
aaaacccctc ctttcctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncttcccca acctccac 118
<210> 197 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 197
aatttatctt tcactaaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnct ttccttcatc ttaactat 118
<210> 198 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 198
ccaaacaaaa accccaacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacca taaccttttt aaataaaa 118
<210> 199 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 199
ccccatcctt tcctacctaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc acacactaac cctaaaaa 118
<210> 200 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 200
acactaactt tcaaatacat atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntat ccaaaataca aacaattt
118
<210> 201 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 201
atcctaataa cttcctcttc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntact tcctaccccc taaaacta 118
<210> 202 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 202
ttttaataat acctccttat aacaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac aaacactaaa tttaaaca 118
<210> 203 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 203
attcaaaata acctattaac aacaatcaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttttccc attaattaaa atcaccaa
118
<210> 204 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 204
acttatctaa aatcacacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaca aaaacttaca taaatctt 118
<210> 205 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 205
ttacaaacaa accacaccta ctattgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aattaaaacc tcaaactt 118
<210> 206 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 206
cttctacaaa accccctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaac cctactaact aaaaactt 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 207
aaaccacaaa cttcctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntctac ttaaatattc aaacaaat 118
<210> 208 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 208
acctttattc ctccccaaca aaaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatat taccctctaa actaaaaacc aaaaccct 118
<210> 209 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 209
acccaaactc ctacaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aactcaccta cttaaaaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 210
cctaaaaacc aaacaaacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa ttttcaatta actacatt 118
<210> 211 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 211
atcacaaacc cctctcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaccc acatatacaa aataacaa 118
<210> 212 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 212
taaaacttat ataactacta tatctaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc ctacaaaaac tactaacc 118
<210> 213 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 213
caaacactaa taccaccaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaact caaaattaaa aattactt 118
<210> 214 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 214
atttttcaaa acctcatttt aaccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa actaacaaaa accctaaa 118
<210> 215 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 215
ctacaaaaac ctaaatcaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actaaactca acccataa 118
<210> 216 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 216
tccactaacc aaattccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat ttttcccaac atcccccaaa ccacttct 118
<210> 217 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 217
ttttaatcaa actactccta acccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa actaaactcc tacaaaaa 118
<210> 218 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 218
tcctcactcc ttttattctt ttagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaatattt acccattaat acctttta 118
<210> 219 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 219
caaacatcaa aactctccta tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aacatccttt taaactaa 118
<210> 220 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 220
cctaaataac cattcctcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntactata aacccaaaat atttataa 118
<210> 221 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 221
acttccccac actcatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat aaaaacaaca aaattcaa 118
<210> 222 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 222
aatttaaaat ccaaactaca ccaccaccct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc caaatcttcc actaaacc 118
<210> 223 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 223
atttccccta aacataaaca tttaaactac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcttttt ccctaacata aaattcat 118
<210> 224 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 224
acccacaatt tccaaactat caccaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaattta atctatacct tatatccc 118
<210> 225 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 225
ctcaaaactt ttcacaccaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac tcacattaaa aattctca 118
<210> 226 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 226
caatcctctc aaacttaatc tctacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc actaaaacta atctaaaa 118
<210> 227 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 227
atttacccac acttcctaac tccaaacttt gttggaggct catcgttcct attcccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ttaccctata ttcctattcc ccttcctt 118
<210> 228 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 228
ttccaaaatt acacaacact tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaaa acccttctta aaaataat 118
<210> 229 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 229
acaccctcca aacctacacc tcttaatcca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaattaa aacacaatta cccaacaa 118
<210> 230 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 230
ctaacttttc ttccaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttcctcccc taccctaa 118
<210> 231 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 231
acaaacccta ctaaataata tttcccgttg gaggctcatc gttcctattc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaataattaa aacctactat tctctttt 118
<210> 232 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 232
cttactccct cattcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatcccaat ttctaaca 118
<210> 233 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 233
tcctctaact acccttaaac cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaataaa atccacctat tccttttt 118
<210> 234 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 234
attcccttat aacaaactaa ctcccaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttttaaaa taatatttct aaccatct 118
<210> 235 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 235
aattttctca actcaaaact ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccataaa ctctcaaa 118
<210> 236 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 236
ctatctccaa actcaactgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat tcatatattt acacccac 118
<210> 237 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 237
cactatataa ctaaaactac taacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt cctactttcc ccaaaaca 118
<210> 238 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 238
atcctaaaat caaaacaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaata aatttccttc ataaaaat 118
<210> 239 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 239
acacttcctc tttcctctaa acagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttactatc attattttcc acaaatat 118
<210> 240 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 240
ataaaaacta aaataaatat taaataaaaa gttggaggct catcgttcct attcccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc ctaaactttt ccaaaaatct ccattcat 118
<210> 241 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 241
ataattaacc ctaaaatacc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncaccaaaaa ctcactca 118
<210> 242 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 242
acccttttct cccctccctt ttctccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnacataaa cttaacttaa cctaaaaa 118
<210> 243 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
modified_base
(87)..(92)
<400> 243
accccttttt aatccccaaa ataaaccctt ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatactact taaaatacta tctaaaaa 118
<210> 244 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 244
atctccaaac ttacaacact tcccaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaatc ttcctacaaa ataccccc 118
<210> 245 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 245
actacaacac caaatctccc caacaaccag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaccaacctc accaacaa 118
<210> 246 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 246
acccaccacc aaacttcatc ccaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa tctcattcct aataatcc 118
<210> 247 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 247
ataatcccaa ctactcaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttttaa aacatattta accaacct 118
<210> 248 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 248
acaactatac aatactccaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaat tcactcccta actaaaaa 118
<210> 249 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 249
acttaataaa ttcctactct aaccagttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tttcattaat tttcctaaca attctttt 118
<210> 250 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 250
cccaccaaca cctaaacaac atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaatctac ctcaatcact taaaaatc 118
<210> 251 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 251
cctatcctaa ccaactcaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcaa aataacttta tcaaaaac 118
<210> 252 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
actccaacaa taaaaccaat taaactgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactaaaa acttccctac cttaaatt 118
<210> 253 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 253
cctaaatcaa aactactaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact tatttctaca taaaacca 118
<210> 254 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 254
ctttactatt tattcctact caagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt caaccttatc acttaaca 118
<210> 255 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 255
aaaaacacca cctataaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ctccaactcc ttatcaaa
118
<210> 256
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 256
aaaaaccaca aacctacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaatactaac aacctcaa 118
<210> 257 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 257
acaaataaat ataataactt tatttaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaaattt accaaaatct ataaataa 118
<210> 258 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 258
ctctaccaaa cccctccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaacc ctaaacaact tttcccaa
118
<210> 259 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 259
acttctactt atttaacact taaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttccttatta accaacaa 118
<210> 260 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 260
ccttttcaca ccaaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaacc attctatctt ccaaataa 118
<210> 261 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 261
acaacaacca taattctttc tatctccacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntccacctt taccccacac ctctaaaa 118
<210> 262 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 262
atacccctca tacaactaat caaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnactaaaca atataaatta ccaaccct 118
<210> 263 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 263
tctccctccc tctcccaaat ccccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacaaatt atacaaatat aacaattt 118
<210> 264 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 264
caactcctca cctaaattta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actaacatcc taactctt
118
<210> 265 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 265
accttttccc caaatactca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa ttaccaaaat aaacacat 118
<210> 266 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 266
acttctccct atatccccac ataatcttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcaca atctttaaaa ctataaat 118
<210> 267 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 267
acaaaaacct acactaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc ccccccccag 60
gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc accttaaaac tactcacctc cttcttct
118
<210> 268 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 268
aataaaattt aaaccccacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactt tctccctata aaataaaa 118
<210> 269 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 269
atcatcatcc caatacaaac cttccccgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aaattttctt tttatcttaa cacaaaaa 118
<210> 270 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 270
caaatctcct tactaaacat cttaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctaaaattcc actaaaca 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 271
atataatcct aattccccaa aattcccaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnattccc tattaccaaa catttaaa 118
<210> 272 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 272
acaccaacac aaaacaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ctcttcctac acacacac 118
<210> 273 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 273
tcacaaacct ctaataaaaa tatctctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaataaaacc ctacctca 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 274
cattttccaa cacctaaccc caacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctctctctcc tacaaaaa 118
<210> 275 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 275
acaccaaatt cacctacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa cactaaaaac ttacaaaa 118
<210> 276 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 276
ccctacacaa aaactactaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncttc actttaaaac attttatc 118
<210> 277 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 277
cctcctatcc aaacctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaactaa ttttaataac aataattt 118
<210> 278 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 278
ataccaaacc ataacactcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna tttccaaccc tttaacca 118
<210> 279 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 279
acctacacaa actacaaatt tataagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttaaatt tcccctacta tactataa 118
<210> 280 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 280
acaaaatcaa ctaaccccct cccaaccagt tggaggctca tcgttcctat tcccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ctataatttc tttaatattt atttctat 118
<210> 281 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 281
acccacctca tctcccacct gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntata taaatccctc tacctttata ctttacca 118
<210> 282 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 282
caaaactcaa acctaactca tctcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaccaaa cccaaaaa 118
<210> 283 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 283
attccttccc caccacaatc acaaatacac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaataa ctaaaattta tttctcca 118
<210> 284 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 284
acctctcccc ttaaataact aaaaatccaa atgttggagg ctcatcgttc ctattcaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa atttctccca accttactcc ctaccttt 118
<210> 285
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 285
tcaccaaact ctactccctc acatactata gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt attaaccaaa acctacac 118
<210> 286 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 286
accatcctaa tcccacagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat actcactaat acatctct 118
<210> 287 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 287
ttttaatcct cacaacaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaaa aacaccttaa attaaaaa 118
<210> 288 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 288
cctttcctca actatctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaaat ttcctttata aactcaaa 118
<210> 289 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 289
acaacctcca ccattagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnactcccac ccaacatt 118
<210> 290 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 290
ccccctctaa ctcatactaa caatcttctt ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaccaa atcatctaat aaaaataa 118
<210> 291 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 291
cttcctacta tttaaaccac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacccaac taacttcc 118
<210> 292 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 292
ccaaaataac cctaaaaata acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntct acaaacaaat aaacaaca 118
<210> 293 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 293
acctttacca ttctatacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt cccaactaac taaaacca 118
<210> 294 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 294
accaaaacct ccctacccca gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaataattt acataaaata tttaaaaa 118
<210> 295 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 295
atactctaaa acctcctttt taaaatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttaaat ttttcccaaa actattaa 118
<210> 296 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 296
tcaaaccata tcaaactttc taacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acaaaataac ttcaaaac 118
<210> 297 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 297
acaaaatctt tctcaccaac ccttcccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactccaacc tataaaaa 118
<210> 298 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 298
ctcacactct taaacaatca tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaataac ttaaataaat cataaacc 118
<210> 299 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 299
acatcaccaa cccacaacca aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaatatca aaaatctaaa cccaacat 118
<210> 300 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 300
ccacacctaa atcaaaactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaat ctaaactctc tttaaaat 118
<210> 301 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 301
ccttaaaaac acaaaaacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc ttacctctaa ttattaaa 118
<210> 302 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 302
ctaactccct ccccacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacctcaaa acctacta 118
<210> 303 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 303
ctcccaaatt ctcaaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttcat aactaaacca aaaatcta 118
<210> 304 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 304
ctcctttcaa cttcccctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acaacctaac atctaatt 118
<210> 305
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 305
tccccactaa aatcacacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacaa atatcctaat cctaaaca 118
<210> 306 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 306
tcctacctca tcctctctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttttaaaa taaaatctta ctctctta 118
<210> 307
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 307
atttacctat ccaaaatcaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttactaaat ttatattccc attttaaa 118
<210> 308 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 308
accttctaaa caaaacaaac ctccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttcccta aatatccatt ctaaaatt 118
<210> 309 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 309
atatatttca aatcaaacac aaccattgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttaacac aatccttaaa acctcaac 118
<210> 310 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 310
actttaccct aaaacctccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta cctacaaaaa caaaacta 118
<210> 311 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 311
acaacctcca ccattagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnactcccac ccaacatt 118
<210> 312 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 312
cacacctaac tctatccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaatacaa aacccaacat aacctaaa 118
<210> 313 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 313
cccacccacc aaaaatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccaaaac cctaattt 118
<210> 314 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 314
cctaaaccat taaacttccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaaa ccctataata aacaaaaa 118
<210> 315 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 315
tctacaacaa ctaactccta cccctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat acaacaataa caaaacaa 118
<210> 316 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
atcacaatta taatttatct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc
aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tttctaataa aacttaaaat ataatttt 118
<210> 317 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 317
actaacccct actacccacc ctatctcaat agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatttc tataaacaaa ttaatccc 118
<210> 318 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 318
cctaaacaaa ctaaaattct cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntacc ctaccaaact caaacaaa 118
<210> 319 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 319
tccccttccc aaccttccta ataaactaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntatac tcaaaaactc ctacaaaa
118
<210> 320
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 320
accttatcaa ataccccact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacatataaa tattcattat ttcaattt 118
<210> 321 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 321
ataaaacccc aaccaccctc ttccaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttataaat aaaacattta caataaaa 118
<210> 322 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 322
atccattaaa atttccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncac tcaaccatta taaattca
118
<210> 323 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 323
acacacacac acaaatatag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acaacttcta aacaaaaa 118
<210> 324 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 324
actaaactaa caaaaattac ataacctcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntccaaa taaaataaac tcaataaa 118
<210> 325 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 325
taaacctcat tccaaaatta tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncccc ttcccacaca cccctacc 118
<210> 326 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 326
cattttccct aacaaaaatt ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntctac aaataacact ccattttt 118
<210> 327
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 327
ccctaaataa aaaccacaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaac tataacttca ataaacta 118
<210> 328 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 328
acaccctcaa tacaacttat accctctctc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa acattactcc ctaatact
118
<210> 329 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 329
acccatttct ctaacattta ccatacacca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc ctattctcaa aaacttat 118
<210> 330 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 330
ccaaaaccta ctcactacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactaaaa actatttcta aattttac 118
<210> 331 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 331
ctcccccttc tccatacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcaaaacaat caactccc
118
<210> 332 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 332
cactaaactt cctactactt tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac tatcctctaa accaaaaa 118
<210> 333 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 333
actcccaact ttaccactgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataccat tctaacaatt acaaatct 118
<210> 334 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 334
ccacacctaa ctaattttcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctatactact accatctc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 335
atcactcctc atcaaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaataaaaa ctaaactaaa tataaaaa 118
<210> 336 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 336
cactctaacc tctaaaccta aatgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tactcaacaa ccaactct 118
<210> 337 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 337
ccttttaaaa acctcctcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc cctacataaa aactaaaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 338
atacaaaaac aacatcttcc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaacatt taatttctta ctttaaaa 118
<210> 339 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 339
accatcctac cataccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttctaataaa cctcctct 118
<210> 340 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 340
ctccttatac aaaataccaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttat ttcttaaaaa ctcacaaa 118
<210> 341 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 341
ttcctctata tattctacaa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcccataac ccctataccc ctaaaccc 118
<210> 342 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 342
actcactaaa tcaaacaccc taagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcca ttattaattt ctaaaacc 118
<210> 343 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 343
attttaaaac tataaaaact aaacttcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttttaaaa ctccacaata aaaatttt 118
<210> 344 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 344
atctaaacta cccaactaat taaaaccata gttggaggct catcgttcct attcccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta tatattttat aaataaaaat aaacccca 118
<210> 345 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 345
acaaatccta cttcctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacccaac cacctcta 118
<210> 346 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 346
acccccactc caaactaaac ctacctttct ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttccct cccaacccta taaaactt 118
<210> 347 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 347
ccttcctctc tctaactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaata acttatttct aaccaaaa 118
<210> 348 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 348
cctactaaac ccctactacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa tcttaaataa ccctatct 118
<210> 349 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 349
acacactttc actcttttta cccaaactaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacct aaaaccctca ccatccta 118
<210> 350 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 350
acaccctccc tcttcacaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttaacca acacctaaca tcataaaa 118
<210> 351 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 351
tatttctccc tttaaattct aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcctaaac ctaacccctc atccaaaa 118
<210> 352 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 352
ctacaaacac ttttccacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcta aattttaaaa ccctaaaa 118
<210> 353 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 353
cacttctctc ttccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac aatttttctt tttccatt 118
<210> 354 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 354
attctaaaaa tatctctacc ttcccaaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntatcatct aaccacccac aactttat 118
<210> 355 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 355
aatcaacaac actatatccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncat tctttcttac ttttacaa 118
<210> 356 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 356
ccaaactttc tctaaatcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact cacccatcta aataaaaa 118
<210> 357 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 357
aaacaatcaa aaattcaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnncc taaataaata aacaaccc 118
<210> 358 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 358
tccaaatatt ctctctaccc cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnataaa acctaacaaa cttattct 118
<210> 359 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 359
ccaacctata caatcctctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac caactatcaa tttctaaa 118
<210> 360 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 360
cttcactacc ctcttatttg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacca aattcttttt ctaattaa 118
<210> 361 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 361
cccctataaa tccccctcca aacaaatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaacc aaacaaatat ttataatt 118
<210> 362 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 362
ccctactaaa ctaaaaacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta acaccaatta catatcaa 118
<210> 363 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 363
actaccctcc tcctctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactcaaaca aaatcaaa 118
<210> 364 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 364
acacctacac ctccctaatc cccagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaatatc cctcctatca aaaatcca 118
<210> 365 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 365
cccaactctc ccaaaactcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaatc caaaaccttc tctctatt 118
<210> 366 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 366
caacttttaa acccaaaatc attagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaatacctt cctttcct 118
<210> 367 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 367
ctctaaaaac aacactccag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa actaaactac ccaattta 118
<210> 368 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 368
cttctcaacc caacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc taccaaccat aatcaaaa 118
<210> 369 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 369
acaccctcaa tacaacttat accctctctc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa cattactccc taatacta 118
<210> 370
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 370
tactaaaaca aaaccatcat catctcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ctctttaaaa cctaacta 118
<210> 371 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 371
actatctaca aacccacata accttatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nccccaaaat atttaatata attaaatt 118
<210> 372 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 372
acacacacct tctccttctc cacctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa atctcttctc tactatct 118
<210> 373 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 373
tcctccttta tctaccacta aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc taacacctac cttataaa 118
<210> 374 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 374
caaactcaaa attcaaaact gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cactcccaac cctctctatc tcacaaat 118
<210> 375 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 375
actttaaaac attacaaatt tatacccaca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntccttaa ctaaaaacta taaaatat 118
<210> 376 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 376
actccttttc tctttaaatt tcttatttac cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatcca ccaccttacc aataatat 118
<210> 377 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 377
atcacaacaa cttcctctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaacctaa actctttaca taccactt 118
<210> 378 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 378
acttactcaa aaacaaaacc aaactcccca ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacct tccccaacca cccactta 118
<210> 379 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 379
acaacctaaa tatctcttca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttatta ccaaaatcaa aaactaaa 118
<210> 380 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
tcaaaacaaa acaactttcc tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntacc aactctaaaa actaatat 118
<210> 381 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 381
ctaacctctt tctcacactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaaac cttaattaaa acctctaa 118
<210> 382 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 382
acccaaaaac ccttccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccacacc tcccaaaa 118
<210> 383 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 383
caataacact aaaatcacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc ctcaataaaa ctattatt
118
<210> 384
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 384
attaatcaca cccccatacc cacacaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttccta tactttatat catactcc 118
<210> 385 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 385
tcctaataac tatactacta ctatgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc caccttaaat aattaaaa 118
<210> 386 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 386
taacaaataa aaaccccact caaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaat taaaacctct aaaaccaa
118
<210> 387 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 387
acacaaataa ttaatccaaa ctccaaaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntccaa aactcaaaat tctaatat 118
<210> 388 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 388
tcaacttacc atatcaatac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttacaa taccaaaaat aaaaataa 118
<210> 389 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 389
acaaacctaa tttccaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaatccct ccccaact 118
<210> 390
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 390
cacctcctcc tacctagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt actaataaaa ctaaattaaa ataaaaat 118
<210> 391 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 391
cctcaatacc acaaacctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tatctaccac aatcaacc 118
<210> 392 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 392
cacccacctc ttaaaacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta cttcaacacc ttatacaa
118
<210> 393 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 393
actcactatc taaactctcc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttcctca attcaacatc tataactt 118
<210> 394 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 394
aaaccacttc ctattacttc atccccgttg gaggctcatc gttcctattc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa aaccaaaaat aactccaaac attacctc 118
<210> 395
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 395
acccactacc caaaaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tcccttaaat caaccact
118
<210> 396 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 396
acccacatca aaacaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna acacaatcaa aaacatct 118
<210> 397
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 397
cttcttccaa catatcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa tcatcactca acaccaaa 118
<210> 398 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 398
tctccttacc ttaaccttaa actacttcta gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aataaccact cccttccc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 399
cctttaaaca ataaccttta caagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac tatttcctaa aactctct 118
<210> 400 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 400
cctaacatat aaaacaacaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataaaa actaaacttt tattcttt 118
<210> 401 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 401
ctcctacaac ctaaacacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa atacaaaaac tcaaattc 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 402
acccccaaca tttaaaaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaac tcccttatta caaacccc 118
<210> 403 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 403
atcctaataa atctattctc cactaaacta gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntata ccattttact caaaacca 118
<210> 404 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 404
actcaaaaca aatcccttca accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntatt ccatatacaa aatctctt 118
<210> 405 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 405
ctcacaaacc aatatcccta tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aacattacaa aaacattt 118
<210> 406 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 406
caaacaacta atatttaaat aataataagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aactctaaaa acttcaca 118
<210> 407 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 407
ctctcctctt tcttttaaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa cccaaatact aacttaaa 118
<210> 408 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 408
ctacactaaa cccaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnccc aaaataaaac aaataacc 118
<210> 409 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 409
ctaatattcc tcctacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncttac taaataaaac taaaacct 118
<210> 410 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 410
cctctaccct ctaatccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttctcc ttaaaacttc ttcccact 118
<210> 411 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 411
tcaaaaacac ttcatccatc aatagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacacacta accaaaaa 118
<210> 412 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 412
taaccccctc ctttatatca cattctcaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnattcc ctccctccca ctaccaat 118
<210> 413 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 413
ctcccttacc ctcaatcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaccaaa actatattta ttaaacaa 118
<210> 414 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 414
atccctaacc aaccaaaata acaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaatttta tcaataaatc caaccctt 118
<210> 415 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 415
taatctataa ctatctttat acctacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncct aactttatct cctaaaaa 118
<210> 416 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 416
ccaaacaacc ttttcctagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaact caatttctct aaaaacta 118
<210> 417 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 417
cctactccac acaaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc ctacttcccc taaaactc 118
<210> 418 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 418
actacccctt cccttcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaccaact ctacaaac 118
<210> 419 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 419
ctttctaccc ccacaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaact aatacaaaac cttaaaaa 118
<210> 420 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 420
ctctcaacct ctcaactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttttt acacactact attataac 118
<210> 421 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 421
ccaaccttac atacctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaatc aattcttctt attaaaat 118
<210> 422 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 422
ccatcaacat acttaaaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcta accaactttt aaaaactt 118
<210> 423 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 423
acttttaaca acaacattac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaaa attaaaattc ttcatcaa 118
<210> 424 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 424
ataatttctc taaccttatt accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntctaaataa aataaaaatt aattacct 118
<210> 425 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 425
aaataacacc cctctaaaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt accacactaa ctcaaaaa 118
<210> 426 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 426
ccccctcttt tcacttaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttccactt ttactttctc taaacaaa 118
<210> 427 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 427
acacaaaaac aaaaacaaca aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaccacaaac aaaacaaa 118
<210> 428 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 428
acattctctt taaattctca caagttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tacatcctta tattttacta taattttt 118
<210> 429 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 429
atcctcctcc ctctccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaactcc ccctcaaa 118
<210> 430 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 430
tctccacact acatctaaaa taaccccttg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt aaattacttc caccttct 118
<210> 431 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 431
tctttaaaac ataaaaaccc taacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaac actcaaatca tattttct 118
<210> 432 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 432
acaaaaacca aaacttaact agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaatt caaactaaat cttttaaa 118
<210> 433 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 433
accttacata ctcttaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcttattac tcctcccctt tccctata 118
<210> 434 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 434
atacaaaact aactacacac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntact ctccttcctt ccactctt 118
<210> 435 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 435
ctctacctct tcaaaataaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ctaataaaaa ccctaaac 118
<210> 436 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 436
atactaaaaa cacaactatc taccaaacac tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa cctcccccaa cacctact 118
<210> 437 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 437
tcaaacaacc cttaaaataa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttac aaatttccca aataataa 118
<210> 438 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 438
ccacctttct aaactacaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncctaa aactaactct ataaacta 118
<210> 439
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 439
acattattta ctcaaaatta ctaccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt caacaaatat tctcaaaa 118
<210> 440 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 440
attctcttta ataaaatttc aaatttcaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaaccaaa atctataaat ttctaact 118
<210> 441 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 441
catctaaaac ttcactttaa atagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttctta ctactaaata tactttaa 118
<210> 442 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 442
acccaacacc caaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcattttct cccaaaaa 118
<210> 443 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 443
aaaatattaa tttttcccca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc aaactccttt atccatta 118
<210> 444 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acccaaaaca atactaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tacaaaacct ctcaaaaa 118
<210> 445 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 445
aaatacatta aaaactacac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca acctaaaatc taaaaatc 118
<210> 446 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 446
tttatactac accccattac ttcctcagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta ctactatttc tcaaacct 118
<210> 447 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 447
atacaattaa atacttctaa ctaatcacct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttttca ttcaatacat aaatcctt
118
<210> 448 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 448
ctcaaaatac ctaaaaacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta accttcaaca aatactac 118
<210> 449 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 449
ttacaacctt aactaactaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa atccctataa aaatcaaa 118
<210> 450 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 450
actattccaa caccaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaacccca accccaaa
118
<210> 451
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 451
ccaaaacacc caacacaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa cctacatata caaataat 118
<210> 452 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 452
aaactcccta cactaacaaa atccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacccccaat atcaaccaca atctcttt 118
<210> 453 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 453
atactatcta cccaaacttt cttaaccaaa ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cccatcctta tcaaaatt 118
<210> 454
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 454
caacaaaact aacaactacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttacaat taacttttcc cacaaaat 118
<210> 455 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 455
ccaaaaatat actttccccc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacaatctca aacacttt 118
<210> 456 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 456
acctaaccta accataaaaa caccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaatccta tccacctaac tcacccat
118
<210> 457 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 457
acaatcctaa actaataccc ccttacctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaatta attatttaaa tcttcctt 118
<210> 458 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 458
attcttaata catatatttt taattctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ctcattaaat cccaaaaa 118
<210> 459 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 459
cacatacttt ttcctaatta ctaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttcc aatactttta ttctttct
118
<210> 460
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 460
tctatcaccc ctttctttaa ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaaatata aaatataatc tcctaatt 118
<210> 461 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 461
acacaataac tctacacaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaatacaaaa ccacaacc 118
<210> 462 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 462
actcccataa acactcccac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaacca aaattcaaca aaaataaa 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 463
catctacaat aatatttatc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaactatac aactccct 118
<210> 464 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 464
cttacaactc tctaattaaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaacaa ccccaacc 118
<210> 465 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 465
tcttcttcca ttttaaaaac aacacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt acaattctta cacatcat 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 466
caaatatctt tcattaaaac ataagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa acaattccta aataccct 118
<210> 467
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 467
actcctctaa aacaaacctc catctccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaaatacct tccctacc 118
<210> 468 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 468
ctatccaaat ccccataaaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ttcctcctcc accaactt 118
<210> 469 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 469
aaaccaactt ccctcaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acctaaaacc tttcactt 118
<210> 470 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 470
tccctaacaa tcaatcctca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaat aactataaaa ctcaaaat 118
<210> 471 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 471
ccacaaaaac acaactactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntatc taactctatc ttttcctt 118
<210> 472 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 472
tccttccttt aaaactaatt taaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnctcta ttaaaaacta tttcctat 118
<210> 473 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 473
tcaccaaaca acaaccacct ctaaaattcc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccccataaa aatacctc 118
<210> 474 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 474
accaaaccct ctacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ccccttttac aaaaacca 118
<210> 475 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 475
ccttcataaa caacaaaaac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctt aaaatttcaa actaaacc 118
<210> 476 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 476
atctaaaccc aacaacaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacaaacaa ccatcact 118
<210> 477 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 477
cccacaccac aaacctcaac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaaccaaaat ctcaaaaa 118
<210> 478 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 478
acccattatc taacctcaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactaatt ctacactttt atataaat 118
<210> 479 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 479
ctctaaaaat aacaaattac acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaaa actaaattct ataacctt 118
<210> 480 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 480
ctctacccac ttccctaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacaaacaaa caaaaacaaa aactaaaa 118
<210> 481 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 481
tcaaccacat aacaacaata cctacctaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntatcc ccaaaaactt ccttatca 118
<210> 482 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 482
ccacttttct tctcaacctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt accaaaactt actaaacc 118
<210> 483 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 483
actctaaaat tccaaaaaca aaacttagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ccccttaaaa actctact 118
<210> 484 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 484
acactatact acatactaaa ataaactaaa tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttactt aatattttcc ttaatctt 118
<210> 485 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 485
ttcttcttac tatttaaata accaaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc ttatccacac ttaaaatt 118
<210> 486 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 486
taaaaatcaa cttctaaatt aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaca aaacacccct tccctttc 118
<210> 487 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 487
attccccacc ttcccttact ctcatatcat cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnataat attattccta acctccct 118
<210> 488 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 488
ccccaaccac ctaaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tctctataac aaacccaa 118
<210> 489 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 489
cctcaacaaa cacacaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacta cctcatattc tacaattt 118
<210> 490 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 490
cctaatatat tctataaaca caaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaatcc ttccatcttc ttaaaatc 118
<210> 491 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 491
acatctctca acatttacta tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ataattaaat ataaaactaa tatttact 118
<210> 492 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 492
attaaacaat aacttatcaa acagttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tcccaacaca taccacctcc aaatacta 118
<210> 493 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 493
atacaaccaa ctcaatcaat tcccaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcaa ccaccaccct cataccca 118
<210> 494 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 494
actttatttc taaatttaaa ctaacttaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac atctttccaa ccctaatt 118
<210> 495 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 495
cttctaaaaa tcccctttct aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaactcaac ctcactaa 118
<210> 496 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 496
actttactca ttcttaaacc aaacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ctctaacata tcttatct 118
<210> 497
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 497
acctatttta aaaacaaaat tactcaaatt ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aatctctaaa taatcccc 118
<210> 498 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 498
ctcaacacca cccaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncccta aacctacaac taacaact 118
<210> 499 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 499
aaatcaaacc ctacatcaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaca accctaataa tatctactac tataccaa 118
<210> 500 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 500
ctaaatttac tcaccccaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaaaa caatctcttc atattttt 118
<210> 501 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 501
acaaacaaaa tctatccaaa atctctcccg ttggaggctc atcgttccta ttccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntacc tttcctcttt cttctacttc cttctctt 118
<210> 502 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 502
acctcaccaa ctactcacat tacacagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn atcaaaaatc ccctccat 118
<210> 503
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 503
acttttcccc taaaaactct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaataaaa ataacatttc cttatcta 118
<210> 504 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 504
actccccaaa aacaaaacac ttctctacct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat accccctaaa tatttcct 118
<210> 505 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 505
atccttaaat caaactccct tccctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn attccccaca cccctattta ccaaaaac 118
<210> 506 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 506
tctccctact acaataaact ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaca tactcaacta aaaattat 118
<210> 507 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 507
ccttaaactc caattaaaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttca catttcacta aataaaaa 118
<210> 508 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
taactcaata ccacaaccca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aactaaatac ccatcaca 118
<210> 509 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 509
acacaaaaac aaaaacaaca aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaccacaaac aaaacaaa 118
<210> 510 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 510
acccctaacc ccaaacactc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accaacccaa tcttctcaca ttctaaaa 118
<210> 511 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 511
tccccacact taaccacaat aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcaaat aaatctaaat tttcttac
118
<210> 512 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 512
actccctcaa caacccaacc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaactaaa ataaaaactc tatataaa 118
<210> 513 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 513
acatactcaa aaacaccaat ccacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttttattc accctatttt tattataa 118
<210> 514 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 514
attctcaaaa tacaatcccc taaccaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cctaactccc attccaat
118
<210> 515 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 515
attataaaaa ctcaccaaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaatctatt tatttcctta aactaaaa 118
<210> 516 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 516
acttttaact acactacttt ctttgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaatttaa atttatctat aaaaatca 118
<210> 517 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 517
acttcctttc cactaaataa tattcattaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccattaat taaattctca cctttaat 118
<210> 518 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 518
ccactacaaa cctaaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcctccaaca ctaaataa 118
<210> 519 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 519
ataaataaaa ccaaacccct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaataa taactaacca aataaaaa 118
<210> 520 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 520
aaccaacaca aaatctaata agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca cttttatctt acaacatt
118
<210> 521 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 521
ctcccctccc taactagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctcccctcaa aataaaaccc aataaaaa 118
<210> 522 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 522
atcacacaat aattccaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaacaact ttttattatc cattataa 118
<210> 523 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 523
acataattat taatatccat accctaactc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta tattcatttc cacccata
118
<210> 524 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 524
aaaaatccaa aaatacaaaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacctatc ctcccctt 118
<210> 525 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 525
ctaaccaaat ccccttacaa aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna actaaaactt cctccaaa 118
<210> 526 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 526
atttattaat tccctactat atactcctta agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttatcatc aatctaacaa ataactaa 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 527
