EA201791005A1 20170929 Номер и дата охранного документа [PDF] EAPO2017\PDF/201791005 Полный текст описания [**] EA201791005 20151106 Регистрационный номер и дата заявки US62/077,105 20141107 Регистрационные номера и даты приоритетных заявок US2015/059532 Номер международной заявки (PCT) WO2016/073890 20160512 Номер публикации международной заявки (PCT) EAA1 Код вида документа [PDF] eaa21709 Номер бюллетеня [**] УЛУЧШЕННЫЕ АНТИТЕЛА ПРОТИВ IL-6 Название документа [8] C07K 16/24, [8] A61P 27/02, [8] A61K 39/00 Индексы МПК [US] Шмидт Майкл Марч, [US] Тисдэйл Элисон, [US] Ферфайн Эрик Стивен, [US] Зарбис-Папастойтсис Григориос Сведения об авторах [US] ИЛЭВЭН БАЙОТЕРАПЬЮТИКС, ИНК. Сведения о заявителях
 

Патентная документация ЕАПВ

 
Запрос:  ea201791005a*\id

больше ...

Термины запроса в документе

Реферат

[RU]

Предлагаются улучшенные антитела против IL-6. Описываются применения этих антител при лечении заболеваний, связанных с IL-6, например глазных заболеваний, таких как диабетический макулярный отек.


Полный текст патента

(57) Реферат / Формула:

Предлагаются улучшенные антитела против IL-6. Описываются применения этих антител при лечении заболеваний, связанных с IL-6, например глазных заболеваний, таких как диабетический макулярный отек.


Евразийское (21) 201791005 (13) A1
патентное
ведомство
(12) ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ К ЕВРАЗИЙСКОЙ ЗАЯВКЕ
(43) Дата публикации заявки 2017.09.29
(22) Дата подачи заявки 2015.11.06
(51) Int. Cl.
C07K16/24 (2006.01) A61P27/02 (2006.01) A61K39/00 (2006.01)
(54) УЛУЧШЕННЫЕ АНТИТЕЛА ПРОТИВ IL-6
(31) 62/077,105; 62/087,448; 62/247,705
(32) 2014.11.07; 2014.12.04; 2015.10.28
(33) US
(86) PCT/US2015/059532
(87) WO 2016/073890 2016.05.12
(71) Заявитель:
ИЛЭВЭН БАЙОТЕРАПЬЮТИКС, ИНК. (US)
(72) Изобретатель:
Шмидт Майкл Марч, Тисдэйл Элисон, Ферфайн Эрик Стивен, Зарбис-Папастойтсис Григориос (US)
(74) Представитель:
Медведев В.Н. (RU)
(57) Предлагаются улучшенные антитела против IL-6. Описываются применения этих антител при лечении заболеваний, связанных с IL-6, например глазных заболеваний, таких как диабетический ма-кулярный отек.
ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
2420-542161ЕА/026
УЛУЧШЕННЫЕ АНТИТЕЛА ПРОТИВ IL-6 Родственные заявки
Настоящая заявка испрашивает приоритет Временной заявки на патент США № 62/077105, поданной 7 ноября 2014 года; Временной заявки на патент США № 62/087448, поданной 4 декабря 2014 года; и Временной заявки на патент США № 62/247705, поданной 28 октября 2015 года. Полное содержание каждой из этих заявок включается в настоящий документ в качестве ссылки.
Область техники, к которой относится изобретение
Область настоящего изобретения относится к IL-б. Более конкретно, эта область относится к модуляторам IL-б и к их применениям при лечении заболеваний, таких как заболевания глаз.
Уровень техники
IL-б представляет собой плейотропный цитокин с известной ролью при воспалении, гематопоэзе, ангиогенезе, дифференциации клеток и выживаемости нейронов. Настоящее изобретение относится к улучшенным антителам против IL-б и к их применениям.
Сущность изобретения
Настоящее изобретение относится к антителам против IL-б и к
их фрагментам (например, антигенсвязывающим фрагментам) или к их
производным, а также к нуклеиновым кислотам, кодирующим антитела
против IL-б и их фрагменты. Настоящее изобретение также
относится к применениям таких антител, фрагментов или
производных. Антитела и их фрагменты или производные могут
использоваться, например, при лечении заболевания,
ассоциированного с IL-б. В некоторых вариантах осуществления, антитело, его фрагмент или производное может связываться (например, специфично связываться) с IL-б, например, с IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, антитело, его фрагмент или производное может связываться (например, специфично связываться) с сайтом II IL-б (например, с сайтом II IL-б человека).
В одном из аспектов в настоящем документе предлагается выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
(i) CDR1 VH, содержащую последовательность GYXiLX2NYLIE (SEQ
ID N0:45),
(ii) CDR2 VH, содержащую последовательность VX3TPGX4GTIN (SEQ ID NO:46), и
(iii) CDR3 VH,
где верным является одно или несколько из следующих утверждений (например, 1, 2, 3 или все они) : Xi не представляет собой А, Х2 не представляет собой S, Х3 не представляет собой I и Х4 не представляет собой S. В некоторых вариантах осуществления, Xi не представляет собой А, Х2 не представляет собой S, Х3 не представляет собой I и Х4 не представляет собой S.
В некоторых вариантах осуществления, Х± представляет собой V или консервативное замещение для V. В некоторых вариантах осуществления, Х2 представляет собой Р или консервативное замещение для Р. В некоторых вариантах осуществления, Х3 представляет собой Т или консервативное замещение для Т. В некоторых вариантах осуществления, Х4 представляет собой G или консервативное замещение для G. В некоторых вариантах осуществления, верным являются одно, два, три из следующих утверждений или все они: Хг представляет собой V или консервативное замещение для V, Х2 представляет собой Р или консервативное замещение для Р, Х3 представляет собой Т или консервативное замещение для Т и Х4 представляет собой G или консервативное замещение для G. В некоторых вариантах осуществления, Xi представляет собой V или консервативное замещение для V, Х2 представляет собой Р или консервативное замещение для Р, Х3 представляет собой Т или консервативное замещение для Т, и Х4 представляет собой G или консервативное замещение для G.
В некоторых вариантах осуществления, Xi выбиран из V, I, L и М. В некоторых вариантах осуществления, Xi выбиран из V, I и L. В некоторых вариантах осуществления, Х2 выбиран из Р, G и А. В некоторых вариантах осуществления, Х2 выбиран из Р и G. В
некоторых вариантах осуществления, Х3 выбиран из Т и S. В некоторых вариантах осуществления, Х4 выбиран из G и Р.
В некоторых вариантах осуществления, верным является одно или несколько из следующих утверждений (например, 1, 2, 3 из них или все они) : Xi представляет собой V, Х2 представляет собой Р, Х3 представляет собой Т, и Х4 представляет собой G. В некоторых вариантах осуществления, Xi представляет собой V, Х2 представляет собой Р, Х3 представляет собой Т и Х4 представляет собой G.
В некоторых вариантах осуществления, CDR3 VH содержит последовательность SEQ ID N0:33.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-6 человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом (например, с идентичным в остальном антителом или антигенсвязывающим фрагментом), содержащим последовательность, где верным является одно или несколько из следующих утверждений (например, 1, 2, 3 из них или все они) : Хг представляет собой А, Х2 представляет собой S, Х3 представляет собой I и Х4 представляет собой S.
В некоторых вариантах осуществления, выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит CDR1 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:31, CDR2 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:32, и необязательно, CDR3 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:33.
В некоторых вариантах осуществления, вариабельная область тяжелой цепи содержит последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:17. В некоторых вариантах осуществления, вариабельная область тяжелой цепи состоит из последовательности, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:17 или отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислот от SEQ ID N0:17. В некоторых вариантах осуществления, вариабельная область тяжелой
цепи отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислот от SEQ ID N0:17. В некоторых вариантах осуществления, вариабельной область тяжелой цепи отличается на 1-5 аминокислот от SEQ ID N0:17.
В некоторых вариантах осуществления, вариабельная область
тяжелой цепи содержит последовательность, которая является, по
меньшей мере, на, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99%
идентичной SEQ ID N0:37. В некоторых вариантах осуществления,
вариабельная область тяжелой цепи состоит из последовательности,
которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95,
96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:37. В некоторых
вариантах осуществления, вариабельная область тяжелой цепи
отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ
ID N0:37. В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность
вариабельной области тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:37. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, состоящую из SEQ ID N0:37.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность, которая является, по меньшей мере, на, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:39. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность, которая отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ ID N0:39. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит SEQ ID N0:39. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:54. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность, которая отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ ID N0:54. В некоторых вариантах
осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит SEQ ID N0:54. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой scFv. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность scFv или состоит из нее
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVTTPGGGTIN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSG GGGSGGGGSGGGGSDIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQQKPGQPPKL LIYAASNRGSGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSEEVPLTFGQGTKLEIKRTV (SEQ ID N0:52) или
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNRG SGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSEEVPLTFGQGTKLEIKRTVGGGGSGGGG SGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVTTPGGGTI NYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSS (SEQ ID N0:53).
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:52 или SEQ ID N0:53. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит SEQ ID N0:52 или SEQ ID N0:53. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой scFv.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:41. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ ID N0:41. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:41. В некоторых вариантах
осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, состоящую из SEQ ID N0:41.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б
человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с EBI-029
или его фрагментом. В некоторых вариантах осуществления,
антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное
сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по
сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом,
содержащим CDR1 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:4, с
CDR2 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:5, и
необязательно, с CDR3 VH, содержащей последовательность SEQ ID
N0:6. В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б
человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом
или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим последовательность
вариабельной области тяжелой цепи, содержащей SEQ ID N0:17 или
состоящей из него. В некоторых вариантах осуществления, антитело
или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б
человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом
или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим SEQ ID N0:24. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:11 или состоящую из нее.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько последовательностей EBI-030 или EBI-031, как приведено в Таблице 4. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит один или несколько доменов EBI-030 или EBI-031, как показано на Фиг.15 (например, один или несколько доменов из FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4, СН1, шарнира, СН2 и СНЗ последовательности тяжелой цепи и/или FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4 и СК последовательности легкой цепи). В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент содержит тяжелую цепь и легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления, тяжелая и легкая цепи связаны одной или несколькими дисульфидными связями. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой scFv. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab, Fab', F(ab')2, scFv или фрагмент Fv.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б
человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом
или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим одну или несколько
соответствующих последовательностей EBI-029 или
последовательностей антитела, описанного в WO2014/074905, включаемой в качестве ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с тоцилизумабом.
НС EBI-029 Н311А
SEQ ID N0:10
QVQLVQSGAE PGQGLEWMGV MELSSLRSED SSASTKGPSV VSWNSGALTS QTYTCNVDHK VFLFPPKPKD DGVEVHNAKT KCKVSNKGLP KNQVSLTCLV SDGSFFLYSK SLSLSPGK
VKKPGSSVKV ITPGSGTINY TAVYYCARSR FPLAPCSRST GVHTFPAVLQ PSNTKVDKTV TLMISRTPEV KPREEQFNST APIEKTISKT KGFYPSDIAV LTVDKSRWQQ
SCKASGYALS AQKFQGRVTI WDPLYYYALE SESTAALGCL SSGLYSLSSV ERKCCVECPP TCVWDVSHE FRWSVLTW KGQPREPQVY EWESNGQPEN GNVFSCSVMH
NYLIEWVRQA TADESTSTAY JYWGQGTTVTV VKDYFPEPVT VTVPSSNFGT CPAPPVAGPS DPEVQFNWYV AQDWLNGKEY TLPPSREEMT NYKTTPPMLD EALHNHYTQK
Последовательно сть aa EBI-029 LC
SEQ ID NO: 12
DIVMTQSPDS QQKPGQPPKL SLQAEDVAVY IFPPSDEQLK GNSQESVTEQ THQGLSSPVT
LAVSLGERAT LIYAASNRGS YCQQSEEVPL SGTASWCLL DSKDSTYSLS KSFNRGEC .GVPDRFSGSG TFGQGTKLEI NNFYPREAKV STLTLSKADY
SGTDFTLTIS KRTVAAPSVF QWKVDNALQS EKHKVYACEV
Последовательно сть aa
Fab HC EBI-029 (IgGl)
SEQ ID N0:24
QVQLVQSGAE PGQGLEWMGV MELSSLRSED SSASTKGPSV VSWNSGALTS QTYICNVNHK
VKKPGSSVKV ITPGSGTINY TAVYYCARSR FPLAPSSKST GVHTFPAVLQ PSNTKVDKKV
SCKASGYALS AQKFQGRVTI WDPLYYYALE SGGTAALGCL SSGLYSLSSV EPKSCDKTHT
NYLIEWVRQA TADESTSTAY JYWGQGTTVTV VKDYFPEPVT VTVPSSSLGT
Последовательно
сть aa
VH EBI-029
SEQ ID NO: 17
QVQ LVQ S GAEVKK P G S SVKVS С KASGYALSNYLIE WVRQAP GQGLEWMGVITPGSGTINYAQКFQGRVTIT ADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEY WGQGTTVTVSS
Последовательно
сть aa
VL EBI-029
SEQ ID N0:18
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQO
KPGQPPKLLIYAASNRGSGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAE
DVAVYYCQQSEEVPLTFGQGTKLEIKRTV
CDR1 HC EBI 029
SEQ ID N0:4
GYALSNYLIE
CDR2 HC EBI-029
SEQ ID N0:5
VITPGSGTIN
CDR3 HC EBI-029
SEQ ID NO: 6
SRWDPLYYYALEY
CDR1 LC EBI-029
SEQ ID N0:7
RASESVDNYGIPFMN
CDR2 LC EBI-029
SEQ ID NO: 8
AASNRGS
CDR3 LC EBI-029
SEQ ID NO: 9
QQSEEVPLT
Последовательно сть aa HC EBI-030 (IgG2)
SEQ ID N0:41
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA PGQGLEWMGVTTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSRWDPLYYYALE YWGQGTTVTV SSASTKGPSV FPLAPCSRST SESTAALGCL VKDYFPEPVT VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSNFGT QTYTCNVDHK PSNTKVDKTV ERKCCVECPP CPAPPVAGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST FRWSVLTW HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP APIEKTISKT KGQPREPQVY TLPPSREEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPMLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK
Последовательно
сть aa
LC EBI-030
SEQ ID N0:42
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASESVD NYGIPFMNWY QQKPGQPPKL LIYAASNRGS GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY YCQQSEEVPLTFGQGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL NNFYPREAKV QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV THQGLSSPVT KSFNRGEC
Последовательно
SEQ
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA
сть aa
NO:
PGQGLEWMGVTTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY
Fab НС
EBI-030
MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV
(IgGl)
SSASTKGPSV FPLAPSSKST SGGTAALGCL VKDYFPEPVT
VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSSLGT
QTYICNVNHK PSNTKVDKKV EPKSCDKTHT
Последовательно
SEQ
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWM
сть aa
NO:
GVTTPGGGTINYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYC
Fab НС
EBI-030
ARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSEST
(IgG2)
AALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSWT
VPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERK
Последовательно
SEQ
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA
сть aa
NO:
PGQGLEWMGV TTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY
VH EBI-
030
MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SS
Последовательно
SEQ
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYOOKPGQPP
сть аа
NO:
KLLIY
VL EBI-
030
AASNRGSGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCOOSEEVPLT
T?C
г о
QGTKLEIKRTV
EBI-030
CDR1 НС
SEQ
GYVLPNYLIE
NO:
EBI-030
CDR2 НС
SEQ
VTTPGGGTIN
NO:
CDR3 НС
EBI-
SEQ
SRWDPLYYYALEY
030-
NO:
CDR1 LC
EBI-030
SEQ
RASESVDNYGIPFMN
NO:
CDR2 LC
EBI-030
SEQ
AASNRGS
NO:
EBI-030
CDR3 LC
SEQ
QQSEEVPLT
NO:
Последовательно
SEQ
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA
сть аа
NO:
PGQGLEWMGV TTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY
НС IgG2
1-031
MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV
SSASTKGPSV FPLAPCSRST SESTAALGCL VKDYFPEPVT
VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSNFGT
QTYTCNVDHK PSNTKVDKTV ERKCCVECPP CPAPPVAGPS
VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVQFNWYV
DGVEVHNAKT KPREEQFNST FRWSVLTW AQDWLNGKEY
KCKVSNKGLP APIEKTISKT KGQPREPQVY TLPPSREEMT
KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPMLD
SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK
SLSLSPGK
Последовательно
SEQ
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWM
сть аа
NO:
GVTTPGGGTINYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYC
VH-VL scFv
ARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVMTQS
PDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQQKPGQPPKLLIYAA
SNRGSGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSEEVPLTFG
QGTKLEIKRTV
Последовательно
SEQ
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQQKPGQPP
сть аа
NO:
KLLIYAASNRGSGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSE
VL-VH scFv
EVPLTFGQGTKLEIKRTVGGGGSGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPG
SSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVTTPGGGTINYAQK
FQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEY
WGQGTTVTVSS
аа=аминокислота; па=нуклеиновая кислота; НС=тяжелая цепь;
ЪС=легкая цепь; УН=вариабельная область тяжелой цепи; УЪ=вариабельная область легкой цепи
Повышенное сродство и/или улучшенную эффективность может оцениваться с использованием способов, описанных в настоящем документе, и/или способов известных в данной области.
В некоторых вариантах осуществления, сродство оценивается с использованием поверхностного плазмонного резонанса (SPR).
В некоторых вариантах осуществления, сродство повышается, по меньшей мере, в 1,5, 1,6, 1,7, 1,8. 1,9, 2, 3 или 4 раза.
В некоторых вариантах осуществления эффективность улучшена. В некоторых вариантах осуществления, эффективность улучшена, как показано понижением IC50 и/или понижением IC90. В некоторых вариантах осуществления, IC50 понижается, по меньшей мере, в 5, 10, 20, 30, 40 или 50 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC50 понижается, по меньшей мере, примерно в 50 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC90 понижается, по меньшей мере, в 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400 или 50 0 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC90 понижается, по меньшей мере, примерно в 100 раз.
В некоторых вариантах осуществления, эффективность оценивается, например, с помощью анализа с использованием НЕК-Blue(tm) или анализа пролиферации Т1165.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует передачу сигналов цис-IL-6, например, как оценивается на основе значения IC50 или IC90, полученного с помощью анализа с использованием HEK-Blue(tm), описанного в настоящем документе, например, с использованием 20 пМ свободного IL-б.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет IC50 меньше чем 47 пМ и/или IC90 меньше чем 4350 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC50 меньше чем 47 пМ, например, меньше чем 40, 30, 20, 10, 5, 4, 3, 2 или 1 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC90 меньше чем 4 350 пМ, например, меньше чем 4000, 2000, 1000, 100, 50, 40, 30, 20, 15, 10 или 5 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC50 и/или IC90 получаются, как оценивается при анализе с использованием HEK-Blue(tm) с 2 0 пМ IL-б.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент блокирует свободный IL-б с более лучшей эффективностью по сравнению с тоцилизумабом, например, как оценивается на основе значений IC50, полученных с помощью анализа с использованием HEK-Blue(tm) с 2 0 пМ IL-б. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует IL-б с эффективностью в 900 раз более лучшей, по сравнению с тоцилизумабом. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой EBI-031 или его антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет IC50 меньше чем 15 пМ, например, IC50, равное 14,2 пМ, при ингибировании IL-б.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент блокирует передачу сигналов транс-
IL-б, например, как оценивается с помощью анализа с
использованием HEK-Blue(tm), описанного в настоящем документе,
например, с 200 пМ гипер IL-б. В некоторых вариантах
осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент
ингибирует передачу сигналов с помощью гипер IL-б. В некоторых
вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий
фрагмент ингибирует передачу сигналов с помощью гипер IL-б с
более лучшей эффективностью, чем тоцилизумаб, например, с
эффективностью в 900 раз более лучшей по сравнению с
тоцилизумабом. В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент ингибирует передачу сигналов с
помощью гипер IL-б с IC50 меньшей, чем 1 мкМ. В некоторых
вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий
фрагмент ингибирует передачу сигналов с помощью гипер IL-б с
IC50 меньшей, чем 1 нМ. В некоторых вариантах осуществления,
антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует передачу
сигналов с помощью гипер IL-б с IC50 меньшей, чем 100 пМ или
меньшей, чем 50 пМ, например, с IC50 примерно 14-15 пМ. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент представляет собой EBI-031 или его антигенсвязывающий фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент ингибирует передачу сигналов цис-IL-б и передачу сигналов транс-1Ъ-б.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент является эффективным при блокировке
передачи сигналов IL-б в глазу в течение, по меньшей мере, 1
месяца, 2 месяцев, 3 месяцев, 4 месяцев, 5 месяцев или б
месяцев, например, после введения в стекловидное тело. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент блокирует на 95% передачу сигналов IL-б в глазу в течение, по меньшей мере, 1 месяца, 2 месяцев, 3 месяцев, 4 месяцев, 5 месяцев или б месяцев, например, после введения в стекловидное тело. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент блокирует на 95% передачу сигналов IL-6 в глазу в течение примерно 150 дней.
В другом аспекте в настоящем документе предлагается выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность вариабельной области тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:37, где указанная последовательность тяжелой цепи содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V2 8, РЗО, Т51 и G55 (нумерация аминокислот осуществляется в соответствии с SEQ ID N0:41).
В другом аспекте, в настоящем документе предлагается выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:39, где указанная последовательность содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V2 8, РЗО, Т51 и G55 (нумерация аминокислот осуществляется в соответствии с SEQ ID N0:41).
В другом аспекте, в настоящем документе предлагается выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90,
91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:54, где указанная последовательность содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V2 8, РЗО, Т51 и G55 (нумерация аминокислот осуществляется в соответствии с SEQ ID N0:41).
В настоящем документе также предлагается выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:41, где указанная последовательность тяжелой цепи содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V28, РЗО, Т51 и G55 (нумерация аминокислот осуществляется в соответствии с SEQ ID N0:41).
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеют повышенное сродство к IL-6 человека по сравнению с контрольным антителом, например, по сравнению с EBI-029 или его фрагментом. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который в остальном является идентичным, за исключением того, что он не содержит указанных одной или несколько аминокислот, выбранных из V28, РЗО, Т51, и G55, а вместо этого, содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из А28, S30, 151 и S55. В некоторых вариантах осуществления, сродство повышается, по меньшей мере, в 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 3 или 4 раза. В некоторых вариантах осуществления, сродство оценивается с использованием поверхностного плазмонного резонанса (SPR).
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет улучшенную эффективность по сравнению с контрольным антителом, например, по сравнению с EBI-029 или его фрагментом. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который в остальном является идентичным, за исключением того, что он не содержит указанных одной или
нескольких аминокислот, выбранных из V28, РЗО, Т51 и G55, а вместо этого, содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из А28, S30, 151 и S55.
В некоторых вариантах осуществления, эффективность улучшена, как показано уменьшением IC50 и/или уменьшением IC90. В некоторых вариантах осуществления, IC50 уменьшается, по меньшей мере, в 5, 10, 20, 30, 40 или 50 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC50 уменьшается, по меньшей мере, примерно в 50 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC90 уменьшается, по меньшей мере, в 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 400 или 500 раз. В некоторых вариантах осуществления, IC90 уменьшается, по меньшей мере, примерно в 100 раз.
В некоторых вариантах осуществления, эффективность оценивается с помощью анализа с использованием HEK-Blue(tm) или анализа пролиферации Т1165.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет IC50 меньше чем 47 пМ и/или IC90 меньше чем 4350 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC50 меньше чем 47 пМ, например, меньше чем 40, 30, 20, 10, 5, 4, 3, 2 или 1 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC90 меньше чем 4 350 пМ, например, меньше чем 4000, 2000, 1000, 100, 50, 40, 30, 20, 15, 10 или 5 пМ. В некоторых вариантах осуществления, IC50 и/или IC90 оценивается при анализе с использованием HEK-Blue(tm) с 2 0 пМ IL-б.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит V28, РЗО, Т51 и G55, и антитело или антигенсвязывающий фрагмент показывает улучшенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который в остальном является идентичным, за исключением того, что он содержит А28, S30, 151 и S55.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанное в настоящем документе, дополнительно содержит вариабельную область легкой цепи или ее
антигенсвязывающий фрагмент, содержащий CDR1 VL, CDR2 VL, и CDR3 VL.
В некоторых вариантах осуществления, CDR1 VL содержит последовательность SEQ ID N0:34, CDR2 VL содержит последовательность SEQ ID N0:35 и CDR3 VL содержит последовательность SEQ ID N0:36.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность вариабельной области легкой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:38.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность вариабельной области легкой цепи, которая содержит SEQ ID N0:38 или которая отличается от SEQ ID N0:38 не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность вариабельной области легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:38. В некоторых вариантах осуществления, последовательность вариабельной области легкой цепи состоит из SEQ ID N0:38.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность легкой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность легкой цепи, которая отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержит
последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42 или последовательность, которая отличается не более чем на 5, 4, 3, 2 или 1 аминокислоту от SEQ ID N0:42. В некоторых вариантах осуществления, последовательность легкой цепи состоит из SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит
(i) CDR1 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:31, CDR2 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:32, и CDR3 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:33, и (ii) CDR1 VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:34, CDR1 VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:35, и CDR3 VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:36. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит указанные выше CDR за исключением того, что он содержит мутацию, например, в целом самое большее 1, 2 или 3 мутации во всех шести CDR. В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) не уменьшает сродство и/или эффективность антитела или антигенсвязывающего фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент представляет собой антитело IgGl,
IgG2, IgG3 или IgG4 или его фрагмент. В некоторых вариантах
осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент
представляет собой антитело IgGl или IgG2 или его фрагмент. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab IgGl или Fab IgG2. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой антитело IgG2 или антигенсвязывающий фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент получают с помощью генной инженерии для уменьшения или устранения активности ADCC.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий
фрагмент представляет собой гуманизированное моноклональное антитело или моноклональное антитело человека или его антигенсвязывающий фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:37 или состоящую из нее, и вариабельную область легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:38 или состоящую из нее. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит указанные выше вариабельные области тяжелых и легких цепей за исключением того, что он имеет мутацию, например, в целом, самое большее, 1, 2 или 3 мутации. В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) не уменьшает сродство и/или эффективность антитела или антигенсвязывающего фрагмента.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:41 и, необязательно, последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, состоящую из SEQ ID N0:41 и, необязательно, последовательность легкой цепи состоящую из SEQ ID N0:42,
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:47 и, необязательно, последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:41, и последовательность легкой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:42, за исключением того, что антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит мутации (например, всего 1, 2, 3, 4 или 5 мутаций, по сравнению с SEQ ID N0:41 и/или SEQ ID N0:42). В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) находится в каркасной области (областях). В некоторых вариантах осуществления, мутации не уменьшают сродство и/или эффективность
антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который не содержит указанной мутации.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:47, и последовательность легкой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:42, за исключением того, что антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит мутацию (например, всего 1, 2, 3, 4 или 5 мутаций, по сравнению с SEQ ID N0:47 и/или SEQ ID N0:42). В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) находится в каркасной области (областях). В некоторых вариантах осуществления, мутация не уменьшает сродство и/или эффективность антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который не содержит указанной мутации.
В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab.
В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab IgGl.
В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой выделенный Fab, содержащий последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:39, и последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42. В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой выделенный Fab, содержащий последовательность тяжелой цепи, состоящую из SEQ ID N0:39, и последовательность легкой цепи, состоящую из SEQ ID N0:42.
В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой Fab IgG2.
В одном из вариантов осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой выделенный Fab, содержащий последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:54, и последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42. В одном из вариантов осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент представляет собой выделенный Fab, содержащий последовательность тяжелой цепи, состоящую из SEQ ID N0:54, и последовательность легкой цепи, состоящую из SEQ ID N0:42.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:39, и последовательность легкой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:42, за исключением того, что антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит мутацию (например, всего 1, 2, 3, 4 или 5 мутаций, по сравнению с SEQ ID N0:39 и/или SEQ ID N0:42). В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) находится в каркасной области (областях). В некоторых вариантах осуществления, мутация не уменьшает сродство и/или эффективность антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который не содержит указанной мутации.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит последовательность тяжелой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:54, и последовательность легкой цепи, которая является идентичной SEQ ID N0:42, за исключением того, что антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит мутацию (например, всего 1, 2, 3, 4 или 5 мутаций, по сравнению с SEQ ID N0:54 и/или SEQ ID N0:42). В некоторых вариантах осуществления, мутация (мутации) находится в каркасной области (областях). В некоторых вариантах осуществления, мутация не уменьшает сродство и/или эффективность антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который не содержит указанной мутации.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент может связываться, по меньшей мере,
с одним из R24, К27, Y31, D34, S118 или V121 IL-б человека. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент может связываться с R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека. В некоторых вариантах
осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент может связываться, по меньшей мере, с 1, по меньшей мере, 2, по меньшей мере, 3, по меньшей мере, 4 или, по меньшей мере, с 5 из R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент может связываться (например, может специфично связываться) с сайтом II IL-б человека.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связываться с IL-б при Тт 7 0°С или выше.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент может связываться с IL-б при Тт 8 0°С или выше.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или его
фрагмент (например, его антигенсвязывающий фрагмент)
связывается, по меньшей мере, с одним из R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается, по меньшей мере, с двумя из R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается, по меньшей мере, с тремя из R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается, по меньшей мере, с четырьмя R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается, по меньшей мере, с пятью R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связывается R24, К27, Y31, D34, S118 и V121 IL-б человека.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент. В некоторых
вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой гуманизированное моноклональное антитело. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой моноклональное антитело человека.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент демонстрирует агрегацию <10% при концентрации 100-150 мг/мл, например, при концентрации примерно 142 мг/мл в PBS, рН 7,4. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет улучшенные фармакокинетические свойства, по сравнению с другим терапевтическим агентом, например, по сравнению с тоцилизумабом, бевацизумабом, ранибизумабом и/или Eylea(r). В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет улучшенное удерживание в глазу, при введении его в глаз, например, в стекловидное тело, например, посредством инъекции в стекловидное тело. В некоторых вариантах осуществления, улучшенное удерживание в глазу показывается с помощью увеличения время полужизни в глазу, например, в стекловидном теле, сетчатке, внутриглазной жидкости, сосудистой оболочке глаза и/или склере.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет время полужизни в стекловидном теле, по меньшей мере, б, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 дней. В некоторых вариантах осуществления, время полужизни в стекловидном теле составляет, по меньшей мере, 10 дней. В некоторых вариантах осуществления, время полужизни в стекловидном теле оценивается на животном, например, на кролике или на обезьяне. В некоторых вариантах осуществления, время полужизни в стекловидном теле оценивается на человеке.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе, имеет уменьшенное системное время полужизни (например, пониженное Т±/2р) и/или улучшенное системное выведение, например, уменьшенное системное время полужизни или более быстрое
системное выведение, по сравнению с другим терапевтическим агентом, например, тоцилизумабом, бевацизумабом, ранибизумабом и/или афиберцептом (Eylea(r)) . В некоторых вариантах осуществления, системное время полужизни (например, ТЧ/гр) меньше чем у тоцилизумаба и/или афиберцепта (Eylea(r)) . В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит домен Fc, содержащий мутацию (например, при 1, 2, 3 или 4 мутации) в одном или нескольких положениях, соответствующих Н311, D313, 1254 или Н436 (нумерация как в SEQ ID N0:41). В некоторых вариантах осуществления, мутация выбирана из одного или нескольких Н311А, Н311Е, H311N, D313T, I254A, I254R и Н436А. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит домен Fc, содержащий мутацию, соответствующую Н311А (нумерация как в SEQ ID N0:41). В некоторых вариантах осуществления, домен Fc представляет собой домен Fc IgGl. В некоторых вариантах осуществления, домен Fc представляет собой домен Fc IgG2.
В некоторых вариантах осуществления, домен Fc представляет собой домен Fc IgGl человека, имеющий последовательность SEQ ID N0:50, и необязательно содержит мутацию в одном или нескольких из подчеркнутых положений: (Н90, D92, 133, и Н215):
DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMXSRTPEVTCWVDVSHEDPEVKFNWYV DGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQP REPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLY SKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID N0:50).
В некоторых вариантах осуществления, домен Fc IgGl содержит мутацию, соответствующую одному или нескольким положениям Н90А, Н90Е, H90N, D92T, I33A, I33R, и Н215А (нумерация в соответствии с SEQ ID N0:50).
В некоторых вариантах осуществления, домен Fc представляет собой домен Fc IgG2 человека, имеющий последовательность SEQ ID N0:51 и необязательно содержащий мутацию в одном или нескольких подчеркнутых положениях (Н8б, D88, 129, и Н211):
VECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMXSRTPEVTCWVDVSHEDPEVQFNWYVDGVE VHNAKTKPREEQFNSTFRWSVLTWHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQ
VYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLT VDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID N0:51).
В некоторых вариантах осуществления, домен Fc IgG 2 содержит мутацию, соответствующую одному или нескольким положениям Н86А, Н86Е, H86N, D88T, I29A, I29R и Н211А (нумерация в соответствии с SEQ ID N0:51).
В некоторых вариантах осуществления, мутация Fc уменьшает системную аккумуляцию антитела или антигенсвязывающего фрагмента (например, увеличивает выведение или уменьшает время полужизни, например, Т^р) антитела или антигенсвязывающего фрагмента. В некоторых вариантах осуществления, системная аккумуляция уменьшается по сравнению с другим терапевтическим агентом (например, тоцилизумабом, бевацизумабом, ранибизумабом и/или афиберцептом). В некоторых вариантах осуществления, системная аккумуляция уменьшается по сравнению с тоцилизумабом и/или афиберцептом. В некоторых вариантах осуществления, системная аккумуляция уменьшается по сравнению с системной аккумуляцией соответствующего антитела или антигенсвязывающего фрагмента, который не содержит мутации. В некоторых вариантах осуществления, системная аккумуляция оценивается после введения в стекловидное тело антитела или антигенсвязывающего фрагмента.