aaacacaaac taacaataaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaccaaactc ttaaaatc 118
<210> 528 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 528
ttctaaaacc acaccttcac ctacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac tccacctaat aacttctc 118
<210> 529 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 529
ccaccaaaac cactccctat tcctctacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncactc cctccaaaac cctcccca 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 530
acataaacca atcctctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaaca taaatatttc aaatatct 118
<210> 531 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 531
tccaactaac tactctcccc tacccaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aacccaaata aacaactt 118
<210> 532 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 532
accctccaaa cctacacctc ttaatccaac gttggaggct catcgttcct attcccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna attaaaacac aattacccaa caacaaac 118
<210> 533 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 533
ctaaaatacc aaactatcat ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact ttcttctatt tccattaa 118
<210> 534 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 534
ccttcttttt cctcttccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa tttaaaccct tcctaaaa 118
<210> 535 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 535
acatccaata caaacttatt ataaaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cattaaattt ccaccaaa 118
<210> 536 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 536
ctaaatcact acctcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnccata aataaaaacc tctaaaaa 118
<210> 537 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 537
atttctatta tttcaaacaa ataagttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt aataaaatta acctttacct ttctcaat 118
<210> 538 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 538
ccaaacctac ctcctcatcc cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntactcaa ctaacaataa taaataaa 118
<210> 539 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 539
acatccctaa cttactctac tctcacccca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ctccctcaaa cacaattt 118
<210> 540 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 540
acctcttacc ccttaaactc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttctaaatta aaaattctaa aaaccaaa 118
<210> 541 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 541
attccaacaa caaaccctag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccctccaa acactaaa 118
<210> 542 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 542
tcaaataaat ctctacacct ttctacctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc cccttacaaa aacaaaaa 118
<210> 543 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 543
ataaaccaaa tcaactaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaaccc caaaccat 118
<210> 544 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 544
acccctacca catcataaca ttcctaataa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaatt aaaaatactc ttaacatt 118
<210> 545 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 545
actaatactc aataaaaata ataacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttaaact ataaacaccc aattttat 118
<210> 546 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 546
acttttccta taaataaacc tatttaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcccca acaaaaactt tattataa 118
<210> 547 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 547
atacataatt cacactcatt tattaccaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ataaatttcc cctcccct 118
<210> 548 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 548
aaccaaatac atcctactgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa accaaattct ttacaaaa 118
<210> 549 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 549
actacctaac tatccccaac accttcctgt tggaggctca tcgttcctat tcccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna atctacctaa aatcctatcc ataccccc 118
<210> 550 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 550
aaacaccaaa cctctaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaaactctaa ccacaact 118
<210> 551 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 551
atccctaatc tattttcata atacacagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttactct accactatat atatttaa 118
<210> 552 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 552
cttcaaataa acacaaaaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc aaaaatcaaa attaaaaa 118
<210> 553 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 553
ataaacccaa atatacaata aactccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nataccaaaa ccctaaaata tctaaaaa 118
<210> 554 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 554
cctatcccaa ataccaacct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntccc aaactaaaaa ctacaact 118
<210> 555 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 555
acactacaaa atactaacta aacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttaatac tatctcattt taatacct 118
<210> 556 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 556
ctcaactccc ctccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnattc tcaactttta tacttttt 118
<210> 557 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 557
ctaattaaat acaaaataca aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttttcccaat cttttctc 118
<210> 558 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 558
aaaaacaacc cctctcctcc aaccccgttg gaggctcatc gttcctattc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa cacaatttaa cccataacat aaatatta 118
<210> 559 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 559
aatatcaacc ataaaccctc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac tttaccaaac aaatacat 118
<210> 560 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 560
acaactaaaa ataacaaaaa ctttgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttttc caactacaat aacaacac 118
<210> 561
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 561
atcccatcaa aacccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca cttttactcc tcctaaaa 118
<210> 562 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 562
ttctttaaaa caacttactc cttcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ttcaacctaa cacacaaa 118
<210> 563 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 563
ctaccaaact ctccaccccc acttccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaatctcc acccacacat tcctaaaa 118
<210> 564 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 564
actttaaatt ctaacaaatt cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac atcccaaaac aaaaatat 118
<210> 565 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 565
ctcaaccacc ctcctacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac attaaacaac catctaaa 118
<210> 566 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 566
acttacatta tcctcaaatc catcaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttctc atcaccaccc acactaaa 118
<210> 567
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 567
aaaaatataa atactccctt caagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaccaaac cctaacac 118
<210> 568 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 568
atcccactaa accactctaa ctaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntac caaataatct ccacttta 118
<210> 569 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 569
cctaaacctc tcaactcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnct aacaatctat cccaaaaa 118
<210> 570 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 570
atataacaac tcctcaaacc ttaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacttttcc tcctaaaa 118
<210> 571 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 571
ccctctaacc tttactcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttcact ctactccatc cactctaa 118
<210> 572 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
aaacaccctt taatacaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactaacaca atcacaat 118
<210> 573 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 573
accaacatct tcaacaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaattaa tatcatttca aaaacaaa 118
<210> 574 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 574
ccactctatc tcccattaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaaccttac aaatcctt 118
<210> 575 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 575
acacccatct aaatcccacc gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccag 60
gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta tatcatcaac taacccaata cctattat
118
<210> 576 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 576
acaccaaacc acaactaact caaacactca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncct ccctctacac caactaaa 118
<210> 577 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 577
attaacacct ctcaaactcc ttaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttcatttcc tcctcaatta taataact 118
<210> 578 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 578
cctccaaaaa ccctaatctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa ctataactac ctcattta
118
<210> 579 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 579
atcctaaata tcttcctctt ccttaattta cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctaaatctac atttcccc 118
<210> 580 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 580
atttctttct tacttacacc aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttatac caatcatcat aaatttct 118
<210> 581 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 581
accctttaac aaccatcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca aacctaaata aacaaaaa 118
<210> 582 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 582
ccaacctcac taacaaaact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcaaa ctaactttaa taaaaact 118
<210> 583 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 583
acaaaaccac aaaactcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaccttc caaaactaac acaacaaa 118
<210> 584 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 584
attctcttcc tctcccaatc cccaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaata aaaaccccct taatattt
118
<210> 585 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 585
actcctactt caactaaatt tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactat taacctataa taaacctt 118
<210> 586 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 586
aatcacacaa acctcaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacta actaaactta aaatacca 118
<210> 587 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 587
taacatcaat aaacctaaca aaaccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tttcccaacc aattaaaa
118
<210> 588 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 588
tctaccctta ccaaattccc aaaatcctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt taaaaaccac aacttcca 118
<210> 589 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 589
ctctaaacac tttaactcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc cattcaataa ccattaaa 118
<210> 590 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 590
acattcttca aaaccaccac taatcgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntatacc taacatacca aactaccc 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 591
atctaaaatt ttctcaactt tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nattataacc ttaaataatc actaatct 118
<210> 592 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 592
cactaaaccc aacaaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa aatacaccta atattcct 118
<210> 593 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 593
acaaccaaac ttaacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat acaaaattcc tccaatat 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 594
atccttaaat ttactctcca aaccctccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacaatta ataaatattt actaaatt 118
<210> 595 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 595
cccttttaat accccaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacaaaaact caactcaaat aaataaaa 118
<210> 596 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 596
cttctttaaa ttccaaatac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttcct tttaatacta ctctaaca 118
<210> 597 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 597
ccaacaaaac aatataaaac ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacaaactca aatcccaa 118
<210> 598 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 598
tctctttcct ctctctacta acacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc ttcaaaatac aaaacact 118
<210> 599 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 599
acccaaaaca aaattcacct ccaatcttat ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntac aaccctacct accaaatt 118
<210> 600 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 600
cacttttctt tctaatataa ctccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa atttcaaact acacaaaa 118
<210> 601 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 601
aaacaccaaa cacaactcac tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcccaca acactcat 118
<210> 602 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 602
actctaccta tttacccagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa aataactctt aaacacac 118
<210> 603 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 603
taatatcaaa atactaaaaa ctaccaaaac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttaatt tccctataac ctttaaca 118
<210> 604 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 604
caacaaatta aaacctacct aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acttaaaacc atcctact 118
<210> 605 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 605
cctaaataat aacttttcac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaat tccaattaaa aataccca 118
<210> 606 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 606
caaataataa aatcaaaact acacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaactcctc ctttaaac 118
<210> 607 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 607
cttccaccaa aataatccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatca acttaaataa atctactt 118
<210> 608 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 608
acaaacttta atttacacca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca aaaatcaaca attaaaaa 118
<210> 609 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 609
attctaacta ccctactccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aacattcatc ttttaaca 118
<210> 610 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 610
atccccctca cctcctctat ctatcttaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacctct ctataaacaa aacaaact 118
<210> 611 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 611
accccaacat tctccctaaa accctcctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaataattt ctatttccaa taaaaatt 118
<210> 612 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 612
attacccaaa aacacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaacaa ctaccccc 118
<210> 613 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 613
cccaaaacca aaatatctaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt aattactttc ccttcaaa 118
<210> 614 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 614
cacttattaa aactactaat tcctgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taactctttc catacact 118
<210> 615 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 615
acaaaaccac aaaccacatt tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacctc cctatcttta ataaaaat 118
<210> 616 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 616
actccttcca taacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccacttcc tttttcac 118
<210> 617 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 617
atacaaccaa tccaacaacc aattccaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntattcc ctaactcctc cctacaaa 118
<210> 618 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 618
acctaaatta aactaaatta tcaacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaacttc attctcaata tttatttt 118
<210> 619 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 619
atacattccc aaacccacct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cccttatcct aaattcccta tataatat 118
<210> 620 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 620
atcctccact cctaattttt ccatccaaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tatccaaaac actaccaacc aaactaat 118
<210> 621 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 621
aaaatactcc aactcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacaaaaca accccatt 118
<210> 622 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 622
caactaatta atattcaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntctaa atacaaaact ctctataa 118
<210> 623 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 623
cccccacccc caatctttct tctcctagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaaa tcccttctac ttaacatt 118
<210> 624 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 624
ttccattcta aataacaaca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaaccc cctcccaa 118
<210> 625
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 625
aaaaaccaca aacctacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acctaaaata ctaacaac 118
<210> 626 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 626
accccctccc ttcaacaact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacac aaatatttat tccaaaaa 118
<210> 627 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 627
ataaataaaa atttcaacac ctcccccaaa ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa attctctaca atcaaaaa 118
<210> 628 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 628
actacctcct cccaatacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnattctccc tacctcca 118
<210> 629 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 629
atttactcta ataaatcaaa aacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata aataaattta catatctttt tcctttta 118
<210> 630 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 630
acacactatc acaataaaaa ccacctaaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcctta actatctatt ctattttt 118
<210> 631 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 631
caaaaactaa accctaccct aacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accaacctaa aacctaac 118
<210> 632 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 632
cccctaaaat atcatcacca aaacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatccaacc ctaactaaat cctttaaa 118
<210> 633 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 633
tactaaataa ctaaactaat cctaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ttcaaaaact actaaaaa 118
<210> 634 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 634
actcaatctc ccttttactt tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaacaacat cacctccc 118
<210> 635 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 635
aaacccctcc cccaatccta tactcgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataccc tccaaactaa aatataac 118
<210> 636 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
accccatcca aacctagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc attttcatta caccatat 118
<210> 637 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 637
acatatctaa acatctacct cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcctaaa tttataactt ttataaaa 118
<210> 638 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 638
acatctattt aactatacac atcaaccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataatt ttaaattttc ctcaatcc 118
<210> 639 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 639
attctaaatc aacaatcacc taatcattcc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60
ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttaatat aacatacaat aaccctaa
118
<210> 640 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 640
ctctaaaaac ttaatatcac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacctcaatc aaaaacac 118
<210> 641 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 641
atcctcacta aaaactaaac acagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaccttc tccaaacc 118
<210> 642 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 642
aaaaccctcc ctcaatacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata cataaactta acccaaaa
118
<210> 643 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 643
tcccatcctc cctaaatccc aatcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natttcccta actacttcct cccctcta 118
<210> 644 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 644
acaaacacct acacctccct aatccccaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt atccctccta tcaaaaat 118
<210> 645 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 645
atatttcctc caaatatttt aatttttgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcactttaa taaacatcta tttacatt 118
<210> 646 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 646
catcttaaaa taaaaacaat ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaacat aacttctaaa attaaaaa 118
<210> 647 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 647
aaactctacc aacatccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc actcctttcc tataatta 118
<210> 648 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 648
atctatactt tcattactaa taccacccta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttaaacaaa tctatacatc tccctaaa
118
<210> 649 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 649
acccacaaac tattttccaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaccata aaaataattt ataatcaa 118
<210> 650
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 650
atataactca caaccccttc ctacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatcatcac acattacttt tatttcat 118
<210> 651 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 651
acaccaaaac aaacctctct cacaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaatc cctacacact cctaccct
118
<210> 652 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 652
cttaccatct aatctctcca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa actactctac aaatccaa 118
<210> 653 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 653
acctaacatc tacttaactc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnncc cctaaaaaca atatacca 118
<210> 654 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 654
ccctaattaa ataatactta aatccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaaaaaca aaaacccc 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 655
aaccaaccaa aactaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaccctcaaa attacact 118
<210> 656 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 656
aaaactctca aaacttaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acataaaaac aactatca 118
<210> 657 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 657
acaaatacca aaaataaatt tctcatcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacttt aaaataaacc taccaaat 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 658
ttaataaaat acaaacaaac acaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa accatccaaa attatctt 118
<210> 659 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 659
atttcttctc ccctctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt caaaaatacc taaaaact 118
<210> 660 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 660
acaccaaaac aaccacatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acccctacta acaaacaa 118
<210> 661 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 661
caatttctta ccaaaatcct aatgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaactacact acttccta 118
<210> 662 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 662
cccccaacta aatcctccca atcctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcatc ctaaaaataa atatacac 118
<210> 663 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 663
cccttaaata taacctacaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntctttt tctatattaa aacaaaaa 118
<210> 664 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 664
atcactcctt ccctaccttt cctacctagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntccata aacattataa ataatact 118
<210> 665 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 665
atttcatttt ctttccatat aactttgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntactaa tttaatacac acataaat 118
<210> 666 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 666
acaccctatc tacactaaat aaacacatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaccc tatctacact aaataaac 118
<210> 667 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 667
atcccaaata ccaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaact aaaaactaca actactaa 118
<210> 668
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 668
cactcaaact tatcatactt ctagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna actaaaacaa aaccacct 118
<210> 669 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 669
aaataaaatc acaacaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat ccaaaaacaa aaacaaaa 118
<210> 670 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 670
ctcctctttc cctcactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaac caaaatcctc tttcaaaa 118
<210> 671 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 671
acctccccaa acacacctca cactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttttc taatcttcaa aatcccaa 118
<210> 672 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 672
atcccctctc atcttaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accacaatct ttctttct 118
<210> 673 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 673
caaataccca caataactac atattgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ctactaacaa taacaaaa 118
<210> 674 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 674
aaaccaaact aaacaaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacaa ttattacttt cctaaaaa 118
<210> 675 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 675
atcccccttc ttcaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acctaactaa ctaaaact 118
<210> 676 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 676
ttcacctact cactccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tctctaccca actaaaaa 118
<210> 677 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 677
tcccattata cctaaactct cctcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acataacatt cttcaataca aacccacc 118
<210> 678 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 678
acttttaaat cttctacctt tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc ataaataaaa cacaaaaa 118
<210> 679 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 679
accctactct caactcaccc cacttctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatcc cctcatcaaa ctcaccca 118
<210> 680 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 680
acatcctact aataaaccaa aatcatcaca gttggaggct catcgttcct attcccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt caaattctta cttctttcaa acccaaaa 118
<210> 681 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 681
catcctcctc tttataataa aactagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaactacc aaaacacc 118
<210> 682 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 682
ataaacacac aatataaaaa ctagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ctcaaaaata aaaacaaa 118
<210> 683 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 683
cctttctcta aacacttaac aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaaaactcc tcctaaaa 118
<210> 684 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 684
attcctacct tactctaaat aactcactag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaataaa aataattcct tttaattt 118
<210> 685 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 685
cccttcctaa accctagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaaac tctaatttat atttccaa 118
<210> 686 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 686
acataaaacc ttcctttttc tcccctcttt atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcataat aataccaaat aaacaaac 118
<210> 687 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 687
ccaataacaa aaacaaatcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accccaactt tctcctaaac taacaacc 118
<210> 688 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 688
ccactacaac ccaattcctc taaaaataat tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcctctcta aatcctacca aataaaaa 118
<210> 689
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 689
taacaaattt tcctcttcac tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttcct ctaattctaa taacttca 118
<210> 690 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 690
ccaacttccc tacaacccca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaacact acaaaaacaa accctaaa 118
<210> 691 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 691
cctcatacat tttcctctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaactctt cctaccttct ctatcata 118
<210> 692 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 692
acacctacac ctccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaacccaaa caaaactt 118
<210> 693 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 693
acttatttta tttaaaaaca aaatcttact ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttcc tctaattaat ttcaaatt 118
<210> 694 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 694
acactcactc tactccttct tcagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaatatt tatactcatt actaacat 118
<210> 695 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 695
acaacatcca aaatatcacc aaaccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttattct ctaaccactt aataatat 118
<210> 696 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 696
cattaataaa ccctaaacac tttgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aaacctattt ataacact 118
<210> 697 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 697
accactaaaa atcacccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacctcctt aaaaccaa 118
<210> 698 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 698
ccttccaact cttcttaacc ttaccaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa taaaaatcca caaaacta 118
<210> 699 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 699
caaaataaac aaacaacccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa tattcaacaa actaaact 118
<210> 700 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
caatttcact tttcttttcc tcttgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcctccctta actaaaaa 118
<210> 701 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 701
atttccaacc aacaccagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acaaactcat aacaaaaa 118
<210> 702 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 702
tacaacaaac ctacccttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tctaatataa aactaaactc tatactat 118
<210> 703 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 703
acttcacaac ccccaccaaa caaaatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttcctt aaactttaaa cccaatat
118
<210> 704 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 704
ccttttaatc aaactactcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actaaactcc tacaaaaa 118
<210> 705 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 705
attaccctac caaaactaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acctcccaaa atactaaa 118
<210> 706 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 706
caatacacac tttccaacta tcagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cttaacctaa aaactccc
118
<210> 707 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 707
acttcctacc taactctaac tcacacaaca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntatttc cttttaccaa cccacacc 118
<210> 708 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 708
acaaccaaac ttaacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat acaaaattcc tccaatat 118
<210> 709 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 709
ttaccaactc tactcaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaccctc ccccaacc 118
<210> 710 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 710
cactttaaac taaaactact ttttaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttacaaaac aactccct 118
<210> 711 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 711
ccaactccta cactcaaaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt acactacaaa tacacacc 118
<210> 712 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 712
aaactaactt caaacaactc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacaa tataaactca aacaaaaa
118
<210> 713 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 713
aaattcatct ccaaaaaccc aacccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ccacaactaa attcctta 118
<210> 714 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 714
accatccacc acatacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttccaaaaca actaacaa 118
<210> 715 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 715
acaaaacaaa accacttccc caaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttcaa taatatctaa cacataaa
118
<210> 716 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 716
actcccaacc tttccaccaa aacctaacta gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntccaat attaccaaaa actaaaaa 118
<210> 717 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 717
aatcaccctt catcttcaaa tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatat ccataacctc ctaataaa 118
<210> 718 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 718
attaataaaa taacaaacta caaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnatatac cttttacaaa tattttct 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 719
tctacaaaac accttcccct ccccttcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcaaattt ctctttcaat ttctaacc 118
<210> 720 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 720
aaactcaaaa ccaacctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttaaaa tacatccttc ttaaccta 118
<210> 721 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 721
acctccacta aacaaaacca aacccctaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnatacaa ccattaacta taatactt 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 722
acctcttccc acataaccca aaattaaact tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaacaa aataaaaccc taaatttt 118
<210> 723 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 723
acactacaaa atactaacta aacactcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatac tatctcattt taatacct 118
<210> 724 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 724
acccaactac tccacagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt actaaaaaca tccaacat 118
<210> 725 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 725
cctacccttt tatatataaa actgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn caaccttacc tttcttct 118
<210> 726 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 726
ccacaaactt ctatcctagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntctact ttaacttaaa atctaaaa 118
<210> 727 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 727
ctccaaactt acaacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aatcttccta caaaatac 118
<210> 728 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 728
acaaaaatct cctacaaaac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aactctactt attcctca 118
<210> 729 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 729
aacaaaaacc accaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnctct caaacccaaa ataaaaat 118
<210> 730 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 730
acttacacca acacacaact tctaaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntatat ctcttattaa tttccctt 118
<210> 731 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 731
atccaaccca tccaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcctacctt taccttct 118
<210> 732 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 732
acaaaatact ccaactcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacaaaaca accccatt 118
<210> 733 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 733
atccctaaat ataacaccaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaacaaac aaacctca 118
<210> 734 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 734
ctataaataa atatcctttc cacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaatctaaac aaccaaac 118
<210> 735
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 735
attccaacaa cctttcagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaacaaacac aatcaaaa 118
<210> 736 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 736
acctaaaacc ctttctaaac aactctagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcaaccc ccttcaacct taaaataa 118
<210> 737 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 737
atattattac tccaccacaa ccacaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat ataaaccaaa tatcacac 118
<210> 738 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 738
accaactact ccataacctt aaacacctca tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttca cctcttaata atctaact 118
<210> 739 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 739
ctcaaaatct cttacttccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacttttta actttaaata taaaaacc 118
<210> 740 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 740
ctctaccaac taactaaaac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn actatcctca ttctcaaa 118
<210> 741 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 741
ctcctaacac tacaaaataa ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaacaacc aaaaccta 118
<210> 742 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 742
cccaaacctc actcatacat cttgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaacactc tatacacc 118
<210> 743 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 743
tctcctctta aaaaccacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaac taaaataaac caacaatc 118
<210> 744 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 744
tcttccaaca ctccctcaac aaaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aataacaaac aaaaccct 118
<210> 745 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 745
accaaaattc aaccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta acctacataa acacacac 118
<210> 746 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 746
aaaaatcacc accatacaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa cactctaaac aaattcta 118
<210> 747 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 747
accccaacaa ttacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa atacaaattc aaacaact 118
<210> 748 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 748
cacttccttt atatcaataa cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttta caactacaaa ttcacatt 118
<210> 749 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 749
tatcttccta acaccttcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcaaccaaat tcctaactaa aactcttc 118
<210> 750 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 750
aaacacacaa actacaatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa atcacaaaat ttcaaaaa 118
<210> 751 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 751
ccttctattt taaaacacac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aacaacaaaa acttcaaa 118
<210> 752 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 752
acaaaaacct ctacttccaa aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaac tatctaacat cactattt 118
<210> 753
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 753
actacttact tcacataaaa ataaccctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcctata aatattacat ataacatt 118
<210> 754 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 754
acctcaaact accaaacttc ctatccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccctcttt cctatttcct atcctaaa 118
<210> 755 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 755
cctcccaacc actattccct aacccactat aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaacatctac ataccctc 118
<210> 756 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 756
cctctcaatc cctataataa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcaac acttcctact ctaaactt 118
<210> 757 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 757
tccctaaatc ctttcctaaa caacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc taaccttctc tatacttt 118
<210> 758 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 758
tctctacctt tattttccac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta cactaaatca aaaacaaa 118
<210> 759 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 759
tccttaaatt tcctttccca tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naataaccct cctaccaact ctcccaaa 118
<210> 760 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 760
cttcattcaa ctctcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaaaa ccacaaacaa ctctaaaa 118
<210> 761 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 761
ataaaatcac aacaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc aaaaacaaaa acaaaaat 118
<210> 762 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 762
ccctaaaacc ccaatcaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaaccttcc acaaataa 118
<210> 763 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 763
cctataactc ttattctacc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncccttatc ccaccttt 118
<210> 764 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
aatccctcac aaacaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caacacaaaa actaacaa 118
<210> 765 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 765
cctacaactt tcccaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaataaac cctctcatat ataccttc 118
<210> 766 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 766
attatcccca acccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncatatacac aacaccca 118
<210> 767 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 767
tcaaaatcca aacaaaaacc cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca aatacaaaat aaatacct
118
<210> 768 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 768
acttccctaa atccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcctttcca ctccccca 118
<210> 769 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 769
taataaacta aaaacctaca aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntatcc cttattctaa aaactaaa 118
<210> 770 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 770
acttcttcta ctaattaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaaataaaca accaacca
118
<210> 771 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 771
tccaactcca aaccctaatt atcccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaacaact actatattcc tcttaaac 118
<210> 772 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 772
aaatctcaca caataaacaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cccccaaccc tctacctc 118
<210> 773 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 773
caaaataaac cctaaatcat cttcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc aaattctttc caaactac 118
<210> 774 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 774
atcctcctct taaatttact cttttaaaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntata ctcccaaaat cctaaaaa 118
<210> 775
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 775
actcaacccc ctttcctaaa accaaaactt gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aattcatccc aattctaa 118
<210> 776 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 776
accctcttaa aattctcaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaattcct aaaatactaa aataaaat
118
<210> 777 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 777
ctcccaaaac acaacaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntctaaccaa acaccaaa 118
<210> 778 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 778
actaaaactt ccttttactc cccaatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaataa ccttaaattt aataaaaa 118
<210> 779 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 779
aaaaaccact acctaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaccaat cttcattatc tttaaaaa
118
<210> 780 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 780
tctatttccc acacccctac ccctatctaa ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatat ctaatataaa acctccct 118
<210> 781 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 781
ccccaactct cctaaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaacac atacaaataa ctaacacc 118
<210> 782 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 782
atctcctcct atttctaaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ccccacttac atccaaca 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 783
ccctatctta cttcaaacta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tcaacctctt ctctaaaa 118
<210> 784 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 784
ttcataactc aactcctaaa tcaaatcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna actaaaccta aacatacc 118
<210> 785 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 785
actttctaac ataactaatt caatgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaacata tacatcctat attctata 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 786
acactaaatt tacaaatttc tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatca aacaaataaa taactttt 118
<210> 787 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 787
actaccttcc ctcccaaaat ctccaaataa tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn atacctctca acccaactcc taacaaaa 118
<210> 788 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 788
atataatttc aaaataaatc actcctccaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat aaaaccctcc ccttcaaa 118
<210> 789 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 789
cttaacacta ttccaaatca ctaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acttcctaaa tacaacaa 118
<210> 790 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 790
acccaaactc tcctccacaa ataaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aactctaaac cccaaaaa 118
<210> 791 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 791
ccataaccca aaacatcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aataaaaact aaccactt 118
<210> 792 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 792
acctataatc ccaacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt aaatacacat ctccaact 118
<210> 793 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 793
actctcctta ataaaattct ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaatac atattactat tttccact 118
<210> 794 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 794
tcacaaaatc acaacctccc caaaaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaacttt aaataaacaa aacttttt 118
<210> 795 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 795
ccaccctcta acacttgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttacaaa ctaataaata atctcaat 118
<210> 796 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 796
acccctaaaa tacccctaac cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ccttaaaaat aaaactataa aaataact 118
<210> 797 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 797
acaaataaca caccactacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaatcca cctaaaaatc ttcaaaaa 118
<210> 798 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 798
accaacttaa aacccaaaac cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt ttactataat ttaacatttc cctccacc 118
<210> 799 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 799
aatcataaac ttccaaatta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncta aaaacatatc taacctca 118
<210> 800 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 800
ccttaaacaa ctctctctac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacccaccta aattactt 118
<210> 801 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 801
ataacaactt cccttcctca actacctaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa cccaaccctt tctaaaaa 118
<210> 802 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 802
tatccaatca aaaccataaa ataaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaactat atctaaaacc tattcatc 118
<210> 803 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 803
actccctatc ccaaactcac cttccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaccca aaaccccaaa acacaaaa 118
<210> 804 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 804
ataccaatct atctccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacattacc ctacccca 118
<210> 805 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 805
cttatcatat caaaaacaca cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnccct ccccacacaa acctcacc 118
<210> 806 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 806
aaccaaaacc aatttacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatctt ttcttataat atcacttc 118
<210> 807 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 807
acaaacacac acacacacac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacacacac aatcacaa 118
<210> 808 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 808
ttaccctaat atcctacatt cttactccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttccaaaaac tcatccaa 118
<210> 809 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 809
attatctcta acaaaaataa aaatcaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacct cctaacaata aataaaaa 118
<210> 810 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 810
cttccttaac tatccccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaactta aataaactca attacaat 118
<210> 811 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 811
accccacttc acaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttaccaat ctcctcct 118
<210> 812 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 812
atctccccat ccccaattac taactatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaacaccc taacatacat ctataaat 118
<210> 813 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 813
actttctcac caacctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcccacct accctaaa 118
<210> 814 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 814
caataactat tccctaaaca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaacacaac ccctacaa 118
<210> 815 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 815
tctccctcca actaccaaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttaa aaatttaaaa acacacta 118
<210> 816 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 816
atccttcctt taaaactaat ttaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntctatta aaaactattt cctataaa 118
<210> 817
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 817
acaaaattaa actaaaacaa ccctccaacc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttccc caaataccct ttaaccat 118
<210> 818 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 818
atactaacaa ctctccaact ctcccctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaacccc caaatacaaa actattat 118
<210> 819 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 819
ctccaaaaca aactcctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatta aataaaatca aaacaaca 118
<210> 820 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 820
tcctcaaaac ctacaacact acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaata acaacactat ctcattaa 118
<210> 821 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 821
aaaaatacct cacccaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc caaattccaa actaaaaa 118
<210> 822 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 822
ccaactcaac actaaatact agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aacttcaatt ccaaatca 118
<210> 823 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 823
cctcccttct ttccaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacaaccc ctatcttc 118
<210> 824 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 824
aactcatcta aatcaaacaa ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctctaaacaa acaacaaa 118
<210> 825 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 825
cttaatcctc ctaacaactt gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatta actactaact aaaaacaa 118
<210> 826 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 826
acaatcctaa accctccacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ccaacctaaa caacaaaa 118
<210> 827 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 827
acctacctcc ctaaacaaaa accccaaaaa ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac ttaataaaac catttcct 118
<210> 828 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
ccaaaccaaa atacaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc
ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaatta tacaatctct aaaataaa 118
<210> 829 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 829
ctacctatca caaaaatact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntct tcaaaaatac atttacct 118
<210> 830 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 830
acacctcaac aattaaattt acctaatccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnattacctt cccatattta tcaataaa 118
<210> 831 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 831
taaaataaaa caaacaaaaa tttcctaaat ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cttttcctcc cctacccttc accctttc
118
<210> 832 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 832
ataaaaatac aaaactatca caaacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaata aatttaataa aactcccc 118
<210> 833 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 833
ctcaatatta cccaaactaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctaatctcca actcctaa 118
<210> 834 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 834
attccccaaa aactcatctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttaaattac aaccccca
118
<210> 835 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 835
acataaacaa taaaactaat actgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttac caacataaat taacaaaa 118
<210> 836 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 836
cttcacccta ttcccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc aaataaaacc ttacctac 118
<210> 837 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 837
ctaaaatctc ataaatccct taaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaccctta aaacacac 118
<210> 838 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 838
aacctaaatc aaacttccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttcact ctaaaaatat ctatcaaa 118
<210> 839 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 839
ctactcacta ctcactcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaccaac aaaacacc 118
<210> 840 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 840
cacaaatata taaatatcta cctaataagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60
cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaacaac cacaacaa
118
<210> 841 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 841
ccaactcccc ctttcaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttctt tcttcaaata ccacatcc 118
<210> 842 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 842
ccaaaacaaa cccctctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact caacccctaa aataaaaa 118
<210> 843 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 843
ctaacacaaa aactaacccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt accttataca accactaa
118
<210> 844 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 844
ccaaaaacct aaccaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac ctaaaatcca attaaaaa 118
<210> 845 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 845
acacacaaat actactctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat catcctaaac actaaaaa 118
<210> 846 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 846
atttaaaaac aaaacaaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taacaacaac ttctaaca 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 847
ctacaaccca aaacaacaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aaaactcaac cttcacaa 118
<210> 848 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 848
ataccaaaat ccaaaactcc ctcaaacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttaattaatc aatttcactt cctctaaa 118
<210> 849 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 849
acatttccct ccacccacac atagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaatctatt caacataaaa accttctt 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 850
ctctaaaacc accctatctc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna acctaacata acctaact 118
<210> 851 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 851
atccctccaa acaacaccaa ctcacagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcccctc tctccccaaa aactaact 118
<210> 852 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 852
aaatccctct acattaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aacaaaaatc tactacct 118
<210> 853 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 853
ccaaatacct acatcaaaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa actttaacat aatcctcc 118
<210> 854 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 854
acaaacaacc ccttccacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taacaccaaa ctaatccc 118
<210> 855 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 855
aaccttaact ataaccctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttctt tttctatttt taaacaaa 118
<210> 856 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 856
ccaaaccaac tccattaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactaaatat ccaccctt 118
<210> 857 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 857
acccacattt taaccaaaat cacaaaccca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa atttcaataa tcccaaat 118
<210> 858 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 858
actcctcctc ctacaataca taactaaacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaat taaattccca tcaatatt 118
<210> 859 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 859