В другом аспекте в настоящем документе предлагается способ уменьшения системных воздействий ингибирования IL-б у субъекта, способ включает введение субъекту антитела или его фрагмента, содержащего мутировавший домен Fc, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент может ингибировать активность IL-б и имеет уменьшенную активность Fc (например, уменьшенное связывание с FcRn) по сравнению с соответствующим антителом или его фрагментом, имеющим домен Fc дикого типа. В некоторых случаях, способ уменьшения системных воздействий ингибирования IL-б у субъекта включает введение субъекту антагониста IL-б, который содержит мутировавший домен Fc, как описано в настоящем документе.
В другом аспекте, в настоящем документе предлагается нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, кодирующую антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота кодирует последовательность аминокислот, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота содержит SEQ ID N0:40, SEQ ID N0:43 или SEQ ID N0:48. В некоторых вариантах осуществления, нуклеиновая кислота кодирует последовательность, описанную в Таблице 4.
В настоящем документе также предлагается вектор, содержащий нуклеиновую кислоту. В настоящем документе также предлагается клетка, содержащая нуклеиновую кислоту или вектор.
В некоторых вариантах осуществления, антитело против IL-б или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе, предназначен для использования при лечении субъекта (например, человека) с заболеванием, ассоциированного с IL-б. В некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой глазное заболевание, например, глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б, например, в стекловидном теле.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент предназначен для использования при лечении субъекта (например, человека) с диабетическим макулярным отеком (DME), диабетической ретинопатией, увеитом, глаукомой, сухим глазом (например, с болезнью сухого глаза или синдромом сухого глаза), аллергическим конъюнктивитом, глазной болью, регматогенной отслойкой сетчатки (RRD), возрастной макулярной дистрофией (AMD), пролиферативной диабетической ретинопатией (PDR), окклюзией вены сетчатки (RV0), нейромиелитом зрительного нерва (NM0), трансплантацией роговицы, эрозией роговицы или механической травмой глаза. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент предназначен для использования при лечении субъекта (например, человека) с DME.
В некоторых вариантах осуществления, антитело IL-б или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе, предназначен для использования при приготовлении лекарственного
препарата для лечения заболевания, ассоциированного с IL-б. В некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой глазное заболевание, например, глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек (DME), диабетическую ретинопатию, увеит, сухой глаз (например, болезнь сухого глаза или синдром сухого глаза), возрастную макулярную дистрофию (AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), регматогенную отслойку сетчатки (RRD), окклюзию вены сетчатки (RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO), трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек. В некоторых вариантах осуществления, лекарственный препарат приготавливают для доставки в стекловидное тело глаза субъекта (например, для инъекции в стекловидное тело).
В настоящем документе также предлагается композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, композиция дополнительно содержит фармацевтически приемлемый носитель и один или несколько фармацевтически приемлемых наполнителей.
В некоторых вариантах осуществления, композиция предназначена для использования при лечении заболевания, ассоциированное с IL-б. В некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой глазное заболевание, например, глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле. В некоторых вариантах осуществления, композиция предназначена для использования при лечении диабетического макулярного отека (DME), диабетической ретинопатии, увеита, сухого глаза (например, болезни сухого глаза или синдрома сухого глаза), возрастной макулярной дистрофии (AMD), пролиферативной диабетической ретинопатии (PDR), регматогенной отслойки сетчатки (RRD), окклюзии вены
сетчатки (RVO), нейромиелита зрительного нерва (NMO), трансплантата роговицы, эрозии роговицы или механической травмы глаза.
В настоящем документе предлагается также способ лечения заболевания, ассоциированного с IL-б, способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества антитела против IL-б или фрагмента, описанного в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированного с IL-б, представляет собой глазное заболевание, например, глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек (DME), диабетическую ретинопатию, увеит, сухой глаз (например, болезнь сухого глаза или синдром сухого глаза), возрастную макулярную дистрофию (AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), регматогенную отслойку сетчатки (RRD), окклюзию вены сетчатки (RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO), трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент или композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент, доставляется в стекловидное тело глаза субъекта (например, посредством инъекции в стекловидное тело). В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент или композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент, предназначается для инъекции в стекловидное тело.
В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек, и антитело или фрагмент или композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент, доставляется в стекловидное тело глаза субъекта.
В настоящем документе также предлагается антитело или его фрагмент (например, антигенсвязывающий фрагмент) (например,
антитело против IL-б или его фрагмент, как описано в настоящем документе) или композиция, содержащая такое антитело или его фрагмент, для использования при лечении заболевания, ассоциированное с IL-б (например, для использования при лечении субъекта, например, субъекта человека, имеющего заболевание, ассоциированного с IL-б).
В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б, например, в стекловидном теле. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой диабетический макулярный отек (DME), диабетическую ретинопатию, увеит, сухой глаз (например, расстройство сухого глаза или болезнь сухого глаза), аллергический конъюнктивит, возрастную макулярную дистрофию
(AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), регматогенную отслойку сетчатки (RRD), окклюзию вены сетчатки
(RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO), трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой DME. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой болезнь сухого глаза. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой синдром сухого глаза. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой увеит. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой AMD. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой PDR. В некоторых вариантах осуществления, указанное заболевание представляет собой трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его фрагмент (например, антигенсвязывающий фрагмент) является пригодным для доставки в стекловидное тело глаза. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его фрагмент (например, антигенсвязывающий фрагмент) доставляется в стекловидное тело глаза.
В настоящем документе предлагается также способ лечения заболевания, ассоциированного с IL-б, способ включает введение субъекту антитела против IL-б или его фрагмента (например, его антигенсвязывающего фрагмента), например, антитела против IL-б или его фрагмента, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, антитело против IL-б или его фрагмент (например, его антигенсвязывающий фрагмент) вводится в терапевтически эффективном количестве. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек (DME), диабетическую ретинопатию, увеит, синдром сухого глаза, болезнь сухого глаза, возрастную макулярную дистрофию (AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), окклюзию вены сетчатки (RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO), трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза.
В некоторых вариантах осуществления, антитело или его фрагмент (например, его антигенсвязывающий фрагмент), является пригодным для доставки в стекловидное тело глаза. В некоторых вариантах осуществления, антитело или его фрагмент (например, его антигенсвязывающий фрагмент) доставляется в стекловидное тело глаза субъекта. В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек, и антитело или его фрагмент доставляется в стекловидное тело глаза субъекта.
В настоящем документе также предлагается набор, содержащий антитело против IL-б или композицию, описанную в настоящем документе, и необязательно, инструкции для применения.
В настоящем документе также предлагается контейнер или устройство, например, устройство для доставки лекарственного средства, содержащее антитело против IL-б или композицию, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления, указанное устройство конфигурируется для доставки антитела или композиции в глаз, например, в стекловидное тело. В
настоящем документе также предлагается набор, содержащий указанный контейнер или устройство.
Как используется в настоящем документе, термин "антитело"
является синонимом иммуноглобулина и должен пониматься как
повсеместно известный в данной области. Термин антитело не
ограничивается каким-либо конкретным способом получения
антитела. Например, термин антитело включает, среди прочего,
рекомбинантные антитела, моноклональные антитела и
поликлональные антитела. Как используется в настоящем документе, антитело представляет собой тетрамер, и если не описано иного, каждое из них состоит из двух идентичных пар полипептидных цепей, каждая пара содержит одну легкую цепь и одну тяжелую цепь. Амино окончания каждой цепи содержит вариабельную область примерно из 100-120 или более аминокислот, которые играют главную роль при распознавании антигена. Часть с карбокси-окончанием каждой цепи содержит константную область с главной ролью для эффекторной функции антитела. Классы легких цепей человека определяют, как каппа и лямбда легкие цепи. Классы тяжелых цепей представляют собой мю, дельта, гамма, альфа или эпсилон, и они определяют изотип антитела. Изотипы антитела представляют собой IgM, IgD, IgG, IgA и IgE, соответственно. В легких и тяжелых цепях, вариабельные и константные области соединяются с областью "J" примерно из 12 или более аминокислот, при этом тяжелая цепь содержит также область "D" примерно из трех или более аминокислот.
Вариабельные области каждой пары тяжелая/легкая цепь (VH и VL), соответственно, образуют сайт связывания антигена. Соответственно, интактное антитело IgG содержит, например, два сайта связывания. За исключением бифункциональных или биспецифичных антител, эти два сайта связывания являются одинаковыми.
Вариабельные области тяжелых и легких цепей антитела демонстрируют одинаковую общую структуру относительно консервативных каркасных областей (FR), соединенных тремя гипервариабельными областями, определяемыми также как области, определяющие комплементарность, или CDR. Термин "вариабельный"
относится к тому факту, что определенные части вариабельных доменов различаются в широких пределах по последовательности среди антител и вовлечены в связывание и специфичность каждого конкретного антитела по отношению к его конкретному антигену. Вариабельность заключается, прежде всего, в CDR, которые разделяются более консервативными каркасными областями (FR). Приписывание аминокислот к каждому домену осуществляется в соответствии с определениями Rabat Sequences of Proteins of Immunological Interest (National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1987 and 1991)) или Chothia and Lesk, J Mol Biol 196:901917 (1987); Chothia et al. , Nature 342:878-883 (1989), которые описывают способы, известные в данной области.
"Дикий тип" может относиться к наиболее преобладающему аллелю или к видам, обнаруживаемым в популяции, или к антителу, полученному от животного, не подвергаемого никакому воздействию, по сравнению с аллелем или полиморфизмом или вариантом или производным, получаемым с помощью некоторой формы воздействия, такого как мутагенез, использование рекомбинантных методов, и тому подобное, для замены аминокислоты молекулы, связывающей антиген.
Термин "фрагмент антитела" относится к части интактной цепи или цепи полной длины или к антителу, как правило, к целевой области связывания или вариабельной области. Примеры фрагментов антитела включают, но, не ограничиваясь этим, Fab, Fab', F(ab')2 и фрагменты Fv. "Функциональный фрагмент" или "аналог сайта II антитела анти-1Ъ-б" представляет собой фрагмент, который может предотвращать или существенно уменьшать способность IL-б к связыванию рецептора, уменьшать способность комплекса IL-6/IL-6R к связыванию с др13 0 или уменьшать способность лиганда к связыванию с др130 или к инициированию передачи сигналов. Как используется в настоящем документе, "антигенсвязывающий фрагмент" или "функциональный фрагмент", как правило, является синонимом "фрагмента антитела" и может относиться к таким фрагментам, как Fv, Fab, F(ab')2, и так далее, которые могут предотвращать или существенно уменьшать способность IL-б к связыванию рецептора,
уменьшать способность комплекса IL-6/IL-6R к связыванию с др130 или к инициированию передачи сигналов.
"Производное" антитела представляет собой полипептид, который содержит, по меньшей мере, одну CDR антитела, описанного в настоящем документе. Как правило, производное может связываться с сайтом II IL-б.
"Конкурировать" означает, что первое антитело или его
фрагмент может конкурировать за связывание со вторым антителом
или его фрагментом таким образом, что связывание первого
антитела с его эпитопом детектируемо уменьшается в присутствии
второго антитела по сравнению со связыванием первого антитела в
отсутствии второго антитела. В некоторых случаях, термин может
также относиться к связыванию второго антитела с его эпитопом,
которое детектируемо уменьшается в присутствии первого антитела.
Механизм такой конкуренции может осуществляться посредством, в
неограничивающих примерах, стерического затруднения,
конформационных изменений, связывания с общим эпитопом.
Термин "процент идентичности последовательностей" в
контексте последовательностей нуклеиновых кислот означает
остатки в двух последовательностях, которые являются
одинаковыми, при выравнивании для максимального соответствия.
Длина сравнения идентичности последовательности может
составлять, по меньшей мере, примерно девять нуклеотидов,
например, по меньшей мере, примерно 18 нуклеотидов, по меньшей
мере, примерно 2 4 нуклеотида, по меньшей мере, примерно 2 8
нуклеотидов, по меньшей мере, примерно 32 нуклеотида, по меньшей
мере, примерно 3 6 нуклеотидов или, по меньшей мере, примерно 4 8
или более нуклеотидов. Алгоритмы, известные в данной области,
могут использоваться для измерения идентичности нуклеотидных
последовательностей. Например, последовательности поли
нуклеотидов могут сравниваться с использованием FASTA, Gap или Bestfit (Wisconsin Package Version 10.0, Genetics Computer Group (GCG), Madison, WI). FASTA включает, например, программы FASTA2 и FASTA3, обеспечивает выравнивания и процент идентичности последовательностей областей наилучшего перекрывания между
запрашиваемой последовательностью и последовательностью поиска (Pearson, Methods Enzymol 183:63-98 (1990); Pearson, Methods Mol Biol 132:185-219 (2000); Pearson, Methods Enzymol 266:227-258 (1996); Pearson, J Mol Biol 276:71-84 (1998); включается в настоящий документ в качестве ссылки). Как правило, используют параметры по умолчанию для конкретной программы или алгоритма. Например, процент идентичности последовательностей между последовательностями нуклеиновых кислот может определяться с использованием FASTA с ее параметрами по умолчанию (размер слова б и коэффициент NOPAM для матрицы оценок) или с использованием Gap с ее параметрами по умолчанию, как предусмотрено в GCG Version 6.1, они включается в настоящий документ в качестве ссылок.
Термин "процент идентичности последовательностей" в
контексте последовательностей аминокислот означает остатки в
двух последовательностях, которые являются одинаковыми, когда
они выравниваются при максимальном соответствии. Длина сравнения
идентичности последовательностей может превышать, по меньшей
мере, примерно пять остатков аминокислот, например, составлять,
по меньшей мере, примерно 2 0 остатков аминокислот, по меньшей
мере, примерно 3 0 остатков аминокислот, по меньшей мере,
примерно 50 остатков аминокислот, по меньшей мере, примерно 100
остатков аминокислот, по меньшей мере, примерно 150 остатков
аминокислот или, по меньшей мере, примерно 2 00 или более
остатков аминокислот. Идентичность последовательностей для
полипептидов, как правило, измеряют с использованием
программного обеспечения для анализа последовательностей.
Алгоритмы для определения процента идентичности
последовательностей известны в данной области. Например, последовательности аминокислот могут сравниваться с использованием FASTA, Gap или Bestfit (Wisconsin Package Version 10.0, Genetics Computer Group (GCG), Madison, WI) . Программное обеспечение для анализа белков согласует последовательности с использованием мер подобия, приписываемых различным замещениям, делециям и другим модификациям, включая консервативные замещения аминокислот. Например, GCG содержит программы, такие как "Gap" и
"Bestfit", которые можно использовать с параметрами по умолчанию, как указано в программах, для определения гомологии последовательностей или идентичности последовательностей между близко родственными полипептидами, такими как гомологичные полипептиды от различных видов организмов, или между белком дикого типа и его аналогом. Смотри, например, GCG Version 6.1
(University of Wisconsin, Madison, WI) . Последовательности
полипептидов также можно сравнивать с использованием FASTA,
используя параметры по умолчанию или рекомендованные параметры,
смотри GCG Version 6.1. FASTA (например, FASTA2 и FAS ТАЗ)
обеспечивает выравнивания и процент идентичности
последовательностей для областей наилучшего перекрывания между запрашиваемой последовательностью и последовательностью поиска
(Pearson, Methods Enzymol 183:63-98 (1990); Pearson, Methods Mol Biol 132:185-219 (2000)) . Другой алгоритм, который можно использовать при сравнении последовательности с базой данных, содержащей большое количество последовательностей от различных организмов, представляет собой компьютерную программу BLAST, например, blastp или tblastn, с использованием параметров по умолчанию, как поставляется вместе с программами. Смотри, например, Altschul et al., J Mol Biol 215:403-410 (1990); Altschul et al., Nucleic Acids Res 25:3389-402 (1997).
Белок или полипептид является "по существу чистым", "по существу гомогенным" или "по существу очищенным", когда, по меньшей мере, примерно 60-75% образца демонстрируют одинаковые виды полипептида. Полипептид или белок может быть мономерным или мультимерным. По существу чистый полипептид или белок может содержать примерно 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 99% чистого полипептида; например, по существу чистый полипептид или белок является чистым на 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 99%. Чистота или гомогенность белка может оцениваться с помощью любых соответствующих средств, таких как электрофорез на полиакриламидном геле образца белка с последующей визуализацией одной или нескольких полос, ассоциированное с белком или полипептидом (например, при окрашивании геля), эксклюзионной ВЭЖХ, катионообменной ВЭЖХ, восстановительного капиллярного
электрофореза в SDS, пептидного картирования или гликанового картирования. Более высокое разрешение может быть достигнуто с использованием, например, способов, известных в данной области, или других средств очистки.
Термин "по существу подобие", когда он относится к
нуклеиновой кислоте или ее фрагменту, означает, что при
оптимальном выравнивании, с соответствующими нуклеотидными
инсерциями или делениями, с другой нуклеиновой кислотой (или с
ее комплементарной нитью), имеется идентичность
последовательности нуклеотидов, по меньшей мере, примерно у 85%, по меньшей мере, примерно у 90% и, по меньшей мере, примерно у 95%, 96%, 97%, 98% или у 99% нуклеотидных оснований, например, идентичность последовательностей 85%, 90%, 95%, 96%, 98% или 99%, как измерено с помощью любого известного алгоритма для идентичности последовательностей, такого как FASTA, BLAST или Gap.
В применении к полипептидам, термин "по существу
идентичность" или "по существу подобие" означает, что две
последовательности аминокислот, при оптимальном выравнивании,
например, с помощью программ GAP или BESTFIT с использованием
весов разрывов по умолчанию, как поставляется вместе с
программами, разделяют между собой идентичность
последовательностей, по меньшей мере, примерно на 70%, 75%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%; например, идентичность последовательностей 70%, 75%, 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99%. В определенных вариантах осуществления, положения остатков, которые не являются идентичными, различаются консервативными замещениями аминокислот.
"Терапевтически эффективное количество" относится к тому количеству терапевтического агента, который при введении будет облегчать, по меньшей мере, один признак или симптом заболевания, которое лечится, или усиливать или улучшать профилактическое или терапевтическое воздействие (воздействия) другой терапии (например, другого терапевтического агента) полезного для лечения заболевания, ассоциированное с IL-б.
Понятно, что терапевтически эффективное количество может вводиться во множестве доз в течение ограниченного периода времени или в виде хронического лечения.
"Лечить", "леченный" и "лечение" относиться к способу облегчения одного или нескольких признаков или симптомов заболевания.
Как используется в настоящем документе, термин "заболевание" включает заболевания и расстройства.
Полное описание каждого патентного документа и научной статьи, упоминаемой в настоящем документе, и патентные документы и научные статьи, цитируемые при этом, включаются в настоящий документ в явном виде в качестве ссылок для всех целей.
Дополнительные особенности и преимущества настоящего изобретения описываются более конкретно ниже.
Краткое описание чертежей
Фиг. 1 представляет собой график, иллюстрирующий результаты эксперимента, при котором антитело анти-1Ъ-б вводится IVT (в стекловидное тело) модели крыс CNV. Антитело анти-VEGF вводится в качестве положительного контроля, и отрицательный контроль представляет собой несущую среду саму по себе. р=0,0054 в День 15 и р=0, 0005 в День 22 для антитела анти-1Ъ-б по сравнению с контролем с несущей средой.
Фиг. 2 представляет собой график, иллюстрирующий результаты исследования с помощью эксперимента по связыванию, относительно способности антитела 64 мышиных к ингибированию связывания IL-6/IL-6R с др130.
Фиг.ЗА представляет собой график, иллюстрирующий эксперимент, в котором 020 исследуют на способность к блокированию передачи сигналов IL-б в отсутствии избытка растворимого IL-6Ra. Эксперименты осуществляют в клетках НЕК-Blue-IL-б с 0,2 нг/мл IL-б и 2 мкг/мл IL-6Ra.
Фиг.ЗВ представляет собой график, иллюстрирующий эксперимент, в котором 020 исследуют на способность к блокированию передачи сигналов IL-б в присутствии избытка
растворимого IL-6Ra. Эксперименты осуществляют в клетках НЕК-Blue-IL-б с 0,2 нг/мл IL-б и 2 мкг/мл IL-6Ra.
Фиг. 4 представляет собой график, иллюстрирующий результаты эксперимента, при котором моноклональное антитело анти-IL- б ("Блокада IL-б") вводят IVT в модели мышей с CNV. Контроли представляют собой отсутствие лечения (противоположный глаз), инъекцию в стекловидное тело антитело анти-VEGF ("Блокада VEGF") или инъекцию в стекловидное тело контроля, изотипа антитела анти-HRP ("Контрольное антитело") .
Фиг. 5 показывает связывание с IL-б, по сравнению с антителом дикого типа (EBI-029), для антител, имеющих следующие мутации (1) I51T/S55G, (2) A28V/I51T/S55G, (3) S30P/I51T,/S55G, и (4) A28V/S30P/I51T/S55G (упоминается также как EBI-030).
Фиг.б показывает относительную величину передачи сигналов в репортерных клетках HEK-Blue(tm) IL6, обработанных IL-б и одним из следующих Fab: (1) (EBI-029) WT, (2) A28V/I51T/S55G, (3) S30P/I51T/S55G, (4) A28V/S30P/I51T/S55G (EBI-030).
Фиг. 7 показывает люминесценцию (меру пролиферации, индуцируемой IL-б) в клетках Т1165.85.2.1, обработанных IL-б и одним из следующих Fab при показанной концентрации: (1) (EBI-029) WT, (2) A28V/I51T/S55G, (3) S30P/I51T/S55G, (4) A28V/S30P/I51T/S55G (EBI-030).
Фиг.8 показывает относительную величину передачи сигналов в репортерных клетках HEK-Blue(tm) IL6, обработанных 20 пМ IL-б и различными концентрациями (1) EBI-029 IgG2 (EBI029), продуцируемых в клетках НЕК-6Е, (2) EBI-030 IgG2 (EBI030), продуцируемых в клетках НЕК-6Е и (3) EBI-030 IgG2-H311A (ЕВЮЗО Н311А), продуцируемых в клетках НЕК-бЕ; (4) тоцилизумабом (TOCI) и (5) EBI-030 IgG2, продуцируемым в стабильном пуле СНО (EBI-030 СНО) .
Фиг.9 демонстрирует фармакокинетическую модель, описанную в Пример 2 0.
Фиг.10 демонстрирует влияние улучшеннения эффективности антитела на продолжительность ингибирования IL-б в глазу, как
смоделировано с использованием фармакокинетической модели, описанной в Примере 20.
Фиг.11 показывает концентрацию лекарственного средства в стекловидном теле для EBI-029, EBI-029-H311A, EBI-030, EBI-030-Н311А, Eylea(r) и тоцилизумаба (TCZ) как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.12 показывает концентрацию лекарственного средства в сетчатке для EBI-029, EBI-030, EBI-030-H311A, Eylea(r) и тоцилизумаба (TCZ) как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.13 показывает концентрацию лекарственного средства во внутриглазной жидкости для EBI-029, EBI-030, EBI-030-H311A,
Eylea(r) и тоцилизумаба (TCZ) как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.14 показывает концентрацию лекарственного средства в сосудистой оболочке глаза для EBI-029, EBI-030, EBI-030-H311A,
Eylea(r) и тоцилизумаба (TCZ) как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.15А демонстрирует положения FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4, СН1, шарнира, СН2 и СНЗ в последовательностях тяжелой цепи EBI-029 (SEQ ID NO: 11), EBI-030 (SEQ ID NO: 41) и EBI-031 (EBI-031 также упоминается в настоящем документе как EBI-030-Н311А) (SEQ ID NO: 47) .
Фиг.15В демонстрирует положения FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4 и СК в последовательности легкой цепи (EBI-029, EBI-030 и EBI-031 имеют одинаковую последовательность легкой цепи) (SEQ ID NO: 12).
Фиг.1бА показывает относительную величину передачи сигналов в репортерных клетках HEK-Blue(tm) IL-б, обработанных 2 0 пМ IL-б и различными концентрациями EBI-031 или тоцилизумаба.
Фиг.1бВ показывает относительную величину передачи сигналов в репортерных клетках HEK-Blue(tm) IL-б, обработанных 2 00 пМ гипер IL-б и различными концентрациями EBI-031 или тоцилизумаба.
Фиг.17 показывает результаты компьютерного моделирования, описанного в Примере 24.
Фиг.18 показывает схематическую диаграмму трех различных структурных изоформ антител IgG2, вызванных дисульфидным шаффлингом.
Фиг.19 показывает хроматограммы ВЭЖХ с обращенной фазой образцов EBI-031: необработанные (верхняя панель), 5 мМ DTT (средняя панель), 10 мМ цистеина (нижняя панель).
Фиг.20 показывает хроматограммы ВЭЖХ с обращенной фазой образцов EBI-031, собранных из различных линий клеток EBI-031: культура в масштабе 200 л клональной линии клеток (верхняя панель), культура в масштабе 10 л линии родительских клеток (средняя панель) и пул стабильно трансфицированных клеток (нижняя панель).
Фиг.21 показывает хроматограмму ВЭЖХ с обращенной фазой EBI-031, собранных из культуры в масштабе 200 л клональной линии клеток, и обозначает и количественно определяет какие именно изоформы представлены каждым пиком на хроматограмме.
Фиг.22А представляет собой график, показывающий фармакокинетические данные от Африканской зеленой мартышки (К797), как описано в Примере 26.
Фиг.22В представляет собой график, показывающий фармакокинетические данные от Африканской зеленой мартышки (К679), как описано в Примере 26.
Фиг.23 представляет собой график, показывающий как фармакокинетические данные от Африканских зеленых мартышек (К7 97 или К679), так и подгоночные кривые.
Фиг.24А показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в жидкой части стекловидного тела как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24В показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 во внутриглазной жидкости как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24С показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в сосудистой оболочке глаза как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24Б показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в конъюнктиве как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24Е показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в роговице как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24Б показывает концентрацию лекарственного средства of EBI-031 в цилиарном теле радужной оболочки как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.246 показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в хрусталике как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.24Н показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в сетчатке как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Фиг.241 показывает концентрацию лекарственного средства EBI-031 в склере как функцию времени после введения в стекловидное тело.
Подробное описание
IL-б описывается в качестве агента, играющего роль в ряде заболеваний, таких как ревматоидный артрит, и как сообщается, является значительно ап-регулируемым при ряде заболеваний, включая глазные заболевания. IL-б может действовать как по цис-, так и по транс-механизмам. При цис-механизме, считается, что свободный IL-б связывается со связанным с мембраной рецептором IL-б (IL-6R упоминается также как IL-6Ra и CD126), а затем комплекс IL-6/IL-6R взаимодействует с др130 (упоминается также как CD130, рецептор онкостатина М, IL-6R6eTa и переносчик сигналов IL-б), для активации передачи сигналов в клетке, содержащей комплекс. При транс-механизме, свободный IL-б связывается с растворимым рецептором IL-б (sIL-6R). Затем комплекс IL-6/sIL-6R может связываться с др130, присутствующими в мембране клетки. Ключевое различие между этими механизмами заключается в том, что др130 экспрессирует большее количество типов клеток, чем экспрессирует IL-6R, экспрессирование которого
является более ограниченным. По этой причине, при заболеваниях, при которых является желательным ингибирование передачи сигналов IL-б, например, при которых желательно в широком смысле ингибировать передачу сигналов IL-б, полезно ингибировать передачу сигналов как цис-, так и TpaHc-IL-б. Авторы настоящей заявки получили с помощью генной инженерии антагонисты IL-б, например, антитела анти-IL- б, фрагменты и производные, которые могут ингибировать передачу сигналов как цис-, так и TpaHc-IL-б. В дополнение к этому, авторы настоящей заявки получили с помощью генной инженерии такие антагонисты IL-б для достижения более быстрого системного выведения. Антагонисты IL-б, например, антитела против IL-б и их фрагменты или производные, описываются в WO2014/074905, полное содержание которой тем самым включаются в настоящий документ в качестве ссылки. Настоящее изобретение относится к улучшенным антителам против IL-6 и к их применениям.
Как используется в настоящем документе, термины в единственном числе включают и множественно число, если контекст четко не указывает иного.
Особенности антагонистов IL-6 (IL-6a)
Как правило, антагонист IL-б (IL-ба), описанный в настоящем документе, специфично связывается с сайтом II (сайтом 2) IL-б и является полезным при лечении глазного заболевания, связанного с IL-б, и определенных других заболеваний. Глазное заболевание, связанное с IL-б, представляет собой заболевание, при котором нежелательный симптом или биологическая активность заболевания ассоциируется с экспрессированием или присутствием IL-б. В некоторых вариантах осуществления IL-ба имеет высокое сродство, как к свободному, так и к связанному IL-б, и является относительно стабильным в организме, может ингибировать связывание с др130 IL-б связанного с IL-6R (в настоящем документе определяется как комплекс IL-6/IL-6R или IL-6/IL-6R), и может оказывать терапевтическое воздействие. Как правило, IL-ба представляет собой антитело или получается из антитела. Например, IL-ба представляет собой имеющий высокое сродство гуманизированный Fab, который может специфично связываться с сайтом II IL-б и мощно блокирует передачу сигналов как цис-, так
и транс-1Ъ-б. В другом примере, IL-ба представляет собой антитело полной длины, например, антитело IgGl или IgG2.
В некоторых вариантах осуществления, Fab также конфигурируется как последовательность Fc, полученная с помощью генной инженерии, или находится в антителе полной длины. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба с Fc, полученным с помощью генной инженерии (например, Fab с Fc, полученным с помощью генной инженерии) имеет более быстрое системное выведение, по сравнению с соответствующим контролем, например, по сравнению с соответствующим антителом, его фрагментом или производным, которое не имеет Fc, полученного с помощью генной инженерии. Эти и другие особенности IL-ба описываются далее в настоящем документе.
Авторы настоящей заявки разработали антагонисты IL-б, которые селективно связываются с сайтом II IL-6, для обеспечения в широком смысле ингибирования передачи сигналов IL-б, поскольку такие молекулы могут ингибировать связывание др13 0 с IL-б, независимо от того, является ли IL-б свободным или связанным с мембраной IL-6R или SIL-6R. Кроме того, нацеливание лиганда (IL-б) , в противоположность рецептору IL-б, может устранить медиируемое рецептором выведение и токсичность, вызываемую ADCC (антитело-зависимую клеточно-медиируемую цитотоксичность).
Поскольку IL-б играет как патологическую, так и защитную роли при заболевании, использование антагониста IL-б (IL-ба) для лечения заболевания, ассоциированного с повышенным уровнем IL-б, может улучшить определенные аспекты состояния, но может также вызывать значительные отрицательные воздействия, например, системные воздействия. Эта двойственность путей IL-б (то есть, способность оказывать желательные и/или нежелательные воздействия) может сделать нежелательным лечение расстройства, ассоциированного с IL-б, с помощью системного ингибитора. Соответственно, композиции и способы, предлагаемые в настоящем документе, могут быть полезными при лечении, которое ингибирует, по меньшей мере, одну активность IL-б, но не оказывает ненужного воздействия на положительные активности IL-б, в частности, поскольку композиции могут приготавливаться для локальной
доставки, например, для локальной доставки в глаз. Например, в определенных аспектах, IL-ба разрабатывается таким образом, чтобы он имел размер пригодный для доставки в конкретное место. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба представляет собой антитело полной длины. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба получается из антитела, и оно имеет формат, который может иметь более продолжительное удерживание в стекловидном теле глаза и ограниченную системную утечку. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба представляет собой модифицированное антитело (например, антитело с модифицированным доменом Fc) , которое имеет более продолжительное удерживание в стекловидном теле глаза и/или более ограниченную системную утечку по сравнению с соответствующим немодифицированным антителом. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба представляет собой антитело IgG2.
В некоторых аспектах, IL-ба представляет собой относительно малый IL-ба, такой как фрагмент антитела или другое производное антитела, которое меньше чем антитело полной длины, например, Fab, который получают из антитела против IL-б. В некоторых случаях, IL-ба представляет собой формат, который может проходить из одной части ткани в другую с улучшенной кинетикой по сравнению с соответствующим антителом против IL-б полной длины. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба представляет собой Fab, который получают с помощью генной инженерии таким образом, чтобы он представлял собой молекулу больших размеров, которая с большей вероятностью имеет повышенное удерживание в том положении, в которое она доставляется, по сравнению с Fab самим по себе, например, IL-ба димеризуется с помощью домена Fc. В определенных вариантах осуществления, домен Fc получают с помощью генной инженерии таким образом, что остаток Fc имеет уменьшенную массу или уменьшенное связывание с FcRn, что может уменьшить системную аккумуляцию по сравнению с таким же объектом связывания IL-б, который содержит Fc дикого типа. Домен Fc, полученный с помощью генной инженерии, может представлять собой, например, домен IgGl или домен IgG2.
Как правило, антагонисты IL-б, описанные в настоящем документе, имеют достаточно высокое сродство к их мишени IL-б, чтобы они были эффективными при ослаблении, по меньшей мере, одного нежелательного воздействия IL-б и были достаточно стабильными для того, чтобы они были пригодными для использования в качестве терапевтических средств.
Как правило, РК IL-ба, например, IL-ба пригодного для использования в глазу, имеет достаточно длительное время полужизни в месте доставки, например, стекловидном теле, для оказания терапевтического воздействия. В неограничивающих примерах, РК может соответствоватьвремени полужизни, по меньшей мере, 8 дней, 10 дней, 14 дней, 21 дней, 28 дней или 30 дней.
Идентификация связывания антагонистов IL-6 с сайтом II
Как правило, любой способ известный в данной области может использоваться для генерирования молекулы, которая может связываться с IL-б, например, библиотеки полипептидов или молекулярные библиотеки могут просматриваться относительно соединений кандидатов при анализе способности полипептида или соединения к связыванию с IL-б. После определения такого соединения кандидата, сайт связывания соединения может определяться с использованием способов известных в данной области. Например, молекула может исследоваться относительно способности связываться с IL-б дикого типа, и это связывание сравнивается со способностью соединения к связыванию с IL-б, мутировавшим на сайте I, сайте II или сайте III. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, как описано в настоящем документе, сохраняет способность к связыванию с комплексом IL-6/IL-6R.O. и с IL-б и предотвращает связывание IL-6/IL-6R.OC с др130. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, как описано в настоящем документе, может конкурировать с др13 0 за связывание с комплексом IL-б/IL-6Ra, например, посредством связывания с сайтом II IL-б. Такие активности связывания могут анализироваться с использованием способов, известных в данной области.
Кандидаты в IL-ба могут исследоваться, например, с помощью системы анализов с использованием HEK-Blue(tm) IL-б (InvivoGen, San Diego). Клетки HEK-Blue(tm) IL-б представляют собой клетки НЕК2 93, которые стабильно трансфицированы IL-6R человека и STAT3-индуцируемым репортерным геном SEAP. В присутстви IL-б, STAT3 активируется, и секретируется SEAP. SEAP оценивается с использованием, например, QUANTI-Blue(tm) (InvivoGen, San Diego). Добавление антагониста IL-б к клеткам предотвращает секрецию SEAP или уменьшает его уровень в результате ингибирования как свободного, так и связанного с растворимыми рецепторами IL-б.
KD относится к константе равновесия сродства связывания конкретного взаимодействия антитело-антиген или взаимодействия фрагмент антитела-антиген. В некоторых вариантах осуществления, антитело или антигенсвязывающий фрагмент, описанный в настоящем документе, связывается с антигеном (например, IL-б) с К D, которая равна или меньше чем 250 пМ, например, равна или меньше чем 225 пМ, 220 пМ, 210 пМ, 205 пМ, 150 пМ, 100 пМ, 50 пМ, 20 пМ, 10 пМ или 1 пМ. KD может определяться с использованием способов, известных в данной области, например, с использованием поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием системы BiaCore(tm).
Koff относится к постоянной скорости диссоциации конкретного взаимодействия антитело-антиген или комплекса фрагмент антитела-антиген. Постоянная скорости диссоциации может определяться с использованием поверхностного плазмонного резонанса, например, с использованием системы BiaCore(tm). Относительно малая Koff может вносить вклад в желательные особенности терапевтического средства, например, делая возможным менее частое введение ингибитора субъекту, нуждающемуся в таком лечении.
Специфичность
В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, описанный в настоящем документе, специфично связывается с мишенью, например, с IL-б. Как правило, "специфичное связывание", как используется в настоящем документе, указывает, что молекула преимущественно связывается с выбранной молекулой и демонстрирует гораздо более
низкое сродство связывания с одной или несколькими другими молекулами. В некоторых вариантах осуществления, сродство связывания с другой молекулой на 1, 2, 3 или больше порядков величины ниже, чем сродство связывания с мишенью.
Как обсуждается выше, IL-б может присутствовать как свободный IL-б, так и IL-б, связанный с растворимым IL-6Ra. Авторы настоящей заявки определили сайт II IL-б в качестве оптимальной мишени для антагониста IL-б, по сравнению с ингибитором, который связывается с сайтом I IL-б. Ингибитор сайта I может ингибировать связывание свободного IL-б с IL-6Ra. Однако такой ингибитор не может предотвращать активность, инициируемую посредством ранее существующих комплексов IL-6/IL-6R, за исключением замещения, ограничиваемого koff комплекса. Другая альтернатива, ингибитор, который связывается с IL-6Ra, является менее пригодным для использования, поскольку он может обладать ограниченной способностью к предотвращению активности IL-б, если только он не присутствует в насыщающих концентрациях. Поскольку количество рецептора IL-б, как правило, является исключительно высоким по сравнению с количеством IL-б, этот подход может потребовать введения нежелательно большого количества композиции, которая ингибирует активность IL-б посредством связывания с рецептором. В некоторых вариантах осуществления, антагонисты IL-б, описанные в настоящем документе (например, антитела и их фрагменты, и производные, описанные в настоящем документе), могут блокировать активность IL-б, даже когда IL-б связан с IL-6R. Соответственно, преимущество IL-ба, как описано в настоящем документе, заключается в том, что может потребоваться относительно меньшее количество композиции для введения с целью достижения терапевтического воздействия, по сравнению с ингибитором, нацеленным на рецептор IL-б. Антитела анти-рецептор, как сообщается, могут быстро выводиться посредством выведения, медиируемого рецептором, значительно ограничивая их РК, при этом требуются более высокие дозы, более частое дозирование или как то, так и другое. В дополнение к этому, антитела как анти-рецептор, так и анти-сайт I IL-б
доставляют ту проблему, что они значительно увеличивают концентрацию IL-б в тканях посредством разрушения нормального медиируемого рецепторами пути выведения лиганда, тем самым экспонируя субъекта для потенциально нежелательных уровней IL-б в тканях. Кроме того, использование ингибитора, нацеленного на IL-6R.0C, может сделать необходимым присутствие ингибитора как вблизи сайта, на котором предполагается ингибирование, так и на сайте, для которого это является нежелательным, например, как системное лечение. Использование IL-ба, который связывает сайт II, сайт, с которым связывается др130, делает возможным ингибирование с помощью свободного IL-б, а также IL-б, который связан с IL-6R, но еще и не активирует путь IL-б посредством др130. Соответственно, без желания ограничиваться теорией, антагонисты IL-б, описанные в настоящем документе, разрабатываются для связывания обеих форм IL-б (растворимого и связанного с рецептором), конкретно, антагонисты IL-б связываются с сайтом II IL-б, который доступен в обеих формах. Композиции, содержащие IL-ба, как описано в настоящем документе, могут ингибировать передачу сигналов как цис-, так и TpaHc-IL-б.
В некоторых случаях соединения и способы, предлагаемые в настоящем документе, разрабатываются для обеспечения эффективной блокады IL-б, достаточной для лечения, по меньшей мере, одного признака или симптома расстройства, ассоциированного с IL-б, например, для ингибирования ангиогенеза и/или воспаления.
Соединения, описанные в настоящем документе, являются пригодными для использования при лечении глазных заболеваний, характеризуемых нежелательно высоким уровнем IL-б, например, в стекловидном теле (смотри Yuuki et al., J Diabetes Compl 15:257 (2001); Funatsu et al., Ophthalmology 110: 1690,(2003); Oh et al., Curr Eye Res 35:1116 (2010); Noma et al., Eye 22:42 (2008); Kawashima et al. , Jpn J Ophthalmol 51:100 (2007); Kauffman et al., Invest Ophthalmol Vis Sci 35:900 (1994); Miao et al., Molec Vis 18:574(2012)).
Как правило, IL-ба, как описано в настоящем документе, представляет собой сильнодействующий антагонист передачи
сигналов IL-б. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, описанный в настоящем документе, имеет высокое сродство к IL-б, например, IC50 равное или меньше чем 100 пМ при анализе с использованием HEK-Blue IL-б с 10 пМ IL-б. Высокое сродство IL-ба можно определить на основе KD IL-ба, например, значения KD равного или меньшего, чем 1 нМ, равного или меньшего, чем 500 пМ, равного или меньшего, чем 400 пМ, равного или меньшего, чем 300 пМ, равного или меньшего, чем 24 0 пМ или равного или меньшего, чем 2 00 пМ.
Для продуцирования биологического IL-ба (например, белка
или полипептида, такого как антитело, его фрагмент или
производное), который является пригодным для использования при
лечении расстройства, ассоциированного с увеличением
экспрессирования или активности IL-б, как правило, желательно, чтобы биологический IL-ба имел высокую продуктивность. Например, пригодная для использования продуктивность равна или больше чем 1 г/л (например, равна или больше чем 2 г/л, равна или больше чем 5 г/л или равна или больше чем 10 г/л).
Для эффективного введения антагониста IL-б, необходимо, чтобы ингибитор имел растворимость совместимую с концентрацией, при которой он будет вводиться. Например, в случае антитела IL-ба полной длины, растворимость равна или больше чем 2 0 мг/мл, равна или больше чем 10 мг/мл, равна или больше чем 5 мг/мл или равна или больше чем 1 мг/мл.
Кроме того, для осуществления жизнеспособного лечения, ингибитор должен иметь высокую стабильность при температуре тела для мест доставки и активности, а также стабильность при хранении. В некоторых вариантах осуществления, ингибитор имеет Тт равную или большую, чем 60°С (например, равную или большую, чем 60°С, равную или большую, чем 62,5°С, равную или большую, чем 65°С, равную или большую, чем 70°С, равную или большую, чем 73°С или равную или большую, чем 7 5°С) . В некоторых вариантах осуществления, ингибитор имеет Tonset равную или большую, чем 4 5°С, например, равную или большую, чем 50°С, равную или большую, чем 51°С, равную или большую, чем 55°С или равную или большую,
чем 60°С. Способы определения Тт и Tonset могут определяться с использованием способов, известных в данной области.
Антагонисты, имеющие желаемые особенности, могут выбираться из соответствующих типов молекул, известных в данной области, например, из антител, включая фрагменты и производные антитела, нацеленного на сайт II IL-б, которое, как правило, удерживает или сохраняет существенные особенности исходного антитела против IL-б (например, желаемые свойства связывания). Такие антагонисты включают фрагменты Fab, фрагменты scFvs, Fab полученные с помощью генной инженерии таким образом, чтобы они содержали остаток Fc, и антитела полной длины, полученные с помощью генной инженерии таким образом, чтобы они имели каркас отличный от исходного антитела, нацеленного на сайт II IL-б.
В некоторых аспектах, IL-ба, описанный в настоящем документе, содержит сайт связывания антигена антитела человека, который может конкурировать или перекрестно конкурировать с антителом или его фрагментом, который может связываться с сайтом II IL-б. Например, антитело или его фрагмент может состоять из домена VH и домена VL, описанных в настоящем документе, и домены VH и VL содержат набор CDR антитела, связывающего сайт II IL-б, описанный в настоящем документе.
Любой пригодный для использования способ можно использовать для определения домена и/или эпитопа, связанного с помощью IL-ба, например, посредством мутации различных сайтов на IL-б. Это те сайты, мутации которых либо предотвращают или уменьшают связывание IL-ба и лиганда IL-б, либо непосредственно вовлечены в связывание с IL-ба, либо опосредованно влияют на сайт связывания, например, посредством влияния на конформацию IL-б. Другие способы можно использовать для определения аминокислот, связанных с помощью IL-ба. Например, можно использовать сканирование с пептидным связыванием, такое как иммуноанализ со связанными ферментами на основе PEPSCAN (ELISA). При сканировании с пептидным связыванием этого типа, короткие перекрывающиеся пептиды, полученные из антигена, систематически просматриваются относительно связывания с элементом связывания.
Пептиды могут быть ковалентно связаны на поверхности подложки с формированием пептидной матрицы. Пептиды могут находиться в линейной или ограниченной конформации. Ограниченная конформация может быть получена с использованием пептидов, имеющих конечный цистеиновый (цис) остаток на каждом конце пептидной последовательности. Цис-остатки могут ковалентно связываться непосредственно или опосредованно с поверхностью подложки таким образом, что пептид поддерживается в петлевой конформации. Соответственно, пептид, используемый в этом способе, может иметь цис остаток, добавленный на каждом конце последовательности пептидов, соответствующей фрагменту антигена. Могут также использоваться пептиды с двойной петлей, в которых цис остаток дополнительно располагается в середине последовательности пептидов или вблизи нее. Цис-остатки могут ковалентно связываться непосредственно или опосредованно с поверхностью подложки таким образом, что пептиды формируют двойную петлевую конформацию, с одной петлей по каждую сторону от центрального цис остатка. Пептиды могут генерироваться синтетически, и, следовательно, цис остатки могут быть получены с помощью генной инженерии в желаемых положениях, несмотря на то, что они не встречаются в природе в последовательности сайта II IL-б. Необязательно, как линейные, так и ограниченные пептиды могут просматриваться в анализе с пептидным связыванием. Сканирование с пептидным связыванием может включать идентификацию (например, с использованием ELISA) набора пептидов, с которым связывается элемент связывания, где пептиды имеют последовательности аминокислот, соответствующие фрагментам IL-ба (например, пептиды, которые содержат примерно 5, 10 или 15 смежных остатков IL-ба), и выравнивание пептидов для определения области узнавания остатков, связанных с элементом связывания, где область узнавания содержит остатки общие для перекрывающихся пептидов. Альтернативно или в дополнение к этому, способ сканирования с пептидным связыванием можно использовать для идентификации пептидов, с которыми IL-ба связывается при наименьшем выбранном отношении сигнал:шум.
Другие способы, известные в данной области, можно использовать для определения остатков, связанных посредством антитела, и/или для подтверждения результатов сканирования с пептидным связыванием, включая, например, сайт-направленный мутагенез (например, как описано в настоящем документе), водородно-дейтериевый обмен, масс-спектрометрию, ЯМР и рентгеновскую кристаллографию.
Как правило, IL-ба пригодный для использования, как описано в настоящем документе, представляет собой молекулу антитела человека, молекулу гуманизированного антитела или их фрагмент связывания. Как правило, антитело представляет собой моноклональное антитело. Источник такого антитела может представлять собой человека, мышиных, крысу, верблюдовых, кролика, овечьих, свиней или крупный рогатый скот, и оно может генерироваться в соответствии со способами, известными в данной области.
Как правило, IL-ба содержит, по меньшей мере, CDR антитела, которое может специфично связываться с IL-б (например, IL-б человека), например, с сайтом II IL-б. Структура, несущая CDR или набор CDR по настоящему изобретению, может представлять собой последовательность тяжелой или легкой цепи антитела или значительную ее часть, в которой CDR или набор CDR располагается в положении, соответствующем CDR или набору CDR вариабельных доменов, встречающихся в природе VH и VL антитела, кодируемым перегруппированным генами иммуноглобулина. Структуры и положения вариабельных доменов иммуноглобулина можно определить по ссылке Rabat, et al., 1983 (National Institutes of Health), и ее обновлениям, которые можно найти по ссылке "Rabat", с использованием любой поисковой машины в Интернете.
IL-ба, как описано в настоящем документе, как правило, представляет собой антитело, которое, как правило, содержит домен VH и/или домен VL антитела. Домен VH содержит набор CDR тяжелой цепи (CDR VH), и домен VL содержит набор CDR легкой цепи (CDR VL) . Примеры таких CDR приведены в настоящем документе в Примерах. Молекула антитела может содержать домен VH антитела, содержащий CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH и каркас. Альтернативно
или в дополнение к этому, оно может также содержать домен VL антитела, содержащий CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL и каркас.
В настоящем документе описаны антагонисты IL-б, содержащие CDR1 VH и/или CDR2 VH и/или CDR3 VH, такие как те, которые описаны в настоящем документе, и/или CDR1 VL и/или CDR2 VL и/или CDR3 VL, такие как те, которые описаны в настоящем документе. IL-ба может содержать один или несколько CDR любого из антител, фрагментов или производных, описанных в настоящем документе. IL-ба может содержать набор CDR VH (например, CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH), и необязательно оно может также содержать набор CDR VL (например, CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL) . CDR могут быть получены от одного или нескольких антител, фрагментов или производных, описанных в настоящем документе. Например, CDR VL могут быть получены из того же антитела, что и CDR VH или из другого антитела.
Как правило, домен VH спаривается с доменом VL для получения сайта связывания антигена у антитела. Например, домен НС SEQ ID N0:1 или SEQ ID N0:3 спаривается с доменом LC SEQ ID N0:2. В некоторых случаях, домен VH или VL сам по себе может использоваться в качестве IL-ба.
В некоторых аспектах, IL-ба представляет собой молекулу антитела, ее фрагмент или производное, которое содержит (i) последовательность домена VH, которая имеет, по меньшей мере, 60, 70, 80, 85, 90, 95, 98 или 99% идентичность последовательности аминокислот с доменом VH, описанным в настоящем документе (например, SEQ ID N0:37), или (ii) набор CDR VH (например, CDR1 VH, CDR2 VH и/или CDR3 VH) из последовательности домена VH. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела, ее фрагмент или производное содержит CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH SEQ ID N0:37. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела, ее фрагмент или производное содержит CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH, которые коллективно отличаются от CDR1 VH, CDR2 VH и CDR3 VH SEQ ID N0:37 не более чем на 1, не более чем на 2, не более чем на 3, не более чем на 4 или не более чем на 5 аминокислот.
Молекула антитела, ее фрагмент или производное может также необязательно содержать (i) последовательность домена VL, которая имеет, по меньшей мере, 60, 70, 80, 85, 90, 95, 98 или 99% идентичность последовательности аминокислот с доменом VL, описанным в настоящем документе, например, с доменом VL SEQ ID NO: 38 или (ii) набор CDR VL (например, CDR1 VL, CDR2 VL и/или CDR3 VL) из домена VL. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела, ее фрагмент или производное содержит CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL SEQ ID NO: 38. В некоторых вариантах осуществления, молекула антитела, ее фрагмент или производное содержит CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL, которые коллективно отличаются от CDR1 VL, CDR2 VL и CDR3 VL SEQ ID N0:38 не более чем на 1, не более чем на 2, не более чем на 3, не более чем на 4 или не более чем на 5 аминокислот. Алгоритмы, которые можно использовать для вычисления процента идентичности двух последовательностей аминокислот включают, например, BLAST, FASTA или алгоритм Смита-Вотерма, например, с использованием параметров по умолчанию.
IL-ба, как описано в настоящем документе, может содержать
константные области антитела или их части, например, константные
области антитела человека или их части. Например, домен VL может
присоединяться на своем С-конечном краю к константным доменам
легкой цепи антитела, включая цепи СК или CL человека. Подобным
же образом, IL-ба на основе домена VH может присоединяться на
своем С-конечном краю ко всей тяжелой цепи иммуноглобулина,
полученной от любого изотипа антитела или ее части (например, к
домену СН1), например, IgG, IgA, IgE и IgM и из любого из
подклассов изотипа, в частности, IgGl, IgG2, IgG3 и IgG4. В
некоторых вариантах осуществления, антитело или
антигенсвязывающий фрагмент получают с помощью генной инженерии для уменьшения или устранения активности ADCC.
В одном из вариантов осуществления, антитело по настоящему изобретению представляет собой антитело IgG2. В одном из вариантов осуществления, антитело по настоящему изобретению содержит каркас IgG2, константную область IgG2 или область Fc IgG2, как описано в настоящем документе.
Антитела IgG2 могут существовать в трех главных структурных изоформах: IgG2-A, IgG2-B, и IgG2-A/B (Wypych J. et al. Journal of Biological Chemistry. 2008, 283:16194-16205). Эта структурная гетерогенность связана с различными конфигурациями дисульфидных связей, которые связывают плечи Fab с областью шарнира тяжелой цепи. В изоформе IgG2-A нет дисульфидных связей, связывающих плечи Fab с областью шарнира. В изоформе IgG2-B, оба плеча Fab имеют дисульфидные связи, связывающие тяжелую и легкую цепь с областью шарнира. Изоформа IgG2-A/B представляет собой гибрид изоформ IgG2-A и IgG2-B, где только одно плечо Fab, имеет дисульфидные связи, связывающие тяжелую и легкую цепь одного плеча Fab с областью шарнира. Пребразование антитела IgG2 между двумя или всеми различными структурными изоформами, упоминается также как дисульфидный шаффлинг, он осуществляется в природе in vivo и in vitro, как для встречающихся в природе, так и для рекомбинантных антител. В результате, препараты антител IgG2 в данной области содержат гетерогенную смесь изоформ IgG2-A, IgG2-В и IgG2-A/B. Различные изоформы IgG2 могут иметь уникальные и различные функциональные свойства, такие как различия стабильности, агрегации, вязкости, связывания рецептора Fc или эффективности. Присутствие множества изоформ или повышенные уровни конкретной изоформы в препарате антитела IgG2 может отрицательно влиять на стабильность, агрегацию илиэффективность.
Настоящее изобретение предлагает антитело с
преимущественным существованием в основном в изоформе IgG2-A или IgG2-A/B. Антитело по настоящему изобретению не существует в изоформе IgG2-B, или оно не существует в изоформе IgG2-B в течение существенного периода времени. Таким образом, композиции и препараты, содержащие антитело по настоящему изобретению, являются менее гетерогенными чем другие антитела IgG2, известные в данной области, и, следовательно, они являются более предпочтительными для использования в терапевтических применениях.
Композиции, содержащие антитело по настоящему изобретению, содержат в основном изоформы антитела IgG2-A и/или IgG2-A/B. В одном из вариантов осуществления, композиция, содержащая
антитело, описанная в настоящем документе, содержит, по меньшей мере, 50, 60, 70, 80, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% изоформ антитела IgG2-A или IgG2-A/B. В одном из вариантов осуществления, композиция, содержащая антитело, описанная в настоящем документе, содержит коллективно, по меньшей мере, 60, 70, 80, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% изоформ IgG2-A и IgG2-A/B. В таких вариантах осуществления, композиция, содержащая антитело, описанная в настоящем документе, не содержит никакого существенного количества изоформ IgG2-B антитела. Например, композиция содержит меньше чем 10%, 5%, 2%, 1%, 0,5% или 0,1% изоформ IgG2-B антитела.
В некоторых случаях, антитело по настоящему изобретению дополнительно модифицируется с использованием способов, известных в данной области, для создания последовательности, имеющей конкретный аллотип, например, аллотип, который преобладает в популяции, имеющей конкретное географическое происхождение. В некоторых случаях, константная область тяжелой цепи человека модифицируется для этой цели.
IL-ба может представлять собой молекулу антитела, ее фрагмент связывания или вариант, имеющий одну или несколько CDR, например, набор CDR, в каркасе антитела. Например, одна или несколько CDR или набор CDR антитела (например, антитела или его фрагмента или производного, как описано в настоящем документе) , может прививаться на каркас (например, на каркас человека) для получения молекул антитела. Области каркаса могут быть получены из последовательностей гена зародышевой линии человека или иметь источник отличный от зародышевой линии.
Остатки каркаса VH и/или VL могут модифицироваться, как обсуждается и иллюстрируется в настоящем документе, например, с использованием сайт-направленного мутагенеза.
Изменения аминокислот могут осуществляться в одной или нескольких областях каркаса и/или в одной или нескольких областях CDR, полученных из антитела IL-ба, нацеленного на сайт II IL-б (определяется в настоящем документе как "эталонное антитело против IL-б") с использованием способов и параметров,
известных в данной области. Также, в настоящий документ включается полученный в результате антагонист IL-б, который сохраняет связывание с сайтом II IL-б (например, с сайтом II IL-б человека) и, как правило, имеет, по меньшей мере, такое же связывание или повышенное сродство, по сравнению с эталонным антителом против IL-б. В некоторых случаях, для улучшения такого параметра, как стабильность, может вводиться изменение, которое дает в результате уменьшение сродства связывания полученного IL-ба, по сравнению с эталонным IL-ба (например, с эталонным антителом), для создания пригодного для использования IL-ба. В некоторых вариантах осуществления, например, в некоторых случаях, в которых сравнение относится к связыванию FcRn или к фармакокинетическому (РК) параметру, такому как время полужизни в стекловидном теле, или к системному времени полужижни (например, в крови, плазме, сыворотке, лимфе, печени, почках, других тканях или телесных жидкостях), эталонное антитело может представлять собой антитело, которое не связывается специфично с IL-б.
Изменение последовательности аминокислот полипептида IL-ба может включать замещение одного или нескольких остатков аминокислот с не встречающейся в природе или нестандартной аминокислотой, модификацию одного или нескольких остатков аминокислот до не встречающейся в природе или нестандартной формы или вставку одной или нескольких не встречающих в природе или нестандартных аминокислот в последовательность. Примеры количеств и положений изменений в последовательностях по настоящему изобретению описываются в настоящем документе в другом месте. Встречающиеся в природе аминокислоты включают 2 0 "стандартных" L-аминокислот, идентифицируемых как G, А, V, L, I, М, Р, F, W, S, Т, N, Q, Y, С, К, R, Н, D, Е по их стандартным однобуквенным кодам. Нестандартные аминокислоты включают любой другой остаток, который может вводиться в основную полипептидную цепь или получаться в результате модификации существующего аминокислотного остатка. Нестандартные аминокислоты могут быть встречающимися в природе или не встречающимися в природе. Несколько встречающихся в природе нестандартных аминокислот
известны в данной области, например, 4-гидроксипролин, 5-
гидроксилизин, 3-метилгистидин и N-ацетилсерин. Остатки
аминокислот, которые дериватизуются в их N-альфа положении,
будут располагаться только на N-окончании последовательности
аминокислот. Аминокислота, как правило, представляет собой L-
аминокислоту. В некоторых случаях аминокислота представляет
собой D-аминокислоту. Следовательно, изменение может включать
модификацию L-аминокислоты до D-аминокислоты или ее замену D-
аминокислотой. Метилированные, ацетилированные и/или
форсфорилированные формы аминокислот также являются известными, и аминокислоты по настоящему изобретению могут подвергаться воздействию такой модификации.
Последовательности аминокислот в доменах антитела и элементах связывания по настоящему изобретению могут содержать не встречающиеся в природе или нестандартные аминокислоты, как обсуждается в настоящем документе. Нестандартные аминокислоты (например, D-аминокислоты) могут вводиться в последовательность аминокислот с использованием способов известных в данной области, например, при синтезе молекулы или с помощью модификации или замены аминокислоты после синтеза. В некоторых случаях, D-аминокислоту используют для увеличения РК IL-ба.
Новые области VH или VL, несущие полученные из CDR последовательности по настоящему изобретению, могут генерироваться с использованием случайного мутагенеза одной или нескольких выбранных последовательностей нуклеиновых кислот VH и/или VL для генерирования мутаций во всем вариабельном домене. Например, можно использовать допускающую ошибки PCR (Chao et al. , Nature Protocols, 1:755-768 (2006)) . В некоторых вариантах осуществления замещения одной или двух аминокислот осуществляют во всем вариабельном домене или в наборе CDR. Другие способы, известные в данной области, можно использовать для генерирования мутаций, например, сайт-направленный мутагенез, как правило, в одной или нескольких CDR.
Один из способов продуцирования антитела IL-ба, заключается в замене домена VH, такого как описывается в настоящем документе, посредством добавления, делеции, замещения или
инсерции одной или нескольких аминокислот. Измененный домен VH может объединяться с доменом VL (например, с доменом VL, описанным в настоящем документе), который может также изменяться, как описано в настоящем документе, и с использованием способов, известных в данной области. Такие измененные молекулы исследуют на их способность связываться с сайтом II IL-б и, необязательно, на другие желаемые свойства, такие как повышенное сродство по сравнению с эталонной молекулой. В некоторых случаях, вариант VH или домен VL может иметь 1, 2, 3, 4 или 5 таких изменений (например, 1, 2, 3, 4 или 5 замещений аминокислот).
В некоторых вариантах осуществления, IL-ба по настоящему изобретению представляет собой фрагмент антитела, который связывается с сайтом II IL-б и содержит сайт связывания антигена, например, может связываться с сайтом II IL-6. Фрагменты антитела по настоящему изобретению, как правило, получают, начиная с эталонной (исходной) молекулы антитела, такой как молекула антитела, содержащая SEQ ID N0:41 и SEQ ID N0:42. Фрагменты антитела могут генерироваться с использованием способов, известных в данной области, таких как рекомбинантная ДНК, ферментативное расщепление (например, с использованием пепсина или папаина), химическое расщепление антитела (например, химическое восстановление дисульфидных мостиков). Фрагменты антитела, которые содержат сайт связывания антигена антитела, включают, но, не ограничиваясь этим, такие молекулы, как Fab, Fab', Fab'-SH, scFv, Fv, dAb, Fd и дисульфидно стабилизированная вариабельная область (dsFv). С помощью генной инженерии, могут быть получены различные другие молекулы антитела, содержащие один или несколько сайтов связывания антигена антитела, включая
например, F(ab')2, F(ab)3, диатела, триотела, тетратела и миниантитела. Примеры молекул антител и способов их конструирования и использования описаны в Holliger and Hudson, 2005, Nat Biotechnol 23:1126-1136. Неограничивающие примеры фрагментов связывания представляют собой фрагмент Fab, состоящий из VL, VH, константный домен легкой цепи (CL) и константный
домен 1 тяжелой цепи доменов (СН1); фрагмент Fd, состоящий из доменов VH и СН1; фрагмент Fv, состоящий из доменов VL и VH одного антитела; фрагмент dAb, состоящий из домена VH или VL; выделенные области CDR; фрагмент F(ab')2, двухвалентный фрагмент, содержащий два связанных фрагмента Fab; одноцепочечную молекулу Fv (scFv), в которой домен VH и домен VL связаны пептидным линкером, который делает возможной ассоциацию двух доменов с образованием сайта связывания антигена; биспецифичный димер одноцепочечных Fv (например, как описано в W0 1993/011161) и диатело, которое представляет собой многовалентный или мультиспецифичный фрагмент, сконструированный с использованием слияния генов (например, как описано в WO94/13804). Молекулы Fv, scFv или диатела могут стабилизироваться посредством введения дисульфидных мостиков, связывающих домены VH и VL. Миниантитела, содержащие scFv, соединенные с доменом СНЗ, также можно использовать в качестве IL-ба. Другие фрагменты и производные антитела, которые можно использовать в качестве IL-ба, включают Fab', который отличается от фрагмента Fab добавлением нескольких остатков аминокислот на карбоксильном окончании домена СН1 тяжелой цепи, включая один или несколько цистеинов из области шарнира антитела, и Fab'-SH, который представляет собой фрагмент Fab', в котором цистеиновый остаток (остатки) константных доменов несет свободную тиольную группу.
В некоторых случаях, IL-ба, который представляет собой фрагмент антитела, химически модифицируется для улучшения или введения желаемого свойства, например, с помощью РЕбилирования для увеличения времени полужижни или удерживания.
dAb (домен антитела) представляет собой малый мономерный антигенсвязывающий фрагмент у антитела (вариабельная область тяжелой или легкой цепи антитела. dAb VH встречаются в природе у верблюдовых (например, у верблюдов и у лам) и могут быть получены посредством иммунизации верблюдового с помощью целевого антигена, выделения антиген-специфичных В лимфоциттов и прямого клонирования генов dAb от индивидуальных В лимфоцитов. IL-ба по настоящему изобретению может представлять собой dAb, содержащий домен VH или VL, по существу, как приводится в настоящем
документе, или домен VH или VL, содержащий набор CDR, по существу, как приводится в настоящем документе.
Антитела по настоящему изобретению включают биспецифичные
антитела, в которых две различных вариабельных области
объединяются в одной молекуле. IL-ба может вводиться как часть
биспецифичного антитела, полученного с использованием способов,
известных в данной области, например, приготавливаться химически
или из гибридных гибридом. Такая молекула может представлять
собой фрагмент биспецифичного антитела типа, обсуждаемого выше.
Один из неограничивающих примеров способа генерирования
биспецифичного антитела представляет собой технологию BiTE(tm), в
которой домены связывания двух антител с различной
специфичностью можно использовать и непосредственно связывать с
помощью коротких гибких пептидов. Это объединяет два антитела на
одной короткой полипептидной цепи. Диатела и scFv могут
конструироваться без области Fc, с использованием только
вариабельных доменов, потенциально уменьшая воздействия анти-
идиотипической реакции. Биспецифичные антитела могут
конструироваться как целые IgG, как биспецифичные Fab'2, как Fab'PEG, как диатела или, кроме того, как биспецифичные scFv. Кроме того, два биспецифичных антитела могут связываться с использованием рутинных способов, известных в данной области, с образованием четырехвалентных антител.
Биспецифичные диатела, в отличие от биспецифичных цельных антител, являются полезными, отчасти потому, что они могут конструироваться и экспрессироваться в Е. coli. Диатела (и многие другие полипептиды, такие как фрагменты антитела) с соответствующими специфичностями связывания могут легко выбираться посредством селекции с использованием фагового дисплея (W0 1994/13804) из библиотек. Если одно плечо диатела должно поддерживаться константным, например, со специфичностью, направленной на сайт II IL-б, тогда может быть получена библиотека, где другое плечо изменяется и осуществляется селекция антитела с соответствующей специфичностью.
Биспецифичные цельные антитела могут быть получены с помощью альтернативных способов генной инженерии, как описано в описании в WO 1996/27011, WO 1998/50431 и WO 2006/028936.