atctttccaa ataacctttt tccatccccc acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntccc taaaaataaa atcccacc 118
<210> 860 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 860
ccctttaaca aaacttttcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ccaaacatta acctacac 118
<210> 861 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 861
atcctttccc acaatttgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaactctt cccacact 118
<210> 862 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 862
taaccctcta aactacccta aaaatataaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca ctctccctaa actctaaa 118
<210> 863 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 863
taacttttaa attaataaaa caataaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaaccataa ctactcca 118
<210> 864 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 864
tccctaccta actcaaattc aaccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntct tataacttct ctactact 118
<210> 865
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 865
cttcttacaa ctctaaaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaact taacaaatat acaaactt 118
<210> 866 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 866
acccttattc cccacttata ttcttcctca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa aatcttctca aacctttt 118
<210> 867
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 867
ccccaaaact tccaaactct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ccattcacta aaaccttt 118
<210> 868 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 868
ctcctactct taacctacct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca aactaactct ctccataa 118
<210> 869 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 869
cctacaaata cctctaccta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc aaaaacaaca aaatcttt 118
<210> 870 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 870
ctaaactcct aataaactca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttaacc aataaaacta aataacac 118
<210> 871 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 871
ctaacatcta caataatcaa atattgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aattcacaaa ctctaact 118
<210> 872 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 872
aaaaccaact tcctttcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa atcaaaacaa accaaaaa 118
<210> 873 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 873
ctcaaaactc caactactcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaact ctaaaatact aaaacaaa 118
<210> 874 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 874
tcaaacccac tacttcataa tcaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cacacacaca cataaaaa 118
<210> 875 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 875
tctctccccc tctatctcta tctctctccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntattttatt aactctttct ctataatt 118
<210> 876 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 876
atttaaatac tactaacact tcccgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt caacactcaa acaaatttaa ttatctct 118
<210> 877 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 877
ccccaaacat cacaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaatc ttactatctc ccctctaa 118
<210> 878 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 878
cattcacaac ttattattaa tcagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc aactaatact atatacac 118
<210> 879 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 879
cctacacaaa acattatatt cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naactcaaac tcccaaaa 118
<210> 880 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 880
cttcctcccc tcccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaat taaatcccta aaataaaa 118
<210> 881
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 881
caaaatccaa aacaccatcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc actataacta taaacaaa 118
<210> 882 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 882
actcatctaa caaccaacca cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatct acaatacact aaacccaa 118
<210> 883 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 883
acccaaaact ctacaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aacatcacca aactctaa 118
<210> 884 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 884
acactaacct acctataaaa tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacaaaca aacaaaca 118
<210> 885 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 885
actcaataaa accaacctta cctccaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacaaacaa tacctttacc caacacct 118
<210> 886 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 886
aaaacttact aaaatcacaa caactgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaatt ccctctccta cctaaacc 118
<210> 887
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 887
tcacttcctt aactatcccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcaacttaa ataaactcaa ttacaata 118
<210> 888 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 888
ataaattcac accataaaac aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa tcaaattttc aaaaccaa 118
<210> 889 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 889
ccaacaacct ttcatccaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaacaaacac aatcaaaa 118
<210> 890 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 890
tcacactata ttaccccaca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntactcttc tactaacatt tcctatta 118
<210> 891 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 891
cctaacaaaa ctcctaaact accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca aaaacaacta aataaaac 118
<210> 892 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
ttaacaaata acacaccact acctcgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aatccaacta aaaacctt 118
<210> 893 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 893
acttaatatc tttccttaaa cctcaactaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcacaat tttcctatca attaaccc 118
<210> 894 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 894
acctcacccc caaaaaccca aaaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa cccttcctta aataatat 118
<210> 895 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 895
ttatatcttc ctaacacctt gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcaaccaaa ttcctaacta aaactctt
118
<210> 896 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 896
cccataacat ctccatattc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntctctc tccctcactc actcacac 118
<210> 897 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 897
acaacctata aaaactaaaa atcaattctt cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt caaataaaac ccttctcc 118
<210> 898 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 898
tcctttttaa aaacctaaaa atccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca aaatactaac cacaatac
118
<210> 899 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 899
ctaccttaaa cccaacaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta ctccataacc aactacaa 118
<210> 900 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 900
actccctaac cctttctaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncccaccaa ctcctcca 118
<210> 901 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 901
ccatactaat atcacttaat ataatgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aactcatacc taatctct 118
<210> 902
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 902
cccccttctc atccctcact attaccactc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa atccctaaaa taaaaacc 118
<210> 903 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 903
taaaatcacc tttaccccac cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aacctctaat acctttat 118
<210> 904 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 904
attccaatta ccccatttac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact accatttcct aaaaacaa
118
<210> 905 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 905
acccaacaac ccctaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ccctttaaac ctaaatat 118
<210> 906 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 906
acttaaaacc taaaccctca gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttat ttttctaata tttaactaca tactaaaa 118
<210> 907 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 907
tatatacaca cacacaacct ccccctccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntatctcc ctaccaaccc cctcaacc
118
<210> 908 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 908
accctaaact atcaccagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttcctcct accccacc 118
<210> 909 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 909
acctcatata acaataacaa taaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaacatta tttaatattt attttatt 118
<210> 910 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 910
cctctttctc taaaaccaaa tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctaaaacct aaacaaaa 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 911
attctacaaa atattctcct tttattcctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaattaa acatcctaac tactatat 118
<210> 912 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 912
acctcaaaaa ctcaataact taccaaacct gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt tcaaaaccac acataaat 118
<210> 913 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 913
cctccaaact cccaaatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ctttccacac tttaaatt 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 914
acacaattct tccaaaatta caaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnattcca aaactacaaa tattctct 118
<210> 915
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 915
ctccaaaaca actatcaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctt caactttact cactataa 118
<210> 916 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 916
aaccaaacca catactaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaaccttcaa cttaaaaa 118
<210> 917 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 917
ctacctcact aacaacacac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aataccctct acattcct 118
<210> 918 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 918
cctctacctc tctcatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataaaa tctactaata aaatcact 118
<210> 919 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 919
attaactaat ccacctaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaacctta cttctccc 118
<210> 920 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 920
tcccatctca aaatcctcca acagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttcaa actactaact tattaata 118
<210> 921 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 921
ccaaattcaa ctaaaccccc aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaca taaaaacaaa aataaaaa 118
<210> 922 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 922
aactctttcc tctaaaccct attaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naactccatt aacaaatccc ctaacaac 118
<210> 923 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 923
ccaaatttct accttcctat ttctgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aaatacaaaa actccaca 118
<210> 924 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 924
acaaaaacca aaaactccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac taaactcaca aactaaaa 118
<210> 925 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 925
acttcttcca acatatcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcactcaa caccaaaa 118
<210> 926 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 926
acacactcct tcaatttcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaacaac aataccaaca acaaaatt 118
<210> 927 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 927
acttcctatc cctcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc acataaacaa cctttaca 118
<210> 928 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 928
tccttcctct tctccctaac tctcctctcc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actaaatctc tacaactc 118
<210> 929 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 929
acaccctaaa acccaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaacccca aacaaaac 118
<210> 930 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 930
acctttcttc ccctcagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncccccaaa cccattct 118
<210> 931 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 931
cctaaataat atccttatac ctacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctcaatccc aaacaatc 118
<210> 932 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 932
atttactact ccttaccctt ccataaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaatcca atattttaat ataaacat 118
<210> 933 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 933
actcttccct atccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa ctaccaacct aaactttt 118
<210> 934 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 934
ccaactccct acaacataat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacat aatcctaaaa actaacac 118
<210> 935 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 935
ctccataatt aaacccacca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacaaacctc aacttacc 118
<210> 936 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 936
cctcctaaac aaaaccaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ccaaaactat tacaaatt 118
<210> 937 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 937
acccacccaa tcccaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntccctcca ttctccca 118
<210> 938 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 938
aattacattc acaactctca ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaacttcac cacaaaaa 118
<210> 939 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 939
atttctcatt cctcttccca cccaaaccag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaattcta atctaattaa tctaaaat 118
<210> 940 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 940
ccctccaccc tatccacaaa aacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataact tatatatatt cattccca 118
<210> 941 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 941
actcaaaact tatttccctc cttcaaaata tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacata cctatatttc catctaat 118
<210> 942 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 942
taaataaatc tcctccaaaa ctaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncact atataaacac tactctaa 118
<210> 943 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 943
actccctata tcaccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncctt ataaaatccc taatatca 118
<210> 944 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 944
ttatatcttc ctaacacctt cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat tcctaactaa aactcttc 118
<210> 945 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 945
atataactca caaccccttc ctacccgttg gaggctcatc gttcctattc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaata ttactatcat cacacattac ttttattt 118
<210> 946 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 946
cttctataca ctactcctct atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntctttaa aacttaataa aaacaaaa 118
<210> 947 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 947
aaatctcaca caataaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa cccccaaccc tctacctc 118
<210> 948 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 948
cccaacataa cacatctacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac ttcaatacta aatcattt 118
<210> 949 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 949
cactaacaaa actaattcct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaaa ctatatacac aataacac 118
<210> 950 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 950
cacccctaaa tatcaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaat caccaacaac attaattt 118
<210> 951
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 951
ctccctctaa aaatcatcac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aatccaatac tccttcta 118
<210> 952 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 952
acaatcctaa aaactctcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttata aatttcaaaa tcactaat 118
<210> 953 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 953
cacaattacc tctccccttt cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaca ttaaaaccac ttctacta 118
<210> 954 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 954
accttacaac ttttaccttt acccagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntattcctt acaactaaat taaactta 118
<210> 955 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 955
caaaacccaa acctctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaaca cttcaataac attataaa 118
<210> 956 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
cactttacct tatcaaatct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntccta ctaaaaatca tcttttat 118
<210> 957 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 957
acacacacac acacacacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata caacttctta aacaaaaa 118
<210> 958 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 958
actttatcac tttttaccat atcttcaaac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttta aaaacattaa aatccttt 118
<210> 959 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 959
ataaactatc tacaaaccca cataacctta tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacccca aaatatttaa tataatta
118
<210> 960 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 960
accatatcta cctaaaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaactaccaa tctatcttaa aacaataa 118
<210> 961 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 961
aaaaacaaaa ataatttatt tacctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntccccatcc tctcccaa 118
<210> 962 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 962
acattataaa actatttaca caacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aatccacaaa accccatt
118
<210> 963 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 963
tccaaaatcc tcctctacct cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaactcc acaacaaact attatttt 118
<210> 964 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 964
aaaaatccct ataaaacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcta actaaaaata attcccct 118
<210> 965 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 965
ttttaactac cttaatacaa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa ataaccccta tacttctt 118
<210> 966 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 966
ccctaacctc acttcacaat tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaataaca accaaacc 118
<210> 967 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 967
atctacccaa taaattctcc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnattat tccaaacaaa attcaacc 118
<210> 968 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 968
ctaaaacaat acataccacc tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nataacctca caacaact
118
<210> 969 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 969
acccatacaa cttcctatcc accacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntatt ttatctcaat cccaaaat 118
<210> 970 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 970
ccaacctacc tccctaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntcaaa aacttaataa aaccattt 118
<210> 971 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 971
tcactacacc cccacctccc aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccaggc 60
agatgttatc gaggtccgac nnnnnnattt ttaaacaaca acctcacctc taaaaact
118
<210> 972 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 972
acctacacac atacaaacaa aacaaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaca taattcttac ttccccaa 118
<210> 973 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 973
acacacacac acacacacac acacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acccctccca actttcta 118
<210> 974 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 974
tttcctaacc ccaaaatcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa ctaaaattac ataaccta 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 975
atccctaccc tcctacaaaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ccatttaaca acattttata aatcatta 118
<210> 976 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 976
caaaattatc cactcacaca accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt actaaaaatc aaattcac 118
<210> 977 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 977
caaatactaa accacctaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcta tatctatcct ctacaaaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 978
aactccaaaa acctactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncttaa ctcataaaaa caaaataa 118
<210> 979 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 979
cttaaaaccc aacactacca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt actactccac aacaaaaa 118
<210> 980 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 980
accccctccc cctatctttc tctgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat taaaataata aaacaaatat ctctttat 118
<210> 981 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 981
actcatacct ataatcccaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntatcttta ttacaacaat tttataaa 118
<210> 982 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 982
tcataccata acaaaatctc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa tttaacctaa ctaaactt 118
<210> 983 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 983
catataatat ctaaacaaaa cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa atccaaaaac tataacca 118
<210> 984 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 984
cttctatacc taactccaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa accaactatt cattttaa 118
<210> 985 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 985
acctaaattt ctcctattaa ataacaaaat aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta accaacctac cctaatat 118
<210> 986 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 986
ccaataacca attataaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncctaccccc tataaccc 118
<210> 987 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 987
accctactca actaccttcc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tttttatcac ataaaattac tataattt 118
<210> 988 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 988
ccaacctcct taacctacct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa atttacttct tccaaaaa 118
<210> 989 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 989
taaactcacc aaaaatacac aacccctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatattttc acccctac 118
<210> 990 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 990
accccaaatt ccccttccta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacttcaaa tattcataat accttaca 118
<210> 991 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 991
cctataatcc caacacttta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntccc aaaatactaa aaatacaa 118
<210> 992 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 992
cattttaacc aaaattaata accagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa atacccaaaa attaactt 118
<210> 993 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 993
acctcataaa acctccatcc ctaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttcattt aacacatatt tataaaaa 118
<210> 994 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 994
actaatcacc cctctatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ctttattccc tcttaaca 118
<210> 995
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 995
acccctacct cccatactca ccttcaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaacccc aacaaaccaa actaccca 118
<210> 996 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 996
acttaaccaa aacataaaat ttatatccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaac ctttattaca aactataa 118
<210> 997
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 997
atctctccct cctcacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacaa tctataaata acctttct 118
<210> 998 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 998
ccaaatataa taacctaaaa acaacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac taaaaacaaa acaatcct 118
<210> 999 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 999
aaaaacccct ctaaacaacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacacatcaa aacaacaa 118
<210> 1000 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1000
aaaaactcct accactatcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctcaaaacca aaaacctt 118
<210> 1001 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1001
acaacctaaa atcacaaaac aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aacccaaaaa cttttaaa 118
<210> 1002 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1002
acctaaacac caaaatattc ctactcaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatc cttttcttca ttataaaa 118
<210> 1003 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1003
tcccaaacca aataactccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnctac aaataaacta cacttaaa 118
<210> 1004 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1004
aactaaaccc acattatcta gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna acaaactcaa aacaaaac 118
<210> 1005 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1005
tctacctcct cctactacta ctaacaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac aaactaaaac tatacctt 118
<210> 1006 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1006
accaccacta catcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta actctcaact acctacct 118
<210> 1007 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1007
acaaaaaccc acttaaatat aacctaaccc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaac acctataaat aatctaaa 118
<210> 1008 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1008
acaccaaaac aaccacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaacaac acccctacta acaaacaa 118
<210> 1009 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1009
tactacaatt tcacaacaca ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatttccac atccacaa 118
<210> 1010 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1010
acctctcaac ccaaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttctcaacct ccctccca 118
<210> 1011 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1011
acaaccacta aatcaaatct aaccaaatac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnataattcc cattatattt attttaaa 118
<210> 1012 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1012
actaactcca ataatttata ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttacccacc tcccaccc 118
<210> 1013 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1013
actccaaacc taccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctacttcct tacaaaac 118
<210> 1014 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1014
tctaaaccct aacccactac ctaatttacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncaaat ccccaaacta acacaaac 118
<210> 1015
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1015
aaactacttt taaaacaaat ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cactaaatcc aacaaaaa 118
<210> 1016 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1016
acactaactt tcaaatacat agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcca aaatacaaac aatttata 118
<210> 1017 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1017
tcctctatta aaacacctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcaaaac ataaactaca aaattaca 118
<210> 1018 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1018
accctaaaac accaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaacctaac ctccttct 118
<210> 1019 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1019
ccccctctta tctacaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttaaac acaaacaata caatactt 118
<210> 1020 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acacacaaat cacctaacta ctccttcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc taacaaaaat ctacaaat 118
<210> 1021 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1021
acccaaaaca acaaccaaaa ccccatacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acatccaata cctacaaa 118
<210> 1022 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1022
tttcttttta cacaacaacc ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaaaa caaaacaaca aataaata 118
<210> 1023 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1023
acaacattta atattaacca caactctaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttttctt atccctcaat cctactta
118
<210> 1024 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1024
acaaaacctt cttcaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntataaa cttaaaccaa accaaaaa 118
<210> 1025 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1025
acctctaact tctacaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ctcatactaa aaattcct 118
<210> 1026 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1026
attcaaataa ttctcctacc tcaaccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttttatt tatttctttt aaaacaaa
118
<210> 1027 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1027
ccactaccaa cccaactcca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacacaaaa acctaaat 118
<210> 1028 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1028
aattcttcta atcacccaaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcacaacaa caacacaa 118
<210> 1029 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1029
aactaaacat ttctaactaa aatccctcct cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaaccac cactcaaa 118
<210> 1030 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1030
acccttcaac ttcctaccca ctatcttcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaacccctt acctcaatcc tctaccct 118
<210> 1031 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1031
ctaaaccatt tccaaaactc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaccccaca aaccacct 118
<210> 1032 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1032
tcctatcctt tcttccaata aatacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacaccaccc ataaaatt
118
<210> 1033 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1033
cctaccaaac caaacaaaat aataagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttctccct ccactaaa 118
<210> 1034 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1034
ccaaaacaac caatcactca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaaaacaaa caaaatcc 118
<210> 1035 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1035
taaaatcaat aaaacccata aacaaaacca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taatcaacct ctcaaccc
118
<210> 1036 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1036
cttccactaa taaacaccag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa aactctctaa aacccaaa 118
<210> 1037 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1037
acttctcatt cctaaccaaa acccaaattc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact ctttcctctc cttttactcc ctaaattt 118
<210> 1038 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1038
ctacactaaa cccaacctac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnccc aaaataaaac aaataacc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1039
ccctaaacct ctataaaata actgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tcaccactaa aaatttct 118
<210> 1040 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1040
ctaactaaca taactaccca cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acaaatttaa caacctct 118
<210> 1041 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1041
ctctttcctt tctaaaaatt ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna actacaacac cccaataa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1042
actcccccac ccctacaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnatatca aaaacaaaat acaaatat 118
<210> 1043 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1043
attttccaaa ataacccaaa atacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataactc attacatatt ctatttat 118
<210> 1044 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1044
caacaacatt taaaacaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaca ccctaaaaat tcttaaaa 118
<210> 1045
<211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1045
atccacaccc ctcttaccta aatctctttc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaca tctccacatt ctacccct 118
<210> 1046 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1046
ccccaaaacc attattccaa catcttttct ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcccaa attaactcat ccattatt 118
<210> 1047
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1047
acaccctctc ctatccaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnactaaccc caaaccca 118
<210> 1048 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1048
aacttactta ctaaatccaa tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa accctctaac atataacc 118
<210> 1049 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1049
ctaatactaa ttattccaac aataagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaactcacta tcctaaat 118
<210> 1050 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1050
tctatcttac cctcctccaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccactaaaa ctttccaaat atttactt 118
<210> 1051 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1051
catcttaaaa ccccacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttttaat ataaccccca aatccttt 118
<210> 1052 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1052
ccaaatacct acatcaaaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactttaaca taatcctc 118
<210> 1053 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1053
attaaaatat taaattaatc atcaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaccttccc tattttcc 118
<210> 1054 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1054
aaataaaact cctcttactc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cttctttcaa attctcaa 118
<210> 1055 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1055
aaatcaaact caccctactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactac attaaataca tacaaatt 118
<210> 1056 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1056
cacttaatta attccaaacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacattt ttataatcaa aactattt 118
<210> 1057 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1057
cacaaaacta actttcacca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa acattcttct atacaaaa 118
<210> 1058
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1058
cacccctaaa tatcaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat caccaacaac attaattt 118
<210> 1059 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1059
aaataaaaac cacctaaact caacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naacaaaatc cccaacct 118
<210> 1060 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1060
ctcttcccta tccctctacc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctaccaacct aaactttt 118
<210> 1061 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1061
ccctacaacc caaaacaaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tctctaaaac tcaacctt 118
<210> 1062 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1062
caacctaaac taatacccta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntac ctaaaactaa aatctacc 118
<210> 1063 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1063
ataaccttaa taatactcct ctactaccag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacattaaaa atactattaa taaaattt 118
<210> 1064 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1064
cctcaaacta ctatcaaaat aaaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctcacttcc acaactca 118
<210> 1065 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1065
accatactaa acaactaact ttcctcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncact aacttcctta aaaataat 118
<210> 1066 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1066
aaaactaaca ctccaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaacctca acttcttc 118
<210> 1067
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1067
tttccacatc ctaccactac ctcgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natttctcta aacaaccaac taatataa 118
<210> 1068 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1068
ctcaaacaaa tcacttaaac cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaattaaccc cttctcta 118
<210> 1069 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1069
aataaatata tatacttatt taacaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cttcttccaa acaaaaca 118
<210> 1070 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1070
aaactacaaa cacaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaata tctctaatca caaaaatt 118
<210> 1071 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1071
actcctaact tcaaaacttg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntccactt aattacaata ataaacta 118
<210> 1072 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1072
acttcccctc ccaaatagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa catctaattc aaaactct 118
<210> 1073 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1073
ttataattat accattactt tttcccaaac ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaacc acatacaccc tcctatca 118
<210> 1074 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1074
atactacaaa acaaaaacac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt acaatttaaa acacacaa 118
<210> 1075 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1075
accatctcct cttaaaaaca atccctatct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa taacctcacc aaaccctt 118
<210> 1076 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1076
aaccacatta aaaatcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnctc caaatttaat acaccaaa 118
<210> 1077 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1077
acctctaact caatatatca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaattt ctttttctac aacaaaaa 118
<210> 1078 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1078
aattcaatct tcacctccca atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaactaac ccaaacca 118
<210> 1079 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1079
acccaacccc cacctctata ccctaactta gttggaggct catcgttcct attcccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat tttattccct aattttaatt ttcttatt 118
<210> 1080 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1080
taaataaaac tacctcaaat atccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cataaccaaa acctaacc 118
<210> 1081 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1081
acttaactca aacaacaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacaaa ctcttaaata actcattt 118
<210> 1082 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1082
actttaaccc tttattccca cttaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaacaatt acataaacac aacctcct 118
<210> 1083 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1083
caaaaattca aaaccaacct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa caaaaaccta tatttaac 118
<210> 1084 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acctatcata taaataccaa cctcaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntataatt aacaaacaaa ataccttt 118
<210> 1085 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1085
cccctacctt aaaacctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnattttt ctaaaaatta aaaactct 118
<210> 1086 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1086
tcctcctatc tcctattcct aaaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ctctcctaat aacaaaaa 118
<210> 1087 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1087
accaccccca atcccaatgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnccaaaccc aatccccc
118
<210> 1088 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1088
cctcctaact tcacacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cacatcacaa aacaaaaa 118
<210> 1089 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1089
acccctctct tcctctctac cctctatcaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttccca tttcaccctt ccactaat 118
<210> 1090 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1090
ttactcacaa cccaacaaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaac tatttaattc actaaact
118
<210> 1091 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1091
ataataccaa taaatcctac tactattgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa atctaaatcc tacaaaaa 118
<210> 1092 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1092
acacaactca aaatcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nactctcctc tttataaaca accctaac 118
<210> 1093 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1093
ccctattcta acaacaaaca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ataacacaat acctcact 118
<210> 1094 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1094
ctaactctcc caacaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntacaaa tacaaattta accaaaaa 118
<210> 1095 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1095
accctttacc taccaacccc aaccagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactataa tacaaaaacc taattatt 118
<210> 1096 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1096
ttaccaaata cctacatcaa aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactttaaca taatcctc
118
<210> 1097 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1097
cccaaaatac ccattctcct tatcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaata atattataac tcaaacac 118
<210> 1098 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1098
ccaaaaaccc ccaccataac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaat aaacaaaacc cttaaaaa 118
<210> 1099 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1099
attttcctat tattatactt caactttttg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntccaata aactaaccaa taacttat
118
<210> 1100 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1100
ctcctactct tacttctaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnactaaa ctactataat ttcacttt 118
<210> 1101 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1101
cacttccaaa cactcaaact agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ctacactacc aaaataaa 118
<210> 1102 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1102
attattcttt tcactaaaaa cctcattgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctt accccataaa ataataat 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1103
cctaactacc taccaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacttcaat tctaaaataa aaataaac 118
<210> 1104 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1104
ctctacaaac caacaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacaaac ttaatatatc tactacct 118
<210> 1105
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1105
caccattaac acaataataa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aactatacct tctaaact 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1106
actcataccc actcactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntat aacatcaaaa caaaatcc 118
<210> 1107 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1107
atatatatat tctatttact aaaatccacc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnattaaact catttttcca tatcaatt 118
<210> 1108 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1108
accccctaac ccaacacttc taaaaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaccc cttctctaaa accccaaa 118
<210> 1109 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1109
actaaactcc tcccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac actctaactt taaaaact 118
<210> 1110 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1110
ccctaactaa accaaaccct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaatt acatttaaca cttaaaaa 118
<210> 1111 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1111
attcatccat tccttcaaca aacatagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnattaacc caatcataat taaaccat 118
<210> 1112 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1112
cacacacaca cacacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncaca tctaaaacta tttacaat 118
<210> 1113 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1113
acccccaaca tttaaaaatt aaataatcat cgttggaggc tcatcgttcc tattccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt acttaataac tcccttatta caaacccc 118
<210> 1114 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1114
acatacctaa aacccaacaa catccactcc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caatctctat tccccaaa 118
<210> 1115 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1115
accctccaaa cctacacctc ttaatccaac gttggaggct catcgttcct attcccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna attaaaacac aattacccaa caacaaac 118
<210> 1116 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1116
taacctaata aatacaactt cttaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa tcaaccacat ataaatca 118
<210> 1117 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1117
tttttcatct acccaaccct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttccctctac tcattcttcc ccaaaaac 118
<210> 1118 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1118
tccttttcat tctttcctcc ctctctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac aactttcctt caccttaa 118
<210> 1119 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1119
aaatatataa taatattaaa caaaccagtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aactttctct tcccaatccc taacctca 118
<210> 1120 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1120
acttccctac aaccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt acaaaaacaa accctaaa 118
<210> 1121 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1121
ataaaattat aaaatctcta atcctccttt gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaataat aacttcccaa aatttata 118
<210> 1122 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1122
acctccccct accaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact ctttattttt accctttt 118
<210> 1123 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1123
acactcaaaa caatacctaa cacacagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnattta tatatatatc tacctccc 118
<210> 1124 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1124
cactaactca tatctcataa acatgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac aacatactta actaaact 118
<210> 1125
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1125
acttcctacc accactccct ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttc cctctaaata tcataata 118
<210> 1126 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1126
acatttataa tatttttctt taaacattag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatttatca tacaaatata aataccct 118
<210> 1127 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1127
atcccccaac cctcctaact actcaaatcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccctacttt ctaactcaac ctcctttt 118
<210> 1128 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1128
ctaacccata aatccccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttttcca attttaaata taatttaa 118
<210> 1129 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1129
ctaaacaaac ctacaaccta cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac aaacctctac taaaactt 118
<210> 1130 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1130
tcaactaaat aaaaccaaaa accacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttc ctaactaata aaacaaat 118
<210> 1131 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1131
actccaactt aaaccaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa acaccacaca caaaactt 118
<210> 1132 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1132
cttctaaacc ctactaaata acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaccttaat aaccaact 118
<210> 1133 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1133
atccctcatt tcacaaataa ttaacaaacc acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa cattcctcat catccctt 118
<210> 1134 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1134
caaaaaccaa cttccctcaa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaacctttca cttcatac 118
<210> 1135 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1135
ccaaacaata taacctccac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttccaaccta ctctaaaa 118
<210> 1136 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1136
accactctct tctaaaacta gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncctcctac ctcaccca 118
<210> 1137 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1137
ccacaataat tttcttcttc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ccaaactaaa aacaaaat 118
<210> 1138 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1138
accttaaaaa ctacatctcc caaaatacac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaatacc ctttcctaaa tttaaaat 118
<210> 1139 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1139
cctctaccac cattacccct aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact aaactaaact ctacaaaa 118
<210> 1140 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1140
ttttctaata aaattaacca aacttgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcta ataaatcaca acataact 118
<210> 1141 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1141
aaaaataact aaatcccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcaccaca acttccta 118
<210> 1142 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1142
cccaaaacaa tctcatctac cacaacaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tttcccacaa ttatacaa 118
<210> 1143 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1143
acctcacccc aaacctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tccttcaact aacaaatt 118
<210> 1144 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1144
ccactacatt acaccaaccc taagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttac accaaaaact cccactta 118
<210> 1145 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1145
actctactaa ttaaacaaat ttctcaacta ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa tcaatcaacc tatttcat 118
<210> 1146 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1146
ccaaaacctc cctaaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntataac ctcccaacac tcataaac 118
<210> 1147
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1147
accaaaccca cccaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntatccaatc ttccccca 118
<210> 1148 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
accccaccct ctacccacat cctcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactt tctaaataca attacaac 118
<210> 1149 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1149
atttataaaa tcaacaaaaa cttgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntacc aacatctctt tatttatt 118
<210> 1150 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1150
atctttccac aaacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc taaccaaaaa caaaaact 118
<210> 1151 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1151
ttacaacaat cacttccaaa cactcagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aattcccaca actacact
118
<210> 1152 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1152
acctcctact acaaacactc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntatattc ttcaattttc aaaaatat 118
<210> 1153 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1153
cctcatctca caactcatta accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca aaacctaaat aaacacat 118
<210> 1154 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1154
ctcttaaaaa ccaaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnacaaaac ttaactccat ctcaaaaa
118
<210> 1155 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1155
tctaaatata ctctaaacaa acttccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctaaacact aaacatct 118
<210> 1156 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1156
tcaccaacaa acccaacaat tctcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacccacat ctataact 118
<210> 1157 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1157
aattacaatt acaaactaca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caattaaaac aaacacct 118
<210> 1158 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1158
ataaaacctc acaaccccct aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaacaca accacaaaca cataaaat 118
<210> 1159 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1159
actcattttc tctttactct ctcaatccaa ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ccaacaactc ccaaattt 118
<210> 1160 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1160
acataaatta cttttataaa taaaaacact gttggaggct catcgttcct attccccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttctat taacacaatt taaaattt
118
<210> 1161 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1161
actctataac ccaacaaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaccaa tttaaaatta ttataaaa 118
<210> 1162 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1162
aaatactcct ctccccatcc cacaaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcctacaa caaccaac 118
<210> 1163 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1163
tcccactaca tctacataac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatctt ttcaaacata attctttt
118
<210> 1164 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1164
attccttccc tctccctctc gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aatactacta aatctatata aataaacc 118
<210> 1165 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1165
acctactctc taaccaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaatcaacc aacttcct 118
<210> 1166 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1166
actcctctct ttatttccta actagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac aaataaacaa catatcat 118
<211> <212> <213>
118
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1167
attttatctt ctttcccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna accaacctta caaattaa 118
<210> 1168 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1168
aaccataaac ctaaaaccac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt aaacctaaac tttaccca 118
<210> 1169 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1169
acactaactc tatattttat taacaacacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacat attctaataa tttcccaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1170
ctcattcaca cttaactaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttataaaat attcaaccta tataaaat 118
<210> 1171 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1171
cttcttccca aaatcaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aatctctaaa aatacacc 118
<210> 1172 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1172
acaaccaaac ttaacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaca aaattcctcc aatataaa 118
<210> 1173 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1173
ataacccctt ccaaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac tccctaataa ctaacttt 118
<210> 1174 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1174
acctaaaaat cctcctaaaa accaaacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntccct catctcaaac atacctac 118
<210> 1175 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1175
taacaactct atattaacta atacagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact aaaacaatct tctaatca 118
<210> 1176 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1176
aaacatttca acaccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactaa tatacaaatt cctaaaaa 118
<210> 1177 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1177
cccttaatct ttaaccaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actccctaac acctcttt 118
<210> 1178 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1178
acctttcact tactccacat atacttatta aagttggagg ctcatcgttc ctattcccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aattatttta ttattcctct cttccccc 118
<210> 1179 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1179
accaacctta acacccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac taaaacaaca tacttcaa 118
<210> 1180 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1180
tctctaaaac cccctcctaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatat tcttctaata aacaaact 118
<210> 1181 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1181
acataactaa aaacctacta aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taaaattttc ttcaaatatt taatactt 118
<210> 1182 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1182
tacaaacaaa tttaaatcca aaatccctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tacctttata cttcacac 118
<210> 1183 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1183
ctctaactaa tttatttatc cacaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna accaaacatt taacttca 118
<210> 1184 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1184
aaaaactaac aaaccctaaa tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcaatt tcctcctata aaataaaa 118
<210> 1185 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1185
tcaatcctcc ccaaaaacca cctaaatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaat aatataaaac tacctctc 118
<210> 1186 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1186
atccctatct caaaaacatc caaaacacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaataaaca caatcataat attattat 118
<210> 1187 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1187
aaacacaacc tacaataacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc tacccaccta ataaatca 118
<210> 1188 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1188
acaaaattaa ctcttcttaa aacctaactt aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnattaaa attattttcc ttaacaat 118
<210> 1189 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1189
ccccctaaca ctaccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnatttcta cttcttattt ttatttac 118
<210> 1190 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1190
cttaattcct cttaactaat acagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc taataactac aacaacaa 118
<210> 1191 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1191