В некоторых случаях, IL-ба по настоящему изобретению содержит сайт связывания антигена в молекуле, отличной от антитела, например, посредством введения одной или нескольких CDR, например, набора CDR, в скелет белка, отличного от антитела, как дополнительно обсуждается ниже. В некоторых случаях, CDR вводятся в скелет молекулы, отличной от антитела. Сайт связывания с сайтом II IL-б может создаваться посредством размещения CDR на скелетах белков, отличных от антитела, таких как фибронектин или цитрохром В, или посредством рандомизации или мутаций остатков аминокислот в петлях в скелете белка с целью придания специфичности связывания с сайтом II IL-б. Скелеты для получения с помощью генной инженерии новых сайтов связывания в белках, известны в данной области. Например, белковые скелеты для воспроизведения свойств антител описаны в WO200034784, которая описывает белки (воспроизводящие свойства антител), которые включают домен фибронектина типа III, имеющий, по меньшей мере, одну рандомизированную петлю. Пригодный для использования скелет, на который должна прививаться одна или несколько CDR, например, набор HCDR, может быть создан с помощью любого элемента домена суперсемейства генов иммуноглобулинов. Скелет может представлять собой белок человека или существа, отличного от человека. Преимущество скелетов белков отличных от антитела заключается в том, что они могут обеспечить сайт связывания антигена на скелете молекулы, которая меньше и/или проще для получения чем, по меньшей мере, некоторые молекулы антител. Малый размер элемента связывания может придавать полезные физиологические свойства, такие как способность к проникновению в клетки, к проникновению глубоко в ткани или к достижению мишеней в других структурах или к связыванию в белковых полостях целевого антигена. Типичными являются белки, имеющие стабильную основную цепь и одну или несколько вариабельных петель, в которых последовательность аминокислот петли или петель специфично или случайным образом мутирует для
создания сайта связывания антигена, который связывает целевой антиген. Такие белки включают домены связывания IgG белка А от S. aureus, трансферрина, тетранектина, фибронектина (например, с использованием 10-ого домена фибронектина типа III), липокалинов, а также гамма-кристаллические и другие скелеты Affilin(tm) (Scil Proteins, Halle, Germany). Примеры других подходов включают синтетические микроантитела на основе циклотидов - малых белков, имеющих внутримолекулярные дисульфидные связи, микропротеинов (например, Versabodies(tm), Amunix Inc., Mountain View, CA) и белков с повторяющимися единицами анкирина (DARPMHH, например, от Molecular Partners AG, Zurich-Schlieren, Switzerland). Такие белки также включают малые, полученные с помощью генной инженерии домены белков, такие, например, как иммуно-домены (смотри, например, публикации патентов США №№ 2003/082630 и 2003/157561). Иммуно-домены содержат, по меньшей мере, одну область, определяющую комплементарность (CDR) антитела.
IL-ба может содержать дополнительные аминокислоты, например, для придания молекуле другой функциональной характеристики, в дополнение к способности к связыванию антигена.
В некоторых случаях, IL-ба несет детектируемую метку или конъюгируется с токсином или нацеливающим остатком или ферментом (например, через пептидильную связь или линкер). Например, IL-ба может содержать каталитический сайт (например, в ферментативном домене), а также сайт связывания антигена (например, сайт связывания с сайтом II IL-б), так что сайт связывания антигена связывается с антигеном, и таким образом, он нацеливает каталитический сайт на IL-б или на комплекс IL-6/IL-6R. Каталитический сайт может, в некоторых случаях, дополнительно ингибировать биологическую функцию IL-б, например, посредством отщепления IL-б, IL-6R или другой молекулы, которая ассоциируется с комплексом IL-ба/IL-б.
В некоторых аспектах, настоящее изобретение включает антитело IL-ба, которое модифицируется по сравнению с эталонным
антителом для изменения, например, для увеличения, уменьшения или устранения функции биологического действия IL-ба. В одном из примеров, модифицируется область Fc или исходный домен Fc заменяется модифицированным доменом Fc для изменения Фармакокинетики модифицированного IL-ба по сравнению с немодифицированным предшественником. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба подвергается воздействию генной инженерии для создания каркаса IgG2. В других вариантах осуществления, IL-ба находится в каркасе IgGl или IgG2 и имеет модифицированную область Fc, которая увеличивает сродство связывания с IL-ба при рН 6,0 и не изменяет существенно сродство связывания при рН 7,0 по сравнению с исходным или другим эталонным IL-ба. В некоторых вариантах осуществления, домен Fc модифицируется и IL-ба имеет уменьшенную системную аккумуляцию, уменьшенное время полужизни и/или увеличенное системное выведение по сравнению с исходным или другим эталонным IL-ба.
В некоторых вариантах осуществления, антитело IL-ба модифицируется для увеличения фиксации комплемента и комплемент-зависимой цитотоксичности. В других аспектах, антитело IL-ба модифицируется для увеличения способности антитела по сравнению с эталонным антителом к активации эффекторных клеток и к участию в антитело-зависимой цитотоксичности (ADCC). В некоторых случаях, антитела, как описано в настоящем документе, могут быть модифицироваться как для повышения и способности к активации эффекторных клеток, так и для участия в антитело-зависимой цитотоксичности (ADCC) и для повышения их способности к фиксации комплемента и к участию в комплемент-зависимой цитотоксичности (CDC) .
В некоторых вариантах осуществления, антитела, описанные в настоящем документе, модифицируются для уменьшения их способности к фиксации комплемента и к участию в комплемент-зависимой цитотоксичности (CDC). В других вариантах осуществления, антитела модифицируются для уменьшения их способности к активации эффекторных клеток и к участию в антитело-зависимой цитотоксичности (ADCC). В других вариантах осуществления, антитело, как описано в настоящем документе,
может модифицироваться как для уменьшения его способности к активации эффекторных клеток, так и к участию в антитело-зависимой цитотоксичности (ADCC) и к уменьшению его способности к фиксации комплемента и к участию в комплемент-зависимой цитотоксичности (CDC).
Как правило, является преимущественным исключение частой доставки дозы IL-ба, например, когда она доставляется посредством инъекции в глаз. Чтобы сделать доступной эту особенность, в определенных вариантах осуществления, время полужизни в месте доставки, например, в стекловидном теле, для IL-ба, как описано в настоящем документе, составляет, по меньшей мере, 4 дня, например, по меньшей мере, 7 дней, по меньшей мере, 9 дней, по меньшей мере, 11 дней или, по меньшей мере, 14 дней. В определенных вариантах осуществления, среднее время полужизни IL-ба составляет, по меньшей мере, 2 дня, 3 дня, 4 дня, 5 дней, б дней, 7 дней, 8 дней, 9 дней, 10 дней, 11 дней, 12 дней, 13 дней, 14 дней, 15 дней, 16 дней, 17 дней, 18 дней, 19 дней, 20 дней, 25 дней, 30 дней, 40 дней, 50 дней или 60 дней. Способы увеличения времени полужизни антитела известны в данной области, например, как описано в патенте США № 62 77375 и в Международных публикациях №№ WO 1998/23289 и WO 1997/3461. В некоторых вариантах осуществления, время полужизни IL-ба увеличивается в целевом месте доставки, например, в стекловидном теле, по сравнению с системным временем полужизни, например, с временем полужизни в крови, сыворотке, плазме, лимфе, печени, почках или в других тканях или телесных жидкостях.
В другом варианте осуществления, настоящее изобретение предлагает промышленное изделие, содержащее контейнер. Контейнер содержит композицию, содержащую IL-ба, как описано в настоящем документе, и вставку или этикетку для упаковки, показывающую, что композицию можно использовать для лечения расстройства, связанного с IL-б. Как правило, композиция представляет собой IL-ба в композиции, содержащей фармацевтически приемлемый наполнитель.
В некоторых случаях, настоящее изобретение представляет собой набор, содержащий композицию, содержащую IL-ба, как
описано в настоящем документе, и инструкции для введения композиции субъекту, нуждающемуся в таком лечении.
В некоторых вариантах осуществления, в которых желательным является большой размер IL-ба, например, для увеличения удерживания IL-ба в месте доставки или вблизи него, с IL-ба может ассоциироваться остаток, который увеличивает размер, но не оказывает в значительной степени отрицательного влияния на функцию IL-ба (например, на сродство связывания IL-ба с IL-б или с комплексом IL-6/IL-6R). Например, Fab может быть получен с помощью генной инженерии таким образом, чтобы он экспрессировался в виде единых полипептидов, содержащих Fab и остаток Fc.
В некоторых вариантах осуществления, в которых желательным является относительно малый размер IL-ба, можно использовать фрагменты антитела против IL-6, например, scFv или фрагмент Fab. Антитело IgG имеет размер примерно 150 кДа, Fab составляет примерно 50 кДа и scFv составляет примерно 25 кДа. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, как описано в настоящем документе, является меньшим примерно, чем 50 кДа по размеру. Такой антагонист может, например, быть равным или меньшим чем 50 кДа и большим чем 10 кДа, равным или меньшим чем 50 кДа и большим чем 2 0 кДа или равным или меньшим чем 50 кДа и равным или большим чем 2 5 кДа.
В некоторых случаях, стабильность антагониста IL-б, например, антитело или другого ингибитора, имеющего дисульфиды, улучшается посредством создания варианта, в котором один или несколько дисульфидных мостиков являются более стабильными, чем в исходной молекуле.
Другое преимущество определенных молекул IL-ба, описанных в настоящем документе, может представлять собой доступность эффективных молекул, имеющих размер пригодный для использования при их способе доставки, месте доставки или режиме активности. Например, IL-ба в формате Fab можно использовать для местного нанесения. Способы генной инженерии таких молекул описываются в настоящем документе и известны в данной области.
Показания/заболевание, ассоциированное с IL-6
Заболевания, которые можно лечить с помощью IL-ба по настоящему изобретению, включают такие заболевания, при которых повышенный уровень IL-б ассоциируется с болезненным состоянием или присутствует в качестве предпосылки болезненного состояния. Такие заболевания включают такие, при которых ангиогенез и воспаление, обусловленные IL-б, вносят вклад в патологию заболевания. Они включают заболевания, при которых уровень IL-б повышается по сравнению с нормальными уровнями, например, заболевания, при которых уровень IL-б повышается в стекловидном теле (такие, например, как диабетический макулярный отек, диабетическая ретинопатия и увеит), или в тканях глаза. Примеры включают определенные глазные заболевания, включая, без ограничения, сухой глаз (например, болезнь сухого глаза или синдром сухого глаза), аллергический конъюнктивит, увеит, возрастную макулярную дистрофию (AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), диабетический макулярный отек (DME), регматогенную отслойку сетчатки (RRD), окклюзию вены сетчатки (RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO). Другие глазные расстройства, которые могут лечиться, включают расстройства, вызываемые травмой, такие как трансплантат роговицы, эрозия роговицы или другие такие механические травмы глаза. Соответственно, настоящее изобретение включает лечение субъекта, имеющего заболевание, связанное IL-б, с помощью IL-ба, описанного в настоящем документе.
В некоторых вариантах осуществления, заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой воспалительное заболевание. В некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой глаукому.
В некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой глазную боль.
В некоторых вариантах осуществления, лечение субъекта также включает определение того, имеет ли субъект имеет заболевание, ассоциированное с IL-б, и необязательно, является ли субъект стойким к другим видам лечения отличным от ингибитора IL-б, таким как стероиды или анти-VEGF терапевтические средства.
Одна из проблем с определенными терапевтическими средствами на основе антител, которые являются эффективными в конкретном месте, таком как глаз, например, в стекловидном теле, представляет собой отрицательные воздействия, которые возникают в результате системного введения. Одно из решений заключается в создании терапевтических средств, которые могут доставляться локально, в отличие от системной доставки, как иллюстрируется молекулами, описанными в настоящем документе. Поскольку некоторые терапевтические средства, которые доставляются локально, например, в стекловидное тело, будут, до некоторой степени, распространяться системно, является преимущественной разразботка молекулы, которая будет иметь относительно быстрый системный оборот. Авторы настоящей заявки получили с помощью генной инженерии примеры антител против IL-б, разработанных для быстрого системного оборота, например, по сравнению с исходной молекулой или с эталонным антителом. Это осуществляется посредством мутации домена Fc для модификации связывания молекулы FcRn, например, для уменьшения медиируемого FcRn рециклирования IL-ба.
Диабетический макулярный отек (DME). Диабетический
макулярный отек (DME) включает окклюзию кровеносных сосудов
сетчатки глаза и утечку из них, вызывая уменьшение остроты
зрения и потенциальную слепоту. Стандартные виды лечения для DME
включают локальное введение стероидов или антител анти-VEGF.
Однако многие пациенты являются невосприимчивыми к этим видам
терапии. Патогенез диабетического макулярного отека включает
компоненты ангиогенеза, воспаления и оксидативного стресса. IL-б
индуцируется гипоксией и гипергликемией и может увеличить
сосудистое воспаление, проницаемость сосудов и патологический
ангиогенез. IL-б может непосредственно индуцировать
экспрессирование VEGF и может способствовать неоваскуляризации хороидеи на животных моделях. У пациентов с DME, глазные уровни IL-б положительно коррелируют с толщиной желтого пятна и тяжестью заболевания. Уровни IL-б явно являются повышенными у пациентов, которым не помогает терапия анти-VEGF, в то же время, они понижаются у пациентов восприимчивых к анти-VEGF.
Соответственно, введение IL-ба, как описано в настоящем документе, является пригодным для использования при лечении диабетиков в сочетании с терапевтическими средствами анти-VEGF или в качестве альтернативы лечению анти-VEGF, включая пациентов, которые невосприимчивы к терапии анти-VEGF. Лечение макулярного отека с помощью IL-ба может также улучшить безопасность посредством устранения необходимости в полном ингибировании любого механизма для ингибирования патологии, сохраняя, таким образом, некоторые из желательных физиологических ролей каждого цитокина. Соответственно, локальное лечение IL-ба в сочетании с ингибированием VEGF может уменьшить частоту дозирования и уменьшить отрицательные воздействия лечения.
При DME имеются положительные корреляции между уровнями IL-6 в стекловидном теле и как тяжестью заболевания, так и невосприимчивости субъектов к VEGF. Соответственно, IL-ба, как описано в настоящем документе, можно использовать для лечения субъектов с DME, которые являются невосприимчивыми к стероидной терапии, анти-VEGF терапии или как к той, так и к другой. В некоторых случаях, IL-ба используется в сочетании с анти-VEGF терапией или стероидной терапией, например, для лечения DME.
IL-ба, описанный в настоящем документе, можно также использовать для лечения расстройств, таких как рак, например, рак простаты, лейкемия, множественная миелома, воспалительного
(такого как хронические воспалительные пролиферативные заболевания) и аутоиммунные заболевания, например, ревматоидный артрит, болезнь Кастлемена (гигантская или ангиофолликулярная гиперплазия лимфоузлов, лимфоидная гамартома, ангиофоллекулярная гиперплазия лимфоузлов), ювенильный идиопатический артрит
(включая полиартикулярный ювенильный идиопатический артрит и системный ювенильный идиопатический артрит), болезнь Стилла
(охватывающую ювенильный идиопатический артрит и болезнь Стилла зрелого возраста), болезнь Стилла зрелого возраста, амилоидоз с отложением амилоида А, ревматическая полимиалгия, временно ослабевающий серонегативный симметричный синовит с отеком с возникновением ямки при надавливании, спондилоартриты, болезнь
Бехчета (включая лечение ее глазных проявлений), атеросклероз, псориаз, системная красная волчанка, полимиозит (воспалительная миопатия), рецидивирующий полихондрит, приобретенная гемофилия А, множественный склероз, анемия воспаления и болезнь Крона.
Антагонисты IL-б также являются пригодными для использования при лечении определенных неврологических заболеваний, например, депрессии и болезни Альцгеймера.
Другие заболевания, которые можно лечить с помощью IL-ба, описанного в настоящем документе, включают, без ограничения, системный склероз, болезнь Такаясу, гигантоклеточный артериит, заболевание реакция "трансплантат против хозяина" и периодический синдром, ассоциированное с рецепторами TNF (TRAPS).
Дозирование
Антитело против IL-6 или его фрагмент может вводиться
субъекту (например, пациенту), который экспрессирует, например,
аномально высокие уровни IL-б. Антитело или его фрагмент может
вводиться один раз или может вводиться многократно. Антитело
может вводиться, например, от трех раз в день до одного раза
каждые шесть месяцев или больше. Введение может осуществляться
по графику, например, три раза в день, два раза в день, один раз
в день, один раз каждые два дня, один раз каждые три дня, один
раз в неделю, один раз каждые две недели, один раз каждый месяц,
один раз каждые два месяца, один раз каждые три месяца и один
раз каждые шесть месяцев. Антитело или его фрагмент может
вводиться непрерывно с помощью мининасоса или другого способа,
такого как имплантируемая капсула с медленным высвобождением,
или с помощью инкапсулированной клетки, продуцирующей антитело
или его фрагмент. Антитело или его фрагмент может вводиться
мукозальным, буккальным, интраназальным, ингаляционным,
внутривенным, подкожным, внутримышечным, парентеральным, интраокулярным или внутриопухолевым способом. Антитело или его фрагмент может вводиться один раз, по меньшей мере, два раза или в течение, по меньшей мере, периода времени до тех пор, пока состояние вылечивается, облегчается или излечивается полностью. Антитело или его фрагмент, как правило, будет вводиться все
время пока присутствует это состояние. Антитело или его фрагмент, как правило, будет вводиться в качестве части фармацевтической композиции, как описано в настоящем документе. Дозировка антитела, как правило, будет находиться в пределах от 0,1 до 100 мг/кг, от 0,5 до 50 мг/кг, от 1 до 20 мг/кг и от 1 до 10 мг/кг. Концентрация антитела или его фрагмента в сыворотке может быть измерена с помощью любого пригодного для использования способа. Одна из особенностей определенных соединений, описанных в настоящем документе, заключается в том, что они требуют относительно нечастого дозирования, например, один раз в неделю, два раза в неделю, три раза в неделю, один раз каждые четыре недели, один раз каждые две недели, один раз каждые 8 недель, один раз каждые 12 недель, один раз каждые 16 недель, один раз каждые 32 недели, один раз в месяц, один раз в два месяца, один раз в три месяца или один раз в шесть месяцев. В некоторых случаях соединение вводится на основании потребности в нем, и это определяется, например, состоянием субъекта. Особенностью антагонистов IL-б, описанных в настоящем документе, является то, что они делают возможным относительно нечастое дозирование в сочетании с лучшей эффективностью, что достигается, по меньшей мере, частично, с помощью низкой скорости отсоединения после связывания с IL-б и с помощью способности к доставке относительно высокой концентрации соединения.
В некоторых случаях, IL-ба вводится в виде монотерапии. В других вариантах осуществления, IL-ба вводится одновременно с метотрексатом или другим модифицирующим заболевание противоартритным лекарственным средством.
Генерация антител
Антитело IL-ба или его производное или фрагмент может продуцироваться с использованием способов, известных в данной области, таких как методика моноклональных антител (например, смотри Kohler and Milstein (1975) Nature 256: 495). Могут использоваться также другие технологии продуцирования моноклональных антител, такие как вирусное или онкогенное преобразование В лимфоцитов.
Химерные или гуманизированные антитела могут
приготавливаться на основе последовательности моноклональных антител мышиных, полученных с использованием способов, известных в данной области. ДНК, кодирующая иммуноглобулины с тяжелыми и легкими цепями, могут быть получены из гибридомы мышиных, представляющей интерес, и преобразованы с помощью генной инженерии таким образом, чтобы они содержали последовательности иммуноглобулинов, отличные от мышиных (например, человека), с использованием стандартных технологий молекулярной биологии. Например, для создания химерного антитела, вариабельные области мышиных могут связываться с константными областями человека с использованием способов, известных в данной области (смотри, например, патент США № 4816567). Для создания гуманизированного антитела, области CDR мышиных могут вставляться в каркас человека с использованием способов, известных в данной области (смотри, например, патент США № 5225539 и патенты США №№ 5530101; 5585089; 5693762 и 6180370).
В некоторых вариантах осуществления, IL-ба, описанный в настоящем документе (например, антитело анти-IL- б или его производное или фрагмент), может специфично связываться с IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба может специфично связываться с сайтом II IL-б (например, с сайтом II IL-б человека).
В некоторых вариантах осуществления, антитело против IL-ба представляет собой моноклональное антитело человека. Такие антитела могут генерироваться с использованием трансгенных или трансхромосомных мышей, содержащих части иммунной системы человека вместо системы мыши. Эти трансгенные и трансхромосомные мыши включают "мыши с Ig человека", такие как HuMAb Mouse(r) и КМ Mouse(r) (смотри, например, патенты США №№ 5545806; 5569825; 5625126; 5633425; 5789650; 5877397; 5661016; 5814318; 5874299 и 5770429; патент США № 5545807; публикации РСТ №№: WO 92/03918, WO 93/12227, WO 94/25585, WO 97/13852, WO 98/24884 и WO 99/45962; и публикацию № WO 01/14424).
В другом аспекте, антитела анти-1Ъ-б человека могут быть получены с использованием мыши, которая несет последовательности иммуноглобулина человека на трансгенах и трансхромосомах, таких как мышь, которая несет трансген тяжелой цепи человека и трансхромосому легкой цепи человека. Такие мыши описаны подробно в публикации РСТ № W0 02/43478.
Другие трансгенные животные системы, экспрессирующие гены иммуноглобулинов человека, являются доступными в данной области и могут использоваться для выращивания антитела IL-ба. Например, может использоваться альтернативная трансгенная система, упоминаемая как Xenomouse(tm) (Abgenix, Inc.); такие мыши описываются, например, в патентах США №№ 5939598; 6075181; 6114598; 6150584 и 6162963. Более того, трансхромосомные животные системы, экспрессирующие гены иммуноглобулинов человека, являются доступными в данной области и могут использоваться для выращивания антитела IL-ба. Например, мыши, несущие как трансхромосому тяжелой цепи человек, так и трансхромосому легкой цепи человека, описываются в Tomizuka et al. (2000, Proc Natl Acad Sci USA 97:722-727). Моноклональные антитела человека могут также быть получены с использованием мышей SCID, у которых иммунные клетки человека восстановлены таким образом, что реакция антитела человека может генерироваться при иммунизации. Такие мыши описываются, например, в патентах США №№ 5476996 и 5698767.
Библиотеки фаговых дисплеев
В некоторых случаях, антитело IL-ба или его производное или фрагмент, продуцируется в способе, который включает синтез библиотеки антител человека с использованием фага, скрининг библиотеки с помощью IL-б, например, IL-б человека или его фрагмента, выделение фага, который связывает IL-б, и получение антитела от этого фага.
Рекомбинантное антитело IL-ба человека может также быть выделено посредством скрининга рекомбинантной комбинаторной библиотеки антител. Как правило, библиотека представляет собой библиотеку фагового дисплея scFv, генерируемую с использованием
cDNA VL и VH человека, полученную из mRNA, выделенную из В лимфоцитов. Способы получения и скрининга таких библиотек известны в данной области. Наборы для генерирования библиотек фаговых дисплеев являются коммерчески доступными (например, Pharmacia Recombinant Phage Antibody System, catalog no. 279400-01; и Stratagene SurfZAP(tm) phage display kit, catalog no. 240612). Другие способы и реагенты, которые можно использовать при генерировании и скрининге библиотек дисплеев антител? известны в данной области (смотри, например, патент США № 5223409; публикации РСТ №№ WO 92/18619, WO 91/17271, WO 92/20791, WO 92/15679, WO 93/01288, WO 92/01047, WO 92/09690; Fuchs et al., Bio/Technology 9:1370-1372 (1991); Hay et al., Hum Antibod Hybridomas 3:81-85 (1992); Huse et al. , Science 246:1275-1281 (1989); McCafferty et al., Nature 348:552-554
(1990); Griffiths et al. , EMBO J 12:725-734 (1993); Hawkins et al., J Mol Biol 226:889-896 (1992); Clackson et al. , Nature 352:624-628 (1991); Gram et al., Proc Natl Acad Sci USA 89:35763580 (1992); Garrad et al. , Bio/Technology 9:1373-1377 (1991); Hoogenboom et al., Nuc Acid Res 19:4133-4137 (1991); и Barbas et al., Proc Natl Acad Sci USA 88:7978-7982 (1991), все они включаются в настоящий документев качестве ссылок.
В примере выделения и продуцирования антител против IL-б человека с желаемыми характеристиками, сначала используют антитело против IL-б человека, чтобы выбрать последовательности тяжелых и легких цепей человека, имеющее сходную активность связывания по отношению к IL-б, с использованием способов импринтинга эпитопа, описанные в публикации РСТ № WO 93/06213, включенной в настоящий документ в качестве ссылки. Библиотеки антител, используемые в этом способе, как правило, представляют собой библиотеки scFv, приготовленные и просмотренные, как описано в публикации РСТ № WO 92/01047; McCafferty et al. , Nature 348:552-554 (1990); и Griffiths et al. , EMBO J 12:725-734
(1993), все они включаются в настоящий документ в качестве ссылок.
После выбора начальных доменов VL и VH человека, осуществляют эксперименты "комбинирования для получения наилучших результатов", при которых различные пары выбранных вначале сегментов VL и VH просматривают относительно связывания IL-б, чтобы выбрать предпочтительные парные сочетания VL/VH. Для выбора желательных особенностей IL-ба, сегменты VL и/или VH выбранной пары могут мутировать случайным образом. Это созревание сродства in vitro может осуществляться, например, посредством амплификации доменов VH и VL с использованием праймеров PCR комплементарных к CDR одного или обоих выбранных доменов VH и VL, эти праймеры содержат неупорядоченную смесь из четырех нуклеотидных оснований в определенных положениях, так что полученные в результате продукты PCR кодируют сегменты VH и VL, в которых вводятся случайные мутации в VH и/или VL. Такие сегменты VH и VL со случайными мутациями могут повторно просматриваться на связывание с IL-б, например, с сайтом II IL-б.
После скрининга и выделения антитела IL-ба из рекомбинантной библиотеки дисплеев иммуноглобулинов, нуклеиновые кислоты, кодирующие выбранное антитело, могут извлекаться из упаковки дисплея (например, из генома фага) и субклонироваться в другие векторы экспрессии с использованием рекомбинантных технологий ДНК, известных в данной области. Такие антитела могут дополнительно подвергаться воздействию манипуляций для получения фрагмента антитела, такого как описано в настоящем документе.
Фармакокинетика (РК)
Исследование РК может осуществляться с использованием способов, описанных в настоящем документе, и/или способов, известных в данной области. Один из барьеров для определений, требующих использование животного, например, определение РК, заключается в том, что IL-б человека имеет гомологию меньше 50% с другими животными, обычно используемыми для такого исследования. По этой причине, один из способов исследования РК заключается в использовании трансгенной мыши, экспрессирующей IL-б человека. В некоторых вариантах осуществления, для определения РК используют примата иного, чем человек.
В некоторых вариантах осуществления, антитело анти-1Ъб мутирует для изменения его РК, например, посредством изменения чувствительности связывания FcRn к рН. Способ получения таких мутаций описан в Примерах. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления, IL-ба имеет измененную системную РК по сравнению с исходным IL-ба или эталонной молекулой. В некоторых случаях, РК в стекловидном теле не изменяется или улучшается. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба имеет пониженную системную РК (например, уменьшенное время полужизни и/или увеличенное выведение, например, как анализируется в циркуляторной жидкости, такой как кровь, плазма, лимфа или сыворотка), по сравнению с исходным IL-ба или эталонной молекулой.
Модели для исследования антагониста IL-6
Антагонисты IL-б могут исследоваться на моделях заболевания относительно доставки, ассоциированного с IL-6, в частности, относительно эффективности лечения и ограничения вредных воздействий на преимущественные свойства IL-б. Например, увеит может исследоваться на экспериментальной модели аутоиммунного увеита на крысах или мышах (Caspi, Invest Ophthalmol Vis Sci 52:1873; Agarwal et al. , 900:443-69, 2012) с иммунизацией с использованием межфоторецепторного ретинол-связывающего белка
(IRBP) в полном адъюванте Фрейнда (CFA). Другие модели включают модели, известные в данной области, для увеита, вызываемого дендритными клетками, адаптивного переноса культивированных эффекторных Т лимфоцитов, спонтанного EAU у IRBP TCR Тд мышей, эндотоксин-индуцированного увеита, аутоиммунного увеоретинита
(Haruta et al., Invest Ophthalmol Vis Sci 53:3264 (2011); Yoshimura et al., Rheumatology 48:347-354 (2009)).
Другие модельные системы, которые могут использоваться для исследования воздействий IL-ба при лечении заболевания, ассоциированного с IL-б, представляют собой, например, модель неоваскуляризации хороидеи (CNV) (Izumi-Nagai et al., Am J Pathol 170:6 (2007); Krzystolik et al. , Arch Ophthalmol 120:338
(2002)) и диабетические модели, такие как описано в Kern et al.
(Animal Models Of Diabetic Complications Consortium (P01 DK57733), Update Report (September 2001 - January 2004)).
Животные модели пригодные для использования при исследовании IL-ба при ревматоидном артрите известны в данной области, смотри, например, Asquith et al. (Eur J Immunol 39:2040-4 (2009)) и Kollias et al. (Ann Rheum Dis 70:1357-62 (2011).
Модели CNV являются репрезентативными, например, для состояний AMD и DME человека. Модели неоваскуляризации сетчатки являются полезными, например, для исследования ишемических ретинопатий, например, диабетической ретинопатии или ретинопатий недоношенных. Различные модели неоваскуляризации хороидеи и сетчатки являются известными в данной области (смотри, например, Grossniklaus, Н.Е. et al. Prog Retin Eye Res. 2010 Nov; 29 ( 6) :500-19. doi: 10,1016/j.preteyeres.2010, 05, 003, Epub 2010 May 19; Saisin, Y et al. (2003) Journal of Cellular Physiology, 195:241-248; Takahashi, K. et al. (2003) Investigative Ophthalmology & Visual Science, 44(1):409-415; Lima e Silva, R. et al. (2007) FASEB Journal, 21:3219-3230; Tobe et al. (1998) American Journal of Pathology, 153(5):1641-1646; Dong, A et al. (2011) PNAS, 108(35): 14614-14619; Dong et al. (2009) J Cell Physiol 219:544-552; Smith, LE et al. 1994 Invest Ophthalmol Vis Sci 1994; 35:101-111; Shen, J. et al. (2007) Investigative Ophthalmology & Visual Science, 48(9):4335-4341), и они могут использоваться для исследования эффективности IL-ба. Неоваскуляризация хороидеи (CNV) может индуцироваться, например, лазерами, светом, хирургическим вмешательством или генетическими модификациями. Модели индуцируемой кислородом неоваскуляризации сетчатки известны в данной области и описываются, например, в Smith, LE et al. 1994 Invest Ophthalmol Vis Sci 1994; 35:101111; Shen, J. et al. (2007) Investigative Ophthalmology & Visual Science, 48 ( 9) :4335-4341.
Может также использоваться модель ишемии/реперфузии. Смотри, например, Zheng, L et al. Investigative Ophthalmology & Visual Science, vol. 48 no. 1 pp. 361-367, 2007. Например, в День 1, игла номер 3 0 присоединенная к мешку с жидкостью, вставляется в роговицу анестезированных мышей, и внутриглазное давление (ЮР) повышается приблизительно до 120 мм. рт. ст. для генерирования ишемии. Через 30-90 минут, иглу удаляют, ЮР
нормализуется и происходит восстановление кровотока в сетчатке. Экспрессирование маркеров воспаления, включая TNF-a и IC7AM-1, может оцениваться с помощью анализа вестерн-блот и qPCR в дни 26. В дополнение к этому, потери ганглионных клеток могут оцениваться с помощью гистологии в дни 3-14, и дегенерация капилляров измеряется с помощью методики трипсинового переваривания в дни 10-14. Для терапевтических исследований, исследуемое изделие (например, 1 мкл соответствующей концентрации, например, 2 0 мг/мл, IL-ба) вводят в виде инъекции в стекловидное тело либо незадолго до индицирования ишемии, либо после этого.
Сочетанная терапия
В некоторых вариантах осуществления, IL-ба вводится в сочетании со вторым терапевтическим средством. Например, IL-ба вводится в режиме лечения, который включает ингибитор VEGF, такой, например, как ранибизумаб. В некоторых вариантах осуществления, IL-ба вводится в режиме лечения, который включает ингибитор PDGF, такой, например, как антитело анти-PDGF или антитело анти-рецептор PDGF (например, иматиниб). В некоторых вариантах осуществления, IL-ба вводится в сочетании с ингибитором пути комплемента, например, с лампализумабом (ингибитор фактора D) или ингибитором С5.
Доставка антагониста IL-6
Антагонист IL-б или композиция, описанная в настоящем документе, может доставляться локально, либо в прямом контакте, либо вблизи клетки или ткани, на которую нацелено ингибирование IL-б. Неограничивающие примеры таких способов доставки включают инъекцию, вливание или имплантацию вещества, содержащего антагонист IL-б.
В некоторых вариантах осуществления, IL-ба или композиция вводится интраокулярно, например, внутрь стекловидного тела, например, с помощью инъекции в стекловидное тело, офтальмологической вставки или генетической доставки.
В некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба вводится в виде офтальмологического препарата. Способы могут
включать введение композиции IL-ба и офтальмологически приемлемого носителя. В некоторых вариантах осуществления, офтальмологический препарат представляет собой жидкость, полутвердое вещество, вставку, пленку, микрочастицу или наночастицу. Композиция IL-ба может вводиться, например, местным образом или посредством инъекции (например, инъекции в стекловидное тело).
В некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба приготавливается для введения в стекловидное тело.
В некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба
приготавливается для местного введения, например, в глаз.
Препарат для местного введения может представлять собой жидкий
препарат или полутвердое вещество, например, препарат для
местного введения может включать водный раствор, водную
суспензию, мазь или гель. Офтальмологический препарат IL-ба
может наноситься местным образом на переднюю часть глаза, под
верхнее веко, на нижнее веко и в свод конъюнктивы. Как правило,
офтальмологический препарат является стерильным.
Офтальмологический препарат IL-ба может содержать один или
несколько фармацевтических наполнителей пригодных для
приготовления офтальмологических препаратов. Примеры таких
наполнителей представляют собой консервирующие агенты, буферные
агенты, хелатирующие агенты, агенты антиоксиданты и соли для
регулировки осмотического давления. Офтальмологические
препараты, включая как мази, так и суспензии, как правило, имеют вязкость, которая соответствует выбранному способу введения. В некоторых вариантах осуществления, офтальмологический препарат имеет вязкость примерно от 1000 примерно до 30000 сантипуаз.
В некоторых вариантах осуществления, препарат представляет собой жидкий препарат, содержащий полимер. Такой полимер может использоваться для улучшения биологической доступности, повышения вязкости или для уменьшения оттока из глаза жидкого препарата. Пригодные для использования полимеры включают, но, не ограничиваясь этим, полимеры, описанные в Wagh et al. (Asian J Pharm, 2:12-17, 2008). В неограничивающих примерах, полимер представляет собой натрий гуалуроназу, хитозан, циклодекстрин
(например, гидроксипропил-(3-циклодекстрин) , полигалактуроновую кислоту, ксилоглюкан, ксантановую смолу, геллановую камедь, тиомер, сложный поли(ортоэфир) (например, Einmahl, Adv Drug Deliv Rev 53:45-73, 2001) или полисахарид из семян тамаринда
(например, Ghelardi et al. , Antimicrob Agents Chemother 48:33963401, 2004) .
В некоторых вариантах осуществления, препарат, содержащий композицию IL-ба для офтальмологической доставки, может содержать одно или несколько веществ из поверхностно-активных веществ, вспомогательных веществ, буферов, антиоксидантов, регуляторов тоничности, консервантов (например, EDTA, ВАК
(бензалкония хлорида), хлорита натрия, пербората натрия, поликватерниума-1), загустителей или модификаторов вязкости
(например, карбоксиметилцеллюлозу, гидроксиметилцеллюлозу,
поливиниловый спирт, полиэтиленгликоль, гликоль 4 00,
пропиленгликоль, гидроксиметилцеллюлозу, гидроксипропил-гуар, гиалуроновую кислоту и гидроксипропилцеллюлозу), и тому подобное. Добавки в препарате могут включать, но, не ограничиваясь этим, хлорид натрия, бикарбонат натрия, сорбиновую кислоту, метилпарабен, пропилпарабен, хлоргексидин, касторовое масло и перборат натрия.
В некоторых вариантах осуществления, в композиции используется очищенная или деионизованная вода. рН может регулироваться посредством добавления любых физиологически и офтальмологически приемлемых кислот, оснований или буферов для регулировки рН, в пределах примерно от 5,0 до 8,5, например, рН 7,0, рН 7,3, рН, 7,4 или рН 7,5. Примеры офтальмологически приемлемых кислот включают уксусную, борную, лимонную, молочную, фосфорную, хлористоводородную кислоту, и тому подобное, и примеры оснований включают гидроксид натрия, фосфат натрия, борат натрия, цитрат натрия, ацетат натрия, лактат натрия, трометамин, трисгидроксиметиаминометан, и тому подобное. Примеры солей и буферов, которые можно использовать в препарате, включают цитрат/декстрозу, бикарбонат натрия, хлорид аммония и смеси рассмотренных выше кислот и оснований.
В некоторых вариантах осуществления, осмотическое давление офтальмологической композиции может составлять примерно от 10 миллиосмоль (мОсМ) примерно до 4 00 мОсМ, например, от 200 до 400 мОсМ или от 22 0 до 37 0 мОсМ. Как правило, осмотическое давление может регулироваться с использованием физиологически и офтальмологически приемлемых солей или наполнителей. В некоторых вариантах осуществления, в препарат вводится хлорид натрия, например, хлорид натрия присутствует в препарате при концентрации в пределах от 0,01% до 1% масс или от 0,05% до 0,45% масс, по отношению к общей массе композиции. Эквивалентные количества одной или нескольких солей, состоящих из катионов, таких как калий, аммоний, и тому подобное, и анионов, таких как хлорид, цитрат, аскорбат, борат, фосфат, бикарбонат, сульфат, тиосульфат, бисульфат, бисульфат натрия, аммоний сульфат, и тому подобное, также можно использовать в дополнение к хлориду натрия или вместо него, для получения осмоляльностей в желаемом диапазоне. В некоторых вариантах осуществления, сахар, такой как маннитол, декстроза, сорбитол, глюкоза, и тому подобное, также используется для регулировки осмоляльности.
В некоторых вариантах осуществления, способы включают формирование или доставку депо агента в контакте с наружной поверхностью глаза. Депо относится к источнику агента, который не удаляется быстро посредством слез или других механизмов очистки глаза. Это делает возможным непрерывное продолжительное присутствие высоких концентраций агента в жидкости на наружной поверхности глаза после единственного нанесения. В некоторых вариантах осуществления, депо может удерживаться до восьми часов или более. В некоторых вариантах осуществления, депо офтальмологического препарата включает, но, не ограничивается этим, водные полимерные суспензии, мази и твердые вставки.
В некоторых вариантах осуществления, полутвердая композиция представляет собой жидкий препарат, вязкость которого увеличивается при нанесении на глаз, как правило, благодаря присутствию полимера в жидком препарате, для которого повышение вязкости происходит при изменении температуры, рН или концентрации электролита. Полимер может представлять собой,
например, ацетатфталат целлюлозы, полиакриловую кислоту, геллановую камедь, гуалуроназу, хитозан, соли альгиновой кислоты (например, альгинат натрия) или блок-сополимер этиленоксида и пропиленоксида (например, Pluronic(r), BASF; полоксамер. В некоторых вариантах осуществления, полиакриловая кислота представляет собой поперечно сшитую акриловую кислоту (например, Carbopol(r)) . В некоторых вариантах осуществления, полутвердая композиция содержит смесь карбопола и блок-сополимера этиленоксида и пропиленоксида; смесь метилцеллюлозы и гидроксиэтилцеллюлозы или смесь полиэтиленгликоля и блок-сополимера этиленоксида и пропиленоксида.
В некоторых вариантах осуществления, офтальмологический препарат, содержащий IL-ба, представляет собой мазь или гель. В некоторых вариантах осуществления, офтальмологический препарат представляет собой несущую среду для доставки на основе масла. Например, препарат может содержать петролейную или ланолиновую основу, к которой добавляется композиция IL-ба (например, при 0,1-2%) и наполнители. Распространенные основы могут включать, но, не ограничиваясь этим, минеральное масло, вазелин и их сочетания. В некоторых вариантах осуществления, мазь наносится в виде ленты на нижнее веко.
В некоторых случаях, офтальмологическая композиция представляет собой офтальмологическую вставку. В некоторых вариантах осуществления, композиция вводится в стекловидное тело с помощью офтальмологической вставки.
Например, офтальмологическая вставка является биологически инертной, мягкой, биоэродируемой, вязкоупругой, стабильной при стерилизации после экспонирования для терапевтических агентов, стойкой к инфекциям от воздушных бактерий, биоразлагаемой, биологически совместимой и/или вязкоупругой. В некоторых вариантах осуществления, вставка содержит офтальмологически приемлемую матрицу, например, полимерную матрицу. Матрица, как правило, представляет собой полимер, и композиция IL-ба диспергируется в матрице или связывается с полимерной матрицей. В некоторых вариантах осуществления, агент медленно
высвобождается из матрицы посредством растворения или гидролиза ковалентной связи. В некоторых вариантах осуществления, полимер является биоразлагаемым (растворимым), и его скорость растворения может контролировать скорость высвобождения агента, диспергированного в нем. В другой форме, полимерная матрица представляет собой биодеградируемый полимер, который разрушается, например, посредством гидролиза, с высвобождением при этом агента, связанного с ним или диспергированного в нем. В других вариантах осуществления, матрица и агент могут быть окружены дополнительным полимерным покрытием для дополнительного контроля высвобождения. В некоторых вариантах осуществления, вставка содержит биодеградируемый полимер, такой как поликапролактон (PCL), сополимер этилен/винилацетат (EVA), полиалкилцианоакрилат, полиуретан, найлон или поли(dl-лактид-со-гликолид) (PLGA) или сополимер любых из них. В некоторых случаях, агент диспергируется в материале матрицы или диспергируется в композиции мономеров, используемых для получения материала матрицы, перед полимеризацией. В некоторых вариантах осуществления, количество агента составляет примерно от 0,1 примерно до 50% или примерно от 2 примерно до 20%. Может использоваться биодеградируемая или биоразлагаемая полимерная матрица, так что спользованная вставка не должна удаляться из глаза. Когда биодеградируемий или биоразлагаемый полимер деградирует или растворяется, агент высвобождается.
В других вариантах осуществления, офтальмологическая
вставка содержит полимер, включая, но, не ограничиваясь этим,
полимеры, описанные в Wagh, et al., "Polymer used in ocular
dosage form and drug delivery systems", Asian J. Pharm., pages
12-17 (January 2008), которая включается в настоящий документ в
качестве ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах
осуществления, вставка содержит полимер, выбранный из
поливинилпирролидона (PVP), полимера или сополимера акрилата или
метакрилата (например, семейство полимеров Eudragit(r) от Rohm или
Degussa), гидроксиметилцеллюлозы, полиакриловой кислоты,
дендримеров поли(амидоамина), поли(диметилсилоксана),
полиэтиленоксида,
поли(лактид-со-гликолида),
поли(2-
гидроксиэтилметакрилата) ,
поливинилового
спирта)
или
поли(пропиленфумарата). В некоторых вариантах осуществления, вставка содержит Gelfoam(r). в некоторых вариантах осуществления, вставка представляет собой конъюгат полиакриловой кислоты и 450-кДа цистеина.
Вставка может содержать сердцевину, которая содержит композицию IL-ба, и наружную трубку (например, как описано в публикации патента США № 2004000 9222). В некоторых случаях, наружная трубка может быть проницаемой, полупроницаемой или непроницаемой для лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления, сердцевина содержит полимерную матрицу, которая не оказывает значительного воздействия на скорость высвобождения композиции IL-ба. В некоторых случаях, наружная трубка, полимерная матрица сердцевины или как то, так и другое являются биоразлагаемыми. Совместно экструдированный продукт может сегментироваться в виде устройств для доставки лекарственного средства. В некоторых вариантах осуществления, устройство не имеет покрытия, так что соответствующие его края являются открытыми, или это устройство имеет покрытие, например, слой, который является проницаемым для композиции IL-ба, полупроницаемым для композиции IL-ба или биоразлагаемым. В определенных вариантах осуществления, композиция IL-ба и, по меньшей мере, один полимер смешиваются в форме порошка.
В некоторых вариантах осуществления, офтальмологическая композиция представляет собой офтальмологическую пленку. Полимеры пригодные для использования в таких пленках включают, но, не ограничиваясь этим, полимеры, описанные в Wagh, et al. {выше). В некоторых вариантах осуществления, пленка представляет собой мягкую контактную линзу, например, линзу, состоящую из сополимеров N,N-диэтилакриламида и метакриловой кислоты, поперечно сшитых с помощью этиленгликоля диметакрилата.
В определенных вариантах осуществления, IL-ба находится во вставке, которая имеет трубчатую форму, и она может быть сегментированной.
В некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба
приготавливается в терапевтически эффективном количестве,
покрытом полимерной матрицей или диспергированном в ней, так что
композиция IL-ба находится в форме гранул или частиц. В
некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба
высвобождается из препарата в качестве лекарственного средства
из гранул, растворяется в матрицу или внутри нее, диффундирует
через матрицу и высвобождается в окружающую физиологическую
жидкость. В некоторых вариантах осуществления, скорость
высвобождения ограничивается, прежде всего, скоростью
растворения композиции IL-ба из гранул/частиц в матрицу; стадии
диффузии через матрицу и диспергирования в окружающую жидкость,
в основном, не являются ограничивающими скорость высвобождения.
В определенных вариантах осуществления, полимерная матрица не
является биоразлагаемой, в то время как в других вариантах
осуществления она является биоразлагаемой. Иллюстративные
неразлагаемые биологически полимерные матрицы могут
формироваться из полиуретана, полисиликона, поли(этилен-со-
винилацетата) (EVA), поливинилового спирта и их производных и
сополимеров. Иллюстративные биоразлагаемые полимерные матрицы
могут формироваться из полиангидрида, полимолочной кислоты,
полигликоевой кислоты, сложного полиортофэира,
полиалкилцианоакрилата и их производных и сополимеров.
В некоторых случаях, композиция IL-ба приготавливается из коллагенового материала. Например, вставка может представлять собой вставку с растворимым офтальмологическим лекарственным средством (например, полимерную овальную пленку, которая может вводиться в верхний конъюнктивальный мешок для доставки лекарственного средства; эллиптическую вставку, такую как OCUSERT(r) (пилокарпиновую глазную терапевтическую систему, разработанную Alza Corporation), которая изготовлена из этилена-винилацетата; Lacrisert(r), вставку в форме стержня, изготовленную из целлюлозы; New Ophthalmic Drug Delivery Systems (NODS), изготовленную из поли(винилового спирта); или такие вставки, как описано в Fabrizio (Adv Drug Deliv Rev 16: 95-106, 1998) . В
некоторых случаях, вставка содержит коллаген, желатин или полимер, где полимер выбиран из поликапролактона (PCL), сополимера этилен/винилацетат (EVA), полиалкилцианоакрилата, полиуретана, найлона, поли(dl-лактид-со-гликолида) (PLGA) или сополимера любых из них. В некоторых случаях, вставку имплантируют под верхнее веко. В некоторых случаях, вставку имплантируют в задний сегмент глаза, в хороидальное пространство или в склеру. В некоторых вариантах осуществления, вставку имплантируют в стекловидное тело или под сетчатку. В некоторых вариантах осуществления, вставку вводят под сетчатку с помощью инъекции. Способы введения и технологии их приготовления приведены в Remington's: The Practice of Science of Pharmacy, 20th edition (Lippincott Williams & Wilkins, 2006), которые включаются в настоящий документ в качестве ссылки во всей своей полноте.
В других вариантах осуществления, вставка, содержащая композицию IL-ба, обеспечивает замедленное высвобождение агента в стекловидном теле глаза. Как используется в настоящем документе, "замедленное высвобождение" означает, что композиция высвобождает агент в течение продолжительного периода времени контролируемым образом. В некоторых вариантах осуществления, вставка высвобождает агент при такой скорости, что концентрация агента в водном растворе остается меньшей, чем концентрация агента в стекловидном теле во время высвобождения. В некоторых вариантах осуществления, концентрация водного раствора агента составляет примерно от 0,002 мкг/мл примерно до 0,01 мкг/мл или примерно от 0,01 мкг/мл, примерно до 0,05 мкг/мл или меньше примерно, чем 0,05 мкг/мл. В некоторых вариантах осуществления, агент высвобождается при скорости примерно от 1 мкг/день примерно до 50 мкг/день или примерно от 1 мкг/день примерно до 10 мкг/день. В некоторых вариантах осуществления, вставка дополнительно содержит дополнительный терапевтический агент, как подробно описано выше, например, флюоцинолон ацетонид (такой как находится в офтальмологической вставке Retisert(r)) .
В некоторых вариантах осуществления, офтальмологическая
композиция содержит микросферы или наночастицы. В некоторых
вариантах осуществления, микросферы содержат желатин. В
некоторых вариантах осуществления, микросферы вводятся
посредством инъекции в задний сегмент глаза, в хороидальное
пространство, в склеру, в стекловидное тело или под сетчатку. В
некоторых вариантах осуществления, микросферы или наночастицы
содержат полимер, включая, но, не ограничиваясь этим, полимеры,
описанные в Wagh, et al. (Asian J Pharm 2:12-17, 2008) . В
некоторых вариантах осуществления, полимер представляет собой
хитозан, поликарбоновую кислоту, такую как полиакриловая
кислота, частицы альбумина, сложные эфиры гиалуроновой кислоты,
полиитаконовую кислоту, поли(бутил)цианоакрилат,
поликапролактон, поли(изобутил)капролактон, поли(молочную
кислоту-со-гликоевую кислоту) или поли(молочную кислоту). В некоторых вариантах осуществления, микросферы или наночастицы содержат твердые липидные частицы.
В некоторых вариантах осуществления, композиция IL-ба содержит ионообменную смолу. В некоторых вариантах осуществления, ионообменная смола представляет собой неорганический цеолит или синтетическую органическую смолу. В некоторых вариантах осуществления, ионообменная смола включает, но, не ограничиваясь этим, смолы, описанные в Wagh, et al., выше, которая включается в настоящий документ в качестве ссылки во всей своей полноте. В некоторых вариантах осуществления, ионообменная смола представляет собой частично нейтрализованную полиакриловую кислоту.
Композиция IL-ба может быть получена в виде водной
полимерной суспензии. В некоторых вариантах осуществления,
композиция IL-ба или полимерный суспендирующий агент
суспендируется в водной среде (например, имеющей свойства, как
описано выше). Примеры полимерных суспендирующих агентов
включают, но, не ограничиваясь этим, декстраны,
полиэтиленгликоли, поливинилпирролидон, полисахаридные гели,
Gelrite(r), полимеры целлюлозы подобные
гидроксипропилметилцеллюлозе и карбокси-содержащие полимеры,
такие как полимеры или сополимеры акриловой кислоты, а также
другие полимерные мягчительные средства. В некоторых вариантах
осуществления, полимерный суспендирующий агент представляет
собой набухающий в воде водонерастворимый полимер, в частности,
поперечно сшитый карбокси-содержащий полимер. В некоторых
вариантах осуществления, полимерный суспендирующий агент
содержит, по меньшей мере, примерно от 90% примерно до 99, 9% или
примерно от 95% примерно до 99,9% масс, по отношению к общей
массе присутствующих мономеров, одного или нескольких карбокси-
содержащих моноэтилен-ненасыщенных мономеров. В некоторых
вариантах осуществления, карбокси-содержащий моноэтилен-
ненасыщенный мономер включает акриловую кислоту, метакриловую
кислоту, этакриловую кислоту, метилакриловую кислоту (кротоновую
кислоту), цис-.альфа.-метилкротоновую кислоту (ангеликовую
кислоту), транс-ос-метилкротоновую кислоту (тиглиновую кислоту),
а-бутилкротоновую кислоту, . альфа.-фенилакриловую кислоту, ос-
бензилакриловую кислоту, а-циклогексилакриловую кислоту,
фенилакриловую кислоту (коричную кислоту), кумаровую кислоту (о-
гидроксикоричную кислоту) и умбелловую кислоту (п-
гидроксикумаровую кислоту). В некоторых вариантах осуществления,
полимер является поперечно сшитым с помощью полифункционального
агента для поперечной сшивки (например, дифункционального агента
для поперечной сшивки). В некоторых вариантах осуществления,
агент для поперечной сшивки содержится в количестве примерно от
0,01% примерно до 5% или примерно от 0,1% примерно до 5,0% или
примерно от 0,2% примерно до 1%, по отношению к общей массе
присутствующих мономеров. В некоторых вариантах осуществления,
агенты для поперечной сшивки представляют собой дифункциональные
мономеры для поперечной сшивки не-полиалкениловых простых
полиэфиров, таких как дивинилгликоль, 2,З-дигидроксигексан-1,5-
диен, 2,5-диметил-1,5-гексадиен, дивинилбензол, N,N-
диаллилакриламид, N,N-диаллилметакриламид; агенты для поперечной сшивки простых полиалкениловых полиэфиров, содержащие две или более группировки простого алкенилового эфира на молекулу, например, группировки простых алкениловых эфиров, содержащие
конечные группы Н2С=С, полученные от этерификации многоатомного спирта, содержащего, по меньшей мере, четыре атома углерода и, по меньшей мере, три гидроксильных группы, с помощью алкенилгалогенида, такого как аллилбромид или что-либо подобное, например, полиаллилсахарозу, полиаллилпентаэритритол или что-либо подобное; диолефиновые не-гидрофильные макромерные агенты для поперечной сшивки, имеющие молекулярные массы примерно от 4 00 примерно до 8 000, такие как нерастворимые диакрилаты и полиакрилаты и метакрилаты диолов и полиолов, продукты реакции с диизоцианатгидроксиалкилакрилатом или -метакрилатом преполимеров с изоцианатными окончаниями, полученные из диолов сложных полиэфиров, диолов простых полиэфиров или полисилоксандиолов с гидроксиалкилметакрилатами, и тому подобное.
В некоторых вариантах осуществления, поперечно сшитые полимеры получают из карбокси-содержащего моноэтилен-ненасыщенного мономера или мономеров, в качестве единственного присутствующего моноэтилен-ненасыщенного мономера, вместе с агентом или агентами для поперечной сшивки. В некоторых вариантах осуществления, полимеры являются такими, в которых примерно до 4 0%, а предпочтительно, примерно от 0% примерно до 2 0% масс, карбокси-содержащего моноэтилен-ненасыщенного мономера или мономеров замещается одним или несколькими не содержащими карбоксила моноэтилен-ненасыщенными мономерами, содержащими только физиологически и офтальмологически нетоксичные заместители, включая сложные эфиры акриловой и метакриловой кислоты, такие как метилметакрилат, этилакрилат, бутилакрилат,
2- этилгексилакрилат, окстилметакрилат, 2-гидроксиэтилметакрилат,
3- гидроксипропилакрилат, и тому подобное, винилацетат, N-винилпирролидон, и тому подобное (например, Mueller et al. патент США № 4548990). В некоторых вариантах осуществления, полимеры содержат поликарбофил (Noveon АА-1), Carbopol(r) и DuraSite(r). В некоторых вариантах осуществления, поперечно сшитые полимеры получают посредством суспензионной или эмульсионной полимеризации мономеров, с использованием обычных свободно-радикальных катализаторов полимеризации, до размера сухих частиц
не более примерно, чем 50 мкм в терминах эквивалентного сферического диаметра. В некоторых вариантах осуществления, средний размер сухих частиц составляет примерно от 1 примерно до 3 0 мкм или примерно от 3 примерно до 2 0 мкм в терминах эквивалентного сферического диаметра. В некоторых вариантах осуществления, полимерные частицы получают посредством механического измельчения полимерных частиц больших размеров. В других вариантах осуществления, такие полимеры будут иметь молекулярную массу примерно от 250000 примерно до 4000000 и от 3000000000 до 4000000000. В других вариантах осуществления, частицы поперечно сшитого полимера являются монодисперсными, это означает, что они имеют распределение размеров частиц такое, что, по меньшей мере, примерно 8 0%, примерно 90% или примерно 95%, частиц попадает в микронную зону распределения главных размеров частиц. В других вариантах осуществления, монодисперсный размер частиц означает, что имеется не более, примерно, чем 2 0%, примерно, чем 10% или примерно, чем 5% частиц размером меньше 1 мкм. В некоторых вариантах осуществления, водная полимерная суспензия содержит примерно от 0,05 примерно до 1%, примерно от 0,1 примерно до 0,5% или примерно от 0,1 примерно до 0,5% агента и примерно от 0,1 примерно до 10%, примерно от 0,5 примерно до 6,5%, примерно от 0,5 примерно до 2,0%, примерно от 0,5% примерно до 1,2%, примерно от 0,6 примерно до 0,9% или примерно от 0,6 примерно до 0,8% полимерного суспендирующего агента. Хотя он упоминается в единственном числе, должно быть понятно, что можно использовать один или несколько видов полимерного суспендирующего агента, при этом его общее количество попадает в сформулированные диапазоны. В одном из вариантов осуществления, количество нерастворимых слегка поперечно сшитых полимерных частиц, рН и осмотическое давление могут коррелировать друг с другом и со степенью поперечной сшивки для получения композиции, имеющей вязкость в пределах примерно от 50 0 примерно до 100000 сантипуаз, а предпочтительно, примерно от 1000 примерно до 30000 или примерно от 1000 примерно до 10000 сантипуаз, как измерено при комнатной
температуре (примерно 25°С) с использованием Brookfield Digital LVT Viscometer, снабженного шпинделем номер 25 и малым держателем образца 13R при 12 об/мин. В некоторых вариантах осуществления, вязкость составляет примерно от 10 примерно до 4 00 сантипуаз, примерно от 10 примерно до 2 00 сантипуаз или примерно от 10 примерно до 2 5 сантипуаз.
В некоторых вариантах осуществления, водные полимерные суспензии могут приготавливаться таким образом, что они сохраняют одинаковую или по существу такую же вязкость в глазу, как они имели перед введением в глаз. В некоторых вариантах осуществления, они могут приготавливаться таким образом, что имеется повышенное гелеобразование при контакте со слезной жидкостью. Например, когда препарат, содержащий DuraSite(r) или другой сходный полимер, типа полиакриловой кислоты, вводится в глаз при рН меньшем, примерно, чем 6,7, полимер может набухать при контакте со слезной жидкостью, поскольку она имеет более высокий рН (примерно 7). Это гелеобразование или повышение гелеобразования может приводить к захвату суспендированных частиц, тем самым увеличивается время удерживания композиции в глазу. В некоторых вариантах осуществления, агент медленно высвобождается, когда суспендированные частицы растворяются со временем. В некоторых вариантах осуществления, этот способ доставки повышает комфорт пациента и увеличивает время контакта агента с тканями глаза, тем самым увеличивая степень поглощения лекарственного средства и продолжительность действия препарата в глазу. Агенты, содержащиеся в этих системах доставки лекарственных средств, будут высвобождаться из геля при скоростях, которые зависят от таких факторов как само лекарственное средство и его физическая форма, степень нагрузки лекарственного средства и рН системы, а также от любых вспомогательных веществ для доставки лекарственных средств, таких как ионообменные смолы совместимые с поверхностью глаза, которые также могут присутствовать.
В некоторых вариантах осуществления, антагонист IL-б доставляется субъекту с использованием генетической доставки,
например, локальной генетической доставки. Такая доставка может осуществляться с помощью системы транзиентной экспрессии, стабильной (например, встроенной) системы экспрессии, такой как лентивирусная система доставки, изготавливаемая Bluebird Bio (Cambridge, MA) , или доставки в клеточной фабрике, такой как те, которые производятся Neurotech (Cumberland, Rhode Island).
Все технические особенности могут индивидуально объединяться во всех возможных сочетаниях таких особенностей.
Эквиваленты
Настоящее изобретение может осуществляться в других
конкретных формах без отклонения от его духа или главных
характеристики. Следовательно, предшествующие варианты
осуществления должны рассматриваться во всех аспектах как иллюстративные, а не ограничивающие изобретение, описанное в настоящем документе.
Примеры
Следующие далее неограничивающие примеры дополнительно иллюстрируют варианты осуществления изобретений, описанных в настоящем документе.
Пример 1: Подтверждение действия локальной блокады IL-6 на модели неоваскуляризации хороидеи (CNV)
Для определения того, может ли локальная блокада IL-б быть эффективной при лечении глазных заболеваний, например, диабетического макулярного отека (DME) или влажной AMD, антитело анти-IL- б вводится локально, используя модельную систему для неоваскуляризации хороидеи. Модель индуцированной лазером CNV (eyecro.com/in-vivo/laser-iduced-horoidal-neovascularization-cnv/) воспроизводит многие из патологических процессов, лежащих в основе DME, включая воспаление и ангиогенез. Исследования осуществляют на крысах от EyeCRO (Oklahoma City, OK) . Шесть животных в каждой группе подвергают воздействию билатеральной обработки лазером в День 0 с осуществлением трех повреждений в каждом глазу. В дни 3 и 10, 3 мкг поликлонального антитела анти-IL-6 крысы (R &D Systems AF506; Minneapolis, MN) вводят исследуемой группе посредством инъекции в стекловидное тело (IVT), при этом PBS или поликлональное антитело анти-VEGF (R &D
Systems AF5 64) вводят группам с несущей средой и группам с положительным контролем, соответственно. Ангиографию in vivo осуществляют в дни 15 и 22 для измерения площади повреждений. Как в день 15, так и в день 22, группа леченая антителом анти-IL-6 имеет значительно уменьшенную неоваскуляризацию по сравнению с контролем с несущей средой. Нет значительной разницы в реакции между группой леченой антителом анти-1Ъ-б и положительным контролем с антителом анти-VEGF. Фиг.1 показывает результаты такого эксперимента. Эти данные демонстрируют, что IL-ба, например, антитело анти-1Ъб, введенное IVT, может уменьшать неоваскуляризацию в модели CNV крыс до уровней, сходных с положительным контролем с антителом анти-VEGF (р=0,0054 в День 15 и р=0,0005 в День 22 для антитела анти-1Ъ-б по сравнению с контролем с несущей средой).
Эти данные показывают, что локальная блокада IL-6 может быть пригодной для использования при лечении глазных заболеваний, таких как заболевания, включающие пропотевание жидкости через сосуды, например, макулярный отек.
Пример 2: Кандидаты в антитела антагонисты против IL-6
Кандидаты в антитела антагонисты против IL-б разрабатывают с использованием способа, который включает сначала иммунизацию. Иммунизацию осуществляют под руководством авторов настоящего изобретения в конкретной исследовательской организации (CRO). Пять мышей BALB/C получают в виде подкожной инъекции 8 0 мкг IL-б человека (R &D Systems, cat# 206-IL/CF, Minneapolis, MN) в PBS, содержащем 1 M NaCl с адъювантом Фройнда. Осуществляют две активизации с помощью 8 0 мкг и 50 мкг IL-б. Собирают клетки селезенки у мышей с самым высоким титром и осуществляют их слияние с клетками миеломы Р3х763Ag8.653 с образованием гибридом.
Супернатанты гибридом просматривают относительно связывания и антагонизма к IL-б. Для осуществления ELISA со связыванием, планшеты Costar 9018 покрывают 1 мкг/мл IL-б человека в PBS в течение ночи при 4°С. Лунки блокируют PBS, содержащим 2% BSA, промывают, а затем инкубируют с помощью 50 мкл каждого супернатанта гибридомы, разбавленного 1:2 PBS, содержащего 2%
BSA. Через 60 минут, лунки промывают три раза 300 мкл PBS, содержащего 0,1% Tween-20. Антитела анти-HRP мыши, разбавленные 1:3000 в PBS-BSA, затем добавляют их в каждую лунку и инкубируют в течение 30 минут. Лунки промывают, как выше, затем добавляют субстрат 3,3',5,5'-тетраметилбензидина (ТМВ) и измеряют сигнал на 450 и 550 нм. Для исследования антагонизма, репортерные клетки HEK-Blue(tm)-IL6 (InvivoGen, San Diego, CA) инкубируют при повышении концентрации IL-б человека в присутствии разбавленного 1:10 супернатанта гибридомы. Через 20-24 часа, 20 мкл супернатанта смешивают с 180 мкл QuantiBlue(tm) (InvivoGen), и измеряют коэффициент поглощения на 655 нм.
На основе исследования связывания и антагонизма, гибридома 64 выбирана авторами настоящей заявки как перспективный кандидат и субклонируется на CRO. Гибридома 64 (моноклональная гибридома мышиных) исследуется в дальнейшем на способность ингибирования связывания комплекса IL-6/IL-6Ra с др130 с использованием иммуносорбентного анализа со связанными ферментами (ELISA). Гибридома 64 при концентрации 1,5 мкг/мл значительно уменьшает связывание комплекса IL-6/IL-6Ra с иммобилизованным др13 0 согласно ELISA (Фиг.2).
Субклоны просматривают, и вариабельные домены субклона 64.58 амплифицируют с помощью 5' RACE PCR и секвенируют. Последовательности вариабельного домена мыши (упоминается как тб4) являются следующими:
тб4 VH (вариабельный домен тяжелой цепи)
QVQLQQSGAELVRPGTSVKVSCKASGYAFSNYLIEWVKQRPGQGLEWIGVITPGSGTIN YNEKFKGKAVLTADKS S S TVYMQLSSLTSDDSAVYFCAKSRWDPLYYYALEYWGQGT SVTVS S (SEQ ID N0:13)
m64 VL (вариабельный домен легкой цепи)
DIVLTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVDNYGISFMNWFQQKPGQPPKLLIYAASNQG SGVPARFSGSGSGTDFSLNIHPMEEDDTAMYFCQQSKEVPLTFGAGTKLELK (SEQ ID N0:14)
Для создания гуманизированных последовательностей, области, определяющие комплементарность (CDR), тб4 прививают на каркас зародышевой линии человека, выбранный в связи с его сходством с
последовательностью мыши посредством компьютерного алгоритма. Гуманизированные последовательности (упоминаются как пб4) являются следующими (измененные остатки по сравнению с последовательностями тб4 подчеркнуты) и имеют идентичность примерно 79,5% (VH) и идентичность 84,4% (VL) с последовательностями мышиных: h64 VH
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYAFSNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVITPGSGTIN YAQKFQGRVTIТАРЕ STSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVS S (SEQ ID N0:15)
h64 VL
DIVMTQSPDSLAVSLGEPJVTINCRASESVDNYGISFMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNQG SGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCOOSKEVPLTFGOGTKLEIK (SEQ ID N0:16)
Гуманизированные последовательности синтезируют с помощью DNA2.О (Menlo Park, СА), затем клонируют в векторы экспрессирования, полученные из pcDNA3.1 в качестве inline слияний с константными доменами IgGl человека. IgG экспрессируют посредством транзиентного трансфицирования в клетках Freestyle(tm)-293 (Invitrogen, Grand Island, NY) и очищают с помощью хроматографии на белке А. В исследованиях, как связывания, так и антагонизма, IgG h64 демонстрирует значительно сниженную эффективность, по сравнению с его предшественником тб4. По этой причине, дрожжевой дисплей используют для восстановления утерянного сродства.
Для осуществления созревания сродства, разработанного для восстановления или улучшения сродства гуманизированного h64IgG, последовательности антитела пб4 повторно клонируют для генерирования молекулы Fab в дрожевых векторах, полученных из pYC2/CT, в которых цепь FabH сливается с scFv 4m5.3 антитела анти-FITC через линкер (G4S)3 (SEQ ID NO: 29). Затем генерируется библиотека вариантов пб4 посредством допускающей ошибки PCR, следуя протоколу Chao et al. (2006, Nature Protocols, 1:755-768) . Варианты H64 экспрессируются и захватываются на поверхности дрожжей, меченых FITC-PEG-NHS,
затем инкубируются вместе с биотинилированным IL-б человека. Связанный IL-б детектируется с помощью стрептавидина-АРС, и клетки с самым большим количеством связанного IL-б, по сравнению с количеством Fab дисплея, выбираются с помощью селекции на клеточном сортере BD FACSAria(tm). После четырех заходов селекции, выбирается с помощью селекции и секвенируется популяция вариантов с более высоким сродством. Последовательность клона, выбранного с помощью селекции посредством созревания сродства (упоминается как пб4-1.4), является такой, как следует далее с выбранными с помощью селекции мутациями (то есть, мутировавшего по сравнению с последовательностями h64 VH и VL), выделенными жирным шрифтом, и CDR подчеркнуты. Они представляют собой вариабельные домены 018 (а также молекулы 020 и 029 IL-ба, описанные ниже). Отметим, что полные Fab содержат домены СК и CHI IgGl. В контексте настоящей заявки, упоминание последовательности аминокислот тяжелой цепи или легкой цепи "Fab" означает, что последовательность может представлять собой часть функционирующего Fab, состоящего из последовательности, полученной из легкой цепи, и последовательности, полученной из тяжелой цепи.