acccctacct ttttccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn actctaaatt ctcaaccc 118
<210> 1192 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1192
tcataataaa aatcccctac accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta cattccacct aaactata 118
<210> 1193 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1193
aaaatcccca attctcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntttaaa ctcctaaaat ctcaacca 118
<210> 1194 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1194
tcataaacta attcatctac tccctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaccaacta caaacttt 118
<210> 1195 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1195
aaaaataccc ctaaccctct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ccctaccaaa aacaaaaa 118
<210> 1196 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1196
atcaacataa ctaatactac cctaaaacac ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttatta aatttattct catttcct 118
<210> 1197 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1197
atttttactc cctatacaca aaccaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac caatttccta actaatat 118
<210> 1198 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1198
attcaccacc tacttccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt actaaccaaa caacacta 118
<210> 1199 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1199
accactacaa tactcacacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nactaaaccc ccaaaaca 118
<210> 1200 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1200
acaaaaactc aacaaactct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat cacatcaaat caacaaat 118
<210> 1201 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1201
atttccctaa aaccttctcc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accaactact ttccttct 118
<210> 1202 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1202
tcctacatca ataccatctc tatcccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntctaaca cctcttcctt ccactccc 118
<210> 1203 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1203
acaacccaca ctccccacac taccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnatcaa ttatccactt atccataa 118
<210> 1204 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1204
ccataattaa acccaccaaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaaacctc aacttacc 118
<210> 1205 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1205
tttaacaact actctaaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaataattt cccttcctac ccacccac 118
<210> 1206 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1206
ccaaactaat aaccaaacct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttaaatccta ccttccaa 118
<210> 1207 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1207
ccatcaaacc actcaaccat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaactaacat ctccctct 118
<210> 1208 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1208
accctaaaaa ctaattaaac tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaatcc tacaattctt tataaacc 118
<210> 1209 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1209
accaaatact acttatcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaactacct cctacaaa 118
<210> 1210 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1210
actaaaaaca tctaataacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa tcactaaaca aaacaaat 118
<210> 1211 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1211
caacttttca aacctcaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaccctaaaa actcaaaa 118
<210> 1212 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
cctaataaaa caaactaacc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tcctcaaata aaacaact 118
<210> 1213 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1213
atttccttcc cacatcctca cctcctgttg gaggctcatc gttcctattc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tctttttacc tccctttata aaacaaaa 118
<210> 1214 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1214
acaccctttt cctaaacaaa cacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttattctttt ccctaatctc taccaaat 118
<210> 1215 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1215
acctcttcct tccctctaca aaaacacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatt ataaccaaca accaaatt
118
<210> 1216 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1216
actccttcca taacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt aaccacttcc tttttcac 118
<210> 1217 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1217
attcctatct atacacctcc tcctatcttc agttggaggc tcatcgttcc tattccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttaatactaa aacccaccct aatacccc 118
<210> 1218 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1218
ccttctaatc caatatcccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacaaaaca acaaaaac
118
<210> 1219 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1219
ccccacaacc tacactcctc ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn attaatacac taaaatcacc ttaaacca 118
<210> 1220 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1220
ccctaaacta aacaccaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntct ctatcctctt ctttatta 118
<210> 1221 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1221
acctcttaat tactttccct tcaaacctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaacccaa caacctcatc accttcct 118
<210> 1222 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1222
accccactct cccatctaaa ccccatcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaca accatcaact atcaaaaa 118
<210> 1223 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1223
aaacctcaca taccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acttactttt tccctcaa 118
<210> 1224 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1224
acaaaacccc tctcctatct ctcctctcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac cctttaccaa acccacaa
118
<210> 1225 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1225
aaacacatta aaataccatc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna accaaaatac tcaaactt 118
<210> 1226 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1226
cctcaaacct tccctcctcc ccaaactagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa accacaaccc aattccca 118
<210> 1227 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1227
caaaactaca taactaaacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntccc ataaacaata tacttttt
118
<210> 1228 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1228
cctacctcca accactgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaactct ataacttaaa tctaaaaa 118
<210> 1229 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1229
attccaacaa cttaaataaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn attatatttt tcccctaact ttccatat 118
<210> 1230 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1230
accctcaccc aaaaatataa cttatcacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcctcta aaaccctatt ctttaccc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1231
cttccctcca actctaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactaa atctatccta aatctttt 118
<210> 1232 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1232
tcctacaacc tctctaatat ctcatatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc actcctaatt tctaaaca 118
<210> 1233 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1233
ttccactttt actttctctg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaccttta attaaaatca taacttta 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1234
taaataatct acaccaaact agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnattc ataatacccc ctataaaa 118
<210> 1235 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1235
ctaaaacaaa aataaaatcc cattccaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acacacacac acacacac 118
<210> 1236 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1236
acccaaccaa aaccacccta caaaataaca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaatt tcctaaacat cttttcta 118
<210> 1237 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1237
atttccctaa acaaaatacc cttgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aatttccatt aacaacacta aaacctcc 118
<210> 1238 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1238
caaaaattac atctccctaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa tctcacaccc tccaaaaa 118
<210> 1239 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1239
accccaacat tctccctaaa accctccgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat aaaaataatt tctatttcca ataaaaat 118
<210> 1240 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1240
cctacctttc ctttcccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnccattaa aaataaaaat attctacc 118
<210> 1241 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1241
caactactcc aatccctaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctctctctc tcatacacac acacacac 118
<210> 1242 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1242
ttaatttcct atatcctcct cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactac tattcaattt actaatct 118
<210> 1243 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1243
atcaaaatcc caaatacaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttcact tccacatcta ccaaataa 118
<210> 1244 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1244
atttcatttt ctttccatat aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnactaa tttaatacac acataaat 118
<210> 1245 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1245
ccacaaaaca tcaaacttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aattttatat aatatatccc ttcttttt 118
<210> 1246 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1246
aaaaatcaaa ttacctaaaa tatcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaattttc taaacaaaat atacattt 118
<210> 1247 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1247
ccacaaccct aaataaccaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttaccctcaa tcctacaa 118
<210> 1248 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1248
caaaaacaat cttaaactcc cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc tacttatcca cacactta 118
<210> 1249 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1249
tcaacaacac ctcctaaaac aaatgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt actacaaacc ttacaaaa 118
<210> 1250
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1250
acaaacacac tcccaacaac cacacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatc cctaatctaa taaacaaa 118
<210> 1251 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1251
ttttcctccc aacaactaaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaatct tttaccttaa acctactt 118
<210> 1252 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1252
ccccaccccc aataccaccc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacatatat ccttactaca tatattat 118
<210> 1253 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1253
actttcaaat tcacaaccac aaacctcagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc ctaataataa ttccaatt 118
<210> 1254 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1254
atccaactca aaacaaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaccctactt ctcaaaaa 118
<210> 1255 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1255
acttctcaac ccaacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncctaccaac cataatca 118
<210> 1256 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1256
atacaaccta aataaataaa ctcccaacac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcttcca cttcccttct tcttaaaa 118
<210> 1257 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1257
ctattccaat taccccattt acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt accatttcct aaaaacaa 118
<210> 1258 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1258
aaactcttca aaacaaacaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaacaaa caccccta 118
<210> 1259 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1259
tactttttat aaatcacaaa ctcgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttca acaataaaca ataactca 118
<210> 1260 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1260
acctcactca atctacttct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataaaaa ttattttacc cattttat 118
<210> 1261 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1261
atctcaacca acacttaact ctaaccctac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc ttttacttct aaatttcc 118
<210> 1262 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1262
ctaccatcta acaaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaactaac accccctaaa cacttact 118
<210> 1263 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1263
ctatatacca acaaaattta cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactt aaaaacatct taacttaa 118
<210> 1264 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1264
taactaaaaa caaaaactcc ctactagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ctttctaaac tacaaaaa 118
<210> 1265 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1265
atacatttct ttcacaaaaa tactaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acccctcttt tccaaaaa 118
<210> 1266 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1266
tcccttcctc tctaaacttc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncttctaaa ttttataaaa tttctttt 118
<210> 1267 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1267
ctattcactt ttcccttcct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaat acaaaaacac tacaaaaa 118
<210> 1268 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1268
ttctacctcc ctaaataatc tatatacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaatcc cttctaaccc ccatccca 118
<210> 1269 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1269
ccctctaccc acttccctac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacaaaaac taaaacct 118
<210> 1270 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1270
cctcaaccaa aaattaaaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttac aatcaaaacc aaacaaaa 118
<210> 1271 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1271
atactactaa acaatataca atcctttcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntctaaact taattttatt tataccaa 118
<210> 1272 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1272
ccaactccaa acaatcctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaatt tctaatcaac aaatataa 118
<210> 1273 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1273
cctaccatac caaaactact ccctacctcc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaattaaaa ataataataa tttcaatc 118
<210> 1274 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1274
attcctcaca ctcaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa caactcaaaa ttaaaaca 118
<210> 1275 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1275
attaaacttt aactaaccat caagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natcttaaat aatacataac tataaaat 118
<210> 1276 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
ctcctaacct acataaacac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaatt ccaatctatc caataaat 118
<210> 1277 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1277
aattatcaat tataacatca ctctgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntca accaataaaa taactacc 118
<210> 1278 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1278
ccactcaaaa tccataaacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acctacctac atactcct 118
<210> 1279 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1279
atacccatca cttacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ctttctctct ttctctct
118
<210> 1280 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1280
atttcataaa aaccaaacca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt cacacaacaa taattcaa 118
<210> 1281 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1281
atcctaacta atctactaac caacacctac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa atcaaaaccc tatacact 118
<210> 1282 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1282
tactacatat ccaaaaacct tctaaaaatt gttggaggct catcgttcct attccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ttcctaaccc caaaatcc
118
<210> 1283 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1283
tcaactttat taataaattc cctttctccc tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatacccaa atactacc 118
<210> 1284 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1284
attcattcat ccactcacac actcactcac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ttcatccact cacccact 118
<210> 1285 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1285
acttcacata aaaataaccc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aaatattaca tataacatta tacttcct 118
<210> 1286 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1286
cttcctacta tttaaaccac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacccaac taacttcc 118
<210> 1287 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1287
caataactac ctcttctaaa taagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aacaacataa aaacctat 118
<210> 1288 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1288
acacaataca ctaaattctt ataaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaca acctttccac aactactt
118
<210> 1289 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1289
tatcactcaa ccctattaac caataaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacacccta aactcattaa aaatccaa 118
<210> 1290 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1290
acccacaatc caacccacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctccaaata tctcatat 118
<210> 1291 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1291
caacctaaat aaataaactc ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ttcccttctt cttaaaaa
118
<210> 1292 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1292
aaaaatatca aatacatctc tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ttacttacta aatccaat 118
<210> 1293 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1293
caccaaaata taactatttc catacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcctaccc aaaactcc 118
<210> 1294 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1294
aaaccaaact aaaacatcct gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaacaatcaa ccaacact 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1295
accccctact ctccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaact cacactaata aataaaaa 118
<210> 1296 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1296
aaacacataa ctaccaacca aaacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnataa aatacctcaa ccatcaac 118
<210> 1297 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1297
ccacttctca acataaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttaaa tcactaactc taccctct 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1298
tctataaacc ttccaccctc tacccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac acttaaatta attctcaa 118
<210> 1299 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1299
ccaaataacc cacctcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctcttacaa ctctatac 118
<210> 1300 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1300
aaccacccta aaactcagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa tcttcaactt cactaaaa 118
<210> 1301 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1301
acaaaacctc caccccttca caaaaactaa acgttggagg ctcatcgttc ctattcccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt atcaaccaaa aaccaacaaa caaccaaa 118
<210> 1302 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1302
acccacccac actcacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc actcccataa accaacaa 118
<210> 1303 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1303
actccatctc ttcttacaaa acctaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta acccaaaata aaaacaaa 118
<210> 1304 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1304
cccaccctct actaaacaca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ttcttttctc aataccaa 118
<210> 1305 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1305
aaaaatctaa aaatttccct tttcatttcc tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acctcctaaa attacaac 118
<210> 1306 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1306
atcctaataa tacttttacc ctatcaccta gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcccttattt ctaaaacact cttacatt 118
<210> 1307 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1307
ccaaccaaaa ataccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactaaaa ctattattat ctaaactt 118
<210> 1308 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1308
acctccccct ccacacccac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aatctacaaa aacttcttct tcccttta 118
<210> 1309 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1309
ccctctttct aacttctaat tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacaatccaa caacaaaa 118
<210> 1310 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1310
aaaacatttt taccatctaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa aacctaaaat tttactct 118
<210> 1311 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1311
acctaaattc aaacaattct cctacctcaa ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttttattttt attttctaaa taaaaatt 118
<210> 1312 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1312
aaacacccac acccccatat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcttctt tctaaaattt tcttcaac 118
<210> 1313 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1313
atataaatat atttcctcct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcac catccaaaaa cataaaaa 118
<210> 1314 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1314
cctctccttc cctccctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa caaaactcca caaataaaaa caaaaact 118
<210> 1315
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1315
atttttaaac aaccaacaac taaaaccaaa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntctaatt ctctataaat cttaccat 118
<210> 1316 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1316
ctaaaaattt cccttttcat tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aacctcctaa aattacaa 118
<210> 1317
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1317
caatttctta actcacaacc tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata caacaatttt tctcatac 118
<210> 1318 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1318
ttctttacac ctttctcata tcctttccgt tggaggctca tcgttcctat tcccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ttccaaccct accttcccta cctaaaaa 118
<210> 1319 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1319
attaacctca acctttctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcaacttcta ttcctcaa 118
<210> 1320 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1320
aactcctatc ctctaacctc tacttaactc ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaccaaatt tcctcctc 118
<210> 1321 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1321
aacctccttc acctacacct acccgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ccttttccta ctcctacctc cctaattt 118
<210> 1322 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1322
attcacctcc caattcttta cataacttac ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cacttcccaa actaaaaa 118
<210> 1323 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1323
accaaatctc ctttcctaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aatctacccc cttcccca 118
<210> 1324 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1324
actcccaccc caaatcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctatcccta aacaccac 118
<210> 1325 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1325
tcctttaacc aaaacttcta taccctaacc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacaccctc cctccatc 118
<210> 1326 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1326
aaactcaaac ccaaaatacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta ctaaaaacta ctacaacc 118
<210> 1327 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1327
acttctacaa ccccaaccca aaattcccaa acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ccctcattta aatacaaa 118
<210> 1328 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1328
atatacaaca attctccaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaactatt ctcaccac 118
<210> 1329 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1329
ctctaaacac ccaaaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca aaaactataa acaaccac 118
<210> 1330 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1330
aaactccacc ataccccact ccacaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacaaa aacccctata tatacccc 118
<210> 1331 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1331
ttataaacct ctctaaccat ctttgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacta aaaactctct aatttacc 118
<210> 1332 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1332
caaaaccaaa taaaaactcc ttcccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa actaaaacac aaatctac 118
<210> 1333 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1333
tcccctacac tattacctta agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa accccttata tatcaatt 118
<210> 1334 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1334
tttctaatta acatttcttt aaacaatact gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnctctaata ataaaaccaa tataaaaa 118
<210> 1335
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1335
caaaactaaa ccaaattaaa accccagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaccc aataaaatcc tccaaact 118
<210> 1336 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1336
aatcactcca aaactaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaccttt ccttacct 118
<210> 1337 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1337
accactaacc tcccaaaacc aaaacccacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntccaac aaaataataa taatctta 118
<210> 1338 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1338
accccttcac caacttctaa aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natcaccaca aactatacct ataaccat 118
<210> 1339 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1339
ttaattctct aaccctcctt ccctaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttcaa ataactaact aaataccc 118
<210> 1340 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acccaatatc ctcttaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnca cataaaaaca atacttcc 118
<210> 1341 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1341
attctaaaac ccctctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctataaccct aaaactcc 118
<210> 1342 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1342
aactttttca ataaatacat tatcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna accacaaccc ccacaaaa 118
<210> 1343 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1343
acttctatat ctctccaaca accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaacctct caactccc
118
<210> 1344 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1344
acaaaaccct tacactccct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntctctaact tcccctca 118
<210> 1345 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1345
aactccaccc taaacttttc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ctctttatct aacaccac 118
<210> 1346 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1346
aaaatctcta cactacctaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt aacacaactt tacaaaaa
118
<210> 1347 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1347
atcactccaa aactaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaccttt ccttacct 118
<210> 1348 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1348
atacaacaat tctccaaact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaactattct caccactc 118
<210> 1349 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1349
atacccatcc aaacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa taccaaaatc aataacac 118
<210> 1350 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1350
caatcttcaa acctcaaaca ctacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcaacatc tcaacacc 118
<210> 1351 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1351
actactacac ttaaacaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttcaaaaac tcaaaacaca aaccaaaa 118
<210> 1352 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1352
cttctcacac aaaacatacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcccactaat tccatacc
118
<210> 1353 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1353
ctacaaatta tcatatacca ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctaaaccaa tacccctc 118
<210> 1354 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1354
cccaacctac ctctaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnncc ccctccccac cccactaa 118
<210> 1355 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1355
ataccactat aaataccact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaacaaaa catccaac
118
<210> 1356 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1356
ctaacctcat aatcctccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnncaaa acaaaactaa ataaacaa 118
<210> 1357 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1357
atccctccct tccttcaacc aactctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacaaa aacaaatacc attaacta 118
<210> 1358 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1358
ctatacaacc atctacccct ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaacaaac actccctt 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1359
acctaaacca aacctcaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacccatta ccacaaac 118
<210> 1360 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1360
caacttccac tacaaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ctaaaaccaa aacaaaac 118
<210> 1361 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1361
ctcaaccacc ctcctacccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naccctccta cccccaatac taaacatc 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1362
ccctacccca actcaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taactctacc ctctcctctc ctctctac 118
<210> 1363 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1363
caacccaacc acaaaacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacccac aacccaacca caaaaccc 118
<210> 1364 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1364
caacttccac tacaaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat ctaaaaccaa aacaaaac 118
<210> 1365 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1365
aataactacc atacaaaacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact tcttctaaat actatttc 118
<210> 1366 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1366
ctccaaatcc ccaactcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntac ctactaaacc taaaaatt 118
<210> 1367 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1367
actctaactc caaaaataac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaccatca aaactcattt aaataatt 118
<210> 1368 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1368
aaacaaacaa caaaaacttc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactt tctcacactt ataaaaat 118
<210> 1369 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1369
ctaaatcccc aaacttccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaaca acctaatact ttaaccta 118
<210> 1370 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1370
aaaaaccacc taccaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaaaa ttctcctcat aactacaa 118
<210> 1371 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1371
cccactccct caaattgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnncc attaccaaca aatacctc 118
<210> 1372 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1372
cctctctcca ataaccaaac ccccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaatacc acaaaacaac cctaaaaa 118
<210> 1373 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1373
aaacccacct acaacctcaa cctccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ttacaaactt aaaatccc 118
<210> 1374 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1374
cccaactacc taactactct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaaaaccc taaaaacc 118
<210> 1375 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1375
cctcatttac aaataaacct cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caacctcctc cactccat 118
<210> 1376 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1376
ctccaaatcc ccaactcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacct actaaaccta aaaattcc 118
<210> 1377 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1377
acactcctcc ataaaatcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacccaaccc caacaccc 118
<210> 1378
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1378
aaaaaccaaa cccaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ctactcccac cccaaatc 118
<210> 1379 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1379
aaataactaa aatcaatcct ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncaatt aacttttcaa aaacttat 118
<210> 1380 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1380
ctaccaaaac ttctctactt gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ataaatctat cccaaaac 118
<210> 1381 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1381
ccaacaattt cttctactac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc tcctaaaaac cctaaaaa 118
<210> 1382 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1382
aaactcccca acaaacaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttcata ataactcaaa aattaaac 118
<210> 1383 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1383
cccaactacc taactactct tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaaaaccc taaaaacc 118
<210> 1384 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1384
aaaccactta tatatactaa aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcacaaacat aaaaccaa 118
<210> 1385 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1385
acccactttt tcaacctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncctaccttt atcctccc 118
<210> 1386 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1386
atttccacca actcataaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaatcct attcctccaa ttacaact 118
<210> 1387 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1387
attttctccc ctttttactg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccaaactca aaacaaaa 118
<210> 1388 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1388
atcccctaac ccccacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac taaaaccctt ctcaaaaa 118
<210> 1389 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1389
aacaaattcc tctaactccc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnncc aaacaacaaa ctaataaa 118
<210> 1390 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1390
ctacaactat ataccctata aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ctcctcctac tacaaaac 118
<210> 1391 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1391
tatcttccct taaaataacc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncaaat ccttcaaaat caaaaaca 118
<210> 1392 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1392
aacccctcct tccaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac taaaatcaaa attcataa 118
<210> 1393 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1393
accacctact ccacttaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttctat aactctaaaa taaatccc 118
<210> 1394 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1394
tccataactc aaaacctccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaact taattcaaaa taactact 118
<210> 1395 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1395
caacacaaac acttccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta aaccacttat ctaccctc 118
<210> 1396 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1396
acacaactac ttctctctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ccaatacaac cacatatc 118
<210> 1397 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1397
atcctaaaaa caccttcttt acaaccccaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntcttaa ttattcctct aaataaaa 118
<210> 1398 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1398
aaatcaaata ataaaatcaa aactagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncca aaaactcttc tttaaaaa 118
<210> 1399 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1399
acaaaactca acaactttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nactattata taaaatactt cataaaac 118
<210> 1400 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1400
ctccaaaaca ccaactaatc tcagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacacttaac ccaaaact 118
<210> 1401 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1401
ttcataaaat accccacata acaataagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa actactaaac tctaccct 118
<210> 1402 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1402
aaaatctcca aaccctccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn cccctactcc cctccata 118
<210> 1403 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1403
cttcactaca cacaaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnataat aacaacaatc accaccac 118
<210> 1404 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
aaaaccccaa acaacaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatc taactactta aaacctac 118
<210> 1405 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1405
acatacccac tctatcctcc tccctccgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ccttccaact tcaccatcaa aattcata 118
<210> 1406 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1406
tctcctaccc tactccccaa aacatcctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacta aaccactatt tccacaaa 118
<210> 1407 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1407
cttcaaacct caaacactac cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60
ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta catcaacatc tcaacacc
118
<210> 1408 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1408
taccaaacta taattaacca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcccttcaaa aacaaaca 118
<210> 1409 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1409
taaacctaat tatcactata aacaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaat aactaactaa ttcaaacc 118
<210> 1410 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1410
taattacaaa cttaaaatcc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaactt attaattaca acctttca
118
<210> 1411 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1411
ccaacttccc taaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aactaaaaac actaacca 118
<210> 1412 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1412
aaaaaccttt ccaacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncaaat aaaaatcata aatctcaa 118
<210> 1413 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1413
ataacaatca actcttttta accgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatcttcca aatcttca 118
<210> 1414 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1414
ttccccactc caaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ccaaccctct cctcctcc 118
<210> 1415 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1415
tctcttctcc cattaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac caataaacct ttaacttc 118
<210> 1416 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1416
cccctaaaat aaccaaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaacctccaa ctcaaaac
118
<210> 1417 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1417
attaatattc tcacccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacta attttaaacc taaaaacc 118
<210> 1418 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1418
tctactactc ttcatacacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nccccaatct tcccactt 118
<210> 1419 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1419
ttccctcacc aaaaacttac cacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaactccact tccctcaa
118
<210> 1420 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1420
acctctctct ttctctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatt accataactc ctaataac 118
<210> 1421 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1421
ctaccaacat ccccacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnatttaa aaccaacaaa cttcccaa 118
<210> 1422 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1422
ctttcaacct ccaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacacaaca aaaataatcc taacaaat 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1423
aaataacctc taccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa caaatttaac tttcaaaa 118
<210> 1424 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1424
attctccacc tcccacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnactaac tactctttat attaaaaa 118
<210> 1425
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1425
acacaaacca aactccttac acccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaac tcaatttaaa aaccataa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1426
ctatacattc tacctacaaa tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc tactacttaa atatttcc 118
<210> 1427 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1427
ctacccactc actataacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa tccaaatcac tctaaaac 118
<210> 1428 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1428
accctactct ctaattcaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacaatcaca aacaaaaa 118
<210> 1429 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1429
ccaaatctct tctaaaaact tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntccttccc tccctacc 118
<210> 1430 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1430
accttccctc cctaccccac cattgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnncaataaa aactatacta aactaaac 118
<210> 1431 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1431
acccaatttc ttccccaact gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaaatct aaaaatctaa acctaaaa 118
<210> 1432 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1432
cttacctctc caatacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntccatacc caataccc 118
<210> 1433 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1433
accacacttc tcaaaccttc actcaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aatacacact tctaaaaa 118
<210> 1434 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1434
catccttctc acttcctccc caacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacta aaaacctaaa atcaaaaa 118
<210> 1435 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1435
aaaccaaaat aaaaactact aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaaa acaaaacaaa aattcctc 118
<210> 1436 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1436
accacctaaa caaattacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat acaaaaacac cacccaaa 118
<210> 1437 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1437
caaacactaa atataaaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntcaa aacaaaatac acaataat 118
<210> 1438 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1438
atcccttctc caacctcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaacta aaactaaacc acctacca 118
<210> 1439 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1439
tctctaaaaa tttaattaaa attaaatcca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaccc aaatataaca ttacaaaa 118
<210> 1440 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1440
atcatcctcc aaacaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnac ttcccaacct aataaaaa 118
<210> 1441 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1441
accaccaaac ttctctccca aaatatttct gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa taaaaaccca aatatcac 118
<210> 1442 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1442
aaaaactcaa aactacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natttcccaa aaaccttc 118
<210> 1443 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1443
aatccactta accttataac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt attttaccta ttttcctc 118
<210> 1444 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1444
actataaaac ttaaacaaca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaccat acaataacta cactcacc 118
<210> 1445 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1445
ctaatcaaaa actcatactt ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaattcta aaaccctacc aacttatt 118
<210> 1446 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1446
attttctcaa cctccccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacac tttctcacat ctaataaa 118
<210> 1447 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1447
tctacactac aacccacctc gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcttaaaa taaaaactaa cacaaaac 118
<210> 1448 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1448
aaacctaata tttactttta tacaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta aatttctttt acttcctc 118
<210> 1449 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1449
aaaccaaaat aaaaactact aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acaaaacaaa aattcctc 118
<210> 1450 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1450
aaactaccta ctaaatacta taatccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt cctcaacaac attcaaaa 118
<210> 1451 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1451
atctaaacct tcttcctcca acttctacct gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaattaaat ttatattttt aatcatct 118
<210> 1452 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1452
aaacaaatcc ctctatttat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntactata ataaaactaa cctaaaaa 118
<210> 1453 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1453
ccaaacccaa accaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaatcac ttcctccc 118
<210> 1454 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1454
acaaacccta aactaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnacc aaaatctact ccaacaaa 118
<210> 1455 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1455
ccccctaaaa actaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaactataa ccaaaacc 118
<210> 1456 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1456
aaacttaaaa tcaaactaca aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aacccttctt ctacaaat 118
<210> 1457 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1457
attccccact acaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttaaac aaacacaccc taacctaa 118
<210> 1458 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1458
acattatcat aacaactaac ccaaccaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctaaccttc taacatcc 118
<210> 1459 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1459
accccaacta acaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaccccaac atctctatac acacctaa 118
<210> 1460 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1460
attccccact acaacctgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttaaaca aacacaccct aacctaaa 118
<210> 1461 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1461
actataaaac ttaaacaaca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaaaccat acaataacta cactcacc 118
<210> 1462 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1462
aaaaactcct atcctaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aattttcacc ttaaccct 118
<210> 1463
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1463
aaaaactcaa aactacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natttcccaa aaaccttc 118
<210> 1464 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1464
aactcaacca aatacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacccttac caaacccc 118
<210> 1465 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1465
acctaaacac cttatccttc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ctaaccaaaa cctaaaaa 118
<210> 1466 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1466
acaactctct aaaaccaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt actcaacttc ctctacta 118
<210> 1467 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1467
ccccctaaaa actaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaactataa ccaaaacc 118
<210> 1468 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
caaaatccat aaacccaaca cacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc
aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taaaaacaaa caccataaac tactaaat 118
<210> 1469 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1469
cccccactat cacacacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttatatttc ctcttctcct cttctaaa 118
<210> 1470
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1470
ccttcctatt taacccaaaa ctataaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaatacccc taccttacct aacccatt 118
<210> 1471 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1471
ctaactacct caaaccatct cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ctattcctaa aacaccac
118
<210> 1472 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1472
acattattaa acaacactcc taagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa tataaactcc atcctacc 118
<210> 1473 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1473
ctacacatcc tacctcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctcatcccc tcatttctcc ttttatac 118
<210> 1474 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1474
cctcaaccat aaccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnncaata tacaaacaaa taatactc
118
<210> 1475 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1475
ctccaccacc atatccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnccat ttcctaattc tctctatatc ccctcaaa 118
<210> 1476 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1476
cctcaaccat aaccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnncaatata caaacaaata atactctc 118
<210> 1477 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1477
actaccaacc cacaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaacct cccaaaacta aacacctc 118
<210> 1478 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1478
accctctatt ctataaataa caacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa cccctcccaa aaataaaa 118
<210> 1479 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1479
acccaattat cacaaaaccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnactc cttccaaaaa taaaaataaa aataaaaa 118
<210> 1480 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1480
aaaaacaaat ataccaacta cctaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaccaa atacaataca aaatatac
118
<210> 1481 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1481
actccctttc catataaacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacctttact ttctacctct actcaaaa 118
<210> 1482 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1482
cctcaaccat aaccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnncaatata caaacaaata atactctc 118
<210> 1483 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1483
aacctttctt cctaaattct ttatctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60
cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ccctaaaaac tctcctac
118
<210> 1484 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1484
ctcctaaaca actcacccta gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact atacacacta cactaact 118
<210> 1485 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1485
cctcctacct tctaacccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttaaacctat taatctctat aaattaaa 118
<210> 1486 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1486
aaactaacca ccctaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa cctccccaaa taataacc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1487
cctcaaccat aaccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnncaatat acaaacaaat aatactct 118
<210> 1488 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1488
ataaataaca ttaaaaaccc ccaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntatcactac cccttacc 118
<210> 1489 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1489
ctatcaatat attcttaaac caatagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaatta ctttccccta aaaccaaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1490
acaaaaataa taaattatca taattcctca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa caattaatta cacaaaac 118
<210> 1491 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1491
ctctctaact aattctaaaa ttaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntttttcaaa taaaatccca caaatcta 118
<210> 1492 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1492
cctcaaccat aaccctacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnncaatat acaaacaaat aatactct 118
<210> 1493 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1493
ccctacaaaa ataataaatt atcataattc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnncaa caattaatta cacaaaac 118
<210> 1494 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1494
acctccaaac tctactccta tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnctaaat ataaaacaat taaaccac 118
<210> 1495
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1495
cctcccaaac attaaaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc aaatcccaca caacctaaaa ctccaaaa 118
<210> 1496 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1496
ctaaaaaccc tccacatcaa ctcctacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aacaaactta taaataaaat ctaataaa 118
<210> 1497 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1497
cctacctaaa tcacaactaa aactagttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt taaaaccaac aaacttccca acaaaccc 118
<210> 1498 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1498
taatacttaa taaaatcaac ctacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc caaaacacac acaaaccc 118
<210> 1499 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1499
actcccttta ctcctcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa caatcctaca aaatttaaaa taaaatat 118
<210> 1500 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1500
accttccaaa ccatcctaac aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc tctcaaactc aaaactac 118
<210> 1501 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1501
ctcaaactcc ccatctccta accttttcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnatctcta aaatcccaaa taaaatac 118
<210> 1502 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1502
aaaaatttca atctctaacc aaaaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tttctcaaat ctcaaccc 118
<210> 1503 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1503
ctactactac tactcctact actaccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnttaacat atatatccac aaacactc 118
<210> 1504 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1504
aaaaattaaa aatttaaaat acaaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaataaaa tccctaaaac tacccctt 118
<210> 1505 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1505
aaaaactcat taaattaatt taaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn acaaccccaa aactaccc 118
<210> 1506 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1506
cccttctcta ccctcatcac tcacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaat atattcccat ttaaaaac 118
<210> 1507 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1507
ctccacccca ccctactccc taataaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaat taatccatca caataaaa 118
<210> 1508 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1508
ctctataaca aatataaaaa taacataatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc cctaaccata aataaaaa 118
<210> 1509 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1509
actctctaca acatcaaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcaaaacc atccttaaaa ccaaaaac 118
<210> 1510 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1510
aaacctaccc ttctacaaaa cctcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna atacatccca actccccc 118
<210> 1511 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1511
acctcacatt tttcaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nactaaaccc tacaaactaa cccaaaaa 118
<210> 1512 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1512
acctccaaac tctactccta tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnctaaat ataaaacaat taaaccac 118
<210> 1513 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1513
actctctaaa ttctcaatac cctcctagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnactcac taacacatca caataaat 118
<210> 1514 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1514
ccacaaaatt acttaaaaac aaaccaaaac ttgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacat aatcaatatt tcacaata 118
<210> 1515 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1515
cccatctttc ttaataaatc tccaacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnatttcc ctacttccaa caactaat 118
<210> 1516 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1516
cccaaatttc taaaccaaaa cccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaacttcct accctcac 118
<210> 1517
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1517
acctaacaca ccacttcctc cctctccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttttctaa ttctacctat cctaaatt 118
<210> 1518 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1518
ccaactatcc tacccttaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn caaaacacct ccttctaa 118
<210> 1519 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1519
tcccactacc taataacttt tctatcttct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttctc cctaccaata tattttct 118
<210> 1520 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1520
tcctacctcc ctcttccaca tttaaaaacc ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatta cataactaaa tccccttt 118
<210> 1521 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1521
atccctaaaa attccaaacc actgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncaatccca caacatcc 118
<210> 1522 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1522
cctctaatca ttataacaaa cccaaaatac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaacta ttctttttat ataaaact 118
<210> 1523 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1523
ctacacataa ataaaacctc aaatcctatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntatctt ccctaattat actaaaaa 118
<210> 1524 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1524
acctaaaatc aaaaattcaa aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tttattcaaa aacctattaa catacaaa 118
<210> 1525 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1525
attatttcct ttatatataa atccccaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tctctccatc ttcaaaaa 118
<210> 1526 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1526
atttaaataa aactacactt aaccctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnccaac taactctcac acctaccc 118
<210> 1527 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1527
acaaccacct acccaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt atatcaccta cataaaaaca aactacaa 118
<210> 1528 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1528
atattaacat caataacaac caccacttat gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnatactta ttaaaacaat aacaatta 118
<210> 1529 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1529
attcctccaa cacaaacaac tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttcccctctc ctccctacta ctaaccca 118
<210> 1530 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1530
ccctccccac acaatccagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac ttaaataaca cccaacaact aatctaat 118
<210> 1531 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1531
atttaaccaa cttatcctta cattaacagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaatat tcacctttta ataaaaat 118
<210> 1532 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
ctaaactcaa ataatcctcc cacctcaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttcttt ttcttttctt ttcttttt 118
<210> 1533 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1533
acactctcta ttcacattca ccaattaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatctttac cttaaaaatc aaaatttt 118
<210> 1534 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1534
aaaacctact ctctaaaccc gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt aaaattaaat ctaaactcaa aaactcct 118
<210> 1535 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1535
cctctaatcc caacacttta aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccagg 60
cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntat ttttaataca cttaaaaata aattttaa
118
<210> 1536 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1536
accccatctc tactaaaaat acaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn attatatcta cataactttc cctaaaaa 118
<210> 1537
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1537
ccttacccta actctatctc aaacctagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcaaaaatt tatatttaca aaacaaat 118
<210> 1538 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1538
actcacacct ataatcctaa cactttaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa aacatacaac tttaaaca
118
<210> 1539 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1539
ccacaataca aaccaacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacta ctacactaaa taaaacaaaa atataaaa 118
<210> 1540 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1540
atctttaaaa acaccaatat tcatctagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaacctc ttaaactcaa ataatctt 118
<210> 1541 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1541
actcccttaa ccctctaact tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa cccttctccc caaaccaa 118
<210> 1542 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1542
attccccctc caaaccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna ccctctacca atccccacac aactaaca 118
<210> 1543 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1543
acttcattcc aaaccatctt acagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt aatttataaa ataccatcat tttaataa 118
<210> 1544 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1544
ccccctctca acccccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc ccccccaggc 60
agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttac ccaaactaat atcaaactcc taaactca
118
<210> 1545 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1545
actaccaacc ttatctcaca tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaata caaaactaaa actttcct 118
<210> 1546 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1546
actccatctc caccaaccca aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcatcaa taaccacaaa aacaaaat 118
<210> 1547 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1547
accccactac actcccacct aaatagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnncctata atcccaacta cttaaaaa
118
<210> 1548 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1548
cctcttctaa caccccaaaa taaccttagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaca accacctact aaaacacc 118
<210> 1549 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1549
ctacaaatat acattaaaaa ttcctctaaa atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaataatt ttcaaattta ttaaaact 118
<210> 1550 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1550
attcctcact tccctccacc cacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aacttacacc cctccacc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1551
atctctcaat tacctcaaaa attctataag ttggaggctc atcgttccta ttccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tcaacctcct taatatttat taatattt 118
<210> 1552 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1552
acttccaaaa accataatca acaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaaaaca aataacaaaa actacaaa 118
<210> 1553 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1553
aatttcaata atcacacaaa ccaatcagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa atctttctca acattaaa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1554
acctaacctc cttaaaccca cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctacttaac tataaattaa caacaccc 118
<210> 1555 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1555
cctccaactc ctaatatata ctaccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt ctaaaaacca aaaatctaaa atcaaaat 118
<210> 1556 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1556
acaatcaact ccacaatcta gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna atctaacatc cccaaaaa 118
<210> 1557 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1557
ataccctatc catttccaat acacatagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacttcttac cctctccc 118
<210> 1558 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1558
acaattcctc ccatccaccc tctacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ctcataataa cacaaaaa 118
<210> 1559 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1559
actaaaactc ctaccccaac tctgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc actatttccc atcctaac 118
<210> 1560 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1560
atcctcctac tttaacctca caaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntttt aaaattttat tttattttta aaattttt 118
<210> 1561 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1561
caataaaaat accaaataca ttcacattgt tggaggctca tcgttcctat tcccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttctaattct aaaattctct taaatatt 118
<210> 1562 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1562
atccaatatt atcctaacaa acaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttttct tcctttttct ctaataaa 118
<210> 1563 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1563
accaatcaaa aaccaactag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc ccaaattaca ctaacaaa 118
<210> 1564 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1564
ccctcccaca cctaaccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatt taatactaat aaattcctaa acaaaaat 118
<210> 1565 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1565
ctataatccc aacactttaa aaagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntc cctaaccaaa cctaatac 118
<210> 1566 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1566
acaataaatc aacctcaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc taactccctt ctcctaac 118
<210> 1567 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1567
ctaccccacc tttctaaacc ctaacctcag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatc ccccttaatt tcctaaaa 118
<210> 1568 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1568
attcccctct cccttcccta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnccaaacac caaaaccc 118
<210> 1569 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1569
atactaatca aaactctttt caatattgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taatactatt aatttaataa taaaaaca 118
<210> 1570 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1570
cttctactat taactaacac tcgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cactctcatt aatcctaa 118
<210> 1571 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1571
accttacatt tctcctctcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ncccaaactc taaaaccaaa accaacta 118
<210> 1572 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1572
taatacttct attactcaca aattaatctc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaatctctac tactcccc 118
<210> 1573 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1573
acactcacat aacctctccc taccccaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa atactactcc cttttaaa 118
<210> 1574 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1574
acacctaact atcaaaacta tcaaccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaacaaa aataaccttc actataat 118
<210> 1575 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1575
acacaacaaa atccttttca tattccaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaatt taaattaccc tataaaaa 118
<210> 1576 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1576
actcaaactc caacctaaac aacatagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttctaaaaac taactaaacc caaaattt 118
<210> 1577 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1577
aaaaacaacc accaccttct tctacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaacataca ataaaactta ctattaac 118
<210> 1578 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1578
aaaaccttta ttctacccta actcagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaccccca aattacttca tttaactt 118
<210> 1579 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1579
atctatactc ccaactcaca accagttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttttaataaa tccatccaac atatctta 118
<210> 1580 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1580
acactcacac aaatacatat tccacgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacaatac ctcccaaa 118
<210> 1581 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1581
accttcaaca taaactccaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaac aaaaccttca aaaaccaa 118
<210> 1582 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1582
ctccctaaaa cactttcatc ctcaaactca gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaatc tacttccccc acattaaa 118
<210> 1583 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1583
accacatttc accttaaaca tttatcaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaatataa caatataact caccactt 118
<210> 1584 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1584
ataccttcaa atcataaccc tacagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnatatataa tcataaaaat attccaaa 118
<210> 1585 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1585
actccacact caatacactt aaaaacacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnataa atacatactt acacacat 118
<210> 1586 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1586
actttccaca caaacctatc ctaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaattataa atcacaaaat aattctat 118
<210> 1587 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1587
atacacaatc taaaaacaac ccaaatctgt tggaggctca tcgttcctat tcccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna tattcctatt ctaataattc cctatact 118
<210> 1588 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1588
atactacaaa aataataaaa cccaccttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntatttaca ttaattcccc aactaaaa 118
<210> 1589 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1589
acttttcaac atcacctaaa aacttaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaatcacctt ttcacacc 118
<210> 1590 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1590
cctaaaaact aatataaaca aaaccaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaccaa accatccttc aaacaccc 118
<210> 1591 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1591
cctccttaaa atatctcaaa tcctaaaaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntatcttc tctattttaa ccatatat 118
<210> 1592 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1592
atcccaatcc caacaaacca aatccactcc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntcc acaataccta taaaaccc 118
<210> 1593 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1593
cctccaactt aaactccatc tacttccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaatt cttatacaac ttaatacc 118
<210> 1594 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1594
aaaactaaac ctaaaataac aacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaatttca tttactattt tctatcta 118
<210> 1595 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1595
acatcccata actatacatt tacattgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naatttaaac caaatataac tctcaatt 118
<210> 1596 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acacatacta ccatacccaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc
aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taatataatc aactataatc tatcataa 118
<210> 1597 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1597
accaccaata ccatcaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttatttt aacctctcta aaccaaaa 118
<210> 1598 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1598
ctttctttaa cttatctaaa cctcatcata ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaaa caatactaat tcatcctt 118
<210> 1599 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1599
actcactaac tttcttccct ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc ccccccccca 60
ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaataacct ccaactatat tcctaaaa
118
<210> 1600
<211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1600
attttacaac ataaaacaaa aatcacaaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaat acataaaaac tcccaatt 118
<210> 1601 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1601
acacctcaat aataatttcc taacttaatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntccca aaatattaaa attacaaa 118
<210> 1602 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1602
ccctaaaata aactctccaa tcctaaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntctaa ctttccccta atacactt
118
<210> 1603 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1603
attcttaata caaatacttc aacctgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat caacaacttt cctatact 118
<210> 1604 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1604
ctcctcaaaa tacctacaaa atccccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaatcc cactcaaaac cattcaaa 118
<210> 1605 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1605
tttaaataac cctaaataaa actcgttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatta ctaaaccttt ttaaaaattc tataaaca 118
<210> 1606 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1606
aactcaacac taacaaccac gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacaaaatat ttctaaacac caacactt 118
<210> 1607
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1607
acacacacca aactcacttc ttaccaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntat ctacattacc atacaact 118
<210> 1608 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1608
ccccactaaa ctataaactt taaaatcccc tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat ctcttaccac ttcaaata
118
<210> 1609 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1609
ctatcatcta ctattctcta ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taaaaactaa cctcaaaatt caatcaaa 118
<210> 1610 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1610
actccccaat tttaaaatac aactaatgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnta cttaaactac ttataaattt ccacctta 118
<210> 1611 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1611
ctactaaaca tttctacata ataaccacta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60
cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttttct ttctattaat attttctt
118
<210> 1612 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1612
acctcatctt aaataaacca accacttgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntacat ctttaatctc ttactaaa 118
<210> 1613 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1613
tccctcctac tttaaaaacc aacttcaata acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntttctat ccttatattt atcataat 118
<210> 1614 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1614
acccacacat ataattaaac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaata acaccataca caatacaa 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1615
atacacctca caataaaact acccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat aaaacttctt aaccataa 118
<210> 1616 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1616
atctaatctt aactctttcc tacctaaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntccctacct cttccctaac taaaacct 118
<210> 1617 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1617
acacacaaca ataatttccc aatcagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaactcc atctacctcc taaaaccc 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1618
ccattaacct aaaatcaatc taaactatct tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaattc taaaaaccac cactctat 118
<210> 1619 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1619
ctttaattca aacctctttt taaaactcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntctcaa ttaatccctt cactttaa 118
<210> 1620 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1620
acctttacac atactactcc cactaatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaattttta cttaaaacca atctccct 118
<210> 1621 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1621
actcctcccc aaaccaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntttct acatctcaac cacaaaaa 118
<210> 1622 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1622
atccttctca acattttccc tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaact ccaaaacttc aaacattt 118
<210> 1623 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1623
acaaaatcaa ccaaccaact tatcaattgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact taaaactctc caaacctt 118
<210> 1624 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1624
cccaattctc aatcaaaata aaccgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntactta aaataaaatc ttaaccat 118
<210> 1625 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1625
actttaaaaa ccaaaaatac cttaacaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnacctacc tttattaata ctaataat 118
<210> 1626 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1626
atttatctaa caattaaaac tctccacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaataac caaatcctcc taacaact 118
<210> 1627 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1627
atttaaaacc aacctaacca acataataag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntcatatt aatacattac ttaaacca 118
<210> 1628 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1628
acaaccaaca cttaaaaatc aaaacaaaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcaaaaacca aaacacaa 118
<210> 1629 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1629
actcctcaac cctaacatca tcacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacttaat caaaaatcct aaatcttt 118
<210> 1630 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1630
aacttataaa ttccttaact caaatacgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnatatcac aaattctaaa aaccaaat 118
<210> 1631 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1631
ctccaaaaat aatcaaacca accaaaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt cctaaatcaa cctcacac 118
<210> 1632 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1632
ctcctacaat aacactataa aatcaaaata tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntctatt cctatattct taaacaat 118
<210> 1633 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1633
acacacacac atcactaaaa acacaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacca ccaatatctt cctataca 118
<210> 1634 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1634
acccatctca actttcatca tcaatcctcc agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntccctacat ttccctctac actaaaca 118
<210> 1635
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1635
ttctaatcac tttacccatt attcactcgt tggaggctca tcgttcctat tccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt ctttttcttc atccatttct ctatctat 118
<210> 1636 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1636
acacccaccc aaaaacaaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nacccaaaat caaaacttaa aatatttt 118
<210> 1637 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1637
ctcccataac attcacctaa taaaactaaa agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaccata tcctctacta attacttt 118
<210> 1638 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1638
acctcaaaaa ctctaccata attcacccgt tggaggctca tcgttcctat tcccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnatat taacttaaaa tcacatcact aacccttt 118
<210> 1639 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1639
caatacctta taataacccc taacttcgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnntaac taattaactt tcttcattta attaccct 118
<210> 1640 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1640
atcctataca taataaacac taacccagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntacctata ataaaccctt taaacaaa 118
<210> 1641 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1641
attcccataa aaactactcc ctcaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaatata ttaccttcat cctaacta 118
<210> 1642 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1642
ccatattacc caaacttctc acaaactccc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacct cccaaataac taaatcca 118
<210> 1643 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1643
actctactaa actccaacac cagttggagg ctcatcgttc ctattccccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat atacaatatc ttaccccttc aaataact 118
<210> 1644 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1644
atccaaaccc ttaaacacct tcttctgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataaaaa caatcacttc caaatctt 118
<210> 1645 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1645
acctcttatt cattcccctt aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tacaaatact ctctcaaaaa ctataaaa 118
<210> 1646 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1646
acacctatta cacaacttat aaatcgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna caaccacaat caaaacaa 118
<210> 1647 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1647
cttctataac taatctcctt cccttactac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntaaaat cctactacaa acattaat 118
<210> 1648 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1648
acttccctac taaaatactc ccgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnntactaa aacatccctc cctaaaaa 118
<210> 1649 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1649
atcccctcct aaaaacacac tcctaaacct gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn natatccaaa ttccacccct ttaccaat 118
<210> 1650 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1650
atattaataa aaataaaaat ttcaccatct gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ctacctccca aattcaaa 118
<210> 1651 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1651
atataaaaat tattcttcct ataaatatac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaatttaaa tatcaccttt ataaaaca 118
<210> 1652 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1652
aaacaaaact actctctaat taagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taatctccat cacactcacc tctcctct 118
<210> 1653 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1653
ataacaaaac aaaccccaca cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacatccc aaaaacaa 118
<210> 1654 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1654
acaaactcta tccctttaaa tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnacaaac acacacacaa aaccacaa 118
<210> 1655 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1655
acccataaac tatacataat aaaacttccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaataaat actaacttca taaaattt 118
<210> 1656 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1656
atactcctct ctcctttcct caattgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaaatact aaaacttaaa ataacaaa 118
<210> 1657 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1657
acacatttaa cctaatcaac cttttccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttaaaattt aattaaaatc acaaattt 118
<210> 1658 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1658
acatcaacaa aaattcacac cccagttgga ggctcatcgt tcctattccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tacttaatta aaattaattt cttataat 118
<210> 1659 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1659
actcttaact ttacaccttc taaccatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaatttcctc cacccatt 118
<210> 1660 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
acccctatta aatatcaatt tctccatagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc
caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaataaa attttatctc tttatttt 118
<210> 1661 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1661
aaatcactaa tacccaaaac tctctaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat aaaaacccaa ttacctat 118
<210> 1662 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1662
acattcttcc ctaccaaccc atcctatccc gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnataaatt cttcttcccc tcccatca 118
<210> 1663 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1663
ccctataaat aaataaacat aattcccgtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccca 60
ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttaaatccct attaaaactc cttcataa
118
<210> 1664 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1664
atctcaaatt cctaaactca aataatctgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc tccaaataac taaaatta 118
<210> 1665 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1665
atccctaaac tccttctcaa aatagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaat cccaaatcaa aataaaaa 118
<210> 1666 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1666
accctctata ctaaaacaat ctactgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60
caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nttttaacat aaataatcct aaaaacta
118
<210> 1667 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1667
acctctatat aaaaattccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt caacttactt cactctcaaa ccttctct 118
<210> 1668 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1668
atcccatcaa cataacaaaa taataaacag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatc cccaacaaaa tctaaaat 118
<210> 1669 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1669
tccccaactc ctcccataaa aaccacgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaatatt tcccccaaaa cactcaat 118
<210> 1670 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1670
acaccaaaaa tcatataata tcaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna acactcccat ccaaaacctc tttctcat 118
<210> 1671 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1671
accctctcct ctaacaacct acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaaaaccc tatctaaaac aaaactat 118
<210> 1672 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1672
actccaatat cccctcttaa ccaccaaata gttggaggct catcgttcct attccccccc 60
cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnata aaattataac cctaccca
118
<210> 1673 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1673
aaacacattt cttttacaac taattactcg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta cattcaaaaa tccaaccc 118
<210> 1674 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1674
atttcacaat actcaccaaa ataaccagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naattcaaaa tttaactctt atactttt 118
<210> 1675 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1675
acatcatatt actataaaca tttatatacg ttggaggctc atcgttccta ttccccccag 60
gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt catttctttt cattacccaa aaatatta
118
<210> 1676 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1676
acccaaaact acacaatatt ttattgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aaaacacaac ctcaaaaa 118
<210> 1677 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1677
ccccaaaaca acttataaat acatcctaag ttggaggctc atcgttccta ttccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt ttttattttt aataaaaatt tttaaaac 118
<210> 1678 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1678
acttaaataa tccacccttt atttaacatg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaatt atcttcacta ctacactc 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1679
aaacctactt tatctcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tccatcaacc ctaccaaa 118
<210> 1680 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1680
ctactactaa aaactaccca aactatctac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaaac ctttctatcc aatcctaa 118
<210> 1681 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1681
atataaccca caaaacctaa atatttgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tatttatata aacttttaca aaacataa 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1682
attccctcta ataaaacccc gttggaggct catcgttcct attccccccc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna aatcctttct tcctccttaa aataaata 118
<210> 1683 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1683
acccaacaaa tttaaccaat cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttacta actcctccta tcaaccaa 118
<210> 1684 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1684
actctctact ctcccaccca gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa tctcttttaa acaacacatt tcaatttt 118
<210> 1685 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1685
acacttactt tctccctaac taccagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaaca ttaaaactaa aattatac 118
<210> 1686 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1686
accacaaccc ccaaaattca agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaac taaaaattaa ctaactctaa tttaacat 118
<210> 1687 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1687
ataataaaac actaaaacta attaaaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acaactcact acaattaa 118
<210> 1688 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1688
cttttataaa aacttctaaa tattttattt atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnncaacctt ataaataaat tttattca 118
<210> 1689 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1689
ctcttaatta aacctaataa aaataaaaac agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntctctaac ttttaaaaat attaaaaa 118
<210> 1690 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1690
aaacaaaaat cttaaaccaa aatcgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaactcaaa ttatttcatc cactaaaa 118
<210> 1691 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1691
ataaaatata aactaaacac aataacttac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntttaacct acaaaaacat tacaattt 118
<210> 1692 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1692
atcacaaaca acaaaaacta aaaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnttcctc tactaaatac accaaaaa 118
<210> 1693 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1693
acttaaacta taccaattac ctactaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnactaaat ctttaaattc tccaacca 118
<210> 1694 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1694
accaaattca aacccaaata caaaataaaa gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntcaaaaccc taaaaccc 118
<210> 1695 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1695
accacactaa catctcaaca acgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaca tcccaacaat taaactaa 118
<210> 1696 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1696
accaaaacta aaacacctta caaaaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnacaatatt actcttaaaa ataactaa 118
<210> 1697 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1697
ctccaatcta aaatctatac aacttcacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn ntaaaatcta caatatatct ttcctaaa 118
<210> 1698 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1698
acttatctaa acctaaaccc atcatgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttttacccaa ctataaacta atataata 118
<210> 1699 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1699
atcccccact aaacctacaa cttaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaataaat atcttattaa taacaaat 118
<210> 1700 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1700
acaaatacaa acacttccca cccaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt tattatctaa atttttatct aaatacca 118
<210> 1701 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1701
acaaaatcct caaatcaata ataactcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taactaacca acttcctc 118
<210> 1702 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1702
actcaaacta taaaacccaa ataaccaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnataaaa ataacaaatt taaaacca 118
<210> 1703 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1703
atctatttcc acttcaaccc cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnacaac caacaacctc aacaaaaa 118
<210> 1704 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1704
actcatacct ataatcccaa cactttaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaatcca aatatattcc aactaatt 118
<210> 1705 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1705
aaaaataaaa acatctacta acacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnaaaaattc tatcaacaac caattaaa 118
<210> 1706 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1706
actctacctt tctaacaaac cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnntaaaa cctcactaac tactacac 118
<210> 1707 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1707
ccctaaacac ctaacacaaa tcctgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn atattatcat tcaccatttt aattaaat 118
<210> 1708 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1708
actttcaata ctccataaaa tccccgttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naatatcttt caaaaattat ctataatt 118
<210> 1709 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1709
atcaaactct ctccactacc tacgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttc tttctataat ttaatttcta taaaaaca 118
<210> 1710 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1710
ctactcaaat aacctaaacc tccgttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntctatca aactacccta aataaaaa 118
<210> 1711 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1711
ttccacaaaa acccaactct taattctata gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntccccat cacaccccac cccatata 118
<210> 1712 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1712
atctatacct atcactacat aaaatcgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn nctaacttca ccaacctc 118
<210> 1713 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1713
ctctaacatc tcttaaatat cccaacttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttaatacaca aatataaata aattactt 118
<210> 1714 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1714
aacaacttta aatccaccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnctt tataatacaa ataactttcc cactaacc 118
<210> 1715 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1715
acaaaaataa aattcaaaac catttttgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaaattata attttaaaaa tactttcc 118
<210> 1716 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1716
atttctccca tatcaaaact caagttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa taacaaaaac tatcctattt cctaaata 118
<210> 1717 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1717
acaaacacaa catcttccac ccacgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaaaa attacaaact cccaaata 118
<210> 1718 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1718
atacaaatct ttataaccac atgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntta taaacctaaa actatactat ctaataca 118
<210> 1719
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1719
acacaacaaa ctccattctt tcataaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttaatcat tccctaaata aattttaa 118
<210> 1720 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1720
caataacaaa attaataaaa atattcaaat ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctc cctataatac tatacttc 118
<210> 1721 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1721
acccaaaaac tataatttta atttctttgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnacaa aataaaacta aatctcca 118
<210> 1722 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1722
cctaaatctc caaatactaa taaaactccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa tatctacacc tctaaccc 118
<210> 1723 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1723
acaaaaccct aaactcccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaact caccttcaca aaactatc 118
<210> 1724 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
attaaccaaa tataataatt catacccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc
cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttcct cttctaattt taaaaact 118
<210> 1725 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1725
actctataac ctaactatac ctttactaag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnattttcc aaaataacca aacacttt 118
<210> 1726 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1726
acccctaaca actacctcaa ctaaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaaat ccaactcctc ctactaat 118
<210> 1727 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1727
atctcccaac ctcaatacct agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc ccccccccca 60
ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnc tactcctcaa aacttaataa ataaaaac
118
<210> 1728 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1728
cccactcaaa accattcaaa cgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncctcaacc caacctcc 118
<210> 1729 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1729
ataatcaacc taaaccccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaacccaa aaactaaaaa caaactaa 118
<210> 1730 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1730
ccctacaaaa tttcatcaat gttggaggct catcgttcct attccccccc cccccccagg 60
cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa acaacttacc tccctactct aactactt
118
<210> 1731 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1731
ctactttttc ttcacttttt attaatatat agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnna cctcccaaaa tactaaaa 118
<210> 1732 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1732
acacaaaacc aatatatttt catcaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn ttataaaaca cccaactatt tttaaatt 118
<210> 1733 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1733
attccttatt taataaaatt aacttaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnat cctaaaaact aaccaaaa 118
<210> 1734
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1734
ataaaacctt attatattac ccaaactgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa acaatccttt taccttaa 118
<210> 1735 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1735
acactaaact atccttatct aatataaaaa tagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 cccccccccc caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaaaacaac aaccccaa 118
<210> 1736 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1736
acatatcctt ccataactct caaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60
aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tatttttaaa atataaaact aaaatcca
118
<210> 1737 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1737
acccctacaa ctccatcgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaactt taaaacttta tcttacat 118
<210> 1738 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1738
acctcctatc tacttccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc ccccccaggc 60 agatgttatc gaggtccgac nnnnnnaacc taacccttct caacaacata caataaaa 118
<210> 1739 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1739
cttccctccc atccccctac ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60
gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt cttcatttta aaaatccata atattaat
118
<210> 1740 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1740
atcccaacca ccttaaatcc ccaagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn taataaaaac acttactaca ttatatta 118
<210> 1741 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1741
atatacttta ttttacactt ctacacatac aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aaattccttc taccaaaa 118
<210> 1742 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1742
actcacccaa ctcaaacttc ctctatgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnataaa accatataaa tactccca 118
<211> <212> <213>
118 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1743
attctcaact ctactctaac ctgttggagg ctcatcgttc ctattccccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnatt caccacaaaa attaaaaa 118
<210> 1744 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1744
attcttcccc ttcttttaac atttgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnntaa ttaaattaca caaaataaca aaattaaa 118
<210> 1745
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1745
atttaaaaac caaatacctc caaatactag ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnntaaaata acttattctt aaaaacca 118
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1746
atccacaact actaccaaaa ctagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa ctctcaaaca ctcaaaaa 118
<210> 1747 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1747
atttaacttt tcatcaataa cctagttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaaact actctctaat tcaaataa 118
<210> 1748 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1748
acctccccac cccaacccat agttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnttttacta taaacaacaa tattataa 118
<210> 1749 <211> 118 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1749
acctcccaac aacctcttta aactgttgga ggctcatcgt tcctattccc cccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnntctc caaacccact tacaacct 118
<210> 1750 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1750
ctaccctcct tccccacccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn accctaccac tacaactacc ataaatat 118
<210> 1751 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1751
actcctcact tctcaaacgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaactaacc cccacctccc tccaaaac 118
<210> 1752 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1752
aaactcccca cttttccccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnccccaccc ccaaacaaat caccaaaa 118
<210> 1753 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1753
ctatcacttc ctctcttccg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc cccccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa aacaaccata acccaaac 118
<210> 1754 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1754
aaaatataac ctaaaaacaa aataattaac gttggaggct catcgttcct attccccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnntt tatcaaaatc aactccaa 118
<210> 1755 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1755
attttattcc cactcccctc tctaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccccagg cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnact aaaaccaacc cacctttt 118
<210> 1756 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1756
ctataacaaa accaacaact tctctaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntcaaaata atttaaaaat atctcatt 118
<210> 1757 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1757
ctatctctaa atctaaatat ttcaatataa aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nntaaactct ttatatatac taaactct 118
<210> 1758 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1758
attaacattt taattcatac caaaactagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 caggcagatg ttatcgaggt ccgacnnnnn naaacatatt taaataatat aacctaaa 118
<210> 1759 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1759
attttcccat ccactaccct aaaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccccc 60 aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aatataaaca ttattttaac taccaata 118
<210> 1760 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1760
acccatcaat tattatctac aacacaaagt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccaggcag atgttatcga ggtccgacnn nnnnaaaata ttactactac tcttaaaa 118
<210> 1761 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other <400> 1761
aaccactacc cctccatccc ccagttggag gctcatcgtt cctattcccc cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnaaaaaca atctataatt acttttct 118
<210> 1762 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1762
acctaatcct ccacaacaaa aatcaagttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn tcaaaaccaa accaacct 118
<210> 1763 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1763
actaaccaaa cccaaaagtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnaaa acccttcaaa ttcattcatt cattcatt 118
<210> 1764 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1764
accttatctc acactaataa tacctgttgg aggctcatcg ttcctattcc ccccccccca 60 ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt taaaatcatc ttatcttact aaaattta 118
<210> 1765
<211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1765
atttaaatta aaatttttct attataccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc 60 ccccccaggc agatgttatc gaggtccgac nnnnnnttaa atcttacaac aactaaaa 118
<210> 1766 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1766
acctacaaac aaactccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnaacct cctcctactc ctactccc 118
<210> 1767 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (83)..(88)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1767
actcaactaa taataataaa cctgttggag gctcatcgtt cctattcccc ccccccccag 60 gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa acctaacact tacccacatc actttata 118
<210> 1768 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1768
aacaacacca aaacccgttg gaggctcatc gttcctattc cccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nncccaaccc ataaaccc 118
<210> 1769 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1769
atatatacat aaccttaaat aaaaaccgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccccaggca gatgttatcg aggtccgacn nnnnnttcct tactattcct cacaaaaa 118
<210> 1770 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1770
acctccaaca acaaactata aacaaatgtt ggaggctcat cgttcctatt cccccccccc 60 cccaggcaga tgttatcgag gtccgacnnn nnnatcctca ttcttcttaa atataaaa 118
<210> 1771 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1771
ataaaatcta caatatatct ttcctaaacg ttggaggctc atcgttccta ttcccccccc 60 ccccccccca ggcagatgtt atcgaggtcc gacnnnnnnt cctctttcca aacaaaaa 118
<210> 1772 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (82)..(87)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1772
atattactat ttcctactat ccaaagttgg aggctcatcg ttcctattcc cccccccagg 60 cagatgttat cgaggtccga cnnnnnnttt aaaatttaat tatatcctaa acctctca 118
<210> 1773 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1773
ttcctaaatc tccaatccgt tggaggctca tcgttcctat tccccccccc cccccccccc 60 cccccccccc aggcagatgt tatcgaggtc cgacnnnnnn aaaactccca aaccccac 118
<210> 1774 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1774
aaatacatat attaaaaata taaaaatcta aagttggagg ctcatcgttc ctattccccc 60 ccccccccag gcagatgtta tcgaggtccg acnnnnnnaa ccacctatct aaacaaac 118
<210> 1775 <211> 118 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1775
atccaaccta tataaatacc tgttggaggc tcatcgttcc tattcccccc cccccccccc 60 ccaggcagat gttatcgagg tccgacnnnn nnattctaaa aatctcatat aaataaaa 118
<210> 1776 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1777
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1777
atggactcca cctggttatg cc 22
<210> 1778 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1778
caccttctcc tgtagcttca gc 22
<210> 1779 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1779
aggagctact gctccacctt ct 22
<210> 1780 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1780
atgaccctgc tggacacaga gc 22
<210> 1781 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1782 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1782
caccattggc aatgagcggt tc 22
<210> 1783 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1783
aggtctttgc ggatgtccac gt 22
<210> 1784 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1784
ctacctctgc actgagacca ac 22
<210> 1785 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1785
gtgcagttgc tccattcaca gc 22
<210> 1786 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
caaggaggat cttagagcca cc
<210> 1787
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1787
tggcgagtat ctccagcact ag 22
<210> 1788 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1788
ggctgtgctc aatgactgga tg 22
<210> 1789
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1789
gcccatccaa taaacagagc gg 22
<210> 1790 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1790
atggaggact ctgccaaagc ca 22
<210> 1791 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1792 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1792
cctggtgggt aggagatgag tt 22
<210> 1793 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1793
gagaatggtg gagaggatca tgg 23
<210> 1794 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1794
gccactacct gtgcaacgcc t 21
<210> 1795
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1795
caatccaagc cgccgtgatg aa 22
<210> 1796
<211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1797 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1797
caatccaagc cgccgtgatg aa 22
<210> 1798 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1798
gctcaggatt ccgctggaag aa 22
<210> 1799 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1799
aggtcaccat ttccacacgc tg 22
<210> 1800 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1800
tgaggcactg tgctcggaag tt 22
<210> 1801 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1801
tcgaagagct gagacatcgc ca 22
<210> 1802 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1802
cattggcggg accatcactt ac 22
<210> 1803 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1803
ccttcaggta tgtagggagc atc 23
<210> 1804 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1804
cacttcctgg aggtgaaact gg 22
<210> 1805 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1805
gaaactccgt gcgctccttc tt 22
<210> 1806 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1806
gcttggacca agaggaaact cc 22
<210> 1807 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1807
caagtgggca tatttggctt ccc 23
<210> 1808 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1808
caccttccaa aatagcgagt atgg 24
<210> 1809 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1809
atggttccga ccgagacgag tt 22
<210> 1810 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1810
ctctcagagt gattctccaa cgg 23
<210> 1811 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1811
ggttctccac atgctgagta gag 23
<210> 1812 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1812
aaatcacacg gcgacctgtc gt 22
<210> 1813 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1813
atggcatcct gaagcctcat cc 22
<210> 1814 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1814
ggcttatgtg caaaatggca gatc 24
<210> 1815 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1815
gctcactcca gcagttctga ag 22
<210> 1816 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1816
caacggcatc tccacagaag ga 22
<210> 1817 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1817
ccaaactctc tgccacttca tcg 23
<210> 1818 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1818
agcctcgttc acggttctat gc 22
<210> 1819 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1819
gcagtgacct tctgcatcca ga 22
<210> 1820 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1820
gttggattgc cgactggaag ga 22
<210> 1821 <211> 22 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1821
ctctcagact ccaaggatgt gg 22
<210> 1822 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1822
ggcacctttt atcgtttcca ggc 23
<210> 1823 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1823
tctgccagtt ccagccttgc tt 22
<210> 1824 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1824
gttcagtgtt ggcagcaatg agc 23
<210> 1825 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1825
agcacagtag ccgtggcatt gt 22
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1826
tgtccagatg ctgtgccttc ct 22
<210> 1827
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1827
ctcgtcttct cctcccagta tg 22
<210> 1828 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1828
gtctgtggat gacctggcta ac 22
<210> 1829
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1829
gacatcggtc tgcttgaagg ac 22
<210> 1830 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1830
gggaaggagg tttagttg 18
<211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1831
caaacccaca cctactac 18
<210> 1832 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (19)..(19) <223> Inosine
<400> 1832
agtttttttt cgtattttng ttaggt 26
<210> 1833 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (23)..(23)
<223> Inosine
<400> 1833
ttatagtttt tttttgtatt ttngttaggt 30
<210> 1834
<211> 15
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1834
ggtttggggg ttttg 15
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 1835
gacngcatat aactaataat aa 22
<210> 1836 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1836
ggtggtcgtt agttgtttgg 20
<210> 1837 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1837
ggtggttgtt agttgtttgg t 21
<210> 1838 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1838
gtaggagggg tgtgtg 16
<210> 1839 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 1839
acaatngact tacccaataa a 21
<210> 1840 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1840
agnggaagtc ggaagttt 18
<210> 1841 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1841
agnggaagtt ggaagtttta g 21
<210> 1842 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<210> 1843
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1843
cccttcatct tcaaataaaa aa 22
<210> 1844 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 1844
ttttagggcg tgtgnga 17
<210> 1845 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (17)..(17)
<223> Inosine
<400> 1845
agttttaggg tgtgtgnga 19
<210> 1846 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1847 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1847
ccaatcaata aaaatacact cta 23
<210> 1848 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1848
attttaggtt tgcgtgagtt attg 24
<210> 1849 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1849
attttaggtt tgtgtgagtt attgga 26
<210> 1850 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1850
ttttaggatt gggtagttta g 21
<210> 1851 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
oligonucleotide <400> 1851
cccacccaca tactc 15
<210> 1852 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1852
tngatgagcg gattgatgt 19
<210> 1853 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1853
tngatgagtg gattgatgtt tg 22
<210> 1854 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1854
aaagggtttt aggtagagtt tg 22
<210> 1855 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1855
gaactaaatt ccctcttata tctttc 26
<210> 1856
<211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<400> 1856
ggaagatagt ttcgtttttt tngga 25
<210> 1857 <211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (23)..(23)
<223> Inosine
<400> 1857
aggaagatag ttttgttttt ttnggaa 27
<210> 1858 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1858
ggagaggagg atttagag 18
<210> 1859 <211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1859
ctccacaatc ttcaaaaac 19
<210> 1860 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (18)..(18) <223> Inosine
<400> 1860
attggggagt cgtatatngg 20
<210> 1861 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (21)..(21)
<223> Inosine
<400> 1861
gttattgggg agttgtatat ngg 23
<210> 1862 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1862
ttagtggagt ggtagtttta ga 22
<210> 1863 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1863
tcaaaaacta aacctcaaat aca 23
<210> 1864 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 1864
aggnggttcg gtattgg 17
<210> 1865 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 1865
aggnggtttg gtattggg 18
<210> 1866 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1866
tgtggangag ttattagta 19
<211> <212> <213>
19 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1867
angaaaccca accaataaa 19
<210> 1868 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1868
gtttggttac gtagggtttt tttag 25
<210> 1869 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1869
gtttggttat gtagggtttt tttagg 26
<210> 1870 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1870
tgttagtttt tatggaagtt t 21
<210> 1871 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Inosine
<400> 1871
aaangaacaa aatactcaaa 20
<210> 1872 <211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1872
tgggagagcg ggagat 16
<210> 1873 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1873