П64-1.4 VH (018VH)(вариабельный домен)
OVOLVOSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYALSNYLIEWVRQAPGOGLEWMGVITPGSGTIN YAQKFQGRVTITAPESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGOGTTVTVSS (SEQ ID N0:17)
п64-1.4 VL (018VL) (вариабельный домен)
DIVMTOSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYOQKPGOPPKLLIYAASNRG SGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCOOSEEVPLTFGOGTKLEIKRTV (SEQ ID N0:18)
Вариабельные домены h64-1.4 повторно клонируются в вектор pcDNA3.1 IgGl человека и экспрессируются как IgGl полной длины в клетках Freestyle(tm)-HEK293 (Life Technologies) . Полученные в результате очищенные IgG являются значительно болееэффективными, чем исходное антитело h64 при исследованиях, как связывания, так и клеточного антагонизма. При исследовании сродства с использованием системы дрожжей, сродство увеличивается от 343 пМ
для исходной гуманизированной молекулы до 4 3 пМ. Эфективность антагониста была увеличена примерно в десять раз, как проанализировано с использованием системы клеток HEK-Blue.
IgG пб4-1.4 переформатируется как Fab для использования при глазных и других показаниях. В дополнение к этому, осуществляют другой заход генерирования библиотеки и селекции на основе дрожжей для дальнейшего улучшения сродства. После четырех заходов селекции имеется значительное обогащение варианта VH с мутацией A7 9V. Антитела, варианты и их фрагменты, содержащие вариант A79V, упоминаются как антитела 019 IL-ба, их варианты и фрагменты.
Пример 3: Селекция формата
Для исследования соответствующих форматов для антагониста IL-б на основе антитела, антитела против IL-б выбранные с помощью селекции, как описано выше, исследуются относительно транзиентной экспрессии, стабильности, свойств агрегации, сродства связывания и IC50 с использованием форм Fab, scFv(VH-VL) и scFv(VL_H) последовательностей 018.
Результаты этих исследований для одной из молекул
кандидатов для IL-ба (последовательности, содержащие
вариабельную область 018) показаны в Таблице 1.
Таблица 1
Параметр
Fab
scFv(VH-VL)
scFv(VL_VH)
Транзиентная экспрессия
4 5 мг/мл
2 мг/л
4 мг/л
Стабильность (Тм)
73°С
43°С
4б°С
Агрегация (SEC, MALS)
Нет
Не применимо
Сродство связывания (KD)
24 0 пМ
1 нМ
72 0 пМ
IC50 для 10 пМ IL-б
2 55 пМ
160 пМ
125 пМ
Эти данные демонстрируют способ идентификации ключевых особенностей различных форматов антагониста IL-б на основе антитела и иллюстрируют, что для антагонистов IL-б, содержащих вариабельные области 018, формат 018Fab имеет наиболее благоприятные особенности в большинстве ключевых категорий, то есть, экспрессию, стабильность, агрегацию и сродство связывания,
по сравнению с конфигурацией scFv. IC50 Fab 018 попадает в разумный диапазон для терапевтического применения.
Пример 4: Примеры антител IL-ба, их фрагментов и производных
Авторы настоящей заявки идентифицировали следующие последовательности, используя способы, описанные в настоящем документе. Подчеркнутые последовательности представляют CDR тяжелых и легких цепей. Другие последовательности можно найти в описании.
Последовательность полипептидов тяжелой цепи 018 (полной длины; fl018HC) в каркасе IgGl
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYALSNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVITPGSGTIN YAQKFQGRVTITAPESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSA STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL SSWTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPK PKDTLMISRTPEVTCWVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRWSVLTVLH QDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYP SDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQ KSLSLSPGK (SEQ ID N0:19)
Последовательность нуклеиновых кислот тяжелой цепи 018 (полной длины; fl018HC) в каркасе IgGl
CAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGGGCCGAGGTTAAGAAGCCAGGGAGCAGCGTCAAGGT ATCTTGTAAAGCGTCTGGTTACGCCCTTTCAAACTACCTGATCGAATGGGTGAGGCAGGCTCCC GGCCAAGGCCTGGAATGGATGGGAGTTATCACCCCTGGGAGCGGCACCATTAATTACGCCCAGA AATTTCAGGGACGAGTGACGATTACCGCCGACGAGTCCACCAGTACTGCCTACATGGAGCTGTC CTCACTCCGCAGCGAGGACACGGCAGTTTACTACTGCGCCCGGAGTCGATGGGACCCTCTTTAC TATTATGCTCTGGAATACTGGGGCCAGGGAACGACCGTTACAGTGTCATCTGCTAGCACAAAAG GACCATCAGTCTTCCCACTTGCTCCTTCATCTAAGAGCACAAGTGGTGGCACTGCAGCCCTTGG CTGCCTGGTGAAAGATTATTTCCCCGAACCTGTTACAGTTTCTTGGAACTCCGGTGCACTGACA TCCGGAGTACACACTTTCCCAGCTGTGCTGCAGAGCTCAGGACTGTATAGCCTGTCTTCGGTGG Т СAC TGTTCCATCGTC GAG Т С Т Т G G СACACAGACATATATТ Т GСAACGТ СААТ СACAAGССС Т С СААСACAAAAGТGGATAAGAAGGТСGAGСССАААТСТТGТGACAAGACССATACGТGТССТССС TGTCCCGCCCCTGAACTGCTGGGAGGCCCTTCTGTGTTCCTGTTCCCACCTAAGCCAAAGGACA CTCTGATGATCAGCCGGACTCCCGAGGTTACCTGTGTGGTGGTGGATGTGTCTCATGAAGACCC TGAGGTTAAGTTCAATTGGTACGTGGATGGCGTCGAGGTGCATAACGCAAAAACCAAGCCGAGA GAG GAG СAG ТAC a a tAG САС С ТATAGAG TAG Т GAG С G Т С С Т GAC Т G Т С Т ТACAT СAG GAT Т G G С
Т С ААТ G G ТAAAGAATATAAG Т G С AAG G Т AAG СAACAAG G С С С Т АС С С G С АС СААТAGAGAAGAC CATCTCCAAGGCGAAAGGTCAGCCCAGGGAGCCCCAGGTTTATACACTGCCTCCCTCACGCGAC GAATTAACAAAGAATCAGGTGTCTCTCACCTGTCTCGTCAAGGGCTTTTACCCTTCCGACATCG CCGTGGAGTGGGAATCCAATGGCCAGCCTGAGAACAATTATAAGACAACTCCCCCAGTCCTGGA TTCAGATGGGTCGTTCTTTCTATATAGTAAGTTGACCGTGGATAAGTCTCGCTGGCAACAGGGG AACGTGTTCTCTTGCTCTGTTATGCATGAAGCGCTGCACAATCATTATACCCAGAAGTCCCTGT CCCTGAGCCCCGGGAAG (SEQ ID N0:20)
Последовательность полипептидов тяжелой цепи Fab 018 (018FabHC) в каркасе IgGl. CDR подчеркнуты
OVOLVOSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYALSNYLIEWVRQAPGOGLEWMGVITPGSGTIN YAQKFQGRVTITAPESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGOGTTVTVSSA
STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL SSWTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC (SEQ ID N0:1)
Последовательность
полипептидов
легкой цепи
018 полной
длины (f1018
LC). CDR подчеркнуты
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASESVD
NYGIPFMNWY
QQKPGQPPKL
LIYAASNRGS
GVPDRFSGSG
SGTDFTLTIS
SLQAEDVAVY
YCQOSEEVPL
TFGQGTKLEI
KRTVAAPSVF
IFPPSDEQLK
SGTASWCLL
NNFYPREAKV
QWKVDNALQS
GNSQESVTEQ
DSKDSTYSLS
STLTLSKADY
EKHKVYACEV
THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ
ID N0:2)
Это представляет собой также и
последовательность легкой
цепи для 02 0
и 029 антагонистов IL-б
Последовательность
нуклеиновых
кислот легкой
цепи 018
полной длины
(018LC) в каркасе IgGl
GACATAGTGA TGACTCAAAG TCCGGACAGC
CTGGCGGTGT
CACTCGGCGA
ACGGGCAACT
ATCAACTGCC
GAGССAGСGA
GAGCGTCGAT
AATTACGGCA
ТССССТТСАТ
GAACTGGTAT
СAG СAGAAG С
CAGGACAGCC
GCCCAAGCTG
CTTATCTACG
CCGCTTCCAA
CCGGGGATCA
GGGGTGCCCG
ATСGATTTAG
TGGAAGCGGT
AGTGGGACCG
ATTTCACACT
GACCATСAGС
TCCCTTCAGG
CCGAGGATGT
GGCTGTCTAT
TATTGTCAGC
ААТССGAGGA
AGTGCCGCTC
ACGTTTGGTC
AG G GAAC СAA
ACTGGAGATC
AAGCGGACCG
TAGCGGCGCC
TAGTGTCTTC
ATCTTCCCAC
CCTCCGACGA
ACAGCTGAAG
TCTGGCACTG
CTTCCGTCGT
GTGCCTGCTC
AACAACTTTT
ACCCTAGAGA
GGCAAAAGTT
СААТ G GAAAG
TAGACAATGC
CTTGCAGTCC
GGGAACTCCC
AGGAGTCTGT
СACAGAG СAG
GATAGTAAGG
ACTCAACCTA
CAGCCTGTCC
AGCACACTGA
СССТСТССАА
AGССGACTAC
GAGAAGCACA
AAGTGTACGC
TTGCGAAGTT
ACGCATСAGG GGCTGTCCTC ACCCGTTACA AAAAGTTTTA ACAGAGGGGA GTGC (SEQ ID N0:26)
PGQGLEWMGV TAVYYCARSR SGGTAALGCL VTVPSSSLGT
Тяжелая цепь Fab 019 (Fab HC 019, такая же, как последовательность как для Fab НС 018, за исключением A79V (жирный шрифт/курсив))
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYALS NYLIEWVRQA ITPGSGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTVY MELSSLRSED WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SSASTKGPSV FPLAPSSKST VKDYFPEPVT VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV
QTYICNVNHK PSNTKVDKKV EPKSC (SEQ ID N0:3) VH 019 (вариабельная область/ НС 019) QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYALS NYLIEWVRQA
ITPGSGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTVY MELSSLRSED
PGQGLEWMGV TAVYYCARSR
WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SS (SEQ ID N0:27)
Последовательность легкой цепи антитела 019 (LC 019] полипептида и нуклеиновых кислот) такая же, как для LC 018
[для
CDR3 VH 019) Пример 5: Картирование эпитопа и структуры Картирование эпитопа
Функциональное картирование эпитопа осуществляют на выбранных с помощью селекции кандидатах в антагонисты IL-б. Обнаружено, что антитело кандидат (антитело 64 мышиных) не уменьшает связывания IL-6Ra с IL-б при анализе ELISA, это показывает, что антитело кандидат не связывается с сайтом I. Осуществляют дополнительные эксперименты, демонстрирующие, что химерное антитело 64 мышиных уменьшает связывание комплекса IL-6/IL-6Ra с др130 при анализе ELISA, показывая, что либо сайт II,
либо сайт III IL-б захватывает сайт связывания антитела. Также обнаружено, что антитело 64 мышиных не блокирует значительно связывания известного сайта III связывания антитела АН-65 (Immunotech, Marseille, France) с IL-б, показывая, что антитело кандидат связывает сайт II IL-б. Эти данные демонстрируют, что антитела против сайта II могут генерироваться, и демонстрируют способ идентификации таких антител.
Для дополнительного определения эпитопа, генерируются мутации IL-б в дрожжах как слияния с 4т5.3 (Boder et al. , 2000, Proc Natl Acad Sci USA 97, 10701-10705; Chao et al. , 2006, Nat Protoc 1, 755-768). Экспрессируемые мутации находятся в IL-б человека, это следующие одинарные или двойные мутации: R24E/D27E, R30E, Y31E, D34R, S118R/V121E, W157E, Q159E/T162P, К171Е и R17 9E. Экспрессируемые мутантные молекулы IL-б используются при исследованиях связывания с 018 (Fab). Наблюдают уменьшение сродства к (Fab) 018 для R24E/K27E, Y31E, D34R и S118R/V121R, все они находятся в сайте II IL-б. Соответственно, изобретение, описанное в настоящем документе, включает антитело, которое связывается, по меньшей мере, с одной, двумя, тремя, четырьмя, пятью или шестью аминокислотами в положении 24, 27, 31, 34, 118 и 121 IL-б человека или эквивалентного сайта в IL-б. Структурное определение эпитопа сайта II
Вычисляются следующие расстояния для структурного определения сайта II. Вычисления основываются на гексамерной кристаллической структуре IL-6/IL-6oc/gpl30, PDB 1Р9М (Boulanger et al. , 2003, Science 300: 2101-2104) . Спираль 1 IL-б проходит между сайтом I и сайтом II, давая в результате определенные остатки, которые попадают близко к сайту II, но имеют боковые цепи, которые направлены в сторону сайта I, например, R30. D2 и D3 относятся к внеклеточным доменам IL-6R0C.
Следующие аминокислоты IL-б, как определено, попадают в пределы 5А от D2-D3 gpl30: L19, R24, К27, Q28, R30, Y31, D34, Е110, QUI, R113, А114, М117, S118, VI21, Q124, F125 и К128.
Следующие аминокислоты, как определено, попадают в пределы 7А от D2-D3 gpl30: L19, Е23, R24, 125, К27, Q28, 129, R30, Y31,
D34, К41, Q102, Е109, El 10, QUI, A112, R113, A114, V115, Q116, M117, S118, K120, V121, L122, Q124, F125 и K128.
Соответственно, молекула, например, антитело или его фрагмент, который может связывать одну или несколько аминокислот IL-б, попадающих в пределы 5А или 7А от сайта II, может представлять собой IL-ба.
Последовательность IL-б человека приводится ниже для сравнения (подчеркнутая последовательность представляет собой лидерную последовательность). Аминокислоты в пределах 7А от D2-D3 др130 обозначены курсивом. Нумерация аминокислот, то есть, мутаций, используемых для определения эпитопов, не содержит лидерной последовательности:
IL-б человека
MNSFSTSAFGPVAFSLGLLLVLPAAFPAPVPPGEDSKDVAAPHROPLTSSЈKJDKQJKY ILDGISALRJvETCNKSNMCESSKEALAENNLNLPKMAEKDGCFQSGFNEETCLVKI ITGLLEFE VYLEYLQNRFESSЈЈQAi^VQMSTKVI,IQFLQi(KAKNLDAITTPDPTTNASLLTKLQAQNQWLQ DMTTHLILRSFKEFLQSSLRALRQM (SEQ ID N0:21)
Осуществляются эксперименты по исследованию фрагмента Fab гуманизированного антитела пб4-1.4, и они демонстрируют, что возможно блокирование передачи сигналов как цис-, так и транс-IL-6, которое вызывается нацеливанием на сайт II. Эффективность фрагмента Fab не изменяется в присутстви растворимого рецептора IL-б (sIL-6R). Это является противоположностью антителу анти-IL-6R IgG, у которого эффективность уменьшается в присутствии sIL6R, и которое блокирует только цис передачу сигналов.
Эти эксперименты демонстрируют, что антитело или фрагмент антитела, такой как фрагмент Fab, который нацелен на сайт II, можно использовать для ингибирования передачи сигналов как цис-, так и TpaHc-IL-б.
Пример 6: Исследования на приматах
Поскольку активности для существ иных, чем приматы могут сильно отличаться от активности на приматах, кандидаты в антагонисты IL-б, как правило, дополнительно оцениваются относительно РК и других параметров с использованием приматов, отличных от человека. IL-б человека отличается от IL-б яванского макака и макака-резус в семи сайтах, один из которых находится в
сайте II (аминокислота 28) и является таким же, как сайт II Африканской зеленой мартышки IL-б. Это, видимо, уменьшает связывание антитела, содержащего последовательности 018, всего лишь примерно в 3-4 раза. Способность к связыванию IL-б приматов отличных от человека представляет собой полезную особенность антагониста IL-б, облегчая разработку кандидата в лекарственное средство, например, давая возможность исследования, такого как токсикологическое исследование на приматах, отличных от человека.
Как и большинство антител против IL-б, антитела анти-IL- б, описанные в настоящем документе, не взаимодействуют перекрестно с IL-б грызунов, кроликов или собачьих из-за низкой гомологии последовательностей. Однако при исследованиях сродства обнаружено, что Fab 018 связывает IL-б яванского макака и Африканской зеленой мартышки приблизительно с таким же сродством, как и для человека (Таблица 2).
Эти данные дополнительно демонстрируют способность IL-ба, как описано в настоящем документе, к специфичному связыванию и возможность разработки молекулы, имеющей особенности, делающие возможным исследования, например, изучение токсикологии и репродуктивные исследования, на соответствующем животном.
Пример 7: Повышение экспрессии IL-ба
Для повышения экспрессии полипептидов Fab 018 и Fab 019, получают конструкты, вводя пять дополнительных аминокислот (DKTHT (SEQ ID NO: 30)) в тяжелую цепь в области CHI/шарнира с
использованием способов, известных в данной области. Последовательность измененной тяжелой цепи Fab 018 показана ниже как SEQ ID N0:24. Измененная последовательность 018 упоминается в настоящем документе как 02 0, и измененная последовательность 019 упоминается в настоящем документе как 021. Молекула 020 (тяжелая цепь Fab 02 0 и легкая цепь Fab 018) имеет улучшенное экспрессирование по сравнению с исходным Fab, который имеет тяжелую цепь Fab 018 и легкую цепь Fab 018. Молекула 019 не демонстрирует значительных различий по сродству по сравнению с молекулой 020. Экспрессирование как 020, так и 019 повышается примерно в два раза, соответственно, и сродство не подвергается влиянию этого изменения.
Тяжелая цепь 020 (Fab с DKTHT (SEQ ID NO: 30) на карбокси окончании)
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYALS NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV ITPGSGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SSASTKGPSV FPLAPSSKST SGGTAALGCL VKDYFPEPVT VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSSLGT QTYICNVNHK PSNTKVDKKV EPKSCDKTHT (SEQ ID N0:24)
Антагонизм IL-б с использованием Fab 02 0 измеряют на репортерных клетках HEK-Blue(tm) IL-б (InvivoGen, San Diego, CA) . Клетки инкубируют в смеси 10 пМ IL-б и при изменяющихся концентрациях антитела, либо 020, либо IL-6Ra (Cell Sciences, Canton, MA), либо с 50 нМ IL-6Ra, либо без него. Через 20-24 часа инкубирования, 2 0 мкл супернатанта клеточной культуры смешивают с 180 мкл субстрата QuantiBlue(tm) (InvivoGen) и инкубируют в течение одного часа; затем измеряют коэффициент поглощения на 655 нм. Фиг.ЗА и Фиг.ЗВ показывают данные от этих экспериментов, демонстрируя способность 020 ингибировать активность IL-б в присутствии или в отсутствие IL-6R.
Пример 8: Антитела IgG2 против IL-6
018 переформатируют в каркасе изотипа IgG2 человека для уменьшения связывания FcyR и уменьшения ADCC по сравнению с форматированным антителом IgGl с использованием способов, известных в данной области. В дополнение к этому,
переформатирование 018 в формат полной длины, например, IgG2, как ожидается, уменьшит скорость выведения из стекловидного тела благодаря большему размеру молекулы.
Конструирование/очистка антитела IqG2 анти-1Ъ6
Для конструирования антител IgG2 человека с использованием последовательностей антитела анти-1Ъ-б, описанных выше, константный домен IgG2 человека амплифицируется с помощью PCR с cDNA с сайтами рестрикции Nhel и Mlul на N- и С-конечных краях, соответственно. Продукт PCR очищается, переваривается с помощью ферментов рестрикции Nhel и Mlul, а затем лигируется в вектор рТТ5, содержащий вариабельный домен анти-1Ъб, то есть, SEQ ID N0:1 (смотри выше). Это дает последовательность тяжелой цепи IgG2 полной длины. Плазмиды, содержащие легкую цепь полной длины, содержащую последовательность 018, используют для получения легкой цепи.
Для дополнительного уменьшения связывания FcRn и, тем самым, уменьшения рециклирования IL-ба, осуществляют точечные мутации в тяжелой цепи. Мутации осуществляют с помощью мутагенеза QuikChange(r) (Agilent Technologies, Santa Clara, CA) . Плазмиды тяжелой и легкой цепи совместно трансфицируются с использованием поли(этиленимина) (PEI) в 100-мл транзиентные культуры клеток НЕК2 93-6Е и культивируются, чтобы сделать возможным экспрессирование в течение примерно пяти дней. Это генерирует антитела, содержащие остаток связывания сайта II антитела анти-1Ъ-б и структуру IgG2. Такие структуры, содержащие CDR 018, определяются в настоящем документе как 018 IgG2 или 029. Точечные мутации осуществляют на остатках 1253.
Молекула IgG2 хорошо экспрессирует и блокирует IL-б при клеточных анализах с чуть улучшенной эффективностью по сравнению с Fab 02 0.
Зрелые последовательности 02 9 (CDR подчеркнуты) Тяжелая цепь 02 9
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYALS NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV ITPGSGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SSASTKGPSV FPLAPCSRST SESTAALGCL
VKDYFPEPVT QTYTCNVDHK TLMISRTPEV FRWSVLTW TLPPSREEMT
VSWNSGALTS PSNTKVDKTV TCVWDVSHE HQDWLNGKEY KNQVSLTCLV
GVHTFPAVLQ ERKCCVECPP DPEVQFNWYV KCKVSNKGLP KGFYPSDIAV
SSGLYSLSSV CPAPPVAGPS DGVEVHNAKT APIEKTISKT EWESNGQPEN
VTVPSSNFGT VFLFPPKPKD KPREEQFNST KGQPREPQVY NYKTTPPMLD
SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID N0:11)
QQKPGQPPKL YCQQSEEVPL NNFYPREAKV EKHKVYACEV
Легкая цепь 029
SGTASWCLL STLTLSKADY
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASESVD NYGIPFMNWY LIYAASNRGS GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY TFGQGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID N0:12)
Измененное связывание FcRn
IL-б может иметь определенные положительные системные воздействия. Следовательно, является преимущественным получение с помощью генной инженерии IL-ба, который имеет хорошее удерживание в стекловидном теле, но имеет ограниченное системное время полужизни. Уменьшение или устранение связывания FcRn должно уменьшить системную аккумуляцию любого лекарственного средства, которое утекает в циркуляцию, улучшая тем самым безопасность IL-ба.
Соответственно, поскольку медиируемая FcRn направленная миграция может увеличить отток антител из глаза, 02 0 IgG2 дополнительно модифицируют для устранения связывания FcRn посредством введения мутаций Fc на остатках 1254, Н311 или Н436 (смотри SEQ ID N0:23) (нумерация в соответствии с Martin et al. , Molecular Cell, 7:4, 867-877 (2001)). Сайты мутации показаны жирным шрифтом в SEQ ID N0:23; 1254 мутирует до А или R, Н311 мутирует до А или Е, Н311 мутирует до N, когда D313 мутирует до Т, и Н436 мутирует до А (нумерация начинается после лидерной последовательности, которая подчеркнута в SEQ ID N0:23, антагонисты IL-б, содержащие такие последовательности, определяются как 018IgG2m.
Тяжелая цепь антитела анти-1Ъ-б (IgG2) (обычный шрифт: VH; курсив: СН) (без лидерной последовательности), показаны сайты мутации (жирный шрифт)
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYALS NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV
ITPGSGTINY
AQKFQGRVTI
TADESTSTAY
MELSSLRSED
TAVYYCARSR
WDPLYYYALE
YWGQGTTVTV
SSASTKGPSV
FPLAPCSRST
SESTAALGCL
VKDYFPEPVT
VSWNSGALTS
GVHTFPAVLQ
SSGLYSLSSV
VTVPSSNFGT
QTYTCNVDHK
PSNTKVDKTV
ERKCCVECPP
CPAPPVAGPS
VFLFPPKPKD
TLMISRTPEV
TCVWDVSHE
DPEVQFNWYV
DGVEVHNAKT
KPREEQFNST
FRWSVLTW
HQDWLNGKEY
KCKVSNKGLP
APIEKTISKT
KGQPREPQVY
TLPPSREEMT
KNQVSLTCLV
KGFYPSDIAV
EWESNGQPEN
NYKTTPPMLD
SDGSFFLYSK
LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID
N0:23)
Тяжелая
цепь антитела
анти-IL- 6
(IgG2) (обычный
шрифт: VH;
курсив: СН
) с лидерной
последовательностью (подчеркнута),
показаны сайты мутации (жирный шрифт)
MDWTWRILFLVAAATGAHSQVQLVQSGAE
VKKPGSSVKV
SCKASGYALS
NYLIEWVRQA
PGQGLEWMGV
ITPGSGTINY
AQKFQGRVTI
TADESTSTAY
MELSSLRSED
TAVYYCARSR
WDPLYYYALE
YWGQGTTVTV
SSASTKGPSV
FPLAPCSRST
SESTAALGCL
VKDYFPEPVT
VSWNSGALTS
GVHTFPAVLQ
SSGLYSLSSV
VTVPSSNFGT
QTYTCNVDHK
PSNTKVDKTV
ERKCCVECPP
CPAPPVAGPS
VFLFPPKPKD
TLMISRTPEV
TCVWDVSHE
DPEVQFNWYV
DGVEVHNAKT
KPREEQFNST
FRWSVLTW
HQDWLNGKEY
KCKVSNKGLP
APIEKTISKT
KGQPREPQVY
TLPPSREEMT
KNQVSLTCLV
KGFYPSDIAV
EWESNGQPEN
NYKTTPPMLD
SDGSFFLYSK
LTVDKSRWQQ
GNVFSCSVMH
EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID N0:28)
Соответственно, некоторые варианты осуществления включают антитело, имеющее последовательность тяжелой цепи, изображенную как SEQ ID N0:23, с мутациями на 1254 (например, А или R) , Н311 (мутирует до А или Е) , Н4 3 6 (мутирует до А) или D313 (мутирует до Т), когда Н311 мутирует до N.
Следовательно, SEQ ID N0:25 предлагает последовательность, которая, когда она мутирует на 1133 (например, I133A или I133R), HI90 (например, HI9OA мутирует на Н190Е), Н315 (например, Н315А) или D192 с Н190 (например, D192T с H190N), может использоваться в качестве антитела, его фрагмента или производного для
VKDYFPEPVT QTYTCNVDHK TLMISRTPEV FRWSVLTW TLPPSREEMT SDGSFFLYSK
VSWNSGALTS PSNTKVDKTV TCVWDVSHE HQDWLNGKEY KNQVSLTCLV LTVDKSRWQQ
получения полипептида, имеющего уменьшенное связывание с Fc при низких рН, например, при рН 5,5, или при лизосомальном рН, и/или полипептида, имеющего уменьшенное системное время полужизни по сравнению с исходной или другой эталонной молекулой, которая не содержит этой последовательности.
ERKCCVECPP DPEVQFNWYV KCKVSNKGLP KGFYPSDIAV
CPAPPVAGPS DGVEVHNAKT APIEKTISKT EWESNGQPEN
SASTKGPSV FPLAPCSRST SESTAALGCL GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSNFGT
VFLFPPKPKD KPREEQFNST KGQPREPQVY NYKTTPPMLD
GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID N0:25)
Легкая цепь антитела анти-IL- б (IqG2) (обычный шрифт: УК; курсив: СК)
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYQQKPGQPPKLLIYAASNRG SGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSEEVPLTFGQGTKLEIKKTVAAPSVT IFPPSDEQLK SGTASWCLL NNFYPREAKV QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID N0:22)
Пример 9: Стабильность препарата
Стабильность фрагмента Fab aHTH-IL-6/IgGl (содержащего домен CHI IgGl) исследуют посредством определения Тт сначала в PBS, а затем в наборе буферов и наполнителей с использованием дифференциальной сканирующей флуорометрии. Обнаружено, что цитратный буфер, рН 5,5, повышает Тт до более чем 80°С. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления, IL-ба предлагается в цитратном буфере, и в некоторых случаях он имеет Тт, по меньшей мере, 8 0°С.
Агрегацию исследуют с использованием SEC-MALS, и никакой агрегации не наблюдается при 2 0 мг/мл в фосфатном буферном солевом растворе (PBS).
Пример 10: рН-чувствительные антитела для улучшения РК
IL-б могут иметь определенные положительные системные воздействия. По этой причине, является преимуществом получение с помощью генной инженерии IL-ба, который имеет хорошее
удерживание в стекловидном теле, но имеет ограниченное системное время полужизни. Уменьшение или устранение связывания с FcRn должно уменьшить системную аккумуляцию любого лекарственного средства, которое утекает в циркуляцию, тем самым улучшая безопасность IL-ба. Соответственно, поскольку медиируемая FcRn направленная миграция может увеличить отток антител из глаза, 02 0 IgG2 дополнительно модифицируют для устранения связывания FcRn посредством введения мутаций Fc на остатках 1253, Н310 или Н435 (нумерация в соответствии с Martin et al. (Molecular Cell, 7:4, 867-877 (2001)) . Такие антитела упоминаются в настоящем документе как антитела IL-брН или антитела анти-1Г-брН и дополнительно описываются ниже.
Генерирование антител с рН-чувствительным связыванием рКа гистидина составляет примерно 6,0 и гистидины, вставленные на границах раздела связывания, могут разрушать связывание при протонировании боковых цепей при низких значениях рН. Используя антитело, нацеленное на сайт II, антитело анти-IL-6, как описано в настоящем документе, генерируют библиотеку, содержащую обогащенные гистидином варианты CDR от 018, и эту библиотеку просматривают относительно рН-чувствительного связывания с использованием дрожжевого дисплея. Генерируемая библиотека представляет собой комбинаторную библиотеку с CDR кодируемыми вырожденными кодонами, так что каждый остаток представляет собой либо остаток дикого типа (то есть, такой же, как в исходном антителе), либо гистидиновый остаток. Скрининг осуществляют посредством поочередной сортировки относительно высокого связывания при физиологических рН (7,4) и низкого связывания при эндосомальном рН (5,5).
С помощью дрожжевой селекции идентифицируется мутант, который имеет относительно высокое связывание при рН 7,4 (одновалентную Ко! 4 07 пМ для мутанта по сравнению с 192 пМ для исходной молекулы) и относительно низкое связывание при рН 5,5 (одновалентную Ко! 2, 362 нМ для мутанта по сравнению с 195 пМ для исходной молекулы). Это составляет изменение приблизительно в 5,8 раза для сродства при рН 5,5. Этот мутант содержит множество гистидиновых мутаций в CDR1 легкой цепи. Таким образом, этот
мутант демонстрирует связывание, сходное с исходной молекулой при рН 7,4, и значительную потерю сродства при рН 5,5. Это наблюдение проверяют с использованием анализа ELISA, FACS и анализа SPR, с помощью способов, известных в данной области.
Эти данные демонстрируют, что может быть создан IL-ба, который основан на антителе, который имеет особенности нацеливания антитела анти-IL- б на сайт II IL-б, что можно использовать для ингибирования активности как цис-, так и транс-IL-б, и он имеет улучшенную РК по сравнению с исходным антителом или другим антителом, имеющим домен Fc дикого типа, на него влияет, по меньшей мере, частичное изменение связывания при рН 5,5.
Пример 11: Эффективность локальной блокады IL-б в модели лазерной неоваскуляризации хороидеи (CNV) мышей
Для определения того, может ли локальная блокада IL-6 быть эффективной при лечении глазного заболевания, например, диабетического макулярного отека (DME) или влажного AMD, моноклональное антитело анти-IL- б вводится локально в модельную систему для неоваскуляризации хороидеи. Лазерно индуцированную модель CNV, как описано в Saishin et al. Journal of Cellular Physiology, 195:241-248 (2003), используют в настоящем Примере. Модель лазерно индуцированной CNV воспроизводит множество патологических процессов, лежащих в основе диабетического макулярного отека (DME), включая воспаление и ангиогенез.
Моноклональное антитело анти-1И-б мыши (MP5-20F3, которое представляет собой антитело изотипа IgGl крысы, купленное от Bio X Cell, catalog number BE0046), вводят исследуемой группе посредством инъекции в стекловидное тело (IVT). Контроли принимают инъекцию в стекловидное тело ловушки VEGF или инъекцию в стекловидное тело контрольного антитела изотипа анти-HRP (IgGl крысы против пероксидазы хрена, клон HRPN, покупают у BioXCell; catalog number ВЕ0088). Для всех групп антител, 20 мкг белка в объеме 1 мкл вводят посредством инъекции в исследуемый глаз, при этом противоположный глаз оставляют нелеченым в качестве дополнительного контроля.
Мышей умерщвляют посредством эвтаназии в День 7 после
лазерного воздействия и плоские срезы хороидеи окрашивают
лектином Griffonia Simplicifolia (GSA) для измерения площади
повреждений. Фиг.4 показывает результаты. Группа, леченная
антителом анти-1Ъ-б, показывает статистически значимое
уменьшение неоваскуляризации по сравнению с группой, леченной
контрольным антителом (р <0,05). В среднем, группа, леченная
антителом анти-IL-б, также показывает уменьшение
неоваскуляризации по сравнению с положительным контролем с антителом анти-VEGF.