tttgggagag tgggagattt 20
<210> 1874 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1874
gttttataag gaggttgtgt t 21
<210> 1875 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 1875
aangaaaaac cctccaaa 18
<210> 1876 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1876
gaggggtcgg atgttgg 17
<210> 1877 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1877
gaggggttgg atgttggg 18
<210> 1878 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1878
ggttatgggg aggttg 16
<210> 1879 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<210> 1880
<211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 1880
ggtagtggta cggagng 17
<210> 1881 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (17)..(17)
<223> Inosine
<400> 1881
gtagtggtat ggagngng 18
<210> 1882 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1882
gatttgttgt tgttgtttta g 21
<210> 1883 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1883
cngcaacata atcttacc 18
<210> 1884 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base <222> (19)..(19) <223> Inosine
<400> 1884
gtnggatatt gacgtttang tt 22
<210> 1885 <211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<400> 1885
atagtnggat attgatgttt angtt 25
<210> 1886 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1886
atggtatatt gtagagtaat ttg 23
<210> 1887
<211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (2)..(2) <223> Inosine
<400> 1887
angccttctt tcttca 16
<210> 1888 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 1888
agttggtcgn gtaggag 17
<210> 1889 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<210> 1890 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1890
ggtgatgttt gttattatgt 20
<210> 1891 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1891
aangactaat ataaaactta atctc 25
<210> 1892 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 1892
tttttattat tgcgtngttg tttatga 27
<210> 1893 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 1893
tttttattat tgtgtngttg tttatgatg 29
<210> 1894 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 1894
gttatgtgan gagattagg 19
<210> 1895 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1895
ccngccaaac acaac 15
<210> 1896 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<210> 1897 <211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<400> 1897
attttaattn ggtgattttt tngaaga 27
<210> 1898 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1898
gtggttatta tgtttttgat atttgt 26
<210> 1899 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1899
cccattattc atacttacct tctta 25
<210> 1900 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 1900
ttttgaatga tcgnggttag gg 22
<210> 1901 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 1901
ttttgaatga ttgnggttag ggg 23
<210> 1902 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1902
gtaatggtgg tagaggaat 19
<210> 1903 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1903
aaaactaaac taaactctac aaaaa 25
<210> 1904 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1905 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1905
tgtgaaattt ttgtttgtat aatttttggg 30
<210> 1906 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1906
gtngtagatg atttgtatta gg 22
<210> 1907 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1907
ccccacaaca acaact 16
<210> 1908 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<210> 1909
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1909
gnggtgatat gggtttttta gg 22
<210> 1910 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1910
ttaggggtta tggaaggag 19
<210> 1911 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1911
cactttaacc acttcctttt 20
<210> 1912 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1912
gattagggcg aatttgttgt ttg 23
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1913
gattagggtg aatttgttgt ttgtg 25
<210> 1914 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1914
gattttttat agggtttgtt gat 23
<210> 1915 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (8)..(8) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 1915
cataaaangn gaaattaaaa acca 24
<210> 1916
<400> 1916 000
<210> 1917 <400> 1917
000
<210> 1918 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (1)..(1)
<223> Inosine
<400> 1918
ngttgagtat attagttgtt tt 22
<210> 1919 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1919
aactacngcc ctaacc 16
<210> 1920 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1920
atgtagngtt tcgtagttgt ag 22
<210> 1921 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1921
atgtagngtt ttgtagttgt agg 23
<210> 1922 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1922
tgattttagg aaaggtttag a 21
<210> 1923 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1923
taccaaacca acaaaataca a 21
<210> 1924 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1924
atagggttgt cgtgagaata gt 22
<210> 1925 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1925
gatagggttg ttgtgagaat agtg 24
<210> 1926 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1926
aggaggtttt tatagtttta tggt 24
<210> 1927 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1927
aaaaactccc ctccaataaa aa 22
<210> 1928 <211> 13 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 1928
agggtcgggn ggt 13
<210> 1929 <211> 14 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 1929
agggttgggn ggtg 14
<210> 1930 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1930
aggggttagg agttac 16
<210> 1931 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1931
aaaaccaata aattccaaaa 20
<210> 1932 <211> 14 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1932
gaggggcgtg ggtg 14
<210> 1933 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1933
ggaggggtgt gggtg 15
<210> 1934 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
gagttngttt ttagttttag
<210> 1935 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1935
tccctctcct ttctc 15
<210> 1936 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (20)..(20)
<223> Inosine
<400> 1936
gtgttagggt tttcgtattn gt 22
<210> 1937 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (21)..(21)
<223> Inosine
<400> 1937
agtgttaggg tttttgtatt ngt 23
<210> 1938 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
tgtgtaatag tttattagat tgatagag
<210> 1939
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1939
aacacaaaca atactaacta ctt 23
<210> 1940 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1940
gatggatgtt tacgttgttt ataaatt 27
<210> 1941 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1941
ggatggatgt ttatgttgtt tataaatt 28
<210> 1942 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1942
ggggatttgt tttagttatt taaag 25
<210> 1943 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1944 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1944
ttgattggat cggttgagtt g 21
<210> 1945 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1945
ttgattggat tggttgagtt gt 22
<210> 1946 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1946
gtgaggattt gtttgttttg 20
<210> 1947
<211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1947
aaactcccac ttaaaaacac 20
<210> 1948
<211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1949 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1949
gtagttaggt ttggtttttt ttaggg 26
<210> 1950 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1950
ggggttagga gaggataaa 19
<210> 1951 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1951
aaacatatat caccaaaact caaa 24
<210> 1952 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (25)..(25) <223> Inosine
<400> 1952
agtttgtagt ataaatcgta ttatngt 27
<211> <212> <213>
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (26)..(26)
<223> Inosine
<400> 1953
tagtttgtag tataaattgt attatngta 29
<210> 1954 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 1954
tagttatngg agatttttat ttaat 25
<210> 1955 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1955
acttccttcc tataactttt tt 22
<210> 1956 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1956
aatagtaatc gtatttttta gaaagagt 28
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1957
taaatagtaa ttgtattttt tagaaagagt 30
<210> 1958 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1958
taggattgat tttgttttta aga 23
<210> 1959 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1959
caataaacaa cacataaact ttc 23
<210> 1960
<211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1960
tagtttttta tcgaggtagg tagg 24
<210> 1961 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 1962 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1962
gtnggatggg gttga 15
<210> 1963 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1963
tacttcctaa ccaaaataca 20
<210> 1964 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1964
tttttttagc gtttgttgta gttgt 25
<210> 1965 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1965
tatttttttt agtgtttgtt gtagttgt 28
<210> 1966 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 1966
ggtgtaaagg tggttttgta 20
<210> 1967 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1967
attaactaac acacaaaact ctaaat 26
<210> 1968 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1968
gtttttngga agtcgttagg tg 22
<210> 1969 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 1969
gtttttngga agttgttagg tga 23
<210> 1970 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 1970
ttngagtttg gtagattagt a 21
<210> 1971
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1971
caatcttcat aacaaaacaa aaata 25
<210> 1972 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 1972
tttnggtttt tcggggttat tag 23
<210> 1973 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<210> 1974
<211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1974
gagtgattga tattgttttt gttta 25
<210> 1975 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1975
accaaacacc aatttcctat ta 22
<210> 1976 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1976
aataaaaaaa atcggtgttt ttatatttag t 31
<210> 1977 <211> 32 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1977
aaataaaaaa aattggtgtt tttatattta gt 32
<210> 1978
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1979 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1979
ccataaaact atctattttc aataatac 28
<210> 1980 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1980
aatagttaat cgttgtttat attgggg 27
<210> 1981 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1981
aatagttaat tgttgtttat attggggt 28
<210> 1982 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Inosine
<400> 1982
ggangatgtg aagga 15
<210> 1983 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 1983
angaacaaca attaaactaa a 21
<210> 1984 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<400> 1984
tgtttttaag aacgattttt tnggt 25
<210> 1985 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (24)..(24)
<223> Inosine
<400> 1985
tatgttttta agaatgattt tttnggtt 28
<210> 1986 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 1987
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1987
aatacacaac ccaataacaa ac 22
<210> 1988 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (17)..(17)
<223> Inosine
<400> 1988
ttttttagtt aaacgtngat taaggtat 28
<210> 1989 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1989
ttttttagtt aaatgttgat taaggtatag 30
<210> 1990 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<210> 1991
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1991
acaaacccct acaacc 16
<210> 1992 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 1992
ggtngagcgt gttngt 16
<210> 1993 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 1993
gaggtngagt gtgttngt 18
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1994
ggggtttatg gtgtagg 17
<210> 1995 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1995
accacccctc aaact 15
<210> 1996 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 1996
tgttttaggc ggttnggg 18
<210> 1997 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 1997
tgttttaggt ggttngggtg 20
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1998
agtgttgatg tttagtaaat g 21
<210> 1999 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1999
cccaatatct aacactataa atc 23
<210> 2000 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2000
atattattgt ggaatcgttt tatttttgt 29
<210> 2001 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2001
atattattgt ggaattgttt tatttttgtt t 31
<210> 2002 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2002
tttgttgaaa gttaggatta g 21
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2003
ccttcccata tttatcaata aac 23
<210> 2004 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2004
tgttatagtt tattaaagac gttagtgaga 30
<210> 2005
<211> 32 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2005
tgttatagtt tattaaagat gttagtgaga ta 32
<210> 2006 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2006
gagatatttg tggtagttat aatttag 27
<210> 2007 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2008 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Inosine
<400> 2008
gtaangtata ttattgtcgg ttataa 26
<210> 2009 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2009
gtaangtata ttattgttgg ttataata 28
<210> 2010 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2010
gaaagggtga ggaggaattt tt 22
<210> 2011 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2012 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2012
tttattttta ggtcgagtga ttagtt 26
<210> 2013 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2013
aatttatttt taggttgagt gattagtt 28
<210> 2014 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2014
tagttttggg aagtaaaga 19
<210> 2015 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2015
ctccaaatca tatacctaac ta 22
<210> 2016 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2017
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2017
gggtgatttt ttgaatttgt gtt 23
<210> 2018
<211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2018
aatgggagtg atttatagag 20
<210> 2019 <211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2019
aaattatacc accctaacc 19
<210> 2020 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2020
atttaggtat ttcgatttta agagga 26
<210> 2021 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2022 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2022
tttagttgaa ggtagtaagt 20
<210> 2023 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2023
gacaatcaca taaccttata aa 22
<210> 2024
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2024
gggtggttcg tagggt 16
<210> 2025 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2025
gtgggtggtt tgtagggt 18
<210> 2026 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
taggtatggt gaaaatatgt
<210> 2027 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2027
tcaatctaac tcaactaaac 20
<210> 2028 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2028
ttgatatatc gttatatttg agaggg 26
<210> 2029 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2029
ttttgatata ttgttatatt tgagaggg 28
<210> 2030 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 2030
tgagtttaag tttangttta c 21
<210> 2031 <211> 19 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2031
tcatttctcc ctaacaatc 19
<210> 2032 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2032
ggtngagttt cgaggttt 18
<210> 2033 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2033
aggtngagtt ttgaggttt 19
<210> 2034 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
cggngaaaag ttgttgt
<210> 2035
<211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2035
accctactac tcaccacta 19
<210> 2036 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2036
tgtatttagt cggggtagtt gt 22
<210> 2037 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2037
ttgtatttag ttggggtagt tgtt 24
<210> 2038 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2038
tatatttatg gtgttagttg tatttagaag 30
<210> 2039 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2040 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2040
ttggtgatag cgtttatatt taattt 26
<210> 2041 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2041
ttggtgatag tgtttatatt taattttt 28
<210> 2042 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2042
gtttgttttg gaggtaggaa gt 22
<210> 2043 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2043
tttaaattct taccaaatac atattt 26
<210> 2044 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Inosine
<400> 2044
aggtngtttt tcggtgttag 20
<210> 2045 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2045
taggtngttt tttggtgtta ga 22
<210> 2046 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2046
aaattacgga ggttgttaaa tatta 25
<210> 2047 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2047
tctaacctat ataactataa aatctactc 29
<210> 2048 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2049 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2049
tggaggtttt agaatgtttt agaattg 27
<210> 2050 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2050
aagtagttaa agtgtttaag ttag 24
<210> 2051 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2051
tcccaacata caacataata 20
<210> 2052 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2052
ttttgagatc ggttgtttta ttagtt 26
<210> 2053 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 2053
ttttgagatt ggttgtttta ttagttg 27
<210> 2054 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2054
tgattttagg aaaggtttag a 21
<210> 2055 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2055
taccaaacca acaaaataca a 21
<210> 2056
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2056
atagggttgt cgtgagaata gt 22
<210> 2057 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2057
gatagggttg ttgtgagaat agtg 24
<210> 2058 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2058
tcgatttaaa gggatagtc 19
<210> 2059 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2059
aaacccaaat cttccctac 19
<210> 2060 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2060
agggagatag tattcgtttt atttttg 27
<210> 2061 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2061
agggagatag tatttgtttt atttttgt 28
<210> 2062 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2062
aggaggtttt tatagtttta tggt 24
<210> 2063 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2063
aaaaactccc ctccaataaa aa 22
<210> 2064 <211> 13 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2064
agggtcgggn ggt 13
<210> 2065 <211> 14 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2065
agggttgggn ggtg 14
<210> 2066 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2066
gggttttgtt taggtgttt 19
<210> 2067 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2067
taaccaatcc tccctttc 18
<210> 2068 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2068
taatgtggcg ngtggg 16
<210> 2069 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2069
ttaatgtggt gngtgggt 18
<210> 2070 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2070
gaaattattt gtgagattag gatag 25
<210> 2071 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2071
aaangacaca ataaccactt c 21
<210> 2072 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2072
ttttcgatgt ttttagaatt tgtagt 26
<210> 2073 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2073
tttttttgat gtttttagaa tttgtagt 28
<210> 2074 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2074
gggatttgga ggaggtttt 19
<210> 2075 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2076 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2076
gtttttcggg gttattaggt attg 24
<210> 2077 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2077
gttttttggg gttattaggt attga 25
<210> 2078 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Inosine
<400> 2078
attnggagtg ggaagtg 17
<210> 2079 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2079
gtaccaatac aacaactaac 20
<210> 2080 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2080
gtttgngagt cggggt 16
<210> 2081
<211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2081
ggtttgngag ttggggt 17
<210> 2082 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2082
tgtatgggtg gagtatttat ag 22
<210> 2083 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2083
cttcaaaacc aaccttaata aaac 24
<210> 2084 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2084
atttttattc gtttgtttta tgatagagat 30
<210> 2085
<211> 33 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2085
tttattttta tttgtttgtt ttatgataga gat 33
<210> 2086
<211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2086
ttatagggat tattatatgg gtaa 24
<210> 2087 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2087
acctaacaat aatcacttaa aa 22
<210> 2088 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2088
gttngngtcg agggat 16
<210> 2089
<211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2089
tgttngngtt gagggat 17
<210> 2090 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2090
aagagngagg tgttg 15
<210> 2091 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220> <221> <222>
<400> 2091
angctacaaa ctaatataca a 21
<210> 2092 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 2092
ggttagttta tcgngngtt 19
<210> 2093 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (17)..(17)
<223> Inosine
<400> 2093
aggttagttt attgngngtt 20
<210> 2094 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
gttggtgttg gtttagttat
<210> 2095
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2095
gatctctaaa acctaataca aat 23
<210> 2096 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2096
tttagatgga ngcgtttgtt t 21
<210> 2097 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (13)..(13)
<223> Inosine
<400> 2097
ggtttagatg gangtgtttg ttt 23
<210> 2098 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
gggttggggg ttttt
<210> 2099 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2099
aaaccccaaa tattccaaa 19
<210> 2100 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2100
ttgttggcgt tngtttagg 19
<210> 2101 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2101
ttgttggtgt ttgtttaggg 20
<210> 2102 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2102
gtttgagggg gaatagg 17
<210> 2103 <211> 17 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2103
atacngaaan gaatcac 17
<210> 2104 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (18)..(18)
<223> Inosine
<400> 2104
tngttttttc gttttttngg g 21
<210> 2105 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (18)..(18)
<223> Inosine
<210> 2106 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2106
ttttgaggat tnggtaaga 19
<210> 2107
<211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2107
gaaangatca aaaattaaat aaaac 25
<210> 2108 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2108
ggtgagtgtt gcgatttgg 19
<210> 2109 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2110 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2110
tagtattgag attattggtt ttt 23
<210> 2111 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2111
caactataat tcctctaatt ctaaa 25
<210> 2112 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (19)..(19)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (21)..(21)
<223> Inosine
<400> 2112
gaattatgaa aatcggtang nga 23
<210> 2113 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (20)..(20)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (22)..(22)
<223> Inosine
<400> 2113
ggaattatga aaattggtan gnga 24
<210> 2114 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2114
tttttagaaa ttgggtattt ttaag 25
<210> 2115
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2115
cngctataaa ctattaaatc taaataca 28
<210> 2116
<211> 32 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2116
gttttattat tcgttttttt tttttttttt tt 32
<210> 2117 <211> 34 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2117
agttttatta tttgtttttt tttttttttt tttt 34
<210> 2118
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2118
gnggtagggt atattagag 19
<210> 2119 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2119
gctccccaaa cttaaatcc 19
<210> 2120 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (13)..(13)
<223> Inosine
<210> 2121 <211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 2121
tttttnggga tttgtnggtt 20
<210> 2122 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2122
ggatatagtn gttgtgttt 19
<210> 2123 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2123
ccataaaatc caacaaaaat aa 22
<210> 2124 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 2124
tttgagggcg atgttgatat ag 22
<210> 2125 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2125
ggttttgagg gtgatgttga tatag 25
<210> 2126 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2126
agagaagaaa gtaagtagtt aat 23
<210> 2127 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2127
ttcctcttaa aaataaacaa tcat 24
<210> 2128 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<210> 2129 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (17)..(17) <223> Inosine
<400> 2129
ttgaaaaagt tagtgtngga agt 23
<210> 2130 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2130
gttaggagtt ggagattag 19
<210> 2131 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2131
ttctcctacc tcaacttac 19
<210> 2132 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<210> 2133 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Inosine
<400> 2133
tggnggtgtg tttttgtaa 19
<210> 2134
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2134
taagtaaata gttggtattt ttaga 25
<210> 2135 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2135
tngaaaaaac taattacaac tta 23
<210> 2136 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2137
<211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2137
gatagagaag attgggttta gtagg 25
<210> 2138 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2138
gtgagtagtt gggatttgg 19
<210> 2139 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2139
aacattanga actccatatt c 21
<210> 2140 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (18)..(18)
<223> Inosine
<210> 2141 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (18)..(18) <223> Inosine
<400> 2141
tgtttttttt tatttgtngt tatttatggt 30
<210> 2142 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2142
tggtgggatt ttagttttag g 21
<210> 2143 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2143
aaactataaa caactcaact aattatc 27
<210> 2144 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2144
gtgtagtatt cggtttttag gtgg 24
<210> 2145 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2145
ggtgtagtat ttggttttta ggtgg 25
<210> 2146
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2146
ggaaagaaag ggatttttat agg 23
<210> 2147
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2147
cccttttcca tactctatc 19
<210> 2148 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2148
aaattaaggg cgagggatta aag 23
<210> 2149 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2149
gataaattaa gggtgaggga ttaaaga 27
<210> 2150 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2150
gggatagaat tggaattagt g 21
<210> 2151 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2151
cccacccacc caatc 15
<210> 2152 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2152
ggaagtgcgt ttgngt 16
<210> 2153 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 2153
gggaagtgtg tttgngtaa 19
<210> 2154 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2154
gagtttangg tatttattaa atag 24
<210> 2155 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2155
gactacaaac caaaataaaa aa 22
<210> 2156 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2156
agaagtgagc gtattgtggt 20
<210> 2157 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2157
tgagaagtga gtgtattgtg gt 22
<210> 2158 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2159 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Inosine
<400> 2159
aaccctaang aaaaaataaa tacc 24
<210> 2160 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2160
tttttattta tgttttcgtt agggtttt 28
<210> 2161 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2161
ttatttttat ttatgttttt gttagggttt t 31
<210> 2162 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2162
gagtttgggg ttaggata 18
<210> 2163 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2163
tngccngctc taaaa 15
<210> 2164 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2164
ggggtngcgg tgttt 15
<210> 2165 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2165
tggggtngtg gtgttttt 18
<210> 2166 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2166
gtttttaggg ttggtggtag 20
<210> 2167
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2167
gngtcctcat aataataaat aac 23
<210> 2168 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2168
gggttttcgt tagngaagat 20
<210> 2169 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<210> 2170
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2170
atgttgagtn gtagagat 18
<210> 2171 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2171
caaanganga aaaacaa 17
<210> 2172 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (13)..(13)
<223> Inosine
gttngaaggc gtngtttt
<210> 2173 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine <400> 2173
ttgttngaag gtgtngtttt 20
<210> 2174
<211> 19
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2174
gtagaatngg gttttagga 19
<210> 2175 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220> <221> <222>
<400> 2175
angaaangtt atccatctc 19
<210> 2176 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2176
gangttaggt cgtnggtt 18
<210> 2177 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 2177
ggangttagg ttgtnggtt 19
<210> 2178 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2178
gtttngggaa atttgtg 17
<210> 2179 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2179
aaatcccaaa ccaaataaac 20
<210> 2180 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2180
tttgtgtgcg ngaaagtt 18
<210> 2181 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2181
gaatttgtgt gtgngaaagt tta 23
<210> 2182 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (4)..(4) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2182
gtgngggttt ngaatt 16
<210> 2183 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2183
gangaaaaac ngacataaac 20
<210> 2184 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2184
ggtagcgngg gaatgt 16
<211> <212> <213>
DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine <400> 2185
ggtagtgngg gaatgtttt 19
<210> 2186 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2186
taggaaggtg taggtagag 19
<210> 2187 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2187
caccactaaa cctcctatc 19
<210> 2188 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<210> 2189 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2189
tggtanggtg tngttagg 18
<210> 2190 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2190
tggttgtttt ttaggtattt g 21
<210> 2191 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2191
caacctngct ctaatcc 17
<210> 2192 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2192
ggnggtcgtt tttttttttg t 21
<210> 2193 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2193
ggnggttgtt tttttttttg ttta 24
<210> 2194 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2194
gtaggaaggt gtaggtagag 20
<210> 2195 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2195
ccactaaacc tcctatcc 18
<210> 2196 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2196
gaaaattgtg gcgttttaag gg 22
<210> 2197
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2197
ggaaaattgt ggtgttttaa ggg 23
<210> 2198 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2198
ggtagngttt atggttattt atta 24
<210> 2199 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2199
caaaaactat cngaaaaata aca 23
<210> 2200 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2200
tngttgagtc ggangatt 18
<210> 2201 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2201
tngttgagtt ggangattgt 20
<210> 2202 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2202
gaaggtgagn gttagaa 17
<211> <212> <213>
17 DNA
Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2203
gaaatngcct acaaaac 17
<210> 2204 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2204
agggttggcg nggtt 15
<210> 2205 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (13)..(13)
<223> Inosine
<400> 2205
ggagggttgg tgnggtt 17
<210> 2206 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2207 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Inosine
<400> 2207
aangctaaaa ttacaaaaca 20
<210> 2208 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2208
agtgngggtc gtttttaag 19
<210> 2209 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2209
agtgngggtt gtttttaagg 20
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2210
ttttgtnggg tttgttt 17
<210> 2211 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2211
ctcataacta aaatctctaa tataatc 27
<210> 2212 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 2212
tggataggtc gttgtngtt 19
<210> 2213 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (17)..(17)
<223> Inosine
<210> 2214 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2214
gaattgtggt gtagttagaa g 21
<210> 2215
<211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2215
ctcccatcta ccttaaaatt c 21
<210> 2216
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2216
aagagttttt tcgtaaatta tgatttgt 28
<210> 2217 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2217
tttaagagtt tttttgtaaa ttatgatttg t 31
<210> 2218 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2219 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2219
actcaaaact aacaaaaata ttc 23
<210> 2220 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<400> 2220
ttggggcggt ngatg 15
<210> 2221 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2221
gttggggtgg tngatga 17
<210> 2222 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Inosine
<400> 2222
ggatagaang tgttagtg 18
<210> 2223 <211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (10)..(10)
<223> Inosine
<400> 2223
gangataacn gaaactac 18
<210> 2224 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (26)..(26) <223> Inosine
<400> 2224
attttttatt atatcgtaga ggaatngt 28
<210> 2225 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (29)..(29)
<223> Inosine
<400> 2225
tttatttttt attatattgt agaggaatng t 31
<210> 2226 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2226
gagtatgngg tgagg 15
<210> 2227
<211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2227
ttctaaaata ctactccatc tc 22
<210> 2228 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (23)..(23)
<223> Inosine
<210> 2229 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (23)..(23)
<223> Inosine
<400> 2229
tangtttatt ttttgtgttt atnggg 26
<210> 2230 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2230
tgtggggaga ttattgag 18
<210> 2231 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2231
cctngaacac taaaacc 17
<210> 2232 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 2232
atggatttat ttcggataga ttaggag 27
<210> 2233 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2233
tatggattta ttttggatag attaggagg 29
<210> 2234 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2234
ggggtaagga attaatattg ag 22
<210> 2235 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (6)..(6) <223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<400> 2235
cattangaaa cngaataaac 20
<210> 2236 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2236
ggngggttcg ttgttg 16
<210> 2237 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2237
ggngggtttg ttgttgg 17
<210> 2238 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2238
ttgtaatgag aggtttgtta at 22
<210> 2239 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (9)..(9)
<223> Inosine
<400> 2239
ctaaatatng caaaaaactc tt 22
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (15)..(15) <223> Inosine
<400> 2240
ttttgtgtag gcgtngatat tta 23
<210> 2241 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 2241
ttttgtgtag gtgtngatat ttagg 25
<210> 2242 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2242
gtgtttagga tgttagatta g 21
<210> 2243 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2243
tctttactat cttccctatt c 21
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2244
ttgtagtttt gtatttttcg agagaag 27
<210> 2245 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2245
ttttgtagtt ttgtattttt tgagagaag 29
<210> 2246 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2246
gtttggttta aagttagaat taatag 26
<210> 2247 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2247
caacctctaa attattaaac aatc 24
<210> 2248
<211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2248
gttgttagat cggggagagt 20
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2249
ggttgttaga ttggggagag t 21
<210> 2250
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2250
attgagaaat tttaaatagg tattat 26
<210> 2251 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2251
gctctattta tatactttta atttttcat 29
<210> 2252 <211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2252
tggttatttt aattacgtag aaatgaatt 29
<210> 2253 <211> 32 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2254 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2254
ttaggggtga tggtagtg 18
<210> 2255 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2255
cccaaaaaac tactaactcc taa 23
<210> 2256 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2256
ggttgttgtt tttcgtttta ttatttgt 28
<210> 2257
<211> 29 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2257
gggttgttgt tttttgtttt attatttgt 29
<210> 2258 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<400> 2258
gaatttnggg gaggatt 17
<210> 2259 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2259
acctaaaccc caccaaa 17
<210> 2260 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2260
aggnggcggt aagtg 15
<210> 2261 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2261
aggnggtggt aagtgtt 17
<210> 2262 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (13)..(13) <223> Inosine
<400> 2262
tgtagatttt ttngatatta ttattt 26
<210> 2263 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2263
taaaccccaa ctaacaacta 20
<210> 2264 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2264
gtatttgttt gacgggaaag aga 23
<210> 2265 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2265
ggtatttgtt tgatgggaaa gaga 24
<210> 2266 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2267 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2267
cngctatacc caaaaatata ataaaa 26
<210> 2268 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2268
atagagagtg acgagtatgt gat 23
<210> 2269 <211> 27 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2269
tgttatagag agtgatgagt atgtgat 27
<210> 2270 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2270
tgaaaaggtt agttagtaat ttagt 25
<210> 2271 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2271
aatatttcct acctaactct aaaaa 25
<210> 2272 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2272
tagttngttt tttatacggt tttaaatg 28
<210> 2273 <211> 31 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (9)..(9)
<223> Inosine
<400> 2273
ttttagttng ttttttatat ggttttaaat g 31
<210> 2274 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2274
gggggataaa ggagaag 17
<210> 2275 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2275
caaaatttcc ctcaatttcc 20
<210> 2276 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2276
ggttgtgtgt tcgtgtatgt a 21
<210> 2277 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2277
tggttgtgtg tttgtgtatg ta 22
<210> 2278
<211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2278
atgtaagtag tgtggtaaag t 21
<210> 2279 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2279
ccacaatcct tacattcata a 21
<210> 2280 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2280
tttatagggc gtttaggttt tattaaat 28
<210> 2281 <211> 32 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2281
tttatagggt gtttaggttt tattaaatat at 32
<210> 2282 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2282
ggggatngag gaaatttt 18
<210> 2283
<211> 16
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (9)..(9) <223> Inosine
<400> 2283
aacccaaang ccctaa 16
<210> 2284 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (5)..(5) <223> Inosine
<400> 2284
aagtngggtt acgtattttt agtt 24
<210> 2285 <211> 26 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2285
aaaagtnggg ttatgtattt ttagtt 26
<210> 2286 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2286
gagaattttt attagggttt tg 22
<210> 2287 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (9)..(9)
<223> Inosine
<210> 2288 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (15)..(15)
<223> Inosine
<400> 2288
gagtttttta gtttngcgtt tttatatt 28
<210> 2289 <211> 30 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 2289
ggagtttttt agtttngtgt ttttatattt 30
<210> 2290 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2290
agtngagggt ttaggt 16
<210> 2291 <211> 18 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<221> modified_base <222> (3)..(3) <223> Inosine
<400> 2291
cangctattc acaaaaaa 18
<210> 2292 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2292
gttngtcgta ttttggaggt t 21
<210> 2293 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2293
gttngttgta ttttggaggt tt 22
<210> 2294 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<210> 2295 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2295
aangccaaat cataacttc 19
<210> 2296 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2296
aggggttngt cgtagtttat t 21
<210> 2297 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (8)..(8)
<223> Inosine
<400> 2297
aggggttngt tgtagtttat ttg 23
<210> 2298 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2298
tggggttgtg tttgat 16
<210> 2299 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2299
gaaaaangct tcctca 16
<210> 2300 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (11)..(11)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (13)..(13)
<223> Inosine
<400> 2300
gggtttttcg ngngg 15
<210> 2301 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (12)..(12)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (14)..(14)
<223> Inosine
<400> 2301
tgggtttttt gngngg 16
<210> 2302 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2302
gggtttttga ttttagtaat atag 24
<210> 2303 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (9)..(9)
<223> Inosine
<400> 2303
tngactccng atcta 15
<210> 2304
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2304
agattttttt ttcggttttt tgttttg 27
<210> 2305 <211> 28 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2305
agattttttt tttggttttt tgttttgt 28
<210> 2306
<211> 13 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2306
gngtngaggg gtt 13
<210> 2307 <211> 20 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<400> 2307
cngaaangcc taaaaattac 20
<210> 2308 <211> 22 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
<400> 2308
aagngttagg cgtttatgta tt 22
<210> 2309
<211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (6)..(6)
<223> Inosine
<400> 2309
ggaagngtta ggtgtttatg tat 23
<210> 2310 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2310
gangtaggat agtaggata 19
<210> 2311 <211> 19 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<210> 2312 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (18)..(18)
<223> Inosine
<400> 2312
tttttggatt tttcgttngg ttt 23
<210> 2313 <211> 25 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (20)..(20)
<223> Inosine
<400> 2313
gttttttgga ttttttgttn ggttt 25
<210> 2314 <211> 21 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<220>
<221> modified_base
<222> (4)..(4)
<223> Inosine
tngngattat ttattgttta t
<210> 2315 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base <222> (7)..(7) <223> Inosine
<400> 2315
ttacctngac cctccta 17
<210> 2316 <211> 15 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2316
tgtaggtcgg ggggg 15
<210> 2317 <211> 16 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2317
gtgtaggttg gggggg 16
<210> 2318 <211> 17 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2318
tgggttgaag ttgttga 17
<210> 2319 <211> 21 <212> DNA
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (5)..(5)
<223> Inosine
<400> 2319
tcaangaaac aaacataata a 21
<210> 2320 <211> 23 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (2)..(2)
<223> Inosine
<400> 2320
tngttgtcgt tgttttttgt tat 23
<210> 2321 <211> 24 <212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (3)..(3)
<223> Inosine
<400> 2321
gtngttgttg ttgttttttg ttat
<210> 2322
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<210> 2323
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 2323
cagttttcca gacctgaagt gt 22
<210> 2324
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 2324
cttcaaatgt agaatcttgg t 21
<210> 2325
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 2325
caattttaca gacatcctgc t 21
<210> 2326
<211> 23
<212> DNA
<213> Artficial sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 2326
cagttattgc ctcatcgaca gct 23
<210> 2327
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<400> 2327
catcaccctc attgttctgt cat 23
<210> 2328
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2328
ctcagcgaac ccggagaggg ct 22
<210> 2329
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2329
gaagctgtcg atgaggcata act 23
<210> 2330
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2330
gtggcacagt accctgagag ct 22
<210> 2331
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220> <220>
<400> 2331
ctggaacaga ggagggtcag 20
<210> 2332
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
<400> 2332
gcagagggtc catgtgcctc t 21
<210> 2333
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<220>
<223> Synthetic polynucleotide
<400> 2333
caggctggga aagctgatac c 21
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
1. Способ определения наличия злокачественной опухоли у нуждающегося в том
индивидуума, предусматривающий:
a. обработку экстрагированной геномной ДНК дезаминирующим средством для получения обработанной геномной ДНК, содержащей дезаминированные нуклеотиды, причем экстрагированная геномная ДНК получена из биологического образца от индивидуума;
b. создание профиля метилирования, содержащего один или несколько биомаркеров, выбранных из таблицы 20, из обработанной геномной ДНК; и
c. сравнение профиля метилирования с контролем, причем корреляция между профилем метилирования и контролем определяет наличие злокачественной опухоли у индивидуума.
2. Способ по п. 1, предусматривающий, что профиль метилирования
дополнительно содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из таблиц 15-18.
3. Способ по п. 1 или п. 2, предусматривающий, что профиль метилирования
дополнительно содержит один или несколько биомаркеров, выбранных из cg20468939,
cg24790419, cg26836479, cgl6911583, cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474,
cg06064964 cg26683005 cgl3911392 cg04858553 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cgl4058476 cg25954028 cg08075204 cgll779113 cg24166457 cgl8901104 cg09419005 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl8158859 cgl4642045 cgl4556909 cgl2042264 cg27141915 cg25982880 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cgO1681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl9300307 cg24165921 cg07119472 cg27377213 cgl7122157 cgl5797834 cgl8456621 cgl2900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 cgl8842353 cgl8215449 cgl4999168 cg26680502 cg09844573 cg27125093 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cgl4088196 cgl0732611 eg16402452 cg09399878 cgl2504877 cg03087897 cgl7518965 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cgO1660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cg03758697 cg24480810 cg21376733 cg02874908 cg21913888, cg24706505, cg20695297, cg06153925, cg27023597, cgO1722297, cg07644807, cg02358862, cg03653601, cgl0186131, cg03569637, cg01657186, cg05398700, cg02053964, cgl6509569, cgl0542975,
cgl5698795, cgl1791526, cg00862408, cgl6260696, cg00220455, cg20826709, cgl1436362, cgl3924996, cg07420137,cg24301930, cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130, cg07380416, cg27284288, cgl3912307, cgl0511890, cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962,cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087,cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392,cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128,cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343,cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513,cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cg01149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118,cgl5341833,cg02233149, cgl4247287,cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573, cg24686918,cg05352688, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713,cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 Hcg26017930.
4. Способ по п. 1, предусматривающий, что сравнение дополнительно включает создание набора данных по попарным различиям метилирования, который содержит:
(i) первое различие между профилем метилирования обработанной геномной ДНК и профилем метилирования первого нормального образца;
(ii) второе различие между профилем метилирования второго нормального образца и профилем метилирования третьего нормального образца и
(in) третье различие между профилем метилирования первого образца первичной злокачественной опухоли и профилем метилирования второго образца первичной злокачественной опухоли.
5. Способ по п. 1 или п. 4, предусматривающий, что сравнение дополнительно включает осуществление анализа набора данных попарных различий метилирования с
5.
контролем с помощью способа машинного обучения для создания профиля метилирования.
6. Способ по любому из пп. 1, 4 или 5, предусматривающий, что сравнение дополнительно включает определение типа злокачественной опухоли у индивидуума.
7. Способ по любому из пп. 1-6, предусматривающий, что способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
8. Способ по любому из пп. 1-7, предусматривающий, что создание
дополнительно включает гибридизацию каждого из одного или нескольких биомаркеров
с зондом и осуществление реакции секвенирования ДНК для количественного
определения метилирования каждого из одного или нескольких биомаркеров.
9. Способ по любому из пп. 1-8, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли.
10. Способ по любому из пп. 1-9, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли представляет собой метастатический тип злокачественной опухоли или рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли.
11. Способ по любому из пп. 1-10, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок,
9.
краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), фиброзную гистиоцитомную злокачественную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, злокачественную опухоль яичников, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки,
злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, такую как аденокарцинома прямой кишки (READ), ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма.
12. Способ по любому из пп. 1-11, предусматривающий, что биологические образцы содержат образец циркулирующей опухолевой ДНК или образец ткани.
13. Способ выбора терапии для индивидуума со злокачественной опухолью, предусматривающий: (а) идентификацию типа злокачественной опухоли индивидуума в соответствии со способом по пп. 1-12 и, (Ь) исходя из результатов стадии (а), выбор терапии, подходящей для такого типа злокачественной опухоли.
14. Вычислительная платформа для использования данных по метилированию CpG злокачественной опухоли с целью создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, включающая:
12.
(а) первое вычислительное устройство, содержащее процессор, модуль памяти, операционную систему и компьютерную программу, включающую исполняемые процессором инструкции для создания приложения для сбора данных с целью получения данных по метилированию CpG из набора биологических образцов, причем приложение для сбора данных содержит:
(1) модуль секвенирования, способный работать с устройством для секвенирования с целью создания данных по метилированию CpG из набора биологических образцов, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; а также первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и
(2) модуль приема данных, способный осуществлять прием:
(i) первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
(ii) второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными; и
(in) третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного
биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и
(Ь) второе вычислительное устройство, содержащее процессор, модуль памяти, операционную систему и компьютерную программу, включающую инструкции, исполняемые процессором, для создания приложения для анализа данных с целью создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем приложение для анализа данных содержит модуль для анализа данных, способный:
(1) создавать набор данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
(2) анализировать набор данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(i) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(ii) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
15. Платформа по п. 14, причем создание набора данных по попарным различиям метилирования включает:
(a) вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных;
(b) вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и
(c) вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных.
16. Платформа по п. 14 или п. 15, причем способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из одного или нескольких из
16.
следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
17. Платформа по любому из пп. 14-16, причем данные по метилированию CpG получены из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством.
18. Платформа по любому из пп. 14-17, причем устройство для секвенирования дополнительно способно анализировать экстрагированную геномную ДНК способом секвенирования следующего поколения для получения данных по метилированию CpG.
19. Платформа по п. 18, причем способ секвенирования следующего поколения представляет собой способ секвенирования с применением цифровой ПЦР.
20. Платформа по любому из пп. 14-19, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 15-18.
21. Платформа по любому из пп. 14-20, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из
17.
cg20468939 cg21122474 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24790419 cg06064964 cg26683005 cgl7126555 cg20695297 cgl7864646 cgl5759721 cg00253248 cg00206490 cg01660934 cg02914427 cg07116712 cg05596756 cg23147227 cgl4088196 cgl0732611 cgl8215449 cgl4999168 cgl6260696 cg26836479 cgl1779113 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cgO1657186 cg03758697 cg24480810 cgl6402452 cg09399878 cg00220455 cgl6911583 eg12042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cgl5139596 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cgl6927606 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cgl2967050, cgl2504877, cg03087897, cg27125093, cgl8456621, cgl2900649, cgl0530767, cg23878564, cg03549146, cg26769927, cg20357538, cgl0590292, cg26363363, cgl6061668, cgl9300307, cgl4642045, cgl4556909, cgl1791526, cg07420137,
cg24301930
cgl3395086, cg20136100, cg09153080, cg09902130
cg07380416
cg27284288,
cgl3912307, cgl0511890,cg00242035, cg04314978, cg25225070, cg20411756, cg24247537, cg04330884, cg23130731, cg04888360, cg00907272, cg05979232, cg00025044, cg04441857, cg09684112, cg27388962, cg05931497, cgl3408086, cgl3555415, cg22552736, cgl6191087, cgl3925432, cgl3464240, cgl4633252, cgl9252956, cg00015530, cg08632810, cgl2737392, cg26769700, cg03218479, cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584,cgl7984956,cg05177060, cg24107852, cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715,cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343,cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313, cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146, cg09001226, cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118, cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601,cg05656900, cg08132573,cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713,cg23589035,cg01903374, cg23612220,cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755,cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
22. Платформа по любому из пп. 14-21, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20.
23. Платформа по любому из пп. 14-22, причем тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли.
24. Платформа по любому из пп. 14-23, причем тип злокачественной опухоли представляет собой метастатический тип злокачественной опухоли или рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли.
25. Платформа по любому из пп. 14-24, причем тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного
22.
мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), фиброзную гистиоцитомную злокачественную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную
опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, злокачественную опухоль яичников, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, такую как аденокарцинома прямой кишки (READ), ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма.
26. Платформа по любому из пп. 14-25, причем контрольный набор данных включает набор профилей метилирования, причем каждый указанный профиль метилирования создан на основе биологического образца, полученного из известного типа злокачественной опухоли.