Эти данные демонстрируют, что IL-ба, например, моноклональное антитело анти-IL-б, вводимое IVT, может значительно уменьшить неоваскуляризацию в модели CNV мышей. Кроме того, результаты говорят, что антитело анти-IL- б может осуществлять уменьшение неоваскуляризации, по меньшей мере, такое же, а возможно и большее, чем антитело анти-VEGF. Эти данные показывают, что локальное ингибирование IL-б является полезным при лечении глазных заболеваний, таких как заболевания, включающие пропотевание жидкости через сосуды, например, влажное AMD или макулярный отек, например, диабетический макулярный отек.
Пример 12: Разработка улучшенного антитела против IL-6.
Генерируются варианты антитела EBI-029. Чтобы лучше
характеризовать вклад мутаций A28V, S30P, I51T и S55G,
конкретные сочетания вводятся в вектор дисплея Fab EBI-029
дикого типа, и измеряется связывание. Результаты показаны на
Фиг.5. После конкуренции в течение ночи с 2 мкМ IL-б, все
мутанты имеют значительно более высокие уровни
биотинилированного IL-б, остающегося на их клеточных поверхностях, по отношению к дисплею, по сравнению с Fab EBI-029 дикого типа. Расположение по порядку для связывания от самого высокого до самого низкого сродства представляет собой A28V/S30P/I51T/S55G > A28V/I51T/S55G > S30P/I51T/S55G > I51T/S55G > WT. Учетверенная мутация A28V/S30P/I51T/S55G упоминается также в настоящем документе как EBI-030.
Последовательности EBI-030 показаны ниже.
Последовательности CDR 030:
GYVLPNYLIE (SEQ ID N0:31) VTTPGGGTIN (SEQ ID N0:32) SRWDPLYYYALEY (SEQ ID N0:33) RASESVDNYGIPFMN (SEQ ID N0:34) AASNRGS (SEQ ID N0:35) QQSEEVPLT (SEQ ID N0:36) Последовательность вариабельной области тяжелой цепи 030 (мутации по сравнению с 02 9 показаны жирным шрифтом):
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV TTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SS (SEQ ID N0:37)
Последовательность вариабельной области легкой цепи 030: DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCRASESVDNYGIPFMNWYOOKPGOPPKLLIYAASNRG SGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQAEDVAVYYCQQSEEVPLTFGQGTKLEIKRTV (SEQ ID N0:38)
Последовательность полипептидов тяжелой цепи Fab (IgGl) 030 (CDR подчеркнуты, мутации по сравнению с 02 9 показаны жирным шрифтом):
WDPLYYYALE
FPLAPSSKST SSGLYSLSSV
SGGTAALGCL VTVPSSSLGT
VKDYFPEPVT VSWNSGALTS QTYICNVNHK PSNTKVDKKV EPKSCDKTHT (SEQ ID N0:39)
В некоторых вариантах осуществления, последовательность DKTHT (SEQ ID N0:30) на карбокси окончании SEQ ID N0:39 не включается в последовательность Fab.
Последовательность нуклеиновых кислот тяжелой цепи Fab 030: CAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGGGCCGAGGTTAAGAAGCCAGGGAGCAGCGTCAAGGT ATCTTGTAAAGCGTCTGGTTACGTCCTTCCAAACTACCTGATCGAATGGGTGAGGCAGGCTCCC GGCCAAGGCCTGGAATGGATGGGAGTTACCACCCCTGGGGGCGGCACCATTAATTACGCCCAGA AATTTCAGGGACGAGTGACGATTACCGCCGACGAGTCCACCAGTACTGCCTACATGGAGCTGTC CTCACTCCGCAGCGAGGACACGGCAGTTTACTACTGCGCCCGGAGTCGATGGGACCCTCTTTAC TATTATGCTCTGGAATACTGGGGCCAGGGAACGACCGTTACAGTGTCATCTGCTAGCACAAAAG GACCATCAGTCTTCCCACTTGCTCCTTCATCTAAGAGCACAAGTGGTGGCACTGCAGCCCTTGG CTGCCTGGTGAAAGATTATTTCCCCGAACCTGTTACAGTTTCTTGGAACTCCGGTGCACTGACA
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV TTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSR YWGQGTTVTV SSASTKGPSV GVHTFPAVLQ
TCCGGAGTACACACTTTCCCAGCTGTGCTGCAGAGCTCAGGACTGTATAGCCTGTCTTCGGTGG T СAC TGTTCCATCGTC GAG T С T T G G СACACAGACATATAT T T G СAAC G T CAATСACAAGССС T С СAACACAAAAG Т G GATAAGAAG G Т С GAG С С САААТ С Т Т G Т GACААААСАСАСАСА(SEQ ID N0:40)
030 могут также быть получены в качестве последовательности полипептидов тяжелой цепи Fab IgG2:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVTTPGGGTIN YAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSA STKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSL SSWTVPSSNFGTQTYTCNVDHKPSNTKVDKTVERK (SEQ ID N0:54)
Пример 13: Экспрессирование и очистка вариантов фрагментов
Fab
Вставки в домен VH, содержащие следующие мутантные сочетания, A28V/I51T/S55G, S30P/I51T/S55G и A28V/S30P/I51T/S55G (EBI-030), генерируются из векторов дрожжевых дисплей посредством двойного переваривания с помощью BamHI-HF/Nhel-HF. Вставки очищаются с помощью электрофореза на 1% агарозном геле и лигируются в вектор экспрессии млекопитающих, полученный из рТТ5, содержащий лидерную последовательность, домен IgGl CHI человека и С-конечную His метку. Трансформанты выбираются с помощью селекции на LB-Amp, обрабатываются с помощью MiniPrep, и вставки подтверждаются посредством секвенирования. Транзиентные трансфицирования осуществляют в клетках НЕК-бЕ (Canadian Research Council) для каждой тяжелой цепи мутантной Fab, спаренной с легкой цепью EBI-029 дикого типа (описывается в настоящем документе как SEQ ID N0:12) с использованием PEI в качестве трансфицирующего реагента. Fab EBI-029 дикого типа также экспрессируется в качестве контроля (тяжелая цепь Fab дикого типа описывается в настоящем документе как SEQ ID N0:24). Супернатанты собирают через 5 дней и экспрессированные Fab очищают с помощью афинной хроматографии с использованием Ni-NTA агарозы (Life Technologies). Для очищенного белка осуществляют замену буфера в PBS, рН 7,4, посредством нескольких заходов концентрирования/разбавления и концентрацию и чистоту белка определяют с помощью Absorbance 280 и SDS-PAGE.
Пример 14: Варианты антител показывают улучшенное связывание согласно оценкам с использованием поверхностного плазмонного резонанса
Сродство вариантов молекул Fab 02 9 по отношению к IL-б измеряют с помощью поверхностного плазмонного резонанса (SPR) на спектрометре Reichert SR7000Dc. IL-б человека при 20 мкг/мл в 10 мМ растворе ацетата натрия, рН 4,5, иммобилизуют на 500-кДа карбоксиметилдекстрановом чипе посредством стандартного аминового связывания. Последовательные разбавления каждой молекулы Fab в 10 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, рН 7,3, инжектируют при 2 5°С при скорости потока 2 5 мкл/мин. Через 4 минуты, загрузку прекращают и измеряют диссоциацию посредством протекания проточного буфера (10 мМ HEPES, 150 мМ NaCl, рН 7,3) в течение 5 минут. Сенсограмма плохо подгоняется к модели связывания 1:1, возможно, из-за присутствия множества ориентаций IL-б на чипе или из-за неспецифичного связывания антитела. Вместо этого, кривые подгоняются по подгонке с 2 видами (виды с низким сродством и высоким сродством, отмеченные как "низкое сродство" и
"высокое сродство" в Таблице 3) с использованием программного обеспечения TraceDrawer, где kal, kdl и KD1 представляют собой скорость ассоциации, скорость диссоциации и равновесную постоянную связывания для видов с низким сродством, и ka2, kd2 и KD2 представляют собой скорость ассоциации, скорость диссоциации и равновесную постоянную связывания для видов с высоким сродством. Все мутантные Fab имеют значительно более медленную диссоциацию по сравнению с Fab EBI-029 WT со следующим расположением по порядку величины от самого высокого до самого низкого сродства - A28V/S30P/I51T/S55G (EBI-030) > S30P/I51T/S55G > A28V/I51T/S55G > (EBI-029) WT.
IL6
Линия репортерных клеток HEK-Blue(tm) IL6 (Invivogen) используется для сравнения эффективность ингибирования передачи сигналов IL6 между различными мутантными фрагментами Fab EBI-029. Клетки HEK-Blue(tm) IL6 представляют собой модифицированную линию НЕК2 93, стабильно экспрессирующую ген IL-6R и содержащую секретируемый репортерный ген щелочной фосфатазы под контролем минимального промотора IFN|3, слитого с четырьмя сайтами связывания STAT3. Для измерения антагонизма к IL6, 10 мкл 400 пМ IL-б человека (R &D Systems 206-IL-010/CF) смешивают с 10 мкл каждого варианта Fab в некотором диапазоне концентраций в 96-луночном планшете и инкубируют при комнатной температуре в течение 30 минут. Клетки HEK-Blue(tm) IL6 в логарифмической фазе трипсинизируются и повторно суспендируются в среде для анализов
(DMEM, 4,5 г/л глюкоза, 10% термически дезактивированного FBS, 2 мМ L-глютамина, Пен-Стреп) при 280000 клеток/мл. 180 мкл суспензии клеток добавляют в каждую лунку смесей IL-б/Fab для доведения конечной концентрации IL-б до 2 0 пМ. Клетки инкубируют при 37°С/5% СОг в течение 20 часов. Затем 20 мкл супернатанта из каждой ленки смешивают с 180 мкл реагента Quanti-Blue(tm)
(Invivogen) и инкубируют при 37°С в течение 4 0 минут перед измерением коэффициента поглощения на 650 нм на спектрофотометре для прочтения планшетов SpectraMax М5. Фоновый сигнал от лунок без IL-б вычитают, а затем производят деление на сигнал от клеток, обработанных IL-б без ингибитора, для получения относительной величины передачи сигналов. Все мутанты показывают значительно более низкую эффективность по сравнению с Fab EBI-029 WT, при этом расположение по порядку антагонистической эффективности является следующим: A28V/S30P/I51T/S55G (EBI-030) > A28V/I51T/S55G > S30P/I51T/S55G > (EBI-029) WT. Эти результаты показаны на Фиг.б.
Пример 16: Варианты антител показывают улучшенную антагонистическую эффективность при анализе пролиферации Т1165
Клетки Т1165.85.2.1 (R &D Systems) представляют собой линию клеток плазмоцитомы мышиных, которые пролиферируют в ответ на IL-б мыши, крысы или человека. Для измерения антагонизма от мутантов Fab EBI-029, 25 мкл 2 нг/мл IL-б человека (R &D Systems 206-IL-010/CF) смешивают с 25 мкл каждого варианта Fab в некотором диапазоне концентраций в 9б-луночном планшете и инкубируют при комнатной температуре в течение 3 0 минут. Клетки Т1165 в логарифмической фазе гранулируют и повторно суспендируют в среде для анализа (90% RPMI 1640, 10% FBS, 2 мМ L-глютамина, Пен-Стреп) при 2х105 клеток/мл. 50 мкл суспензии клеток добавляют в каждую лунку смесей IL-б/Fab для доведения конечной концентрации IL-б до 0,5 нг/мл. Клетки инкубируются при 37°С/5% СОг в течение 72 часов. 100 мкл реагента Cell-Titer Glo(r)
(Promega) добавляют в каждую лунку и инкубируют при комнатной температуре в течение 10 минут. Люминесценцию измеряют на спектрофотометре для прочтения планшетов SpectraMax М5. Все мутанты показывают значительно более высокую эффективность по сравнению с Fab EBI-029 WT без какой-либо измеримой передачи сигналов IL-б во всем диапазоне исследуемых концентраций Fab
(смотри Фиг.7).
Пример 17: Сравнение сходных свойств лекарственных средств вариантов антител
Термическую стабильность каждого варианта Fab определяют с помощью дифференциальной сканирующей флуорометрии (DSF). 2 мкл белка при концентрации 2,5 или 5 мг/мл смешивают с 18 мкл PBS и 2 мкл 50х Sypro Orange в 9б-луночном планшете для PCR BioRad. Планшет помещают в BioRad CFX9 6 RT-PCR System с линейным повышением температуры от 25°С и 95°С, и измеряют флуоресценцию как функцию времени. Тт вычисляется как самая низкая точка первой производной кривой плавления. Все варианты имеют измеренные значения Тт в пределах между 7 6 и 7 8°С, что согласуется с измеренной Tm Fab EBI-029 WT при 76°С.
Для измерения агрегации, образцы оценивают с помощью SEC-MALS с использованием ВЭЖХ Agilent 12 60, объединенной с инструментом для измерения рассеяния света Wyatt miniDawn TREOS и инструментом для измерения коэффициента преломления Wyatt Optilab rEX. Инжектируют 20-100 мкг белка, и исследуют его при скорости потока 1 мл/мин. Все варианты имеют молекулярную массу в пределах между 45000 и 52 000 Да, как измерено с помощью рассеяния света, что согласуется с Fab EBI-029 дикого типа.
Эти результаты показывают, что EBI-030 тоже ведет себя хорошо, по сравнению с EBI-029, с точки зрения свойств подобных лекарственным средствам.
Пример 18: Продуцирование антител IgG2 EBI-029 и EBI-030 полной длины и антител IgG2 с мутантными доменами Fc
Переформатирование EBI-029 и EBI-030 до IgG2 и IgG2 с мутантными Fc
Вариабельные домены тяжелых цепей EBI-029 и EBI-030, содержащие лидерную последовательность (MDWTWRILFLVAAATGAHS; SEQ ID N0:49), амплифицируются с помощью PCR из векторов Fab с использованием праймеров, которые вводят N-конечный сайт EcoRI и С-конечный сайт Nhel. Продукты PCR очищаются на 1% агарозном геле и подвергаются воздействию двойного переваривания с помощью EcoRI-HF и Nhel-HF. Векторы основных цепей на основе рТТ5, содержащие последовательность тяжелой цепи IgG2 дикого типа или вариант домена IgG2 с мутацией Н311А (Н311 соответствует нумерации SEQ ID N0:41; это соответствует Н310 в нумерации, предлагаемой в Martin et al. , Molecular Cell, 7:4, 867-877
(2001)) подобным же образом, перевариваются EcoRI-FH/Nhel-HF и очищаются на 1% агарозном геле. Вставки лигируются в переваренную основную цепь с использованием фермента Quikligase
(New England Biolabs), трансформируются в клетки ТОРЮ (Life Technologies) и подвергаются селекции на LB-Amp. Клоны обрабатываются с помощью MiniPrep и секвенируются для подтверждения вставок. Выбирают мутацию Н311А для уменьшения сродства связывания Fc по отношению к FcRn для уменьшения системной аккумуляции молекул, которые утекают из ткани глаза.
Экспрессирование и очистка вариантов IgG2 с помощью транзиентного трансфицирования
IgG2 EBI-029, IgG2 EBI-029-H311A, IgG2 EBI-030 и EBI-030
IgG2-H311A экспрессируются посредством транзиентного
трансфицирования в клетках НЕК-бЕ. Векторы рТТ5, содержащие, каждый, тяжелую цепь, совместно трансфицируются плазмидом LC EBI-029 с использованием PEI в качестве реагента трансфицирования. Супернатанты собирают через 5 дней, и экспрессируемые молекулы IgG2 очищают с помощью афинной хроматографии с использованием агарозы с белком А. Для очищенного белка осуществляют замену буфера в PBS, рН 7,4 с помощью нескольких заходов концентрирования/разбавления, и концентрацию и чистоту белка определяют с помощью Absorbance 280 и SDS-PAGE.
Продуцирование стабильного пула СНО
Стабильные пулы СНО, продуцирующие IgG2 EBI-029, IgG2 EBI-030 или IgG2-H311A EBI-030 генерируют с использованием набора Freedom CHO-S (Life Technologies) в соответствии с инструкциями производителя. Вкратце, каждую тяжелую цепь клонируют посредством стандартного переваривания/лигирования в вектор рСНО 1.0 в сочетании с EBI-029 LC. Конструкты трансфицируют в клетки CHO-S с использованием реагента Freestyle МАХ, и стабильные пулы, выбирают с помощью селекции при увеличении концентраций Puromycin и МТХ. После двух заходов селекции, пулы просматривают на продуцирование антитела с помощью аналитической хроматографии на белке А, и пулы с наивысшей производительностью выбирают для масштабирования и субклонирования.
Последовательности представлены ниже.
Последовательность полипептидов тяжелой цепи 030 (в каркасе IgG2, CDR подчеркнуты):
QVQLVQSGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP NYLIEWVRQA PGQGLEWMGV TTPGGGTINY AQKFQGRVTI TADESTSTAY MELSSLRSED TAVYYCARSR WDPLYYYALE YWGQGTTVTV SSASTKGPSV FPLAPCSRST SESTAALGCL VKDYFPEPVT VSWNSGALTS GVHTFPAVLQ SSGLYSLSSV VTVPSSNFGT QTYTCNVDHK PSNTKVDKTV ERKCCVECPP CPAPPVAGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVWDVSHE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST
FRWSVLTW HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP APIEKTISKT KGQPREPQVY TLPPSREEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPMLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID N0:41)
Последовательность полипептидов легкой цепи 030 (в каркасе IgG2, CDR подчеркнуты):
DIVMTQSPDS LAVSLGERAT INCRASESVD NYGIPFMNWY QQKPGQPPKL LIYAASNRGS GVPDRFSGSG SGTDFTLTIS SLQAEDVAVY YCQOSEEVPL TFGQGTKLEI KRTVAAPSVF IFPPSDEQLK SGTASWCLL NNFYPREAKV QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS STLTLSKADY EKHKVYACEV THQGLSSPVT KSFNRGEC (SEQ ID N0:42)
Последовательность нуклеиновых кислот тяжелой цепи 030:
CAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGGGCCGAGGTTAAGAAGCCAGGGAGCAGCGTCAAGGT ATCTTGTAAAGCGTCTGGTTACGTCCTTCCAAACTACCTGATCGAATGGGTGAGGCAGGCTCCC GGCCAAGGCCTGGAATGGATGGGAGTTACCACCCCTGGGGGCGGCACCATTAATTACGCCCAGA AATTTCAGGGACGAGTGACGATTACCGCCGACGAGTCCACCAGTACTGCCTACATGGAGCTGTC CTCACTCCGCAGCGAGGACACGGCAGTTTACTACTGCGCCCGGAGTCGATGGGACCCTCTTTAC TATTATGCTCTGGAATACTGGGGCCAGGGAACGACCGTTACAGTGTCATCTGCTAGCACCAAGG GCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCGCCCTGCTCCAGGAGCACCTCCGAGAGCACAGCGGCCCTGGG CTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCTCTGACC AGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGG TGACCGTGCCCTCCAGCAACTTCGGCACCCAGACCTACACCTGCAACGTAGATCACAAGCCCAG CAACACCAAGGTGGACAAGACAGTTGAGCGCAAATGTTGTGTCGAGTGCCCACCGTGCCCAGCA CCACCTGTGGCAGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCT CCCGGACCCCTGAGGTCACGTGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCCGAGGTCCAGTT CAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCACGGGAGGAGCAGTTC AACAGCACGTTCCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCGTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAGG AGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGGCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAAC CAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAG AACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGG AGAG СААТ GGGCAGCCG GAGAACAAC TACAAGAC CACACCTCCCATGCTG GAC T С С GAC G G С T С CTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCA TGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGG GTAAA SEQ ID N0:43
Последовательность нуклеиновых кислот легкой цепи 030:
GACATAGTGATGACTCAAAGTCCGGACAGCCTGGCGGTGTCACTCGGCGAACGGGCAAC TATCAACTGCCGAGCCAGCGAGAGCGTCGATAATTACGGCATCCCCTTCATGAACTGGTATCAG CAGAAGCCAGGACAGCCGCCCAAGCTGCTTATCTACGCCGCTTCCAACCGGGGATCAGGGGTGC CCGATCGATTTAGTGGAAGCGGTAGTGGGACCGATTTCACACTGACCATCAGCTCCCTTCAGGC CGAGGATGTGGCTGTCTATTATTGTCAGCAATCCGAGGAAGTGCCGCTCACGTTTGGTCAGGGA ACCAAACTGGAGATCAAGCGGACCGTAGCGGCGCCTAGTGTCTTCATCTTCCCACCCTCCGACG AACAGCTGAAGTCTGGCACTGCTTCCGTCGTGTGCCTGCTCAACAACTTTTACCCTAGAGAGGC AAAAGTTCAATGGAAAGTAGACAATGCCTTGCAGTCCGGGAACTCCCAGGAGTCTGTCACAGAG СAG GATAG TAAG GAC T СAAC С TACAG С С T G T С СAG СACAC T GAC С С T С T С СAAAG С С GAC ТAC G AGAAGCACAAAGTGTACGCTTGCGAAGTTACGCATCAGGGGCTGTCCTCACCCGTTACAAAAAG TTTTAACAGAGGGGAGTGCSEQ ID N0:44
030 Последовательность
полипептидов
тяжелой цепи
с мутацией
H311A (311A
выделена жирным шрифтом и
CDR подчеркнуты), также
упоминаемая
в настоящем
документе
как последовательность
полипептидов
тяжелой цепи 031:
0V0LV0SGAE VKKPGSSVKV SCKASGYVLP
NYLIEWVRQA
PGQGLEWMGV
TTPGGGTINY
AQKFQGRVTI
TADESTSTAY
MELSSLRSED
TAVYYCARSR
WDPLYYYALE
YWGQGTTVTV
SSASTKGPSV
FPLAPCSRST
SESTAALGCL
VKDYFPEPVT
VSWNSGALTS
GVHTFPAVLQ
SSGLYSLSSV
VTVPSSNFGT
QTYTCNVDHK
PSNTKVDKTV
ERKCCVECPP
CPAPPVAGPS
VFLFPPKPKD
TLMISRTPEV
TCVWDVSHE
DPEVQFNWYV
DGVEVHNAKT
KPREEQFNST
FRWSVLTW
AQDWLNGKEY
KCKVSNKGLP
APIEKTISKT
KGQPREPQVY
TLPPSREEMT
KNQVSLTCLV
KGFYPSDIAV
EWESNGQPEN
NYKTTPPMLD
SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK (SEQ ID N0:47)
Последовательность нуклеиновых кислот тяжелой цепи 031: CAAGTGCAGCTGGTGCAGTCAGGGGCCGAGGTTAAGAAGCCAGGGAGCAGCGTCAAGGT ATCTTGTAAAGCGTCTGGTTACGTCCTTCCAAACTACCTGATCGAATGGGTGAGGCAGGCTCCC GGCCAAGGCCTGGAATGGATGGGAGTTACCACCCCTGGGGGCGGCACCATTAATTACGCCCAGA AATTTCAGGGACGAGTGACGATTACCGCCGACGAGTCCACCAGTACTGCCTACATGGAGCTGTC CTCACTCCGCAGCGAGGACACGGCAGTTTACTACTGCGCCCGGAGTCGATGGGACCCTCTTTAC TATTATGCTCTGGAATACTGGGGCCAGGGAACGACCGTTACAGTGTCATCTGCTAGCACCAAGG GCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCGCCCTGCTCCAGGAGCACCTCCGAGAGCACAGCGGCCCTGGG CTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCTCTGACC AGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGG TGACCGTGCCCTCCAGCAACTTCGGCACCCAGACCTACACCTGCAACGTAGATCACAAGCCCAG
CAACACCAAGGTGGACAAGACAGTTGAGCGCAAATGTTGTGTCGAGTGCCCACCGTGCCCAGCA CCACCTGTGGCAGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCT CCCGGACCCCTGAGGTCACGTGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCCGAGGTCCAGTT CAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCACGGGAGGAGCAGTTC AACAGCACGTTCCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCGTGGCCCAGGACTGGCTGAACGGCAAGG AGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGGCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAAC CAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGAGGAGATGACCAAG AACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTACCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGG AGAG СAAT GGGCAGCCG GAGAACAAC TACAAGAC CACACCTCCCATGCTG GAC T С С GAC G G С T С CTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCA TGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGG GTAAA (SEQ ID N0:48)
Пример 19: Сравнение эффективности IqG2 EBI-029 и EBI-030 при анализе с использованием HEK-Blue-IL6
Линия репортерных клеток HEK-Blue(tm) IL6 (Invivogen) используется для сравнения эффективности ингибирования передачи сигналов IL6, для антител IgG2 EBI-029 и EBI-030. Сравнивают три препарата белков, очищенных из клеток НЕК-бЕ - IgG2 EBI-029, IgG2 EBI-030, и IgG2-H311A EBI-030 (также упоминаемые как 031 или EBI-031), вместе с препаратом IgG2 EBI-030, продуцируемого в стабильном пуле СНО. В дополнение к этому, тоцилизумаб, одобренное антитело анти-1ЪбРч, включается в качестве контроля. Для измерения антагонизма к IL6, IL-б человека (R &D Systems 206-IL-010/CF) при концентрации 400 пМ смешивают с различными концентрациями каждого антитела в 9б-луночном планшете и инкубируют при комнатной температуре в течение 3 0 минут. Клетки HEK-Blue(tm) IL6 в логарифмической фазе трипсинизируются и повторно суспендируются в среде для анализов (DMEM, 4,5 г/л глюкоза, 10% термически дезактивированного FBS, 2 мМ L-глютамина, Пен-Стреп) при 2 8 0000 клеток/мл. Добавляют 180 мкл суспензии клеток в каждую лунку смесей IL-б/Fab для доведения конечной концентрации IL-б до 20 пМ. Клетки инкубируют при 37°С/5% С02 в течение 20 часов. Затем 2 0 мкл супернатанта из каждой лунки смешивают с 180 мкл реагента Quanti-BlueTM (Invivogen) и инкубируют при 37°С в
течение 4 0 минут перед измерением коэффициента поглощения на 650 нм на спектрофотометре для прочтения планшетов SpectraMax М5.
Результаты показаны на Фиг.8 и в Таблице 5. EBI-030 (включая EBI-030, продуцируемые в клетках НЕК с мутацией Н311А или без нее, и EBI-030, продуцируемые в клетках СНО), показывают сильное увеличение эффективности (примерно 50-кратное уменьшение IC50 и > 100-кратное уменьшение IC90) по сравнению с EBI-029. Увеличение эффективности больше чем увеличение сродства, измеренное с помощью SPR.
Таблица 5: Значения IC50 и IC90
IC50 (пМ)
IC90 (пМ)
EBI-029
4350
EBI-030
0, 9
1,1
EBI-030 СНО
1,4
EBI-030-H311A
0, 6
12,4
Тоцилизумаб
1490
23700
EBI-031 (упоминаемый также в настоящем документе как IgG2-Н311А EBI-030) имеет IC50 более чем в 75 раз меньшее, чем у EBI-029 и IC90 примерно в 350 раз меньшее, чем у EBI-029. EBI-030, продуцируемые в клетках НЕК, имеют IC50 более чем в 50 раз меньше чем у EBI-029 и IC90 приблизительно в 4000 раз меньше чем у EBI-029.
Пример 20: Анализ моделирования влияния увеличения эффективности на продолжительность блокады IL-6 в стекловидном теле
Воздействие увеличения эффективности на степень и продолжительность блокады IL-б после введения в стекловидное тело моделируют с использованием фармакокинетической модели (Фиг.9). Дифференциальные уравнения, описывающие изменения концентрации свободного антитела (А), свободного IL-б (IL), и комплекса антитело/IL-б (AIL), определяются следующим образом:
d/dt(A)=-A*kae - A*IL*kl+AIL*к2
d/dt(IL)=kpi - IL*kie - A*IL*kl+AIL*к2
d/dt(AIL)=-AIL*kaie+A*IL*kl - AIL*k2
где кае представляет собой скорость выведения свободного антитела из стекловидного тела, kl представляет собой скорость ассоциации для связывания антитело/1Ъ-б, к2 представляет собой скорость диссоциации комплекса антитело/1Ъб, kpi представляет собой скорость продуцирования IL-б, kei представляет собой скорость выведения свободного IL-б из стекловидного тела и kaie представляет собой скорость выведения комплекса антитело/IL-б из стекловидного тела. Исходные значения параметров и скорости определяются, как показано в Таблице б.
А0 вычисляют на основании предположений относительно 50-мкл дозы 50 мг/мл антитела в глазу человека при объеме стекловидного тела 5 мл. IL0 оценивают на основе клинически измеренных величин для IL-б в стекловидном теле у пациентов с DME -200 пг/мл. kl оценивают на основе типичных скоростей ассоциации антител 1Е5 М-гсек-1, при этом к2 изменяется для моделирования величины эффективности в пределах от 100 пМ до 1 пМ. кае получают из измеренных времен полувыведения из стекловидного тела у кролика
~11 дней, масштабируемого в 1,8 раза, как измерено ранее для РК человека, kie оценивают при времени полувыведения 2 4 часа и kpi вычисляют как IL0*kie.
Моделирование свободного антитела и свободного IL-б
осуществляют с использованием программного обеспечения Berkeley
Madonna в течение времени 300 дней (Фиг. 10) . Порог 95% для
блокады IL-б выбирают для измерения продолжительности
ингибирования. Модель предсказывает, что увеличение
эффективности антитела значительно увеличивает продолжительность ингибирования IL-б в глазу от 130 дней для k2/kl = 100 пМ до 200 дней для k2/kl=10 пМ и до 225 дней для k2/kl=l пМ.
Пример 21: Фармакокинетика IL-ба
Фармакокинетические (РК) эксперименты осуществляют на самцах Новозеландских белых кроликов от PharmOptima (Portage, MI) . Все животные имеют возраст 12-13 месяцев и массу 2,61-3,42 кг. Сравнивают следующие белки - EBI-029-IgG2 (SEQ ID N0:11 и SEQ ID N0:12), EBI-029-IgG2-H311A (SEQ ID N0:10 и SEQ ID N0:12), EBI-030 (SEQ ID N0:41 и SEQ ID N0:42), EBI-030-IgG2-H311A (SEQ ID N0:47 и SEQ ID N0:42), EBI-029 Fab (SEQ ID N0:24 и SEQ ID N0:12), Eylea(r) (ловушка VEGF) и тоцилизумаб (TCZ; антитело анти-IL6R) . Все белки приготавливают при 13,8 мг/мл в PBS, рН 7,4. EBI-029-IgG2, EBI-029-IgG2-H311A, EBI-030, EBI-030-IgG2-H311A, EBI-029 Fab и тоцилизумаб не связываются с их целевыми антигенами у кролика, в то время как Eylea(r) связывается с VEGF кролика.
Для исследования РК в стекловидном теле, 9 животным делают инъекцию из 50 мкл исследуемого изделия в каждый глаз. Перед инъекцией, на поверхность глаза наносят лидокаин гидрохлорид (2% для инъекции), 0,5% проксиметакаина или 0,5% тетракаина. Инъекции осуществляют в среднюю часть стекловидного тела с помощью BD 3 0 0-мкл шприца для инсулина (31Gx5/16-дюймовая игла) вставляемого через дорсотемпоральный квадрант глаза. Для исследования системной РК, 3 животным делают инъекцию 100 мкл исследуемого изделия через ушную вену.
Последовательные образцы крови собирают у 3 животных в группах, как с IVT, так и с iv (внутривенным введением) через 0, 083, 1, 4, 8, 24, 72, 168, 240 и 336 часов и разбавляют 1:1 цитратно-фосфатно-декстрозным раствором и помещают на лед. Плазму собирают посредством центрифугирования охлажденных образцов крови при 4000 об/мин в течение 10 минут при 4°С, и хранят ее замороженной при -8 0°С.
Ткани глаза собирают из обоих глаз у всех животных в группе IVT через 0,25, 24, 168 и 336 часов после дозирования. Животных умерщвляют посредством эвтаназии с помощью внутривенного передозирования барбитурата. Для отбора внутриглазной жидкости непосредственно после эвтаназии, вставляют шприц с иглой под роговицу и внутриглазную жидкость медленно выкачивают. Внутриглазную жидкость переносят в предварительно помеченную пробирку и помещают на сухой лед или замораживают при -8 0°С. Для отбора жидкой части стекловидного тела, маленький срез вводят в склеру извлеченного глаза с использованием скальпеля, и жидкая часть стекловидного тела выкачивается через отверстие с помощью шприца. Образец измеряют помощью делений на шприце, переносят в предварительно помеченную пробирку и помещают на сухой лед или замораживают при -8 0°С.
Для отбора сетчатки и сосудистой оболочки глаза, маленький срез вводится с помощью скальпеля в склеру извлеченного глаза параллельно и каудально радужной оболочке. Используют ножницы для продолжения отверстия вокруг глазного яблока глаза, разделяя его на две половинки. Заднюю часть глазного яблока располагают таким образом, что внутренняя часть направлена вверх. С использованием ребристого ножа, сетчатку осторожно выбирают из глазного яблока. После сбора сетчатки из глазного яблока, сосудистую оболочку глаза выбирают сходным образом из оставшейся части глазного яблока. Оба образца, отдельно, переносятся в предварительно взвешенные и предварительно помеченные пробирки Precellys(r), взвешиваются и помещаются на сухой лед или замораживаются при -8 0°С. Ткани сетчатки и сосудистой оболочки
глаза разбавляют десятикратно в фосфатном буферном солевом растворе (PBS), гомогенизируют и хранят при -8 0°С.