27. Платформа по любому из пп. 14-26, причем биологические образцы содержат образец циркулирующей опухолевой ДНК или образец ткани.
28. Реализуемый на компьютере способ создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, предусматривающий:
a. создание данных по метилированию CpG из набора биологических образцов способом секвенирования, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и причем первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
b. получение с помощью первого процессора первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
c. получение с помощью первого вычислительного устройства второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
a.
d. получение с помощью первого вычислительного устройства третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными;
e. создание с помощью второго процессора набора данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
f. анализ набора данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(1) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(2) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
29. Реализуемый на компьютере способ по п. 28, предусматривающий, что стадия е) дополнительно предусматривает
a. вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных;
b. вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и
c. вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных.
30. Реализуемый на компьютере способ по п. 28 или п. 29, причем способ машинного обучения предусматривает использование алгоритма, выбранного из одного или нескольких из следующих: анализа главных компонент, логистического регрессивного анализа, анализа ближайших соседей, опорно-векторной машины и модели нейронной сети.
30.
31. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-30, предусматривающий, что данные по метилированию CpG получают из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством.
32. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-31, предусматривающий, что профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 1518.
33. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-32, предусматривающий, что профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583,cgl5139596, cgl6927606, cgl2967050, cg21122474, cg06064964,
30.
cgl1779113 cg24166457 cgl3911392 cg04858553 cg06153925 cg27023597 cgO1722297 cg07644807 cg02358862 cg03653601 cgl0186131 cg03569637 cgO1657186 cg03758697 cg24480810 eg16402452 cg09399878 cg00220455 cg20136100 cg00242035 cg04888360 cg05931497 cgl4633252 cgl2042264 cg27141915 cgl8901104 cg09419005 cg27410601 cg02782634 cg22589778 cg00558804 cg23093496 cgO1990910 cg06380123 cg02522196 cg23764129 cg05398700 cg02053964 cg21376733 cg02874908 cg20826709 cg09153080 cg04314978 cg00907272 cgl3408086 cgl9252956 cg27377213 cgl7122157 cg25982880 cg25490145 cg03297901 cgl8942579 cg07137244 cg05304979 cg07641284 cg00933696 cgl8610205 cgl1655490 cg04514998 cgl4058476 cg25922751 cgl6509569 cgl0542975 cgl1436362 cg09902130 cg25225070 cg05979232 cgl3555415 cg00015530 cg26680502 cg09844573 cgl5797834 cgl1252953 cg06853339 cg01409343 cg04147906 cg27598656 cg01681367 cg09866569 cgl2353452 cgl9693177 cg07332880 cgl8158859 cg25954028 cg08075204 cgl5698795 eg13924996 cg07380416 cg20411756 cg00025044 cg22552736 cg08632810 cgl2504877 cg03087897 cg27125093 cgl8456621 eg12900649 cgl0530767 cg23878564 cg03549146 cg26769927 cg20357538 cgl0590292 cg26363363 cgl6061668 eg19300307 eg14642045 cgl4556909 cgl1791526 cg07420137 cg27284288 cg24247537 cg04441857 cgl6191087 eg12737392 cg21913888 cg24706505 cgl7518965 cg07058988 cg27219182 cg26112797 cg07860918 cg22190721 cg08480068 cg22460896 cg00037681 cg21249754 cg25574765 cgl8842353 cg24165921 cg07119472 cg00862408 cg24301930 cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700 cg26683005, cgl7126555, cg20695297, cgl7864646, cgl5759721, cg00253248, cg00206490, cgO1660934, cg02914427, cg07116712, cg05596756, cg23147227, cgl4088196, cgl0732611, cgl8215449, cgl4999168, cgl6260696, cgl3395086, cgl0511890, cg23130731, cg27388962, cgl3464240, cg03218479,
cg02609337, cgl0351284, cg23554164, cgl9021985, cg21031128, cgl9421584, cgl7984956, cg05177060, cg24107852,cg25652701, cg00282244, cgl8887230, cg08486903, cg09335715, cgl2629796, cgl6454130, cg26433975, cgl0673833, cg06787669, cgl2192582, cg05098343, cg07573366, cgl1105292, cg05287480, cgl6748008, cgl6644023, cg06488150, cg09450197, cg20336172, cg08858130, cgl2098228, cg26811313,cg25432518, cgl6622899, cgl2359001, cg01209642, cgl4564351, cg23429794, cg26401541, cg20046343, cg20847580, cg03431741, cg07417146,cg09001226,cg06482498, cg03891050, cg00899907, cgl3597051, cgl8113826, cg04859102, cg01620360, cgl4083015, cgl5046123, cg03190513, cg01456691, cgl7207512, cg20510285, cgOl149192, cg05614346, cg06439655, cgl1334870, cg08912922, cg23021796, cg24835948, cgl0393744, cg07428959, cgl7694130, cg03956042, cgl9266387, cgl3512830, cgl9982684, cg22513455, cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118,cgl5341833, cg02233149,cgl4247287, cg23824762, cg01604601,cg05656900, cg08132573, cg24686918, cg05352688, cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731,cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220,cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490, cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 и cg26017930.
34. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-33, предусматривающий, что профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20.
35. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-34, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли.
36. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-35, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли представляет собой рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли.
37. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-36, предусматривающий, что тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль
34.
центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), фиброзную гистиоцитомную злокачественную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль
ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, злокачественную опухоль яичников, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому, первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, такую как аденокарцинома прямой кишки (READ), ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма.
38. Реализуемый на компьютере способ по любому из пп. 28-37, предусматривающий, что биологические образцы содержат образец циркулирующей опухолевой ДНК или образец ткани.
39. Панель зондов, содержащая множество зондов, каждый зонд является зондом с формулой I
г- L
Формула I,
где:
А является первым связывающим цель участком; В является вторым связывающим цель участком; и L является линкерным участком;
где А содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 30 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 5' конце последовательности, выбранной из SEQ Ш N0: 1-1775; В содержит последовательность, которая по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95% или 99% идентична по меньшей мере 12 смежным нуклеотидам, начиная с положения 1 на 3' конце той же последовательности, выбранной из SEQ Ш NO: 1-1775; L присоединен к А; а В присоединен либо к А, либо к L.
40. Панель зондов по п. 39, где L присоединен к А, а В присоединен к L.
41. Панель зондов по п. 39 или п. 40, причем множество зондов представляет собой по меньшей мере 10, 20, 30, 50, 100 или более зондов.
42. Панель зондов по любому из пп. 39-41, причем множество зондов применяют в реакции секвенирования следующего поколения в растворе для получения данных по метилированию CpG.
43. Панель зондов по п. 42, причем реакция секвенирования следующего поколения в растворе представляет собой способ секвенирования с применением капельной цифровой ПЦР.
44. Панель зондов по любому из пп. 39-43, где L составляет в длину от 10 до 60, от 15 до 55, от 20 до 50, от 25 до 45 и от 30 до 40 нуклеотидов.
45. Панель зондов по любому из пп. 39-44, где L дополнительно содержит адапторный участок для идентификации каждого зонда.
46. Машиночитаемый носитель с постоянной записью с сохраненными на нем инструкциями, которые при выполнении процессором осуществляют стадии, предусматривающие:
40.
a. создание данных по метилированию CpG из набора биологических образцов способом секвенирования, причем набор содержит первый злокачественный биологический образец, второй злокачественный биологический образец, третий злокачественный биологический образец, первый нормальный биологический образец, второй нормальный биологический образец и третий нормальный биологический образец; причем первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными; и причем первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
b. получение с помощью первого процессора первой пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от первого злокачественного биологического образца и первого нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от первого злокачественного биологического образца, образуют первый набор данных в рамках первой пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от первого нормального биологического образца, образуют второй набор данных в рамках первой пары наборов данных, и первый злокачественный биологический образец и первый нормальный биологический образец происходят из одного и того же источника биологических образцов;
c. получение с помощью первого вычислительного устройства второй пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго нормального биологического образца и третьего нормального биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго нормального биологического образца, образуют третий набор данных в рамках второй пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего нормального биологического образца, образуют четвертый набор данных в рамках второй пары наборов данных, и первый, второй и третий нормальные биологические образцы являются различными;
d. получение с помощью первого вычислительного устройства третьей пары наборов данных по метилированию CpG, полученной от второго злокачественного биологического образца и третьего злокачественного биологического образца, причем данные по метилированию CpG, полученные от второго злокачественного биологического образца, образуют пятый набор данных в рамках третьей пары наборов данных, данные по метилированию CpG, полученные от третьего злокачественного биологического образца, образуют шестой набор данных в рамках третьей пары наборов данных, и первый, второй и третий злокачественные биологические образцы являются различными;
a.
e. создание с помощью второго процессора набора данных по попарным различиям метилирования из первой, второй и третьей пары наборов данных; и
f. анализ набора данных по попарным различиям метилирования с помощью контрольного набора данных способом машинного обучения для создания базы данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли, причем
(1) способ машинного обучения предусматривает идентификацию множества маркеров и множества весовых значений на основе наивысшего показателя и классификацию образцов на основе множества маркеров и множества весовых значений; и
(2) база данных по профилям метилирования CpG злокачественной опухоли содержит набор профилей метилирования CpG, и каждый профиль метилирования CpG представляет тип злокачественной опухоли.
47. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по п. 46, причем стадия е) дополнительно предусматривает
a. вычисление различия между первым набором данных и вторым набором данных в первой паре наборов данных;
b. вычисление различия между третьим набором данных и четвертым набором данных во второй паре наборов данных; и
c. вычисление различия между пятым набором данных и шестым набором данных в третьей паре наборов данных.
48. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по п. 46 или п. 47, причем стадия е) дополнительно предусматривает создание набора данных по попарным различиям метилирования с помощью второго процессора из вычисленного различия первой пары наборов данных, вычисленного различия второй пары наборов данных и вычисленного различия третьей пары наборов данных.
49. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-48, причем данные по метилированию CpG получены из экстрагированной геномной ДНК, обработанной дезаминирующим средством.
50. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-49, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из таблиц 15-18.
51. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-50, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 10, 20, 30, 40, 50, 100, 200 или более биомаркеров, выбранных из cg20468939, cg24790419, cg26836479, cgl6911583,
48.
cgl5139596: cg27377213: cgl7122157 cg25982880: cg25490145: cg03297901: cgl8942579 cg07137244: cg05304979: cg07641284: cg00933696: cgl8610205: cgll655490: cg04514998: cgl4058476: cg25922751: cgl6509569 cgl0542975: cgl1436362 cg09902130: cg25225070: cg05979232: cgl3555415: cg00015530: cg23554164 cg25652701: cg26433975: cg05287480: cgl2098228: cg23429794: cg06482498: cgl4083015: cg05614346: cg07428959: cgl6927606: cg26680502: cg09844573: cgl5797834 cgll252953: cg06853339 cg01409343: cg04147906: cg27598656: cg01681367 cg09866569: cgl2353452 cgl9693177 cg07332880: cgl8158859 cg25954028: cg08075204: cgl5698795: cgl3924996: cg07380416: cg20411756: cg00025044: cg22552736: cg08632810: cgl9021985: cg00282244: cgl0673833: cgl6748008: cg26811313: cg26401541: cg03891050: cgl5046123: cg06439655: cgl 7694130: cgl2967050: cgl2504877 cg03087897: cg27125093: cgl8456621: cgl2900649: cgl0530767 cg23878564: cg03549146: cg26769927: cg20357538: cgl0590292 cg26363363: cgl6061668: cgl9300307 cgl4642045: cgl4556909 cgll791526: cg07420137 cg27284288: cg24247537: cg04441857 cgl6191087 cgl2737392 cg21031128: cgl8887230: cg06787669: cgl6644023: cg25432518: cg20046343: cg00899907: cg03190513: cgll334870: cg03956042: cg21122474 cg21913888: cg24706505: cgl7518965: cg07058988: cg27219182 cg26112797 cg07860918: cg22190721: cg08480068: cg22460896: cg00037681: cg21249754 cg25574765: cgl8842353: cg24165921: cg07119472 cg00862408: cg24301930: cgl3912307 cg04330884 cg09684112 cgl3925432 cg26769700: eg19421584 cg08486903: cgl2192582 cg06488150: cgl6622899 cg20847580: cgl3597051: cg01456691: cg08912922 cgl9266387 cg06064964: cg26683005: cgl7126555: cg20695297: cgl7864646: cgl5759721: cg00253248: cg00206490: cgO1660934 cg02914427: cg07116712 cg05596756: cg23147227: cgl4088196: cgl0732611: eg18215449 cgl4999168: cgl6260696: cgl3395086: cgl0511890: cg23130731: cg27388962: cgl3464240: cg03218479 cgl7984956: cg09335715: cg05098343: cg09450197 cgl2359001: cg03431741: cgl8113826: eg17207512 cg23021796: cgl3512830: cgl 1779113: cg24166457 cgl3911392 cg04858553: cg06153925: cg27023597: cg01722297: cg07644807: cg02358862 cg03653601: cgl0186131: cg03569637 cg01657186: cg03758697 cg24480810: cgl6402452: cg09399878: cg00220455: cg20136100: cg00242035: cg04888360: cg05931497 cgl4633252 cg02609337: cg05177060: cgl2629796: cg07573366: cg20336172 cg01209642: cg07417146: cg04859102 cg20510285: cg24835948: cgl9982684 eg12042264, cg27141915, cgl8901104, cg09419005, cg27410601, cg02782634, cg22589778, cg00558804, cg23093496, cgO1990910, cg06380123, cg02522196, cg23764129, cg05398700, cg02053964, cg21376733, cg02874908, cg20826709, cg09153080, cg04314978, cg00907272, cgl3408086, cgl9252956, cgl0351284, cg24107852, cgl6454130, cgl1105292, cg08858130, cgl4564351, cg09001226, cgO1620360, cgOl149192, eg10393744, cg22513455,
cg07186032, cg08052292, cg27366280, cg06825448, cg25451702, cg08098128, cgl3821008, cg27405400, cg09366118,cgl5341833, cg02233149, cgl4247287, cg23824762, cg01604601, cg05656900, cg08132573,cg24686918, cg05352688,cgl8384097, cgl6266227, cgl9675731, cg21461981, cg25765104, cg26394055, cg20685713, cg23589035, cg01903374, cg23612220, cg26315985, cgl8856478, cg23229016, cg21004490,cg24742520, cg23013029, cgl9704755, cg07589991, cgl0055231 ncg26017930.
52. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-51, причем профиль метилирования содержит по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 100 или более биомаркеров, выбранных из таблицы 20.
53. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-52, причем тип злокачественной опухоли представляет собой солидный тип злокачественной опухоли или гематологический тип злокачественной опухоли.
54. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-53, причем тип злокачественной опухоли представляет собой рецидивирующий или рефрактерный тип злокачественной опухоли.
55. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-54, причем тип злокачественной опухоли включает острый миелоцитарный лейкоз (LAML или AML), острый лимфобластный лейкоз (ALL), адренокортикальную карциному (АСС), злокачественную опухоль уротелия мочевого пузыря (BLCA), глиому ствола головного мозга, глиому головного мозга с низкой степенью злокачественности (LGG), опухоль головного мозга, злокачественную опухоль молочной железы (BRCA), бронхиальные опухоли, лимфому Беркитта, злокачественную опухоль без выявленного первичного очага, карциноидную опухоль, карциному без выявленного первичного очага, атипичную тератоидную/рабдоидную опухоль центральной нервной системы, эмбриональные опухоли центральной нервной системы, цервикальную плоскоклеточную карциному, эндоцервикальную аденокарциному (CESC), детские злокачественные опухоли, холангиокарциному (CHOL), хордому, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелолейкоз, хронические миелопролиферативные нарушения, злокачественную опухоль (аденокарциному) толстой кишки (COAD), злокачественную опухоль толстой и прямой кишок, краниофарингиому, кожную Т-клеточную лимфому, опухоли островковых клеток эндокринной части поджелудочной железы, злокачественную опухоль эндометрия, эпендимобластому, эпендимому, злокачественную опухоль пищевода (ESCA), эстезионейробластому, саркому Юинга, экстракраниальную эмбрионально-клеточную
52.
опухоль, внегонадную эмбрионально-клеточную опухоль, злокачественную опухоль лежащих за пределами печени желчевыводящих путей, злокачественную опухоль желчного пузыря, злокачественную опухоль (желудка) желудочно-кишечного тракта, гастроинтестинальную карциноидную опухоль, опухоль гастроинтестинальных стромальных клеток, гастроинтестинальную стромальную опухоль (GIST), гестациозную трофобластическую болезнь, глиобластому мультиформную (GBM), волосатоклеточный лейкоз, злокачественную опухоль головы и шеи (HNSD), злокачественную опухоль сердца, лимфому Ходжкина, гипофарингеальную злокачественную опухоль, интраокулярную меланому, опухоли островковых клеток поджелудочной железы, саркому Капоши, злокачественную опухоль почки, лангергансоклеточный гистиоцитоз, злокачественную опухоль гортани, злокачественную опухоль губы, злокачественную опухоль печени, опухоль лимфоидной ткани, диффузную В-крупноклеточную лимфому (DLBCL), фиброзную гистиоцитомную злокачественную опухоль костей, медуллобластому, медуллоэпителиому, меланому, карциному из клеток Меркеля, карциному кожи из клеток Меркеля, мезотелиому (MESO), метастатическую сквамозную злокачественную опухоль с источником неизвестного происхождения, злокачественную опухоль ротовой полости, синдромы множественных эндокринных неоплазий, множественную миелому, множественную миелому/плазмаклеточную миелому, фунгоидный микоз, миелодиспластические синдромы, миелопролиферативные неоплазий, злокачественную опухоль полости носа, носоглоточную злокачественную опухоль, нейробластому, неходжкинскую лимфому, немеланоцитарную злокачественную опухоль кожи, немелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль ротовой полости, злокачественную опухоль полости рта, злокачественную опухоль ротоглотки, остеосаркому, другие опухоли головного и спинного мозга, злокачественную опухоль яичников, овариальную эпителиальную злокачественную опухоль, овариальную эмбрионально-клеточную опухоль, овариальную пограничную опухоль, злокачественную опухоль поджелудочной железы, папилломатоз, злокачественную опухоль придаточных пазух носа, злокачественную опухоль паращитовидной железы, злокачественную опухоль почечной лоханки, злокачественную опухоль полового члена, фарингеальную злокачественную опухоль, феохромоцитому и параганглиому (PCPG), пинеальную паренхиматозную опухоль промежуточной дифференцировки, пинеобластому, опухоль гипофиза, плазмаклеточную миелому/множественную миелому, плевролегочную бластому,
первичную лимфому центральной нервной системы (CNS), первичную гепатоклеточную злокачественную опухоль печени, злокачественную опухоль предстательной железы, такую как аденокарцинома предстательной железы (PRAD), злокачественную опухоль прямой кишки, такую как аденокарцинома прямой кишки (READ), ренальную злокачественную опухоль, почечно-клеточную злокачественную опухоль (почки), почечно-клеточную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль дыхательных путей, ретинобластому, рабдомиосаркому, злокачественную опухоль слюнной железы, саркому (SARC), синдром Сезари, меланому кожи (SKCM), мелкоклеточную злокачественную опухоль легкого, злокачественную опухоль тонкого кишечника, саркому мягких тканей, плоскоклеточную карциному, сквамозную злокачественную опухоль шеи, (гастральную) злокачественную опухоль желудка, супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли, Т-клеточную лимфому, злокачественную опухоль яичка, опухоли половых клеток яичка (TGCT), злокачественную опухоль горла, тимусную карциному, тимому (THYM), злокачественную опухоль щитовидной железы (ТНСА), злокачественную опухоль "переходных" клеток, злокачественную опухоль "переходных" клеток почечной лоханки и мочеточника, трофобластическую болезнь, злокачественную опухоль мочеточника, уретральную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль матки, злокачественную опухоль матки, увеальную меланому (UVM), вагинальную злокачественную опухоль, злокачественную опухоль наружных женских половых органов, макроглобулинемию Вальденстрема или опухоль Вильма.
56. Машиночитаемый носитель с постоянной записью по любому из пп. 46-55, причем биологические образцы содержат образец циркулирующей опухолевой ДНК или образец ткани.
Y
Обучение
Машинное обучение/классификация
База данных по профилям метилирования CpG
105
114
J4L
113
Машинное обучение/классификация биомаркеров
Сравнение профиля метилирования с базой данных по профилям метилирования CpG
Проведение анализа
115
Фиг. 4
Бесклеточная ДНК в моче с различным буфером
U ЕС
200 180 160 140 _ 120 s 100 SO 60 40 20 0
\ > >
! Ю со й>
С5")
Злокачественная
опухоль молочной железы
Злокачественная опухоль легкого
ДНК нг/мл мочи у нормальной женщины
ДНК нг/мл мочи у беременной 31 неделю
Электродный USB 1:50 USB 1:20 USB 1:10 Без буфера
беременная 21 неделю
беременная 28 недель
беременная месяцев
3 повторности бесклеточной ДНК из образца страдающего злокачественной опухолью пациента
200 - -
150
ДНК нг/мл жидкости
злокачествен злокачествен- злокачествен- злокачествен- злокачественная -ная опухоль ная опухоль ная опухоль ная опухоль опухоль
легкого, легкого, легкого, легкого, моча легкого, моча 2 жидкость 1 жидкость 2 жидкость 3 1
Злокачественная опухоль
Нормальный
BRCA
LUSC
LUAD
COAD
KIRC
KIRP
LIHC
GBM
GBM I Нормальный
Фиг. 9B
Нормальный
KIRC KIRP Нормальный О
Фиг. 10А
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001 ¦Значение РСА> 0 , Значение РСА <0
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001
- .Логарифмический ранговый критерий, р=0,068
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
" Логарифмический ранговый <г критерий, р <0,0001
Общая выживаемость (дни)
,.;!Логарифмический ранговый
|кри icpnii. р- 0,0001
00 в ш mm mz Общая выживаемость (дни)
СО P*1j
СО С-5 •
2 ...
Логарифмический ранговый критерий, р=0,141
Общая выживаемость (дни)
Логарифмический ранговый 8,, критерий, р <0,0001 ра
критерий, р=0,397
. Логарифмический ранговьп ?L " . fi.
' критерий, р=0,019 д ' (tm)(tm)?"*^-аС(tm)" Ранговыи
. Логарифмический ранговый критерий, р=0,002
J . < Логарифмический ранговый Sj критерий, р=0,179
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
Общая выживаемость (дни)
хМ1
3 "'
Логарифмический ранговыг §-, критерий, р <0,0001 Р5
# '-s. лай
Общая выживаемость (дни) j Логарифмический ранговый (критерий, р=0,001
Общая выживаемость (дни)
Логарифмический ранговый ( критерий, р=0,145
Общая выживаемость (дни)
i Логарифмический ранговый о ..|
критерий, р=0,001 5" " Логарифмический ранговый
Общая выживаемость (дни)
1 PS i критерий, р=0,133
Общая выживаемость (дни)
Логарифмически
й ранговый -
критерий,
р <0,0001
Общая выживаемость (дни)
Все пациенты
I I
J Логарифмический ранговый 2. критерий, р=0,016 ?
Общая выживаемость (дни)
Пациенты без опухоли "Логарифм ический т ранговый н критерий, р=0,043
Общая выживаемость (дни)
Пациенты с опухолью
i Логарифмический 1ранговый критерий, р <0,0001
Общая выживаемость (дни)
Пациенты с I-III стадией
Логарифмическ i ий ранговый •критерий, ,п=0Л88
Общая выживаемость (дни)
Пациенты с III-IV стадией
Фиг. 10В
Q Значение PCA> 0 Живые Без мутации ¦ Значение РСА <0 Мертвые * Мутация
й "
у Злокачественная опухоль Нормальный
• ~ •штшввтяттяшт
Статус
Название-1 : .1
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001 Общая выживаемость (дни)
Значение РСА> 0, мутация ШН1 Значение РСА> 0, дикий тип ШН1
Значение РСА <0, мутация ШН1 Значение РСА <0, дикий тип ШН1
Значение РСА <() Живые Без мутации Значение РСАХ) ((Мертвые Мутация
Злокачественная опухоль Нормальный
Аннотация
mm* " ш
Значение РСА <0 | ""j Живые Без мутации Злокачественная опухоль
Значение РСА> 0 Щ Мертвые Мутация Нормальный
Фиг 12
Злокачественная Нормальный опухоль
50%
Л те 33 S те
юо%г
50%
л те я
S те
О >
Л о
^ ^ ^ ^ ^ <гк v> ^ ч> <^ ъ> ^ с$> ^
^^^^^^^^> > > €о°> :^
с. Значимо мутировавшие гены в KIRC
100%
50%
100%
50%
О.'
сч." *!> _у ,р Јi jQr JX <^ ^ # ^ ^ &
Злокачественная опухоль молочной железы
Злокачественная опухоль печени
и о
о и
И и
1-н
и S К и и и
# ^ 4? ^
р=1,21хЮ 21, по ранговому критерию Уилкоксона объединенных образцов
а а щ С = о
Ш ш
о -
Фиг. 15В
тпттгз метилирование
ч У
" 65 9." •" a* i"
Контроль
ген
Фиг. 15С |
0.0 .1 ОЛ пь 04 1.0
метилирование
Контроль -ш- Сконструированный ген
Фиг. 15D
Фиг. 15Е
Контроль Сконструированный ген
О 100
О 50-
Фиг. 15F §
Фиг. 15Н
Фиг. 15G
"2,
О О О В О Л ШМ ОЛ 1 о
ев1втвэз1в метилирование
Контроль
_1500
S S
К юоо-
о к > .
о 500
о ю
Контроль
Сконструированный ген
Дни
Сконструированный ген
200-1
1SO
2 1004
Фиг. 151
о m-i
Контроль Сконструированный ген
Злокачественная опухоль толстой/тонкой кишок Нормальное состояние толстой/тонкой кишок
относительный
Злокачественная опухоль толстой/тонкой кишок Нормальное сисюянис 10ЛС10Й юнкой кишок
сьгоои мин. Злокачеств енная опухоль печени 11ормальнос состяние печени
сьгоои макс. Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние легкого
относительный
сырой мин. Злокачественная опухоль толстой/тонкой кишок
Злокачественная опухоль толстой/тонкой кишок метастазиоует в печень Злокачественная опухоль толстой/тонкой кишок метастазирует в легкое Нормальное состояние толстой/тонкой кишок
сьгоои макс.
(Злокачественная опухоль печени Нормальное состояние печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние легкого
1шЖ'Щ1ьШ1В 'ii lf$t'J ШтШШШШШШШШШШ
Фиг. 19А
n 127
Значение PCA> 0 Значение PCA <0
0.4-
Логарифмический ранговый критерий, p=0,007
500 1000 1500 1000
Общая выживаемость (дни)
Фиг. 19В
1.0 РМ{~
n 7J
Фиг. 19С
1.0
п- 49
? 0.6-1
л- 7?
n f.6
0,4-
. 0.2-
Логарифмический ранговый критерий, р=0,007
0.2-
Логарифмический ранговый критерий, р=0,01
0.0 i 1- t -т (tm)(tm) =р
о 500 woo isoo гтес
Общая выживаемость (дни)
S00 1000 1500 20ОС
Общая выживаемость (дни)
Фиг. 19D
1.0
Фиг. 19E
л 51 Г*3^ "
1 0.1
л-34
мЗ 0,S-
0.4-
Логарифмический ранговый критерий, р=0,029
got
Логарифмический ранговый критерий, р=0,021
o.o
о soo looo isoo гоос Общая выживаемость (дни)
looo 1500 гоос
Общая выживаемость (дни)
Л Я
5 0.4
Значение PCA> 0 Значение PCA <0
500 1000 1500
Общая выживаемость (дни)
200i
0.8-
ГР146
Я №
и*.
Я Я
fi=126
ж ;
Б tics и н " о
ffl 12'
Дикий тип Мутация
Логарифмический ранговый критерий, р=0,0()4
ш wm isoo жю
Общая выживаемость (дни)
Логарифмический ранговый критерий, р=0,0001
п=61
ЬОО 1000 Общая выживаемость (дни)
7000
Значение PCA <0 j 13начение РСА> 0
Живые ) Мертвые
Дикого типа Мутация
Злокачествен |ная опухоль
1 Нормальное состояние
Жизн. статм; 1 и '
Значение Рса
Оора "ец
1. Wf -OS
T"NP~
mi цй
IMSBlHil
"0,0*02 2781*
[".00Ai4J
С DM)
0.0Ui/S/l
1Л1М
о,ош/ь48
" OR10C14
" 0.003^144
MTTg
(1,00482/3
'lrmp ____
дМШШш
HIS ! 1H.
ОЛМЫЧ)4
Bf SP1
0.1Ю/Л/4У
CtDO
IRIMM
о.осэтзгзч
/N1ЬЪН
0.014t"4
WW-
0 014/1 S
MliPSb
!).он> / m
OSBPi 1 1
О.ШЙО/
(MM
0.01 'MMS
GANAB
0,0?387S
а u;;f,-> [.••,
( Si m
\lKi 11)1
И.П7/ 5/ 1
с (ite
О.ШМИ/
~ BRSKi
roxr?
¦¦vie;
оси i,")4
C,PRJM1
0 0 1 if.IK
MKl )
0,(3'14"j1K
ЛКИ
0.0 iH//S
I NKSK i
O.O.WOb'i
RAB.18
0^04179?
.N14
0.04/ЫЗ
> Rf-80
_____ 0-§?~3
0.04S?
q.m 'о.звг'
О S/4 ПЛ/4
0Л/4 0Л/4 jIs/4 0374' 0,1.74
олд*
?),'"/{" O.SK I
O.VJl 0.G04
o.bie
Of.')*)
O.bbb O.Mib 0.G7G 0.G70 O.G/C, 0 (./(> U.UHJ, O.hHb Q.uRb 0.G86 0.С8Г-Ob HO {) f.Kb O.hW 0/01 0.707 Q.IJ 0J2
7.74F
8'/
0.1 L7H
ШШ 1
:.! HF :r>
*,1
0. > 4771
¦:> .:)> ,: I?M
Я." 1.142
Н 1
0.0.'Ч7Ч 7
4(-
ИЛ1133
¦И''V- 1
0.00227(51
0.064719
У*-...
0.002343
0.1199
НГ < < 1
0.0027571
0.97289
НННЕбяв
Ц 5
0.0037> > l-i
: 1
п.63516
¦¦яняеяи
1И\:/;:. '¦'¦¦¦'.:%.¦
0.031 1.5 J
О.Ь9Г> 14
'.'.OO-IS.V*
-ГШ-
?i-
П.1В-172
шШ-4:'-.'--:-У•,
!).o;> "ii"i?i
21-
Р. &77Ч1
И 2
fl.ii'l-';71
f).i):if!7 ":i
П.7П-1Ы
HH 2
:-лумюз?
ЯНЕЕЛВНН
2 Л
O.'iSH11
C-.OijS 393-1
ИИИ!ШИИИ1 ' л
0.24789
О.О^ПЩЬ
:i.4M15
Н...з
0.014o4
: 1
0.34399
., :, 2
Hi з
0.01471S 0.016738
22 21
0.58455 0.19522
0.01H07
0.12797
ШШШШШ
0 СЧ'-'ЧЗ
"'¦ШИШИ
2:>
0.-10918
Н 4
С. 37347"
2 Г-
П.7'177Г.
шшшшшшш
-WW
ill : ¦
BBWfffWHH: '¦/.:.
0. > 711i
Hi 1
0 он" .ч
ЯИи ¦ 1 iii 1ж3г ТиТИИИИИ
!).-'.'. > Ы
С;.:.ЧУ77-,
0.22111
ill,
¦1 1 Cenfic
-: •¦. 117"7
ннякшшяняннв
Р.Л'л'пЧ
11Я(":.
¦1 :r;/; /V'.'
0.П47М1
0 S!i44
Фиг. 21
Характеристика
Общее количество (п) Пол
Кол-во женщин (%) Кол-во мужчин (%)
Возраст (лет) Среднее Диапазон Раса
Кол.-во белых (%) Кол.-во азиатов (%) Другая
Злокачествен ная опухоль толстой/тонк ой кишок
390
179(45.9} 211(54.1) О
64 31-90
283(72.6)
12(3.1) 95(24.3)
Злокачес твенная опухоль легкого
311
Злокачес Злокачествен Злокачес
твенная ная опУхоль твенная
ои кишок
толстой/тонк ОПУХОЛЬ
опухоль " шгулиль
I-l ТТ T."TTTTT(-1TJ-
124
55(43.5} 70(56.5} О
65 31-90
76(61.3}
1(0.8) 47(37.9)
печени
238
60 17-90
163(52.4} 83(34.9) 148(47.6) 155(65.1)
65 40-87
248(79.7) 152(63.9) 3(1.0) 61(25.6) 60(19.3) 25(10.5)
Злокачес твенная опухоль печени
24(34.3) 46(65.7} 0
58 17-81
39(55.7) 26(37.2) 5(7.1)
шшы
Злокачествен ная опухоль толстой/тонк ой кишок
161
52(32.3) 71(44.1) 38(23.6)
57 27-79
161(100) 0
Злокачественная Злокачественная
опухоль опухоль
толстой/тонкой толстой/тонкой
легкое
кишок кишок
метастазирует в метастазирует в
9(26.5) 25(73.5) О
59 32-81
34(100) 0
печень
12(36.4} 20(60.6) 1(3.0}
56 30-77
33(100)
Злокачес Злокачес твенная твенная опухоль опухоль легкого печени
57 37-83
14(29.8) 9(18.8) 31(65.9) 39(81.2) 2(4.3) 0
50 21-60
0 0 47(100) 48(100) 0 0
" о к к и
и К
И и
-40%
-60%
-80%
± \J\J /о
й -
Фиг. 23В
ог о." OS
<42tesaia4 ;метилирование
Фиг. 23С,
о,г §,4 о.в о." 1,о сдггюкм (Метилирование
^ Контроль ¦ Сконструированный ген
Контроль
Сконструированный ген
Фиг. 23D
Фиг. 23Е
150п
¦л*\ -.¦"
§ 100'
Контроль Сконструированный ген
о " н о
п о
50-
относительный
гыпой макс
злокачественная опухольаггЛ нормальное состояниекровь
злокачественная опухоль ami
относительный нормальное
сырой мин. сырой макс. состояние кровь
•та
.... злокачественная
относительный опухольаП
-jzss* нормальное
сырой мин. сырой макс. состояние_кровь
относительный злокачественная
W liSf "¦* опухоль all
сырой мин. сырой макс. злокачественная
опухоль ami
П=48; Значение PCA> 0
П=134; Значение РСА <0
Логарифмический ранговый критерий. р <0.0001
I I I I
О 500 1000 1500 2000
Общая выживаемость (дни)
1.0 -.
П=105; Значение РСАХ)
0.8 -
Е§ ра к
на н о о к н " о а
0.6 (tm)
0.4 -
0.2
П=31; Значение РСА <0
0.0
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001
500 1000 1500
Общая выживаемость (дни)
2000
1.0-
0.8*
та Я О Ck Я
0.6-
0.4"
a cg06747543
О cgl5536663
П cg22129276 ¦ cg07418387
0.2-
0.0-
gr су
Фиг. 30
Я О
Si-
Образцы FFPE Пул злокачественной опухоли толстой кишки
Нормальный геномный пул
40-
p б
го-
cg06747543
cg07418387
22129276
cgl5536663
cg14S1S3SS
Метилированный аллель С (тС)
10000 20000 30000 40000 50000 60000 70000 80000 Количество событий
Фиг. 31В
Неметилированный аллель С (С)
DOt
Ch2. Пол.: 10911 Отр.:75335
юг к" оо* сю?
008
10000 20000 30000 40000 50000 60000 70000 80000
Количество событий
8060-40" 20' 0"
2043089
2042981
ЕЗ 2004651
СП Пул норм. cfDNA ям Пул злокачественной опухоли толстой кишки
Норм, генетический пул
cgl0673833
30-I
10-1
<ь 1
ffl
50% -
о гм со гм
о гм
Пациенты со злокачественной опухолью толстой кишки
т о
Пациенты со злокачественной опухолью толстой кишки
Brb-3
cg08066035
норм_крс ВЯСА_соли,
IIOpM_K|
Brb-4
cg07665510
но рм_кро в ь_С F В11СА_солидная_г
норм_кровь_г.
Фиг. 34В
20%
Brb-8
cg06818532
0% Ш _ \ 30:
порм_кровъ_С F В RC A_co л идн ая_г
иорм_кровь_г.
Фиг. 34D
Brb-13
0% 5% I'Jr 1Ь : l\fz 2.5%
BRCA CF ^^^^^^^^^^^^^^И
норм_кровь_СК ВЯСА_солидная_г
норм_кровь_г.
cob-3 Злокачественная опухоль толстой
кишки метастазирует в легкое, FFPE
Фиг. 35В
Злокачественная опухоль толстой кишки метастазируег к па кое, FFPR
Сырые данные
Данные РСА
Данные ICA
Обучающая группа
Характеристика Всего (п) Пол, кол-во (%)
Женщина
Мужчина
Возраст при диагностике - лет Средний Диапазон Раса, кол-во (%) Белые Азиаты Другие
Курение, кол-во (%) Не курящие Бросившие на данный момент КУПИТЬ Курящие
Статус в отношении опухоли Без опухоли С опухолью
Жизненный статус, кол-во (%) Живые Мертвые
Стадия AICC, кол-во (%) Стадия I Стадия II Стадия III Стадия IV
Злокачествен Злокачественная Злокачествен Злокачествен опухоль ная опухоль ная опухоль
Группа проверки 1
Группа проверки 2
I Злокачественная
опухоль толстой кишки
Зл. опухоль толстой кишки мет-ет в печень
Злокачественная опухоль молочной железы
Зл. опухоль молочной железы мет-ет в печень
Злокачественная опухоль печени
Нормальная • печень
-* Значение РСАХ) . ATJD1A *\7Х1 IFF1A1 дикий тип
- Значение РСАХ) гШтл л\1М у l'l iU мутация
* Значение РСА <0, - Значение РСА <(> . ШИПА \\IMTFM\1 мутация
11=20
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001
-Р-1000 *~"т~~*
1S00
?000
Общая выживаемость (дни)
Фиг. 42В
- Значение РСАХ) В \Tl 'IP?.* РТС Hi дикий тип ***** Значение РСАХ) В\?1 ТГг* Р1СШ мутация
Значение> СА <() В KFI 1 г? * PIC HI дикий тип ~"'т Значение РСА <() . БЛ?1 ТГ- < ?ГС И: мутация
^- 1 ¦ *
"1 .
11 = 1/6
о.ь
n=25
п"81
11=35
Логарифмический ранговый критерий, р <0,0001
--г~
1000
?000
Общая выживаемость (дни)
Фиг. 43А
BRCA
ZNF667
C2QRF74
ZNF502
8 6 4
2 о
1PIJ
Рг-105:
NSD2
PUS3
BNIP >
:: :i
2 0
CRHR2
NPBWR1
ЕР НА 5
8 6
А ^
Pe-0.S1 &7
Р*-0,61О8
0.0 П.? 0.4 0.6 П.в 1.0 0.0 0./ 0.4 06 О.Я 1.00.0 IX? 0.4 0.6 0.8 1.0
Фиг. 43В
У НС
NPHP4
РРДР2С
(N О
h-1
X и
1-н
U U
4 2
2 0
4 2 0
Ре=10-
CYGB
Ре=0.91"М
ENTPD3
Ре=0,"687
SGFB7
PW=0LL421
SHISA3
Ре=0,6334
Р BNIP3
Р" =0.2 751
ANK1
Й.0 Г,. J 0.4 ft.fi П.8 1.0 0.0 I).? О.г 0.6 0.В 1.0 0.0 0.? 0.3 0.6 O.fi 1.0
Характеристика
Всего (п) Пол
Женшина. кол-во (%) Мужчина, кол-во (%)
Возраст (лет) Средний
Диапазон Раса, кол-во (%) Белые, кол-во (%) Азиаты, кол-во (%)
Другие
Характеристика
Всего (п) Пол
Женщина, кол-во (%) Мужчина, кол-во (%)
Возраст (лет) Средний
Диапазон Раса, кол-во (%) Белые, кол-во (%) Азиаты, кол-во (%)
Злокачеств енная опухоль
толстой и тонкой кишок
124
55(43.5) 70(56.5) 0
31-90
75(61.3) 1(0.8)
47(37.9)
Злокачеств енная опухоль
толстой и тонкой кишок
390
379(45.9) 211(54.1)
64 31-90
283(72.6)
12(3.1)
Нормальное
состояние состояние легкого печени
венная опухоль
венная опухоль печени
Злокачест Злокачест состояние Нормальное Нормальное
толстой и тонкой кишок
27(36.5) 47(63.5) 0
59 23-80
10(58.8) 7(41.7)
21(34.3} 46(65.7} 0
58 1/-81
39(55.7} 76(37.2}
5(7.1)
13(56.5) 10(43.5) О
64 45-80
20(87.0) 0
3(13.0)
6(50.0) 6(50.0)
60 45-74
11(91.7) 0
1(8.3)
легкого
199
108(51.3) 91(45.7}
65 33-86
152(76.4) 0
47(23.6}
Нормальное
состояние состояние легкого печени
венная опухоль легкого
венная опухоль печени
Злокачест Злокачест состояние Нормальное Нормальное
71(46.7) 24(53.3) 0
63 33-74
40(88.9) 1(2.2}
39(52.7) 35(47.3} О
59 23-80
58(78.4) 0
738
83(34.9) 155(65.1) О
60 17-90
152(63.9) 61(25.6)
18(36.0}
32(64.0) О
65 45-82
32(64.0) 17(34.0)
толстой и тонкой кишок
163(52.4) 148(47.6) О
65 40-87
748(79.7) 3(1.0)
Другие
95(24.3)
60(19.3)
25(10.5)
4(8.9}
16(21.6)
1(2.0}
Характеристика
Всего (п) Пол
Женщина, кол-во
Мужчина, кол-во <"">
Возраст (лет) Средний
Диапазон
Раса, кол-во (%)
Белые, кол-во (%) Азиаты, кол-во
Злокачес твенная опухоль толстой и тонкой кишок
161
52(32.3) 71(44.1) 38(23.6)
57 27-/9
161(100)
ТОЛСТОЙ И ТОЛСТОЙ и
тонкой тонкой
кишок кишок
мет-ет в мет-ет в
печень легкое
Зл. Зл. Злокачес Злокачес Нормаль Нормаль Нормаль
состояни состояни е легкого е печени
опухоль опухоль состояни легкого печени етолстой и тонкой кишок
опухоль опухоль ТВенная твенная ное ное ?ое
14(30.4) 30(65.2) 2(4.4)
3/-83
9(26.5) 25(73.5} 0
32-81
19(26.0} 53(72.6} 1(1.4)
59 23-80
14(29.8} 31(65.9} 2(4.3)
57 37-83
9(18.8}
39(81.2) О
50 21-60
12(36.4) 20(60.6) 1(3.0)
56 30-/7
гппггти и тпгкгти и "Лт,""...,
164
54(32.9) 72(43.9} 38(23.2)
О 0 46(100) 73(100)
27-79
33(100) 34(100) 47(100) 48(100) 164(100)
Другие
Метилирование ДНК
40.00%
20.00%
0.00% у///
'//, cob-2 " cob-9
Сайт CpG 1
Сайт CpG 2
ш cob-2 ¦ cob-9
100.00%
Профиль метилирования злокачественной опухоли толстой кишки на разных стадиях злокачественной опухоли
1Я О t
с злю о о "еда
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
0.2 3 4 0.6 0.8 1 0
Ф о
ffl с" ея о со
**> WET*
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
С о
0 5
1 о
т -
л п
га о со
• опипн
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
С о
0.4
¦ 1 Об
0.8
1 0
Ct _
" Т
С ь
мовшз
> -it;
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
ON ON
О '0(r)(r)в"ИШ1
-ЖНИ"!
¦¦МИНСК!
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови
Злокачественная опухоль поджелудочной железы "О
" ON
Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
Г "
0.2
0 6
0.8
02 04 Со 0 b 13
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
наш
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
0.2
С 6
0.8
1.0
Г 1
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
О С 0.2 0 4 0 5 0 8 1.0
т й
ч -
о J о сяво в'
имшни> -
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
о -
1 0
сч " о
¦¦¦И
Злокачественная опухоль мочевого пузыря Злокачественная опухоль молочной железы Злокачественная опухоль шейки матки Холангиогенная злокачественная опухоль Злокачественная опухоль толстой кишки Злокачественная опухоль пищевода Злокачественная опухоль головы и шеи Злокачественная опухоль почки Злокачественная опухоль печени Злокачественная опухоль легкого Нормальное состояние крови Злокачественная опухоль поджелудочной железы Феохромоцитома и параганглиома Злокачественная опухоль предстательной железы Злокачественная опухоль прямой кишки Саркома Меланома кожи
Злокачественная опухоль желудка Злокачественная опухоль щитовидной железы
. Г I 1
СО D.2 0 4 0 6 0 8 10
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухольпечени злокачественная опухоль легкого нормальное состояниекрови
cg20468939 cg24790419 cg21122474
eg 12967050 eg16927606 cgl5139596 eg16911563 cg26836479 cg271419!5 cg24feo457 cg266830Q5 cg21913888 eg12504877 cg26680502 cg27377213 eg12042264 cgt1779113 cg06064964 cg09844573 eg17122157
¦Т - u I11"1" ¦-. TTS 'гшашштшт
~~i 1 1 1 1 г~
0.D 0.2 0.4 0.6 0.8 1 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли_1;[, критерий]
злокачественная опухольмолочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
злокачественная опухоль печени
- злокачественная опухоль легкого
нормальное состояние крови
eg03297901 eg27410601 egQ6153925 eg 17864646 cg07058968 eg 18456621 eg 11252953 C02549G14S cgO94190D5 cgfM§"553 cg20e9S297 eg17518965 cg2712S093 4157978.34 cg25982880 eg18901104 eg 13911392 cg17126555 cg24706505 cg03087897
-1 1 1
0.D 0.2 0.4 0 6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли_1;[, критерий]
злокачественная опухоль молочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
злокачественная опухоль печени - злокачественная опухоль легкого
нормальное состояниекрови
cg00558804 cg07644807 ogOD206490 cg07860918
cg23B7B564 cg041479Q6
cg07137244
cg22589778
cgOl722297 8
cgQ02%3248 cg26112797 eg10530767 cg01405343 eg18942579 cg02782634 cg27023597 cgl5759721 cg27219182 eg12900649 Ci06853339 -
¦hp
из; э
О .51.".
о, '-ЪМВШ
Pi ж з
ХТТТГГ
Щ..В
~~1 1 1 1 1
0.0 0.2 0.4 06 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли_t[, критерий]
1.0
злокачественная опухоль молочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
--- злокачественная опухоль печени -- злокачественная опухоль_легкого
нормальное состояниекрови
-г 1 1 1 1
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли tj, критерий!
~~г
1.0
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухоль легкого нормальное состояниекрови
cg07119472 cg14556909 cg08075204 eg16509569 cg21376733 eg16402452 eg 18215449 cg24165921
cg14642045
cg25fe4028 cg25922751 cg02053964 cg24480810 eg10732611 eg18842353 eg 19300307 eg1B158359 eg14058476 cg053987D0 cg03758697
..a ass
шш -г NN
-\ 1 1 1 1 Г~
0.0 0.2 0 4 0 6 0.8 1 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли_t[, критерий]
злокачественная опухоль молочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
злокачественная опухоль печени
- злокачественная опухоль_легкого
нормальное состояние крови
cg14088196 cg25574765 cg16061668 cg07332S80 cg04514998 cg23764123 cg01657186 cg23147227 cg21249754
JL*
cg19693177 cg11655490 cg02522196 cg03569637 cg05596756 cgQQ03768t cg10590292 cg12353452 cg18610205 cg06380123
тот
arc •? сг шшявша
аодя
"""Сг;е
:0 ' ЯЗЯШН
" 1 ог-л
йшвяз*
¦Кг'
~1 1 1 1 1
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли_t[, критерий]
1.0
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухоль_легкого нормальное состояниекрови
cg272S4288 cg07380416
cg09902130 cg09t53C№0 cg20136100 eg13396086 cg24301930 cg07420137 eg13924996 едиИбЭ62 cg20826709 cgO022O455 cg16260696 cgO08624O8 cgl1791526 eg 15698795 cg10542975 cg02874908 cg09399878 eg14999168
-о.
о т
- л. л
ОЙ5'
_ т
ID".
toe.
.т -
("ЛГГв
0:У- О.
, шеиазд
Л "ЯП
шч1§
гаг: п
¦ГО";
¦с-;
твт-
юга
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухоль_легкого нормальное состояниекрови
cg22552736 cgl3555415 cg134G?086
cg05 &314S7 cg27J88 &62 ср-Ж.84112 cg04441857 €300025044 cg05979232 cgO0 &7272 cgQ4838360 CQ23130731 tg0433C?S4 €324:47537 fg20411756 cg2522507G cg04314978 cgO0242C35 сдЮ51 1890 сдШ12307
-Г г_
; з о. осты***
Аса
ог.-.хя
г 1
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная он> холь_10лсюй кишки злокачественная оп> холь печени злокачественная он> холь легкого нормальное состоянискрови
Щ2 5с 52701 cg241C7852 С305177С60 eg17984956 cgl9421564 сд2!03П2? cg19C21 &65 cg23554164
cg10351264
c.g0321S479 cg267657oo
cgl273?392
щ> штк-
СgO0O15530 cg1 &252 &5Ђ cg14-=33252 cgl 3464240 cg13y2!432 сд16191С87
133
_1 1 Г
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухольлегкого нормальное состояниекрови
soots.
ттш
хяиш
1шшшшшштм
шшк.
- fflt
¦ Я9
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухоль_толстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухоль легкого нормальное состояниекрови
cgO4S59102 eg16113326 cg13597C51 cgC <0899907 cg03891C50 cg064824S8 сдЮ001226 cg07417146
cg03431741
cg20 &7580 cg20046343 cg26401541 cg23429794 cg14564351 cg01209642 cgl2359001 eg16622899 cg25432518 og36811313 од12098228
1Ш1
mm "йЙГ^
WOW
a^-V; ах спя
rt*Tf
¦В"
злокачественная опухоль молочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
злокачественная опухоль печени
злокачественная опухоль легкого
нормальное состояниекрови
опт
ЯСС
злокачественная опухоль молочной железы
злокачественная опухоль_толстой кишки
злокачественная опухоль печени ~~ злокачественная опухоль_легкого нормальное состояниекрови
cg05552666 C32468691S cgOS132573 cgt'5656900 cgOk"> 046G1 cg2362476I cg142472S7 cg02233149 С81534ШЗЗ cgcafecl !6 cg2740540G cg13S21C0? сд> ЖШО cg25451702 cgOt.Ђ2544S cg27366260 cg08u52292 cgC'7!8tC32 cg225 B455 eg19962664
С s
-ааи
wear г.
4J ''ЙиЙ
"15: Si
S3*
1,9
злокачественная опухоль молочной железы злокачественная опухольтолстой кишки злокачественная опухоль печени злокачественная опухольлегкого нормальное состояниекрови
eg26017330 eg 10055231 og07589991 eg19704755 cg23013029 og24742520 cg21004490 cg23229016 eg18856478 сд2бЙ5985 cg23612220 •eg01 §03374 cg235a9035 cg20685713 og26394065 cg25765104 cg214619B1 eg19675731 eg 16266.227 cgl8334097
meter.
"аояю
шшв.
-EST*
------
шШЬ
н 1 1 1 г~
1.0
109
112
112
175
176
178
178
186
186
187
187
188
188
188
188
189
189
190
190
195
194
197
197
202
202
202
202
208
208
209
209
218
218
218
218
218
218
219
219
220
220
225
225
226
226
415
415
<210> 15
<210> 15
<210> 18 <211> 118
<210> 18 <211> 118
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(91)..(96)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(91)..(96)
<400> 60
<400> 60
<210> 79
<210> 79
<210> 82 <211> 118
<210> 82 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(93)..(98)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(93)..(98)
<400> 124
<400> 124
<400> 124
<210> 143
<210> 143
<210> 146 <211> 118
<210> 146 <211> 118
<210> 146 <211> 118
<210> 146 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<400> 188
<400> 188
<400> 188
<210> 207
<210> 207
<210> 210 <211> 118
<210> 210 <211> 118
<210> 210 <211> 118
<210> 210 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 252
<400> 252
<400> 252
<210> 271
<210> 271
<210> 274 <211> 118
<210> 274 <211> 118
<210> 274 <211> 118
<210> 274 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 316
<400> 316
<400> 316
<210> 335
<210> 335
<210> 338 <211> 118
<210> 338 <211> 118
<210> 338 <211> 118
<210> 338 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 380
<400> 380
<400> 380
<210> 399
<210> 399
<210> 402 <211> 118
<210> 402 <211> 118
<210> 402 <211> 118
<210> 402 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 444
<400> 444
<400> 444
<210> 463
<210> 463
<210> 466 <211> 118
<210> 466 <211> 118
<210> 466 <211> 118
<210> 466 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(81)..(86)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(81)..(86)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 508
<400> 508
<400> 508
<210> 527
<210> 527
<210> 530 <211> 118
<210> 530 <211> 118
<210> 530 <211> 118
<210> 530 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 572
<400> 572
<400> 572
<210> 591
<210> 591
<210> 594 <211> 118
<210> 594 <211> 118
<210> 594 <211> 118
<210> 594 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 636
<400> 636
<400> 636
<210> 655
<210> 655
<210> 658 <211> 118
<210> 658 <211> 118
<210> 658 <211> 118
<210> 658 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(88)..(93)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 700
<400> 700
<400> 700
<210> 719
<210> 719
<210> 722 <211> 118
<210> 722 <211> 118
<210> 722 <211> 118
<210> 722 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(94)..(99)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 764
<400> 764
<400> 764
<210> 783
<210> 783
<210> 786 <211> 118
<210> 786 <211> 118
<210> 786 <211> 118
<210> 786 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 828
<400> 828
<400> 828
<210> 847
<210> 847
<210> 850 <211> 118
<210> 850 <211> 118
<210> 850 <211> 118
<210> 850 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(94)..(99)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 892
<400> 892
<400> 892
<210> 911
<210> 911
<210> 914 <211> 118
<210> 914 <211> 118
<210> 914 <211> 118
<210> 914 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 956
<400> 956
<400> 956
<210> 975
<210> 975
<210> 978 <211> 118
<210> 978 <211> 118
<210> 978 <211> 118
<210> 978 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (88)..(93)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1020
<400> 1020
<400> 1020
<210> 1039
<210> 1039
<210> 1042 <211> 118
<210> 1042 <211> 118
<210> 1042 <211> 118
<210> 1042 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(91)..(96)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1084
<400> 1084
<400> 1084
<210> 1103
<210> 1103
<210> 1106 <211> 118
<210> 1106 <211> 118
<210> 1106 <211> 118
<210> 1106 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (97)..(102)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(89)..(94)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1148
<400> 1148
<400> 1148
<210> 1167
<210> 1167
<210> 1170 <211> 118
<210> 1170 <211> 118
<210> 1170 <211> 118
<210> 1170 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1212
<400> 1212
<400> 1212
<210> 1231
<210> 1231
<210> 1234 <211> 118
<210> 1234 <211> 118
<210> 1234 <211> 118
<210> 1234 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(92)..(97)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1276
<400> 1276
<400> 1276
<210> 1295
<210> 1295
<210> 1298 <211> 118
<210> 1298 <211> 118
<210> 1298 <211> 118
<210> 1298 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (95)..(100)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1340
<400> 1340
<400> 1340
<210> 1359
<210> 1359
<210> 1362 <211> 118
<210> 1362 <211> 118
<210> 1362 <211> 118
<210> 1362 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (90)..(95)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(93)..(98)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(93)..(98)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1404
<400> 1404
<400> 1404
<210> 1423
<210> 1423
<210> 1426 <211> 118
<210> 1426 <211> 118
<210> 1426 <211> 118
<210> 1426 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (94)..(99)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1468
<400> 1468
<400> 1468
<210> 1487
<210> 1487
<210> 1490 <211> 118
<210> 1490 <211> 118
<210> 1490 <211> 118
<210> 1490 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (91)..(96)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(89)..(94)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(89)..(94)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1532
<400> 1532
<400> 1532
<210> 1551
<210> 1551
<210> 1554 <211> 118
<210> 1554 <211> 118
<210> 1554 <211> 118
<210> 1554 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (87)..(92)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(84)..(89)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(84)..(89)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1596
<400> 1596
<400> 1596
<210> 1615
<210> 1615
<210> 1618 <211> 118
<210> 1618 <211> 118
<210> 1618 <211> 118
<210> 1618 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(86)..(91)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1660
<400> 1660
<400> 1660
<210> 1679
<210> 1679
<210> 1682 <211> 118
<210> 1682 <211> 118
<210> 1682 <211> 118
<210> 1682 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<222> (96)..(101)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(85)..(90)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
modified_base
(85)..(90)
<223> a, c, t, g, unknown or other
<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 1724
<400> 1724
<400> 1724
<210> 1743
<210> 1743
<210> 1746 <211> 118
<210> 1746 <211> 118
<210> 1746 <211> 118
<210> 1746 <211> 118
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
polynucleotide
polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polynucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1776
gacgagctga tctccatcct ca
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1776
gacgagctga tctccatcct ca
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1781
acggagttct ctggctgctt ca
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1781
acggagttct ctggctgctt ca
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1786
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1786
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1791
tggacatcca gaagttagtc acc
<400> 1791
tggacatcca gaagttagtc acc
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<400> 1796
gccactacct gtgcaacgcc t
<400> 1796
gccactacct gtgcaacgcc t
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
primer
primer
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic primer
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<210> 1826 <211> 22
<210> 1826 <211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<210> 1831
<210> 1831
<210> 1835
<210> 1835
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<400> 1842
agtatnggga gaaggt
<400> 1842
agtatnggga gaaggt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1846
atatttgttt ggtttgattt agg
<400> 1846
atatttgttt ggtttgattt agg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<210> 1867
<210> 1867
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
modified_base (3)..(3)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
modified_base (3)..(3)
<223> Inosine
<223> Inosine
<400> 1879
gcngaaactt aaccac
<400> 1879
gcngaaactt aaccac
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1889
agttggttgn gtaggagg
<400> 1889
agttggttgn gtaggagg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<222> (16)..(16)
<223> Inosine
<400> 1896
attttaattn ggcgattttt tngaag
<400> 1896
attttaattn ggcgattttt tngaag
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1904
tgtgaaattt tcgtttgtat aatttttgg
<400> 1904
tgtgaaattt tcgtttgtat aatttttgg
<400> 1908
gnggtgatac gggtttttta g
<400> 1908
gnggtgatac gggtttttta g
<210> 1913
<211> 25
<210> 1913
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1934
<400> 1934
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1938
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1938
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1943
aaaaaattaa acaaacacct ctac
<400> 1943
aaaaaattaa acaaacacct ctac
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1948
agttaggttc ggtttttttt aggg
<400> 1948
agttaggttc ggtttttttt aggg
<210> 1953
<210> 1953
<210> 1957
<210> 1957
<210> 1957
<210> 1957
<400> 1961
ttagtttttt attgaggtag gtagga
<400> 1961
ttagtttttt attgaggtag gtagga
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1973
tttnggtttt ttggggttat tagg
<400> 1973
tttnggtttt ttggggttat tagg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1978
ttagatttgt tttgaaagta gaa
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1978
ttagatttgt tttgaaagta gaa
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1986
tagtagtagt aggaggaggt ag
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 1986
tagtagtagt aggaggaggt ag
<400> 1990
ggngtttggg attgg
<400> 1990
ggngtttggg attgg
<210> 1994 <211> 17
<210> 1994 <211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<210> 1998 <211> 21
<210> 1998 <211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<210> 2003
<210> 2003
<400> 2007
attatacaat aacaacccaa aattactc
<400> 2007
attatacaat aacaacccaa aattactc
<400> 2011
aaaaaccaaa aataactcca aacatt
<400> 2011
aaaaaccaaa aataactcca aacatt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2016
gggtgatttt tcgaatttgt g
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2016
gggtgatttt tcgaatttgt g
<400> 2021
atttaggtat tttgatttta agaggatt
<400> 2021
atttaggtat tttgatttta agaggatt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2026
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2026
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<400> 2034
<400> 2034
<400> 2039
attaactacg ccacctactc
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2039
attaactacg ccacctactc
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2039
attaactacg ccacctactc
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2048
ggaggtttta gaacgtttta gaattg
<400> 2048
ggaggtttta gaacgtttta gaattg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2075
cctcacatct tatttatcat atctac
<400> 2075
cctcacatct tatttatcat atctac
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
modified_base (2)..(2)
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
modified_base (2)..(2)
<223> Inosine
<223> Inosine
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2094
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2094
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2098
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2098
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
<400> 2105
tngttttttt gttttttngg gt
<400> 2105
tngttttttt gttttttngg gt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2109
tggtgagtgt tgtgatttgg
<400> 2109
tggtgagtgt tgtgatttgg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2120
ttngggattc gtnggtt
<400> 2120
ttngggattc gtnggtt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<400> 2128
gaaaaagtta gcgtnggaag t
<400> 2128
gaaaaagtta gcgtnggaag t
<400> 2132
tggnggtgcg tttttg
<400> 2132
tggnggtgcg tttttg
<400> 2136
atagagaaga tcgggtttag tagg
<400> 2136
atagagaaga tcgggtttag tagg
<400> 2140
tgtttttttt tattcgtngt tatttatgg
<400> 2140
tgtttttttt tattcgtngt tatttatgg
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2158
ggtggttatg gggttt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2158
ggtggttatg gggttt
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2169
ggggtttttg ttagngaaga t
<400> 2169
ggggtttttg ttagngaaga t
<400> 2172
<400> 2172
modified_base (7)..(7)
modified_base (7)..(7)
<223> Inosine
<223> Inosine
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2185
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2185
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2185
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2185
<400> 2188
tggtanggcg tngttag
<400> 2188
tggtanggcg tngttag
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2203
<210> 2203
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2206
gggaaaaata ggatttttga t
<400> 2206
gggaaaaata ggatttttga t
<210> 2210 <211> 17
<210> 2210 <211> 17
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<400> 2213
gtggataggt tgttgtngtt t
<400> 2213
gtggataggt tgttgtngtt t
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2218
tttaggatgg gtttgaaata g
<400> 2218
tttaggatgg gtttgaaata g
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2228
tangtttatt tttcgtgttt atngg
<400> 2228
tangtttatt tttcgtgttt atngg
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<210> 2240 <211> 23
<210> 2240 <211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<210> 2244 <211> 27
<210> 2244 <211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<210> 2249
<210> 2249
<400> 2253
tttggttatt ttaattatgt agaaatgaat tt
<400> 2253
tttggttatt ttaattatgt agaaatgaat tt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<221> modified_base
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<222> (7)..(7)
<223> Inosine
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2266
tttgggagta gtttattagg taa
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2266
tttgggagta gtttattagg taa
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2287
tcaacaacng ctaaacatc
<400> 2287
tcaacaacng ctaaacatc
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2294
ggagggtagg gttttt
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2294
ggagggtagg gttttt
<220>
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
<400> 2311
gaaangaacc ctaaaaaac
<400> 2311
gaaangaacc ctaaaaaac
<400> 2314
<400> 2314
<213> Artificial Sequence
<213> Artificial Sequence
Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<400> 2322
gatgttaata tgcaaggagc t
<400> 2322
gatgttaata tgcaaggagc t
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<220> <220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic
oligonucleotide
oligonucleotide
416
416
1/96
101
Фиг. 1А
1/96
101
Фиг. 1А
1/96
101
Фиг. 1А
1/96
101
Фиг. 1А
1/96
101
Фиг. 1А
1/96
101
Фиг. 1А
2/96
111
Фиг. IB
2/96
111
Фиг. IB
2/96
111
Фиг. IB
2/96
111
Фиг. IB
2/96
111
Фиг. IB
2/96
111
Фиг. IB
7/96
Фиг. 6
7/96
Фиг. 6
8/96
Фиг. 7
8/96
Фиг. 7
8/96
Фиг. 7
8/96
Фиг. 7
8/96
Фиг. 7
8/96
Фиг. 7
Фиг. 8
Фиг. 8
Фиг. 8
Фиг. 8
Фиг. 8
Фиг. 8
10/96
Фиг. 9А
10/96
Фиг. 9А
11/96
Фиг. 9С
11/96
Фиг. 9С
Фиг. НА
Фиг. НА
Фиг. НА
Фиг. НА
15/96
Фиг. 11В
15/96
Фиг. 11В
Фиг. НС
Фиг. НС
Фиг. НС
Фиг. НС
Фиг. 11D
Фиг. 11D
Фиг. 13А
Фиг. 13А
Фиг. 13В
Фиг. 13В
Фиг 13С
Фиг 13С
22/96
Фиг. 14
22/96
Фиг. 14
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
Фиг. 154
25/96
Фиг. 16
25/96
Фиг. 16
26/96
Фиг. 17
26/96
Фиг. 17
27/96
Фиг. 18
27/96
Фиг. 18
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
28/96
29/96
29/96
29/96
29/96
29/96
29/96
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
30/96
Фиг. 20А
31/96
Фиг. 20С
31/96
Фиг. 20С
31/96
Фиг. 20С
31/96
Фиг. 20С
32/96
Фиг. 20D
32/96
Фиг. 20D
33/96
Фиг. 20Е
33/96
Фиг. 20Е
34/96
Фиг. 20F
34/96
Фиг. 20F
36/96
Фиг. 22
36/96
Фиг. 22
36/96
Фиг. 22
36/96
Фиг. 22
36/96
Фиг. 22
36/96
Фиг. 22
37/96
Фиг. 23А
37/96
Фиг. 23А
37/96
Фиг. 23А
37/96
Фиг. 23А
38/96
38/96
38/96
38/96
38/96
38/96
38/96
38/96
39/96
Фиг. 24
39/96
Фиг. 24
40/96
Фиг. 25
40/96
Фиг. 25
41/96
Фиг. 26
41/96
Фиг. 26
42/96
Фиг. 27
42/96
Фиг. 27
43/96
Фиг. 28А
43/96
Фиг. 28А
43/96
Фиг. 28А
43/96
Фиг. 28А
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
44/96
Фиг. 28В
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
Фиг. 29
47/96
Фиг. 31A
47/96
Фиг. 31A
48/96
100-
Фиг. 31С
48/96
100-
Фиг. 31С
49/96
Фиг. 32А
49/96
Фиг. 32А
49/96
Фиг. 32А
49/96
Фиг. 32А
50/96
Фиг. 32В
50/96
Фиг. 32В
51/96
Фиг. 32С
51/96
Фиг. 32С
51/96
Фиг. 32С
51/96
Фиг. 32С
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
52/96
Фиг. ЗЗА
53/96
Фиг. 33В
53/96
Фиг. 33В
53/96
Фиг. 33В
53/96
Фиг. 33В
53/96
Фиг. 33В
53/96
Фиг. 33В
54/96
Фиг. 34А
54/96
Фиг. 34А
55/96
Фиг. 34С
55/96
Фиг. 34С
Фиг. 35А
Фиг. 35А
Фиг. 35А
Фиг. 35А
57/96
Фиг. 36
57/96
Фиг. 36
58/96
Фиг. 37
58/96
Фиг. 37
59/96
Фиг. 38
59/96
Фиг. 38
60/96
Фиг. 39
60/96
Фиг. 39
61/96
Фиг. 40
61/96
Фиг. 40
62/96
Фиг. 41
62/96
Фиг. 41
62/96
Фиг. 41
62/96
Фиг. 41
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
63/96
Фиг. 42А
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
64/96
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
65/96
65/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
66/96
66/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
66/96
66/96
Метилирование ДНК
Метилирование ДНК
67/96
Фиг. 44А
67/96
Фиг. 44А
68/96
Фиг. 44В
68/96
Фиг. 44В
69/96
69/96
70/96
Фиг. 46
70/96
Фиг. 46
70/96
Фиг. 46
70/96
Фиг. 46
70/96
Фиг. 46
70/96
Фиг. 46
71/96
Фиг. 47
71/96
Фиг. 47
71/96
Фиг. 47
71/96
Фиг. 47
72/96
Фиг. 48
72/96
Фиг. 48
Фиг. 49 А
Фиг. 49 А
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49 А
Фиг. 49 А
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
"5 -
Фиг. 49В
"5 -
Фиг. 49В
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
"5 -
Фиг. 49В
"5 -
Фиг. 49В
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49С
Фиг. 49С
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49С
Фиг. 49С
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49D
Фиг. 49D
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49Е
Фиг. 49Е
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49Е
Фиг. 49Е
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49F
Фиг. 49F
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49G
Фиг. 49G
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49G
Фиг. 49G
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49Н
Фиг. 49Н
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 491
Фиг. 491
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 491
Фиг. 491
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Фиг. 49.Т
Фиг. 49.Т
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли
83/96
Фиг. 50А
83/96
Фиг. 50А
84/96
Фиг. 50В
84/96
Фиг. 50В
84/96
Фиг. 50В
84/96
Фиг. 50В
84/96
Фиг. 50В
84/96
Фиг. 50В
85/96
Фиг. 50С
85/96
Фиг. 50С
85/96
Фиг. 50С
85/96
Фиг. 50С
86/96
Фиг. 50D
86/96
Фиг. 50D
87/96
Фиг. 50E
87/96
Фиг. 50E
88/96
Фиг. 50F
88/96
Фиг. 50F
88/96
Фиг. 50F
88/96
Фиг. 50F
89/96
Фиг. 50G
89/96
Фиг. 50G
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
90/96
Фиг. 50Н
90/96
Фиг. 50Н
0,0 : _. 04 Об 08 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0,0 : _. 04 Об 08 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
90/96
Фиг. 50Н
90/96
Фиг. 50Н
0,0 : _. 04 Об 08 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0,0 : _. 04 Об 08 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
91/96
Фиг. 501
91/96
Фиг. 501
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
91/96
Фиг. 501
91/96
Фиг. 501
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
91/96
Фиг. 501
91/96
Фиг. 501
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
С 0 02 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
92/96
Фиг. 50J
92/96
Фиг. 50J
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
92/96
Фиг. 50J
92/96
Фиг. 50J
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
92/96
Фиг. 50J
92/96
Фиг. 50J
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
00 0.2 0.4 Об 08
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
93/96
Фиг. 50К
93/96
Фиг. 50К
Q.0 0.2 0.4 0 6 0.8 1 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
Q.0 0.2 0.4 0 6 0.8 1 0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
94/96
Фиг. 50L
94/96
Фиг. 50L
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
95/96
Фиг. 50М
95/96
Фиг. 50М
СО 0,2 0.4 0 6 СЗ
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
СО 0,2 0.4 0 6 СЗ
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
96/96
Фиг. 50N
96/96
Фиг. 50N
0.0 0.2 04 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0.0 0.2 04 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
96/96
Фиг. 50N
96/96
Фиг. 50N
0.0 0.2 04 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]
0.0 0.2 04 0.6 0.8
Метилирование для различных форм злокачественной опухоли t[, критерий]