Концентрации белка в каждой ткани оцениваются с помощью ELISA. Для EBI-029-IgG2, EBI-029-IgG2-H311A, EBI-030, EBI-030-IgG2-H311A и Fab EBI-029, планшеты половинного объема Costar покрывают раствором 1 мкг/мл IL-б человека в PBS в течение 1 часа при комнатной температуре. Лунки блокируют PBS, содержащим 2% BSA, промывают, а затем инкубируют с помощью ряда разбавлений для каждого образца, используя в качестве разбавителя PBS+5% плазмы кролика+0,05% Tween-20. Стандартную кривую с использованием очищенного белка также включают для каждого планшета. Образцы инкубируют при комнатной температуре в течение 60 минут, затем промывают три раза 300 мкл PBS, содержащего 0,05% Tween-20. Антитело анти-каппа-HRP (Genway Inc.) разбавленное 1:10000 в PBS, 1% BSA, 0,05% Tween-20, добавляют затем в каждую лунку и инкубируют в течение 3 0 минут. Лунки промывают, как выше, затем добавляют субстрат 3,3',5, 5'-тетраметилбензидин (ТМВ) , и измеряют сигнал на 450 и 550 нм на спектрофотометре для прочтения планшетов Spectramax. Концентрации белка вычисляют на основе стандартной кривой с использованием программного обеспечения Softmax Pro б. Каждый анализ ELISA повторяют, по меньшей мере, на 3 независимых планшетах, и регистрируют среднее время полужизни.
Для тоцилизумаба, концентрации белка определяют с помощью ELISA, как выше, за исключением того, что Fab анти-тоцилизумаб (BioRad НСА252) используют в качестве реагента захвата и антитело анти-IgG-Fc-HRP человека (Sigma А0170) используют в качестве детектирующего антитела. Два различных аналиаза ELISA используют для измерения свободного Eylea(r) и Eylea(r) в целом. Для свободного Eylea(r), лунки покрывают рекомбинантным VEGF (R &D Systems), и связанный белок детектируется с помощью антитела анти-IgG-Fc-HRP человека (Sigma А0170). Для измерения Eylea(r) в целом, антитело анти-Fc человека (Sigma 12136) используют для захвата и антитело aHTH-IgG-CH2-HRP человека (BioRad МСА647Р) используют для детектирования. Каждый анализ ELISA повторяют, по
меньшей мере, на 3 независимых планшетах, и регистрируют среднее время полужизни.
Сводка результатов
У большинства животных, наблюдается стойкое образование антител против белка, введенного посредством инъекции, оно наблюдается в моменты времени 240 и 336 часов. Поскольку это образование антител может влиять на выведение белков или оказывать влияние на ELISA, анализ данных ограничивается моментами времени до 168 часов и включая это время. Для РК в стекловидном теле, все белки EBI-029 и EBI-030 IgG2 выводятся значительно медленнее (Ti/2=9,3, 9,0, 15,7 и 9, 8 дня для EBI-029, EBI-029-H311A, EBI-030 и EBI-030-H311A, соответственно) по сравнению с Eylea(r) (Т1/2=б,3 дня), тоцилизумабом (Т1/2=4,8 дня) или фрагментом Fab EBI-029 (Т1/2=3,9 дня) (Фиг. 11, Таблица 7) . Сходные тенденции наблюдаются в сетчатке, сосудистой оболочке глаза и в глазной жидкости, где EBI-030 и EBI-030-H311A аккумулируются при более высоких уровнях по сравнению с Eylea(r) и тоцилизумабом (смотри Фиг.12 и Фиг.13). Все белки являются детектируемыми в плазме после введения IVT EBI-029, EBI-030 и тоцилизумаба, они аккумулируются при значительно более высоких уровнях, чем Eylea(r) или EBI-030-H311A (смотри Фиг.14). Подобным же образом, Eylea(r) и EBI-030-H311A выводятся быстрее из плазмы после IV введения, при этом время полужизни EBI-030-H311A составляет приблизительно половину от этого параметра для IgG2 дикого типа из-за уменьшения связывания FcRn (Таблица 7).
Очищенный EBI-031 концентрируют от 3 мг/мл до 142 мг/мл в PBS, рН 7,4 с использованием центробежного концентратора Amicon Ultra-15. Препараты до и после концентрирования оцениваются относительно агрегации посредством анализа на колонке SEC (для эксклюзионной хроматографии) Tosoh G3000SWXL 7,8x30, объединенной с инструментом для измерения рассеяния света Wyatt miniDawn TREOS и с инструментом для измерения коэффициента преломления Wyatt Optilab rEX. 2 0 мкг белка инжектируется и исследуется при скорости потока 1 мл/мин в PBS. Массовая относительная величина для пика с ожидаемой молекулярной массой -150 кДа приблизительно равна для двух концентраций (90,9% для 3 мг/мл и 91,3% для препарата 142 мг/мл), это показывает, что нет никакого значительного увеличения агрегации белка во время концентрирования. Эти результаты демонстрируют, что EBI-031 может концентрироваться до 142 мг/мл при небольшой измеряемой агрегации (агрегация <10%).
Пример 23: EBI-031 блокирует передачу сигналов цис- и транс- IL6
Линию репортерных клеток HEK-Blue(tm) IL6 (Invivogen) используют для сравнения эффективности EBI-031 и тоцилизумаба относительно блокирования передачи сигналов цис- и транс-1Ъб. Для передачи сигналов, свободный цис-1Ъ-б (конечная концентрация=20 пМ) смешивается с EBI-031 или тоцилизумабом в некотором диапазоне концентраций в 9б-луночном планшете и инкубируется при комнатной температуре в течение 3 0 минут. Клетки HEK-Blue(tm) IL6 в логарифмической фазе трипсинизируются и повторно суспендируются в среде для анализов (DMEM, 4,5 г/л глюкоза, 10% термически дезактивированного FBS, 2 мМ L-глютамина, Пен-Стреп) , и 50000 клеток добавляют в каждую лунку при конечном объеме 200 мкл. Планшеты инкубируют при 37°С/5% С02 в течение 2 0 часов. 50 мкл супернатанта из каждой лунки затем
смешивают с 150 мкл реагента Quanti-Blue(tm) (Invivogen) и инкубируют при 37°С в течение 4 0 минут перед измерением коэффициента поглощения на 650 нм на спектрофотометре для прочтения планшетов SpectraMax М5. Фоновый сигнал от лунок без IL-б вычитается, а затем делится на сигнал клеток, обработанных IL-б без ингибитора для получения относительного значения передачи сигналов. EBI-031 (1С50=14,2 пМ) блокирует свободный IL-б с эффективностью > 900 раз большим, по сравнению с тоцилизумабом (1С50=12,9 нМ) (Фиг.16А).
Для измерения блокады транс-передачи сигналов, осуществляются эксперименты, как выше, за исключением использования гипер IL-б при конечной концентрации 200 пМ вместо свободного IL-б. Гипер IL-б представляет собой продукт генетического слияния между IL-б и растворимым рецептором IL-б (Fischer et al. , Nature Biotechnology 15:142-145 (1997). EBI-031 блокирует гипер IL-б с высоким эффективностью (1С50=32 пМ) , в то время как тоцилизумаб не способен значительно ингибировать передачу сигналов без концентрации 1 мкМ (Фиг.16В).
Эти результаты показывают, что EBI-031 связывает IL-б человека на сайте II или на сайте, который находится в контакте с др130, при пМ сродстве и блокирует передачу сигналов IL-б и комплекса IL-6/sIL-6Ra при клеточных анализах в > 900 раз сильнее, чем тоцилизумаб.
Пример 24: Компьютерное моделирование подавления передачи сигналов IL-б с помощью EBI-031 внутри стекловидного тела
Осуществляется компьютерное моделирование, как описано в Примере 20, для предсказания продолжительности времени, в течение которого введение в стекловидное тело EBI-031 у людей должно подавлять 95% передачи сигналов IL-б. к2 устанавливают при 0,12 в день-1, так что k2/kl=14 пМ, как измерено при анализе эффективности. Т1/2 выведения устанавливается при 18 дней на основе измеренного времени полувыведения из стекловидного тела кролика, масштабируемого в 1,8 раза для людей. Все другие параметры описаны в Таблице 6. Модель предсказывает, что EBI-031 должны блокировать 95% передачи сигналов IL-б в течение -150
дней после введения в стекловидное тело (Фиг.17). Эти результаты моделирования показывают, что EBI-031 может в достаточной степени блокировать передачу сигналов IL-б в глазу в течение продолжительного периода времени, например, примерно до б месяц. Пример 25: Характеризация изоформ EBI-031
EBI-031 представляет собой антитело IgG2. Как обсуждалось ранее, антитела IgG2 существуют в трех различных структурных изоформах, изоформах IgG2-A, IgG2-B и IgG2-A/B (Фиг.18). В этом примере, осуществляют эксперименты для идентификации структурных изоформ в образцах EBI-031.
Анализ ВЭЖХ с обращенной фазой
Высокоэффективный жидкостной хроматограф с обращенной фазой (ВЭЖХ с обращенной фазой) используют для разрешения различных структурных изоформ EBI-031. Улучшенный способ аналитической ВЭЖХ с обращенной фазой, который использовался ранее для разрешения структурных изоформ IgG2, опосредуемых дисульфидными связями (смотри, Dillon et al. , Journal of Chromatography A, 2006, 1120:112-120), оптимизируют для разрешения EBI-031.
Образцы EBI-03.1, содержащие приблизительно по 30 мкг, загружают в колонку Zorbax 300SB-C8 (150 мм х 2,1 мм, 5,0 мкм, 300 А) . Температуру колонки устанавливают при 7 5°С. Подвижная фаза А представляет собой воду, содержащую 0,1% TFA, а подвижная фаза В представляет собой 55% IPA, 40% ACN, 4,9% воды и 0,1% TFA. Скорость потока составляет 0,5 мл/мин. Колонку сначала уравновешивают с помощью 90% подвижной фазы А и 10% подвижной фазы В в течение 2 мин, затем следует ступенчатый градиент от 10 до 2 5% В в течение 2 мин. Элюирование осуществляют с линейным градиентом 25-32% В в течение 21 мин. УФ поглощение отслеживают на 214 нм и/или 280 нм.
Для определения того, связано ли разрешение с дисульфидными
мостиками, образцы обрабатывают 5 мМ DTT и 10 мМ цистеина при
комнатной температуре в течение 2 мин, а затем анализируют с
помощью метода ВЭЖХ с обращенной фазой (Фигура 19) . Обработка
DTT, который представляет собой сильнодействующий
восстанавливающий агент, вызывает восстановление антитела IgG2,
дающее в результате элюирование в ранних пиках (Пик 0 и Пик 1) (Фигура 19, средняя панель). Обработка цистеином, который представляет собой более мягкий восстанавливающий агент, по сравнению с DTT, также сдвигает распределение изоформ в направлении ранних пиков (Пик 0 и Пик 1), хотя и не до такой степени как видно для образца, обработанного DTT (Фигура 19, нижняя панель).
Данные демонстрируют, что метод ВЭЖХ с обращенной фазой разрешает структурные изоформы с различными дисульфидными связями. Структуры с различными дисульфидными связями подтверждаются посредством картирования невосстановленных пептидов и с помощью масс-спектрометрии: ранний элюирующийся пик (Пик 1) содержит изоформу IgG2-A/B, а поздний элюирующийся пик (Пик 2) содержит изоформу IgG2-A. Что важно, нет изоформы В IgG2-B (Пик 0) детектируемой в образце EBI-031 (Фигура 19, верхняя панель).
Сравнение различных образцов EBI-031
Используя анализ ВЭЖХ с обращенной фазой, описанный выше, анализируются образцы EBI-031, собранные от различных линий клеток, экспрессирующих EBI-031, для сравнения распределения изоформ продуцируемых антител. Образцы EBI-031 собирают из культуры в масштабе 200 л клональной линии клеток, культуры в масштабе 10 л от родительской линии клеток и из стабильно трансфицированого пула клеток. EBI-031 очищают с использованием трехстадийного хроматографического способа для линий клональных клеток и родительских линий клеток, экспрессирующих EBI-031. EBI-031 очищают из стабильно трансфицированого пула клеток, используя очистку на белке А. Образцы анализируются с помощью способов, описанных выше.
Результаты, показанные на Фигуре 20, показывают, что все три образца EBI-031 содержат изоформы IgG2-A и IgG2-A/B, но существенных количеств IgG2-B нет. Эти данные демонстрируют, что антитело IgG2 EBI-031 продуцируется в менее гетерогенной смеси, чем другие антитела IgG2, происходит ли продуцирование в линии клональных клеток, экспрессирующих EBI-031, в линии родительских клеток, экспрессирующих EBI-031, или в гетерогенной популяции
клеток, которые стабильно экспрессируют EBI-031. Фигура 21 показывает распределение изоформ для образца EBI-031 из культуры в масштабе 200 л линии клональных клеток, экспрессирующих EBI-031, то есть, это верхняя панель Фигуры 20. Площади под кривыми также измеряются, и распределения между изоформами показаны в Таблице, под фигурой.
Пример 26: Фармакокинетика в исследованиях на приматах Фармакокинетика EBI-031 исследуется в исследованиях на приматах. Исследуют двух самцов Африканской зеленой мартышки. 50 мкл 50 мг/мл EBI-031 вводят как инъекцию в стекловидное тело глаза. Для подгонки кривой используют программное обеспечение Madonna.
Данные от исследований на приматах моделируют с использованием подгоночной кривой. Дифференциальные уравнения, описывающие изменения концентрации антител в стекловидном теле (А) и антител вне стекловидного тела, например, системной концентрации, (Ар), определяются как следующим образом: d/dt(А)=-А*кае
d/dt(Ар)=А*кае(Dil) - Ар*каре
Начальные значения параметров и скорости определяются, как показано в Таблице, ниже:
Другие соображения, включенные для подгонки включают: как разбавление, так и константа скорости являются плавающими при подгонке. Начальное значение А поддерживается постоянным (2x50 мл при 50 мг/мл в 5-мл глазе). Результаты моделирования, как показано на Фигурах 22А, 22В и 23, показывают, что постоянные скорости удаления из стекловидного тела дают время полужизни 4,6 и 5,7 дней, соответственно, для двух обезьян. Средняя постоянная
скорости удаления из стекловидного тела, как вычислено, составляет 5,2 дня. Системное удаление моделируется как 1,1 дня и 0,63 дня (в среднем 0,85 дня) . Эти результаты демонстрируют, что время полужизни EBI-031 в стекловидном теле значительно больше, чем системное время полужизни у приматов. Пример 27: Фармакокинетика EBI-031
Осуществляют другой фармакокинетический (РК) эксперимент, где 50 мкл раствора 20 мг/мл EBI-031 вводят в виде инъекции в стекловидное тело в глазах кроликов. Исследуемые моменты времени представляют собой 1, 3, 7 и 14 дней (например, 24, 72, 168 и 336 часов). Анализируют двух животных (четыре глаза) в каждый момент времени. Способы введения препарата EBI-031, сбора ткани глаза, и определения концентрации белка осуществляются, как описано в Примере 21.
Результаты показаны на Фигурах 24A-24I. При анализе концентрации белка в течение дней 1-14 в жидкой части стекловидного тела, время полужизни EBI-031, как определено, составляет 8,95 дня (Фиг.24А). Однако детектируется сильная реакция антитела в день 14, которая может повлиять на эти результаты. Анализируя концентрацию белка в течение дней 1-7 в жидкой части стекловидного тела, время полужизни EBI-031, как определено, составляет 18,88 дня.
EBI-031 детектируются также и в других отделениях глаза после инъекции в стекловидное тело. EBI-031 проникает также во внутриглазную жидкость (Фиг.2 4В), сосудистую оболочку глаза (Фиг.24С), конъюнктиву (Фиг.24Б), роговицу (Фиг.24Е), ресничное тело (Фиг.24Е), хрусталик (Фиг.240, сетчатку (Фиг.24Н) и склеру (Фиг.241). Концентрация лекарственного средства в этих тканях на один - два порядка величины ниже, чем концентрации, детектируемые в стекловидном теле.
Другие варианты осуществления находятся в рамках следующей далее формулы изобретения.
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
1. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащие вариабельную область тяжелой цепи, содержащую
(i) CDRI VH, содержащую последовательность GYXiLX2NYLIE (SEQ
ID N0:45),
(ii) CDR2 VH, содержащую последовательность VX3TPGX4GTIN
(SEQ ID NO:46), и
(ii) CDR3 VH,
где верным является одно или несколько из следующих утверждений: Xi не представляет собой А, Х2 не представляет собой S, Х3 не представляет собой I и Х4 не представляет собой S.
2. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.1, где Xi представляет собой V или консервативное замещение для V, Х2 представляет собой Р или консервативное замещение для Р, Х3 представляет собой Т или консервативное замещение для Т, и Х4 представляет собой G или консервативное замещение для G.
3. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.1 или 2, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с идентичным в остальном антителом или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим последовательность вариабельной области тяжелой цепи, где Хг представляет собой А, Х2 представляет собой S, Х3 представляет собой I и Х4 представляет собой S.
4. Выделенное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие (i) CDRI VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:31, CDR2 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:32, и CDR3 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:33.
5. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п. 4, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеет повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, содержащим CDRI VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:4, CDR2 VH, содержащим последовательность SEQ ID N0:5, и CDR3 VH, содержащую последовательность SEQ ID N0:6.
2.
6. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит (i) последовательность вариабельной области тяжелой цепи, содержащей SEQ ID N0:37 или (ii) последовательность вариабельной области тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:37.
7. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит (i) SEQ ID N0:39 или SEQ ID N0:54 или (ii) последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:39 или SEQ ID N0:54.
8. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит (i) последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:41 или (ii) последовательность тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:41.
9. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность вариабельной области тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:37, где указанная последовательность тяжелой цепи содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V2 8, РЗО, Т51 и G55 (нумерация в соответствии с SEQ ID N0:41).
10. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащие последовательность, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:39 или SEQ ID N0:54, где указанная последовательность содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V28, РЗО, Т51 и G55 (нумерация в соответствии с SEQ ID N0:41).
11. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащие последовательность тяжелой цепи, которая является, по меньшей мере, на, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99%
10.
идентичной SEQ ID N0:41, где указанная последовательность тяжелой цепи содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из V28, РЗО, Т51 и G55 (нумерация в соответствии с SEQ ID N0:41).
12. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.9-11, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеют повышенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который в остальном является идентичным, за исключением того, что он не содержит указанной одной или нескольких аминокислот, а вместо этого, содержит одну или несколько (например, 1, 2, 3 или 4) аминокислот, выбранных из А28, S30, 151 и S55.
13. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.9-11, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержат V28, РЗО, Т51 и G55, и антитело или антигенсвязывающий фрагмент показывает улучшенное сродство к IL-б человека и/или улучшенную эффективность по сравнению с антителом или антигенсвязывающим фрагментом, который в остальном является идентичным, за исключением того, что он содержит А28, S30, 151 и S55.
14. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержат CDRI VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:34, CDR2 VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:35, и CDR3 VL, содержащую последовательность SEQ ID N0:36.
15. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержат (i) последовательность вариабельной области легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:38, или (ii) последовательность вариабельной области легкой цепи, которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:38.
16. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент дополнительно содержат (i) последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42, или (ii) последовательность легкой цепи
12.
которая является, по меньшей мере, на 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичной SEQ ID N0:42.
17. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.З, 5, 12 или 13, где сродство повышено, по меньшей мере, в 1,5, 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2, 3 или 4 раза.
18. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.17, где сродство оценивается с использованием поверхностного плазмонного резонанса (SPR) или проточной цитометрии.
19. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.З, 5, 12 или 13, где эффективность улучшена, как показано
(i) уменьшением IC50, где IC50 необязательно понижена, по меньшей мере, в 5, 10, 20, 30, 40 или 50 раз и/или
(ii) уменьшением IC90, где IC90 необязательно понижена, по меньшей мере, в 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 200, 300, 4 00 или 50 0 раз.
20. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.З, 5 или 13, где эффективность оценивается с помощью анализа с использованием HEK-Blue(tm) или анализа пролиферации Т1165.
21. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащие вариабельную область тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:37, и вариабельную область легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:38.
22. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащие последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:41, и последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
23. Выделенный Fab, содержащий последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:39 или SEQ ID N0:54, и последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
24. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеют
(i) IC50 меньше чем 47 пМ (например, IC50 меньше чем 40, 30, 20, 10, 5, 4, 3, 2 или 1 пМ) , как оценивают при анализе с использованием HEK-Blue(tm) с 20 пМ IL-б, и/или
(ii) IC90 меньше чем 4350 пМ (например, IC90 меньше чем 4000, 2000, 1000, 100, 50, 40, 30, 20, 15, 10 или 5 пМ) , как оценивают при анализе с использованием HEK-Blue(tm) с 2 0 пМ IL-б.
25. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из
предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент
имеют улучшенное удерживание в глазу, при введении в
стекловидное тело, например, по сравнению с тоцилизумабом и/или
Eylea(r).
26. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из
предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент
содержат мутацию (например, 1, 2, 3 или 4 мутации) в одном или
нескольких положениях, соответствующих Н311, D313, 1254 или Н436
(нумерация как в SEQ ID N0:41).
27. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.2 6, где указанная мутация выбирана из одного или нескольких положений из Н311А, Н311Е, H311N, D313T, I254A, I254R и Н436А.
28. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент содержит мутацию Н311А (нумерация как в SEQ ID N0:41).
29. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.2 6-2 8, где указанная мутация уменьшает системную аккумуляцию антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с системной аккумуляцией антитела или антигенсвязывающего фрагмента, который не содержит мутации.
30. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.2 6-2 8, где указанная мутация уменьшает системную аккумуляцию антитела или антигенсвязывающего фрагмента по сравнению с системной аккумуляцией антитела или антигенсвязывающего фрагмента, который не содержит мутации, где системную аккумуляцию оценивают после введения в стекловидное тело антитела или антигенсвязывающего фрагмента.
31. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент имеют системное время полужизни меньше, чем у тоцилизумаба и/или Eylea(r).
27.
32. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, где антитело или антигенсвязывающий фрагмент представляет собой изоформу IgG2-A или изоформу IgG2-A/B, но не изоформу IgG2-B.
33. Выделенное антитело или антигенсвязывающий фрагмент, содержащий последовательность тяжелой цепи, содержащую SEQ ID N0:47 и, необязательно, последовательность легкой цепи, содержащую SEQ ID N0:42.
34. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из предыдущих пунктов, для использования при лечении субъекта (например, человека) с заболеванием, ассоциированным с IL-б.
35. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.34, где указанное заболевание представляет собой глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле.
36. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.34 или 35, для использования при лечении субъекта (например, человека) с диабетическим макулярным отеком (DME), диабетической ретинопатией, увеитом, сухим глазом (например, болезнью сухого глаза или синдромом сухого глаза), возрастной макулярной дистрофией (AMD), пролиферативной диабетической ретинопатией (PDR), окклюзией вены сетчатки (RV0), нейромиелитом зрительного нерва (NM0), трансплантатом роговицы, эрозией роговицы или механической травмой глаза.
37. Антитело или антигенсвязывающий фрагмент по п.3 6, для использования при лечении субъекта (например, человек) с DME.
38. Композиция, содержащая антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.1-37 и, необязательно, фармацевтически приемлемый носитель.
39. Композиция по п.38, где композиция содержит, по меньшей мере, 60, 70, 80, 90, 95 или 99% изоформы IgG2-A или IgG2-A/B антитела или их сочетания.
40. Композиция по п. 3 8 или 39, где композиции содержит меньше чем 10%, 5%, 2%, 1% или 0,5% изоформы IgG2-B антитела.
41. Композиция по любому из пп.3 8-4 0 для использования при лечении заболевания, ассоциированного с IL-б.
27.
42. Композиция по п.41 для использования при лечении глазного заболевания, характеризуемого повышенным уровнем IL-б.
43. Композиция по п.41 для использования при лечении диабетического макулярного отека (DME), диабетической ретинопатии, сухого глаза (например, болезни сухого глаза или синдрома сухого глаза), аллергического конъюнктивита, увеита, возрастной макулярной дистрофии (AMD), пролиферативной диабетической ретинопатии (PDR), регматогенной отслойки сетчатки (RRD), окклюзии вены сетчатки (RVO), нейромиелита зрительного нерва (NMO), трансплантата роговицы, эрозии роговицы или механической травмы глаза.
44. Способ лечения заболевания, ассоциированного с IL-б, способ включает введение субъекту терапевтически эффективного количества антитела против IL-б или антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп.1-37.
45. Способ по п.44, в котором заболевание, ассоциированного с IL-б, представляет собой глазное заболевание, характеризуемое повышенным уровнем IL-б в стекловидном теле.
46. Способ по п. 44 или 45, в котором заболевание, ассоциированное с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек (DME), диабетическую ретинопатию, увеит, сухой глаз (например, болезнь сухого глаза или синдром сухого глаза), возрастную макулярную дистрофию (AMD), пролиферативную диабетическую ретинопатию (PDR), окклюзию вены сетчатки (RVO), нейромиелит зрительного нерва (NMO), трансплантат роговицы, эрозию роговицы или механическую травму глаза.
47. Способ по п.45, в котором антитело или
антигенсвязывающий фрагмент доставляется в стекловидное тело
глаза субъекта.
48. Способ по любому из пп.44-47, в котором заболевание, ассоциированного с IL-б, представляет собой диабетический макулярный отек и антитело или его фрагмент доставляется в стекловидное тело глаза субъекта.
49. Нуклеиновая кислота, содержащая последовательность, кодирующую антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп.1-37.
48.
50. Нуклеиновая кислота, содержащая SEQ ID N0:40, SEQ ID N0:43 или SEQ ID N0:48.
51. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п.4 9 или 50.
52. Клетка, содержащая вектор по п.51.
По доверенности
542161
День 15
День 22
35000-1
35000-
^ 30000-о
_о 25000-
ct аз
_Е 20000 ^ 30000-о
_о 25000
с! аз
В 20000-
Несущая В среда
II Anti-VEGF
? Антитело анти-И-6
15000
15000-
0.18-1
0.16-
0.14-
0.12-
0.1-
_i_
0.08-
0.06-
0.04-
0.02-
ФИГ. 1
PBS mAb 64
ФИГ. 2
Блокада IL-6
1.2-
0.0- i : г-
0.00001 0.001 0.1 10
Белок (нМ)
? a-IL-6Ra (r) EBI-020
ФИГ. ЗА
Блокада IL-6/sll_6Ra
1.2-
Белок (нМ)
? a-IL-6Ra • EBI-020
ФИГ. зв
Леченый глаз
^ 0.006-
I51T/S55G
S30P/I51T/S55G
A28V/S51T/S55G
5|4Q4M^^ \ртШшщещ 140409-АТ-З-конкуренция Щшй-тнщщм
"To7
A28V/S30P/I51T/S55G
(EBI-030)
40409-АТ-5-КОН куренц мя
5000-1
4500
4000
3500 3000 '2500 2000 1500 1000 500
0i г
0.001 0.01
-j-
0.1 -!
10 -I
100
[Fab] (нМ)
ФИГ. 7
1.4-1
1.2
-г m
Is 1
к s 0.8 го о
сБ S0-6
t CD
о °-
о с 0.4 I-
0.2
ФИГ. 8
IL:1 (0.864)
A: 1(0.864) !L:2(0.273221) A:2(0.273221) I L:3 (0.0864) A:3(0.0864) 11:4(0.0273221) A:4(0.0273221) 11:5(0.00864) A:5 (0.00864)
Free 11-6
STARTTIME -
A!L =
STQPTfME =
400
kei =
0.69
DTIVHN = 1E-
kpi =
0.0069
DTMAX- 1
kae -
; 0.032
?TOUT = 0
kaie
- 0.032
TOLERANCE
-0.01
kl =
8.64
A - 3000
k2 =
0.00864...0.864
о ЕВЮ29 OEBI029-H311A ? ЕВЮЗО ДЕВЮ30-Н311А
A Eylea #TCZ
РК для сетчатки
о о
0 ^ го ^ ш ^
го о; со
ГО g
1 о CD
I000
о EBI-029 ? EBI-030 AEBS-030-H31L A Eylea (r)TCZ
100 200 300
Время (ч)
ФИГ. 12
400
Внутриглазная жидкость
0 100 200 300
Время (ч)
Системная аккумуляция после введения IVT
1000-1
900-
800-
700-
* '
600-
500-
400-
зоо-
200
Время (часы)
ФИГ. 14
300
-TJ- Е ВI-029 -О- EBI-030 --¦ЗК~- EBI-030-H311А -О-¦ Eylea -¦-TCZ
400
л FRl . . CDR1 , , FR2 , , CDR2 , , FR3 ,
10 20 30 40 50 60 70
....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|
EBI-029 QVQLVOSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYALSNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVITPGSGTINYAOKFQGRVTI
EBI-030 QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGWLPNYLIEWVRQAPGQGLEWMGVTTPGGGTINYAQKFQGRVTI
EBI-031 OVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYVLPNYLIEWVRQAPGOGLEWMGVTTPGGGTINYAQKFQGRVTI
FR3 , , CDR3 FR4 , , CH1
80 90 100 110 120 130 140
EBI-029 TADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRST EBI-030 TADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRST EBI-031 TADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARSRWDPLYYYALEYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRST
A CHj
150 160 170 130 190 200 210
- \ - ! - I - I - ! - ! - I - \ - ! - I - I - ! - ! - ! EBI-029 SESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQ3SGLYSLSSWTVPSSNFGTQTYTCNVDHK EBI-030 SESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQ8SGLYSLSSWTVP88NFGTQTYTCNVDHK EBI-031 SESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLOSSGLYSLSSWTVPSSNFGTOTYTCNVDHK
220 230 ; 240 _ 250 260 270 280
EBI-029 PSNTKVDKTVERKCCVE CPPCkpPVAGPSVFLFpkPKDTLMi SRTPE VTCVWDVSHE DPE VQFNWYV EBI-030 PSNTKVDKTVERKCCVE CPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHE DPEVQFNWYV EBI-031 PSNTKVDm'ERKCCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVWDVSHEDPEVQFNWYV
" m " < сиз,
290 300 _ 310 _ 320 330 340 350
EBI-029 DGVEVHNMTKPREEQFNSTFRVVSVLTVV
EBI-030 DGVEVHNAKTKPREEQFNSTFRWSVLTWHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPREPQVY EBI-031 DGVE VHNAKTKPREE OFNSTFRWSVLTWAQDWLNGKE YKCKVSNKGLPAPIEKTISKTKGQPRE PQVY
360 370 380 390 400 410 420
....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|.... ....
EBI-029 TLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGOPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQ EBI-030 TLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWE8NGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQ EBI-031 TLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPMLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQ
^ CH3 .
430 440
....|....|....|....|....|...
EBI-029 GNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK EBI-030 GNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK EBI-031 GNVFSCSVMHEALSNHYTQKSLSLSPGK
ФИГ. 15A
FR1 CDRI FR2 ЈDR2 FR3
................................Jmmfe. ^ - - -jfr ^ jfr. ^jj...................
10 _ 20 _ 30 _ 40 50 60 70
DIVlfTOJPDSLAVSLGERATINCRASESVm^^
FR3 """(tm)3 _ FR4 _ CK
80 _ 90 100 _ 110 _ 120 130 140
SGTDFTLTISSLQAEDVAVYICQQSEEVPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASWCLL
. CK ^
150 160 170 180 190 200 210
....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|....|
NNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVT
, CK , ....!...
KSFNRGEC
ФИГ. 15B
Передача сигналов цис-(11_-6 человека)
0,0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000
Белок (нМ)
ФИГ. 16А
0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000
Белок (нМ)
Передача сигналов транс-(11_-6 человека)
ВЭЖХ с обращенной фазой изоформ с дисульфидными связями
- Сравнение образцов EBI-031
NBL0071-08-06 (Масштаб 200 л, линия клональных клеток)
NBL0G43-10-G4
(Масштаб 10 л, родительская линия клеток)
EBI-031 (NBL0071-08-06, BDS из 200-л биореактора, клональная линия клеток) ВЭЖХ с обращенной фазой изоформ с дисульфидными связями
NBL0071-08-06
Наименование удерживания Пл°ЩаДь % Площади
ВИзоформа 13.383 А/ВИзоформа 13.682
АИзоформа 14.854
58509 1349980 5453505
0.85
19.67
79.47
ФИГ. 21
<
ГчГ
<
=8=
350-1 300250200150 100
ВРЕМЯ
ФИГ. 22A
ю сл
600i
<
t; 400'
> 300-
КЭ 200i <
100
ВРЕМЯ
ФИГ. 22В
700т
-Подгонка -Подгонка 2
A EBI031 (К679) х EBI031 (К797)
100 200 300 Время (ч)
ФИГ. 24А
Внутриглазная жидкость
400
ЮхЮ5-
6.3x1041
со ?5
4.0x104i
100
So"
-,- 300
Время (ч)
ФИГ. 24С
1x104
IxlO3
1x1 (У
Конъюнктива
О О
2.5x104 ¦1.6x104
S 1.0xl04i
IT! 6.3xi о3
Роговица
О 100 200 300 400
Время (ч)
ФИГ. 24D
Цилиарное тело lYins радужной оболочки
1x1!
0 100 200 300 400
Время (ч)
ФИГ 24Е
Хрусталик
со ср
со ср
1x104'
1х103
63x1 (Р
-| 4.0x105 2.5x10Ц
g 1,6x105 1,0x105
100 200 300 400
Время (ч)
ФИГ 24F
Сетчатка
0 100 200 300 400
Время (ч)
ФИГ. 24G
Склера
:Ь4 Д
1x10
со "
ср 1x104.!
100 200 300 400
Время (ч)
ФИГ. 24Н
100 200 300
Время (ч)
ФИГ 241
400
(19)
(19)
(19)
(19)
(19)
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
1/25
3/25
3/25
6/25
6/25
6/25
6/25
7/25
7/25
7/25
7/25
7/25
7/25
8/25
8/25
10/25
11/25
11/25
11/25
13/25
14/25
14/25
16/25
16/25
19/25
19/25
20/25
20/25
20/25
20/25
21/25
21/25
21/25
21/25
21/25
21/25
21/25
21/25
21/25
23/25
23/25
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
24/25
24/25
400
400
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25
25/25